Αφηρημένο

ευαισθησία του καρκίνου του προστάτη έχει ήδη συσχετιστεί με περικοπή παραλλαγές βλαστική στο γονίδιο

TP53AIP1

(πρωτεΐνη όγκου ρ53 ρυθμίζεται απόπτωση που επάγει πρωτεΐνη 1). Για δύο φαινομενικά επαναλαμβανόμενες μεταλλάξεις (p.Q22fs και p.S32X) μια αξιόλογη Ή 5,1 αναφέρθηκε για τον κίνδυνο καρκίνου του προστάτη. Δεδομένου ότι τα ευρήματα αυτά δεν έχουν επικυρωθεί μέχρι στιγμής, έχουμε γονότυπος p.Q22fs και p.S32X σε δύο γερμανικά σειρά με συνολικά 1.207 περιπτώσεις καρκίνου του προστάτη και 1.495 ελέγχους. Οι παραλλαγές περικοπή δεν σχετίστηκαν σημαντικά με τον καρκίνο του προστάτη σε καμία από τις δύο ομάδες, ούτε στην συνδυασμένη ανάλυση [αναλογία πιθανοτήτων (OR) = 1,16? 95% διάστημα εμπιστοσύνης (CI 95%) = 0,62 – 2,15? ρ = 0,66]. Οι μεταφορείς δεν έδειξαν σημαντικές διαφορές σε οικογενειακό ιστορικό καρκίνου του προστάτη, την ηλικία κατά τη διάγνωση, Gleason στείλει ή PSA κατά τη διάγνωση σε σύγκριση με μη-φορέα περιπτώσεων καρκίνου του προστάτη. Το μεγάλο μέγεθος του δείγματος της συνδυασμένης ομάδα απορρίπτει ένα αποτέλεσμα υψηλού κινδύνου είναι μεγαλύτερη από 2,2 και δείχνει έναν περιορισμένο ρόλο του

TP53AIP1

στην προδιάθεση του καρκίνου του προστάτη

Παράθεση:. Luedeke Μ, Coinac Ι, Linnert CM, Bogdanova Ν, Rinckleb ΑΕ, Schrader M, et al. (2012) Καρκίνος του προστάτη του κινδύνου δεν μεταβάλλεται από το

TP53AIP1

βλαστικές μεταλλάξεις σε ένα γερμανικό Series Case-Control. PLoS ONE 7 (3): e34128. doi: 10.1371 /journal.pone.0034128

Επιμέλεια: Paolo Peterlongo, IFOM, Fondazione Istituto di FIRC Oncologia Molecolare, Ιταλία

Ελήφθη: 18 Ιανουαρίου του 2012? Αποδεκτές: 22, Φεβρουαρίου, 2012? Δημοσιεύθηκε: 23 Μαρ 2012

Copyright: © 2012 Luedeke et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Προστάτη Καρκίνος Γενετικής του έργου στο Ulm έχει υποστηριχθεί από υπεργολαβίας Εθνικό Ινστιτούτο Καρκίνου με τίτλο «Καρκίνος του προστάτη Ευαισθησία: Η μελέτη ICPCG» – επιχορήγηση # CA089600 – https://cancer.gov/. AM έχει υποστηριχθεί από την υποτροφία Hannelore Munke, μια εσωτερική έρευνα υποτροφία του Hannover Medical School. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

ο καρκίνος του προστάτη (PRCA) είναι η πιο συχνή όγκου και η τρίτη κύρια αιτία θανάτου που σχετίζονται με τον καρκίνο στους άνδρες στο δυτικό βιομηχανικό κόσμο [1]. Στην αιτιολογία της PRCA ένας σημαντικός βαθμός κληρονομικότητας υποτίθεται ότι εμπλέκεται [2]. Μέχρι σήμερα, περισσότεροι από 30 πολυμορφισμούς μονών νουκλεοτιδίων μέτρια κινδύνου που συνδέεται έχουν εντοπιστεί σε μελέτες γονιδιώματος μεγάλη ένωση, που εξηγούν ένα μικρό κλάσμα της κληρονομικότητας [3]. Αντίθετα, η υψηλή γονίδια κινδύνου που θα μπορούσε να είναι υπεύθυνη για την πλειονότητα της παρατηρούμενης οικογενειακή ομαδοποίηση είναι ακόμα άγνωστη.

