Αφηρημένο

Ιστορικό

CagA κυτταρική αλληλεπίδραση μέσω της ενεργοποίησης του μονοπατιού σηματοδότησης ERK μπορεί να είναι ένα σημείο εκκίνησης για την ανάπτυξη του καρκίνου του στομάχου. Η παρούσα μελέτη στοχεύει να αξιολογήσει κατά πόσον τα γονίδια που εμπλέκονται στην ERK οδών κατάντη σηματοδότησης που ενεργοποιούνται από CagA είναι ευαίσθητα γενετικούς δείκτες για καρκίνο του στομάχου.

Μέθοδοι

Στη φάση ανακάλυψης, συνολικά 580 SNPs στο + /-5 kbp 30 υποψήφια γονίδια γονότυπος να εξετάσει τη σύνδεση με το γαστρικό κίνδυνο καρκίνου στην κορεατική Multi-κέντρο καρκίνου Cohort (100 περιστατικό σύνολα καρκίνο του στομάχου case-control). Οι πιο σημαντικές SNPs (ωμά ή παραλλαγμένα

σ

αξία & lt? 0,02) εντοπίστηκαν στην ανάλυση ανακάλυψη ήταν επαναξιολογούνται σε φάση επέκτασης, χρησιμοποιώντας άνευ όρων μοντέλο λογιστικής παλινδρόμησης (400 γαστρικό καρκίνο σύνολα case-control). Σε συνδυασμό αναλύσεις που περιελάμβαναν pooled- και μετα-ανάλυση διεξήχθησαν για να συνοψίσουμε όλα τα αποτελέσματα.

Αποτελέσματα

24 SNPs σε οκτώ γονίδια (ΕΚΚ, Dock180, C3G, Rap1, Src, CrkL, ΜΕΚ και Crk) ήταν σημαντικά σχετίζονται με γαστρικό κίνδυνο καρκίνου στο άτομο SNP αναλύσεις στη φάση ανακάλυψης (

σ

& lt? 0,05). Στην επέκταση αναλύσεις, ERK rs5999749, rs4635002 Dock180 και C3G rs7853122 παρουσίασαν οριακά σημαντικές επιπτώσεις γονίδιο-δόση για καρκίνο του στομάχου. Συνέπεια, η τελική συνδυασμένη ανάλυση παρουσιάζεται η SNPs όπως αυτές σχετίζονται σημαντικά με γαστρικό κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου (OR = 1,56, [95% CI: 1.19 – 2.6], OR = 0,61, [95% CI: 0,43 – 0,87], OR = 0,59, [95 % CI: 0,54 – 0,76], αντίστοιχα)

Συμπεράσματα

τα ευρήματά μας υποδηλώνουν ότι η ERK rs5999749, rs4635002 Dock180 και rs7853122 C3G είναι γενετικούς καθοριστικούς παράγοντες στην γαστρική καρκινογένεση

Αιτιολογική αναφορά.. : Γιανγκ JJ, Cho LY, Ma SH, Ko KP, Shin Α, Choi ΜΕ, et al. (2011) τον ογκογόνο CagA Προωθεί γαστρικός καρκίνος του κινδύνου μέσω της ενεργοποίησης ERK μονοπάτια σηματοδότησης: μια ένθετη μελέτη ασθενών-μαρτύρων. PLoS ONE 6 (6): e21155. doi: 10.1371 /journal.pone.0021155

Επιμέλεια: Patrick Tan, Duke-Εθνικό Πανεπιστήμιο της Σιγκαπούρης Πτυχιούχος Ιατρικής Σχολής, Σιγκαπούρη

Ελήφθη: 22, Ιουλίου του 2010? Αποδεκτές: 21 Μάη, 2011? Δημοσιεύθηκε: 16, Ιουν, 2011

Copyright: © 2011 Yang et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Η μελέτη αυτή υποστηρίχθηκε από μια επιχορήγηση από το Basic Science Πρόγραμμα Έρευνας μέσω του Εθνικού Ιδρύματος Ερευνών της Κορέας (NRF), που χρηματοδοτείται από το Υπουργείο Παιδείας, Επιστημών και Τεχνολογίας [KRF-2007 με 313-E00175] και [NRF-2009-0066258]. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

ελικοβακτηρίδιο του πυλωρού (

Η. pylori

) είναι μια αποδεδειγμένη αιτία της γαστρικής καρκινογένεσης [1]. Παρ ‘όλα αυτά, η απόλυτη δράση της μπορεί να τροποποιηθεί με ατομικούς παράγοντες κινδύνου ευαισθησίας, όπως γενετικές παραλλαγές και

H. pylori

λοιμογόνο χαρακτηριστικά [2], [3]. Κυτταροτοξίνης-αντιγόνο που σχετίζεται με (CagA), ένα

