Αφηρημένο

Προηγουμένως αναφέρθηκε ευρήματα στην αυστριακή

BRCA1

/2 φορείς μετάλλαξης πρότεινε μια πιθανή εξάρτηση των εμβρύων με

BRCA1

/2 μεταλλάξεις στο λεγόμενο

χαμηλή

αλληλόμορφα του εύθραυστου Χ νοητική υστέρηση 1 (

του Fmr1

) γονίδιο, που χαρακτηρίζεται από λιγότερο από 26 CGG επαναλαμβάνει (CGG

n & lt ? 26). Η υπόθεση προέκυψε από μια μελέτη που ανέφερε υψηλά στατιστικά σημαντική εμπλουτισμό του

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα, υπερβαίνοντας σημαντικά

χαμηλή

αλληλόμορφο επικράτηση στο γενικό πληθυσμό, γεγονός που υποδηλώνει έμβρυο θνησιμότητα των

BRCA1

/2 μεταλλάξεις, «έσωσαν» από την παρουσία του

του Fmr1

αλληλόμορφα χαμηλή. Μια τέτοια εξάρτηση θα προσφέρουν επίσης μια εξήγηση για τη λεγόμενη «

BRCA

-paradox», που χαρακτηρίζεται από

BRCA1

/2 ελλιπής εμβρυϊκών ιστών είναι αντι-πολλαπλασιαστικές (προκαλώντας ενδεχομένως έμβρυο-φονικότητα ) αλλά πολλαπλασιαστική σε κακοήθεις όγκους, συμπεριλαμβανομένων του μαστού και των ωοθηκών. Παρακολούθηση των ερευνών και από άλλους ερευνητές, ωστόσο, στις περισσότερες αποδειχθεί τάσεις προς εμπλουτισμό, αλλά, ως επί το πλείστον, δεν εμπλουτισμός σε όλα, εγείροντας ερωτήματα σχετικά με την αρχική παρατήρηση και η υπόθεση. Είμαστε σε αυτή τη μελέτη, ως εκ τούτου, διερευνώνται CGG

ν του

του Fmr1

γονίδιο του 86 ανώνυμα δείγματα DNA από τις γυναίκες με τις διάφορες μορφές του καρκίνου των ωοθηκών, και δεν ήταν σε θέση να αποδείξει τις διαφορές στον επιπολασμό της

χαμηλή του Fmr1

αλληλόμορφα είτε μεταξύ των ασθενών θετικών και αρνητικών καρκίνου των ωοθηκών για

BRCA1

/2 ή μεταξύ των ασθενών με καρκίνο των ωοθηκών και ανέφεραν ποσοστά σε πληθυσμούς μη-καρκίνου. Αυτό εγείρει περαιτέρω ερωτήματα σχετικά με την προτεινόμενη εξάρτησης μεταξύ

BRCA1 /2

και

του Fmr1

, αλλά επίσης αυξάνει την πιθανότητα που διερευνάται αυστριακή

πληθυσμούς BRCA1

/2 φορέα διαφέρουν από εκείνες άλλες χώρες. Είτε μόνο επιλεγμένα

BRCA1

/2 μεταλλάξεις, ως εκ τούτου, να αλληλεπιδράσει με το

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα ή τα αυστριακά δεδομένα αντικατοπτρίζουν μόνο τυχαίο παρατηρήσεις

Παράθεση:. Gleicher Ν, McAlpine JN, Gilks ​​CB, Kushnir VA, Lee HJ, Wu YG, et al. (2014) Απουσία

BRCA

/

του Fmr1

συσχετίσεις σε γυναίκες με ωοθηκών. PLoS ONE 9 (7): e102370. doi: 10.1371 /journal.pone.0102370

Επιμέλεια: Ajay Pratap Singh, Πανεπιστήμιο της Νότιας Αλαμπάμα Mitchell Ινστιτούτο Καρκίνου, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 8 Απρ 2014? Αποδεκτές: 17 Ιουνίου 2014? Δημοσιεύθηκε: 18, Ιουλίου 2014

Copyright: © 2014 Gleicher et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Δεδομένα Διαθεσιμότητα:. Η συγγραφείς επιβεβαιώνουν ότι όλα τα δεδομένα που διέπουν τα ευρήματα είναι πλήρως διαθέσιμα χωρίς περιορισμούς. Όλα τα σχετικά δεδομένα είναι εντός του Υποστηρίζοντας αρχεία πληροφοριών του χαρτιού και

Χρηματοδότηση:. Η μελέτη αυτή χρηματοδοτήθηκε από κονδύλια από το Ίδρυμα μη κερδοσκοπικού Αναπαραγωγικής Ιατρικής (FRM), New York, NY 10021, USA, και εντός των τειχών κεφάλαια από το κέντρο Ανθρώπινης Αναπαραγωγής (ΕΑΔ) – New York, NY 10021, USA, μια κερδοσκοπική ευφορία και ερευνητικό κέντρο. Η FRM δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή δεδομένων, την ανάλυση, η απόφαση για τη δημοσίευση ή την προετοιμασία του χειρογράφου, ακόμα κι αν Ν.Ο. και D.H.B. είναι μέλη του Διοικητικού Συμβουλίου του Ιδρύματος. Από το προσωπικό λαμβάνει αποφάσεις χρηματοδότησης στην ΕΑΔ, ανεξάρτητα από την ιδιοκτησία ΕΑΔ, χρηματοδότες στην ΕΑΔ είχε επίσης κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή δεδομένων, την ανάλυση, η απόφαση για τη δημοσίευση ή την προετοιμασία του χειρογράφου. Όλες αυτές οι ευθύνες ήταν αποκλειστικά οι συγγραφείς, μεταξύ των οποίων Ν.Ο., ιδιοκτήτη ΕΑΔ, είναι ένα. Οι χρηματοδότες στην ΕΑΔ παρέχεται υποστήριξη μόνο με τη μορφή των μισθών στους Ν.Ο., V.A.K. και D.H.B. Οι συγκεκριμένοι ρόλοι αυτών των συγγραφέων αρθρωτά στο τμήμα συγγραφέα συμβολή

