Αφηρημένο

Τα microRNAs (miRNAs) να συμμετέχουν σε διάφορες βιολογικές οδούς και μπορούν να ενεργούν είτε ως ογκοκατασταλτικά γονίδια ή ογκογονίδια. Πολυμορφισμούς μονών νουκλεοτιδίων (SNPs) σε miRNA μπορεί να συμβάλει στην ανάπτυξη του καρκίνου με τις αλλαγές στις ιδιότητες ή /και την ωρίμανση του microRNA του. Οι πολυμορφισμοί στο miRNAs έχουν προταθεί στην προδιάθεση για κίνδυνο καρκίνου? Ωστόσο, η συσσωρευμένη μελέτες έχουν δείξει ασυνεπείς conslusionss. Για να επικυρώσετε την περαιτέρω προσδιορίσει αν υπάρχει οποιαδήποτε πιθανή σύνδεση μεταξύ των τεσσάρων κοινών SNPs (miR-196a2C & gt? T, rs11614913? MiR-146aG & gt? C, rs2910164? MiR-499A & gt? G, rs3746444? MiR-149Γ γλωσσιδίου & gt? T, rs2292832) και η κίνδυνο για την ανάπτυξη κινδύνων, μια μετα-ανάλυση διεξήχθη σύμφωνα με τις δημοσιευμένες μελέτες 40-μαρτύρων. αναλογίες πιθανοτήτων (OR) με 95% διαστήματα εμπιστοσύνης (ΠΙ) υπολογίστηκαν για να εκτιμήσει την έκταση του συλλόγου. Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι ο γονότυπος rs11614913TT συσχετίστηκε με μειωμένο κίνδυνο καρκίνου, ιδιαίτερα με μειωμένο κίνδυνο για καρκίνο του παχέος εντέρου και του καρκίνου του πνεύμονα, ή για την ασιατική υποομάδα του πληθυσμού. Επιπλέον, το αλληλόμορφο rs2910164C συσχετίστηκε με μειωμένο κίνδυνο για καρκίνο του οισοφάγου, καρκίνο του τραχήλου, τον καρκίνο του προστάτη, και ηπατοκυτταρικό καρκίνωμα (HCC), ιδίως στις ασιατικές υποομάδα πληθυσμό. Ομοίως, το αλληλόμορφο rs3746444G παρατηρήθηκε ως παράγοντας κινδύνου για καρκίνο σε ασιατικών πληθυσμών. Το συμπέρασμα είναι ότι δύο SNPs prsent σε miRNAs (rs11614913TT, και rs2910164C) μπορεί να προστατεύσει από την παθογένεση ορισμένων μορφών καρκίνου, και ότι ο rs3746444 μπορεί να αυξήσει τον κίνδυνο για καρκίνο του

Παράθεση:. Αυτός B, Pan Υ, Cho WC , Xu Y, Gu L, Nie Ζ, et al. (2012) Ο Σύνδεσμος μεταξύ Τέσσερις γενετικές παραλλαγές σε Τα microRNAs (rs11614913, rs2910164, rs3746444, rs2292832) και του καρκίνου του κινδύνου: Στοιχεία από δημοσιευμένες μελέτες. PLoS ONE 7 (11): e49032. doi: 10.1371 /journal.pone.0049032

Επιμέλεια: Τζωρτζίνα Λ Κρατήστε, Πανεπιστήμιο του Αμπερντίν, Ηνωμένο Βασίλειο

Ελήφθη: 5 Αυγ 2012? Αποδεκτές: 3 Οκτ, 2012? Δημοσιεύθηκε: 14, Νοεμβρίου 2012

Copyright: © 2012 Ο et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτό το έργο υποστηρίχθηκε από μια επιχορήγηση από το Εθνικό Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας (81200401), Πρόγραμμα Καλλιέργεια Υγιείς Ταλέντα »για την πόλη Nanjing και Κοινωνικής Ανάπτυξης Τεχνολογίας Έργα της Nanjing City, Κίνα (QYK11175). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