H. pylori

ανοσοπρωτεΐνης, είναι ένας κρίσιμος παράγοντας για την ευαισθησία του κάθε ατόμου και συνδέεται με σοβαρές κλινικές εκβάσεις συμπεριλαμβανομένου του καρκίνου του στομάχου [4], [5], [6]. Σε γαστρικά επιθηλιακά κύτταρα, CagA παρεμβαίνει με ποικίλες οδούς μεταγωγής σήματος, όπως Dock180-Rac1-WAVE-ARP2 /3, C3G-Rap1-BRaf-ΜΕΚ, SOS1-HRAS-Raf1, και Ras-Raf-MEK-ERK σηματοδότηση [3 ], [7], [8], [9]. Σήματα τροποποιήθηκε από CagA προκαλέσουν κυτταρικές αλλαγές, όπως η απόπτωση, τον πολλαπλασιασμό και τη θνησιμότητα των κυττάρων, και να τονωθεί η γαστρική καρκινογένεση [10], [11], [12].

Μεταξύ των πολλών μεταγενέστερων μονοπάτια που ενεργοποιούνται από CagA, το εξωκυτταρικό σήμα -regulated κινάσης (ERK) καταρράκτη είναι μια βασική οδός δεδομένου ότι διαδραματίζει σημαντικό ρόλο στην γαστρική καρκινογένεση. Οι CagA κυτταρικές αλληλεπιδράσεις με Src, SHP2, Crk, CrkL ή GRB2 σχετίζονται σημαντικά με την ενεργοποίηση ERK, και άλλες ποικίλες πρωτεΐνες που εμπλέκονται στην σηματοδότηση CagA είναι στενά συνδεδεμένη με ERK μονοπατιών σήματος [10], [11], [12], [13] . Οι πρωτεΐνες μπορεί να ρυθμίζεται από γονίδια ξενιστή τους? Ως εκ τούτου, γονίδια που κωδικοποιούν πρωτεΐνες που σχετίζονται με την διαδικασία σηματοδότησης CagA και ERK μπορεί να είναι σημαντική για τη γαστρική καρκινογένεση αλλά λίγες μελέτες έχουν εστιάσει σε αυτά γενετικών πολυμορφισμών.

CagA ογκογονικότητα μπορεί να είναι ένα σημείο εκκίνησης για την ανάπτυξη του καρκίνου του στομάχου μέσω ενεργοποίησης το σηματοδοτικό μονοπάτι ΕΚΚ. Αυτές οι μεταγωγές σήματος φαίνεται να τροποποιηθούν από γενετικές παραλλαγές υποδοχής. Έτσι, υποθέσαμε ότι γονίδια που εμπλέκονται στις οδούς κατάντη σηματοδότησης ERK ενεργοποιείται από CagA μπορεί να είναι επιρρεπή γενετικούς δείκτες για τον καρκίνο του στομάχου. Για την αξιολόγηση αυτή την υπόθεση, πραγματοποιήσαμε μια μελέτη γενετικής σύνδεσης πολλαπλών σταδίων που περιλάμβανε 1) φάση ανακάλυψη: μια ανάλυση υποψήφιο γονίδιο που επικεντρώθηκε σε 30 γονίδια, Crk, CrkL, Csk, GRB2, c-Met, NFATC4, PTPN11, SMS, SOS1 , Src, ERK, FAK, ΡΙ_Ογ, KRAS, ΕΡΑ, BRAF, RAF1, MAP2K1, MAP2K3, MAP2K4, MAP2K5, MAP2K6, p21, Dock180, RAC1, RAP1, WAVE, ARP2, Arp3 και C3G, που εμπλέκονται στο σήμα CagA και ERK μονοπάτι μεταγωγής, και 2) φάση επέκτασης, που εξέτασε τις πιο σημαντικές SNPs που εντοπίζονται στην ανάλυση ανακάλυψη.

Μέθοδοι

πληθυσμός Μελέτη

Discovery φάση.