Αντικρουόμενα συμφέροντα:. Όλοι οι συγγραφείς, αλλά HJL, YGW και ELT, έχουν στο παρελθόν λάβει την υποστήριξη της έρευνας, αμοιβές και τα ταξίδια κεφάλαια ομιλητών από τις φαρμακευτικές και ή /και εταιρειών ιατρικών συσκευών, αν και κανένα με οποιονδήποτε τρόπο συνδέονται με την έρευνα που αναφέρονται εδώ. NG και DHB, παρατίθενται σε μια σειρά του Fmr1 που σχετίζονται με αιτήσεις για διπλώματα ευρεσιτεχνίας ΗΠΑ. Ανάμεσα σε αυτούς, μόνο το ένα ήδη απονεμηθεί δίπλωμα ευρεσιτεχνίας σχετίζεται με την πιθανή αλληλεπίδραση του Fmr1 και BRCA γονίδια (όνομα ευρεσιτεχνίας: «Μέθοδος της θεραπείας που σχετίζονται με το γονίδιο του Fmr1?» Αριθμός διπλωμάτων ευρεσιτεχνίας:. US 8,629,120 B2) Όλες ακόμα-εκκρεμείς αιτήσεις ευρεσιτεχνίας που αφορούν αποκλειστικά να αξιώνεται λειτουργίες του γονιδίου του Fmr1, επηρεάζοντας τα πρότυπα των ωοθηκών γήρανσης, που σχετίζονται με συγκεκριμένες μεταλλάξεις γονιδίων, και την ικανότητα να προβλέψουμε διαγνωστικά πρότυπα γήρανση των ωοθηκών βασίζονται σε τέτοιες μεταλλάξεις του Fmr1. NG είναι ιδιοκτήτης της CHR και, όπως VAK, HJL, YGW, ELT και DHB, απασχολείται από ΧΡ. Η CHR ήταν μέσω μισθό υποστηρίξει τον κύριο χρηματοδότη της μελέτης? η ιατρική εταιρεία, ωστόσο, δεν άσκησε επιρροή στην όλες τις πτυχές της συμπεριφοράς αυτής της μελέτης. δείγματα ασθενών δόθηκαν ανώνυμα και κωδικοποιούνται από JNMA και Εμπορική Τράπεζα, με βάση μια θεσμική συμφωνία μεταξύ CHR και το Πανεπιστήμιο της Βρετανικής Κολομβίας. CHR ήταν υπεύθυνος για του Fmr1 αναλύσεις δειγμάτων και την απόδοση της ανάλυσης δεδομένων. Το Ίδρυμα Αναπαραγωγικής Ιατρικής ήταν μια δευτερεύουσα χρηματοδότη της μελέτης, και το φυσικό αέριο, καθώς και DHB. είναι μέλη του Διοικητικού Συμβουλίου του Ιδρύματος. NG και DHB είναι επίσης εφευρέτες σε μια σειρά από άλλα διπλώματα ευρεσιτεχνίας των ΗΠΑ, κάποιοι έχουν ήδη ανατεθεί και άλλοι εξακολουθούν να εκκρεμούν, όλα, όμως, που δεν έχουν σχέση με εδώ παρουσιάζονται έρευνας. NG είναι μέτοχος στη γονιμότητα Nutraceuticals, LLC, και ο ίδιος και η DHB λαμβάνουν δικαιώματα από την εν λόγω εταιρεία για τα διπλώματα ευρεσιτεχνίας, οι οποίες περιλαμβάνουν τη θεραπεία της χαμηλής λειτουργικής επάρκειας των ωοθηκών με τη συμπλήρωση της DHEA και άλλα ανδρογόνα. Δεν υπάρχουν περαιτέρω διπλώματα ευρεσιτεχνίας, τα προϊόντα για την ανάπτυξη ή την εμπορία προϊόντων που να δηλώνουν. Κανένα από τα πιθανά ανταγωνιστικά συμφέροντα σημειωθεί εδώ αλλάξει την τήρηση των συγγραφέων σε όλες τις PLoS ONE πολιτικές για την ανταλλαγή δεδομένων και υλικών, όπως περιγράφεται λεπτομερώς σε απευθείας σύνδεση στον οδηγό για τους συγγραφείς. Συν-συγγραφέας Norbert Gleicher, είναι, πράγματι, σήμερα μέλος της Συντακτικής Επιτροπής του PLoS ONE? αλλά δεν είχαν ακόμη προσκληθεί να συμμετάσχουν στο Διοικητικό Συμβούλιο κατά τη στιγμή της υποβολής της παρούσας χειρογράφου. Αυτό δεν αλλάζει την τήρηση των συγγραφέων να PLoS ONE Editorial πολιτικές και κριτήρια.

Εισαγωγή

Αυστριακή συναδέλφους και έχουν αναφερθεί στο παρελθόν σε αυστριακό πληθυσμό των γυναικών με λειτουργική

BRCA1

και

BRCA2

μεταλλάξεις στατιστικά πολύ σημαντικό εμπλουτισμό με το λεγόμενο

χαμηλή

εύθραυστου Χ ψυχική retardation1 (

του Fmr1

) αλληλόμορφα του γονιδίου [1], [2]. Όπως

Οι χαμηλές

αλληλόμορφα που ορίζεται από λιγότερο από 26 CGG επαναλήψεων (CGG

n & lt? 26), και έχουν συσχετιστεί με την πρόωρη πτώση των λειτουργικών αποθεματικό των ωοθηκών, που ονομάζεται επίσης την πρόωρη γήρανση των ωοθηκών (POA) ή απόκρυφη πρωτογενή ωοθηκών ανεπάρκεια (OPOI) [3].

