Αφηρημένο

Ιστορικό

Ο υποδοχέας του επιδερμικού αυξητικού παράγοντα (EGFR) γονίδιο παίζει καθοριστικό ρόλο στην επιβίωση των όγκων, την εισβολή, την αγγειογένεση και τη μεταστατική εξάπλωση. Πρόσφατες μελέτες έδειξαν ότι γαστρικό καρκίνο (GC) συσχετίστηκε με πολυμορφισμούς του γονιδίου EGFR και περιβαλλοντικές επιδράσεις, όπως παράγοντες του τρόπου ζωής. Σε αυτή τη μελέτη, επτά γνωστά SNPs σε εξώνια EGFR ερευνήθηκαν σε μια υψηλού κινδύνου κινέζικα πληθυσμού στην επαρχία Jiangsu για να ελεγχθεί αν οι γενετικές παραλλαγές των εξονίων EGFR και του τρόπου ζωής που σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο GC.

Μεθοδολογία /Principal ευρήματα

Μια μελέτη ασθενών-μαρτύρων νοσοκομείο με βάση εκτελέστηκε στην επαρχία Jiangsu. Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι το κάπνισμα, η κατανάλωση αλκοόλ και η προτίμηση για αλμυρά τρόφιμα συσχετίστηκαν σε σημαντικό βαθμό με τον κίνδυνο της GC. Οι διαφορές στον τρόπο ζωής μεταξύ ανδρών και γυναικών μπορεί να είναι η αιτία των υψηλότερων ποσοστών επίπτωσης στους άνδρες από ό, τι εκείνα στα θηλυκά. Επτά εξόνιο SNPs γονότυπος rs2227983, rs2072454, rs17337023, rs1050171, rs1140475, rs2293347, και rs28384375. Διαπιστώθηκε ότι η παραλλαγή rs2072454 Τ αλληλόμορφου και ΤΤ γονότυπο σχετίζονταν σημαντικά με αυξημένο κίνδυνο GC. Είναι ενδιαφέρον, αποτέλεσμα μας πρότεινε ο απλότυπος ACAGCA μπορεί να σχετίζεται με μειωμένο κίνδυνο GC. Ωστόσο, δεν υπάρχει σημαντική συσχέτιση εξετάστηκε μεταξύ των άλλων έξι SNPs και τον κίνδυνο της GC, τόσο στο σύνολο του πληθυσμού και την ηλικία που ταιριάζουν πληθυσμού, ακόμη και με τις διαφορές μεταξύ των φύλων.

Συμπεράσματα

Το κάπνισμα, το ποτό και προτίμηση για αλμυρά τρόφιμα συσχετίστηκαν σε σημαντικό βαθμό με τον κίνδυνο της GC στην επαρχία Jiangsu με τις διαφορές μεταξύ των φύλων. Παρά το γεγονός ότι μόνο ένας SNP (rs2072454) ήταν σημαντικά σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο GC, σε συνδυασμό το εξόνιο έξι EGFR SNPs μαζί μπορεί να είναι χρήσιμη για την πρόβλεψη του κινδύνου GC

Παράθεση:. Zhang J, Zhan Ζ, Wu J , Zhang C, Yang Υ, Tong S, et al. (2013) Σύνδεσμος μεταξύ των πολυμορφισμών στο EGFR Gene εξώνια, Lifestyle και κίνδυνο γαστρικού καρκίνου με διαφορές μεταξύ των φύλων στην κινεζική Han Θέματα. PLoS ONE 8 (3): e59254. doi: 10.1371 /journal.pone.0059254

Επιμέλεια: Eithne Costello, το Ηνωμένο Βασίλειο κέντρο του Λίβερπουλ Cancer Research, Ηνωμένο Βασίλειο

Ελήφθη: 19 Σεπτέμβρη 2012? Αποδεκτές: 13 του Φλεβάρη 2013? Δημοσιεύθηκε: 29 Μαρτίου του 2013

Copyright: © 2013 Zhang et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτή η μελέτη υποστηρίχθηκε από Ακαδημαϊκό προτεραιότητας του Προγράμματος Ανάπτυξης των Jiangsu Ιδρυμάτων Ανώτατης Εκπαίδευσης (PAPD), Jiangsu Φυσικών Επιστημών Ίδρυμα (BK2008461), Εθνικό Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας (30973715 και 81001502), Ταμείο Έρευνας για τον Διδακτορικό Πρόγραμμα της Ανώτατης Εκπαίδευσης της Κίνας (20103237110011) , Νέοι εκπαιδευτικοί στο Nanjing Πανεπιστήμιο της Παραδοσιακής Κινέζικης Ιατρικής. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Παρά το γεγονός ότι τόσο η συχνότητα και η θνησιμότητα του καρκίνου του στομάχου (GC) έχουν μειωθεί τα τελευταία χρόνια, GC ήταν η τέταρτη πιο συχνή κακοήθεια στον κόσμο το 2008, με περίπου 989.600 νέες περιπτώσεις. Οι άνδρες γενικά να αναπτύξουν GC δύο φορές τόσο συχνά όσο οι γυναίκες και περίπου το 72% των νέων περιπτώσεων συμβαίνουν σε αναπτυσσόμενες χώρες. Σε γενικές γραμμές, τα υψηλότερα ποσοστά εμφάνισης είναι στην Ασία, ιδιαίτερα στις χώρες της Ανατολικής Ασίας, όπως η Κορέα, την Ιαπωνία και την Κίνα [1].

Πράγματι, σχεδόν το 40% όλων των περιπτώσεων GC συμβαίνουν στην Κίνα, και υπάρχει μια αξιόλογη γεωγραφική διαφοροποίηση στα ποσοστά GC σε όλη την Κίνα [2]. Περισσότερα από τα δύο τρίτα των ασθενών που έχουν διαγνωστεί με GC στην Κίνα έχουν ανεγχείρητο νόσο και μέση επιβίωση των έξι έως εννέα μήνες. Επιπλέον, σε ασθενείς με χειρουργικά εξαιρέσιμων όγκων, οι τοπικές και απομακρυσμένες ποσοστά υποτροπής είναι υψηλά, και το ποσοστό επιβίωσης 5 ετών είναι λιγότερο από 30% [3]. Sun

et al.

[4] αξιολόγησε την επίδραση της GC στην κινεζική πληθυσμού από την επιδημιολογική ανάλυση της κατανομής της θνησιμότητας του 1990-1992, τα αποτελέσματα έδειξαν ότι GC ήταν η κύρια αιτία θνησιμότητας σχετίζονται με τον καρκίνο στην Κίνα .

