PLoS One: Δυναμική Δίκτυο Μεταγραφή και Pathway Παρεμβολή να αποκαλύψουν μοριακός μηχανισμός της MGD-επεξεργασμένο ανθρώπινα κύτταρα καρκίνου του πνεύμονα


Αφηρημένο

Η πρόσφατη έρευνα έχει αποκαλύψει διάφορες μοριακών δεικτών στον καρκίνο του πνεύμονα. Ωστόσο, οι οργανωτικές αρχές που διέπουν τη γενετική ρυθμιστικών δικτύων τους εξακολουθούν να περιμένουν έρευνα. Εδώ πραγματοποιήσαμε Analysis Network Component (ΕΑΑ) και Pathway Analysis Παρεμβολή (PCA) για να κατασκευάσει ένα ρυθμιστικό δίκτυο σε ανθρώπινο καρκίνο του πνεύμονα (Α549) κύτταρα τα οποία υποβλήθηκαν σε αγωγή με 50 υΜ motexafin γαδολίνιο (MGD), ένα μεταλλικό κατιόν που περιέχει χημειοθεραπευτικό φάρμακο για 4 , 12, και 24 ώρες. Έχουμε εντοπίσει ένα σύνολο βασικών TFs, γνωστά γονίδια-στόχους για αυτά τα TFs, και τα μονοπάτια σηματοδότησης που εμπλέκονται στο δίκτυο ρύθμισης. Η εργασία μας έδειξε ότι το υποτιθέμενο αλληλεπιδράσεις μεταξύ αυτών των TFs (όπως ESR1 /Sp1, E2F1 /Sp1, c-myc-ΕΣΡ, Smad3 /c-myc, και NFKB1 /RELA), μεταξύ TFs και γονιδίων-στόχων τους (όπως BMP41 /EST1 , TSC2 /Myc, APE1 /Sp1 /p53, RARA /HOXA1, και SP1 /USF2), και μεταξύ των οδών (όπως PPAR οδού σηματοδότησης και Αδιποκυτοκίνες μονοπάτι σηματοδότησης σηματοδότησης). Τα αποτελέσματα αυτά θα προσφέρουν πληροφορίες για την ρυθμιστικό μηχανισμό της MGD που έλαβαν τα ανθρώπινα καρκινικά κύτταρα του πνεύμονα

Παράθεση:. Shao L, Wang L, Wei Ζ, Xiong Υ, Wang Υ, Tang K, et al. (2012) Δυναμική Δικτύου Μεταγραφή και Pathway Παρεμβολή να αποκαλύψουν μοριακός μηχανισμός της MGD-επεξεργασμένο ανθρώπινα κύτταρα καρκίνου του πνεύμονα. PLoS ONE 7 (5): e31984. doi: 10.1371 /journal.pone.0031984

Επιμέλεια: Yidong Bai, του Πανεπιστημίου του Τέξας Επιστήμη Κέντρο Υγείας στο San Antonio, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 18 του Σεπτεμβρίου 2011? Αποδεκτές: 16 Γενάρη του 2012? Δημοσιεύθηκε: 31 Μαϊ, 2012

You must be logged into post a comment.