Από

BRCA1

μεταλλάξεις έχουν επίσης συσχετιστεί με POA /OPOI [4], που περιγράφεται παραπάνω ευρήματα στην αυστριακή

BRCA1 /2

φορείς μετάλλαξης οδήγησε στην υπόθεση ότι

BRCA1

επιδράσεις στη λειτουργία των ωοθηκών μπορεί να αντανακλά στην πραγματικότητα

του Fmr1

αποτελέσματα. Σύμφωνα με αυτή την υπόθεση,

BRCA1 /2

μεταλλάξεις είναι, κατ ‘αρχήν, έμβρυο-θανατηφόρο [1], μια πρόταση που υποστηρίζεται από ορισμένους ομόζυγο

ομόλογα BRCA1

/2 ποντίκι, πράγματι, είναι έμβρυο θανατηφόρο , αν και με σημαντική μεταβλητότητα σε φαινότυπο και διάσωση από θνησιμότητα σε ρ53-ηυΙΙ φόντο [5]. Έμβρυα έτσι, δυνητικά, που προορίζονται για τη θνησιμότητα, αν μεταφέρουν επίσης

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα, θα ήταν, ωστόσο, να διασωθούν, οδηγούν στον εμπλουτισμό του

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα τώρα διασωθεί φορείς του

BRCA1

/2 μεταλλάξεις, όπως παρατηρήθηκε στην αυστριακή γυναίκες [1], [2].

Αυτή η υπόθεση, επίσης, για πρώτη φορά, προσφέρεται μια εξήγηση για τη λεγόμενη «

BRCA

παράδοξο «, το οποίο έλαβε το όνομά της από τις αντιφατικές παρατηρήσεις που

BRCA1 /2

ανεπαρκή τα καρκινικά κύτταρα πολύ γρήγορα πολλαπλασιάζονται, ενώ η

BRCA1 /2

ελλιπή ως έμβρυα πάσχουν από ελαττώματα πολλαπλασιασμό (και , ενδεχομένως, ως εκ τούτου, να υποκύψει σε έμβρυο θνησιμότητα) [5]. Σε ζωικά μοντέλα, π-53-nullizygosity μπορεί να σώσει

BRCA1

μεταλλαγμένο ποντίκι, αλλά, συχνά, καθυστερεί μόνο θνησιμότητα [6] – [10].

Στους ανθρώπους,

BRCA1

/2 μεταλλάξεις συνδέονται στενά με αυξημένο κίνδυνο για κακοήθειες, συμπεριλαμβανομένου του μαστού και των ωοθηκών [11]. Εάν

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα ήταν να είναι σε θέση να καταστείλει αντι-πολλαπλασιαστικές (και, ως εκ τούτου, έμβρυο-θανατηφόρο) δράση του

BRCA1 /2

μεταλλάξεις, παρέχοντας στους μεταφορείς των

χαμηλό του Fmr1

μεταλλάξεις για να ξεφύγουν από έμβρυο-θνησιμότητα, μόνο

BRCA1

/2 που μεταφέρουν τα έμβρυα θα γεννηθεί. Επίσης, θα φέρουν ένα

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφο, και μεγαλώνουν με κατέστειλε αντι-πολλαπλασιαστικές επιδράσεις (δηλαδή, θα εκφράσουμε μία πολλαπλασιαστική φαινότυπο) και, ως εκ τούτου, να είναι σε κίνδυνο για

BRCA1

/2 -associated καρκίνους. Ο πραγματικός ένοχος για τον κίνδυνο καρκίνου του κάτω από ένα τέτοιο σενάριο θα ήταν, ως εκ τούτου, στην πραγματικότητα είναι η κατασταλτική δράση του

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα στο

BRCA1

/2, μετατροπή αντι-πολλαπλασιαστική σε πολλαπλασιαστικές φαινότυπους [1 ].

Η δυνητική σημασία αυτής της υπόθεσης για την ογκολογία προσέλκυσε παρακολούθηση από τους ερευνητές στην Ολλανδία [12], του Ισραήλ [13] και της Ιταλίας [14]. Και οι τρεις μελέτες, ωστόσο, απέτυχε να επιβεβαιώσει την αυστριακή παρατήρηση του

χαμηλό του Fmr1

εμπλουτισμό αλληλόμορφο ανάμεσα σε φορείς του

BRCA1

της /2 μεταλλάξεις. Ως πιθανή εξήγηση, σημειώσαμε σε συνοδευτικό εκδοτική στην ιταλική μελέτη που διερεύνησε

BRCA1 /2

μεταλλάξεις σε ασθενείς της μελέτης Αυστρίας και της Ιταλίας ήταν εντελώς διαφορετική [15].

Τα αποκλίνοντα αποτελέσματα μεταξύ των αυστριακών και ιταλικά μελέτες, ως εκ τούτου, θα μπορούσε να αντανακλά διαφορετικές

BRCA1

/2 μεταλλάξεις με διαφορετικούς βαθμούς εμβρύου θνησιμότητας.

BRCA1

/2 μεταλλάξεις σε αυτές τις δύο χώρες είναι, πράγματι, είναι γνωστό ότι αποκλίνουν [16]. Ειδικά σχετικά με την ολλανδική μελέτη [12], Verhoog et al ανέφεραν ότι ακόμη και μέσα στην Ολλανδία, σημαντική απόκλιση σε

BRCA1

/2 μεταλλάξεις παρατηρείται ακόμη και σε πολύ μικρές γεωγραφικές περιοχές [17]. Τέλος, η ισραηλινή μελέτη συμμετείχαν σχεδόν αποκλειστικά

μεταλλάξεις BRCA1

/2 ιδρυτή σχετίζεται με τον κίνδυνο καρκίνου σε καταγωγής Ασκενάζι πληθυσμούς [13] και, ως εκ τούτου, ήταν εξ ορισμού διαφορετικό από το

BRCA1

/2 μεταλλάξεις στο αυστριακή πληθυσμούς.

