Αφηρημένο

Ιστορικό

Η διαμάχη των CpG φαινότυπο νησιού methylator (CIMP) σε γαστρικό καρκίνο επιμένει, παρά το γεγονός ότι πολλές μελέτες έχουν διεξαχθεί σχετικά με τη σχέση της με το

Helicobacter pylori

(η

pylori

), Epstein-Barr ιός (EBV), και αστάθεια μικροδορυφόρου (MSI) και την πρόγνωση. Για να οδηγήσετε μια πιο ακριβή εκτίμηση της αυτή η αξιωματική σχέση, μια μετα-ανάλυση έγινε με βάση τις υπάρχουσες σχετικές μελέτες.

Μέθοδοι

Είμαστε σε συνδυασμό ατομικών στοιχείων των ασθενών από τις 12 μελέτες που συμμετείχαν 1000 ασθενείς με γαστρικό του καρκίνου, οι οποίες πληρούσαν τα κριτήρια. Εμείς πίνακα και αναλύονται οι παράμετροι από κάθε μελέτη, συμπεριλαμβανομένων H.

πυλωρού

, EBV, MSI, και κλινικές πληροφορίες των ασθενών.

Αποτελέσματα

Η συνολική ή H.

πυλωρού

μόλυνση στο CIMP θετική ομάδα

vs.

αρνητική ομάδα αποκάλυψε ότι σημαντικά αυξημένα κινδύνους των θετικών H.

πυλωρού

μόλυνση στην πρώην επιτεύχθηκαν (OR 2.23 95% CI, 1,25 – 4,00? P = 0,007, P

ετερογένεια = 0,05). Ομοίως, η ισχυρή σχέση μεταξύ της μόλυνσης EBV και CIMP επιτεύχθηκε με OR 51.27 (95% CI, 9,39 έως 279,86? P & lt? 0,00001, P

ετερογένεια = 0,39). . Η συνολική Ή για MSI σε CIMP θετική ομάδα

vs

αρνητική ομάδα ήταν 4,44 (95% CI, 1,17 έως 16,88? P = 0,03, P

ετερογένεια = 0,01). Ωστόσο, εκεί, δεν φαίνεται να υπάρχουν συσχετίσεις με κλινικές παραμέτρους όπως θέση του όγκου, παθολογική τύπου, κυτταρική διαφοροποίηση, στάδιο TNM, μακρινή μετάσταση, μετάσταση λεμφαδένα, και η επιβίωση των 5 ετών.

Συμπεράσματα

Η μετα-ανάλυση αναδεικνύει την ισχυρή σχέση της CIMP με H.

πυλωρού

, EBV, και MSI, αλλά CIMP δεν μπορεί να χρησιμοποιηθεί ως προγνωστικός δείκτης για καρκίνο του στομάχου.

Παράθεση : Zong L, Seto Υ (2014) CpG νησί Methylator φαινότυπο,

Helicobacter pylori

, ιό Epstein-Barr, και αστάθεια μικροδορυφόρου και πρόγνωση σε γαστρικό καρκίνο: Μια συστηματική ανασκόπηση και μετα-ανάλυση. PLoS ONE 9 (1): e86097. doi: 10.1371 /journal.pone.0086097

Επιμέλεια: Ivo Γ Boneca, Ινστιτούτο Παστέρ στο Παρίσι, Γαλλία

Ελήφθη: 5 Ιούν, 2013? Αποδεκτές: 11 Δεκ 2013? Δημοσιεύθηκε από: January 27, 2014

Copyright: © 2014 Zong, Seto. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Δεν υπάρχει τρέχουσα εξωτερικές πηγές χρηματοδότησης για τη μελέτη αυτή