Υπάρχουν αυξανόμενες ενδείξεις ότι τα γονίδια που εμπλέκονται στην αντιμετώπιση της βλάβης του DNA παίζουν ρόλο προδιαθεσικοί για PRCA [4]. Αυτό περιλαμβάνει διαδικασίες επιδιόρθωσης του DNA, καθώς και οι σχετικοί μηχανισμοί όπως αποπτωτικά μονοπάτια. TP53AIP1 (πρωτεΐνη ρ53 όγκου ρυθμίζεται απόπτωση που επάγει πρωτεΐνη 1) παίζει ένα ρόλο κλειδί στο ογκοκατασταλτικό ρ53 σηματοδότηση εξαρτώμενη αποπτωτικά. TP53AIP1 εντοπίζεται στη μιτοχονδριακή μεμβράνη και προκαλεί απόπτωση μέσω του κυτοχρώματος

γ

απελευθέρωση [5]. Η έκφραση του

TP53AIP1

εντοπίζεται μετά σοβαρή ζημιά με φωσφορυλίωση του ρ53 σε Ser46 [6].

TP53AIP1

βρέθηκε να μεταλλαχθεί σε PRCA ιστού σε μια πρόσφατη μελέτη [7]. Οι δύο εντοπίστηκαν περικοπή μεταλλάξεις p.Q22fs και p.S32X αποδείχθηκε ότι ήταν επαναλαμβανόμενες παραλλαγές βλαστικής σειράς και συνδέθηκαν στενά με PRCA κινδύνου (OR 5,1), υποδηλώνοντας έτσι

TP53AIP1

ως μια πολλά υποσχόμενη γονιδιακή προδιάθεση. Στην παρούσα μελέτη έχουμε αξιολόγησε την επίδραση των κινδύνων αυτών των δύο

TP53AIP1

μεταλλάξεις σε δύο ανεξάρτητες γερμανικές ομάδες PRCA.

Αποτελέσματα

Και οι δύο παραλλαγές περικοπή παρατηρήθηκαν σε ομάδες μας. Ενώ οι μετατόπισης πλαισίου p.Q22fs αλληλόμορφο ήταν παρούσα στο 1,8% των περιπτώσεων και 1,6% των ελέγχων, ο p.S32X νοηματική μετάλλαξη φαίνεται να είναι συγκριτικά σπάνιες (0,1% μεταφορείς και στις δύο περιπτώσεις και ελέγχους). Συνολικά, p.Q22fs και p.S32X δεν συσχετίστηκαν με τον κίνδυνο καρκίνου του προστάτη, ούτε στη συνδυασμένη σειρά του Ulm και Hannover, ούτε σε κάθε επιμέρους δείγμα (Πίνακας 1). Δεν υπάρχουν αποδεικτικά στοιχεία εναντίον ομοιογένεια παρατηρήθηκε μεταξύ της σειράς Ulm και Αννόβερο (p = 0,39). Συσσώρευση σε οικογενείς περιπτώσεις καρκίνου του προστάτη θα μπορούσε να δείξει ένα υψηλό αποτέλεσμα τον κίνδυνο που προκαλείται από τις παραλλαγές. Αυτή η υπόθεση εξετάστηκε στη σειρά Ulm, που περιείχε μια συλλογή των περιπτώσεων PRCA με θετικό οικογενειακό ιστορικό. Ωστόσο, δεν εμπλουτισμός των μεταλλάξεων παρατηρήθηκε σε οικογενείς περιπτώσεις (6 από τους 377 (1,6%)), σε σύγκριση με σποραδικές περιπτώσεις (7 από τους 325 (2,1%)). Τέλος, κλινικές υποομάδες των περιπτώσεων ορίστηκαν προκειμένου να αποσαφηνιστεί τάσεις επιθετικές μορφές όγκων. Οι φορείς μετάλλαξης δεν έδειξε σημαντική διαφορά από τους μη φορείς σε σοβαρότητα του καρκίνου του προστάτη, όπως καθορίζεται από την ηλικία έναρξης της νόσου, το σκορ Gleason, ή το επίπεδο PSA πριν από τη θεραπεία (Πίνακας 2).