Η πιθανότητα ότι διαφορετικά

BRCA1

/2 μεταλλάξεις μπορεί να παρουσιάζουν διαφορετικούς βαθμούς εξάρτησης με το

του Fmr1

γονίδιο ενδεχομένως υποστηρίζεται επίσης από την τάση προς εμπλουτισμό με

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα μεταξύ των

BRCA1

/2 φορείς μετάλλαξης που παρατηρείται στην ιταλική μελέτη (32,6% έναντι 23,1%) [14]. Μιλώντας κατά μιας τέτοιας εξήγηση, μια πρόσφατη μελέτη, ωστόσο, πρότειναν άλλοι, μη

του Fmr1

-associated μοριακών μηχανισμών ως αιτίες για

BRCA1

-associated POA /OPOI [18].

με το θέμα παραμένει άλυτο, εμείς, ως εκ τούτου, αποφάσισε να διερευνήσει περαιτέρω σε γυναίκες με καρκίνο των ωοθηκών. Η υπόθεση της εδώ παρουσιάζονται μελέτης είναι ότι, δεδομένου του κινδύνου καρκίνου των ωοθηκών συνδέεται με

BRCA1

/2 μεταλλάξεις [11], εάν

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα, πράγματι, είναι αιτιολογικά σχετίζεται με πολλαπλασιαστική

BRCA1 /2

κινδύνους του καρκίνου, (i) των γυναικών με καρκίνο των ωοθηκών, σε γενικές γραμμές, θα πρέπει να επιδείξουν υψηλότερο επιπολασμό

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα από ό, τι έχει αναφερθεί σε καρκίνο χωρίς πληθυσμούς? και (ii)

BRCA1 2

ασθενείς /-θετικό καρκίνο των ωοθηκών θα πρέπει να επιδείξουν περισσότερη

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα από

BRCA1

/2-αρνητικούς ασθενείς.

υλικά και Μέθοδοι

Ο πληθυσμός της μελέτης συμμετείχαν γενετικό υλικό από 86 ασθενείς με καρκίνο των ωοθηκών, για το ποιος κρυοσυντηρηθούν δείγματα DNA φυλάχθηκαν στους -80 ° C στο Πανεπιστήμιο της βρετανικής Κολομβίας, Βανκούβερ του Καναδά.

IRB εγκρίσεις και δείγματα «καταγωγή

Υλικό συμφωνίες μεταφοράς εκτελέστηκαν μεταξύ του Πανεπιστημίου της βρετανικής Κολομβίας και του Κέντρου Ανθρώπινης Αναπαραγωγής (ΕΑΔ) στην πόλη της Νέας Υόρκης, και οι εγκρίσεις για τις μελέτες τόσο από Institutional Review Boards (Πανεπιστήμιο British Columbia, Βανκούβερ του Καναδά, και το Κέντρο Ανθρώπινης Αναπαραγωγής, Νέα Υόρκη, Νέα Υόρκη) έχουν ξεχωριστά λαμβάνονται, συμπεριλαμβανομένων των εξαιρέσεων από τις δύο IRBs να πάρει μεμονωμένες πληροφορημένες συγκαταθέσεις από ασθενείς που ήταν η πηγή των γενετικών υλικών διερευνηθεί γιατί τα δείγματα κωδικοποιήθηκαν, πριν τα δείγματα απεστάλησαν εν μία νυκτί σε ξηρό πάγο από το Βανκούβερ στη Νέα Υόρκη. Κάθε δείγμα περιείχε τουλάχιστον 100 ng DNA σε 5 έως 10 όγκο ul.

Illumina αλληλουχίας των CCGn

Η εξονικό και περιορισμένη συνοδευτικά ιντρονική ακολουθία

BRCA1

/2 ήταν καθορίζεται από το περιφερικό αίμα προέρχεται gDNA μετά την ενίσχυση με τη χρήση της τεχνολογίας Raindance και αλληλουχίας Illumina. Οι προκύπτουσες ακολουθίες ευθυγραμμίστηκαν με την hg19 αναφορά ανθρώπινο γονιδίωμα χρησιμοποιώντας BWA (τόσο ALN και bwasw αλγόριθμοι), και συναρμολογούνται με άβυσσο. Παραλλαγή κλήση έγινε με τη χρήση του mpileup samtools (άβυσσο, bwasw, και ALN) και pindel (ALN μόνο) πακέτα. Προσδιορίζονται παραλλαγές υποβλήθηκαν από έκθεση στο ΚΕΓ. ΚΕΓ: Υποβλήθηκε παραλλαγές ερμηνεύονται και σχολιάζονται χρησιμοποιώντας ονοματολογία HGVS, χρησιμοποιώντας ακολουθίες αναφοράς NM_007294 για

BRCA1

, και NM_000059 για

BRCA2

. Σύμφωνα με τη Σύμβαση βαρέα αρίθμηση cDNA ξεκινά από το Α του κωδικόνιο έναρξης (ATG). Ακολουθίες των χαμηλών περιοχών κάλυψης και της κατηγορίας 1 και 2 μετάλλαξη παραλλαγές ACMG επιβεβαιώθηκαν με προσδιορισμό της αλληλουχίας Sanger. Αυτό το τεστ αναπτύχθηκε και τα χαρακτηριστικά των επιδόσεων του καθορίζεται από το Κέντρο Κλινικής Διαγνωστικό Γονιδιωματική και περαιτέρω επικυρώνονται σε γενετική του καρκίνου Εργαστήριο (BCCA).