τα microRNAs (miRNAs) είναι μικρά, μονόκλωνο, 19-21 νουκλεοτιδίων μακρύ μη-κωδικοποίησης πρωτεΐνης RNA μόρια, που λειτουργούν ως αρνητικοί ρυθμιστές που περιλαμβάνουν μετα-μεταγραφικής γονιδιακής έκφρασης μέσω σύνδεσης προς mRNAs στόχο περιοχές και, κατά συνέπεια τους να οδηγήσει σε διάσπαση του mRNA ή μεταφραστικά καταστολή [1]. Συσσωρευμένα στοιχεία έχουν δείξει ότι miRNAs ρυθμίζουν την έκφραση του περίπου 10-30% των όλων των ανθρώπινων γονιδίων μέσω μετα-μεταγραφικούς μηχανισμούς [2], συμβάλλοντας στην υπερβολική φυσιολογικές και παθολογικές καταστάσεις, όπως η διαφοροποίηση των κυττάρων, πολλαπλασιασμό και την απόπτωση [1], και Συγκεκριμένως με την ανάπτυξη και την εξέλιξη των διαφόρων ανθρώπινων καρκίνων με τη ρύθμιση της έκφρασης του πρωτο-ογκογονίδια ή γονίδια καταστολής όγκου [3], [4], [5].

SNPs σε γονίδια miRNA θεωρούνται να επηρεάζουν τη λειτουργία με τρεις τρόπους: πρώτον, μέσω της μεταγραφής του πρωτογενούς μεταγραφήματος? δεύτερο, μέσω pri-miRNA και προ-miRNA επεξεργασίας? και τρίτον, μέσω των αποτελεσμάτων για τις αλληλεπιδράσεις miRNA-mRNA [6]. Πρόσφατα, αρκετές μελέτες έχουν δείξει ότι ορισμένα πολυμορφισμός (SNPs) που υπάρχουν στα γονίδια miRNA, τα οποία μπορούν να μεταβάλλουν την έκφραση miRNA και /ή ωρίμανση και να συνδέεται με την ανάπτυξη και την εξέλιξη του καρκίνου [6]. Για παράδειγμα, τέσσερα SNPs – miR-196a2C & gt? T (ή rs11614913), miR-146aG & gt? C (rs2910164), miR-499A & gt? G (rs3746444), και miR-149Γ γλωσσιδίου & gt? T (rs2292832) – που προσδιορίζονται στην προ-miRNA περιοχές του miR-146a, miR-149, miR-196a2, και miR-499, αντίστοιχα, έχουν αναφερθεί να σχετίζεται με τον κίνδυνο καρκίνου [7], [8]. Ωστόσο, τα συμπεράσματα των σχετικών μελετών παραμένει ασυνεπής, εν μέρει λόγω της ετερογένειας του υποτύπου του καρκίνου, το μικρό μέγεθος του δείγματος, και η εθνικότητα των ασθενών. Να καθορίσει περαιτέρω εάν υπάρχει σύνδεση των τεσσάρων SNPs στα γονίδια miRNA με τον κίνδυνο για ανάπτυξη καρκίνου, μια συνολική ανασκόπηση και ανάλυση των δημοσιευμένων στοιχείων από διάφορες μελέτες είναι απαραίτητη. Σε αυτή τη μελέτη, έχουμε εκτενώς λογοτεχνία και πραγματοποιείται μια μετα-ανάλυση βασίζεται σε όλες τις επιλέξιμες περίπτωση ελέγχου δημοσιευμένα στοιχεία για την αξιολόγηση της σύνδεσης μεταξύ των τεσσάρων πολυμορφισμών και την ευαισθησία του καρκίνου.

Υλικά και Μέθοδοι

Αναγνώριση των επιλέξιμων μελετών

Πραγματοποιήσαμε μια αναζήτηση των βάσεων δεδομένων PubMed και Embase για όλες τις σχετικές αναφορές, χρησιμοποιώντας τις λέξεις κλειδιά «microRNA /miR-146a /miR-149 /miR-196a2 /miR-499», «πολυμορφισμός», και «καρκίνος» (ενημέρωση για 23 Ιουνίου 2012). Η αναζήτηση περιορίστηκε στα αγγλικά έγγραφα γλώσσα και μελέτες ανθρώπινο υποκείμενο. Αξιολογήσαμε δυνητικά σχετικές δημοσιεύσεις από την εξέταση τίτλους και περιλήψεις τους, ανασύρθηκαν στη συνέχεια όλες οι μελέτες που ταιριάζουν με τα επιλέξιμα κριτήρια ένταξης. Επιπλέον, μελέτες που εντοπίστηκαν από χειροκίνητη αναζήτηση των αναφορών που αναφέρονται στα σχόλια που εμπλέκονται. Όλες οι μελέτες περιλαμβάνονται εφόσον πληρούν τα ακόλουθα κριτήρια:. (I) για την rs11614913, rs2910164, rs3746444, και πολυμορφισμοί rs2292832 και του καρκίνου του κινδύνου, (ii) από μια περίπτωση-ελέγχου σχεδιασμένη μελέτη, και (iii) οι συχνότητες γονοτύπου διαθέσιμη

