PLoS One: Η σημασία της Exo1 K589E Πολυμορφισμός για τον Καρκίνο Ευαισθησία: Τα στοιχεία Βασισμένο σε μια μετα-ανάλυση


Αφηρημένο

Η exonuclease1 (

Exo1

) γονίδιο είναι ένα βασικό συστατικό της αναντιστοιχίας επισκευής (MMR) με εκτομή του κατεστραμμένου σκέλος, το οποίο είναι το μόνο εξωνουκλεάση που συμμετέχουν στο ανθρώπινο σύστημα MMR. Το γονιδιακό προϊόν είναι ένα μέλος της οικογένειας νουκλεάσης RAD2 και λειτουργίες στην αντιγραφή του DNA, την επισκευή και ανασυνδυασμό. Ωστόσο, εάν

Exo1

απαιτείται για την ενεργοποίηση MMR-εξαρτώμενη απόκριση βλάβης DNA (DDR) παραμένει άγνωστη, τα συμπεράσματα του

Exo1

πολυμορφισμών σε μελέτες ευαισθησίας του καρκίνου δεν ήταν συνεπής. Πραγματοποιήσαμε μία μετα-ανάλυση 7 μελέτες ασθενών-μαρτύρων να διευκρινιστεί η σχέση μεταξύ του

Exo1

K589E πολυμορφισμό και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Συνολικά, μια σημαντική συσχέτιση του

Exo1

K589E πολυμορφισμού με τον κίνδυνο καρκίνου σε όλες τις γενετικές μοντέλα (Lys vs Glu: OR = 1.51, 95% CI: 1,39 – 1,99,

P

& lt? 0,01 ? Glu /Lys vs Glu /Glu: OR = 1,43, 95% CI: 1,28 – 1,60,

P

& lt? 0,01? Lys /Lys vs Glu /Glu: OR = 2.45, 95% CI: 1.90- 3.17,

P

& lt? 0,01? Lys /Lys + Glu /Lys vs Glu /Glu: OR = 1.53, 95% CI: 1,38 – 1,71,

P

& lt? 0,01? Glu /Glu vs Glu /Lys + Lys /Lys: OR = 2.27, 95% CI: 1,79 – 2,89,

P

& lt? 0,01). Στο στρωματοποιημένη ανάλυση ανά εθνικότητα, σημαντικά αυξημένο κίνδυνο παρατηρήθηκε σε ασιατικό πληθυσμό (Lys vs Glu: OR = 1.53, 95% CI: 1,39 – 1,69,

P

& lt? 0,01? Glu /Lys vs Glu /Glu : OR = 1.50, 95% CI: 1,34 – 1,69,

P

& lt? 0,01? Lys /Lys vs Glu /Glu: OR = 2.48, 95% CI: 1,84 – 3,34,

P

& lt? 0,01? Lys /Lys + Glu /Lys vs Glu /Glu: OR = 1.58, 95% CI: 1,41 – 1,78,

P

& lt? 0,01? Glu /Glu vs Glu /Lys + Lys /Lys: OR = 2,18, 95% CI: 1,62 – 2,93,

P

& lt? 0,01). ανάλυση υποομάδας με βάση το κάπνισμα πρότεινε

Exo1

K589E πολυμορφισμός που ανατίθενται σημαντικό κίνδυνο μεταξύ των καπνιστών (Lys /Lys + Glu /Lys vs Glu /Glu: OR = 2.16, 95% CI: 1,77 – 2,63,

P

& lt? 0.01), αλλά όχι σε μη-καπνιστές (Lys /Lys + Glu /Lys vs Glu /Glu: OR = 0.89, 95% CI: 0,64 – 1,24,

P

= 0.50). Εν κατακλείδι,

Exo1

K589E Lys αλληλόμορφο μπορεί να χρησιμοποιηθεί ως νέο βιοδείκτη για την ευαισθησία του καρκίνου, ιδιαίτερα σε καπνιστές

Παράθεση:. Duan F, Τραγούδι C, Dai L, Cui S, Zhang X , Zhao X (2014) Η σημασία του

