Αφηρημένο

Συντήρηση της ισορροπίας μεταξύ των βακτηρίων συμβιωτικών και το βλεννογόνο του ανοσοποιητικού σύστημα είναι ζωτικής σημασίας και εντερική dysbiosis μπορεί να είναι ένα γεγονός κλειδί στην παθογένεση του καρκίνου του παχέος εντέρου (CRC). Ο υποδοχέας ΤοΙΙ 4 (TLR4) είναι μια σημαντική υποδοχέα μοτίβο αναγνώρισης που ρυθμίζει τη φλεγμονή και φράγμα λειτουργία στο έντερο μέσω ενός μηχανισμού που περιλαμβάνει την ενεργοποίηση του μεταγραφικού παράγοντα πυρηνικού παράγοντα-κΒ (NF-κΒ). Διαιτητικά και η ζωή παράγοντες του τρόπου μπορεί να επηρεάσουν αυτές τις λειτουργίες. Ως εκ τούτου, χρησιμοποιείται μια δανική προοπτική μελέτη ασθενών-ομάδα των 1010 υποθέσεων CRC και 1829 τυχαία επιλεγμένους συμμετέχοντες από τη δανική Διατροφή, Καρκίνος και ομάδα Υγείας να διερευνήσει τρεις πολυμορφισμούς στο

NFKB1

και

TLR4

και τους πιθανές αλληλεπιδράσεις με τη διατροφή και παράγοντες του τρόπου ζωής σε σχέση με τον κίνδυνο της CRC. Ομόζυγο μεταφορά της παραλλαγής αλληλόμορφου του

TLR4

/rs5030728 πολυμορφισμού συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο CRC (αναλογία συχνότητα εμφάνισης (IRR) = 1,30? 95% διάστημα εμπιστοσύνης (CI): 1,05 – 1,60? P = 0,02 (μοντέλο γονίδιο-δόση)? IRR = 1,24? 95% CI: 1,01 – 1,51? P = 0.04 (υπολειπόμενο μοντέλο)). Del-φορείς του

NFKB1

/rs28362491 πολυμορφισμός είχε 17% (95% CI: 1,03 – 1,34? P = 0,02), αυξημένο κίνδυνο CRC σε σύγκριση με ομόζυγο φορείς της ins-αλληλόμορφο. Ωστόσο, καμία από αυτές τις εκτιμήσεις κινδύνου άντεξε προσαρμογή για πολλαπλές συγκρίσεις. Εμείς δεν βρήκε ισχυρή γονιδίων-περιβάλλοντος αλληλεπιδράσεις μεταξύ του εξεταζόμενου πολυμορφισμό και τη διατροφή και παράγοντες του τρόπου ζωής σε σχέση με CRC κίνδυνο

Παράθεση:. Kopp TI, Andersen V, Tjonneland Α, Vogel U (2015) πολυμορφισμοί στο

NFKB1

και

TLR4

και Αλληλεπίδραση με Διαιτητικά και παράγοντες του τρόπου ζωής σε σχέση με τον καρκίνο του παχέος εντέρου σε ένα δανικό Υποψήφιοι Case-Cohort Study. PLoS ONE 10 (2): e0116394. doi: 10.1371 /journal.pone.0116394

Ακαδημαϊκό Επιμέλεια: Jeffrey S. Chang, Εθνική Έρευνα Υγείας Ινστιτούτα, την Ταϊβάν

Ελήφθη: 21 Αυγ του 2014? Αποδεκτές: 9 Δεκ 2014? Δημοσιεύθηκε: 23 του Φλεβάρη του 2015

Copyright: © 2015 Kopp et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Δεδομένα Διαθεσιμότητα: Όλα τα σχετικά δεδομένα είναι εντός του Υποστηρίζοντας αρχεία πληροφοριών του χαρτιού και

Χρηματοδότηση:. το έργο υποστηρίζεται από ένα διδακτορικό μισθό από τη δανική έρευνα Συμβούλια των στο πλαίσιο του προγράμματος «μια ολοκληρωμένη προσέγγιση για την αξιολόγηση του κινδύνου-οφέλους των επιπτώσεων στην ανθρώπινη υγεία από τα τρόφιμα και προσμείξεις στα τρόφιμα »(Forskeruddannelse 2009-10), και από επιχορήγηση PhD κινητικότητας (09-06 7572) από το Συμβούλιο της Δανίας για ανεξάρτητη έρευνα (www.ufm.dk) και ως μέρος του έργου:« Βόειο έναντι κατανάλωση χοιρινού κρέατος στην αιτιολογία των καρκίνων του παχέος εντέρου και του ορθού: έρευνες που πραγματοποιήθηκαν στο πλαίσιο της διατροφής, του καρκίνου και την Υγεία ομάδα «και από το Συμβούλιο της Δανίας για ανεξάρτητη έρευνα? Ιατρικών Επιστημών (δεν χορηγούν. 09-073597) (www.ufm.dk). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:. Οι συγγραφείς έχουν διαβάσει την πολιτική του περιοδικού και έχουν τα ακόλουθα ανταγωνιστικά συμφέροντα: VA λαμβάνει αποζημίωση ως σύμβουλος για την Merck & amp? Co., Inc. (MSD) και Janssen. Αυτό δεν αλλάζει την τήρηση των συγγραφέων να PLoS ONE πολιτικές για την ανταλλαγή δεδομένων και υλικών.