MLPA

Η παρουσία ή η απουσία του αριθμού αντιγράφων διαφορές στην

BRCA1

/2 γονίδια ή τμήματα αυτών, προσδιορίστηκαν μέσω Multiplex πρόσδεση εξαρτώμενη Probe Amplification (MLPA) σύμφωνα με το πρωτόκολλο του κατασκευαστή (P002-C1, P090-Α3, MRC-Ολλανδία, Άμστερνταμ). Η ανάλυση των προκυπτόντων προϊόντων ενίσχυσης πραγματοποιήθηκε χρησιμοποιώντας ένα ΑΒΙ 3730 DNA Analyzer και το σχετικό λογισμικό ανάλυσης. Μεγάλες προσθήκες κλίμακας και τις διαγραφές που βρίσκονται εκτός των περιφερειών που αξιολογούνται από τις επιμέρους ανιχνευτές MLPA δεν είναι ανιχνεύσιμες με τη μέθοδο αυτή. Γενετικές παραλλαγές που βρίσκονται εντός θέσεις δέσμευσης ατομική ανιχνευτής μπορεί να οδηγήσει σε ψευδώς θετικά αποτελέσματα MLPA. Ενιαία εξόνιο διαγραφές ανεξάρτητα επιβεβαιώνονται.

BRCA1

ακολουθία αναφοράς: NM_007294.

αλληλουχία BRCA2

αναφορά NM_000059.

Αυτό το τεστ αναπτύχθηκε και τα χαρακτηριστικά των επιδόσεων του καθορίζεται από MRC-Ολλανδία (Άμστερνταμ). Επιπλέον, αυτό το κιτ δοκιμής με την ένδειξη «μόνο για ερευνητικούς σκοπούς.»

Τα δείγματα αρχικά σταλμένο ανώνυμα με τους κωδικούς αναγνώρισης. Μόλις

του Fmr1

αποτελέσματα δοκιμών είχαν ληφθεί, κλινικές πληροφορίες σε σχέση με κάθε δείγμα διαβιβάστηκε από το Βανκούβερ έως τη Νέα Υόρκη, η οποία περιελάμβανε

BRCA1

και

BRCA2

κατάσταση, τον τύπο της ωοθηκών κακοήθεια και το στάδιο της νόσου.

Μόλις δείγματα ελήφθησαν στη Νέα Υόρκη, είχαν αποθηκευθεί αμέσως στους -80 ° C μέχρι τον ποσοτικό προσδιορισμό με εμπορική δοκιμασία για CGG

ν του

του Fmr1

γονίδιο (LabCorp, Burlington, North Carolina), όπως αναφέρθηκε προηγουμένως [3]. Εν ολίγοις, δεν ερμηνεύσιμα αποτελέσματα λήφθηκαν σε 6/86 δείγματα υποβάλλονται, αφήνοντας 80 ασθενείς με καρκίνο των ωοθηκών στη μελέτη για ανάλυση. CGG

n αναφέρθηκε για δύο αλληλόμορφα. Ατομική μεταλλάξεις που περιγράφονται όπως αναφέρθηκε προηγουμένως βασίζεται σε μια κανονική CGG

n φάσμα 26-34. Αλληλόμορφα παρακάτω CGG

n = 26 ήταν, ως εκ τούτου, θεωρείται ότι

χαμηλή

[3]. Οι γυναίκες με δύο αλληλόμορφα σε φυσιολογικά όρια θεωρούνται φυσιολογικά (

κανόνας

)? εκείνοι με ένα αλληλόμορφο σε κανονική και μία εκτός του κανονικού εύρους είναι ετερόζυγο (

het

) και εκείνοι με δύο αλληλόμορφα εκτός του κανονικού εύρους είναι ομόζυγη (

hom

). Γονότυπους στη συνέχεια υποδιαιρούνται περαιτέρω σε υπο-γονότυπους με βάση την

χαμηλή

ή

υψηλή

(CGG

n & gt? 34). Αλληλόμορφα

Στη συνέχεια, ίδρυσε την επικράτηση του

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα για όλη την ομάδα του καρκίνου των ωοθηκών και σε σύγκριση με τον έλεγχο των πληθυσμών χωρίς γνωστή κακοήθεια, έχουν αναφερθεί στο παρελθόν στην βιβλιογραφία. Σε μια δεύτερη ανάλυση μπορούμε συνέχεια συγκρίνεται ο επιπολασμός της

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα σε ασθενείς με καρκίνο των ωοθηκών, είτε με είτε χωρίς

BRCA1

/2 μεταλλάξεις. Και, επιπλέον, επανέλαβε την ανάλυση μόνο για λειτουργικά ογκογόνο

BRCA1

της /2 μεταλλάξεις.

Οι στατιστικές αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση IBM SPSS στατιστικές έκδοση 21. Οι συνεχείς μεταβλητές εκφράσθηκαν ένα μέσο ± τυπική απόκλιση. Κατηγορικές μεταβλητές εκφράστηκαν ως μετρήσεις (ποσοστό). Τα αποτελέσματα ήταν cross-πίνακα και δοκιμή πλατεία Chi χρησιμοποιήθηκε για τη σύγκριση διαφορετικών κατανομών.

Αποτελέσματα

Ικανοποιητική

του Fmr1

αποτελέσματα ελήφθησαν από 80/86 δείγματα. Ο Πίνακας 1 συνοψίζει τα χαρακτηριστικά των ασθενών για αυτές τις 80 ασθενείς.

Η

σχήματα 1α (κάτω

του Fmr1

αλληλόμορφο) και 1β (υψηλότερη αλληλόμορφο) αποδεικνύουν την CGG

n διανομής για το σύνολο του ασθενή κοόρτης (σημαίνει 27,45 ± 3,62 και 31,59 ± 4,14 CGGs, αντίστοιχα).