Exo1

K589E Πολυμορφισμός για τον Καρκίνο Ευαισθησία: Τα στοιχεία Βασισμένο σε μια μετα-ανάλυση. PLoS ONE 9 (5): e96764. doi: 10.1371 /journal.pone.0096764

Συντάκτης: William B. Coleman, του Πανεπιστημίου της Βόρειας Καρολίνας Σχολή Ιατρικής, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 10 Μαρ, 2014? Δεκτές: 7 Απρίλη 2014? Δημοσιεύθηκε: May 8, 2014

Copyright: © 2014 Duan et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Δεδομένα Διαθεσιμότητα:. Η συγγραφείς επιβεβαιώνουν ότι όλα τα δεδομένα που διέπουν τα ευρήματα είναι πλήρως διαθέσιμα χωρίς περιορισμούς. Όλα τα στοιχεία που περιλαμβάνονται στο χειρόγραφο

Χρηματοδότηση:. Η έρευνα υποστηρίχθηκε από Λαϊκή Δημοκρατία της Κίνας Εθνικό Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας (Νο 81202278), και το Πρόγραμμα για την Επιστήμη και την Τεχνολογία Καινοτομία ταλέντα στα Πανεπιστήμια της επαρχίας Henan (Αρ 2010HASTIT027), και Εξαιρετική Ίδρυμα Νεότητας της He’nan Επιστημονικής Επιτροπής (Νο 124 100 510 007). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

ο καρκίνος είναι η πρώτη αιτία θανάτου στις οικονομικά ανεπτυγμένες χώρες και η δεύτερη κύρια αιτία θανάτου στις αναπτυσσόμενες χώρες [1]. Στις Ηνωμένες Πολιτείες, ένα τέταρτο θανάτων οφείλεται σε καρκίνο [2]. Η επιβάρυνση του καρκίνου αυξάνεται στις οικονομικά αναπτυσσόμενες χώρες, ως αποτέλεσμα της γήρανσης του πληθυσμού και της ανάπτυξης, καθώς και, ολοένα και περισσότερο, η υιοθέτηση του καρκίνου που σχετίζονται με επιλογές τρόπου ζωής όπως το κάπνισμα. Πρωτοβάθμια στρατηγικές πρόληψης στοχεύουν στη μείωση συχνότητα, την έγκαιρη ανίχνευση, όπως είναι υποκλινική περιπτώσεις καρκίνου που ανακαλύφθηκε, η οποία αυξάνει την πιθανότητα μιας θεραπείας σε ασθενείς με πρώιμο στάδιο ή παρατείνει το χρόνο επιβίωσης τους. Ωστόσο, οι περισσότεροι καρκίνοι είναι δύσκολο να ανιχνευθούν σε πρώιμο στάδιο, νέων δεικτών για την αναγνώριση των πληθυσμών υψηλού κινδύνου, καθώς και νέες στρατηγικές για την έγκαιρη ανίχνευση χρειάζονται επειγόντως. Τώρα, ο μηχανισμός της καρκινογένεσης είναι ελάχιστα κατανοητός. Έχει προταθεί ότι τα γονίδια ευαισθησίας συνδυασμό με περιβαλλοντικούς παράγοντες μπορεί να είναι σημαντική για την ανάπτυξη του καρκίνου [3], [4].

Ατομική διακύμανση γενετικό υπόβαθρο μπορούν με τη σειρά τους οδηγούν σε διαφορετικές συνέπειες μετά την έκθεση στο περιβάλλον και μπορεί τελικά να καθορίσει τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. γονίδια επιδιόρθωσης του DNA σχηματίζουν ένα πολύπλοκο δίκτυο που προστατεύουν την ακεραιότητα του γονιδιώματος από ενδογενείς και εξωγενείς βλάβη [5]. Όταν βλάβη του DNA δεν επιδιορθώνεται και δεν επάγει αποπτωτικό εξάλειψη του κυττάρου, ελαττώματα DNA συσσωρεύονται και πολλαπλασιάζονται μέσω της κυτταρικής απογόνους, και τελικά μπορεί να προκύψει καρκίνος [6], [7]. Ατομική παραλλαγές στην ικανότητα επιδιόρθωσης του DNA λόγω της παρουσίας των πολυμορφισμών σε γονίδια που σχετίζονται με την επισκευή του DNA μπορεί να ευθύνεται για κάποια ευαισθησία καρκίνου στον γενικό πληθυσμό [8], [9]. έχουν γενετικών πολυμορφισμών των γονιδίων επιδιόρθωσης του DNA έχουν αναφερθεί για τον προσδιορισμό της ευαισθησίας σε διάφορες καρκίνους [10] – [15].