είναι πλέον γενικά αποδεκτό ότι η παθογένεια της GC περιλαμβάνει μια πολυπαραγοντική αλληλεπίδραση μεταξύ περιβαλλοντικοί παράγοντες και η γενετική προδιάθεση. Επιδημιολογικές μελέτες έχουν εντοπίσει την ηλικία, το φύλο και τις διαφορές μια σειρά από περιβαλλοντικούς παράγοντες που μπορούν να συμβάλλουν στην ανάπτυξη του GC, συμπεριλαμβανομένου ενός αλμυρή διατροφή, κάπνισμα, κατανάλωση αλκοόλ και

Helicobacter pylori

μόλυνση [5] – [8] . Άλλες μελέτες έχουν προσδιορίσει τους παράγοντες ξενιστή και γενετικές αλλαγές που παίζουν επίσης σημαντικό ρόλο στην ανάπτυξη και την πρόοδο της GC μέσω αλληλεπιδράσεων γονιδίων-περιβάλλοντος [9], [10].

Ο υποδοχέας του επιδερμικού αυξητικού παράγοντα γονίδιο (EGFR) βρίσκεται στο μικρό βραχίονα του ανθρώπινου χρωμοσώματος 7 και παράγει μια γλυκοπρωτεΐνη με μοριακό βάρος 170 kDa που έχει μια υψηλή συγγένεια για συνδέτες της, συμπεριλαμβανομένων του επιδερμικού αυξητικού παράγοντα (EGF) και του παράγοντα μετασχηματισμού ανάπτυξης άλφα (ΤΟΡ-α). EGFR συμμετέχει σε διάφορα ουσιώδη ογκογόνα μηχανισμούς, όπως η επιβίωση του όγκου, εισβολή, αγγειογένεση και τη μεταστατική εξάπλωση. έκφραση EGFR έχει παρατηρηθεί σε πολλές ανθρώπινους όγκους, και πολλές μελέτες απέδειξαν ότι η υπερέκφραση του EGFR σχετίζεται με κακή έκβαση [11]. Σε GC, EGFR υπερέκφραση συσχετίζεται με προχωρημένο στάδιο του όγκου και μια κακή κλινική έκβαση [12]. Ωστόσο, οι ρόλοι που παίζουν EGFR υπερέκφραση και γενετικές αλλαγές στο γαστρικό καρκινογένεση παραμένουν ασαφείς. Επιπλέον, λίγες μόνο πολυμορφισμούς μονών νουκλεοτιδίων (SNPs) έχουν βρεθεί να συνδέσει με την ανάπτυξη GC και τα αποτελέσματα [11], [13].

Σε αυτή τη μελέτη, υποθέσαμε ότι οι περιβαλλοντικές εκθέσεις και τις διαφορές των δύο φύλων δρουν ως τροποποιητές επίδραση σε φόντο της γενετικής ποικιλομορφίας στα εξώνια EGFR που ενδέχεται να επηρεάσουν EGFR λειτουργία, διαμορφώνοντας με αυτόν τον τρόπο την ευαισθησία GC. Για να ελέγξει την υπόθεση αυτή, μια μελέτη νοσοκομείο με βάση διεξήχθη στην οποία 387 περιπτώσεις GC και 392 του καρκίνου χωρίς ελέγχους σε ένα κινεζικό πληθυσμό υψηλού κινδύνου ήταν ο γονότυπος για επτά γνωστών SNPs στα εξώνια EGFR, δηλαδή, rs2227983 A & gt? G, rs2072454 C & gt? Τ, rs17337023 A & gt? T, rs1050171 G & gt? Α, rs1140475 C & gt? T, rs2293347 G & gt? Α, και rs28384375 T & gt?. C

Υλικά και Μέθοδοι

Πρόσληψη των υποθέσεων και την ομάδα ελέγχου

Αρχικά, περιπτώσεις 401GC και 420 ελέγχους εντοπίστηκαν? 3 περιπτώσεις έλλειψης καρκίνο των ερωτηματολογίων καθώς και 11 όγκους εκτός από αδενοκαρκίνωμα αποκλείστηκαν? 18 ελέγχους αποκλείστηκαν από βιοδείκτες του καρκίνου που σχετίζονται με υπέρμετρη ορού και 10 ελέγχους αποκλείστηκαν από τη γεωγραφική απόκλιση. Συνολικά, ένα συνολικό πληθυσμό με 387 περιπτώσεις και 392 έλεγχοι ήταν διαθέσιμα για την παρούσα μελέτη με βάση τους υποψήφιους εξουσίας αναλύσεων, είναι λυπηρό το γεγονός ότι οι έλεγχοι ήταν περίπου 10 χρόνια νεότερος από τις περιπτώσεις, έτσι, μια ηλικία που ταιριάζουν πληθυσμού με 294 περιπτώσεις και 294 έλεγχοι εκχυλίστηκε από το συνολικό πληθυσμό για την αντιπαραβολή του ηλικία που να ταιριάζουν. Όλα τα άτομα ήταν γενετικά άσχετη εθνικής Κινέζων Χαν. Οι ασθενείς με πρωτοπαθή GC προσλήφθηκαν από το Τμήμα Χειρουργικής Γαστρεντερολογίας στο Jiangsu Provence Νοσοκομείο της Παραδοσιακής Κινέζικης Ιατρικής (TCM) από τον Ιανουάριο του 2008 και τον Ιούλιο του 2010 στην πόλη Nanjing, επαρχία Jiangsu. Τα καρκινικά χωρίς υγιείς μάρτυρες διαδοχικά προσληφθεί από Jiangsu Νοσοκομείο TCM, και ήταν οι επισκέπτες στο νοσοκομείο για ένα ετήσιο check-up κατά την ίδια περίοδο. Για να συμπεριληφθεί στη μελέτη, οι ασθενείς (α) αρσενικά ή θηλυκά άνω των 20 ετών αλλά κάτω των 80 ετών, (β) έπρεπε να είναι Κινέζοι Χαν εθνικότητα (αυτο-αναφερθεί), (γ) προήλθαν από τρεις περιοχές της Jiangsu επαρχία και έπρεπε να είναι ένας κάτοικος για τουλάχιστον 5 χρόνια, (δ) έπρεπε να έχουν πρόσφατα ιστοπαθολογικά διαγνωστεί πρωτογενή GC, (ε) έπρεπε να στερούνται προηγούμενες κακοήθεις όγκους σε άλλα όργανα, και (στ) δεν είχε αντικαρκινική θεραπεία πριν από την πρόσληψη , συμπεριλαμβανομένων χημειοθεραπεία και ακτινοθεραπεία. Εκπαιδευμένοι ερευνητές χρησιμοποίησαν ένα προ-δοκιμαστεί ερωτηματολόγιο για τη συλλογή επιδημιολογικών δεδομένων από τους συμμετέχοντες, δηλαδή, δημογραφικούς παράγοντες όπως η ηλικία και το φύλο, και γνωστοί παράγοντες κινδύνου για GC (όπως το κάπνισμα, η κατανάλωση αλκοόλ, και ένα οικογενειακό ιστορικό καρκίνου του πεπτικού σωλήνα) . Τα άτομα που κάπνιζαν μία ή περισσότερες φορές την ημέρα για πάνω από ένα χρόνο ορίστηκαν ως καπνιστές και εκείνοι που κατανάλωναν τρία ή περισσότερα αλκοολούχα ποτά την εβδομάδα για πάνω από 6 μήνες θεωρήθηκαν χρόνιος πότες [14], [15]. Μετά την υπογραφή ενημερωθεί έντυπα συγκατάθεσης, κάθε υποκείμενο δωρεά 3-5 ml περιφερικού αίματος που πρέπει να χρησιμοποιούνται για την εκχύλιση γενωμικού DNA. Το ερευνητικό πρωτόκολλο εγκρίθηκε από την επιτροπή δεοντολογίας της Jiangsu Provence Νοσοκομείο TCM.