Εισαγωγή

Καρκίνος του παχέος εντέρου (CRC) είναι το τρίτο πιο κοινός τύπος καρκίνου στους άνδρες και η δεύτερη στις γυναίκες σε όλο τον κόσμο [1]. Οι κληρονομικούς παράγοντες εκτιμάται ότι θα συνεισφέρουν μόνο το 35% του κινδύνου [2] τονίζοντας τη σημασία των περιβαλλοντικών παραγόντων στην αιτιολογία της CRC. Πράγματι, διατροφικές και παράγοντες του τρόπου ζωής έχουν εντατικά μελετηθεί για το ρόλο τους στην παχέος καρκινογένεση? και το αλκοόλ, το κάπνισμα, η παχυσαρκία και η υψηλή πρόσληψη κρέατος έχουν πλέον εγκατασταθεί σε παράγοντες κινδύνου για CRC [3-5]. Η πρόσληψη του κόκκινου και επεξεργασμένου κρέατος έχει τη δυνατότητα να επάγει καρκίνο με χημικά καρκινογόνα που σχηματίζονται κατά το μαγείρεμα του κρέατος σε υψηλές θερμοκρασίες [6], η παραγωγή τοξικών ενώσεων ζύμωσης [7-9] ή με την επαγωγή της φλεγμονής λόγω των αλλαγών στη βακτηριακή σύνθεση [10] . Αντιστρόφως, φυτικές ίνες, φρούτα και τα λαχανικά παρέχουν λιπαρά οξέα βραχείας αλύσου (SCFAs) προς το κολονικό επιθήλιο με ζύμωση δεν έχει απορροφηθεί διαιτητικών ινών και άμυλο [11-15]. Το βουτυρικό SCFA είναι σημαντικό για κολονική ακεραιότητα [14], αναστέλλει την ανάπτυξη των καρκινικών κυττάρων

in vitro

[16,17] και έχει αντι-φλεγμονώδεις ιδιότητες, κυρίως μέσω της αναστολής του πυρηνικού παράγοντα-κΒ (NF-κΒ) ενεργοποίηση [18].

ΤοΙΙ υποδοχέων (TLR) είναι σημαντικά υποδοχείς μοτίβο αναγνώρισης που ρυθμίζουν τη φλεγμονή και λειτουργία φραγμού στο έντερο διατηρώντας έτσι την ισορροπία μεταξύ των βακτηρίων συμβιούντα και του βλεννογόνου ανοσοποιητικού συστήματος [19,20] . Ο υποδοχέας για κατά Gram αρνητικά βακτήρια λιποπολυσακχαρίτη (LPS), TLR4, ρυθμίζει τον πολλαπλασιασμό των κυττάρων σε απόκριση σε κυτταρικό τραυματισμό μέσω επαγωγής της κυκλοοξυγενάσης 2 έκφραση [21] σε έναν καταρράκτη που περιλαμβάνει ενεργοποίηση του ΝΡ-κΒ και επιδερμικού αυξητικού παράγοντα [22] υποδηλώνοντας ότι TLR4 είναι ένα σημαντικό στοιχείο για τη μετάβαση από τη φλεγμονή σε νεοπλασία [19]. Πράγματι, η αυξημένη έκφραση του TLR4 έχει συνδεθεί με την ανάπτυξη της φλεγμονής που σχετίζεται με νεοπλασία [23-26]. Επιπλέον, έχουμε βρει προηγουμένως αποδείξεις ότι η φλεγμονή μπορεί να συνεισφέρει στη CRC καρκινογένεση. επίπεδα Έτσι, γενετικά καθορισμένες υψηλής IL-1β και COX-2 συνδέονται με αυξημένο κίνδυνο CRC [27].

Dysbiosis στο έντερο μπορεί να είναι ένα γεγονός κλειδί στην παθογένεση των δύο φλεγμονώδεις παθήσεις του εντέρου (IBD) και CRC. Χρησιμοποιώντας λειτουργική πολυμορφισμών μοναδικού νουκλεοτιδίου (SNPs) και την αλληλεπίδρασή τους με τη διατροφή και τον τρόπο ζωής μπορεί να αποκαλύψει σημαντικές πορείες για τον ορθοκολικό καρκινογένεση [28]. Δεδομένου ότι

TLR

πολυμορφισμοί έχουν συσχετιστεί με IBD [29], έχουμε ως στόχο να εξετάσει μια πιθανή αμοιβαία μηχανισμό για IBD και CRC.

Έχουμε δείξει στο παρελθόν ότι η μεταφορά της παραλλαγής del-αλληλόμορφο οι λειτουργικές ins /del

NFKB1

/rs28362491 πολυμορφισμός σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο CRC και αλληλεπιδρούν με την πρόσληψη κρέατος σε ένα υποσύνολο της τρέχουσας ομάδας μελέτης [30], σε συμφωνία με τα αποτελέσματα από δύο άλλες μελέτες αναφέρουν επίσης αυξημένο κίνδυνο της CRC μεταξύ των μεταφορέων παραλλαγή του πολυμορφισμού ανάμεσα σε μια Μαλαισίας [31] και μια σουηδική πληθυσμού [32], αλλά δεν είναι μια κινεζική ομάδα μελέτης [32]. Ένα λειτουργικό SNP σε

TLR4

(rs4986790) έχει μελετηθεί εκτενώς και έχει συσχετισθεί με νεοπλασματική εξέλιξη

in vitro

[33], επιθετικό καρκίνο ανθρώπινου κόλον [33], IBD [34-37 ] και CRC [38-40]. Ωστόσο, άλλοι δεν ήταν σε θέση να βρει μια σχέση μεταξύ CRC και το SNP [41-43]. Σε μια καναδική μελέτη [44], η πρόσληψη διαιτητικών κορεσμένων λιπαρών οξέων ήταν αντιστρόφως ανάλογη με το επίπεδο του αίματος της υψηλής πυκνότητας λιποπρωτεΐνης χοληστερόλης σε άτομα ομόζυγα για το

TLR4

/rs5030728 G-αλληλόμορφο.