η ανάλυση του γονιδίου υποψήφιος ανακάλυψη ήταν μια μελέτη ένθετα περίπτωση ελέγχου βάσει πληθυσμού εντός της Κορέας Multi-Κέντρο Καρκίνου κοόρτης (KMCC). Από το 1993 έως το 2004, η KMCC προσληφθεί συνολικά 19.688 συμμετέχοντες από τέσσερις αστικές και αγροτικές περιοχές στην Κορέα. Όλοι οι συμμετέχοντες συμπλήρωσαν λεπτομερή ερωτηματολόγια τυποποιημένα από προσωπική συνέντευξη μετά την ενημερωμένη συγκατάθεση. δείγματα αίματος και ούρων συλλέχθηκαν επίσης. Μέσω ρεκόρ δεσμούς με το εθνικό πιστοποιητικό θανάτου, τις ασφάλιση υγείας βάσεις δεδομένων ιατρικά αρχεία και το εθνικό μητρώο καρκίνου, όλοι οι συμμετέχοντες είχαν παθητικά παρακολουθούνται, και πρόσφατα διαγνωστεί περιπτώσεις διαπιστώθηκαν. Λεπτομερείς πληροφορίες σχετικά με την KMCC περιγράφεται αλλού [14]. Τον Δεκέμβριο του 2005, 249 γαστρικό περιπτώσεις καρκίνου που καθορίζονται σύμφωνα με τη Διεθνή Στατιστική Ταξινόμηση των Ασθενειών και Συναφών Προβλημάτων Υγείας 10η Αναθεώρηση (ICD-10, C16) εντοπίστηκαν. Περιπτώσεων που διαγιγνώσκονται πριν από την πρόσληψη (n = 52), χωρίς τα δείγματα αίματος (n = 35), ή ανεπαρκές επίπεδο DNA κάτω των 50 ng /μl (n = 62) αποκλείστηκαν. Χωρίς καρκίνο έλεγχοι συνδυάζεται με την ηλικία (± 5 έτη), το φύλο, κατοικημένη περιοχή, και το έτος εγγραφής. Τέλος, 100 σύνολα των γαστρικών περιπτώσεων καρκίνου και μάρτυρες ορίστηκαν. Φάσης

Επέκταση.

1) Τον Δεκέμβριο του 2008, 95 νέες γαστρικό περιπτώσεων καρκίνου είχαν επιπλέον επιβεβαιωθεί από την KMCC. Αυτές οι περιπτώσεις και 116 περιπτώσεις που εξαιρέθηκαν στην κοόρτη ανακάλυψη οφείλεται σε κατάσταση επικράτηση ή ανεπαρκή συγκέντρωση DNA συμπεριλήφθηκαν στη φάση επέκτασης (n = 211). Χρησιμοποιώντας την ίδια μέθοδο που να ταιριάζουν με την φάση ανακάλυψη, επελέγησαν 211 ελέγχους. 2) Η γαστρική περιπτώσεων καρκίνου ελήφθησαν από δύο πανεπιστημιακά νοσοκομεία στην Κορέα, που ήταν το Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο Chungnam και το Πανεπιστήμιο Hanyang GURI Νοσοκομείο. Από Μάρτιος 2002 – Σεπτέμβριος 2006, συνολικά 490 ασθενείς με γαστρικό καρκίνο είχαν διαγνωστεί πρόσφατα στα νοσοκομεία. επιδημιολογικά δεδομένα τους και δείγματα φλεβικού ολικού αίματος συλλέχθηκαν κατά την στιγμή της διάγνωσης ή πριν από χειρουργική επέμβαση γαστρικής καρκίνο. Μεταξύ αυτών, 189 περιπτώσεις με επαρκή δείγματα DNA και ενημέρωσε συναινεί επίσης περιλαμβάνονται στο σύνολο επέκτασης. Επίσης, 189 έλεγχοι με βάση την κοινότητα αντιστοιχήθηκαν με την ηλικία (± 5 έτη) και το φύλο από τα θέματα KMCC εγγραφεί μετά το 2000.

Ηθική Δήλωση

Τα πρωτόκολλα μελέτης για τη μελέτη KMCC, το νοσοκομείο με έδρα τη μελέτη και την τρέχουσα μελέτη ασθενών-μαρτύρων ένθετη εγκρίθηκαν από τις θεσμικές πίνακες αξιολόγησης (IRB) του Εθνικού Πανεπιστημίου της Σεούλ Νοσοκομείο και το Εθνικό Κέντρο Καρκίνου της Κορέας (H-0110-084-002 και C-0603-161-170) και από την επιτροπή δεοντολογίας του Πανεπιστημιακού Νοσοκομείου Hanyang (IRB αρ. 2003-4).

Gene και SNP επιλογής

Μέσα από βιβλιογραφική ανασκόπηση, μπορούμε αταξινόμητους 30 υποψήφια γονίδια που μπορεί να εμπλέκονται στην CagA μονοπάτι μεταγωγής σήματος συνδέεται με ERK κατάντη σηματοδότησης με άμεση αλληλεπίδραση με CagA ή δευτερογενή στοργή σε CagA γενετικές αλληλουχίες [3], [7], [8], [9], [10], [11], [12]. Τα 30 υποψήφια γονίδια έχουν ως εξής: ν-Crk ιού σαρκώματος CT10 ογκογονιδίου ομόλογο (