Η

Συζήτηση

TP53AIP1

έχει προταθεί ως ένα γονίδιο ευαισθησίας PRCA, δεδομένου ότι οι δύο επαναλαμβανόμενες βλαστική μεταλλάξεις (p.Q22fs και p.S32X) βρέθηκαν σημαντικά υπερεκπροσωπούνται μεταξύ PRCA ασθενείς μέσα σε μια προηγούμενη μελέτη ασθενών-μαρτύρων [7]. Για τους σκοπούς της επιβεβαίωσης, έχουμε γονότυπος p.Q22fs και p.S32X σε περίπου 1.200 περιπτώσεις καρκίνου του προστάτη και 1.500 ελέγχους, αλλά απέτυχε να αναπαράγουν μια ένωση αυτών των παραλλαγών με PRCA κίνδυνο.

Οι διαφορές μεταξύ των παρόν και η αρχική μελέτη θα μπορούσε να εξηγηθεί από διάφορους παράγοντες, συμπεριλαμβανομένων των μεταβλητών εθνικές καταγωγές, διαφορετικά μεγέθη δείγματος και αποκλίνοντα κριτήρια ένταξης. Πληθυσμός-ειδικές διαφορές έχουν γίνει εμφανής στην περίπτωση της p.S32X, καθώς αυτή η παραλλαγή έχει βρεθεί σπάνια σε γερμανικά probands, και ως εκ τούτου δεν θα μπορούσε να αξιολογηθεί για συσχέτιση της νόσου. Η πιο εμφανής διαφορά μεταξύ των δειγμάτων της μελέτης είναι η συχνότητα της παραλλαγής p.Q22fs, η οποία εμφανίστηκε πολύ μικρότερη στην ομάδα ελέγχου των Wang και οι συνεργάτες του, σε σύγκριση με τους ελέγχους μας (0,3% έναντι 1,6%, αντίστοιχα). Αξίζει να σημειωθεί, Wang et al. έχουν προσλάβει υγιή, την ηλικία μάρτυρες, οι οποίες θα μπορούσαν να είναι πιο ισχυρή για την ανίχνευση ενώσεων με τον κίνδυνο καρκίνου του προστάτη, παρά την κατά 4,5 φορές μικρότερο μέγεθος του δείγματος τους. Αντίθετα, οι μη επιλεγμένες έλεγχοι για συγκρίσεις μας μπορεί να περιέχει ταξινομείται εσφαλμένα προστάτη περιπτώσεις καρκίνου σε επίπεδα επιπολασμού του πληθυσμού, έτσι ώστε αλήθεια επιπτώσεις της νόσου θα εμφανίζονται ελαφρώς υποτιμηθεί. Ωστόσο, οι εκτιμήσεις εξουσίας δείχνουν ότι η απώλεια της εξουσίας από την επιλογή του πληθυσμού ελέγχει αντί του «σούπερ ελέγχου» θα είναι μικρό για μια νόσο με συχνότητα εμφάνισης περίπου 10%, και ότι η απώλεια αυτή μπορεί να αντισταθμιστεί αποτελεσματικά από μέτριες αυξήσεις στο μέγεθος του δείγματος [ ,,,0],8]. Το γεγονός ότι παρατηρείται σχεδόν ίσες συχνότητες φορέα και στις δύο περιπτώσεις και τους ελέγχους έντονα υποστηρίζει εναντίον μιας ένωσης p.Q22fs με PRCA. Με βάση τα μεγέθη δειγμάτων που εγγράφονται εδώ, η προκύπτουσα διάστημα εμπιστοσύνης αποκλείει οποιαδήποτε επίδραση κίνδυνο μεγαλύτερο από 2,2 για p.Q22fs και p.S32X.