TLR4

/rs5030728 μπορεί, επομένως, να αλληλεπιδράσουν με διατροφικών συστατικών στο έντερο.

Έτσι, αναμένεται ότι η φλεγμονή είναι ένας σημαντικός παράγοντας στην παχέος καρκινογένεσης και επομένως εξέτασε κατά πόσον παράγοντες διατροφή και τον τρόπο ζωής (μη στεροειδή αντι-φλεγμονώδη φάρμακα (ΜΣΑΦ) και το κάπνισμα) να τροποποιήσει CRC κίνδυνος μεταβάλλοντας την βλεννογονική ανοσοαπόκριση στο έντερο μέσω αλληλεπίδρασης με TLR4 και NF-κΒ. Ως εκ τούτου, αξιολογήθηκαν τρεις πολυμορφισμούς στο

NFKB1

και

TLR4

και πιθανή αλληλεπίδραση τους με τη διατροφή και παράγοντες του τρόπου ζωής σε μια προοπτική ομάδα των 1010 υποθέσεων CRC και 1829 τυχαία επιλεγμένους συμμετέχοντες από τη διατροφή της Δανίας, του καρκίνου και μελέτη Υγείας.

Υλικό και Μέθοδοι

Σπούδασε θέματα

Η μελέτη διατροφή, τον καρκίνο και την υγεία είναι μια συνεχής μελέτη της Δανίας ομάδα σχεδιάστηκε για να διερευνήσει τη σχέση μεταξύ της διατροφής, του τρόπου ζωής και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου [45]. Η ομάδα αποτελείται από 57.053 άτομα, που προσλαμβάνονται μεταξύ Δεκεμβρίου 1993 και Μαΐου 1997. Όλα τα θέματα που γεννήθηκαν στη Δανία, και τα άτομα που ήταν 50-64 ετών και δεν είχε προηγούμενο καρκίνων κατά την έναρξη της μελέτης. δείγματα αίματος και τα δεδομένα ερωτηματολόγιο σχετικά με τη διατροφή και τον τρόπο ζωής συλλέχθηκαν κατά την έναρξη της μελέτης.

Συνέχεια και τα τελικά σημεία

Συνέχεια βασίστηκε σε πληθυσμό με βάση τα μητρώα του καρκίνου. Μεταξύ του 1994 και 31 του Δεκεμβρίου 2009, 1010 υποθέσεις CRC διαγνώστηκαν. Μια υπο-ομάδα των 1829 προσώπων που επιλέγονται τυχαία μέσα στην ομάδα. 28 άτομα ήταν δύο περιπτώσεις και υπο-ομάδα λόγω του μεταχειρισμένου σχεδιασμό της μελέτης [46]. 245 με τα δεδομένα που λείπουν γονότυπο και 16 με τα ελλείποντα στοιχεία σχετικά με τους παράγοντες κινδύνου εξαιρέθηκαν. Όλες οι πληροφορίες σχετικά με γονότυπους και τη διατροφή και παράγοντες του τρόπου ζωής ήταν διαθέσιμες για 915 περιπτώσεις CRC και 1719 μέλη του υπο-ομάδα.

Διαιτητικά και τον τρόπο ζωής ερωτηματολόγιο

Πληροφορίες σχετικά με τη διατροφή, τον τρόπο ζωής, το βάρος, το ύψος, την ιατρική περίθαλψη , περιβαλλοντική έκθεση, και άλλους κοινωνικοοικονομικούς παράγοντες που συλλέχθηκαν κατά την ένταξη με τη χρήση ερωτηματολογίων και συνεντεύξεων και έχει περιγραφεί λεπτομερώς αλλού [27,47-49]. Εν ολίγοις, το ερωτηματολόγιο συχνότητας κατανάλωσης τροφίμων, η κατανάλωση διατροφή αξιολογήθηκε σε 12 κατηγορίες προκαθορισμένες απαντήσεις, κατάταξη από το «ποτέ» σε «οκτώ ή περισσότερες φορές την ημέρα». Η ημερήσια πρόσληψη υπολογίστηκε στη συνέχεια με FoodCalc [45]. το κάπνισμα ταξινομήθηκε ως ποτέ, παρελθόν ή την τρέχουσα. Άτομα κάπνισμα τουλάχιστον 1 τσιγάρο καθημερινά κατά τη διάρκεια του τελευταίου έτους ταξινομήθηκαν ως καπνιστές. χρήση ΜΣΑΦ ( «Ασπιρίνη», «Η παρακεταμόλη», «ιβουπροφαίνη», ή «Άλλα αναλγητικά) αξιολογήθηκε ως ≥ 2 χάπια το μήνα στη διάρκεια ενός έτους κατά την έναρξη.

Γονοτυπικές

Buffy παλτό παρασκευάσματα αποθηκεύτηκαν στους μείον 150 ° C μέχρι τη χρήση. DNA εκχυλίστηκε όπως περιγράφεται [50]. Το DNA ήταν ο γονότυπος από LGC KBioscience (LGC KBioscience, Hoddesdon, Ηνωμένο Βασίλειο) με PCR βασίζεται σε δοκιμασία KASP του γονότυπου (Error! Αναφορά υπερ-σύνδεσης δεν είναι έγκυρη. Www.lgcgenomics.com/).