CRK

)? v-Crk σαρκώματος ιό CT10 ογκογονίδιο ομόλογο (γρίπη) -όπως (

CRKL

)? c-Src κινάσης τυροσίνης (

CSK

)? αυξητικού παράγοντα πρωτεΐνη 2 υποδοχέα-δεσμευμένο (

GRB2

)? Met πρωτο-ογκογονίδιο (C-

MET

)? πυρηνικού παράγοντα των ενεργοποιημένων Τ-κυττάρων, κυτταροπλασματική, καλσινευρίνης εξαρτώμενη 4 (

NFATC4

)? πρωτεϊνικής φωσφατάσης τυροσίνης, τύπου μη-υποδοχέα 11 (

PTPN11

)? σπερμίνη συνθάσης (

SMS

)? Ο γιος του sevenless ομόλογο 1 (

SOS1

)? v-Src σάρκωμα (Schmidt-Ruppin Α-2) ιικό ογκογονίδιο ομόλογο (

SRC

)? άλκες που σχετίζονται με την κινάση της τυροσίνης (

ERK

)? κινάση εστιακής προσκόλλησης 1 (

ΡΑΚ

)? φωσφολιπάση C-γ (

ΡΙ_Ογ

)? v-Ki-Ras2 Kirsten σαρκώματος αρουραίου ιικό ογκογονίδιο ομόλογο (

KRAS

)? RAS νευροβλάστωμα ιογενή (v-ras) ογκογονίδιο ομόλογο (

NRAS

)? v-raf σαρκώματος ποντικού ογκογονίδιο ιού ομόλογο Β1 (

BRAF

)? v-raf-1 λευχαιμίας των ποντικών ογκογονίδιο ιού ομόλογο 1 (

RAF1

)? που ενεργοποιείται από μιτογόνο πρωτεΐνη κινάση κινάση 1 (

MAP2K1

)? που ενεργοποιείται από μιτογόνο πρωτεΐνη κινάση κινάση 3 (

MAP2K3

)? που ενεργοποιείται από μιτογόνο πρωτεΐνη κινάση κινάση 4 (

MAP2K4

)? που ενεργοποιείται από μιτογόνο πρωτεΐνη κινάση κινάση 5 (

MAP2K5

)? που ενεργοποιείται από μιτογόνο πρωτεΐνη κινάση κινάση 6 (

MAP2K6

)? εξαρτώμενη από κυκλίνη αναστολέα κινάσης 1Α (

p21

)? αναθέτη του κυτταροκίνηση 1 (

Dock180

)? ras σχετίζονται C3 τοξίνη botulinum υπόστρωμα 1 (

RAC1

)? RAP1A μέλος της RAS ογκογονιδίου οικογένειας (

RAP1

)? ΗΤΑΝ οικογένεια πρωτεϊνών, μέλος 1 (

WAVE

)? ARP2 ακτίνη πρωτεΐνη που σχετίζεται με 2 ομόλογο (

ARP2

)? ARP3 ακτίνη πρωτεΐνη που σχετίζεται με 3 ομόλογο (

Arp3

)? παράγοντα ανταλλαγής νουκλεοτιδίων Rap γουανίνης (GEF) 1 (

C3G

).

Γονοτυπικές

φάσης Discovery.

Γονοτυπικές έγινε με τη χρήση του γονιδιώματος σε επίπεδο ανθρώπινου SNP Array 5,0 σύμφωνα με το πρότυπο πρωτόκολλο που συνιστάται από τις οδηγίες του κατασκευαστή [15]. Πριν γονοτυπική, οι συγκεντρώσεις του γενωμικού DNA για όλα τα άτομα της μελέτης μετρήθηκαν χρησιμοποιώντας ένα φασματοφωτόμετρο (NanoDrop ND-1000, NanoDrop Technologies). Για ποσοτικό προσδιορισμό κάθε άτομο, 250 ng γενωμικού DNA υποβλήθηκε σε πέψη με ένα ένζυμο περιορισμού (NSP Ι ή Sty Ι). Αν και διαλογή ένα σύνολο 580 SNPs εντός +/- 5 kbp από τις θέσεις του γονιδίου-στόχου 30, 103 πολυμορφισμοί αποκλείστηκαν λόγω ενός ρυθμού κλήση SNP μικρότερο του 95% ή μία τιμή HWE λιγότερο από 0.0001. Επειδή το γονιδίωμα ολόκληρη την ανθρώπινη SNP Array 5.0 κατασκευάστηκε με βάση ένα Καυκάσιο πληθυσμό, 115 SNPs δεν πληρούν τα κριτήρια της MAF & lt? 0,05 σε Ασιάτες και επίσης εξαιρούνται. Επιπρόσθετα, 20 περιπτώσεις και 14 μάρτυρες εξαιρέθηκαν λόγω ανεπαρκών γενωμικού DNA (& lt? 250 ng), το φύλο ασυμφωνία ή κακή προσδιορισμού του γονότυπου (& lt? 90%). Τέλος, 362 SNPs σε 30 γονίδια (ποσοστό του γονότυπου 99,5%) ήταν ο γονότυπος σε 81 περιπτώσεις και 85 ελέγχους. Οι εικόνες σύμπλεγμα έντασης σήματος εξετάστηκαν για όλους τους SNPs