Η exonuclease1 (

Exo1

) γονίδιο, που βρίσκεται στο χρωμόσωμα 1q42-43, περιέχει μία αμετάφραστη εξόνιο που ακολουθείται από 13 κωδικοποιητικά εξώνια και κωδικοποιεί μία πρωτεΐνη 846 αμινοξέων [16], [17]. Το γονιδιακό προϊόν είναι ένα μέλος της οικογένειας νουκλεάσης RAD2 και λειτουργίες στην αντιγραφή του DNA, την επισκευή και ανασυνδυασμό [18].

Exo1

είναι ένα βασικό συστατικό της αναντιστοιχίας επισκευής (MMR) με εκτομή του κατεστραμμένου σκέλος, ωστόσο, αν Exo1 απαιτείται να MMR-εξαρτώμενη απόκριση βλάβης DNA (DDR) παραμένει άγνωστη [19]. Τα συμπεράσματα του

Exo1

πολυμορφισμών σε μελέτες ευαισθησίας του καρκίνου παραμένουν ασυνεπείς, γεγονός που εν μέρει οφείλεται στην ετερογένεια του υποτύπου του καρκίνου, το μικρό μέγεθος του δείγματος, και η εθνικότητα των ασθενών.

Ένα γουανίνη ( G) /αδενίνη (Α) κοινές πολυμορφισμού ενός νουκλεοτιδίου (SNP) στην πρώτη θέση του κωδικονίου 589 στο εξόνιο 13 του

Έξω

1 (dbSNP ID: rs 1047840), με αποτέλεσμα την υποκατάσταση ενός γλουταμικού οξέος (Glu , Ε) υπόλειμμα (GAG) με λυσίνη (Lys, Κ) υπόλειμμα (AAG) (επίσης οριζόμενο

Exo1

K589E) σε ενισχυτή εξονικές splicing (ESE), έχει προταθεί να επηρεάσει τα προϊόντα της

Exo1

mRNA. Να καθορίσει περαιτέρω εάν υπάρχει μια ένωση του

Exo1

K589E με τον χρειάζεται κίνδυνο για ανάπτυξη καρκίνου, μια συνολική ανασκόπηση και ανάλυση των δημοσιευμένων στοιχείων από διάφορες μελέτες.

Στην παρούσα μελέτη, έχουμε εκτενώς λογοτεχνία και πραγματοποιείται μια μετα-ανάλυση βασίζεται σε όλες τις επιλέξιμες περίπτωση ελέγχου δημοσιευμένα στοιχεία για την αξιολόγηση της συσχέτισης μεταξύ

Exo1

K589E πολυμορφισμών και την ευαισθησία του καρκίνου.

Υλικά και Μέθοδοι

Αναγνώριση των επιλέξιμων μελετών

Μια ολοκληρωμένη βιβλιογραφική έρευνα διεξήχθη με τη χρήση του PubMed, Springer, Elsevier, CNKI (κινέζικα), και Wanfang (κινεζική) Ψηφιακή Διατριβές Βάσεις Δεδομένων για τα σχετικά άρθρα που δημοσιεύτηκαν στην αγγλική και κινεζική έως Δεκεμβρίου 2013, με τις λέξεις κλειδιά «K589E /rs1047840», «