Αντικρουόμενα συμφέροντα:. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

καρκίνο του στομάχου είναι η τέταρτη πιο συχνή κακοήθεια και η δεύτερη κορυφαία. αιτία θανάτου από καρκίνο στον κόσμο [1]. Ακόμη και τα προγράμματα προσυμπτωματικού ελέγχου με photofluorography βαρίου ή ενδοσκόπηση επιτρέπει την έγκαιρη ανίχνευση στην Ιαπωνία και την Κορέα, οι ασθενείς με προχωρημένο καρκίνο του στομάχου είναι ακόμη χειρότερα σε 5-ετή συνολική επιβίωση. Προσδιορισμός των μοριακών εκτροπές σε καρκίνο του στομάχου μπορεί να βελτιώσει την κατανόηση της γαστρικής καρκινογένεσης, να εντοπίσει στρατηγικές για την υποδιαίρεση των ασθενών στις σχετικές υποομάδες, και να τονίσει τα νέα μέσα μοριακό στόχο. Αν και οι μοριακοί μηχανισμοί της γαστρικής καρκινογένεσης του καρκίνου παραμένουν ασαφή, οι δύο γενετικές και επιγενετικές αλλαγές είναι σημαντικές. Γενετικές αλλοιώσεις είναι υπεύθυνα για την ενεργοποίηση των onceogenes και αδρανοποίηση του γονιδίου καταστολής όγκων. Επιγενετικές αλλοίωση μέσω μεθυλίωσης του DNA είναι γνωστό ότι παίζει ένα σημαντικό ρόλο στην αναστολή της έκφρασης των γονιδίων των όγκων που σχετίζονται με.

Η παρεκκλίνουσα μεθυλίωση του DNA στον καρκίνο συνοψίζεται ως παγκόσμιο υπομεθυλίωση και περιφερειακές υπερμεθυλίωσης, οι οποίες συνδέονται με γενωμική αστάθεια και αδρανοποίηση των γονιδίων καταστολής όγκων, αντίστοιχα [2]. Ωστόσο, οι περιφερειακές υπερμεθυλίωση αναφέρεται στην παρεκκλίνουσα μεθυλίωση του κανονικά μη μεθυλιωμένες ακολουθίες, οι περισσότεροι εκ των οποίων είναι συστάδες των περιοχών CpG, συμβολίζεται νησί CpG. Επειδή πολλαπλά γονίδια ταυτόχρονα μεθυλιώνονται στο υπερμεθυλιωμένων υπότυπο, η έννοια CIMP εισήχθη για πρώτη φορά με τα μοριακά μονοπάτια του παχέος εντέρου από την ομάδα του Δρ Issa [3]. Μετά από αυτό, οι επιστήμονες έχουν διαπιστώσει ότι CIMP θετικά του παχέος εντέρου έχουν μια στενή συνεργασία με τους μοριακούς και κλινικοπαθολογοανατομικών χαρακτηριστικά, και φτωχή πρόγνωση [4] – [6]

Επίσης, η παρουσία του CIMP θετικών γαστρικό καρκίνο. έχει αναφερθεί από πολλούς επιστήμονες [7] – [24], αλλά αμφιλεγόμενη δεδομένα δεν επιβεβαιώνουν την προγνωστική αξία της CIMP για καρκίνο του στομάχου. Αυτό ήταν πιθανόν λόγω του μικρού μεγέθους του δείγματος ή συγχυτικούς παράγοντες. Ως εκ τούτου, έχουμε ξεκινήσει μια διεθνή συλλογική προσπάθεια η οποία οδήγησε σε μια μετα-ανάλυση των δεδομένων για κάθε ασθενή σε προοπτικές μελέτες κοόρτης για να αξιολογηθεί η σχέση μεταξύ CIMP και κακοήθη συμπεριφορά σε καρκίνο του στομάχου.

Μέθοδοι

Αναζήτηση δημοσίευση

Δύο ηλεκτρονικές βάσεις δεδομένων (PubMed και Embase) αναζητήθηκαν (τελευταία αναζήτηση ενημερώθηκε στις 21 Νοεμβρίου 2012, με τη χρήση των όρων αναζήτησης:. «Καρκίνος στομάχου» και «CIMP« Όλες οι επιλέξιμες μελέτες ανακτήθηκαν και τους βιβλιογραφίες ελέγχθηκαν για άλλες σχετικές δημοσιεύσεις. Επανεξέταση άρθρα και βιβλιογραφίες άλλων συναφών μελετών που εντοπίστηκαν ήταν χέρι-αναζήτηση για τον εντοπισμό πρόσθετων επιλέξιμων μελέτες. συμπεριλήφθηκαν μόνο δημοσιευμένες μελέτες με άρθρα πλήρους κειμένου. Όταν το ίδιο πληθυσμό ασθενών συμπεριλήφθηκε σε αρκετές δημοσιεύσεις, μόνο η πιο πρόσφατη ή ολοκληρωμένη μελέτη χρησιμοποιήθηκε σε αυτό το μετα-ανάλυση

κριτήρια ένταξης

η συμπερίληψη κριτήρια έχουν ως εξής:. (α) την αξιολόγηση της σχέσης μεταξύ CIMP και H.