NFKB1

/rs28362491 αναλύθηκε και αναφέρθηκε για ένα υποσύνολο της τρέχουσας ομάδας μελέτης [30]. Δύο από τους πολυμορφισμούς (

NFKB1

/rs28362491 και

TLR4

/rs4986790) επιλέχθηκαν με βάση την γνωστή λειτουργικότητα και την ένωσή τους με το CRC [30-33] και IBD [34-37] από ένα αναζήτηση βιβλιογραφίας. Η

TLR4

/rs5030728 πολυμορφισμού, από την άλλη πλευρά, δεν έχει καμία γνωστή λειτουργία. Ωστόσο,

TLR4

/rs4986790 είναι στενά συνδεδεμένη με το

TLR4

/rs5030728 (Δ ‘: 1,0? R

2: 0.017) χρησιμοποιώντας Haploview έκδοση 4.2 (Ινστιτούτο Broad του MIT και του Χάρβαρντ, Cambridge) [51] με HapMap3 Γονιδιώματος απελευθέρωση Browser # 2 (Φάση 3) [52]? και δεδομένου ότι

TLR4

/rs5030728 έχει υψηλότερη συχνότητα ελάσσονα αλληλόμορφο σε Καυκάσιους από

TLR4

/rs4986790 (0.305 έναντι 0.035), αυτός ο πολυμορφισμός είναι πιο κατάλληλο για τις αναλύσεις αλληλεπίδραση γονιδίου-περιβάλλοντος. Για να επιβεβαιώσετε επαναληψιμότητα, την γονοτυπική επαναλήφθηκε για το 10% των δειγμάτων που αποδίδει 100% ταυτότητα.

Η στατιστική ανάλυση

Απόκλιση από την ισορροπία Hardy-Weinberg αξιολογήθηκε χρησιμοποιώντας ένα Chi-square test.

αναλογίες ποσοστό επίπτωσης (IRR) και 95% Διάστημα εμπιστοσύνης (CI) υπολογίστηκαν σύμφωνα με τις αρχές για την ανάλυση των μελετών περιπτώσεων, κοόρτης χρησιμοποιώντας μια un-σταθμισμένη προσέγγιση [46]. Ηλικία χρησιμοποιήθηκε ως ο χρόνος κλίμακα στα μοντέλα παλινδρόμησης Cox. Έλεγχοι υποθέσεων και διαστήματα εμπιστοσύνης βασίστηκαν σε δοκιμές Wald, χρησιμοποιώντας την ανθεκτική εκτίμηση του πίνακα διακύμανσης-συνδιακύμανσης των παραμέτρων παλινδρόμησης στα μοντέλα παλινδρόμησης κατά Cox [53] όπως περιγράφηκε προηγουμένως [27,46,48,54-61].

Όλα τα μοντέλα προσαρμόστηκαν για αρχικές τιμές των παραγόντων κινδύνου για καρκίνο του παχέος εντέρου, όπως ο δείκτης μάζας σώματος (ΔΜΣ) (kg /m

2, η συνεχής), η χρήση της θεραπείας ορμονικής υποκατάστασης (HRT) (ποτέ /το παρελθόν /ρεύμα, μεταξύ των γυναικών), πρόσληψη διαιτητικών ινών (g /ημέρα, συνεχής), και το κόκκινο κρέας και τα επεξεργασμένα κρέατα (g /ημέρα, συνεχής) και εκτός από την υποψία παράγοντες κινδύνου, όπως η χρήση των ΜΣΑΦ (ναι /όχι) και το κάπνισμα (ποτέ /το παρελθόν /ρεύμα). Δημητριακά, φυτικές ίνες, φρούτα και λαχανικά επίσης εισαχθεί γραμμικά. Όλες οι αναλύσεις στρωματοποιήθηκαν ανάλογα με το φύλο, έτσι ώστε οι βασικές (υποκείμενα) κίνδυνοι ήταν φύλο. Για όλους τους πολυμορφισμούς, IRR υπολογίστηκε ξεχωριστά για ομόζυγα και ετερόζυγα φορείς παραλλαγή αλληλόμορφου. Για

TLR4

/rs4986790 και

NFKB1

/rs28362491, φορείς παραλλαγή αλληλόμορφου στη συνέχεια ομαδοποιούνται για την αλληλεπίδραση αναλύσεις αφού δεν παρατηρήθηκαν υπολειπόμενο αποτελέσματα.

TLR4 /

rs5030728 είχε συναχθεί τόσο σε ένα γονίδιο-δόση και ένα υπολειπόμενο κατάσταση στις επόμενες αναλύσεις.

Επιπλέον, αξιολογήσαμε εβδομαδιαία χρήση ΜΣΑΦ με βάση τα αποτελέσματα μιας μελέτης του καρκίνου του παχέος εντέρου στο πλαίσιο της διατροφής, του καρκίνου και την Υγεία ομάδα [62] αναφέρουν ότι η μακροπρόθεσμη συνεπής χρήση της ασπιρίνης ή μη ασπιρίνη ΜΣΑΦ φαίνεται αναγκαία για να επιτευχθεί μια προστατευτική επίδραση. Ωστόσο, δεν υπήρχαν διαφορές στις εκτιμήσεις κινδύνου μεταξύ μηνιαία ή εβδομαδιαία χρήση, κατά συνέπεια, να διατηρηθεί η στατιστική ισχύ στην στρώματα? χρησιμοποιήσαμε μηνιαία χρήση ΜΣΑΦ στις αναλύσεις.