Η

Χρησιμοποιώντας προηγουμένως σημειωθεί συντομογραφίες για την κανονική (

κανόνας

), ετερόζυγη (

het

) και ομόζυγη (

hom

) αλληλόμορφα, τα Σχήματα 1α και β, ως εκ τούτου, να αποδείξει κυρίως

κανόνας

γονότυπους, και πιο

het-νόρμα /χαμηλή

από

het νορμάλ /υψηλής

υπο-γονότυπους.

Η πλειοψηφία των όγκων των ωοθηκών (60/80, 75,0%) ήταν ορώδες όγκους υψηλού βαθμού (Πίνακας 1). Το υπόλοιπο προκειμένου είχαν σαφή κυττάρων (9/80, 11,3%), endometroid (6/80, 7,5%) και ορώδες όγκους χαμηλής ποιότητας (5/80, 6,3%). Αυτοί οι τύποι όγκων εμφανίστηκαν ονομαστικά διαφορετικά στη διανομή των

του Fmr1

γονότυπους /υπο-γονότυπους (2 σχέδια), αλλά παρατηρούνται διαφορές δεν ήταν στατιστικά σημαντική (Pearson Chi-Square 6.872? Df 9, Ρ = 0,65, NS) .

Η

Μεταξύ 80 ασθενών με καρκίνο για τους οποίους

ήταν διαθέσιμα του Fmr1

δεδομένα, μόνο 27 (33,8%) ήταν

BRCA

-θετικό, 21 φορείς του

BRCA1

και 6 του

BRCA2

μεταλλάξεις. Ωστόσο, μεταξύ των

BRCA1

/2 μεταλλάξεις που καταγράφονται μεταξύ των ασθενών της ομάδας μελέτης, μόνο 15/80 (18,8%) θεωρήθηκαν λειτουργικά ογκογόνο.

του Fmr1

δεδομένα, ως εκ τούτου, να παρουσιάζονται ξεχωριστά για το σύνολο του

BRCA1

/2 του πληθυσμού και μόνο λειτουργικά ογκογόνο

BRCA1

/2 μεταλλάξεις.

Πίνακας 2 παρουσιάζει την επικράτηση του

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα στον πληθυσμό με καρκίνο των ωοθηκών αυτής της μελέτης σε σύγκριση με την επικράτηση που αναφέρονται στη βιβλιογραφία για άλλους πληθυσμούς.

Η

Ο πίνακας δείχνει τα δεδομένα για όλους

φορείς BRCA1

/2 μετάλλαξη, είτε λειτουργικά ογκογόνο ή όχι. Σε αυτή την ομάδα των ασθενών με καρκίνο των ωοθηκών η επικράτηση του

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα ήταν στην πραγματικότητα ονομαστικά υψηλότερη σε

BRCA1

/2-

αρνητικές

(18/57, 31,6%) από ό, τι

BRCA1

/2-θετική ασθενείς με καρκίνο των ωοθηκών (5/23, 21,7%? P = 0.43)., αν και η διαφορά δεν ήταν στατιστικά σημαντική

Όταν επαναλήφθηκε η ίδια ανάλυση μόνο για 15 λειτουργικά ογκογόνο

BRCA1

/2 μεταλλάξεις, τα αποτελέσματα ήταν πολύ παρόμοια, 2/15 (13,3%)

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα στο

BRCA1

/2 φορείς μετάλλαξης και 21 /65 (32,3%) σε ασθενείς με καρκίνο των ωοθηκών, χωρίς να

BRCA1

/2 μεταλλάξεις (P = 0,21).

Και οι δύο αναλύσεις, ως εκ τούτου, να αποδείξει ότι η συνδυασμένη παρουσία του

BRCA1

/2 μεταλλάξεις και

εμφανίζεται πραγματικά χαμηλές του Fmr1

αλληλόμορφα να συνδέονται λιγότερο συχνά με καρκίνο των ωοθηκών από απουσία και των δύο από αυτές τις μεταλλάξεις στον ίδιο ασθενή.

Όπως ο πίνακας δείχνει περαιτέρω, η μη πληθυσμούς ασθενών καρκίνο στις ΗΠΑ (έλεγχοι για την αυστριακή μελέτη) [1] και της Ιταλίας [14] έδειξε μια σχετική χαμηλή επικράτηση του

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα στο εύρος 20,5 – 23,1%, ενώ οι ισραηλινές έλεγχοι έχουν αναφερθεί σε αποδεικνύουν τόσο πολύ ένα 31,5%

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα. Σε αντίθεση, ακόμη και με εξαίρεση τον επιπολασμό 78,8% των

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα στην αυστριακή μελέτη (πιθανότατα ακόμα και υποαναφορά αφού σπάνια

hom

ασθενείς δεν ήταν υποδιαιρούνται σε αυτή τη μελέτη, επομένως, μη συμπεριλαμβανομένων των

Hom-υψηλή /χαμηλή

και

Hom-χαμηλό ασθενείς /χαμηλή

), η ολλανδική [12] ανέφεραν 35,0% επιπολασμό και τους Ιταλούς [14] μια επικράτηση 32,6% των

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα. Μόνο η ισραηλινή μελέτη [13], ως εκ τούτου, όπως εδώ αναφερόμενα στοιχεία καρκίνο των ωοθηκών, ανέφερε μια πραγματικότητα αντεστραμμένη εικόνα του πιο

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα στο

BRCA1

/2-αρνητικό από ό, τι

BRCA1

/2-θετικές γυναίκες. Η μελέτη αυτή, ωστόσο, είχε περιοριστεί σε μόλις 3 κυρίαρχη μεταλλάξεις ιδρυτής Ασκενάζι για Ασκενάζι εβραϊκοί πληθυσμοί, στο

BRCA1

185delAG, 5382insC, και 617delT στο

BRCA2

.