δεδομένα εξόρυξη

Όλα τα δεδομένα που πληρούν τα κριτήρια επιλογής εξήχθησαν ανεξάρτητα από δύο υπαλλήλους (BSH, και YQX). Για κάθε μελέτη, τα ακόλουθα χαρακτηριστικά εξήχθησαν: το πρώτο συγγραφέα επώνυμο, έτος δημοσίευσης, τη χώρα προέλευσης, την εθνικότητα, ο αριθμός των γονότυπου ασθενών και μαρτύρων, πηγή των ομάδων ελέγχου (πληθυσμό, ή το νοσοκομείο με βάση τους ελέγχους), οι μέθοδοι προσδιορισμού του γονότυπου και τον τύπο του καρκίνου. Ethnic καταβάσεις ταξινομήθηκαν ως Καυκάσου, της Ασίας ή μικτά (η οποία περιελάμβανε περισσότερες από μία εθνοτική καταγωγή). Μια μελέτη περιελάμβανε τις πληροφορίες για τον γονότυπο rs11614913 CT + ΤΤ, χωρίς τα στοιχεία για την CT και TT γονότυπους, έτσι ήμασταν μόνο σε θέση να υπολογίσει το OR για τη σύγκριση μεταξύ των CT + ΤΤ έναντι ΤΤ [9].

Η στατιστική ανάλυση

τα τέσσερα SNPs στο miRNAs ελέγχθηκαν για τις ενώσεις με την ευαισθησία του καρκίνου βασίζονται σε διαφορετικούς γενετικούς μοντέλα. Η μετα-ανάλυση εξέτασε τη συνολική σύνδεση των τεσσάρων SNPs με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου, όπως μετράται με αναλογίες πιθανοτήτων (OR) στα διαστήματα εμπιστοσύνης 95% (ΠΙ). Σε αντίθεση το ομοζυγώτες φυσικού τύπου (WW), υπολογίσαμε πρώτα τον κίνδυνο σπάνια ομοζυγώτες αλληλόμορφο (RR) και ετερόζυγα (WR) γονότυπους σε καρκίνους, στη συνέχεια, αξιολογείται ο κίνδυνος καρκίνου στο πλαίσιο ενός κυρίαρχου μοντέλου (RR + WR εναντίον WW ). Επιπλέον, οι ενώσεις υπολειπόμενο μοντέλο ήταν επίσης εκτιμάται (RR εναντίον WR + WW). Επιπλέον, στρωματοποιημένη αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν επίσης με την εθνικότητα (Ασίας και του Καυκάσου), τον τύπο του καρκίνου (αν μόνο ένας τύπος καρκίνου που περιέχονται λιγότερα από δύο επιμέρους μελετών ήταν συνδυάζονται σε ομάδα των «Άλλες μορφές καρκίνου») και την πηγή του ελέγχου για rs11614913 και rs2910164. Στρωματοποιημένη αναλύσεις διεξήχθησαν από την εθνικότητα για rs2292382, και με την εθνικότητα και τον τύπο του καρκίνου για rs3746444, αντίστοιχα

Η στατιστική σημαντικότητα των συγκεντρωμένων Ή προσδιορίστηκε με τη δοκιμασία Z, και μια τιμή Ρ & lt?. 0,05 θεωρήθηκε σημαντικός. Η ετερογένεια μεταξύ των μελετών αξιολογήθηκε με τη στατιστική δοκιμασία που βασίζεται Q Chi-square [10], με την ετερογένεια (

P

h) & lt? 0,05 που θεωρείται σημαντική. Ένα μοντέλο σταθερής αποτέλεσμα χρησιμοποιώντας τη μέθοδο Mantel-Haenszel και ένα μοντέλο τυχαίων δράσεων με τη χρήση της μεθόδου Dersimonian και Laird χρησιμοποιήθηκαν για τη συγκέντρωση των δεδομένων [11]. Το μοντέλο τυχαίων δράσεων που χρησιμοποιήθηκε κατά την ετερογένεια στα αποτελέσματα των μελετών βρέθηκε? Αλλιώς χρησιμοποιήθηκε το μοντέλο σταθερής αποτέλεσμα. Αναλύσεις ευαισθησίας για να αξιολογηθεί η σταθερότητα των αποτελεσμάτων, δηλαδή, μία μελέτη στη μετα-ανάλυση έχει διαγραφεί κάθε φορά ώστε να αντικατοπτρίζει την επιρροή των μεμονωμένων ένα σύνολο δεδομένων σε συγκεντρωτική OR. Για να διαπιστωθεί αν υπήρχε μια προκατάληψη δημοσίευση, Χωνί οικόπεδα και εφαρμόστηκαν γραμμικής παλινδρόμησης δοκιμές Egger [12].