Η δοκιμή αναλογία πιθανότητας χρησιμοποιήθηκε για την αλληλεπίδραση μεταξύ των αναλύσεων που μελετήθηκαν πολυμορφισμών και την πρόσληψη του κόκκινου και επεξεργασμένου κρέατος, φυτικές ίνες, δημητριακά, ψάρια, φρούτα, λαχανικά, η κατανάλωση αλκοόλ, το κάπνισμα και τη χρήση ΜΣΑΦ. Σε αλληλεπίδραση αναλύσεις, όπου οι διαιτητικοί παράγοντες είχαν εγγραφεί ως κατηγορικές μεταβλητές, σημεία αποκοπής τριτημόριο έγιναν με βάση την εμπειρική κατανομή μεταξύ των αρσενικών και θηλυκών περιπτώσεις, αντίστοιχα. Οι πιθανές αλληλεπιδράσεις μελετήθηκαν χρησιμοποιώντας το τεστ λόγου πιθανοφάνειας.

Όλες οι αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση SAS έκδοση 9.3 (SAS Institute Inc., Cary, NC). Ένα p & lt? 0,05 θεωρήθηκε σημαντική. Επιπλέον, για να ελέγξετε για πολλαπλές συγκρίσεις, χρησιμοποιήθηκε η διόρθωση Bonferroni.

Ηθική δήλωση

Όλοι οι συμμετέχοντες έδωσαν προφορικές και γραπτές συγκατάθεση. Η μελέτη διατροφή, τον καρκίνο και την υγεία εγκρίθηκε από την Εθνική Επιτροπή για την Υγεία Έρευνας Ηθικής (nr περιοδικό. (KF) 01-345 /93) και η Υπηρεσία Προστασίας Δεδομένων της Δανίας.

Αποτελέσματα

τα βασικά χαρακτηριστικά του πληθυσμού της μελέτης παρουσιάζονται στον πίνακα 1. μεταξύ των μελών υπο-ομάδα, η κατανομή γονότυπο του SNPs δεν αποκλίνουν από την ισορροπία Hardy-Weinberg (τα αποτελέσματα δεν φαίνονται).

η

Σύλλογοι μεταξύ πολυμορφισμών και CRC

Ομόζυγος φορείς παραλλαγή του

TLR4

/rs5030728 πολυμορφισμού ήταν στο 1,30 φορές (95% CI: 1.05-1.60) αυξημένο κίνδυνο CRC σε ένα μοντέλο γονίδιο-δόση και σε 1,24 φορές σε (95% CI: 1,01 – 1,51) αύξηση του κινδύνου CRC σε σύγκριση με άγριου τύπου και ετερόζυγοι φορείς σε ένα υπολειπόμενο μοντέλο (Πίνακας 2). Επιπλέον, φορείς του

NFKB1

del-αλληλόμορφο είχαν 17% (95% CI: 1,03 – 1,34) αυξημένο κίνδυνο CRC σε σύγκριση με ομόζυγο φορείς της ins-αλληλόμορφο (Πίνακας 2). Αυτές οι εκτιμήσεις κινδύνου δεν, όμως, φτάσει στατιστικά σημαντική μετά από διόρθωση Bonferroni. Δεν υπήρξε καμία αλληλεπίδραση μεταξύ των δύο γονότυπων κινδύνου

TLR4

/rs5030728 και

NFKB1

/rs28362491 αλλά από την άλλη μεριά, δεν υπήρχε προσθετικό αποτέλεσμα του να είναι ομόζυγο μεταφορέα δύο αλληλόμορφα παραλλαγής (Πίνακας S1 ).

Η

γονιδίων-περιβάλλοντος αναλύσεις

Εμείς δεν βρήκε καμία αλληλεπίδραση μεταξύ οποιονδήποτε από τους διατροφικούς παράγοντες και σπούδασε πολυμορφισμούς σε σχέση με τον κίνδυνο του CRC στις γραμμικές αναλύσεις (S2 Πίνακας). Σε αναλύσεις τριτημόριο, υπήρχε ασθενής αλληλεπίδραση μεταξύ

TLR4

/rs5030728 και την πρόσληψη των λαχανικών (μοντέλο Gene-δόση: P-τιμή για την αλληλεπίδραση (P

int) = 0,05? Υφεσιακές μοντέλο: P

int = 0,03) (Πίνακας 3). Επιπλέον, ένα οριακά στατιστικά σημαντική αλληλεπίδραση μεταξύ της πρόσληψης κρέατος και το

NFKB1

/rs28362491 πολυμορφισμός (P

int = 0,06) βρέθηκε (Πίνακας 3). Για ins-φορείς, οι εκτιμήσεις κινδύνου ήταν συγκρίσιμες σε όλη τεταρτημόρια πρόσληψης κρέατος. Αντίθετα, μεταξύ των Del-φορείς, η πρόσληψη κρέατος στο δεύτερο (IRR = 1,46? 95% CI: 1,17 – 1,83) και το τρίτο τριτημόριο (IRR = 1,24? 95% CI: 0,99 – 1,56) συσχετίστηκε με κίνδυνο CRC, ενώ del-αλληλόμορφο μεταφορείς δεν ήταν σε κίνδυνο στο πρώτο τριτημόριο με χαμηλή πρόσληψη κρέατος (IRR = 0,98? 95% CI: 0,78 – 1,23). Όσον αφορά το αλκοόλ, φορείς παραλλαγή του

NFKB1

/rs28362491 και ομόζυγο A-αλληλόμορφο φορείς του

TLR4

/rs5030728 συνδέθηκαν με CRC κινδύνου σε σύγκριση με τις ομόζυγο φορείς άγριου τύπου μεταξύ των συμμετεχόντων με χαμηλό πρόσληψη αλκοόλ. Επιπλέον, για τους μεταφορείς παραλλαγή των τριών πολυμορφισμών, χαμηλή πρόσληψη (πρώτο τριτημόριο) του αλκοόλ συσχετίστηκε με την υψηλότερη CRC κινδύνου σε σύγκριση με μέτρια (δεύτερο τριτημόριο) εισαγωγής-το οποίο συνδέεται με το χαμηλότερο κίνδυνο και υψηλή κατανάλωση αλκοόλ (τρίτο τριτημόριο ) (Πίνακας 3).