φάσης επέκτασης

Επτά SNPs με ωμά ή παραλλαγμένα

σ

αξία & lt?.. 0.02 (rs5999749, rs9418677, rs4635002, rs10901081, rs7853122, rs530801, rs747182) εντοπίστηκαν στην ανάλυση ανακάλυψη ήταν ο γονότυπος χρησιμοποιώντας τη Δοκιμασία Illumina VeraCode GoldenGate με BeadXpress σύμφωνα με το πρωτόκολλο του κατασκευαστή (Illumina, San Diego, CA, USA) [16]. Για να εξασφαλιστεί η αξιοπιστία των δύο μεθόδων προσδιορισμού του γονότυπου, 135 δείγματα (59 περιπτώσεις και 76 έλεγχοι) ήταν ο γονότυπος δύο φορές τόσο από το γονιδίωμα σε επίπεδο ανθρώπινου SNP Array 5.0 και η δοκιμασία Illumina VeraCode GoldenGate, και το ποσοστό αντιστοιχίας ήταν & gt? 98,2%. Από τις 7 SNPs, rs9418677 είχε αποκλειστεί λόγω ενός ρυθμού κλήσης SNP & lt? 95%. Δύο περιπτώσεις και 40 έλεγχοι με χαμηλή διαθεσιμότητα DNA (n = 15) ή συντελεστής προσδιορισμού του γονότυπου & lt? 90% (n = 27) αποκλείστηκαν επίσης στην ανάλυση. Τέλος, έξι SNPs σε πέντε γονίδια (ρυθμός προσδιορισμού του γονότυπου του 99,1%) αναλύθηκαν σε 398 περιπτώσεις και 360 μάρτυρες στη φάση επέκτασης.

H. pylori

να ανίχνευση CagA

H. κατάστασης της λοίμωξης και CagA pylori

οροθετικότητας αξιολογήθηκαν χρησιμοποιώντας προσδιορισμό ανοσοστυπώματος, Helico Blot 2.1 ™ (MP Biomedicals Ασίας-Ειρηνικού, Σιγκαπούρη). Helico Blot 2.1 ™ κιτ ανέφεραν ευαισθησία 99% και για τα δύο

H.pylori

και CagA οροθετικότητας και ειδικότητα 98% για

H. pylori

και 90% για CagA οροθετικότητας [17].

Η στατιστική ανάλυση

Η ισορροπία Hardy-Weinberg (HWE) στην ομάδα ελέγχου εκτιμήθηκε με την ακριβή δοκιμή του Fisher με ένα cut- off επίπεδο HWE & lt?. 0.0001

στον πρωτογενή σάρωση στο σύνολο ανακάλυψη, η συσχέτιση μεταξύ των επιμέρους SNPs και γαστρικό κίνδυνο καρκίνου αξιολογήθηκε με βάση τόσο ωμά και παραλλαγμένα

σ

-τιμές χρησιμοποιώντας το LRT με 1 βαθμό ελευθερίας στην (πρόσθετο) μοντέλο τάση. Η δοκιμή τάση υποθέτει ένα φαινόμενο δόσης-απόκρισης με έναν αυξανόμενο αριθμό παραλλαγής αλληλόμορφα. Παραλλαγμένο

σ

-τιμές υπολογίστηκαν από 100.000 εξετάσεις μετάθεση. Με βάση το μοντέλο πρόσθετο, γαστρικό κίνδυνο καρκίνου του υπολογίστηκε ως λόγοι πιθανοτήτων (OR) και 95% διαστήματα εμπιστοσύνης (ΠΙ) με τη χρήση άνευ όρων μοντέλο λογιστικής παλινδρόμησης για την προσαρμογή των παραγόντων κινδύνου που το κάπνισμα (ποτέ

vs.

Ποτέ) ,

H. πυλωρού

μόλυνσης (θετική

vs.

αρνητική) και CagA οροθετικότητας (θετική

vs.

αρνητική). Το ποσοστό εσφαλμένης ανακάλυψη Benjamini-Hochberg (BH-FDR) διορθώνεται

σ

-τιμές της κάθε SNP υπολογίστηκε για την αποφυγή ψευδών συνεργασία με ψευδώς θετικά αποτελέσματα [18].