Εμείς στο παρελθόν ανέφερε ότι οι Αυστριακοί [1] και της Ιταλίας [14] μελέτες δεν συμπίπτουν σε καμία

BRCA1

/2 μεταλλάξεις [15]. Όπως προαναφέρθηκε, η ισραηλινή μελέτη περιορίστηκε σε τρεις

BRCA1

/2 μεταλλάξεις ιδρυτής, κατά κύριο λόγο βρίσκονται μόνο σε καταγωγής Ασκενάζι πληθυσμούς. [13], και η ολλανδική μελέτη δεν αναφέρει

BRCA1

/2 μεταλλάξεις στον πληθυσμό μελέτη τους [12], αν και άλλοι αναφέρθηκαν πολύ σημαντικές περιφερειακές διαφορές στο

BRCA1

της /2 μεταλλάξεις, ακόμη και μέσα σε αυτό σχετικά μικρή χώρα [17]. Το άτομο

BRCA1

/2 μεταλλάξεις εδώ ανέφεραν οι ασθενείς με καρκίνο των ωοθηκών αναφέρονται στον Πίνακα 3, και έδειξε επίσης καμία σημαντική επικάλυψη είτε με αυστριακή ή ιταλική μελέτες.

Η

Συζήτηση

Είμαστε σε αυτή τη μελέτη διερευνήθηκαν σε γυναίκες με διάφορες μορφές καρκίνου των ωοθηκών κατά πόσον η παρουσία του

BRCA1

/2 μεταλλάξεις είχε ως αποτέλεσμα τον εμπλουτισμό του

του Fmr1

μεταλλάξεις χαμηλή, η οποία θα πρότεινα αλληλεπίδραση μεταξύ Αυτά τα δύο γονίδια, για τον καθορισμό ογκογόνο κινδύνου. Εμείς, όμως, δεν ήταν σε θέση να ανιχνεύσει οποιαδήποτε διαφορά στην κατανομή των

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα σε σύγκριση με αναφέρθηκαν διανομές σε κανονική άγονα πληθυσμούς, χωρίς να είναι γνωστό κακοήθειες [1], [12] – [14], ούτε και ήμασταν σε θέση να επιδείξουν μια σχετική αύξηση στο

του Fmr1

αλληλόμορφα χαμηλά σε

BRCA1

/2 φορείς με καρκίνους των ωοθηκών, σε σύγκριση με τους ασθενείς με καρκίνο των ωοθηκών οι οποίοι δεν ήταν

BRCA1

/2 φορείς μετάλλαξης.

Μάλιστα, αυτή η μελέτη απέδειξε στην πραγματικότητα το αντίθετο, μια επικράτηση φυσιολογικό εύρος

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα στο

BRCA1

/2 ασθενείς με καρκίνο των ωοθηκών μετάλλαξη μεταφοράς, αλλά μια τάση υψηλότερη συχνότητα σε ασθενείς με καρκίνο των ωοθηκών που δεν ήταν

BRCA1

/2 φορείς. Είναι ενδιαφέρον, ένα παρόμοιο αποτέλεσμα αναφέρθηκε στην ισραηλινή μελέτη [13], όπου

BRCA1

/2 φορείς μετάλλαξης, η μεγάλη πλειονότητα των οποίων έχουν ήδη διαγνωστεί με καρκίνο του μαστού, έδειξε μόνο σε 24,8%

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα, ενώ τυχαίων ελέγχων αποδεικνύεται

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα στο 31,5% των γυναικών.

Γιατί εδώ αναφερθεί ασθενείς με καρκίνο των ωοθηκών, χωρίς να

BRCA1

/2 μεταλλάξεις και ισραηλινών ελέγχους του παρόντος με μια τέτοια ασυνήθιστα υψηλή, και προφανώς αυξημένη συχνότητα πάνω από μέσο όρο του πληθυσμού, των

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα είναι ασαφής. Σε μια μεγάλη πλειοψηφία,

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα αντιπροσωπεύουν

het-νόρμα /χαμηλή του Fmr1

υπο-γονότυπους. Σε μια μικρή μειοψηφία που επίσης μπορεί να αντιπροσωπεύει είτε

Hom-υψηλή /χαμηλή

ή

Hom-χαμηλή /χαμηλή

υπο-γονότυπους. . Σε συνδυασμό, χαμηλά αλληλόμορφα σπάνια αντιπροσωπεύουν περισσότερο από το 25% περίπου της άγονων γυναικείου πληθυσμού [3]

Εδώ ευρήματα που έχουν αναφερθεί, ωστόσο, δεν προσφέρουν κάποια δυνητικά σημαντικές απαντήσεις: Κάνουν οι υποθέσεις όλο και πιο πιθανό ότι (i) όλοι

BRCA1

/2 μεταλλάξεις στον άνθρωπο είναι σε σημαντικό βαθμό έμβρυο θανατηφόρο? (Ii)

χαμηλό του Fmr1

έμβρυα αλληλόμορφα διάσωσης από το

BRCA

-lethality και (iii) το

του Fmr1

γονίδιο προσφέρει μια οριστική λύση στο «

BRCA

παράδοξο. «

Λαμβάνοντας υπόψη ότι εκατοντάδες

έχουν BRCA1 2

μεταλλάξεις /έχουν αναφερθεί, μεταξύ των οποίων μόνο λίγα λειτουργικά συνδέονται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου, ακόμη και αν θεωρηθεί εδώ παρουσιάζονται τα αποτελέσματα της μελέτης, το ένα, εντούτοις , ακόμα δεν μπορεί να αποκλείει ότι η προηγουμένως πρότεινε υποθετικό αλληλεπίδραση μεταξύ

BRCA1

/2 και

του Fmr1

γονίδια, ομοίως, μπορεί να περιοριστεί μόνο σε επιλεγμένα

BRCA1

/2 μεταλλάξεις.