Όλες οι στατιστικές δοκιμασίες για αυτό το μετα-ανάλυση πραγματοποιήθηκαν με STATA έκδοση 10.0 (Κόλετζ Στέισον Stata Corporation, TX, ΗΠΑ).

Αποτελέσματα

Χαρακτηριστικά των μελετών

Ένα σύνολο των 40 επιλέξιμων μελέτες πληρούσαν τα κριτήρια ένταξης των προκαθορισμένων (Βλέπε Σχήμα S1), στην οποία 27, 26, 13 και 6 μελέτες pooleded για τις αναλύσεις του rs11614913, rs2910164, rs37464444, και rs2292832, αντίστοιχα (Πίνακας 1). Όλες οι μελέτες ήταν μελέτες ασθενών-μαρτύρων, μεταξύ των οποίων 8 μελέτες για ηπατοκυτταρικού καρκίνου (ΗΚΚ), 5 καρκίνου του μαστού, 5 γαστρικό καρκίνο, 4 καρκίνο του παχέος εντέρου, 3 ο καρκίνος του πνεύμονα, και 15 σε άλλους τύπους καρκίνου, και μία στο στήθος /καρκίνο των ωοθηκών ήταν εγγεγραμμένοι . Υπήρχαν 28 μελέτες της Ασίας απόγονος, 11 του Καυκάσου απόγονοι και ένα από τα μικτά εθνικότητα [13]. Για τον προσδιορισμό της SNPs, γονοτυπική με αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης-πολυμορφισμό μήκους θραύσματος περιορισμού (PCR-RFLP) και δοκιμασία TaqMan διεξήχθησαν στις 28 μελέτες. Επιπλέον, 34 μελέτες συμπεριλήφθηκαν με βάση το sex- έλεγχο και ίδιας ηλικίας για την υπόθεση ομάδες (έξι μελέτες με 2.050 περιπτώσεις και 2.626 έλεγχοι δεν συνοδεύτηκε από την ηλικία ή το φύλο), εκ των οποίων 33 έγιναν με βάση τον πληθυσμό και επτά ήταν στο νοσοκομείο -με βάση.

η

η ποσοτική σύνθεση

για rs11614913 πολυμορφισμό, παρατηρήθηκαν σημαντικές διαφορές για τη σύγκριση του ΤΤ έναντι CC και ΤΤ έναντι CC + CT. Όταν ομαδοποιούνται από τους τύπους καρκίνου, σημαντικές ενώσεις εξακολουθούν να βρίσκονται σε καρκίνο του παχέος εντέρου (ΤΤ έναντι CC: OR = 0.70, 95% CI: 0,57 – 0,85,

P

h = 0,284? ΤΤ + TC εναντίον CC: OR = 0.77, 95% CI: 0,65 – 0,91,

P

h = 0,377? ΤΤ έναντι CC + TC: OR = 0.80, 95% CI: 0,69 – 0,94,

P

h = 0,198), ο καρκίνος του πνεύμονα (ΤΤ έναντι CC: OR = 0.77, 95% CI: 0,65 – 0,91,

P

h = 0,284? ΤΤ + TC εναντίον CC: OR = 0.85, 95% CI: 0,74 – 0,98,

P

h = 0,289? ΤΤ έναντι CC + TC: OR = 0.83, 95% CI: 0,73 – 0,95,

P

h = 0,281). Εκτός από το μειωμένο κίνδυνο για καρκίνο του παχέος εντέρου και του καρκίνου του πνεύμονα, ένας μειωμένος κίνδυνος παρατηρήθηκε επίσης σε άλλες ομάδες του καρκίνου (CT vs. CC: OR = 1.23, 95% CI: 1.10 – 2.13,

P

h = 0,239? ΤΤ + CT εναντίον CC: OR = 1,13, 95% CI: 01.03 έως 01.25,

P

h = 0,096). ανάλυση μίας υποομάδας με βάση την εθνικότητα αποκάλυψε μια σημαντική συσχέτιση με τη σύγκριση των ΤΤ έναντι CC (OR = 0,80, 95% CI: 0,73 – 0,88,