Στη φάση επέκτασης, οι πιο σημαντικές SNPs με ωμά ή παραλλαγμένα

σ

αξία & lt? 0,02 εντοπίστηκαν στη φάση ανακάλυψης ήταν επανεκτιμηθεί. Με βάση το μοντέλο πρόσθετο, γαστρικό κίνδυνο καρκίνου εκτιμήθηκε ως ΕΑΠ και 95% ΚΠ χρησιμοποιώντας άνευ όρων μοντέλο λογιστικής παλινδρόμησης για την προσαρμογή των παραγόντων κινδύνου που το κάπνισμα (ποτέ

vs.

Ποτέ),

H. πυλωρού

μόλυνσης (θετική

vs.

αρνητική) και CagA οροθετικότητας (θετική

vs.

αρνητική). Για να συνοψίσουμε τα αποτελέσματα από την ανακάλυψη και αναλύει την επέκταση, δεδομένων συγκέντρωση και μετα-ανάλυση διεξήχθησαν. Οι συνοπτικές ΕΑΠ και 95% ΚΠ υπολογίστηκαν χρησιμοποιώντας ένα μοντέλο σταθερής αποτέλεσμα και ετερογένεια αξιολογήθηκε από τα στατιστικά στοιχεία Cochran Q [19].

Όλες οι στατιστικές αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση του λογισμικού SAS έκδοση λογισμικού 9.1 (SAS Institute, Cary, Βόρεια Καρολίνα) και plink έκδοση λογισμικού 1.06 (https://pngu.mgh.harvard.edu/purcell/plink) [20]. Μετα-αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση του λογισμικού STATA έκδοση 10 (Stata, College Station, TX).

Αποτελέσματα

Ο Πίνακας 1 συνοψίζει τα βασικά χαρακτηριστικά των συμμετεχόντων σε κάθε φάση. Γαστρικό περιπτώσεις καρκίνου έδειξαν σημαντικά υψηλότερα ποσοστά CagA οροθετικότητας (

σ

= 0.03 στη φάση ανακάλυψης,

σ

= 0,09 σε φάση επέκτασης και

σ

= 0,02 μεταξύ των συνολικών θεμάτων) .

Η. pylori

λοίμωξη, VacA οροθετικότητας και το κάπνισμα ήταν επίσης υψηλότερα μεταξύ γαστρικό περιπτώσεις καρκίνου (Πίνακας 1).

Η

Στην πρωτογενή σάρωση του συνόλου ανακάλυψη, από τα 362 SNPs που επιλέγονται από CagA που σχετίζονται με γονίδια στο μονοπάτι μεταγωγής σήματος, 24 SNPs σε οκτώ γονίδια, ERK, Dock180, C3G, Rap1, Src, CrkL, ΜΕΚ και Crk, συσχετίζονταν σημαντικά με γαστρικό κίνδυνο καρκίνου στην ενιαία ανάλυση SNP (

ρ

& lt ? 0,05). Σύμφωνα με τη δοκιμή 100.000 μετάθεση, ERK rs5999749 και rs9418677 Dock180 παρουσίασε μια ισχυρότερη συσχέτιση με καρκίνο του στομάχου (

σ

& lt? 0,01). Αυτοί οι SNPs έδειξε σημαντικές επιδράσεις του γονιδίου-δόσης στο γραμμικό τεστ τάσης και ήταν σημαντικά σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο γαστρικού καρκίνου (OR = 2,83, [95% CI: 1,42 – 5,65] για ERK rs5999749? OR = 1,90, [95% CI : 01/18 – 03/05] για Dock180 rs9418677). Εκτός από την rs9418677 Dock180 και Rap1 rs17028287, οι περισσότεροι SNPs προς τα κάτω από CagA-Crk σηματοδότησης (Dock180, C3G, Rap1 και ΜΕΚ) ήταν σημαντικά σχετίζεται με μειωμένο κίνδυνο γαστρικού καρκίνου (Πίνακας 2).

Η

η φάση επέκτασης, όλες οι ενώσεις μεταξύ των επιλεγμένων SNPs και γαστρικό κίνδυνο καρκίνου ήταν σχετικά εξασθενημένα. ERK rs5999749, rs4635002 Dock180 και rs7853122 C3G έδειξε σημαντική επίδραση του γονιδίου-δόση για καρκίνο του στομάχου (OR = 1,40, [95% CI: 1,04 – 1,89]? OR = 0,65, [95% CI: 0,44 – 0,94]? OR = 0,61, [95% CI: 0,46 – 0,81], αντίστοιχα). Στην τελική συνδυασμένη ανάλυση που περιελάμβανε την ανακάλυψη και την επέκταση αναλύσεις, οι εκτιμήσεις κινδύνου των ERK rs5999749 συσχετίστηκε σημαντικά με τον καρκίνο του στομάχου, τόσο η συγκεντρωτική ανάλυση και μετα-ανάλυση (OR = 1,57, [95% CI: 1.20 – 2.7]? Ή = 1.56, [95% CI: 1.19 – 2.6], αντίστοιχα). Επιπλέον, Dock180 rs4635002 και rs7853122 C3G έδειξαν σημαντικά μειωμένο κίνδυνο του καρκίνου του στομάχου και στις δύο αναλύσεις (OR = 0,60, [95% CI: 0,42 – 0,84], OR = 0,61, [95% CI: 0,43 – 0,87] για Dock180 rs4635002? Ή = 0,59, [95% CI: 0,45 – 0,77], OR = 0,59, [95% CI: 0,45 – 0,76] για C3G rs7853122). Δεν υπήρχε ετερογένεια μεταξύ των μελετών (δοκιμή Cochran Q,