Το γονιδιακό DNA Απομόνωση από κυττάρων περιφερικού αίματος

Ένα εμπορικό κιτ εκχύλισης DNA στο αίμα (AxyPrep-96 σετ, Axygen, CA, USA) χρησιμοποιήθηκε για την εκχύλιση γενωμικού DNA από τα δείγματα αίματος. Τα καθαρισμένα ϋΝΑ φυλάχτηκαν στους -20 ° C μέχρις ότου χρησιμοποιήθηκαν για τη δοκιμή γονότυπο. Η ποιότητα του DNA εκτιμήθηκε με ηλεκτροφόρηση πηκτής αγαρόζης.

γονοτυπικός

αντίδραση ανίχνευσης αντίδραση απολίνωσης-Polymerase chain (PCR-LDR) μέθοδοι χρησιμοποιήθηκαν για προσδιορισμό του γονότυπου [16]. Συντέθηκαν από τη Σαγκάη Sangon Βιολογικής Μηχανικής Τεχνολογίας και Υπηρεσιών (No.698, Xiangmin Rd, Songjiang District, Shanghai, Κίνα). Κάθε ομάδα ανιχνευτών αντίδραση ανίχνευσης λιγάσης αποτελούμενο έναν κοινό ανιχνευτή και δύο διακρίσεις ανιχνευτές για τους δύο τύπους (Πίνακας S1).

Ο στόχος ακολουθίες DNA ενισχύθηκαν χρησιμοποιώντας μία πολλαπλή μέθοδο PCR. PCRs για κάθε υποκείμενο διεξήχθησαν σε έναν τελικό όγκο 20 μΐ που περιείχε 1 χ PCR ρυθμιστικό, 3.0 mmol /l MgCl

2, 2,0 mmol /l τριφωσφορικών δεοξυνουκλεοτιδίων, 1 μΐ εκκινητές, 0.2 μλ QIAGEN HotStarTaq πολυμεράσης (QIAGEN, Κίνα ), 4 μΙ 1 × Q-λύση, και 10-20 ng γενωμικού DNA. Η θερμική κυκλοποίηση πραγματοποιήθηκε για πέντε SNPs (rs2227983, rs17337023, rs1140475, rs2293347 και rs2072454) στο σύστημα PCR Gene Amp 9600 (PerkinElmer) με αρχική μετουσίωση επί 15 λεπτά στους 95 ° C, ακολουθούμενη από 35 κύκλους αποδιάταξης στους 94 ° C για 30 s, ανασύνδεση στους 59 ° C για 1 λεπτό, και επέκταση στους 72 ° C για 1 λεπτό, ακολουθούμενη από μία τελική επέκταση στους 72 ° C για 7 λεπτά. Το πρωτόκολλο για την ενίσχυση rs28384375 αποτελούμενο από μία αρχική μετουσίωση επί 15 λεπτά στους 95 ° C, ακολουθούμενη από 35 κύκλους αποδιάταξης στους 94 ° C για 30 s, ανόπτηση στους 56 ° C για 1 λεπτό, και επέκταση στους 72 ° C για 1 λεπτό , ακολουθούμενη από μία τελική επέκταση στους 72 ° C για 7 λεπτά. Το πρωτόκολλο για rs1050171 αποτελούμενο από μία αρχική μετουσίωση επί 15 λεπτά στους 95 ° C, ακολουθούμενη από 35 κύκλους αποδιάταξης στους 94 ° C για 30 s, ανόπτηση στους 53 ° C για 1 λεπτό, και επέκταση στους 72 ° C για 1 λεπτό, ακολουθούμενη από μια τελική επέκταση στους 72 ° C για 7 λεπτά.

Η αντίδραση σύνδεσης για κάθε υποκείμενο διεξήχθη σε τελικό όγκο 10 μΐ που περιείχε 1 χ ΝΕΒ Taq DNA λιγκάσης ρυθμιστικού διαλύματος, 12,5 pmol από κάθε μείγμα ιχνηλατών , 0.05 μΐ Taq DNA λιγάση [ΝΕΒ Βιοτεχνολογίας (Πεκίνο)] και 1 μλ πολλαπλών PCR προϊόντων. Οι αλληλουχίες ανιχνευτή φαίνονται στον Πίνακα S2. Συνολικά, πραγματοποιήθηκαν 35 κύκλοι που αποτελούνται από 95 ° C για 2 λεπτά, 94 ° C για 30 s, και 60 ° C για 2 λεπτά. Οι φθορίζουσες προϊόντα των αντιδράσεων ανίχνευσης λιγάσης διαφοροποιήθηκαν με αλληλουχητή ΑΒΙ 377 (Σχήμα S1). Για να επιβεβαιώσετε την ακρίβεια της μεθόδου προσδιορισμού του γονότυπου PCR-LDR, άμεση αλληλούχιση του DNA των τυχαία επιλεγμένων προϊόντων PCR διεξήχθη. Η αναλογία των δειγμάτων αλληλούχισης ήταν περίπου 5%. Τα αποτελέσματα του γονότυπου PCR-LDR έδειξε πλήρη συμφωνία με τα αποτελέσματα απευθείας αλληλούχιση του DNA.