P

h = 0.169), και ΤΤ έναντι CC + CT (OR = 0,85, 95% CI: 0,80-0,92,

P

h = 0,300) σε ασιατικό πληθυσμό της. ανάλυση υποομάδας καθορίζεται από την πηγή του ελέγχου αποκάλυψε μια σημαντική συσχέτιση μεταξύ του κινδύνου πολυμορφισμού και του καρκίνου τόσο στο νοσοκομείο και ο πληθυσμός τους ελέγχους με βάση τη σύγκριση των ΤΤ έναντι CC και ΤΤ έναντι CT + CC? Επιπλέον, παρατηρήθηκε επίσης μειωμένο κίνδυνο για τη σύγκριση των ΤΤ + CT εναντίον CC στο νοσοκομείο με βάση μελέτη, όπως συνοψίζεται στον Πίνακα 2.

Η

Για τον πολυμορφισμό rs2910164, δεν υπάρχει σημαντική συσχέτιση του κινδύνου παρατηρήθηκε σε η συνολική συγκεντρωτική ανάλυση. Ωστόσο, η ανάλυση του καρκίνου του τύπου υποομάδα αποκάλυψε ένα μειωμένο κίνδυνο για τη σύγκριση των CC εναντίον GG στην υποομάδα των HCC (OR = 0,76, 95% CI: 0,59 – 0,99,

P

h = 0,313 ), ο καρκίνος του προστάτη (OR = 0,77, 95% CI: 0,65 – 0,91,

P

h = 0,425), του τραχήλου της μήτρας καρκίνου (OR = 0,50, 95% CI: 0,37 – 0,68,

P

h = 0.814) και καρκίνο του οισοφάγου (OR = 0,58, 95% CI: 0,37 – 0,90,

P

h = 0,055). Ομοίως, παρατηρήθηκε μειωμένο κίνδυνο για τη σύγκριση των GC εναντίον GG στον καρκίνο του τραχήλου της μήτρας (OR = 0,71, 95% CI: 0,51 – 0,99,

P

h = 0,254), CC + GC εναντίον GG σε καρκίνο του οισοφάγου (OR = 0,79, 95% CI: 0,65 – 0,96,

P

h = 0,195), και CC εναντίον GG + GC στον καρκίνο του προστάτη (OR = 0,65, 95 % CI: 0,44 – 0,96,

P

h = 0,699) και καρκίνο του οισοφάγου (OR = 0,64, 95% CI: 0,41 – 0,98,

P

h = 0,079 ). ανάλυση υποομάδας με βάση την εθνικότητα αποκάλυψε ένα μειωμένο κίνδυνο στο ασιατικό πληθυσμό της (CC εναντίον GG: OR = 0.80, 95% CI: 0,67 – 0,96,

P

h = 0.000? GC εναντίον GG: Ή = 0.91, 95% CI: 0,84 – 0,98,

P

h = 0,139? CC + GC εναντίον GG: OR = 0.88, 95% CI: 0,79 – 0,99,

P

h = 0,002? CC εναντίον GG + GC: OR = 0.86, 95% CI: 0,76 – 0,98,

P

h = 0.000), αλλά δεν Καυκάσιο πληθυσμό. Ένα μειωμένο κίνδυνο παρατηρήθηκε επίσης για τη σύγκριση των CC εναντίον GG και στις δύο μελέτες με βάση τον πληθυσμό (OR = 0,87, 95% CI: 0.77-0.98,

P

h = 0.000) και τους ελέγχους του νοσοκομείου (OR = 0,65, 95% CI: 0,53 – 0,79,

P

h = 0.000), όταν εκτελείται η ανάλυση μίας υποομάδας με βάση την πηγή των ελέγχων. Σε αντίθεση, ένας αυξημένος κίνδυνος παρατηρήθηκε επίσης στην ομάδα άλλους καρκίνους για τη σύγκριση των CC + GC εναντίον GG (OR = 1,09, 95% CI: 1,00 – 1,19, Ζ = 2,02,

P

= 0,043 ,

P

h = 0,222), όπως συνοψίζεται στον πίνακα 3.

η

για τον πολυμορφισμό rs3746444, δεν υπήρχε σημαντική συσχέτιση του κινδύνου που παρατηρήθηκε για τη συνολική συγκεντρωτική ανάλυση του κινδύνου καρκίνου . Ωστόσο, η αύξηση των κινδύνων παρατηρήθηκαν για GG εναντίον ΑΑ (OR = 1,23, 95% CI: 1,00-1,50, Ζ = 2,00,

P

= 0,045,

P

h = 0,118), GA εναντίον ΑΑ (OR = 1,19, 95% CI: 1,01 – 1,41,

P

h = 0,001) και CC + GC εναντίον GG (OR = 1,14, 95% CI: 01.05 – 01.25,

P

h = 0,003) σε ασιατικών πληθυσμών και όχι στον Καυκάσιο πληθυσμό συνοψίζονται στον πίνακα 4. Για το rs2292832, δεν υπήρχε σημαντική συσχέτιση παρατηρήθηκε σε όλες τις συγκρίσεις (τα δεδομένα δεν παρουσιάζονται ).