σ

& gt? 0,05) με εξαίρεση rs10901081 (

σ

= 0,040) (Πίνακας 3)

Η

Συζήτηση

σε πολλαπλών σταδίων μας γενετική ανάλυση, τρεις SNPs, rs5999749 ΕΚΚ, rs4635002 Dock180 και rs7853122 C3G, έδειξε ισχυρή ενώσεις με καρκίνο του στομάχου και μπορεί να είναι σημαντικό ρυθμιστικούς παράγοντες στην CagA μονοπάτι μεταγωγής σήματος.

κινάσης εξωκυτταρικού σήματος ρυθμιζόμενη (ΕΚΚ), επίσης γνωστή ως ενεργοποιείται από μιτογόνο κινάσης πρωτεΐνης (ΜΑΡΚ), είναι ένα σημαντικό σημείο ολοκλήρωσης για πολλαπλά κυτταρικά σήματα που ρυθμίζει διάφορες ογκογόνο απαντήσεις. Το σηματοδοτικό μονοπάτι ERK αλληλεπιδρά με έναν σημαντικό αριθμό υποστρωμάτων, συμπεριλαμβανομένων των πρωτεϊνικών κινασών, φωσφατασών, κυτταροσκελετικές συστατικά, ρυθμιστές της απόπτωσης, και μια σειρά άλλων μορίων σηματοδότησης που σχετίζονται με [21]. σηματοδότηση CagA είναι ένα από τα ρεύματα που εμπλέκονται στον καταρράκτη σήματος ERK. Πολυάριθμες μελέτες έχουν αναφέρει ότι CagA θετικά

H. pylori

μπορεί να ενεργοποιήσει ERK σε γαστρικά επιθηλιακά κύτταρα για την προώθηση ακατάλληλη κυτταρικές λειτουργίες [11], [21], [22], [23]. Επιπλέον, η αλληλεπίδραση μεταξύ των πρωτεϊνών CagA και μεταγωγής σήματος προωθεί σηματοδότηση ERK σε συνδυασμό με Ras, ΜΕΚ και NF-kB, που επάγει γαστρική καρκινογένεση. Σε κυτταρικούς μηχανισμούς, ERK φαίνεται να εμπλέκεται σε μια ευρεία ποικιλία κυτταρικών διεργασιών. Έτσι, το γονίδιο υποδοχής του ERK πρωτεΐνης μπορεί να είναι περισσότερο σημαντική για τον καθορισμό της έκφρασης της πρωτεΐνης και την ικανότητα. Τα αποτελέσματα αυτής της μελέτης δείχνουν ότι η ERK rs5999749 είναι κατά κύριο λόγο επιλέγεται στην ανάλυση SNP με βάση και διατηρεί ισχυρή συσχέτιση της με γαστρικό καρκίνο στο τελικό συνδυασμένο αναλύσεις. Αυτό υποστηρίζει ότι η γενετική επίδραση μπορεί να διαδραματίσει κρίσιμο ρόλο στη γαστρική καρκινογένεση ίσο με το επίπεδο δραστηριότητας της πρωτεΐνης του σε κυτταρικό στάδιο.