Στατιστικές Αναλύσεις

Όλες οι στατιστικές αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση SPSS έκδοση λογισμικού 16.0 (SPSS Inc., Chicago, IL, ΗΠΑ). Για να συγκρίνετε τα παρατηρούμενα συχνότητες γονοτύπου στην ομάδα ελέγχου με τις αναμενόμενες συχνότητες, η ισορροπία Hardy-Weinberg (HWE) ελέγχθηκε με ένα χ

2-test καλοσύνη-of-fit. Περιπτώσεις και ελέγχους συγκρίθηκαν σε όρους δημογραφικά χαρακτηριστικά, παράγοντες του τρόπου ζωής, καθώς και τις συχνότητες αλληλόμορφο κάθε SNP, χρησιμοποιώντας το

χ

2

-τεστ. Για κάθε πολυμορφισμού, αναλογίες πιθανοτήτων (OR) και τα διαστήματα εμπιστοσύνης 95% (CI) υπολογίστηκαν από όρους μοντέλα λογιστικής παλινδρόμησης για την εκτίμηση της κύρια επίδραση κάθε πολυμορφισμού με GC, ενώ την προσαρμογή για συνεχή παράγοντες ηλικία, το φύλο και τον τρόπο ζωής. Λογιστικής παλινδρόμησης αναλύει χρησιμοποιώντας το μείζον αλληλόμορφο ως σημείο αναφοράς χρησιμοποιήθηκαν για την εκτίμηση προσαρμοστεί ΕΑΠ, 95% ΠΙ, και

P

τιμές. Ωστόσο, βρήκαμε ότι η μεταβλητή φύλο και η ηλικία δεν είναι σύμφωνη με την παραδοχή της αναλογικότητας. Έτσι, διαστρωμάτωση φύλο και την ηλικία αντιστοίχησης χρησιμοποιήθηκαν για τη μέτρηση της ΕΑΠ και 95% ΠΙ. Για τις μεταβλητές του τρόπου ζωής που έδειξε σημαντικές σχέσεις με GC σε αναλύσεις που ελέγχονται για ταιριάζουν μόνο παράγοντες, εκτιμήσαμε περαιτέρω την ανεξαρτησία τους σε αναλύσεις προσαρμοσμένο για επιπλέον πιθανούς συγχυτικούς παράγοντες (δηλαδή, το κάπνισμα, το ποτό, αλμυρά τρόφιμα, τρώει το χρόνο και τρώει πρωινό) στην ηλικία αντιστοίχησης πληθυσμός. Και το λογισμικό ΦΑΣΗ πακέτο έκδοση 2.0 χρησιμοποιήθηκε για να συμπεράνουμε συχνότητες απλότυπου βασίζονται στα παρατηρούμενα γονότυπους EGFR. Όλα

P

τιμές ήταν δύο όψεων και ένα

P

αξία & lt?. 0.05 θεωρήθηκε στατιστικά σημαντική

Αποτελέσματα

Χαρακτηριστικά των συμμετεχόντων στη μελέτη

Τα χαρακτηριστικά αυτών των συμμετεχόντων στη μελέτη ήταν σύμφωνα με περιγράφηκε προηγουμένως [17], [18]. Σε αυτή την εργασία, ο συνολικός πληθυσμός με 387 περιπτώσεις και 392 έλεγχοι και μια ηλικία που ταιριάζουν πληθυσμού με 294 περιπτώσεις και 294 μάρτυρες συμπεριλήφθηκαν στις τρέχουσες αναλύσεις. Το φύλο, η ηλικία και η γεωγραφική κατανομή περιοχής των συμμετεχόντων στη μελέτη παρουσιάζονται στον Πίνακα 1.

Η

Για να εξετάσει τις διαφορές στη συχνότητα GC μεταξύ ανδρών και γυναικών, οι κατανομές των μεταβλητών επιλέξτε τον τρόπο ζωής αναλύθηκαν με τις διαφορές μεταξύ των φύλων. Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι έξι παράγοντες του τρόπου ζωής (δηλαδή, λαμβάνοντας τακτικά γεύματα, προτίμηση για αλμυρά τρόφιμα, τρώει χρόνο, το κάπνισμα, το ποτό κατάσταση, και να τρώει πρωινό) συσχετίζονταν σημαντικά με τον κίνδυνο της GC, και τα αποτελέσματά τους θα μπορούσε να τροποποιηθεί κατά φύλο και ηλικία. Τέσσερις παράγοντες του τρόπου ζωής, δηλαδή, προτίμηση για αλμυρά τρόφιμα, τρώει χρόνο, το κάπνισμα και το ποτό κατάσταση, ήταν σημαντικά διαφορετική μεταξύ ανδρών και γυναικών (

P

& lt? 0,05) (Πίνακας 2). Διαπιστώθηκε ότι τα ποσοστά των ανδρών που μεταφέρουν ανθυγιεινές διατροφικές συνήθειες, όπως η προτίμηση για αλμυρά τρόφιμα, σύντομο χρονικό διάστημα το φαγητό, το κάπνισμα και το ποτό, ήταν σημαντικά υψηλότερα από αυτά των θηλυκών (

P

& lt? 0.05), η οποία θα μπορούσε να είναι η αιτία των υψηλότερων ποσοστών επίπτωσης στους άνδρες από ό, τι εκείνα στα θηλυκά. Στο σύνολο του πληθυσμού, σε τακτική βάση, λαμβάνοντας γεύματα και πρωινό φαγητό μείωσε τον κίνδυνο των γυναικών GC, ενώ το πόσιμο θα μπορούσε να αυξήσει τον κίνδυνο των ανδρών GC (Πίνακας 3). Επιπλέον, τόσο προτίμηση για αλμυρά τρόφιμα και το κάπνισμα αυξάνει τον κίνδυνο των αρσενικών και θηλυκών GC (

P

& lt? 0,05). Παρόμοια αποτελέσματα βρέθηκαν και μετά την ηλικία των αντιστοίχησης που τακτικά λαμβάνουν τα γεύματα μείωσε τον κίνδυνο του GC και προτίμηση για αλμυρά τρόφιμα και το κάπνισμα αυξάνει τον κίνδυνο τόσο των ανδρών όσο και των γυναικών GC (

P

& lt? 0.05, Πίνακας 4). Ωστόσο, υπήρχαν δύο εξαιρέσεις, ότι έπινε αυξάνει τον κίνδυνο των ανδρών GC (