του πυλωρού

, EBV, MSI ή κλινικών προγνωστικών παραμέτρων? (Β) μεθυλίωση προαγωγού? και (γ) επαρκή δημοσιευμένα στοιχεία για την εκτίμηση αναλογία πιθανοτήτων (OR) με 95% διάστημα εμπιστοσύνης (CI).

Data Extraction

Πληροφορίες εκχυλίζεται προσεκτικά από όλες τις επιλέξιμες μελέτες από δύο από τα συγγραφείς (Zong L και Seto Υ), σύμφωνα με τα κριτήρια συμπερίληψης που αναφέρονται παραπάνω. Τα ακόλουθα δεδομένα συλλέχθηκαν από κάθε μελέτη: πρώτο συγγραφέα επώνυμο, ημερομηνία δημοσίευσης, η μέθοδος της μελέτης, το μέγεθος του δείγματος, ο συνολικός αριθμός των ασθενών με θετικά CIMP και αρνητικές CIMP, και ο αριθμός των ασθενών που διαιρείται με την ηλικία, το φύλο, την περιοχή του όγκου, παθολογική τύπου, των κυττάρων διαφοροποίησης, το στάδιο TNM, λεμφικό μετάσταση στους λεμφαδένες, μακρινή μετάσταση και 5-ετή συνολική επιβίωση σε άτομα με και χωρίς CIMP, αντίστοιχα. Δεν καθορίσει ένα ελάχιστο αριθμό ασθενών για να συμπεριληφθούν στην μας μετα-ανάλυση.

Στατιστική Ανάλυση

Μονά αναλογίες με 95% CI χρησιμοποιήθηκαν για να εκτιμηθεί η συσχέτιση της CIMP με H.

pylori

, EBV, και MSI και πρόγνωση, σύμφωνα με τη μέθοδο του Woolf. παραδοχή ετερογένεια επιβεβαιώθηκε από το X

2-based Q-test. Μια Ρ-τιμή μεγαλύτερη από 0,10 για το Q-δοκιμή έδειξε έλλειψη ετερογένεια μεταξύ των μελετών, ως εκ τούτου, η εκτίμηση για κάθε μελέτη υπολογίσθηκε από το μοντέλο σταθερών επιδράσεων. Διαφορετικά, χρησιμοποιήθηκε το μοντέλο τυχαίων δράσεων. Η σημασία του ομαδοποιημένου OR προσδιορίστηκε με την Ζ-δοκιμή και Ρ & gt? 0,05 θεωρήθηκε στατιστικά σημαντική. αναλύσεις ευαισθησίας διεξήχθησαν για να προσδιοριστεί εάν η τροποποίηση των κριτηρίων ένταξης για αυτό το μετα-ανάλυση επηρέασαν τα τελικά αποτελέσματα. Μια εκτίμηση των πιθανών προκατάληψη δημοσίευση διεξήχθη με τη χρήση του οικοπέδου χοάνη, στην οποία η OR για κάθε μελέτη συναρτήσει του log (ή). Ένα ασύμμετρο οικόπεδο πρότεινε δυνατή προκατάληψη δημοσίευση. Χωνί οικόπεδο ασυμμετρία αξιολογήθηκε χρησιμοποιώντας δοκιμασία γραμμικής παλινδρόμησης Egger, η προσέγγιση γραμμική παλινδρόμηση για να μετρήσει χοάνη οικόπεδο ασυμμετρία στο φυσικό λογάριθμο κλίμακα των ΙΑΠ. Η σημασία της τομής προσδιορίζεται από το t-test, όπως προτείνεται από Egger (P & lt? 0,05 θεωρήθηκε αντιπροσωπευτικό των στατιστικά σημαντική προκατάληψη δημοσίευση). Όλες οι στατιστικές δοκιμές πραγματοποιήθηκαν με κριτική Διευθυντής Έκδοση 5.0 (συνεργασία Cochrane, Οξφόρδη, Αγγλία).