Dock180, συνώνυμη με αναθέτη της κυτοκίνησης 1, είναι μία 180 kDa πρωτεΐνη κατάντη-συνδυάζοντας μόριο του Crk και up-ρυθμιστής της Rac1 [24]. Ρυθμίζει διάφορες λειτουργίες, συμπεριλαμβανομένης της διασποράς κυττάρου, κυτταρική μετανάστευση, και η ακτίνη του κυτταροσκελετού οργάνωση μέσω της ενεργοποίησης του Rac1 [24], [25], [26], [27], [28]. Αυτή η πρωτεΐνη είναι μια από τις Crk-κατάντη πρωτεΐνες που εμπλέκονται στον καταρράκτη του CagA και Crk σηματοδότηση μέσω του μονοπατιού Crk-Codk180-Elmo [9]. Ομοίως, C3G γνωστή ως παράγοντας Rap γουανίνη ανταλλαγής νουκλεοτιδίων (GEF) 1 (RAPGEF1) και αλληλεπιδρά με την Crk [29]. Προηγούμενες μελέτες απέδειξαν ότι η σηματοδότηση Crk-C3G-Rap1 μπορεί να ενεργοποιήσει τον καταρράκτη ERK και επάγουν την απόπτωση, την κυτταρική ανάπτυξη, μετανάστευση, προσκόλληση και τη θνησιμότητα [30], [31], [32]. Στην ανθρώπινη καρκινογένεση, το γονίδιο C3G φαίνεται να παίζει έναν κρίσιμο ρόλο από μόνη της. Αλλοίωση της γενετικής δραστηριότητας C3G μέσω ενίσχυσης ή μεθυλίωση σχετίζεται με αρκετές καρκίνους όπως του πνεύμονα, το γαστρεντερικό και γυναικολογικών καρκίνων [33], [34]. Αν και δεν είναι ακριβώς γνωστά αν οι γενετικές παραλλαγές του γονιδίου Dock180 και C3G συνδέονται με γαστρική καρκινογένεση, η μελέτη μας προτείνει διάφορα SNPs σε αυτά τα γονίδια, ειδικά rs4635002 και rs7853122, συνδέονται σημαντικά με κίνδυνο γαστρικού καρκίνου, και έτσι μπορεί να είναι ένας ευαίσθητος γονίδιο στην ανάπτυξη του καρκίνου του στομάχου.

Με βάση τα σημερινά αποτελέσματα και την επανεξέταση των κυτταρικών μηχανισμών [3], [9], [11], [21], [22], [23], [24], [30], CagA ογκογονικότητα που προκαλείται από ενεργοποίηση του μονοπατιού ERK σήματος μπορεί να Συμπεραίνουμε (Σχήμα 1). Η αλληλεπίδραση CagA με μόρια σύνδεσης όπως Src, Crk, GRB2 και SHP-2 διεγείρει τα κατάντη σήματα στον καταρράκτη ERK συνδέεται με παρεκκλίνουσα κυτταρικές λειτουργίες που οδηγεί σε γαστρική καρκινογένεση. Κατά τη διάρκεια αυτής της διαδικασίας, οι γενετικές επιδράσεις της ERK, Dock180 και C3G μπορεί να παίξει κρίσιμο ρόλο ίση με πρωτεΐνη δραστηριότητές τους. Αυτά τα αποτελέσματα παρέχουν υποστήριξη για τη γενετική και κυτταρική σημασία αυτών των μορίων.

Ο CagA αλληλεπίδραση μπορεί να τονώσει τα κατάντη σήματα στον καταρράκτη ERK συνδέεται με παρεκκλίνουσα κυτταρικές λειτουργίες που οδηγεί σε γαστρική καρκινογένεση. Σε αυτή τη διαδικασία, οι γενετικές επιδράσεις της ERK, Dock180 και C3G παίζουν κρίσιμους ρόλους ίσο με τα επίπεδα δραστηριότητας της πρωτεΐνης τους σε κυτταρικό στάδιο.

Η

γενετική ανάλυση μας παρουσίασε εύλογες αποδείξεις για γενετικές παραλλαγές της μεταγωγής σήματος ERK οδός ενεργοποιείται από CagA, αλλά αρκετοί περιορισμοί πρέπει να σημειωθεί. Πρώτον, ο αριθμός των συμμετεχόντων στη μελέτη ήταν ανεπαρκής για να εξασφαλίσει στατιστική δύναμη να εκτιμηθεί η ακριβής σχέση μεταξύ επιλεγμένων SNPs και γαστρικό κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Δεύτερον, λόγω του μικρού μεγέθους του δείγματος και η έλλειψη των ασθενών καρδιακής γαστρικό καρκίνο (λιγότερο από 5%), δεν θα μπορούσαμε να διεξάγει στρωματοποιημένη ανάλυση σύμφωνα με γαστρικό καρκίνο τύπου, καρδιακή

vs.

Μη καρδιακό. Ως εκ τούτου, τα αποτελέσματα πρέπει να ερμηνεύονται με προσοχή.

Αυτή η μελέτη δείχνει ότι τα γονίδια που εμπλέκονται στην οδό μεταγωγής σήματος ERK ενεργοποιούνται από CagA μπορούν να τροποποιήσουν τον κίνδυνο του καρκίνου του στομάχου. ERK, Dock180 και C3G γονίδια μπορεί να παίζουν σημαντικό ρόλο στην ανάπτυξη του καρκίνου του στομάχου. Μελέτες αναπαραγωγής σε άλλους πληθυσμούς θα μας επιτρέψει να φωτιστούν καρκίνο του στομάχου παθολογικών μηχανισμών. Περαιτέρω βιολογικές μελέτες επικεντρώθηκαν σε αυτά τα γονίδια μπορεί να διευκρινίσει το ρόλο τους στη γαστρική καρκινογένεση.