μια τέτοια εξήγηση θα δείχνουν ότι η αυστριακή μελέτη, που τόσο έντονα πρότεινε μια εμβρυϊκά διαδικασία επιλογής για

χαμηλό του Fmr1

αλληλόμορφα, δυσανάλογα αντανακλούσε μια επιλεκτική έμβρυο θανατηφόρο

BRCA1

/2 του πληθυσμού, που ευνοεί την αλληλεπίδραση με το

του Fmr1

γονίδιο. Σε αντίθετη περίπτωση, η μελέτη αυτή του αυστριακού ασθενείς θα πρέπει να θεωρείται μια στατιστική σύμπτωση, αν και διεξήχθη σε τυφλό τρόπο, με όλα τα

BRCA

και

του Fmr1

αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν στην Αυστρία από την καθιερωμένη εργαστήρια γενετικής στην ακαδημαϊκή κέντρα, ενώ η στατιστική ανάλυση των δεδομένων προσδιορισμού ήταν, ανεξάρτητα, πραγματοποιήθηκε στις ΗΠΑ [1].

ενώ εδώ αναφερόμενη μελέτη, ως εκ τούτου, μειώνει περαιτέρω την πιθανότητα ότι το

BRCA

και

του Fmr1

γονίδια αλληλεπιδρούν με τις επιπτώσεις τους στην επιβίωση του εμβρύου και ογκογόνο κίνδυνο, η μελέτη δεν αποκλείει το ενδεχόμενο να επιλεγεί εμβρύου θανατηφόρο ογκογόνων μεταλλάξεων του

BRCA1 /2

, πράγματι, διασώζονται από

χαμηλή του Fmr1

αλληλόμορφα

.

στο πλαίσιο αυτό, είναι ενδιαφέρον να σημειωθεί ότι μια ποικιλία των μελετών συσχέτισης γονιδιώματος-πάνω από

BRCA1 /2

φορείς μετάλλαξης εντοπίστηκαν πρόσφατα κάποια γενετικούς τόπους, τα οποία επηρεάζουν

BRCA1

/2 που σχετίζεται με τον κίνδυνο καρκίνου του μαστού και των ωοθηκών [19] – [21]. Η σκέψη ότι συγκεκριμένες μεταλλάξεις του

του Fmr1

γονιδίου μπορεί, επιλεκτικά, επηρεάζουν

BRCA1

/2, ως εκ τούτου, είναι νοητή.

BRCA

είναι γενικά θεωρείται γενετική γονίδιο επισκευής, η οποία, όταν μεταλλάσσονται, μεταξύ άλλων αρνητικών επιπτώσεων, μπορεί επίσης να επηρεάσει το Χ-χρωμόσωμα αδρανοποίηση [22]. Λοξή ενεργοποίηση σε γυναίκες με καρκίνο του μαστού και των ωοθηκών, τουλάχιστον εν μέρει, έχει αποδοθεί σε

BRCA1

και σε μικρότερο βαθμό

BRCA2

μεταλλάξεις [23].

Μία επίσης, μπορείτε να υποθέσει περαιτέρω σχετικά με την πιθανή αμφίδρομη επιδράσεις αυτών των δύο γονιδίων πάνω στο άλλο. Για παράδειγμα, ορισμένες

BRCA1

/2 μεταλλάξεις θα μπορούσαν να επηρεάσουν το

του Fmr1

γονίδιο, που βρίσκεται στο Xq27.3, μέσω απενεργοποίησης X-χρωμοσώματος και μεθυλίωση του

του Fmr1

. Η

του Fmr1

γονιδίου, με τη σειρά του, θα μπορούσε να σώσει, όπως υπέθεσε στο παρελθόν [1], επιλέγεται έμβρυο θανατηφόρο

BRCA1

/2 μεταλλάξεις. Τέτοια διαδραστικά αποτελέσματα μεταξύ των δύο γονιδίων θα πρέπει, βέβαια, να οδηγήσει σε πολύ πιο περίπλοκη κλινικών φαινοτύπων. Μελέτες όπως αυτό ή έχουν αναφερθεί στο παρελθόν μελέτες από άλλους [12] – [14]. Ως εκ τούτου, θα ήταν πιθανό να μην είναι σε θέση να ανακαλύψει τέτοιου είδους αλληλεπιδράσεις μεταξύ των δύο γονιδίων

Ένα

του Fmr1

αλληλεπίδραση ως εξήγηση της «

BRCA

παράδοξο», ως εκ τούτου, φαίνεται όλο και πιο απίθανη, αλλά ακόμα δεν μπορεί να αποκλειστεί εντελώς.

Αυτή η μελέτη για πρώτη φορά διερευνήθηκε η υποτιθέμενη

BRCA1 /2

αλληλεπίδραση με

χαμηλό του Fmr1

μεταλλάξεις σε ένα μοντέλο καρκίνου των ωοθηκών. Όλες οι προηγούμενες μελέτες διεξήχθησαν σε ασθενείς με καρκίνο του μαστού. Η χρήση μιας άλλης

BRCA1 /2 συνδέεται

καρκίνο μοντέλο, και ο αρκετά μεγάλος αριθμός των διαθέσιμων δειγμάτων ασθενών αποτελούν τα δυνατά σημεία αυτής της μελέτης. Κάπως της αδυναμία είναι η απουσία των φυλετικών στοιχεία για τους ασθενείς ερευνήθηκε από το

του Fmr1

επικράτηση μετάλλαξη σε ένα βαθμό είναι φυλετικά ορίζεται [24]. Οντάριο του νόμου, ωστόσο, δεν επιτρέπει τη διατήρηση των δεδομένων αυτών σε σχέση με γενετικές μελέτες.

Ευχαριστίες

Η υλικοτεχνική βοήθεια στο συντονισμό των μεταφορών των δειγμάτων και των πληροφοριών μεταξύ των δύο κέντρων στην πόλη της Νέας Υόρκης και το Βανκούβερ από Ying Ng στο Βανκούβερ είναι ευπρόσδεκτη.