Exo1

πολυμορφισμός» και «καρκίνος». Το πλήρες κείμενο των υποψηφίων άρθρα εξετάστηκαν προσεκτικά για να προσδιοριστεί εάν συμφωνούσε με τα κριτήρια ένταξης για τη μετα-ανάλυση. Τα κριτήρια ένταξης ήταν τα εξής: 1) για το

Exo1

κίνδυνο K589E πολυμορφισμού και του καρκίνου, 2) από μια περίπτωση-ελέγχου σχεδιασμένη μελέτη, 3) την επαρκή δημοσιευμένα στοιχεία για την εκτίμηση αναλογία πιθανοτήτων (OR) με 95% διάστημα εμπιστοσύνης (CI), και 4) οι συχνότητες γονοτύπου διαθέσιμες.

Οι μελέτες, στις οποίες ο γονότυπος των ελέγχων για ένα συγκεκριμένο πολυμορφισμό δεν ήταν σύμφωνη με Hardy-Weinberg ισορροπία (HWE) εξαιρέθηκαν από την ανάλυση αυτή πολυμορφισμός.

δεδομένα εξόρυξη

τα δεδομένα προέρχονται ανεξάρτητα από δύο ερευνητές. Για αντικρουόμενες εκτιμήσεις, επιτεύχθηκε συμφωνία ακόλουθη συζήτηση. Αν δεν μπορούσαν να καταλήξουν σε συναίνεση, ζητήθηκε η γνώμη της τρίτης ερευνητής για την επίλυση της διαφοράς, καθώς και η τελική απόφαση ελήφθη με ψηφοφορία

Οι ακόλουθες μεταβλητές εξήχθησαν από κάθε μελέτης εάν υπάρχει:. Όνομα, έτος δημοσίευσης πρώτο συγγραφέα , τον τύπο του καρκίνου, τη χώρα προέλευσης, την εθνικότητα, το σχεδιασμό της μελέτης, κατανομές γονότυπου και HWE των ελέγχων, αντίστοιχα. Διαφορετικές καταβάσεις εθνικότητα είχαν χαρακτηριστεί ως Ασίας ή του Καυκάσου. σχεδιασμός της μελέτης ήταν στρωματοποιημένη σε νοσοκομείο με βάση μελέτη και τη μελέτη βασισμένη στον πληθυσμό. Εάν τα δεδομένα συχνότητας αρχικό γονότυπο δεν ήταν διαθέσιμα σε σχετικά άρθρα, μια αίτηση για πρόσθετα στοιχεία στάλθηκε στον αντίστοιχο συγγραφέα.

Η στατιστική ανάλυση

Οι αναλύσεις έγιναν σε αναθεώρηση Διευθυντής 5.0. Οι κίνδυνοι (ΕΑΠ) του καρκίνου που σχετίζονται με το

Exo1

K589E πολυμορφισμός υπολογίστηκαν απευθείας από τα δεδομένα που δίνονται στις επιλέξιμες μελέτες. Ή που αντιστοιχεί στο 95% CI χρησιμοποιήθηκε για την αξιολόγηση του βαθμού συσχέτισης μεταξύ των

Exo1

K589E πολυμορφισμό και τον καρκίνο. Τα συγκεντρωτικά ΕΑΠ πραγματοποιήθηκαν για σύγκριση αλληλομόρφων (Lys vs Glu), η σύγκριση ετεροζυγώτες (Glu /Lys vs Glu /Glu) και σύγκριση ομοζυγώτες (Lys /Lys vs Glu /Glu), κυρίαρχο μοντέλο (Lys /Lys + Glu /Lys vs Glu /Glu), υπολειπόμενο μοντέλο (Glu /Glu vs Glu /Lys + Lys /Lys), αντίστοιχα. Επιπλέον, μελέτες κατανεμημένες ανάλογα με την εθνικότητα (Ασίας, του Καυκάσου) και το κάπνισμα.

Είμαστε αξιολόγησε την αναχώρηση από την HWE για την ομάδα ελέγχου σε κάθε μελέτη χρησιμοποιώντας την καλοσύνη-of-fit

χ

2

δοκιμή με 1 βαθμό ελευθερίας.