Αποτελέσματα

Χαρακτηριστικά Μελέτη

Ένα σύνολο των 18 εκδόσεων συνάντησε τον βασικό ένταξη κριτηρίων [7] – [24]. Η μελέτη από Oue

et al

αποκλείστηκε επειδή δεν κατηγοριοποιούνται σε CIMP υποομάδες με μετουσιωμένο πίνακα γονίδιο [7]. Επιπλέον, η μελέτη από Kanai

et al

αποκλείστηκε επειδή επικεντρώθηκε στην μεθυλίωσης του DNA του ΚΚΕ νησιά και pericentromeric δορυφορική περιοχές του παχέος εντέρου και του καρκίνου του στομάχου [8]. Ομοίως, η μελέτη από Oshimo

et al

αποκλείστηκε επειδή ανέλυσε κυρίως τη σχέση μεταξύ των επιγενετικών αδρανοποίηση των RIZ1 και CIMP [9]. Η μελέτη από Watanabe

et al

δεν συμπεριλήφθηκε επειδή προσπάθησαν να αποδείξουν την πιστότητα στην αντιγραφή προτύπων μεθυλίωσης του DNA στα καρκινικά κύτταρα να οδηγήσουν σε πυκνή μεθυλίωση του νησιού CpG [10]. Άλλες μελέτες είχαν αποκλειστεί λόγω των ανεπαρκών πληροφοριών για τον υπολογισμό ή [11], [12]. Ως εκ τούτου, ένα σύνολο 12 μελετών, συμπεριλαμβανομένων 1.000 ασθενών χρησιμοποιήθηκαν στις συγκεντρωτικές αναλύσεις. Ο Πίνακας 1 παραθέτει τις μελέτες που εντοπίστηκαν και τα κύρια χαρακτηριστικά τους. Από τις 12 ομάδες, το μέγεθος του δείγματος κυμαίνονταν από 40 έως 200 (Σχήμα 1).

Η

Συσχέτιση με μόλυνση από τον ιό και Μοριακής Σταθερότητας

Η συνολική ή H.

πυλωρού

μόλυνση στο CIMP θετική ομάδα

vs.

αρνητική ομάδα αποκάλυψε ότι σημαντικά αυξημένα κινδύνους των θετικών H.

πυλωρού

μόλυνση στην πρώην επιτεύχθηκαν (OR 2.23 95% CI, 1,25 -4.00? P = 0,007, P

ετερογένεια = 0,05). Ομοίως, η ισχυρή σχέση μεταξύ της μόλυνσης EBV και CIMP επιτεύχθηκε με OR 51.27 (95% CI, 9,39 έως 279,86? P & lt? 0,00001, P

ετερογένεια = 0,39). . Η συνολική Ή για MSI σε CIMP θετική ομάδα

vs

αρνητική ομάδα ήταν 4,44 (95% CI, 1,17 έως 16,88? P = 0,03, P

ετερογένεια = 0,01) (Πίνακας 2 και Σχήμα 2).

Η

Συσχετισμός με την κλινική Πληροφορίες

Η μετα-ανάλυση των δύο κατανομή ηλικίας και φύλου στην CIMP θετικά

vs.

-αρνητικοί ομάδες δεν το έκανε επιτύχουν στατιστική σημαντικότητα (OR 1.10 95% CI, 0,63 – 1,93? P = 0,74, P

ετερογένεια = 0.52) και (OR 0.69 95% CI, 0,48 – 1,00? P = 0,05, P

ετερογένεια = 0,91) . . Η συνολική Ή για την περιοχή του όγκου στο CIMP θετικά

vs

-αρνητικοί υποομάδες ήταν 0,85 (95% CI, 0,51 – 1,44? P = 0,55, P

ετερογένεια = 0,17). Η συνολική Ή είτε παθολογική τύπο ή κυτταρική διαφοροποίηση στην CIMP θετικά

vs

-αρνητικοί υποομάδων δεν έδειξε θετικό αποτέλεσμα (OR 0.63 95% CI, 0,31 – 1,28?. Ρ = 0,20, P