η

Δοκιμή της ετερογένειας

Υπήρξε σημαντική ετερογένεια μεταξύ των μελετών του rs11614913, rs2910164, rs3746444, και ως εκ τούτου η πηγή της ετερογένειας διερευνήθηκε περαιτέρω με τη σύγκριση ετεροζυγώτες. Για την rs11614913, ο καρκίνος του τύπου (χ2 = 23.68, df = 5,

P

= 0.000) και την πηγή ελέγχου (χ2 = 5.63, df = 1,

P

= 0.018) ήταν η πηγή της ετερογένειας. Για rs2910164 πολυμορφισμού, τύπου καρκίνου (χ2 = 27,65, df = 6,

P

= 0.000) και την εθνικότητα (χ2 = 15.52, df = 3,

P

= 0.000) συνέβαλαν ουσιαστικά στην ανομοιογένεια. Για τον πολυμορφισμό rs3746444, εθνικότητα (χ2 = 8.38, df = 1,

P

= 0,004) συνέβαλαν ουσιαστικά στην ετερογένεια.

Η ανάλυση ευαισθησίας έδειξε ότι οι τέσσερις ανεξάρτητες μελέτες [14], [15 ], [16], [17] ήταν η κύρια αιτία της ετερογένειας για την rs11614913. Ετερογένεια μειώθηκε όταν οι μελέτες αυτές αφαιρέθηκαν (ΤΤ + CT εναντίον CC:

P

h = 0,061,

I

2 = 33.49%). Ομοίως, η ετερογένεια του rs2910164 (CC + GC εναντίον GG:

P

h = 0,060,

I

2 = 33,5%) και rs3746444 (ΦΕΚ + GA vs . AA:

P

h = 0.092,

I

2 = 39,8%) μειώθηκαν όταν τα τέσσερα [18], [19], [20], [ ,,,0],21] και οι τρεις [16], [22], [23] ανεξάρτητες μελέτες αφαιρεθεί, αντίστοιχα.

προκατάληψη δημοσίευση

οικόπεδο χοάνη Begg και δοκιμή Egger του έγιναν για να εκτιμηθεί η προκατάληψη δημοσίευση το παρόν διαθέσιμη βιβλιογραφία. Το σχήμα των οικοπέδων χοάνη δεν αποκάλυψε καμία ένδειξη προφανή ασυμμετρία σε όλα τα μοντέλα σύγκριση. Στη συνέχεια, δοκιμή του Egger χρησιμοποιήθηκε για να παρέχει στατιστικά στοιχεία για την πλοκή χοάνη συμμετρία. Τα αποτελέσματα επίσης δεν έδειξαν οποιαδήποτε ένδειξη σφάλματος εκ της δημοσίευσης (rs11614913:

t

= 0.25,

P

= 0,806, rs2910164:

t

= -0,70,

P

= 0,489, rs37464444:

t

= 1,88,

P

= 0,087, και rs2292832:

t

= 1.14,

P

= 0.318 για κυρίαρχο μοντέλο. Εικόνα 1).

Κάθε κύκλος υποδηλώνει μια ανεξάρτητη μελέτη για την υποδεικνυόμενη ένωση. Σύνδεση [OR], το φυσικό λογάριθμο του OR. Οριζόντια γραμμή αντιπροσωπεύει την μέση μέγεθος της επίδρασης. Α: rs11614913, Β: rs2910164, C: rs37464444, D: rs2292832

Η

Συζήτηση

Σε αυτό το μετα-ανάλυση, μια ένωση μεταξύ των τεσσάρων κοινών SNPs σε microRNAs (rs11614913,. rs2910164, rs3746444, rs2292832 και) και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου αξιολογήθηκε από συγκεντρωτικά αποτελέσματα από 40 δημοσιευμένες μελέτες. Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι ο γονότυπος rs11614913TT συσχετίστηκε με μειωμένο κίνδυνο για την ανάπτυξη καρκίνου, ιδιαίτερα του καρκίνου του παχέος εντέρου και του καρκίνου του πνεύμονα, ή σε ασιατικών πληθυσμών, και ότι το αλληλόμορφο rs2910164C συσχετίστηκε με μειωμένο κίνδυνο για την ανάπτυξη καρκίνου του οισοφάγου, ο καρκίνος του τραχήλου της μήτρας , καρκίνο του προστάτη και HCC, ιδίως των ασιατικών πληθυσμών. Σε αντίθεση με τα παραπάνω, το αλληλόμορφο rs3746444G παρατηρήθηκε ως παράγοντας κινδύνου για καρκίνο σε ασιατικό πληθυσμό της? Ωστόσο, ο πολυμορφισμός rs2292832 δεν σχετίστηκε με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου.