η ετερογένεια στη μετα-ανάλυση αναφέρεται στην διακύμανση των αποτελεσμάτων της μελέτης μεταξύ των διαφόρων μελετών. Μεταξύ μελέτη ετερογένεια αξιολογήθηκε με ένα

χ

2

βασίζεται Q-test ανάμεσα στις μελέτες [20]. Ετερογένεια θεωρήθηκε σημαντική όταν

P & lt? 0,05

. Σε περίπτωση μη σημαντική ετερογένεια, σημειακές εκτιμήσεις και 95% CI υπολογίστηκε χρησιμοποιώντας το μοντέλο σταθερό αποτέλεσμα (Mantel-Haenszel), διαφορετικά, τυχαία εφέ μοντέλο (Dersimonian Laird) χρησιμοποιήθηκε [21], [22]. Η σημασία της συνολική αναλογία πιθανοτήτων (OR) προσδιορίστηκε με την Ζ-test. Αν υπήρχε σημαντική ετερογένεια μεταξύ περιλαμβάνονται μελέτες, οι πηγές της ετερογένειας θα πρέπει να διερευνηθούν με τη χρήση μετα-παλινδρόμησης στο Stata έκδοση 12,0 (https://www.stata.com).

Για να αξιολογηθεί η σταθερότητα των αποτελεσμάτων, ένα κατευθύνσεων αναλύσεις ευαισθησίας για να αξιολογηθεί η σταθερότητα των αποτελεσμάτων, στην οποία μία μελέτη στην μετα-ανάλυση έχει διαγραφεί κάθε φορά ώστε να αντικατοπτρίζει την επιρροή των επιμέρους στοιχείων που να συγκεντρωτική OR. Η προκατάληψη δημοσίευση διαγνώστηκε με τη χρήση ανεστραμμένου οικόπεδα χωνί, δοκιμασία Begg και δοκιμή του Egger κατά Stata 12.0.

Στατιστική δοκιμές που πραγματοποιούνται στην παρούσα ανάλυση θεωρήθηκαν σημαντικά όταν η αντίστοιχη πιθανότητα null-υπόθεση ήταν

P

& lt?. 0.05

Αποτελέσματα

χαρακτηριστικά Μελέτη

Ένα σύνολο 8 δημοσιεύσεις πληρούσαν τα κριτήρια ένταξης [23] – [30], όπως συνοψίζεται στον πίνακα 1 ( η διαδικασία επιλογής μελέτη δείχθηκε στο Σχήμα 1). Σε ένα άρθρο [24], γονότυπος των ελέγχων για ένα ορισμένο πολυμορφισμού δεν ήταν σύμφωνο με HWE, ως εκ τούτου, αποκλείστηκε από την ανάλυση. Ως εκ τούτου, συνολικά 7 μελετών, συμπεριλαμβανομένων 2.951 περιπτώσεις και 3.101 μάρτυρες χρησιμοποιήθηκαν στην μετα-ανάλυση. Όλες οι μελέτες ήταν μελέτες ασθενών-μαρτύρων, συμπεριλαμβανομένων 7 μελέτες για 7 τύπους καρκίνου. Υπήρχαν 5 μελέτες της Ασίας απόγονος και 2 του Καυκάσου απόγονος. Ένα κλασικό δοκιμασία PCR-RFLP χρησιμοποιήθηκε σε 6 από τα 7 μελετών. Μια μελέτη τυχαία επαναλαμβάνεται ένα μέρος των δειγμάτων, όπως τον έλεγχο της ποιότητας, ενώ του γονότυπου.