Η

δεν υπήρχε αλληλεπίδραση μεταξύ της χρήσης ΜΣΑΦ ή το κάπνισμα και τις μελέτησε γονότυπους (S3 και S4 πίνακες). Μεταξύ των μη καπνιστών (Πίνακας S4), ωστόσο, η

TLR4

/rs5030728 πολυμορφισμός αποδειχθεί γονίδιο δόσης αποτέλεσμα το οποίο είναι συγκρίσιμο με τα αποτελέσματα που παρατηρήθηκαν μεταξύ των συμμετεχόντων με χαμηλή πρόσληψη αλκοόλ (Πίνακας 3). Σε ένα μοντέλο όπου ο κίνδυνος της CRC είχε συναχθεί ανά 25 g πρόσληψη κρέατος ανά ημέρα υποδιαιρείται με τη χρήση ΜΣΑΦ, ο κίνδυνος της CRC από κατανάλωση κρέατος αυξήθηκε κατά δοσοεξαρτώμενο τρόπο μεταξύ παραλλαγή φορείς αλληλόμορφου του

TLR4

/rs5030728 απουσία χρήση NSAID, αλλά όχι μεταξύ των NSAID χρήστες (S5 πίνακα). Έτσι, η πρόσληψη κρέατος δεν συσχετίστηκε με κίνδυνο μεταξύ ομόζυγο φορείς του αλληλόμορφου άγριου τύπου, ενώ η πρόσληψη κρέατος συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο κατά 4% ανά 25 g κρέατος /ημέρα (95% CI: 1,00-1,09) μεταξύ ετεροζυγώτες και 11% αύξηση κινδύνου μεταξύ των φορέων αλληλόμορφο ομόζυγη παραλλαγή (95% CI: 01.02 – 01.22). Ωστόσο, δεν υπήρχαν στατιστικά σημαντικές αλληλεπιδράσεις (S5 Πίνακας).

Συζήτηση

Στην παρούσα μελέτη, διαπιστώσαμε ότι ομόζυγη παραλλαγή μεταφορά

TLR4

/rs5030728 και παραλλαγή μεταφορά του

NFKB1

/rs28362491 πολυμορφισμός συσχετίστηκαν με αυξημένο κίνδυνο CRC, αλλά όχι μετά από διόρθωση για πολλαπλές δοκιμές. Βρήκαμε μόνο ασθενείς αλληλεπιδράσεις με μερικούς διατροφικούς παράγοντες και, ως εκ τούτου, δεν ήμασταν σε θέση να αναπαράγουν το παρελθόν διαπιστώθηκε αλληλεπίδραση μεταξύ του

NFKB1

/rs28362491 πολυμορφισμό και το κρέας πρόσληψη. Η έλλειψη σύνδεσης μεταξύ των

TLR4

/rs4986790 και CRC που βρέθηκαν στην παρούσα μελέτη θα μπορούσε ενδεχομένως να οφείλεται στην πολύ χαμηλή συχνότητα παραλλαγή αλληλόμορφου στον δανικό πληθυσμό. Μόνο ένα άτομο ήταν ομόζυγο φορέα αλληλόμορφο παραλλαγής. Συνεπώς, δεν μπορούμε να αποκλείσουμε ότι το λειτουργικό αποτέλεσμα αυτού του SNP επηρεάζει παχέος καρκινογένεση.

Το

NFKB1

/rs28362491 πολυμορφισμός έχει μάλλον σταθερά συσχετιστεί με CRC κίνδυνο [30-32], και σε κάποιο βαθμό επίσης IBD [29,63,64]. Όπως περιγράφηκε προηγουμένως [65,66],

NFKB1

κωδικοποιεί τις υπομονάδες ρ50 /ρ105 του παράγοντα μεταγραφής ΝΡ-κΒ. ΝΡ-κΒ αποτελείται από ομο- ή ετεροδιμερών έναν αριθμό διαφορετικών υπομονάδων ρ65, ρ50, ρ105, C-rel και relB [67,68] και ο συνδυασμός καθορίζει ειδικότητα γονιδίου στόχου. Ως ετεροδιμερές p65 /p50, το συγκρότημα έχει προ-φλεγμονώδη [68], ενώ το ομοδιμερές P50 έχει αντι-φλεγμονώδεις ιδιότητες [65,67,69,70]. Κατά συνέπεια, η σχετική αφθονία του ρ50 /ρ65 ετεροδιμερή και ομοδιμερή ρ50 θα καθορίσει το μέγεθος της φλεγμονής με την εξισορρόπηση του προ-φλεγμονώδη και αντι-φλεγμονώδη απόκριση [67]. Η