Ο πολυμορφισμός rs11614913 υπάρχουν στο miR-196a2 έχει σημαντικά μεγαλύτερη επίδραση στην έκφραση του miR-196a και σχετίζεται με διάφορες καρκινογένεση [24], [25], [26]. Αν και υπήρχαν μελέτες που ανέφεραν καμία άμεση συσχέτιση μεταξύ rs11614913 και την έκφραση του miR-196a [9], [13], μελέτες προηγούμενο, μετα-ανάλυση έχουν προτείνει τη σύνδεση μεταξύ rs11614913 και τον κίνδυνο καρκίνου [7], [27], [ ,,,0],28], [29], Αυτή η ενημερωμένη μετα-ανάλυση περαιτέρω υποστηρίζουν το rs11614913 ΤΤ γονότυπο συσχετίστηκε με μειωμένο κίνδυνο για καρκίνο. Επιπλέον, σημαντικές συσχετίσεις παρατηρήθηκαν σε ασιατικών πληθυσμών αλλά όχι στον Καυκάσιο πληθυσμό, γεγονός που υποδηλώνει μια πιθανή εθνοτική διαφορά στο γενετικό υπόβαθρο και το περιβάλλον, η οποία ήταν η παρόμοια με αυτή που αναφέρθηκε από τους Chu et al [28] και Wang et al [ ,,,0],27]. Σε αντίθεση με τα δημοσιευμένα συγκεντρωτικά αποτελέσματα, αυτό το ενημερωμένο συγκεντρωτικά αποτελέσματα αποκάλυψαν ότι το TT rs116114913 θα μπορούσε να είναι ένας προστατευτικός παράγοντας έναντι ορθοκολικού καρκίνου και του καρκίνου του πνεύμονα. Ωστόσο, δεν υπάρχει σημαντική συσχέτιση παρατηρήθηκε στον καρκίνο του μαστού, γεγονός που υποδηλώνει ότι καρκινογόνες μηχανισμοί μπορεί να διαφέρουν στις θέσεις του όγκου και HSA-miR-196a2 γενετικές παραλλαγές .. Ο κίνδυνος διαφορετικών τύπων καρκίνου θα πρέπει να επιβεβαιωθεί από άλλες μελέτες.

για το rs2910164, δεν υπάρχει σημαντική συσχέτιση παρατηρήθηκε στη συνολική συγκεντρωτική αποτελέσματα, όπως υποστηρίζεται από την έκθεση του Xu et [7] al. Σε αντίθεση με τα δημοσιευμένα αποτελέσματα, η μελέτη αυτή αποκάλυψε την διαφορετική σχέση μεταξύ rs2910164 πολυμορφισμού και του κινδύνου καρκίνου μεταξύ εθνικότητας και τους τύπους καρκίνου. Ο γονότυπος rs2910164 CC συσχετίστηκε με μειωμένο κίνδυνο για καρκίνο του οισοφάγου, καρκίνο του τραχήλου, τον καρκίνο του προστάτη, και HCC σε ασιατικό πληθυσμό της, γεγονός που υποδηλώνει τη διαφορά στην γενετικό υπόβαθρο και το περιβάλλον, και παθογένεση των διαφορετικών τόπων όγκου. Η rs2910164 του miR-146aG & gt? Γονίδιο C βρίσκεται στην αντίθετη στέλεχος περιοχή με την ώριμη miR-146 σειρά και έχει ως αποτέλεσμα μια αλλαγή από το ζεύγος G:U να C:U αναντιστοιχία στη δομή στελέχους των πρόδρομων miR-146a. Έχει αναφερθεί ότι ο πρόδρομος miR-146a G-αλληλομόρφων θα μπορούσαν να αυξήσουν την παραγωγή των ώριμων miR-146a και δεσμευτική mRNA που επηρεάζουν στόχο [18], [19].