P

& lt? 0.05), αλλά δεν θηλυκό GC (

P

& gt? 0.05), ίσως λόγω του περιορισμένου θηλυκό του πληθυσμού, ενώ καθημερινά τρώει πρωινό μείωσε τον κίνδυνο των γυναικών GC (

P

& lt? 0.05), αλλά όχι αρσενικό GC (

P

& gt? 0,05). (Πίνακας 4)

η

Διανομή Γονοτυπικές και κίνδυνος GC

στην παρούσα μελέτη, ανιχνεύθηκε μόνο το Τ αλληλόμορφο του τόπου παρερμηνεύσιμη rs28384375. Όσον αφορά τα υπόλοιπα έξι SNPs, οι παρατηρούμενες συχνότητες γονοτύπου στους ελέγχους ήταν HWE. Δεδομένου ότι δεν στατιστική σημαντικότητα χάθηκε, μόνο τα αναπροσαρμοσμένα στατιστικά αποτελέσματα φαίνονται στους πίνακες. Στο σύνολο του πληθυσμού, η σύνδεση μεταξύ της κατανομής των αλληλόμορφων γονιδίων EGFR, γονότυπους και τον κίνδυνο της GC ήταν φαίνονται στον Πίνακα 5. παρατηρήθηκε μόνο μια μικρή διαφορά όσον αφορά την κατανομή των αλληλομόρφων rs2072454 (

χ

2

= 3.844,

P =

0.050), και της λογιστικής παλινδρόμησης αναλύσεις αποκάλυψαν ότι η παραλλαγή αυτού του αλληλόμορφου μπορεί να σχετίζεται με τον κίνδυνο GC (προσαρμογή OR = 1,23, 95% CI = 1,00-1,50). Ωστόσο, δεν υπάρχουν σημαντικές διαφορές μεταξύ των περιπτώσεων και ελέγχων όσον αφορά την κατανομή αλληλόμορφου παρατηρήθηκαν με τις διαφορές μεταξύ των φύλων. Ο πολυμορφισμός rs2293347 συσχετίστηκε με αρσενικό περιπτώσεις GC εξαιτίας 73,0% των περιπτώσεων GC διεξάγεται ένα αλληλόμορφο G σε σύγκριση με το 29,5% των ελέγχων υγείας (προσαρμογή OR = 6,45, 95% CI = 4,89 – 8,51,

P

& lt? 0.001 ), αλλά δεν γονότυποι σχετίζονταν σημαντικά με τον κίνδυνο GC. Στην αντίθετη γυναικείο πληθυσμό ο γονότυπος GA θα μπορούσε να μειώσει τον κίνδυνο των γυναικών GC εξαιτίας του 34,5% των περιπτώσεων GC μεταφέρουν ένα γονότυπο GA σε σύγκριση με το 38,9% των ελέγχων για την υγεία, αλλά όχι σημαντικές διαφορές μεταξύ της κατανομής του αλληλόμορφου και γονότυπο συχνότητες (

P

& gt? 0,05). Επιπλέον, υπάρχουν σημαντικές διαφορές εξετάστηκαν στα άλλα τέσσερα SNPs (

P

& gt? 0,05), δηλαδή rs2227983, rs17337023, rs1050171 και rs1140475 μεταξύ των περιπτώσεων και ελέγχει ακόμη και με τις διαφορές μεταξύ των φύλων

Η

στο πληθυσμού σε ηλικία-αντιστοίχιση, η συσχέτιση μεταξύ της κατανομής του αλληλόμορφα του γονιδίου EGFR, απλοτύπων και τον κίνδυνο της GC ήταν φαίνονται στον πίνακα 6. Μια σημαντική διαφορά παρατηρήθηκε όσον αφορά την κατανομή αλληλομόρφων (

χ

2

= 4.795,

P =

0,029) και τη διανομή γονότυπο (

χ

2

= 6.668,

P = 0,036

) του rs2072454, εκτός από τα αποτελέσματα στον πίνακα 5. Επιπλέον, λογιστικής παλινδρόμησης αναλύσεις αποκάλυψαν ότι η παραλλαγή του αλληλόμορφου rs2072454 Τ θα μπορούσε να αυξήσει τον κίνδυνο GC (προσαρμογή OR = 0.77, 95% CI = 0,61 – 0,97?

P

& lt? 0,05 ). Σύμφωνα με την κατανομή γονότυπο, μια σημαντική διαφορά παρατηρήθηκε επίσης στον ανδρικό πληθυσμό (

χ

2

= 7.914,

P =

0.019) και όχι γυναικείο πληθυσμό (

χ

2

= 0,452,

P =

0.798). Ωστόσο, δεν υπήρχαν σημαντικές διαφορές μεταξύ ασθενών και μαρτύρων, ακόμη και με τις διαφορές μεταξύ των φύλων για τις υπόλοιπες SNPs, δηλαδή, rs2227983, rs17337023, rs1140475, rs1050171 και rs2293347 (

P

& gt? 0,05).

Η

Για να εξαιρέσετε την επίδραση του περιβάλλοντος, διερευνήσαμε τη συσχέτιση μεταξύ των δυνητικών τρεις SNPs GC που σχετίζονται και με τον κίνδυνο της GC στην εποχή αντιστοίχησης πληθυσμού που μεταφέρουν τον τρόπο ζωής της υγείας (Πίνακας 7). Μια ευδιάκριτη διαφορά εξετάστηκε από την άποψη της κατανομής γονότυπου του rs2072454 (

χ

2

= 6.036,

P =

0.049). Ειδικά, λογιστικής παλινδρόμησης αναλύσεις αποκάλυψαν ότι ο γονότυπος ΤΤ αύξησε σημαντικά τον κίνδυνο GC στον πληθυσμό με καθημερινό πρωινό φαγητό (προσαρμογή OR = 1.92, 95% CI = 1,07 – 3,44,

P

& lt? 0.05).