NFKB1

/rs28362491 πολυμορφισμός δημιουργεί μια διαγραφή τεσσάρων νουκλεοτιδίων στην περιοχή προαγωγέα προκαλεί μειωμένα επίπεδα μεταγραφής και συνεπώς μερική εξάντληση του ρ50 [63]. Σε συμφωνία με αυτό, βρέθηκε ότι τα επίπεδα του mRNA της

NFKB1

ήταν χαμηλότερες σε βιοψίες του κόλου του υγιούς ιστού από ομόζυγο del-φορείς σε σχέση με ετεροζυγώτες [71]. Αυτό θέτει σε μειονεκτική θέση την αντι-φλεγμονώδη απόκριση από το σχηματισμό του προ-φλεγμονωδών ρ65 /ρ50 ετεροδιμερές εξαρτάται από τη συγκέντρωση του ρ50, ενώ το σχηματισμό του αντι-φλεγμονώδη ρ50 ομοδιμερές εξαρτάται από τη συγκέντρωση του ρ50 τετράγωνο [65].

Το

TLR4

/rs5030728 πολυμορφισμός δεν έχει ακόμη συνδεθεί με CRC [20] και η λειτουργία του είναι άγνωστη [72].

TLR4

/rs4986790, η οποία έχει συνδεθεί με IBD και CRC, είναι στενά συνδεδεμένη με το

TLR4

/rs5030728. Επομένως, δεν είναι σαφές ποια από τις δύο πολυμορφισμούς είναι η βιολογικά σχετική. Ωστόσο, τα αποτελέσματά μας δείχνουν ότι η μεταφορά των

TLR4

/rs4986790 δεν σχετίστηκε με τον κίνδυνο της CRC, ενώ μεταφορά του

TLR4

/rs5030728 συσχετίστηκε με τον κίνδυνο. Αυτό υποδηλώνει ότι ο κίνδυνος που παρέχονται από

TLR4

/rs5030728 μεταφορά δεν προκλήθηκε από την σύνδεση με το

TLR4

/rs4986790. Είναι ενδιαφέρον, παραλλαγή μεταφορά του

TLR4

/rs5030728 A-αλληλόμορφο έχει συσχετιστεί με ωφέλιμα ανταπόκριση στη θεραπεία με αντι-ΤΝΡ μεταξύ των ασθενών με ΙΒϋ [73], υποδηλώνοντας ότι αυτοί οι ασθενείς μπορεί να έχουν υψηλότερη αρχική δραστικότητα ή την έκφραση της TLR4.

οι δύο

TLR4

SNP είναι παρούσα σε πολλές συνήθως χρησιμοποιούνται συστοιχίες GWAS (https://www.broadinstitute.org/mpg/snap/ldsearch.php), ενώ η ins /del

NFKB1

/rs28362491 πολυμορφισμός δεν παρακολουθείται σύνδεση στο GWAS [65]. Κανένα από τα δύο TLR4 SNPs συνδέθηκαν με CRC σε GWAS. Ωστόσο, κύριος στόχος μας ήταν να ψάξετε αλληλεπιδράσεων γονιδίων-περιβάλλοντος, παρά την αναγνώριση τόπων με ισχυρές ενώσεις για την CRC. Αλληλεπιδράσεων γονιδίων-περιβάλλοντος σπάνια αξιολογούνται GWAS.

Εμείς δεν βρέθηκε καμία ισχυρές ενδείξεις αλληλεπιδράσεων γονιδίων-περιβάλλοντος. Για τους μεταφορείς παραλλαγή του

NFKB1

/rs28362491 και ομόζυγο A-αλληλόμορφο φορείς του

TLR4

/rs5030728, ο κίνδυνος της CRC μεταξύ χαμηλής καταναλωτές κρέατος ήταν χαμηλότερη σε σύγκριση με τις μεσαίες και υψηλές κρέας τους καταναλωτές, οι οποίοι είχαν κινδύνου εκτιμήσεις μεταξύ 1.24 και 1.70 που δείχνει έναν ισχυρότερο ρόλο του κρέατος σε παχέος καρκινογένεση μεταξύ των ατόμων με γενετικά καθορισμένες υψηλή φλεγμονώδη απόκριση. Εναλλακτικά, covaries πρόσληψη κρέατος με άλλους παράγοντες του τρόπου ζωής που

per se

επάγουν μία φλεγμονώδη απόκριση ότι δεν ήταν σε θέση να προσαρμοστεί για.

Η διαπίστωσε αλληλεπίδραση με λαχανικά και

TLR4

/rs5030728 στην παρούσα μελέτη δεν είναι άμεσα ερμηνεύσιμο και θα μπορούσε να οφείλεται σε μικρές ομάδες στα τριτημόρια. Ωστόσο, τα λαχανικά φάνηκε να αυξάνουν ελαφρώς τον κίνδυνο CRC στην παρούσα μελέτη, η οποία θα πρέπει να αντιμετωπιστούν σε άλλες προοπτικές μελέτες.