Στην υποομάδα αναλύσεις που έχουμε θεωρείται προδιαθέτουν τους ρόλους των

TP53AIP1

μεταλλάξεις ιδιαίτερα για οικογενειακές και για την επιθετική PRCA. Δεν παρατηρήθηκε συσσώρευση της p.Q22fs και p.S32X παρατηρήθηκε σε οικογενείς περιπτώσεις, απορρίπτοντας την υπόθεση της υψηλής διεισδυτικότητας αυτών των μεταλλάξεων. Τέλος, η έλλειψη γονότυπο /φαινότυπο συσχέτιση όσον αφορά τις κλινικές παραμέτρους συνηγορεί υπέρ ευαισθησία σε πιο σοβαρές μορφές της PRCA για τους φορείς μετάλλαξης.

Εκτός από την περικοπή μεταλλάξεις που εξετάστηκαν στην παρούσα μελέτη, η αντικατάσταση των εσφαλμένων διευθύνσεων (σελ. A7V) στο

TP53AIP1

έχει προηγουμένως μελετηθεί σε σειρά Ανόβερο. Ομοίως, η παραλλαγή p.A7V επίσης δεν είχε δείξει αυξημένη συχνότητα σε περιπτώσεις καρκίνου του προστάτη [9]. Καταλήγουμε στο συμπέρασμα ότι υπάρχει λίγη υποστήριξη προς το παρόν να θεωρήσει

TP53AIP1

ως ένα γονίδιο ευαισθησίας στον καρκίνο του προστάτη.

Υλικά και Μέθοδοι

εξεταζομένων

Δύο σειρές περιπτώσεις και τους ελέγχους συγκεντρώθηκαν για την παρούσα μελέτη, που προσλαμβάνονται στα πανεπιστήμια του Ulm και Ανόβερο, Γερμανία. Όλες οι εξεταζομένων ήταν Καυκάσιοι προέλευσης. Η μελέτη εγκρίθηκε από το Διοικητικό Συμβούλιο Ίδρυμα αναθεώρηση του Ulm (Ethikkommission der Universität Ulm – αριθμός ψήφο 87/97) και του Διοικητικού Συμβουλίου Ίδρυμα αναθεώρηση του Αννόβερο (Ethikkommission der Medizinischen Hochschule Hannover – αριθμός ψηφοφορία 3894/05). Γραπτή συγκατάθεση, σύμφωνα με το θεσμικό όργανο κριτική Συμβούλια, αποκτήθηκε.

Από το καρκίνο του προστάτη Γενετικής του έργου της Ulm είχαν συμπεριληφθεί ένας συνολικός αριθμός των 377 οικογενή και 325 σποραδικές περιπτώσεις. Το σύστημα στρατολόγηση των ασθενών αυτών περιγράφεται αλλού [10]. Η μέση ηλικία διάγνωσης ήταν τα 63 έτη (εύρος 40-84 έτη) και η πλειοψηφία επεξεργάστηκε από ριζική προστατεκτομή. Για σύνδεση δοκιμές χρησιμοποιήθηκαν 995 έλεγχοι πληθυσμού από Ulm.

Η Hannover μελέτη για τον καρκίνο του προστάτη (HaPCS) αποτελείται από ένα νοσοκομείο που βασίζεται σε σειρά 505 μη επιλεγμένων ασθενών με PRCA που υποβλήθηκαν σε θεραπεία με βραχυθεραπεία μεταξύ Οκτωβρίου 2000 και του Σεπτεμβρίου 2007 Hannover Medical School [9]. Όλοι οι ασθενείς είχαν αδενοκαρκίνωμα αποδεδειγμένο με βιοψία του προστάτη. Ένδειξη για μόνιμη βραχυθεραπεία ήταν κλινικά εντοπισμένο χαμηλό κίνδυνο πρόωρης PRCA (cT2a ή λιγότερο με το επίπεδο του PSA στον ορό & lt? 10 ng /ml και Gleason σκορ & lt? 7). Η διάμεση ηλικία κατά τη διάγνωση ήταν 67 έτη (εύρος 42-82 έτη). Για λόγους σύγκρισης, 504 γονιδιωματική δείγματα DNA συλλέχθηκαν από ενήλικο αρσενικό αιμοδότες στην Ιατρική Σχολή του Ανόβερου μεταξύ του 2006 και του 2007.