Η rs3746444 πολυμορφισμού που υπάρχει στο miR-499 θα στοχεύουν στην SOX6 και τα γονίδια Rod1 σημαντικό ρόλο για την αιτιολογία των καρκίνων [30], [31]. Τα συγκεντρωτικά αποτελέσματα από 13 μελέτες αποκάλυψαν ότι rs3746444G αλληλόμορφο συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο για την ανάπτυξη καρκίνου σε ασιατικών πληθυσμών. Για τις γνώσεις μας, αυτή είναι η πρώτη μετα-analysisabout η ένωση του rs3746444 του καρκίνου από 11 ασιατικές πληθυσμιακές μελέτες και δύο Καυκάσου πληθυσμιακές μελέτες. Περισσότερες μελέτες θα πρέπει να συσσωρεύονται για να επιβεβαιωθούν τα αποτελέσματα. Ο πολυμορφισμός rs2292832 έχει επίσης αξιολογηθεί από έξι συμμετείχαν μελέτες, με σημαντικές συσχετίσεις βρέθηκαν από όλα τα συγκεντρωτικά αποτελέσματα. Μέχρι στιγμής, λίγες επιδημιολογικές μελέτες έχουν διερευνήσει τη σχέση του rs2292832 πολυμορφισμό και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου.

Η ετερογένεια παρατηρήθηκαν στις μελέτες για τους πολυμορφισμούς του rs11614913, rs2910164, rs3746444, η πηγή της ετερογένειας ήταν κυρίως από τον καρκίνο τύπου, όπως γλοίωμα, τη χοληδόχο κύστη, της ουροδόχου κύστης, και θηλώδες καρκίνωμα του θυρεοειδούς και του καρκίνου του τραχήλου, υποδηλώνοντας πολυμορφισμοί στο miRNAs μπορεί να παίζουν διαφορετικούς ρόλους ανάλογα από τον τύπο του καρκίνου. Επιπλέον, διαφορετικές κίνδυνο πολυμορφισμών στα miRNAs ήταν επίσης η πηγή της ετερογένειας, σημαντικές συσχετίσεις παρατηρήθηκαν στις περισσότερες μελέτες για τις ασιατικές πληθυσμούς. Οι μελέτες βασίζονται σε διαφορετική πηγή του ελέγχου ήταν επίσης η πηγή της ετερογένειας των μελετών.

Αν μετα-ανάλυση είναι ισχυρή, η μελέτη μας εξακολουθεί να έχει κάποιους περιορισμούς. Κατ ‘αρχάς, μας μετα-ανάλυση δεν αξιολογεί κάθε πιθανή αλληλεπίδραση αλληλεπίδραση γονιδίων-γονιδίων και γονιδίων-περιβάλλοντος, λόγω της έλλειψης των σχετικών δημοσιευμένων στοιχείων. Δεύτερον, αν και συνοπτικά όλες οι επιλέξιμες μελέτες, το σχετικά μικρό μέγεθος του δείγματος των μελετών μπορεί να οδηγήσει σε μειωμένη στατιστική ισχύς όταν κατανεμημένες ανάλογα με την κατάσταση τύπο του όγκου, την εθνικότητα ή τη μόλυνση. Τέλος, σχετικά μεγάλη ετερογένεια παρατηρήθηκε σε όλες τις όλες τις μελέτες που εμπλέκονται.

Εν ολίγοις, αυτή η μετα-ανάλυση πρότεινε ότι ο γονότυπος rs11614913TT συσχετίστηκε με μειωμένο κίνδυνο καρκίνου, ειδικά για τον ορθοκολικό καρκίνο και τον καρκίνο του πνεύμονα, ότι η rs2910164C αλληλόμορφο ήταν ένας προστατευτικός παράγοντας για καρκίνο του οισοφάγου, ο καρκίνος του τραχήλου της μήτρας, καρκίνο του προστάτη και HCC, και ότι οι rs11614913, rs2910164 και rs3746444 SNPs είχαν παράγοντες κινδύνου για καρκίνο στο ασιατικό πληθυσμό της.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Εικόνα S1 .

διαδικασία επιλογής μελετών ασθενών-μαρτύρων.

doi: 10.1371 /journal.pone.0049032.s001

(DOC)

Ευχαριστίες

Εκτιμούμε Καθ Χονγκ-Guang Xie, Κεντρικό Εργαστήριο, Nanjing Πρώτη Νοσοκομείο, Ναντζίνγκ Ιατρικό Πανεπιστήμιο, Jiangsu, Κίνα, για την κριτική εξέταση του και την επιστημονική επιμέλεια του χειρογράφου και εποικοδομητικές παρατηρήσεις.