εξώνια όχι μόνο κωδικοποιούν την αλληλουχία αμινοξέων της πρωτεΐνης, αλλά επίσης περιέχουν αλληλουχίες που επηρεάζουν τη μετάφραση ή mRNA αποικοδόμηση [19]. Η loci συνενώθηκαν και υποβλήθηκαν σε ανάλυση απλότυπου συμπέρασμα χρησιμοποιώντας το πρόγραμμα ΦΑΣΗ 2.0. Υπήρχαν τέσσερις πιθανές απλοτύπων στο σύνολο του πληθυσμού και τρεις πιθανές απλοτύπων του πληθυσμού σε ηλικία-αντιστοίχιση, με συχνότητα & gt? 4% (Πίνακας 8, Πίνακας 9). Σε σύγκριση με το απλότυπος GTTGCG, λογιστική παλινδρόμηση αναλύσεις αποκάλυψαν ότι ο απλότυπος ACAGCG συσχετίστηκε με σημαντικά μειωμένο κίνδυνο του GC (OR = 0,67, 95% CI = 0,49 – 0,92,

P

& lt? 0,05 προσαρμοσμένο για την ηλικία, παράγοντες το φύλο και τον τρόπο ζωής) στο σύνολο του πληθυσμού (Πίνακας 8) και όχι του πληθυσμού σε ηλικία αντιστοίχησης (OR = 0,83, 95% CI = 0,58 – 1,19,

P

& gt? 0,05 προσαρμοσμένο για την ηλικία, το φύλο και τον τρόπο ζωής παράγοντες) (Πίνακας 9). Οι άλλοι απλότυποι συσχετίστηκαν με σημαντικά μειωμένο κίνδυνο GC (προσαρμογή OR = 0.69, 95% CI = 0,52 – 0,90 για το σύνολο του πληθυσμού? Προσαρμογή OR = 0.74, 95% CI = 0,56 – 0,99 για τον πληθυσμό ηλικίας αντιστοίχησης). Σε σύγκριση με το απλότυπος ACAGCG, η ACAACG θα μπορούσε να μειώσει τον κίνδυνο της GC (OR = 0,61, 95% CI = 0,40 – 0,94 προσαρμοσμένο για την ηλικία, το φύλο και τον τρόπο ζωής) στο σύνολο του πληθυσμού, αλλά το

P

αξία έκανε δεν φθάνουν στατιστική σημαντικότητα με διόρθωση Bonferroni (Πίνακας 8).

η

Συζήτηση

Παρά το γεγονός ότι ένας μεγάλος αριθμός των νέων κρουσμάτων GC είχαν δει σε όλο τον κόσμο τις τελευταίες δεκαετίες, η ακριβείς μηχανισμοί υποκείμενες γαστρική καρκινογένεση δεν είναι ακόμη πλήρως κατανοητοί. Παρόμοια με την προηγούμενη έρευνα [20], [21], αποτέλεσμα μας έδειξε ότι οι άνδρες γενικά έχουν την ανάπτυξη GC δύο φορές τόσο συχνά όσο οι γυναίκες στην Κίνα. Προτάθηκε από τον Michael

et al.

Ότι ένα μεγάλο μέρος της παγκόσμιας μεταβολής στη συχνότητα εμφάνισης του καρκίνου έχει αποδοθεί σε επιδράσεις του περιβάλλοντος, συμπεριλαμβανομένων των διατροφικές προτιμήσεις και ανθυγιεινές παράγοντες του τρόπου ζωής [22]. Στην παρούσα μελέτη, ως εκ τούτου, μας ενδιαφέρει να ελέγξετε αν μερικοί ανθυγιεινές παράγοντες του τρόπου ζωής μπορεί να αυξήσει τον κίνδυνο της GC με τις διαφορές μεταξύ των φύλων στην Κίνα. Έξι παράγοντες του τρόπου ζωής, συμπεριλαμβανομένων τακτικά τη λήψη των γευμάτων, προτίμηση για αλμυρά τρόφιμα, τρώει χρόνο, το κάπνισμα, το ποτό κατάσταση, και να τρώει πρωινό, εντοπίστηκαν να επηρεάζεται ο κίνδυνος GC με τις διαφορές μεταξύ των φύλων, η οποία ήταν σύμφωνη με τις προηγούμενες μελέτες στην ανατολική Κίνα [20], [23], [24]. Ειδικά, η προτίμηση για αλμυρά τρόφιμα, το ποτό και το κάπνισμα ήταν οι ισχυρότερες και πιο συνεπείς παράγοντες κινδύνου για GC.

Resent έρευνες πρότεινε ότι η υψηλή πρόσληψη αλατιού (νατρίου) μπορεί να αυξήσει τον κίνδυνο της GC [21], [ ,,,0],24] – [26]. Ήταν, επίσης, αποδεικνύεται από την παρατήρηση μας ότι οι ασθενείς GC στην επαρχία Jiangsu ήταν προτίμηση για αλμυρά τρόφιμα, όπως τα αλατισμένα κρέατα, λαχανικά τουρσί και τουρσί χυμό λαχανικών, που θα μπορούσαν να έχουν μολυνθεί από ενώσεις Ν-νιτρωδο. Εντούτοις, οι ενώσεις Ν-νιτροζο ήταν οι πιο συχνά προτείνεται σχετίζονται με την αύξηση του κινδύνου της ανώτερης γαστρεντερικής καρκίνων [27]. Ποτών και το κάπνισμα, άλλα δύο κυρίαρχοι παράγοντες κινδύνου για GC στον κόσμο [28], εξετάστηκαν επίσης σε αυτή τη μελέτη. Βρήκαμε μια σημαντική συσχέτιση μεταξύ της κατανάλωσης και του κινδύνου GC στην επαρχία Jiangsu. Ήταν αποδείξεων από μια εργαστηριακή μελέτη ότι το κάπνισμα θα μπορούσε να αυξήσει την απόπτωση στο γαστρικό βλεννογόνο αρουραίου από αύξηση της δραστηριότητας XO [29], και το αλκοόλ θα μπορούσε επίσης να ασκήσει επιρροή επί έκκρισης οξέος, γαστρική κένωση, και ορισμένες ασθένειες που σχετίζονται με οξέα, όπως γαστρίτιδα συνοδεύεται με βλάβη του γαστρικού βλεννογόνου, και η ακόλουθη φλεγμονώδης αντίδραση θα προωθήσει με τη σειρά του γαστρικού πολλαπλασιασμό και διαφοροποίηση [30] κυττάρων. Κατά τη διαδικασία αυτή, οι ενώσεις Ν-νιτροζο και μυκοτοξινών από κάποιο αλμυρό φαγητό μπορεί να προκαλέσει μεταλλάξεις γονιδίων [31], [32], ως εκ τούτου προτίμηση για αλμυρά τρόφιμα μπορεί να είναι η αρχική κίνδυνος GC. Και αποδεικτικά στοιχεία έδειξαν μια σύνδεση με οδών που εμπλέκονται στην αναπτυξιακές διαδικασίες [33]. Βασικά μόρια αυτών των οδών είναι οι κινάσες τυροσίνης υποδοχέα, τα οποία βρέθηκαν να ενεργοποιηθεί παρεκκλίνοντα ή υπερεκφράζεται σε μία ποικιλία όγκων και ως εκ τούτου αντιπροσωπεύουν υποσχόμενους στόχους για θεραπευτική παρέμβαση [13].

EGFR ήταν ένα από τα βασικά μόρια , και πολλές γραμμές απόδειξης προτείνουν ότι υψηλά διεισδυτική GC συνδέεται με την ανώμαλη ενεργοποίηση ή υπερενεργοποίηση του EGFR, λόγω γονιδιακής ενίσχυσης ή δομικές αλλαγές [13]. Πολύ πρόσφατα, μια μελέτη ασθενών-μαρτύρων των 61 περιπτώσεις και 20 έλεγχοι στην επαρχία Χενάν, που βρίσκεται στη μέση της Κίνας, έδειξε ότι ο EGFR rs28384375 C /T πολυμορφισμός μπορεί να προωθήσει την εμφάνιση και την ανάπτυξη της GC [34]. Επιπλέον, μια άλλη μελέτη ασθενών-μαρτύρων των 138 περιπτώσεις και 170 έλεγχοι στην επαρχία Jiangxi, που βρίσκεται στη νοτιο-ανατολική Κίνα, αποκάλυψε ότι ο EGFR rs763317 G /A πολυμορφισμός μπορεί να συνδέσει με αυξημένο κίνδυνο GC [35].

EGFR είναι ένας αυξητικός παράγοντας κινάσης τυροσίνης υποδοχέα και ανήκει στην υπεροικογένεια των υποδοχέων της κινάσης της τυροσίνης, τα μέλη της οποίας χαρακτηρίζονται από μία εξωκυτταρική περιοχή (όπου συνδετήρες σύνδεσης συνδετήρα λαμβάνει χώρα), σε μικρή λιπόφιλη διαμεμβρανική περιοχή, και μία ενδοκυτταρική περιοχή που φιλοξενεί την κινάση της τυροσίνης δραστηριότητα [36]. EGFR μπορεί να ενεργοποιηθεί με συνδέτες πρόσδεσης, όπως EGF και ΤΟΡ-α, και αυτό παίζει καίριο ρόλο στην ανάπτυξη, πολλαπλασιασμό και διαφοροποίηση. Η ενεργοποίηση του EGFR μπορεί να συμβάλει στη μετατροπή των κυτταρικών φαινοτύπων και να παρέχουν τα καρκινικά κύτταρα με σημαντικά πλεονεκτήματα ανάπτυξη και την επιβίωση [37]. Πολλοί ανθρώπινοι όγκοι εμφανίζουν EGFR υπερέκφραση, η οποία συσχετίζεται με ένα προηγμένο στάδιο του όγκου ή κακή κλινική έκβαση, όπως μη-μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα [38], ορθοκολικό καρκίνο [39], του καρκίνου του μαστού [40], καρκίνο κεφαλής και λαιμού [ ,,,0],41], καρκίνος της ουροδόχου κύστης [42], και GC [43].

υπάρχουν σήμερα αυξανόμενο ενδιαφέρον για SNP μεταλλάξεις στο EGFR, δεδομένου ότι θα μπορούσαν να επηρεάσουν την αποτελεσματικότητα του EGFR αναστολέα τυροσινικής κινάσης θεραπεία (ΤΚΙ) σε διάφορα καρκίνους [44], ορθοκολικό καρκίνο [39], μη μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα [45], GC [46] – [49]. Είναι γνωστό ότι τα εξώνια όχι μόνο κωδικοποιούν την αλληλουχία αμινοξέων της πρωτεΐνης, αλλά επίσης περιέχουν αλληλουχίες που επηρεάζουν τη μετάφραση ή mRNA αποικοδόμηση [19]. Έτσι, EGFR SNPs εξόνιο θα μπορούσε να επηρεάσει την έκφραση του γονιδίου EGFR και /ή δραστικότητα της πρωτεΐνης και έτσι να μεταβάλλουν την συγγένεια του EGFR για όχι μόνο συνδέτες του, αλλά και για αντικαρκινικούς παράγοντες που στοχεύουν αυτήν την πρωτεΐνη. Πράγματι, Puyo

et al.

Βρήκαν ότι οι μεταλλάξεις στα εξόνια 18-21 του EGFR ενισχύουν την δραστικότητα του ΤΚΙδ, ενώ η διαγραφή των εξωνίων 2-7 συνδέεται με γλοιοβλάστωμα ογκογένεση [49]. Επιπλέον, δύο κλινικές μελέτες έδειξαν ότι SNPs σε εξώνια EGFR 18, 19, 21, και 25 επηρεάζουν την κλινική αποτελεσματικότητα του gefitinib και μπορεί να είναι εν δυνάμει βιοδείκτες για την πρόβλεψη της κλινικής έκβασης ασθενών gefitinib αγωγή με προχωρημένο καρκίνο μη-μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα (NSCLC) [50], [51].

στην παρούσα μελέτη, οι έξι εξώνια SNPs σε EGFR ήταν ελαφρώς σχετίζονται με τον κίνδυνο της GC, τόσο στο σύνολο του πληθυσμού και την ηλικία που ταιριάζουν πληθυσμού, ακόμη και με το φύλο διαφορές. Σημειώθηκε ότι οι rs2072454 SNP συσχετίστηκε σημαντικά με τον κίνδυνο της GC. Ειδικά, το αλληλόμορφο Τ παραλλαγή rs2072454 και ΤΤ γονότυπο σχετίζονταν με αυξημένο κίνδυνο GC. Ωστόσο, οι rs2227983, rs17337023, rs1050171 και rs1140475 SNPs δεν σχετίζονται με τον κίνδυνο GC. Όσον αφορά τη θέση των εσφαλμένων διευθύνσεων rs28384375, μόνο ο Τ αλληλόμορφο ανιχνεύθηκε σε περιπτώσεις και τους ελέγχους. Πολλά δημοσιεύματα αναφέρουν ότι αρκετές EGFR SNPs, συμπεριλαμβανομένων rs2227983 (ορίζεται επίσης ως Arg521Lys ή R497K) [39], [52], [53], rs1050171 (ορίζεται επίσης ως Q787Q) [54], [55] και rs2293347 (C2982T) [ ,,,0],56], ήταν πιο πιθανό να επηρεάσουν τη βιολογική συμπεριφορά των όγκων (όπως ανάπτυξη όγκου, εισβολή, μετάσταση, και την εξέλιξη), παρά να καθορίσει την ευαισθησία στην ανάπτυξη του καρκίνου. Από EGFR, ένας βασικός μεσολαβητής της αγγειογένεσης, μπορεί να ρυθμίσει τα γονίδια-στόχους της, όπως ο VEGF, η οποία μπορεί να επηρεάσει άμεσα όγκου βιολογική συμπεριφορά. Τα αποτελέσματα αυτά θα μπορούσε να εξηγήσει επίσης γιατί EGFR SNPs μπορεί να χρησιμεύσει ως καθοριστικοί παράγοντες της απάντηση σε EGFR ΤΚΙ χημειοθεραπεία με βάση [11]. Ως εκ τούτου, αυτές οι μεταλλάξεις του γονιδίου μπορεί να αναθέτει την πολυπλοκότητα και την αμηχανία για τη θεραπεία GC και την επιβίωση [57].