Γονοτυπικές

Το γονιδιακό DNA, που εξάγεται από τα λεμφοκύτταρα του περιφερικού αίματος, υπηρέτησε ως πρότυπο για προσδιορισμό του γονότυπου . Η ομάδα Ulm ήταν δακτυλογραφημένη για p.Q22fs με υψηλή ανάλυση τήξης (HRM) μέθοδο. Εν συντομία: Η PCR πραγματοποιήθηκε με AmpliTaq Gold βασικού μείγματος (Applied Biosystems, Foster City, USA). Μετά την ενίσχυση PCR 1,0 μί EVA-Πράσινο (Biotium, Hayward, USA) προστέθηκαν σε κάθε δείγμα και η καμπύλη διαστάσεως μετρήθηκε σε 96 φρεατίων 7900HT Fast PCR Πραγματικού χρόνου System (Applied Biosystems, Foster City, USA). δεδομένων HRM αναλύθηκε με την v1.1 λογισμικό High Resolution Melt (Applied Biosystems, Foster City, USA). Η παραλλαγή S32X πληκτρολογήθηκε χρησιμοποιώντας Δοκιμασία Προσαρμοσμένη Γονοτυποποίηση SNP (Applied Biosystems, Foster City, USA) μαζί με TaqMan γονοτυπικός βασικού μείγματος (Applied Biosystems, Foster City, USA) σε ένα συνολικό όγκο 5 μλ σε 384 φρεατίων 7900HT Fast Σε πραγματικό Σύστημα PCR χρόνο (Applied Biosystems, Foster City, USA). Για θετικούς ελέγχους χρησιμοποιήσαμε πλασμίδια που αντιστοιχούν στα περικοπή αλληλόμορφο p.Q22fs ή p.S32X αντίστοιχα και το φυσιολογικό αλληλόμορφο. Φυσιολογικό αλληλόμορφο και μεταλλαγμένα πλασμίδια αναμίχθηκαν 1:01 προκειμένου να μιμηθεί ετερόζυγο γονότυπους. Γονοτυπικός της σειράς Hannover διεξήχθη με μήκος θραύσματος περιορισμού πολυμορφισμού αναλύσεις χρησιμοποιώντας τα

Bgl

Ι για p.Q22fs και

BFA

Ι για p.S32X, μετά από ενίσχυση PCR. Primer και ο ανιχνευτής ακολουθίες, καθώς και PCR συνθήκες θα δοθεί κατόπιν αιτήσεως. Τα δείγματα που ταυτοποιήθηκαν να φέρουν τις p.Q22fs ή παραλλαγή p.S32X με οποιαδήποτε από τις μεθόδους διαλογής που χρησιμοποιούνται επαληθεύθηκαν με αλληλούχιση του Sanger.

Στατιστικές αναλύσεις

αξιολογήθηκαν Ενώσεις μεταξύ των γονότυπων και την κατάσταση της νόσου με τη SAS 9.2 (SAS, Cary, USA). Οι αναλογίες πιθανοτήτων και ακριβείς διαστήματα εμπιστοσύνης 95% δίνονται μαζί με ρ-τιμές με την ακριβή δοκιμή του Fisher. Για τη συνδυασμένη ανάλυση ομοιογένεια των λόγων πιθανοτήτων όπου ελέγχεται με δοκιμή Breslow-Day και η συνδυασμένη αναλογία πιθανοτήτων ήταν υπολογίζονται με τεστ Mantel-Haenszel. Το αταίριαστο T-test χρησιμοποιήθηκε για τη σύγκριση των κλινικών παραμέτρων στους φορείς μετάλλαξης και μη φορείς και υπολογίστηκε με StatView 5.01 (SAS, Cary, USA).

Ευχαριστίες

Manuel Luedeke είναι συμμετέχων του Διεθνούς Graduate School στη Μοριακή Ιατρική Ulm.