Είχαμε περιορισμένη στατιστική ισχύ για την ανίχνευση αλληλεπιδράσεων γονιδίων-περιβάλλοντος. Ωστόσο, ο μελλοντικός σχεδιασμός της μελέτης χρησιμοποιήθηκαν στη μελέτη αυτή είναι κατάλληλη για την αλληλεπίδραση γονιδίων-περιβάλλοντος αναλύσεις λόγω της συλλογής των διατροφικών συνηθειών και του τρόπου ζωής τους παράγοντες πριν από τη διάγνωση, την εξάλειψη του κινδύνου της προκατάληψης ανάκληση. Η αλλαγή στις διατροφικές και τη ζωή συνήθειες του τρόπου κατά τη διάρκεια της παρακολούθησης είναι, όμως, δυνατό, αλλά δεν αναμένεται να οδηγήσει σε απόκλιση εσφαλμένης ταξινόμησης μεταξύ των περιπτώσεων και της ομάδας σύγκρισης. Επιπλέον, η παρούσα ομάδα μελέτης είναι ομοιογενής αποτελείται από Δανούς και δύο από τα μελετήθηκαν οι πολυμορφισμοί έχουν υψηλή αλληλόμορφο συχνότητες. Χρησιμοποιώντας την παρούσα ομάδα μελέτης, έχουμε βρεθεί στο παρελθόν γονιδίων-περιβάλλοντος αλληλεπιδράσεις μεταξύ διατροφής και

IL10

rs3024505 (P

int? Κρέας = 0,04, ψάρι = 0,007, ίνα = 0,0008, τα λαχανικά = 0.0005),

IL1B

C-3737T (P

int? ΜΣΑΦ χρήση = 0,040),

PTGS2

G-765c (P

int? κρέας = 0,006, ίνα = 0,0003, τα φρούτα 0,004) και

PTGS2

T8473C (P

int? φρούτα = 0.03) και

PTGS2

Α-1195G (P

int? ινών 0.020 και το κάπνισμα = 0,046) [27] . Έχουμε προσαρμοστεί οι εκτιμήσεις κινδύνου για ύποπτους παράγοντες κινδύνου και να επιλέγονται προσεκτικά τα πολυμορφισμούς με βάση τη λειτουργία ή /και στο παρελθόν ευρήματα σχετικά με τη σύνδεση με διατροφικούς παράγοντες, CRC ή IBD. Ωστόσο, καμία από τις αναλύσεις που άντεξε την προσαρμογή για πολλαπλές δοκιμές. Έτσι, δεν μπορούμε να αποκλείσουμε ότι τα ευρήματά μας οφείλονται στην τύχη και δεν πρέπει να θεωρηθούν ως σημαντικές συσχετίσεις.

Εν κατακλείδι, η μελέτη αυτή δεν ήταν σε θέση να αποδείξει τις ενώσεις μεταξύ των μελετηθεί πολυμορφισμών στα γονίδια φλεγμονής μεσολαβητή

NFKB1

και

TLR4

καθώς κανένας από τους βρέθηκαν ενώσεων άντεξε προσαρμογή για πολλαπλές συγκρίσεις. Εμείς δεν βρήκε ισχυρές αλληλεπιδράσεις γονιδίων-περιβάλλοντος μεταξύ των εξεταζόμενων πολυμορφισμούς και τη διατροφή και παράγοντες του τρόπου ζωής σε σχέση με CRC κίνδυνο.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Πίνακα S1. IRR για CRC σε σχέση με συνδυασμούς

NFKB1

/rs2836249 και

γονότυπους TLR4

/rs5030728

doi:. 10.1371 /journal.pone.0116394.s001

(DOCX)

S2 πίνακα. Αλληλεπίδραση μεταξύ διατροφικών παραγόντων και των μελετηθεί πολυμορφισμούς σε σχέση με CRC κίνδυνο

doi:. 10.1371 /journal.pone.0116394.s002

(DOCX)

S3 πίνακα. Η αλληλεπίδραση μεταξύ της χρήσης ΜΣΑΦ και σπούδασε πολυμορφισμούς σε σχέση με CRC κίνδυνο

doi:. 10.1371 /journal.pone.0116394.s003

(DOCX)

S4 πίνακα. Αλληλεπίδραση μεταξύ του καπνίσματος και της υπό μελέτη πολυμορφισμούς σε σχέση με τον κίνδυνο του CRC

doi:. 10.1371 /journal.pone.0116394.s004

(DOCX)

S5 πίνακα. Η αλληλεπίδραση μεταξύ της χρήσης ΜΣΑΦ και τα μελέτησαν τους πολυμορφισμούς ανά 25 γραμμάρια κόκκινο και επεξεργασμένα κρέατα πρόσληψη ανά ημέρα σε σχέση με CRC κίνδυνο

doi:. 10.1371 /journal.pone.0116394.s005

(DOCX)

Ευχαριστίες

Σας ευχαριστούμε Nick Martinussen και Katja Boll για τεχνική βοήθεια με δεδομένα τη διαχείριση? και η Jane Christensen για στατιστικούς συμβούλων. Το έργο υποστηρίζεται από ένα διδακτορικό μισθό από τις δανικές συμβούλια έρευνας στο πλαίσιο του προγράμματος «Μια ολοκληρωμένη προσέγγιση για την αξιολόγηση του κινδύνου-οφέλους των επιπτώσεων στην ανθρώπινη υγεία από τις προσμείξεις των τροφίμων και τα τρόφιμα» (Forskeruddannelse 2009-10), και από επιχορήγηση PhD Κινητικότητα (09 -06 7572) από το Συμβούλιο της Δανίας για ανεξάρτητη έρευνα (www.ufm.dk) και ως μέρος του έργου: «Βόειο έναντι κατανάλωση χοιρινού κρέατος στην αιτιολογία των καρκίνων του παχέος εντέρου και του ορθού: έρευνες που πραγματοποιήθηκαν στο πλαίσιο της διατροφής, του καρκίνου και την Υγεία κλάση «και από το Συμβούλιο της Δανίας για ανεξάρτητη έρευνα? Ιατρικών Επιστημών (δεν χορηγούν. 09-073597) (www.ufm.dk). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου.