Αφηρημένο

Ιστορικό

Το νέο ιό της γρίπης Α πανδημικό ιό (H1N1pdm) προκάλεσε σημαντική νοσηρότητα και θνησιμότητα σε όλο τον κόσμο το 2009 . Ο σκοπός της παρούσας μελέτης ήταν να αξιολογήσει την κλινική πορεία, η διάρκεια της ιικής αποβολής, εξέλιξη H1N1pdm και ανάδειξη της αντι-ιικής αντοχής σε νοσηλευόμενους ασθενείς με καρκίνο με σοβαρές λοιμώξεις H1N1pdm κατά τη διάρκεια του χειμώνα του 2009 στη Βραζιλία.

Μέθοδοι

Πραγματοποιήσαμε μια προοπτική μελέτη κοόρτης ενιαίο κέντρο σε κέντρο καρκίνου στο Ρίο ντε Τζανέιρο, Βραζιλία. Νοσηλευόμενους ασθενείς με καρκίνο και επιβεβαιωμένη διάγνωση της γρίπης Α H1N1pdm αξιολογήθηκαν. Τα κύρια μέτρα έκβασης σε αυτή τη μελέτη ήταν σε ενδονοσοκομειακή θνησιμότητα, τη διάρκεια της ιικής αποβολής, ιογενείς επιμονή και τόσο λειτουργική και μοριακή ανάλυση της ευαισθησίας H1N1pdm στην οσελταμιβίρη.

Αποτελέσματα

Ένα σύνολο των 44 νοσηλεύονται ασθενείς με υποψία γρίπης-όπως ασθένεια ελέγχθηκαν. Ένα σύνολο των 24 είχαν διαγνωστεί λοιμώξεις H1N1pdm. Η συνολική θνησιμότητα νοσοκομείο στην ομάδα μας ήταν 21%. Δεκατρείς (54%) των ασθενών που χρειάστηκαν εντατική φροντίδα. Η μέση ηλικία του μελέτησαν ομάδα ήταν 14,5 έτη (3-69 ετών). Δεκαοκτώ (75%) ασθενείς είχαν λάβει χημειοθεραπεία κατά τον προηγούμενο μήνα, και 14 ήταν ουδετεροπενικοί κατά την έναρξη της γρίπης. Συνολικά 10 ασθενείς αξιολογήθηκαν για τη διάρκειά τους ιογενούς αποβολής, και 5 (50%) εμφανίζεται παρατεταμένη εξάπλωση του ιού (διάμεσος 23, εύρος = 11-63 ημέρες)? Ωστόσο, αυτό δεν σχετίζεται με την εμφάνιση ενός ανθεκτικού ιού H1N1pdm. Viral εξέλιξη παρατηρήθηκε σε διαδοχικά συλλέγονται δείγματα.

Συμπεράσματα

Η παρατεταμένη γρίπης Α H1N1pdm σκόρπισμα παρατηρήθηκε σε ασθενείς με καρκίνο. Ωστόσο, η αντίσταση oseltamivir δεν εντοπίστηκε. Στο σύνολό τους, τα στοιχεία μας δείχνουν ότι ασθενείς με καρκίνο σοβαρά άρρωστος μπορεί να αποτελέσει μια πανδημία δεξαμενή του ιού με σημαντικές επιπτώσεις για την εξάπλωση του ιού

Παράθεση:. Souza TML, Salluh JIF, Bozza FA, Mesquita Μ, Soares Μ, Motta FC, et al. (2010) H1N1pdm Γρίπη Λοίμωξη σε νοσηλευόμενους ασθενείς με καρκίνο: Κλινική Εξέλιξη και ιολογικές αναλύσεις. PLoS ONE 5 (11): e14158. doi: 10.1371 /journal.pone.0014158

Επιμέλεια: Μιχαήλ Β Fessler, Εθνικό Ινστιτούτο Περιβαλλοντικών Επιστημών Υγείας, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 11, Ιουλ, 2010? Αποδεκτές: 27 Οκτωβρίου 2010? Δημοσιεύθηκε: 30 Νοεμβρίου, 2010

Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της δήλωσης Creative Commons Public Domain που ορίζει ότι, μόλις τοποθετηθεί στο δημόσιο τομέα, το έργο αυτό μπορεί να αναπαραχθεί ελεύθερα, διανεμηθεί, μεταδοθεί, τροποποιηθεί, χτισμένο πάνω, ή ειδάλλως να χρησιμοποιηθεί από οποιονδήποτε για οποιονδήποτε νόμιμο σκοπό

Χρηματοδότηση:. Το έργο χρηματοδοτήθηκε από το Instituto Nacional de καρκίνου (www.inca.gov.br), Instituto Oswaldo Cruz /Fiocruz ( www.ioc.fiocruz.br) και του Υπουργείου Βραζιλίας της Υγείας /Decit (https://dtr2001.saude.gov.br/sctie/decit/index.htm). Ο Δρ Soares, ο Δρ Bozza και ο Δρ Siqueira υποστηρίχθηκαν εν μέρει από μεμονωμένες ερευνητικές επιχορηγήσεις από CNPq (www.cnpq.br). Ο Δρ Souza χρησιμοποιούνται, εν μέρει, μεμονωμένες ερευνητικές επιχορηγήσεις από FAPERJ (www.faperj.br). FAPERJ /SESDEC /CNPq προβλέπεται η χορήγηση # Ε-26 /110.778 /2010 (PPSUS – DECIT /SCTIE /MS). Ευχαριστίες οφείλονται επίσης στην IOC /Fiocruz για την παροχή ΜΜ υποτροφία διδακτορικού. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Η εμφάνιση της /H1N1 πανδημία του ιού της νέας γρίπης Α (H1N1pdm) επηρέασε σημαντικά την αξιοποίηση των πόρων της υγειονομικής περίθαλψης και της αυξημένης νοσηρότητας και θνησιμότητας σε παιδιά και νεαρούς ενήλικες [1], [2]. Από τον Απρίλιο μέχρι το Σεπτέμβριο του 2009, κατά τη διάρκεια της πτώσης /χειμώνα στο νότιο ημισφαίριο, η Βραζιλία γνώρισε το πρώτο κύμα του ιού H1N1pdm, και μέχρι το τέλος του Δεκεμβρίου του 2009, πάνω από 1600 H1N1pdm θανάτων είχε αναφερθεί στη Βραζιλία [3].