ετερογένεια = 0,03 και OR 0.64 95% CI, 0,29 – 1,42?. Ρ = 0,027, P

ετερογένεια = 0,68, αντίστοιχα) (Πίνακας 2 και Σχήμα 3)

Η

Συσχέτιση με Προγνωστικοί Παράμετροι

Αν και μερικές μελέτες ανέφεραν ότι CIMP μπορεί να συσχετίζονται με καλύτερη πρόγνωση σε γαστρικό καρκίνο, δεν έχει σημασία στη σκηνή ΤΝΜ, μακρινή μετάσταση, μετάσταση στους λεμφαδένες, ή ακόμα και το ποσοστό επιβίωσης 5 ετών, CIMP δεν έχουν καμία σημαντική συσχέτιση με έναν από αυτούς στην ανάλυσή μας (Πίνακας 2 και Σχήμα 4).

η

δημοσίευση Bias

οικόπεδο χοάνη Begg για διεξήχθη για να εκτιμήσει προκατάληψη δημοσίευση. Οι δοκιμές ετερογένεια για τη σύγκριση των 12 συνδυασμένες μελέτες έδειξαν ετερογένεια σε ορισμένες αναλύσεις, όπως MSI, παθολογικές τύπου, μακρινή μετάσταση και επιβίωση 5 ετών. Ωστόσο, καμία μελέτη επηρεάζεται η συγκεντρωτική ή ποιοτικά όπως φαίνεται από την ευαισθησία αναλύσεις (τα δεδομένα δεν παρουσιάζονται).

Συζήτηση

έχουν επιγενετικές διαταραχές προταθεί ότι είναι σημαντικός για την έναρξη γεγονότων στην σχηματισμός καρκίνου [25] . Ωστόσο, με την εκτεταμένη συμμετοχή του παρεκκλίνουσα μεθυλίωσης του DNA σε ανθρώπινους καρκίνους γίνει σαφές, η περιστασιακή παρουσία παρεκκλίνουσας μεθυλίωσης του DNA σε μη καρκινικούς ιστούς αναγνωρίστηκε στον οισοφάγο του Barrett [26], το στομάχι [27], του παχέος εντέρου [28], [29 ], και το ήπαρ [30], η οποία πρότεινε τη συμμετοχή της πρώην στον τομέα των σχηματισμός καρκίνου. Η χρόνια φλεγμονή, πιθανώς συγκεκριμένα είδη είναι πιθανό να προκαλέσει παρεκκλίνουσα μεθυλίωση του DNA σε φυσιολογικούς ιστούς και έτσι σχηματίζουν ένα «επιγενετική πεδίο για σχηματισμός καρκίνου». Για την παροχή αποδεικτικών στοιχείων, είναι γνωστό ότι η χρόνια φλεγμονή παίζει σημαντικό ρόλο στην ελκώδη κολίτιδα για καρκίνους του παχέος εντέρου, χρόνια ηπατίτιδα για καρκίνους του ήπατος, και οισοφάγος Barrett για οισοφάγου καρκίνους. Μόλυνση από τον Η

pylori

είναι γνωστό ότι προκαλεί σοβαρή χρόνια φλεγμονή, οι οποίες εμπλέκονται στην επαγωγή του πεδίου για γαστρικών καρκίνων. Επιπλέον, παρεκκλίνουσα μεθυλίωση του DNA στο γαστρικό βιοψίες από H.

pylori

ασθενείς

+ βρέθηκε να συσχετίζεται με μεγαλύτερο γαστρικό κίνδυνο καρκίνου σε διάφορες μελέτες [31], [32]. Ως εκ τούτου, παρεκκλίνουσα μεθυλίωση του DNA μπορεί να είναι το βασικό γεγονός στην καρκινογένεση του καρκίνου του στομάχου.

Στην τελευταία δεκαετία, η προσεκτική ποσοτική αξιολόγηση έδειξε ότι πολλά γονίδια που είναι ιδιαίτερα μεθυλιώνονται στο καρκίνωμα δείχνουν επίσης ένα χαμηλό, αλλά μετρήσιμο βαθμό της μεθυλίωσης στο φυσιολογικό βλεννογόνο [33]. Επιπλέον, παρεκκλίνουσα μετουσιωμένο περιοχή εστιάζοντας στον υποκινητή πλούσια σε CpG νησίδες πρότεινε το βασικό βήμα για επιγενετικές γονιδιακή αποσιώπηση. Συνεπώς, είναι απαραίτητο να φωτιστούν οι καταστάσεις μεθυλίωσης μιας ομάδας αντιπροσωπευτικών γονιδίων σε ένα άτομο ασθένεια. Για την επίτευξη αυτού του στόχου, CpG φαινότυπος νησί methylator εισήχθη από την Toyota

et al

[3]. Μέχρι τώρα, ήταν καλά αποδεικνύεται ότι CIMP σχετίζεται με κακή πρόγνωση σε ορθοκολικό καρκίνο, καρκίνο του πνεύμονα και νευροβλάστωμα. Αν και ο όρος «CIMP» έχει χρησιμοποιηθεί σε μια ποικιλία τρόπων, στο πλαίσιο του γαστρικού καρκίνου [18], προγνωστική αξία του σε γαστρικό καρκίνο είναι ακόμα αμφιλεγόμενη. Για παράδειγμα, ένα

et al.

Έδειξε ότι CIMP, η οποία συσχετίζεται με κακοήθη χαρακτηριστικά για ιστοπαθολογική εξέταση, ήταν ένας ανεξάρτητος προγνωστικός παράγοντας για τη συνολική και να προκαλέσουν ειδικές επιβίωσης σε ασθενείς με καρκίνο του στομάχου [14], ενώ η Kim

et al.

και Zhang em> et al.

παρέλειψε να παρατηρήσει μια τέτοια ένωση [15]

et al.

Πρότεινε ότι CIMP-υψηλής GCs χαρακτηρίστηκαν με χαρακτηριστική κλινικοπαθολογοανατομικές παραμέτρους, συμπεριλαμβανομένων φτωχή πρόγνωση [22]. Ωστόσο, σε αντίθεση, Chang

et al.

Και Kusano

et al.

Πρότειναν ότι CIMP-υψηλής δείχνει καλύτερη πρόγνωση [17], [18]. Μερικοί επιστήμονες υποτίθεται ότι η διαφορά αυτή μπορεί να προέλθει από τη χρήση διαφορετικών πάνελ δείκτη CIMP όπως τον καθορισμό του καθεστώτος CIMP? Ωστόσο, υπήρξε ένα κοινό σημείο αυτών των μελετών στις οποίες το μεθυλιωμένο αναφέρω γονιδίων δεικτών CIMP ψέματα στην υποκινητή. Ως εκ τούτου, εξακολουθεί να αντιπροσωπεύει μια τάση επίπεδο μεθυλίωσης σε υποκινητή, με την οποία η CIMP έχει νόημα σε ογκογένεση του καρκίνου του στομάχου. Κατά τη γνώμη μας, οι μελλοντικοί δεδομένα ήταν λιγότερο πειστικά, κυρίως λόγω του μικρού μεγέθους του δείγματος και την έλλειψη στατιστικής ισχύος για την ενσωμάτωση σποραδικές μεμονωμένες μελέτες.

Με στόχο να διερευνήσει την πιθανή αξία των CIMP στο γαστρικό καρκίνο, πραγματοποιήσαμε αυτή μετα-ανάλυση των δημοσιευμένων μελετών για να καθοριστεί μια συνολική συγκεντρωτική εκτίμηση. Από μερικές μελέτες έχουν χωριστεί ασθενείς σε τρεις ομάδες, CIMP-υψηλή, CIMP-άμεση, CIMP-χαμηλά, συνδυάζουμε την τελευταία δύο σε CIMP αρνητικά υποτύπου σε σύγκριση με καμία αλλαγή CIMP-υψηλές όσο CIMP θετικά υπότυπο. Από τον πίνακα 2, τα ευρήματά μας υποδηλώνουν έντονα ότι το H.

πυλωρού

και λοιμώξεις EBV προκαλέσει την παρεκκλίνουσα DNA υπερμεθυλίωση των συγκεκριμένων γονιδίων και να προκαλέσει CIMP, ένα σημαντικό επιγενετικές μηχανισμό της ογκογένεσης. Ωστόσο, ο μηχανισμός για την παρεκκλίνουσα υπερμεθυλίωση του DNA που προκαλούνται από τον H.

πυλωρού

θα μπορούσε να είναι διαφορετική από ότι με EBV. Πρόσφατη μελέτη από Huang

et al.

Υποστηρίζεται ότι H.

πυλωρού

μόλυνση προκαλεί γαστρικού βλεννογόνου φλεγμονώδεις αποκρίσεις, με αποτέλεσμα την προς τα πάνω ρύθμιση της ιντερλευκίνης-1β (IL-1β) και υπερπαραγωγή του νιτρικού μεταλλαξιογόνων του αζώτου (ΝΟ), με την οποία παρεκκλίνουσα μεθυλίωση του DNA επάχθηκε [34]. Όσο για τη μόλυνση EBV, προτάθηκε ότι ο μηχανισμός της μεθυλίωσης σε κύτταρα-ξενιστές μπορεί να είναι κατά κύριο λόγο για την άμυνα κατά των ξένων DNA και ότι το κράτος με γνώμονα την εκτεταμένη μεθυλίωση του γονιδιώματος του ιού μπορεί επίσης να προκαλέσει γονιδίωμα του ξενιστή μεθυλίωση [35]. Αποδείχθηκε επίσης επανειλημμένα ότι η άμεση αλληλεπίδραση των ιικών λανθάνουσας πρωτεϊνών με DNA μεθύλιο τρανσφεράσες (DNMT), προς τα πάνω ρύθμιση των γονιδίων DNMT από ιογενή λανθάνουσα πρωτεΐνες, και αυξημένη έκφραση των πρωτεϊνών της ομάδας Polycomb μπορεί να συνεισφέρει στην εναλλαγές στο DNA μεθυλίωση και τροποποιήσεις των ιστονών [35 ] – [38]

Επιπλέον, η ισχυρή σχέση CIMP με MSI αποκαλύπτει ότι CIMP έχει δυνητικό σχέση με γονιδιακές μεταλλάξεις, οι οποίες μπορεί να συνεργάζονται μεταξύ τους στην ανάπτυξη και εξέλιξη του καρκίνου του στομάχου.. Ωστόσο, η μετα-ανάλυση δεν έδειξε τυχόν συσχετίσεις με τις κλινικές παραμέτρους όπως η ηλικία, το φύλο, θέση του όγκου, παθολογική τύπου, διαφοροποίηση των κυττάρων, το στάδιο TNM, μακρινή μετάσταση, λεμφικό μετάσταση στους λεμφαδένες, και την επιβίωση 5 ετών.

Εάν CIMP ήταν βασική συχνότητα σε γαστρικό καρκίνο, ο λόγος που το CIMP σε προαγωγός δεν θα μπορούσε να χρησιμοποιηθεί ως προγνωστικός δείκτης δεν είναι σαφής. Είναι πιθανό ότι το γονίδιο μεθυλίωσης σε υποκινητή οδηγήσει στην πρωτογενή γένεση όγκου αλλά όχι προχωρούν σε γαστρικό καρκίνο. Ωστόσο, μια άλλη πιθανή αιτία είναι ότι η περιορισμένη μετουσιωμένο νησί CpG θέσεις δεν αντιπροσωπεύουν την πραγματική τάση της CIMP. Ανεξάρτητα από την παραπάνω ανάλυση, η ετερογένεια είναι επίσης μια από τις σημαντικότερες πηγές που μας περιορίζονται να κάνουν πιο ακριβές συμπέρασμα. Ως εκ τούτου, είναι σημαντικό να αναπτυχθούν πιο εκτεταμένη μεγάλης κλίμακας μελέτη με τεχνολογία χάντρα-array στο μέλλον.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Λίστα ελέγχου S1.

doi: 10.1371 /journal.pone.0086097.s001

(DOC)

Διάγραμμα S1.

doi: 10.1371 /journal.pone.0086097.s002

(DOC)