Η

Η ποσοτική σύνθεση

Τα κύρια αποτελέσματα αυτής της μετα-ανάλυσης και δοκιμής ετερογένεια παρουσιάστηκαν στο Πίνακας 2 (Σχήμα 2). Έχουμε κατ ‘αρχάς ανέλυσε τη συσχέτιση του συνολικού πληθυσμού. Στη συνέχεια, προκειμένου να επιτευχθεί το ακριβές αποτέλεσμα της σχέσης μεταξύ

Exo1

K589E πολυμορφισμού και του καρκίνου ευαισθησία, έγιναν στρωματοποιημένη αναλύσεις από την εθνικότητα και το κάπνισμα. Όταν το Q-test της ετερογένειας δεν ήταν σημαντική, πραγματοποιήσαμε αναλύσεις χρησιμοποιώντας τα μοντέλα σταθερό αποτέλεσμα. Τα μοντέλα τυχαία επίδραση διεξήχθησαν όταν ανιχνεύεται σημαντική μεταξύ μελετών ετερογένεια.

Οι πλατείες και οι οριζόντιες γραμμές αντιστοιχούν στη μελέτη ειδικών OR και 95% CI. Η περιοχή των πλατειών αντανακλά την ειδική μελέτη του βάρους. Το διαμάντι αντιπροσωπεύει το συγκεντρώνονται OR και 95% CI.

Η

Σε συνολική ανάλυση, βρήκαμε μια σημαντική συσχέτιση μεταξύ

Exo1

K589E πολυμορφισμό και τον κίνδυνο καρκίνου σε όλες τις γενετικές μοντέλα (Lys vs Glu: OR = 1.51, 95% CI: 1,39 – 1,99,

P

& lt? 0,01? Glu /Lys vs Glu /Glu: OR = 1,43, 95% CI: 1,28 – 1,60,

P

& lt? 0,01? Lys /Lys vs Glu /Glu: OR = 2.45, 95% CI: 1,90 – 3,17,

P

& lt? 0,01? Lys /Lys + Glu /Lys vs Glu /Glu: OR = 1.53, 95% CI: 1,38 – 1,71,

P

& lt? 0,01? Glu /Glu vs Glu /Lys + Lys /Lys: OR = 2.27, 95% CI: 1,79 – 2,89,

P

& lt?. 0.01)

Περαιτέρω ανάλυση διαστρωμάτωση από την εθνικότητα, τα αποτελέσματα έδειξαν ότι το

Exo1

K589E πολυμορφισμού ήταν σημαντικά συνδέεται με κίνδυνο καρκίνου (πίνακας 3, σχήμα 3). Συνολικά, τα άτομα που μεταφέρουν Lys αλληλόμορφης είχε μια ελαφρά αυξημένο κίνδυνο καρκίνου μεταξύ των ασιατικών πληθυσμών (Lys vs Glu: OR = 1.53, 95% CI: 1,39 – 1,69,

P

& lt? 0,01? Glu /Lys vs Glu /Glu : OR = 1.50, 95% CI: 1,34 – 1,69,

P

& lt? 0,01? Lys /Lys vs Glu /Glu: OR = 2.48, 95% CI: 1,84 – 3,34,

P

& lt? 0,01? Lys /Lys + Glu /Lys vs Glu /Glu: OR = 1.58, 95% CI: 1,41 – 1,78,

P

& lt? 0,01? Glu /Glu vs Glu /Lys + Lys /Lys: OR = 2,18, 95% CI: 1,62 – 2,93,

P

& lt? 0,01). Σε Καυκάσιο πληθυσμό,

Exo1

K589E πολυμορφισμού συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο σε αντίθεση αλληλομόρφων, η σύγκριση ομοζυγώτες και υπολειπόμενο μοντέλο (Lys vs Glu: OR = 1,43, 95% CI: 1,14 – 1,79,

P

& lt? 0,01? Lys /Lys vs Glu /Glu: OR = 2,37, 95% CI: 1,44 – 3,97,

P

& lt? 0,01? Glu /Glu vs Glu /Lys + Lys /Lys : OR = 2.48, 95% CI: 1,64 – 3,75,

P

& lt? 0,01)

Οι πλατείες και οι οριζόντιες γραμμές αντιστοιχούν στη μελέτη ειδικών OR και 95% CI.. Η περιοχή των πλατειών αντανακλά την ειδική μελέτη του βάρους. Το διαμάντι αντιπροσωπεύει το συγκεντρώνονται OR και 95% CI.

Η

ανάλυση των υποομάδων επίσης ανάλογα με την κατάσταση του καπνίσματος.

Exo1

K589E πολυμορφισμού ήταν σημαντικά σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου στους καπνιστές (Lys /Lys + Glu /Lys vs Glu /Glu: OR = 2.16, 95% CI: 1,77 – 2,63,

P

& lt? 0,01), αλλά καμία συσχέτιση παρατηρήθηκε σε μη-καπνιστές (Lys /Lys + Glu /Lys vs Glu /Glu: OR = 0.89, 95% CI: 0,64 – 1,24,

P

= 0,50) .

η αξιολόγηση της μεροληψίας δημοσίευση

οικόπεδο χοάνη Begg και δοκιμή Egger του έγιναν για να εκτιμηθεί η προκατάληψη δημοσίευση του παρόντος διαθέσιμη βιβλιογραφία. Το σχήμα των οικοπέδων χοάνη δεν αποκάλυψε καμία ένδειξη προφανή ασυμμετρία σε όλα τα μοντέλα σύγκριση (Σχήμα 4). Στη συνέχεια, δοκιμή του Egger χρησιμοποιήθηκε για να παρέχει στατιστικά στοιχεία για την πλοκή χοάνη συμμετρία (Πίνακας 4).

Η

Ανάλυση ευαισθησίας

Μια ενιαία μελέτη συμμετείχαν στη μετα-ανάλυση διαγράφεται κάθε φορά για να αντανακλούν την επιρροή των μεμονωμένων δεδομένων που με συγκεντρωτική ΙΑΠ, και οι αντίστοιχες συγχωνευμένες ΕΑΠ δεν μεταβλήθηκαν σημαντικά, υποδεικνύοντας ότι τα αποτελέσματά μας ήταν στατιστικώς ισχυρή (τα δεδομένα δεν παρουσιάζονται).

Συζήτηση

Exo1

είναι ένα μέλος της οικογένειας RAD2 νουκλεασών και κατέχει 5 ‘προς 3′ δίκλωνο DNA (dsDNA) εξωνουκλεάση και 5’-πτερύγιο δραστηριότητες ενδονουκλεάση και τις λειτουργίες σε μια σειρά σημαντικών κυτταρικών οδών συμπεριλαμβανομένης της επισκευής του DNA, αντιγραφή, ανασυνδυασμό, και την ακεραιότητα των τελομερών [31]. Μεταξύ του συστήματος επιδιόρθωσης του DNA,

Exo1

είναι το μόνο εξωνουκλεάση εμπλέκεται στο ανθρώπινο σύστημα MMR, ένας από τους βασικούς ρόλους είναι το σύστημα MMR η οποία είναι υπεύθυνη για τη διόρθωση αναντιστοιχίες μεταξύ των βάσεων και των μικρών εισαγωγή ή διαγραφή βρόχοι [32] , [33]. Αν και πολλοί SNPs στο

NQO1, CYP1A1, ERCC4, EXO1, MSH2, ΧΚΧΧ1

και

hOGG1 έχουν εντοπιστεί, μόνο μερικά από αυτά έχουν ερευνηθεί εκτενώς σε επιδημιολογικές μελέτες [34]

, SNPs για η οποία εν δυνάμει λειτουργικές ενδείξεις για την ανάπτυξη, την εξέλιξη και τη μετάσταση του καρκίνου παραμένει άγνωστη, ειδικά για

Exo1

γονίδιο.

στην παρούσα μελέτη, αναλύθηκαν πρώτα με τη σύνδεση της

Exo1

K589E του καρκίνου από τις 7 μελέτες. Τα συγκεντρωτικά αποτελέσματα αποκάλυψαν ότι

Exo1

K589E Lys αλληλόμορφο σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο για ανάπτυξη καρκίνου. Μεταξύ ασιατικό πληθυσμό,

Exo1

K589E πολυμορφισμός σημαντικά συνδέεται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου σε όλες τις γενετικές μοντέλα, αλλά όχι στον Καυκάσιο πληθυσμό, αυτό πρότεινε ότι μια πιθανή εθνοτική διαφορά στο γενετικό υπόβαθρο. ανάλυση των υποομάδων στρωματοποιημένη με βάση την κατάσταση καπνίσματος,

Exo1

K589E πολυμορφισμού ήταν σημαντικά σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου στους καπνιστές, αλλά καμία σημαντική συσχέτιση παρατηρήθηκε σε μη-καπνιστές. Η λογική εξήγηση είναι το κάπνισμα τσιγάρων, ένα πολύ γνωστό προέλευση της βλάβης του DNA, απελευθερώνει πολλά επαγωγείς της βλάβης του DNA για το αναπνευστικό σύστημα και προκαλεί βλάβες του DNA στα κύτταρα. Ως εκ τούτου, οι άνθρωποι που έχουν τη γενετική παραλλαγή υψηλού κινδύνου, όπως το αλληλόμορφο Lys της K589E, και τις συνήθειες, επίσης, το κάπνισμα, το συνδυασμένο αποτέλεσμα των γενετικών και περιβαλλοντικών παραγόντων θα αυξήσει συνεργικά καρκίνο ευαισθησίες τους.

Αν μετα-ανάλυση είναι ισχυρή, η μελέτη μας εξακολουθεί να έχει κάποιους περιορισμούς. Πρώτον, δεν έχουν επαρκή επιλέξιμα μελέτες περιορίζεται περαιτέρω στρωματοποιημένη ανάλυση μας για τους τύπους καρκίνου. Δεύτερον, για κάθε επιλεγμένη μελέτη ασθενών-μαρτύρων, τα αποτελέσματά μας βασίστηκαν σε αδιόρθωτη εκτιμήσεις, ενώ θα μπορούσε να πραγματοποιηθεί μια πιο ακριβή ανάλυση, αν ήταν διαθέσιμα ατομικά στοιχεία. Τρίτον, η έλλειψη του αρχικού δεδομένων των αναθεωρηθεί μελέτες περιορίζονται περαιτέρω αξιολόγηση μας των πιθανών αλληλεπιδράσεων, επειδή οι αλληλεπιδράσεις μεταξύ γονιδίων-to-γονιδίου και του γονιδίου-to-περιβάλλον μπορεί να διαμορφώνει τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Τέταρτον, αν και συνοπτικά όλες οι επιλέξιμες μελέτες, το σχετικά μικρό μέγεθος του δείγματος των μελετών μπορεί να οδηγήσει σε μειωμένη στατιστική ισχύς όταν κατανεμημένες ανάλογα με την κατάσταση εθνικότητα και το κάπνισμα.

Εν ολίγοις, αυτή η μετα-ανάλυση έδειξε ότι το

Exo1

K589E πολυμορφισμού συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου, ιδιαίτερα σε καπνιστές. Ωστόσο, απαιτούνται περαιτέρω καλά σχεδιασμένες μελέτες σε μεγάλη ομάδα των διαφόρων εθνοτικών προελεύσεων και τύπων καρκίνου που απαιτούνται πριν από την εφαρμογή του

Exo1

K589E πολυμορφισμός ως βιοδεικτών του καρκίνου σε κλινικό περιβάλλον και την έγκαιρη διάγνωση του καρκίνου.

Υποστήριξη πληροφορίες

Λίστα ελέγχου S1.

PRISMA Λίστα ελέγχου

doi:. 10.1371 /journal.pone.0096764.s001

(DOC)

Ευχαριστίες

Ευχαριστούμε όλους τους ανθρώπους που δίνουν τη βοήθεια για το σκοπό αυτό μελέτη. Εκτιμούμε Καθ Kaijuan Wang, Henan Βασικά Εργαστήριο του όγκου Επιδημιολογίας, Zhengzhou, Henan, Κίνα, για την κριτική εξέταση της και την επιστημονική επιμέλεια του χειρογράφου και εποικοδομητικές παρατηρήσεις.

You must be logged into post a comment.