οι αναδυόμενες δεδομένα σχετικά με την κλινική πορεία της σοβαρής λοίμωξης H1N1pdm επέτρεψαν τον εντοπισμό των ομάδων υψηλού κινδύνου, οι οποίες περιλαμβάνουν έγκυες γυναίκες και οι ασθενείς με νοσογόνο παχυσαρκία [4], [5]. Ωστόσο, η ανάλυση των επιπτώσεων αυτού του νέου ιού σε ένα εξαιρετικά ευαίσθητο πληθυσμό, όπως ασθενείς με καρκίνο, μέσα από την κλινική και ιολογική προοπτικές, πρέπει να επισημανθεί [6], [7], [8], [9], [10 ], [11]. Η άτυπη κλινική εικόνα των λοιμώξεων γρίπης σε ασθενείς με καρκίνο, η οποία καθυστερεί την κλινική υποψία, αντι-ιική θεραπεία και την επαρκή πρόληψη μετάδοσης του ιού, είναι μια μεγάλη πρόκληση για την κλινική διαχείριση σε αυτόν τον πληθυσμό [12]. Οι ασθενείς με καρκίνο έχουν περισσότερες πιθανότητες να υποφέρουν από σοβαρές λοιμώξεις εποχικής γρίπης [12], [13], [14] και παρατεταμένη εξάπλωση του ιού, όπως έχει αναφερθεί για μια Η3Ν2 εποχικής ιό [15]. Η παρατεταμένη αποβολή και η ανάπτυξη αντοχής oseltamivir σε ασθενείς με καρκίνο έχουν μολυνθεί με τον ιό H1N1pdm δεν έχουν καλά αξιολογηθεί. Τα στοιχεία σχετικά με τις πτυχές αυτές θα μπορούσαν να έχουν σημαντικές επιπτώσεις για τις πρακτικές διαχείρισης και ελέγχου λοιμώξεων κλινική για ασθενείς H1N1pdm με λοίμωξη του καρκίνου [16].

Επειδή η ανάλυση αυτού του μυθιστορήματος ιογενούς λοίμωξης σε ασθενείς με καρκίνο είναι ένα σημαντικό συστατικό του 2009 πανδημίες, πραγματοποιήσαμε μια προοπτική μελέτη κοόρτης που αποσκοπούν στην αξιολόγηση της κλινικής πορείας της λοίμωξης της γρίπης, κατά τη διάρκεια της ιικής αποβολής, εξέλιξη H1N1pdm και την εμφάνιση αντοχή στα αντιιικά φάρμακα σε ασθενείς με καρκίνο που νοσηλεύονται με σοβαρή λοίμωξη H1N1pdm σε ένα κέντρο καρκίνου αναφοράς κατά τη διάρκεια του χειμώνα του 2009 στη Βραζιλία.

Αποτελέσματα

Χαρακτηριστικά του πληθυσμού της μελέτης

κατά τη διάρκεια της μελέτης, 44 ασθενείς νοσηλεύονται με καρκίνο με μια υποψία λοίμωξης γρίπης ελέγχθηκαν, και 24 είχαν μια επιβεβαιωμένη γρίππης Α διάγνωση, χρησιμοποιώντας μία ταχεία έμμεσου ανοσοφθορισμού (IFI) δοκιμή ή τον Παγκόσμιο Οργανισμό Υγείας (ΠΟΥ) -Συστημένος πραγματικού χρόνου RT-PCR (rRT-PCR) (Σχήμα 1 και Πίνακας S1). Μεταξύ αυτών, 20 ασθενείς είχαν επιβεβαιωθεί ότι είναι θετικά για τον ιό H1N1pdm χρησιμοποιώντας rRT-PCR (Σχήμα 1 και Πίνακας S1). Οι υπόλοιποι τέσσερις ασθενείς ήταν θετικοί για τη γρίπη Α χρησιμοποιώντας μόνο IFI. Λαμβάνοντας υπόψη τις πανδημία ορισμών των κρουσμάτων σε σχέση με τις διεθνείς κατευθυντήριες γραμμές [17], τα τελευταία τέσσερα περιπτώσεις ταξινομήθηκαν ως H1N1pdm επιβεβαιωμένα κρούσματα. Συνολικά, αυτές οι 24 περιπτώσεις αποτελούσαν τον πληθυσμό της μελέτης. Όλα τα δείγματα της αναπνευστικής οδού που συλλέγονται από τα rRT-PCR-επιβεβαιωμένους ασθενείς 20 εμβολιάστηκαν σε κυτταρικές καλλιέργειες. Έχουμε ανακτηθεί τον ιό από 13 άτομα μετά από τουλάχιστον δύο περάσματα σε MDCKs, αποτελώντας 15 απομονωμένα δείγματα. Τα στελέχη αυτά αναλύθηκαν επίσης για την αντίσταση oseltamivir χρησιμοποιώντας ένα λειτουργικό προσδιορισμό.

Η

Οι ασθενείς που έχουν διαγνωστεί με H1N1pdm ήταν νέοι (μέση ηλικία = 14.5, εύρος 3-69 έτη). Συνολικά, 14 (58,3%) ήταν κάτω των 18 ετών, και 17 (70,8%) ήταν μικρότερη από 50 ετών. καρκίνος Αιματολογικές συνέβη στο 75% (18) των ασθενών, ενώ συμπαγείς όγκους συνέβη στο 25% (6) ασθενείς (πίνακες S2 και S3). Ένα σύνολο 22 (~92%) ασθενείς είχαν λάβει ανοσοκατασταλτική αγωγή κατά τις τελευταίες 30 ημέρες. Μεταξύ αυτών των ατόμων, 18 ασθενείς (75%) ήταν σε χημειοθεραπεία, 14 (58,3%) έλαβαν συστηματικά κορτικοστεροειδή και 1 (4%) έλαβαν θεραπεία με ακτινοβολία (Πίνακας 1 και S4). Κανένας ασθενής δεν λάβει ερυθροποιητίνη (EPO) ή ανοσοτροποποιητικά φάρμακα. Συνολικά 14 ασθενείς (58,3%) παρουσίασαν εμπύρετη ουδετεροπενία (& lt? 500 ουδετερόφιλα /mm

3) κατά το χρόνο H1N1pdm διαγνώστηκε. Η μέση διάρκεια της ουδετεροπενίας μετά την έναρξη της ιικής νόσου Ήταν δύο ημέρες (που κυμαίνονται από ένα έως έξι ημέρες? Πίνακας S5). Σύμφωνα με το πρωτόκολλο της Βραζιλίας Εθνικό Ινστιτούτο Καρκίνου, όλοι οι ασθενείς που παρουσίασαν ουδετεροπενία έλαβαν G-CSF μέχρι την εξομάλυνση των αριθμού των ουδετερόφιλων. Τα κλινικά χαρακτηριστικά και τις συγκρίσεις μεταξύ των ομάδων που φαίνονται στον Πίνακα 1 και στους Πίνακες S1, S2, S3, S4, S5, S6, S7, S8, S9, S10, S11 και. Η συνολική θνησιμότητα σε ομάδα μας ήταν περίπου 21% (n = 5), και τέσσερις ασθενείς (n = 16,6%) είχαν τουλάχιστον μία συννοσηρότητα εκτός του καρκίνου. Από αυτούς τους ασθενείς με συνοδά νοσήματα, το ένα πέθανε. Δεν είστε έγκυος ή νοσηρά παχύσαρκοι ασθενείς εντοπίστηκαν.

Η

Ένα σύνολο των 23 (95,8%) των ασθενών που έλαβαν θεραπεία με oseltamivir, και ο διάμεσος χρόνος από τα αρχικά συμπτώματα από την έναρξη της θεραπείας ήταν τρεις ημέρες (0 -15 ημέρες? πίνακες 1, S2 και S6). Ένας ασθενής που έχασαν τη ζωή τους λόγω της σοβαρής οξείας αναπνευστικής ανεπάρκειας 24 ώρες μετά την κλινική υποψία λοίμωξης H1N1pdm δεν έλαβε ποτέ αντιική θεραπεία. Oseltamivir χρησιμοποιήθηκε για ένα μέσο επτά ημερών (0-19 ημέρες), και το διπλό δόσεις (150 mg δύο φορές ημερησίως για τους ενήλικες και δύο φορές τη συνιστώμενη δόση ανά χιλιόγραμμο για τα παιδιά) χορηγήθηκαν για 11 (47,8%) των ασθενών (Πίνακας S6). Ένα σύνολο των 11 (47,8%) ασθενείς έλαβαν oseltamivir για περισσότερο από επτά ημέρες. Έξι ασθενείς (25%) έλαβε αυτή την αντι-ιική μέσα σε 48 ώρες από την κλινική υποψία. Όλοι οι ασθενείς που πέθαναν έλαβαν oseltamivir περισσότερο από 48 ώρες μετά την έναρξη της ασθένειας. Ωστόσο, όταν συγκρίναμε την θνησιμότητα των ασθενών που έλαβαν oseltamivir είτε εντός είτε μετά από 48 ώρες από την έναρξη της νόσου, δεν παρατηρήθηκε σημαντική διαφορά (0/6 έναντι 5/18, ρ = 0.28). Δεν παρατηρήθηκαν διαφορές στην παρατεταμένη εξάπλωση του ιού μεταξύ των δύο αυτών ομάδων.

Κατά την παρουσίαση, όλοι οι ασθενείς υποβλήθηκαν σε θεραπεία με ευρέος φάσματος ενδοφλέβια αντιμικροβιακών παραγόντων για την καταπολέμηση της πνευμονίας της κοινότητας και /ή εμπύρετη ουδετεροπενία [18], και πέντε (20,8%) είχαν ταυτόχρονη θετικές καλλιέργειες (πίνακες S7 και S8). Υποξαιμία ήταν συχνή, και το μεσαίο PaO2 /FiO2 για την πρώτη αξιολόγηση του φυσικού αερίου αρτηριακού αίματος ήταν 192 mmHg (εύρος: 64 – 367 mmHg).

Μονάδα Εντατικής Θεραπείας εισαγωγή

Συνολικά, 13 ασθενείς ( πέντε ενήλικες και οκτώ παιδιά) εισήχθησαν στη ΜΕΘ. Έξι ασθενείς είχαν άμεση δεκτοί από το τμήμα επειγόντων περιστατικών, καθώς και οι άλλοι επτά ασθενείς μεταφέρθηκαν από άλλες πτέρυγες του νοσοκομείου (Πίνακας S2). Η αναπνευστική υποστήριξη δόθηκε σε 12 ασθενείς (Πίνακας 1 και S9). Επεμβατικό μηχανικό αερισμό πραγματοποιήθηκε σε 10 ασθενείς (76,9%), και μη επεμβατικού αερισμού (ΜΕΜΑ) πραγματοποιήθηκε σε 3 ασθενείς (23,1%? Πίνακας 1). Μεταξύ των ασθενών ΜΕΜΑ, που απαιτείται επακόλουθη ενδοτραχειακή διασωλήνωση και μηχανική υποστήριξη της αναπνοής, και οι τρεις ασθενείς εξιτήριο από το νοσοκομείο. αποτυχία εξω-πνευμονική όργανο συνέβη σε οκτώ ασθενείς (33,3%? Πίνακα 1 και S9).

Από τους 13 ασθενείς σε κρίσιμη κατάσταση, 12 υποβλήθηκαν σε θεραπεία με oseltamivir, και η θεραπεία ξεκίνησε 48 ώρες μετά τα πρώτα σημάδια /συμπτώματα του ιογενής λοίμωξη σε 5 από αυτά. Συμπλήρωμα ή μη συμβατικών υποστηρικτική θεραπεία για ARDS έγιναν για 12 από τους 13 ασθενείς που εισήλθαν στην ΜΕΘ (92,3%). Συνολικά 10 ασθενείς (76,9%) έλαβαν συστηματικά κορτικοστεροειδή (οκτώ λόγω της προηγούμενης χρήσης και δύο για το σοκ και επίμονη ARDS)? πέντε (38,5%) ήταν αεριζόμενο σε πρηνή θέση, και τέσσερις (30,8%) που απαιτείται ελιγμοί προσλήψεων. Κανένας ασθενής δεν έλαβε εξωσωματική οξυγόνωση μεμβράνης.

Η παρατεταμένη H1N1pdm ρίχνοντας

Αν και η παρατεταμένη γρίπης έχει παρατηρηθεί μια αποβολή για έναν ασθενή με καρκίνο έχουν μολυνθεί με τον ιό της εποχικής Η3Ν2 [15], πιο λεπτομερή στοιχεία σχετικά με H1N1pdm έκκριση σε ασθενείς με καρκίνο σοβαρά άρρωστος είναι υποχρεωτικά. Αξιολογήσαμε εξάπλωση του ιού σε 10 μηχανικά αεριζόμενους ασθενείς με τη συλλογή διαδοχική αναπνευστικού δείγματα σε διαφορετικά χρονικά σημεία μετά την έναρξη της νόσου. Η διάρκεια της ιικής αποβολής θεωρήθηκε ότι είναι το χρονικό πλαίσιο από τα αρχικά συμπτώματα στο τελευταίο δείγμα H1N1pdm-επιβεβαιώνονται. Πέντε (50%) των ασθενών στην ομάδα αυτή έδειξε εξάπλωση του ιού για τουλάχιστον 11 ημέρες κατά τη διάρκεια της θεραπείας με oseltamivir (Σχήμα 2 και Πίνακας S12). Η διάμεση διάρκεια της H1N1pdm αποβολής ήταν 23 ημέρες (που κυμαίνονται 11 έως 63 ημέρες? Σχήμα 2 και Πίνακας S12)

Η

Το πιο σημαντικό, η μέγιστη διάρκεια των H1N1pdm ρίχνοντας στην έρευνά μας ήταν 63 ημέρες, ακολουθείται. κατά 44 ημέρες για το άλλο ασθενή. Για τις γνώσεις μας, οι περίοδοι αυτές αποτελούν οι μεγαλύτερες καταγεγραμμένες υποθέσεις της H1N1pdm σκόρπισμα περιγραφεί μέχρι σήμερα. Όλα rRT-PCR-θετικά δείγματα από αυτούς τους ασθενείς με τις μεγαλύτερες διάρκειες ιική απόπτωση (5645 και 5899) ήταν καλλιεργήσιμων, πράγμα που σημαίνει ότι αυτά ήταν μολυσματικών ιών (Σχήμα 2 και Πίνακας S12). Επιπλέον, τα τελευταία H1N1pdm επιβεβαιωμένα δείγματα από αυτούς τους ασθενείς είχαν μόνο ανιχνεύθηκαν χρησιμοποιώντας ανιχνεύσεις κυτταρικής καλλιέργειας, υποδεικνύοντας την παρουσία χαμηλών φορτίων ιικών σε αυτά τα δείγματα (Σχήμα 2 και Πίνακας S12). Αυτοί οι ασθενείς εξακολουθούν να ρίξει τον ιό για ένα επιπλέον 25 με 40 ημέρες μετά τη διακοπή της αντι-ιικής θεραπείας (Εικόνα 2).

H1N1pdm μοριακή εξέλιξη σε κλινικές απομονώσεις

Μέχρι σήμερα, καμία σημαντική μεταβολή υπήρξε ανιχνευθούν στο επίπεδο αμινοξέων στην αιμοσυγκολλητίνη (ΗΑ) του ιού 2.009 πανδημίας [19]. Επομένως, εξετάσαμε την γενετική ποικιλότητα του ιού H1N1pdm ανακτάται από αυτούς σοβαρά άρρωστους ασθενείς εκτελώντας ανάλυση αλληλουχίας του ιικού γονιδίου ΗΑ. Καμία σημαντική διαφορά βρέθηκε στο H1N1pdm απομονώσεις που συλλέγονται κατά τη διάρκεια της εμφάνισης της ασθένειας από τους τέσσερις ασθενείς με παρατεταμένη αποβολή (Σχήμα S1).

Για την αξιολόγηση των γενετικών χαρακτηριστικών των στελεχών από ασθενείς με παρατεταμένη εξάπλωση του ιού, μπορούμε αλληλουχία δύο διαδοχικά δείγματα από ένα μόνο άτομο (5645s2 /09 και 5645s3 /09) και συγκρίνονται οι ακολουθίες τους ΗΑ σε άλλους ιούς H1N1pdm από ήπια, σοβαρή και θανατηφόρα κρούσματα από διαφορετικές χώρες. Παρατηρήσαμε ότι τα δείγματα που συλλέγονται από ένα μήνα χώρια (5645s2 /09 και 5645s3 /09) είναι συγκεντρωμένοι μαζί και εμφανίζεται ένα σχετικά μεγάλο μήκος διακλάδωση από άλλους ιούς H1N1pdm (Σχήμα 3). Αυτό το αποτέλεσμα μπορεί να οφείλεται στέλεχος 5645s2 /09 απέκλιναν από CA /04 στις L52S υπολείμματα αμινοξέων, L70P, P100S, C153L, T214A, Q293R και I321V (Η1 αρίθμηση). Επιπλέον, απομόνωση 5645s3 /09, το οποίο αλληλουχήθηκε από τα υπολείμματα αμινοξέων 167 να 413, είχαν επίσης τις μεταλλάξεις T214A, Q293R και I321V καθορίζονται στο ιικό πληθυσμό ένα μήνα μετά την αρχική δειγματοληψία. Στην απομόνωση 5645s3 /09, μια άλλη μετάλλαξη απέκτησε επίσης, D238P, γεγονός που υποδηλώνει τη συνεχή ιογενή εξέλιξη. Αν και δεν μπορούμε να προσδιορίσουμε το ρόλο αυτών των μεταλλάξεων στο ιικό παθογένεση από αυτό το αποτέλεσμα και μόνο, η διατήρηση της αλλαγής των υπολειμμάτων πάροδο του χρόνου δείχνει έντονα ιογενή επιμονή παρά την εκ νέου μόλυνση.

Η bootstrap πιθανότητα ενδείκνυται για κάθε εσωτερικό κλάδο και τιμές κάτω από το 80% είναι κρυφό. Η γραμμή κλίμακας δείχνει τον αριθμό των αλλαγών αμινοξέων ανά περιοχή. Ο αριθμός δειγματοληψίας και το κράτος προέλευσης στη Βραζιλία εμφανίζονται. Αυτό το δέντρο έχει τις ρίζες του από την /04/2009 ακολουθία ΗΑ Καλιφόρνια.

Η

H1N1pdm ευαισθησίας στην οσελταμιβίρη

Θεωρώντας ότι η αντίσταση της γρίπης στα αντιιικά, είναι πιθανό να εμφανιστούν σε ανοσοκατεσταλμένα άτομα και ότι, με σχέση με τον ιό H1N1pdm, μόνο λίγες μελέτες έχουν ανιχνεύσει αντίσταση oseltamivir [20], διερευνήσαμε την εμφάνιση αντι-ιική αντίσταση σε δείγματα H1N1pdm απομονωθεί σε κυτταρική καλλιέργεια. Έτσι, το oseltamivir carboxylate IC

50 τιμές μετρήθηκαν για 15 δείγματα H1N1pdm απομονώθηκαν από 13 ασθενείς. Βρήκαμε ότι το 10 απομονώσεις ήταν ευαίσθητοι (0,85 ± 0,27 ηΜ), και 5 εμφανίζεται υψηλή IC

50 τιμές για την αντι-ιική που χρησιμοποιείται (165.13 ± 42.26 ηΜ). Αυτά τα δείγματα στάλθηκαν σε συνεργαζόμενο κέντρο της ΠΟΥ στο CDC στην Ατλάντα για την επιβεβαίωση αντίσταση. Βρήκαμε ότι τα στελέχη με υψηλή IC

50 τιμές προικισμένο με νευραμινιδάση (ΝΑ) δραστηριότητα που ήταν διασταυρούμενη αντοχή στην οσελταμιβίρη, ζαναμιβίρη και Peramivir, γεγονός που υποδηλώνει την παρουσία ενός συν-παθογόνου προικισμένη με δραστηριότητα NA μέσα σε αυτές τις απομονώσεις. Συν-μολύνσεις με άλλες αναπνευστικές ιούς (κορωναϊός (229, 43 και 63), της παραγρίπης (1, 2, 3 και 4), τα ανθρώπινα μεταπνευμονοϊού, parechovirus, ρινοϊό, RSV Α /Β, αδενοϊό και εντεροϊού) ή άτυπα βακτήρια (

Mycobacterium πνευμονία

) δεν εντοπίστηκαν στα δείγματα αυτά, γεγονός που υποδηλώνει ότι καμία άλλη ιογενή πηγή της δραστηριότητας NA ήταν υπεύθυνη για αυτές τις υψηλές IC

50 τιμές. Ωστόσο, συν-απομονώθηκε ένα

Streptococcus

sp. από τα δείγματα με υψηλές IC

50 τιμές. Η δραστηριότητα NA αυτού του βακτηριακού στελέχους εμφανίζεται ένα φαινότυπο ανθεκτικό στην ΕΟΕ. Σε περαιτέρω δοκιμές με βακτήρια H1N1pdm απομονώνει, ο ιός «IC

50 ήταν σύμφωνα με μια ευαίσθητη απομόνωση. Pyrosequencing αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν επίσης και αποκάλυψε ότι τα άλλα high-IC

50 δείγματα είχαν το υπόλειμμα WT H275 και ως εκ τούτου δεν περιέχουν αυτό το δείκτη αντίστασης oseltamivir. Οι ιοί που απομονώθηκαν από την αρχική εμφάνιση της ασθένειας ήταν /California /07-όπως οι ιοί Α (Εικόνα S2).

Συζήτηση

Η παρατεταμένη γρίπης ρίχνοντας σε ασθενείς με καρκίνο έχει παρατηρηθεί για την εποχική στελέχη [15] . Όσον αφορά τον ιό H1N1pdm, έχει δείξει ότι η παρατεταμένη έκλυση ιών σε ασθενείς με καρκίνο μπορεί να συμβεί, αν και ένα τέτοιο φαινόμενο έχει τεκμηριωθεί μόνο μέσω περιπτώσεις που αφορούν ένα μόνο μελέτησαν ασθενή [21], [22], [23], [24], [25]. Εδώ, έχουμε μελλοντικά και συστηματικής συλλογής πληροφοριών από μια ομάδα των νοσηλευόμενων ασθενών με καρκίνο με σοβαρές λοιμώξεις H1N1pdm. Αυτοί οι ασθενείς παρουσίασαν υψηλή θνητότητα, η παρατεταμένη απόπτωσης του ιού και την εξέλιξη H1N1pdm χωρίς την εμφάνιση αντοχής oseltamivir. Αυτή είναι η πρώτη μελέτη για την αντιμετώπιση της απόπτωσης του ιού και την αντίσταση σε καρκινοπαθείς ασθενείς με λοιμώξεις H1N1pdm? ως εκ τούτου, μπορεί να παρέχουν πληροφορίες για τον ρόλο των ασθενών με καρκίνο και ανθρώπινου δυναμικού δεξαμενές για αυτή την πανδημία του ιού.

Σε αντίθεση με τις προηγούμενες εκθέσεις, ο πληθυσμός μας αποτελείται από νοσηλευόμενους ασθενείς με σοβαρή ανοσοκαταστολή του καρκίνου [26]. Οι περισσότεροι από αυτούς ήταν νέοι, είχαν αιματολογικές κακοήθειες και έλαβαν χημειοθεραπεία και συστηματική στεροειδή κατά τις εβδομάδες που προηγήθηκαν της λοίμωξης H1N1pdm. Οι ασθενείς έλαβαν θεραπεία με oseltamivir στις αρχές της δεκαετίας πορεία της μόλυνσης (το διάμεσος χρόνος έως την έναρξη αντιική ήταν τρεις ημέρες). Συνολικά 13 ασθενείς (54%) που απαιτείται εντατική φροντίδα και παρουσίασε σοβαρή αναπνευστική δυσχέρεια. Σε αυτούς τους ασθενείς, τα ποσοστά θνησιμότητας ήταν υψηλότερη (38%) από εκείνες που παρατηρήθηκαν για τη γενική ΜΕΘ ασθενείς που υποφέρουν από λοιμώξεις H1N1pdm [2], [27], καθώς και για μη-βαρέως πάσχοντες ασθενείς καρκίνο [26]. Ωστόσο, τα αποτελέσματα δεν ήταν διαφορετικές από αυτές που αναφέρθηκαν για τους ασθενείς με καρκίνο που απαιτεί μηχανικό αερισμό [28], [29].

Είναι ενδιαφέρον ότι, κατά τη διάρκεια της περιόδου γρίπης, 14 ασθενείς (58,3%) με εμπύρετη ουδετεροπενία προσδιορίστηκαν ως H1N1pdm περιπτώσεις, μια κατάσταση που δεν είναι συνήθως διερευνηθεί σε αυτό το σενάριο. Ωστόσο, οι ασθενείς εμπύρετη ουδετεροπενική καρκίνο έχουν αυξημένο κίνδυνο να εμφανίσουν αναπνευστική δυσχέρεια και πολυοργανική ανεπάρκεια. Ως εκ τούτου, η διαλογή για αναπνευστικούς ιούς και έγκαιρη έναρξη της θεραπείας oseltamivir θα πρέπει να εξετάζεται σε αυτούς τους ασθενείς. Εμπύρετη ουδετεροπενία υποδεικνύει ένα φτωχό προγνωστικό όσον αφορά την έκβαση του ασθενούς, αλλά η διάρκειά ουδετεροπενίας σε ομάδα μας των ασθενών ήταν μικρότερη από επτά ημέρες. Έτσι, η παρατεταμένη εξάπλωση του ιού μπορεί να μην έχει σχέση με ουδετεροπενία.

Παρατηρήσαμε την εμμονή της H1N1pdm σε 5 από τους 10 ασθενείς που μελετήθηκαν για το σκοπό αυτό. Σε αυτά τα άτομα, εξάπλωση του ιού συνεχίζεται για τουλάχιστον 11 ημέρες, παρά τη χρήση του oseltamivir. Η μέση διάρκεια της ιικής αποβολής σε πληθυσμό μας ήταν 23 ημέρες και δύο παιδιατρικούς ασθενείς με οξεία λεμφοβλαστική λευχαιμία έδειξε ακόμη περισσότερο εκκρίσεις του ιού (44 και 63 ημέρες? Σχήμα 2 και Πίνακας S10), αν και είναι δύσκολο να καθοριστεί εάν ιική επιμονή οφειλόταν σε καρκίνο

per se

ή σε οξεία πνευμονική βλάβη και μηχανικό αερισμό.

γρίπη απόπτωση δεν θεωρείται να διαρκέσει πολύ, και εξαφανίζεται επτά ημέρες μετά την έναρξη (2,4 και 4,5 ημέρες για την oseltamivir- και εικονικό φάρμακο, αντίστοιχα) [30]. Μελέτες με στόχο την παρακολούθηση του 2009 H1N1pdm αποβολή ιού χρησιμοποιώντας τυχαιοποιημένες μελέτες με κατάλληλους ελέγχους, όπως εξωτερικοί ασθενείς και στο νοσοκομείο ή ανοσοκατασταλμένα άτομα, δεν έχουν ακόμη διεξαχθεί. Επειδή ήμασταν επίσης σε θέση να θεσπίζουν ελέγχους ίδιας ηλικίας με ή χωρίς ανοσοκαταστολή, δεδομένου ότι αυτή η μελέτη διεξήχθη κατά τη διάρκεια της αιχμής του πρώτου κύματος των πανδημιών 2009 στη Βραζιλία, συγκρίναμε το έργο μας με άλλες μελέτες για H1N1pdm ρίχνοντας σε γενικές γραμμές, στο νοσοκομείο ή ανοσοκατασταλμένους πληθυσμούς [21], [22], [23], [24], [25], [31], [32], [33], [34], [35], [36]. Στον Πίνακα 2, συνοψίζουμε την ομάδα που χρησιμοποιείται σε κάθε μελέτη, έστω και αν δεν ήταν ανοσοκατεσταλμένοι, υποκείμενα νοσήματα και ο αριθμός των ασθενών που αναλύθηκαν για την εξάπλωση του ιού σε κάθε μία από αυτές τις μελέτες. Συγκρίναμε τις μέγιστες περίοδοι των περικοπών μεταξύ αυτών των διαφορετικών πληθυσμών και τον αριθμό των ασθενών που εκκρίνεται από τον ιό για περισσότερο από επτά ημέρες. Τα στοιχεία αυτά θα ήταν πιο κατατοπιστική και σχετικές από την άποψη της δημόσιας υγείας, επειδή η διάρκεια της καραντίνας για H1N1pdm ήταν περίπου ότι πολύ καιρό [21]. Βρήκαμε (Πίνακας 2) ότι στα νοικοκυριά στο Χονγκ Κονγκ [31] και ο Καναδάς [34], οι μέγιστες περίοδοι των H1N1pdm απόπτωση κυμάνθηκε από 8 έως 11 ημέρες. Αυτές οι περίοδοι δεν ήταν διαφορετικό από αυτό που παρατηρήθηκε με τη στρατιωτική δοκίμους [22], καθώς και κατά τη φάση περιορισμού των πανδημιών στο Βιετνάμ [23] (Πίνακας 2). Όσον αφορά H1N1pdm ρίχνοντας μεταξύ των βρεφών, Hien et al. έδειξε ότι τα παιδιά εννέα παρα πέντε ετών θα μπορούσαν να εκκρίνουν τον ιό H1N1pdm για πέντε έως έξι ημέρες, το οποίο είναι σημαντικά χαμηλότερο από ό, τι παρατηρείται για τον ιό της εποχικής γρίπης [30], [33]. Σε σύγκριση με τα αποτελέσματα μας, παρατηρήσαμε υψηλότερες περιόδους της ιικής αποβολής σε δύο επτά ετών ασθενείς με οξεία λεμφοβλαστική λευχαιμία (Πίνακας 2 και Σχήμα 2). Ωστόσο, μια ενιαία έκθεση για δύο ταξιδιώτες στη Γαλλία έδειξε ότι αυτές οι φαινομενικά ανοσοεπαρκή άτομα που εκκρίνεται από τον ιό H1N1pdm για 14 και 28 ημέρες [25] (Πίνακας 2). Αν και αυτά τα χρονικά διαστήματα είναι συγκρίσιμα με το χρονικό πλαίσιο της έκκρισης του ιού σε ασθενείς που νοσηλεύονται στην Κίνα [23] και το έργο μας, τη μελέτη από Felury et al. μπορεί να είναι τόσο προκατειλημμένη όπως η δική μας από το μικρό μέγεθος της κλάσης (Πίνακας 2). Μολυσμένα με γρίπη ανοσοκατεσταλμένα άτομα μπορεί να έχουν παρατεταμένη γρίπης ρίχνοντας [15], [21], [32], [36]? Ωστόσο, περισσότερο ιδέες είναι αναγκαία για να κατανοήσει καλύτερα τη δυναμική του ιού H1N1pdm στα άτομα αυτά. Mora et al. έδειξαν ότι σε HIV-1-μολυσμένα άτομα, συν-μόλυνση με τον ιό H1N1pdm θα μπορούσε να οδηγήσει σε αποτέλεσμα που δεν διαφέρει από εκείνη που αναμένεται για τα υποκείμενα ανοσοεπαρκείς, αν και καμία συστηματική ανάλυση της ιικής αποβολής διεξήχθη [36]. Ένα παρόμοιο συμπέρασμα Εφιστάται επίσης για λήπτη άτομα, των οποίων οι μεγαλύτερες περίοδοι της απόπτωσης του ιού δεν υπερβαίνει τις 11 ημέρες [32] (Πίνακας 2). Στη μελέτη μας, βρήκαμε τις περιόδους H1N1pdm ρίχνοντας παρόμοιο με αυτό που παρατηρήθηκε το CDC για ασθενείς με λευχαιμία [21] (Πίνακας 2). Παρόλο το μικρό μέγεθος αυτών των κλάσεων των ανοσοκατεσταλμένα άτομα [21], [32], συμπεριλαμβανομένης της δική μας, μπορεί να απαιτήσει μια πιο αποφασιστική και μηχανιστική ανάλυση, αυτές οι παρατηρήσεις μπορεί να τονώσει περαιτέρω συστηματικές μελέτες για να κατανοήσει ή να αποκτήσουν γνώσεις σε παράγοντες που σχετίζονται με παρατεταμένη H1N1pdm απόπτωση. Επιπλέον, θα μπορούσε να δώσει πληροφορίες σχετικά με τις βασικές μελέτες για την παθογένεση της γρίπης.

Η

Τα αποτελέσματά μας υπογραμμίζουν την ανάγκη για στενότερη παρακολούθηση των ασθενών με καρκίνο με λοιμώξεις H1N1pdm μέχρι την ανίχνευση της πρώτης αρνητικό δείγμα. Υποθέτουμε ότι τα πρωτόκολλα παρακολούθησης με στόχο την παρακολούθηση της εμμονής της απόπτωσης του ιού σε ασθενείς με καρκίνο μπορεί να είναι σχετικές εάν οι ασθενείς υποβάλλονται σε ανοσοκατασταλτική θεραπεία τις επόμενες ημέρες ή εβδομάδες πριν ή μετά από μια μόλυνση H1N1pdm.

Στη συνέχεια, επιδίωξαν να καθορίσουν την ιογενή εξέλιξη κατά τη διάρκεια της παρατεταμένης απόπτωση. Βρήκαμε ότι ορισμένοι αλλαγές αμινοξέων συνεχίστηκε από τα αρχικά συμπτώματα μέχρι 30 ημερών, γεγονός που υποδηλώνει ότι αυτοί οι ασθενείς είχαν ιικό επιμονή παρά την εκ νέου μόλυνση. Επιπλέον, μια μεταβολή επιπλέον αμινοξύ (D238P) βρέθηκε στο ιικό ΗΑ αλληλουχία ένα μήνα μετά την έναρξη της ασθένειας, γεγονός που υποδηλώνει τη συνεχή ιογενή εξέλιξη. Αν και ορισμένες από τις μεταλλάξεις που βρήκαμε (L52S, L70P, P100S, C153L, T214A, D238P, Q293R και I321V) σε στελέχη 5645s2 /09 και 5645s3 /09 δεν έχουν περιγραφεί προηγουμένως, άλλες αλλαγές υπολειμμάτων αμινοξέων που ανιχνεύθηκαν σε μας μελέτη (P100S και T214A) έχουν βρεθεί σε ιούς H1N1pdm σε όλο τον κόσμο, χωρίς σημαντική σύνδεση με την ιογενή παθογένεση ή αντιγονική παραλλαγή [37], [38], [39].

οι ιοί της γρίπης ανθεκτικά στα αντιιικά φάρμακα έχουν έχουν αναφερθεί σε ανοσοκατεσταλμένους ασθενείς, [21], [40] και αυτή η αντίσταση θα μπορούσε να σχετίζεται με την παρατεταμένη ιικής αποβολής [41], [42]. Αξίζει να σημειωθεί ότι, πέντε στελεχών από δύο ασθενείς είχαν υψηλές IC

50 τιμές σε αναστολείς της νευραμινιδάσης (ΕΟΕ). Μια δραστηριότητα NA που ήταν πολυανθεκτικά να ΕΟΕ ταυτοποιήθηκε και θα μπορούσε να οφείλεται στην παρουσία ενός

Streptococcus

στέλεχος που βρέθηκε στην φαρυγγικά επιχρίσματα και αναρροφήσεις τραχείας. Pyrosequencing αναλύσεις των δειγμάτων με υψηλή IC

50 τιμές αποκάλυψε ότι αυτά τα δείγματα ήταν H275 άγριου τύπου ευαίσθητων ιών. Τα αποτελέσματα αυτά ενισχύουν την ανάγκη για πρόσθετες δοκιμασίες προσδιορισμού του γονότυπου για να επιβεβαιωθεί η ταυτοποίηση των θεωρούμενων ανθεκτικών στελεχών ταυτοποιηθούν χρησιμοποιώντας λειτουργικούς προσδιορισμούς. Επιπλέον, τα ευρήματά μας δείχνουν την ανάγκη για τη διερεύνηση άλλων πηγών δραστηριότητας ΕΜ ιό απομονώνει με περίεργο IC ​​

50 τιμές.

Το φαινομενικά παράδοξο της παρατεταμένης εξάπλωση του ιού χωρίς αντι-ιική αντίσταση θα μπορούσε να εξηγηθεί είτε από την ανικανότητα του ανοσοκατασταλμένους υποδοχής να καθαρίσει αποτελεσματικά τον ιό H1N1pdm [12], [43] ή αναποτελεσματική απορρόφηση του φαρμάκου [44]. Επειδή έχουμε συνδυασμό των δύο κλινικών και μοριακών δεδομένων ιολογία, τα αποτελέσματά μας θα μπορούσε να συμβάλει στη συζήτηση για την επαρκή διάρκεια και το είδος της θεραπείας αντι-H1N1pdm σε ανοσοκατεσταλμένους ασθενείς με παρατεταμένη πορεία. Σε αυτούς τους ασθενείς, θα πρέπει επίσης να διερευνηθεί η χρήση παρεντερικής συστηματικών ή εισπνεόμενων αντιιικά.

Αν και το έργο μας διερευνά περαιτέρω τις μοναδικές δυναμική της μόλυνσης από τον ιό H1N1pdm σε ανοσοκατασταλμένους ξενιστές, ορισμένες προειδοποιήσεις πρέπει να σημειωθεί. Επειδή η έρευνά μας ξεκίνησε κατά τη διάρκεια μιας νέας πανδημίας, τα πρωτόκολλα κλινική αξιολόγηση και τη διαχείριση αλλάξει κατά τη διάρκεια της μελέτης, όπως νέα δεδομένα προέκυψαν από τη βιβλιογραφία και από αναθεωρημένες συστάσεις [45]. Καθώς η πανδημία έφτασε στο αποκορύφωμά της στη Νότια Αμερική, η δημιουργία ενός μεγαλύτερου και πιο ποικιλόμορφη ομάδα με την ηλικία-μάρτυρες με ή χωρίς ανοσοκαταστολή έγινε περίπλοκη. Έτσι, σε βάθος πολλών μεταβλητών και μηχανιστικές κλινικές αναλύσεις περιορίστηκαν. Επιπλέον, δεν υπάρχουν συστάσεις για την παρακολούθηση της ιογενούς επιμονής ήταν διαθέσιμα? Ως εκ τούτου, μόνο ένα υποσύνολο των σοβαρά άρρωστος ασθενών που εισάγονται σε ΜΕΘ αξιολογήθηκε. Παρά το γεγονός ότι, μια σημαντική σύνδεση μεταξύ κλινικών και εργαστηριακών πληροφοριών μελετήθηκε, αποκαλύπτοντας τη συνεχή εξέλιξη των ακολουθιών H1N1pdm ΗΑ και τη σταθερότητα του γονιδίου ΝΑ σε βαριά άρρωστους ασθενείς [14].

Εν κατακλείδι, η μελέτη αυτή παρέχει αποδείξεις ότι σοβαρή λοίμωξη H1N1pdm σχετίζεται με σημαντική νοσηρότητα και θνησιμότητα στους ασθενείς με καρκίνο. Σε αυτούς τους ασθενείς, μπορεί να συμβεί ιική επιμονή, χωρίς την εμφάνιση του αντι-ιική αντίσταση κατά τη διάρκεια της κλινικής πορείας της νόσου. Το αποτέλεσμα αυτό έχει σημαντικές επιπτώσεις για την κλινική διαχείριση των λοιμώξεων H1N1pdm και τις στρατηγικές ελέγχου των λοιμώξεων. Η μελέτη μας μπορεί να παρέχει γνώσεις σχετικά με H1N1pdm ρίχνοντας και μπορεί να συμβάλει στην ανάπτυξη των νέων κατευθυντήριων γραμμών για τη διαχείριση των ασθενών με καρκίνο με λοίμωξη H1N1pdm.

Μέθοδοι

Δήλωση Ηθικής

Η επιτροπή δεοντολογίας ( Comité de Ética em Pesquisa? CEP? https://www.inca.gov.br/conteudo_view.asp?id=2380) στο Instituto Nacional de καρκίνου (INCA), το Ρίο ντε Τζανέιρο, στη Βραζιλία, με επικεφαλής τον Δρ Adriana Scheliga ενέκρινε τη μελέτη σύμφωνα με το πρωτόκολλο # 18/2010 και παραιτήθηκε από την ανάγκη για πληροφορημένη συναίνεση.

Σχεδιασμός και ρύθμιση

Αυτή ήταν μια προοπτική μελέτη κοόρτης διεξήχθη στο Νοσοκομείο κάνει τον καρκίνο-Ι, Instituto Nacional de καρκίνο (HC-Ι-INCA), το Ρίο ντε Τζανέιρο, στη Βραζιλία, από τις 8 Ιουλίου

ου έως την 1η Οκτωβρίου

ου 2009. το HCI-Inca είναι ένα 160-κρεβάτι ολοκληρωμένο κέντρο καρκίνου κυρίως για τον πληθυσμό του Ρίο de Janeiro και τα γειτονικά κράτη. Η παρούσα μελέτη ήταν αυστηρά παρατήρησης, και κάθε κλινική απόφαση ήταν κατά την κρίση του θεράποντος ιατρού.

Οι ασθενείς, τη συλλογή δεδομένων και τους ορισμούς

Όλοι οι ασθενείς με οριστική διάγνωση του καρκίνου που απαιτούν εισαγωγή στο νοσοκομείο για οποιοδήποτε λόγο και ο οποίος εμφανίζεται γριππώδης αξιολογήθηκαν. Οι ασθενείς με πλήρη ύφεση από καρκίνο για περισσότερο από πέντε χρόνια δεν θεωρήθηκαν.

Τα δεδομένα συλλέχθηκαν χρησιμοποιώντας μια τυποποιημένη μορφή περίπτωση έκθεσης που περιελάμβανε τα δημογραφικά στοιχεία, η κλινική παρουσίαση, συνοδά νοσήματα, την κατάσταση του καρκίνου, η χρήση ανοσοκατασταλτικών θεραπειών, φυσικά χρόνο της οξείας ασθένειας, ανάγκη για εντατική φροντίδα, τη χρήση των αντιιικών φαρμάκων, συμπληρωματικές θεραπείες, προηγμένη υποστήριξη ζωής και στη νοσοκομειακή θνητότητα (πληροφορίες που υποστηρίζουν? SI). Οι ασθενείς συμπεριλήφθηκαν αν είχε πυρετό (& gt? 37,8 ° C) και /ή αναπνευστική νόσο ομοιάζουσα με γρίπη και επιβεβαίωσε γρίπης Α H1N1pdm διάγνωση (με τουλάχιστον μία από τις τρεις δοκιμασίες, IFI, rRT-PCR ή κυτταρική καλλιέργεια, και σύμφωνα με ορισμοί των κρουσμάτων από τον ΠΟΥ [46]). Οι ασθενείς υποβλήθηκαν σε αγωγή σύμφωνα με τις κατευθυντήριες γραμμές της Βραζιλίας Δημόσιας Υγείας [47].

συλλογή και ανάλυση δειγμάτων

ρινοφαρυγγικής Dacron-μπατονέτα δείγματα συλλέχθηκαν από όλους τους ασθενείς και τοποθετούνται πάνω σε μεταφορικό μέσο (διάλυμα Hanks με 100 U /mL πενικιλλίνη και 100 μg /mL στρεπτομυκίνη) κατά την αρχική αξιολόγηση. Τραχείας αναρροφήσεις ελήφθησαν επίσης εάν ο ασθενής χρειάζεται διασωλήνωση της τραχείας. κλινικά δείγματα ασθενών είχαν άμεση ελέγχονται για μια ομάδα αναπνευστικών ιών χρησιμοποιώντας μια δοκιμασία IFI για τη γρίπη Α (πάνελ ιός του αναπνευστικού? Biotrin, Όρος Merrion, Co. Dublin, Ιρλανδία.). Τα δείγματα στάλθηκαν επίσης να Βραζιλίας Εθνικό Κέντρο Γρίπης του (ΔΟΕ /Fiocruz) για H1N1pdm επιβεβαίωση χρησιμοποιώντας rRT-PCR, η οποία έγινε σύμφωνα με τις ισχύουσες κατευθυντήριες γραμμές του ΠΟΥ /CDC [46]. Viral αποβολή αξιολογήθηκε στο υποσύνολο των ασθενών που παρέμειναν υπό μηχανικό αερισμό για περισσότερο από επτά ημέρες και σε εκείνους τους ασθενείς με επίμονη υποξαιμία και πνευμονική διήθηση. Αυτοί οι ασθενείς έλαβαν ένα συγκεκριμένο αριθμό στο οποίο προσαρτάται αριθμός δείγματος τους. Δηλαδή, το πρώτο δείγμα ήταν «S1», και την επακόλουθη δείγματα αριθμημένα διαδοχικά (Πίνακας S12). Viral έκκριση αξιολογήθηκε χρησιμοποιώντας τόσο κυτταρικής καλλιέργειας και προσδιορισμούς rRT-PCR έως ότου ήταν αρνητικό. Η απομόνωση του ιού πραγματοποιήθηκε σε κύτταρα Madin-Darby νεφρού σκύλου (MDCK) και /ή γονιμοποιημένα αυγά (βλέπε κείμενο S1 και Πίνακας S12). Η λειτουργική αντι-ιική δοκιμασία διεξήχθη χρησιμοποιώντας το κιτ NA-Star (Applied Biosystems, CA), σύμφωνα με τις οδηγίες του κατασκευαστή. Το πρωτόκολλο RT-PCR για προσδιορισμό της αλληλουχίας χρησιμοποιώντας την μέθοδο Sanger και Pyrosequencing [48] παρουσιάζονται στο SI, καθώς και η φυλογενετική ανάλυση.

Δείγματα αίματος ρουτίνας σταλεί για βακτηριακή καλλιέργεια, όπως ήταν τραχείας αναρροφήματα εάν η ασθενής διασωληνώθηκε.

η στατιστική ανάλυση

Πρότυπο περιγραφική στατιστική χρησιμοποιείται για να περιγράψει τον πληθυσμό της μελέτης. Μονοπαραγοντική ανάλυση χρησιμοποιήθηκε για να προσδιοριστούν οι παράγοντες που σχετίζονται με τη θνησιμότητα νοσοκομείο.