Όταν Puyo

et al

. [49] ανέλυσε τη συσχέτιση μεταξύ συγκεκριμένων EGFR λειτουργική πολυμορφισμών και δραστικότητα αντικαρκινικών φαρμάκων σε 60 ανθρώπινες κυτταρικές γραμμές όγκου συσταθεί από το Εθνικό Ινστιτούτο Καρκίνου, τη συχνότητα της nonsynonymous rs28384375 SNP (ορίζεται επίσης ως Val592Ala) ήταν 0,5, ενώ το ετερόζυγο συχνότητα του -216G & gt? T SNP (που ορίζεται επίσης ως rs287129) ήταν 0.346. Οι κυτταρικές σειρές που ήταν ετερόζυγοι και παραλλαγή ομόζυγα για το -216 G & gt? Τ SNP έδειξαν σημαντικά υψηλότερη έκφραση του γονιδίου EGFR από τα ομόζυγα γραμμές άγριου τύπου. Επιπλέον, σε σύγκριση με κυτταρικές σειρές χωρίς ένα αλληλόμορφο παράλλαγμα, οι κυτταρικές σειρές με τουλάχιστον μία παραλλαγή Τ αλληλίου στο -216 G & gt? Τ SNP ήταν πιο ευαίσθητα σε erlotinib και λιγότερο ευαίσθητη σε γκελνταναμυκίνη, αναστολείς τοποϊσομεράσης Ι και II, και αλκυλιωτικοί παράγοντες. Είναι ενδιαφέρον ότι, τα αποτελέσματά μας έδειξαν ότι ο απλότυπος GTTGCG ήταν πιο διαδεδομένη σε περιπτώσεις GC σε σχέση με τον καρκίνο χωρίς ελέγχους, και ότι οι απλότυποι ACAGCG συσχετίστηκαν με σημαντικά μειωμένο κίνδυνο του GC (ρυθμισμένο OR = 0.67, 95% CI = 0,49 – 0,92 για ACAGCG, προσαρμοσμένη OR = 0.69, 95% CI = 0,52 – 0,90 για τους άλλους) στο σύνολο του πληθυσμού (Πίνακας 8). Ωστόσο, στον πληθυσμό ηλικίας αντιστοίχησης, δεν υπάρχει σημαντική συσχέτιση εξετάστηκε μεταξύ ACAGCA απλότυπος και τον κίνδυνο της GC (προσαρμογή OR = 0.83, 95% CI = 0,58 – 1,19) (Πίνακας 9). Έτσι, τα Τ αλληλόμορφα του rs2072454 και rs17337023, ειδικά το πρώτο, θα μπορούσε να σχετίζεται με τον κίνδυνο της GC. Ως εκ τούτου, συνδυασμένη ανάλυση των έξι SNPs, ιδιαίτερα τα Τ αλληλόμορφα του rs2072454 και rs17337023, μπορεί να είναι χρήσιμη για την πρόβλεψη του κινδύνου GC

Πολλά περιορισμούς στην παρούσα μελέτη πρέπει να αντιμετωπιστούν:. 1) το μέγεθος του δείγματος της μπορεί να μην ήταν αρκετά μεγάλη για να ανιχνεύσουν SNPs με χαμηλή συχνότητα παραλλαγή, όπως rs28384375? 2) επιλέχθηκαν οι πολυμορφισμοί που διερευνήθηκαν σε αυτή τη μελέτη με βάση τα αποτελέσματά τους στη λειτουργία EGFR και δεν μπορεί να δώσει μια ολοκληρωμένη εικόνα της γενετικής ποικιλομορφίας στα εξώνια EGFR? Δεν συλλέχθηκαν 3) λεπτομερείς πληροφορίες σχετικά με τις περιπτώσεις GC, συμπεριλαμβανομένης της επιβίωσης των ασθενών, αν οι όγκοι ήταν η εντερική ή διάχυτη τύπου, αν υπήρχε μετάσταση, και ποια είναι η επίδραση της θεραπείας με το φάρμακο ήταν.

Εν κατακλείδι, η παρούσα μελέτη προτείνει ότι οι διαφορές του τρόπου ζωής μεταξύ ανδρών και γυναικών μπορεί να είναι η αιτία των υψηλότερων ποσοστών επίπτωσης στους άνδρες από ό, τι εκείνα στα θηλυκά. Παρά το γεγονός ότι μόνο ένας SNP (rs2072454) ήταν σημαντικά σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο GC, σε συνδυασμό αναλύοντας το άλλο εξώνιο έξι EGFR SNPs μαζί μπορεί να είναι χρήσιμος για την πρόβλεψη του κινδύνου GC. Περαιτέρω μελέτες δικαιολογείται να καθιερώσει αυτές τις διαπιστώσεις και για την αντιμετώπιση των υποκείμενων μηχανισμών.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Εικόνα S1.

Τα φθορίζοντα προϊόντα LDR διαφοροποιήθηκαν από την ΑΒΙ sequencer 377 για τις επτά SNPs σε εξώνια EGFR. Συνολικά, πάνω από το 90% των προϊόντων που διαφοροποιήθηκαν με επιτυχία από την ABI sequencer 377.

doi: 10.1371 /journal.pone.0059254.s001

(ΔΕΘ)

Πίνακα S1.

Οι αλληλουχίες εκκινητών PCR για την επτά θέσεις στο γονίδιο EGFR. Οι εκκινητές σχεδιάστηκαν από Primer Premier 6 λογισμικού και συντίθεται από Σαγκάη Sangon Βιολογική Μηχανική Τεχνολογία και Υπηρεσίες