Αφηρημένο

Ιστορικό

Τα αγγειακά ενδοθηλιακά κύτταρα συμβάλλουν στην παθογένεση πολλών ανθρώπινων ασθενειών ρυθμίζοντας ενεργά την στρωματική φλεγμονώδη αντίδραση? Ωστόσο, λίγα είναι γνωστά σχετικά με το ρόλο των ενδοθηλιακών φλεγμονής στην ανάπτυξη των ανθρώπινων όγκων και την επιρροή της για την πρόγνωση καρκίνων επί ανθρώπων.

Μέθοδοι

Χρησιμοποιώντας ένα πειραματικό μοντέλο παράγοντα νέκρωσης όγκου-άλφα (TNF-α) μεσολάβηση φλεγμονής, χαρακτηρίσαμε φλεγμονώδη έκφραση γονιδίων σε ανοσοκαθαρισμένου που σχετίζονται με όγκους τα ενδοθηλιακά κύτταρα. Αυτά τα γονίδια αποτέλεσαν τη βάση της πολυμεταβλητής μοριακής προγνωστικός της συνολικής επιβίωσης που είχε εκπαιδευτεί και να επικυρωθούν σε τέσσερις τύπους καρκίνου στον άνθρωπο.

Αποτελέσματα

Σας αναφέρουμε ότι η έκφραση της πειραματικά προέρχονται όγκου των ενδοθηλιακών γονίδια διακρίνονται παθολογική δείγματα ιστών από κανονικά συγκριτικά σε αρκετές ανθρώπινες ασθένειες που σχετίζονται με χρόνια φλεγμονή. Έχουμε εκπαιδευτεί αυτά τα γονίδια σε ανθρώπινα σύνολα δεδομένων καρκίνου και ορίζονται έξι-γονίδιο φλεγμονώδεις υπογραφή που προλέγεται από σημαντικά μειωμένη συνολική επιβίωση στον καρκίνο του μαστού, καρκίνο του κόλου, καρκίνο του πνεύμονα, και γλοίωμα. Αυτό ενδοθηλιακά προερχόμενο υπογραφή προβλεπόμενη έκβαση ανεξαρτήτως, αλλά σε συνεργασία με, τυπικές κλινικές και παθολογικές προγνωστικούς παράγοντες. Σε συμφωνία με αυτά τα ευρήματα, ρυθμισμένα μέσα καλλιέργειας από ανθρώπινα ενδοθηλιακά κύτταρα που διεγείρονται από προ-φλεγμονώδεις κυτοκίνες επιτάχυνε την ανάπτυξη του ανθρώπινου κόλου και του μαστού όγκων σε ανοσοανεπαρκή ποντίκια, σε σύγκριση με ρυθμισμένα μέσα από μη επεξεργασμένα ενδοθηλιακά κύτταρα.

Συμπεράσματα

Αυτή η μελέτη παρέχει την πρώτη προγνωστικός γονίδιο του καρκίνου υπογραφή που προέρχεται από ένα πειραματικό μοντέλο που σχετίζονται με όγκους ενδοθηλιακού φλεγμονή. Αυτά τα ευρήματα υποστηρίζουν την ιδέα ότι η ενεργοποίηση των φλεγμονωδών μονοπατιών σε μη-κακοήθη ενδοθηλιακά κύτταρα όγκου που διηθούν συμβάλλει στην ανάπτυξη του όγκου και την εξέλιξη σε πολλαπλές ανθρώπινων καρκίνων. Είναι σημαντικό, τα αποτελέσματα αυτά προσδιορίζουν ενδοθηλιακά που προέρχονται από τους παράγοντες που θα μπορούσαν να χρησιμεύσουν ως πιθανοί στόχοι για θεραπεία σε διάφορες ανθρώπινους καρκίνους

Παράθεση:. Pitroda SP, Zhou Τ, Sweis RF, Filippo M, Labay Ε, Μπέκετ MA, et al . (2012) του όγκου των ενδοθηλιακών Φλεγμονή Προβλέπει Κλινική έκβαση σε ποικίλες ανθρώπινους καρκίνους. PLoS ONE 7 (10): e46104. doi: 10.1371 /journal.pone.0046104

Επιμέλεια: Sharon Α Glynn, Εθνικό Πανεπιστήμιο της Ιρλανδίας Galway, Ιρλανδία

Ελήφθη: 14 Μαρ του 2012? Αποδεκτές: 28 Αυγούστου, 2012? Δημοσιεύθηκε: 4 Οκτωβρίου 2012 |

Copyright: © Pitroda et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτές οι μελέτες υποστηρίχθηκαν από τη χρηματοδότηση από την Βιρτζίνια και DK Ταμείο Ludwig για την Έρευνα του Καρκίνου (RRW), Lung Cancer Research Foundation (RRW), Σικάγο όγκου Ινστιτούτο (RRW), και του εγκεφάλου του έργου Πρόγραμμα όγκου (PO1 CA 07193312) (RRW), εκτός από την , Ηνωμένες Πολιτείες Εθνικό Ινστιτούτο Υγείας χορηγεί HL58064 (JGNG), HL98050 (JGNG), και HL105371 (JGNG) και ένα γενναιόδωρο δώρο από την οικογένεια Foglia (RRW). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

κατά την τελευταία δεκαετία, η κατανόηση της βιολογίας των όγκων έχει επεκταθεί για να περιλάβει στοιχεία στρωματικά υποδοχής ως σημαντικοί καθοριστικοί παράγοντες στην κακοήθη μετασχηματισμό και την εξέλιξη [1]. Θεραπείες στόχευσης στρωματικά κύτταρα έχουν, εν μέρει, προέκυψε από την μοριακό χαρακτηρισμό των αλληλεπιδράσεων στρωματικών όγκων. Υπάρχουν σημαντικές ενδείξεις ότι στρωματικά φλεγμονή συμβάλλει στον πολλαπλασιασμό και την επιβίωση των κακοηθών κυττάρων, διευκολύνει γενωμική αστάθεια, διεγείρει την αγγειογένεση και μετάσταση, και μεταβάλλει την απόκριση σε αντικαρκινικές θεραπείες [2], [3]. Όταν παράγεται χρονίως στο μικροπεριβάλλον του όγκου, ΤΝΡ-α είναι ένας σημαντικός μεσολαβητής της φλεγμονής στρωματικών [3]. TNF-α είναι σημαντική σε πρώιμα γεγονότα στην ογκογένεση, τον έλεγχο ενός καταρράκτη των κυτοκινών, χημειοκινών, μόρια προσκόλλησης, και προ-αγγειογενετική δραστηριότητα [2], [3]. Τα πιο καλά χαρακτηρισμένη δράσεις των κακοηθών κυττάρων που προέρχονται από TNF-α είναι σε αγγειακά ενδοθηλιακά κύτταρα. Τα αγγειακά ενδοθηλιακά κύτταρα συμμετέχουν ενεργά και να ρυθμίζουν την φλεγμονώδη απόκριση και στις δύο κανονικές και νοσούντων ιστών [4], και τις αναδυόμενες στοιχεία δείχνουν ότι τα ενδοθηλιακά κύτταρα επηρεάζουν άμεσα τη συμπεριφορά του όγκου [5] – [7]. Παρ ‘όλα αυτά, λίγα είναι γνωστά σχετικά με το ρόλο των ενδοθηλιακών φλεγμονής στην προώθηση της ανάπτυξης του όγκου και την επιρροή της για την πρόγνωση καρκίνων επί ανθρώπων.

προφίλ γονιδιακής έκφρασης των κλινικών όγκων οδήγησε στην ανακάλυψη πολλών μοριακών υπογραφών. Ένας περιορισμός των μελετών προφίλ τρέχουσα έκφραση του γονιδίου είναι η έλλειψη επικύρωσης σε ανεξάρτητες κλινικές σύνολα δεδομένων [8], [9]. Είναι σημαντικό, πολλά εμπειρικά προέρχεται κλινικές υπογραφές είναι συγκεκριμένες σε ένα μόνο είδος καρκίνου και συχνά δεν παρέχουν πληροφορίες για τις σχετικές βιολογικές οδούς που επηρεάζουν την πρόγνωση του καρκίνου. Χρησιμοποιήσαμε ένα πειραματικό μοντέλο ΤΝΡ-α διαμεσολαβούμενη φλεγμονή να χαρακτηρίσει φλεγμονώδεις γονιδιακή έκφραση σε όγκους που σχετίζονται με τα ενδοθηλιακά κύτταρα. Σε αυτή τη μελέτη, δείχνουμε ότι η επαγωγή της φλεγμονώδους γονιδιακής έκφρασης σε όγκους που συνδέονται ενδοθηλιακά κύτταρα επιταχύνει σημαντικά την ανάπτυξη των ανθρώπινων όγκων. Αξίζει να σημειωθεί ότι, αντλούμε το πρώτο γονίδιο του καρκίνου υπογραφή σχετίζεται με ενδοθηλιακή φλεγμονή που προβλέπει την κλινική έκβαση σε τέσσερις τύπους καρκίνων του ανθρώπου ανεξάρτητα από την τυπική κλινική και παθολογική προγνωστικούς παράγοντες. Τα ευρήματά μας παρέχουν μια νέα βιολογικά προέρχεται μέθοδος πρόγνωση του καρκίνου και να προτείνει δυνητικές οδούς για την ανάπτυξη αντικαρκινικών θεραπειών που στοχεύουν στην στρώματος του όγκου.

Μέθοδοι

Οι μέθοδοι που χρησιμοποιούνται για κυτταρικές σειρές πολιτισμό και να δημιουργήσουν οι όγκοι σε ποντίκια περιγράφεται λεπτομερώς στο προσάρτημα S1, η οποία είναι διαθέσιμη με το πλήρες κείμενο του άρθρου αυτού στο www.plosone.org. Tumor-σχετίζεται ενδοθηλιακά κύτταρα απομονώθηκαν χρησιμοποιώντας μια σταδιακή ανοσοκαθαρισμού του ιστού όγκου (προσάρτημα S1 για περισσότερες λεπτομέρειες). Εν συντομία, αυτό έγινε με κάθαρση αιμοποιητικών κυττάρων από ομογενοποιημένο ιστό όγκου με επώαση με επισημασμένο με βιοτίνη αντι-CD19, αντι-CD45 και αντι-F4 /80, το οποίο είχε χωριστά προ-συνδεδεμένο με στρεπταβιδίνη-συνδεδεμένη Dynabeads (Dynal? Lake Success, ΝΥ), που ακολουθείται από απομάκρυνση των σφαιριδίων-δεσμευμένα κύτταρα με έναν Dynal-50 μαγνήτη. Fc-Block (αντι-CD16 /32 αντισώματα) προστέθηκε στο κυτταρικό εναιώρημα για την πρόληψη της μη ειδικής σύνδεσης του Fc υποδοχέα που περιέχει κύτταρα στον θετικής επιλογής. Στη συνέχεια, αντι-VE καντερίνη και προστέθηκαν αντι-CD105 αντισώματα να δεσμεύονται ενδοθηλιακά κύτταρα, το οποίο ακολουθήθηκε από την προσθήκη στρεπταβιδίνης-συνδεδεμένων Dynabeads και να συλλάβει με Dynal-50 μαγνήτη μέχρι μόνο σφαιρίδια δεσμευμένα κύτταρα παρέμειναν σε διάλυμα. Οι μέθοδοι που χρησιμοποιούνται για την εκχύλιση RNA, η συλλογή δεδομένων μικροσυστοιχιών και την ανάλυση, και ποσοτική πραγματικού χρόνου αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης που περιγράφεται επίσης στο προσάρτημα S1. υπάρχουν διαθέσιμα δεδομένα μικροσυστοιχιών στο Gene Expression Omnibus (GEO) [αριθμός ένταξης: GSE33253] (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?token=dfyldgammaawwjw acc=GSE33253).

Patient Δείγμα δεδομένων

Πληροφορίες για τον ασθενή, συμπεριλαμβανομένων τόσο κλινικά δεδομένα και τα δεδομένα γονιδιακής έκφρασης, λήφθηκε από πολλαπλές ανεξάρτητες πηγές. σύνολα δεδομένων γονιδιακής έκφρασης που εκπροσωπούν φλεγμονώδη νόσο του εντέρου (GSE13367), ρευματοειδή αρθρίτιδα (GSE12021), και κίρρωση (GSE14323) είχαν κατεβάσει από GEO. Αυτά τα σύνολα δεδομένων επιλέχθηκαν με βάση την διαθεσιμότητα των δύο νοσούντων και φυσιολογικό δείγματα ιστών, καθώς επίσης και έχοντας ένα μεγάλο αριθμό δειγμάτων διαθέσιμα κατά το χρόνο της ανάλυσης. σύνολα δεδομένων γονιδιακής έκφρασης που αντιπροσωπεύει ανθρώπινο καρκίνο του μαστού, καρκίνο του κόλου, καρκίνο του πνεύμονα, γλοίωμα και είχαν κατεβάσει από δημόσια διαθέσιμες αποθετήρια. Αυτά τα σύνολα δεδομένων επιλέχθηκαν με βάση τον μεγάλο αριθμό δειγμάτων, τη διαθεσιμότητα των δεδομένων κλινικής έκβασης, καθώς και την ποικιλία των τύπων όγκων. Για κάθε τύπο όγκου, ομάδες κατάρτισης και επικύρωσης κατασκευάστηκαν. Στον καρκίνο του μαστού [10] (n = 295? Ολλανδικό Ινστιτούτο Καρκίνου? https://bioinformatics.nki.nl/data.php) και καρκίνο του παχέος εντέρου [11] (n = 232? Vanderbilt Medical Center (VMC? Nashville, ΤΝ) και H. Lee Moffitt Κέντρο Καρκίνου (MCC? Tampa, FL)? GSE17538 [177 από το MCC? 55 από VMC]), τα δείγματα όγκων χωρίστηκαν τυχαία σε δύο μέρη (2/3 για την εκπαίδευση και 1/3 για την επικύρωση) χρησιμοποιώντας υπολογιστή που δημιουργείται από τυχαίους αριθμούς για να ορίσετε τα δείγματα σε ομάδες κατάρτισης ή επικύρωσης. Για γλοίωμα, διακριτά σύνολα δεδομένων [12], [13] χρησιμοποιήθηκαν για την εκπαίδευση (n = 77? Πανεπιστήμιο της Καλιφόρνια στο Σαν Φρανσίσκο και MD Anderson Cancer Center? GSE4271) και επικύρωση (n = 50? Καναδική Brain Tumor Tissue Bank (Λονδίνο, Ontario, Canada), Γενικό Νοσοκομείο της Μασαχουσέτης (Βοστώνη, ΜΑ), Νοσοκομείου Brigham and Women της (Boston, MA), και το Νοσοκομείο Charite »(Βερολίνο, Γερμανία))? https://www.broadinstitute.org/cgi-bin/cancer/datasets.cgi). Τέλος, για τον καρκίνο του πνεύμονα [14], τέσσερα σύνολα δεδομένων (n = 441) ήταν διαθέσιμα από μία μελέτη και διαχωρίζεται σε εκπαίδευση (n = 257) και οι ομάδες επικύρωσης (n = 184) όπως περιγράφηκε στην αρχική δημοσίευση. Αυτά τα σύνολα δεδομένων ελήφθησαν από το Πανεπιστήμιο του Μίτσιγκαν Κέντρο Καρκίνου, Moffitt Κέντρο Καρκίνου, Memorial Sloan-Kettering, και την Dana-Farber Cancer Institute (διαθέσιμο σε https://caarraydb.nci.nih.gov/caarray/publicExperimentDetailAction.do; expId1 /41015945236141280. Κλινικά χαρακτηριστικά των ασθενών που χρησιμοποιούνται για την κατάρτιση και την επικύρωση παρατίθενται στον πίνακα S1.

Στατιστική Ανάλυση

Κέντρο Ανάλυσης Affymetrix NetAffx χρησιμοποιήθηκε για τον προσδιορισμό σύνολα ανιχνευτή που αντιστοιχεί στα ανθρώπινα ορθόλογα του πειραματικώς λαμβανόμενο ποντικού γονίδια. Καμία συγκεκριμένη προεπεξεργασία των δεδομένων έγινε πριν Σημασία Ανάλυση των μικροσυστοιχιών (SAM) [15] χρησιμοποιήθηκε για σύγκριση της έκφρασης του ανθρώπινου ορθόλογα σε δείγματα νοσούντος και του φυσιολογικού ιστού. η διαφορική έκφραση ορίστηκε ως ποσοστό εσφαλμένης ανακάλυψη (FDR) -adjusted ρ τιμή μικρότερη από 0,05 και πολλαπλή μεταβολή μεγαλύτερη από 1,5. γονίδια που εκφράζονται διαφορικά σε τουλάχιστον δύο από τα τρία σύνολα δεδομένων δοκιμαστεί ορίστηκαν ως αμοιβαία απορυθμισμένη. Ιεραρχική ομαδοποίηση μέσω κανόνας σύνδεσης του Ward με Ευκλείδεια μετρική απόστασης χρησιμοποιώντας JMP 7.1 (SAS Institute Inc .; Cary, NC) χρησιμοποιήθηκε για να απεικονίσει τις διαφορές της γονιδιακής έκφρασης.

Σε κάθε σύνολο δεδομένων εκπαίδευσης του καρκίνου, χρησιμοποιήθηκε μονοπαραγοντική Cox αναλογική παλινδρόμηση κινδύνου για την αξιολόγηση της σύνδεσης μεταξύ επιβίωσης και το επίπεδο της έκφρασης των γονιδίων που προέρχονται στην ανάλυση πειραματικών μικροσυστοιχιών που εκφράζονται διαφορικά σε σύνολα δεδομένων των ανθρώπινων ασθενειών που συνδέονται με τη χρόνια φλεγμονή. Έξι από αυτά τα σαράντα εννέα γονίδια είχαν συγκλίνουσες συντελεστές παλινδρόμησης σε όλους τους τέσσερις τύπους όγκων. Η έκφραση του κάθε μεμονωμένου γονιδίου σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο θανάτου. Για αυτούς τους έξι γονιδίων, ένας γραμμικός συνδυασμός των τιμών γονιδιακής έκφρασης σταθμισμένων με τους συντελεστές παλινδρόμησης χρησιμοποιήθηκε για να υπολογιστεί μια βαθμολογία κινδύνου για κάθε ασθενή. Τα μοντέλα και τις συναφείς συντελεστές κλιμάκωσης τους μονιμοποιήθηκαν, με βάση τις ομάδες κατάρτισης, και στη συνέχεια αξιολογούνται στις ομάδες επικύρωσης (Πίνακας S2). Αφήνοντας e

ki χαρακτηρίζει το επίπεδο έκφρασης του γονιδίου i για k ασθενή, και να αφήσει w

i χαρακτηρίζει το βάρος για γονιδιακή i, η βαθμολογία γονίδιο για k ασθενής είναι s

k = Σw

i ( e

ki-μ

i) /τ

i, όπου μ

i και τ

i είναι η μέση τιμή και την τυπική απόκλιση των τιμών γονιδιακής έκφρασης για τη γονιδιακή i σε όλα τα δείγματα στο σύνολο δεδομένων επικύρωσης. Οι ασθενείς ταξινομήθηκαν ως έχοντα ένα γονίδιο υπογραφή υψηλού κινδύνου ή ένα γονίδιο υπογραφή χαμηλού κινδύνου, με τη μέση της βαθμολογίας του κινδύνου καθώς η τιμή κατωφλίου. Μια υψηλή βαθμολογία έδειξε μια κακή έκβαση. Για κάθε μονοπαραγοντική ανάλυση Cox, κλινικές και παθολογικές παράγοντες που σχετίζονται με την κακή συνολική επιβίωση εντοπίστηκαν μεταξύ των διαθέσιμων στοιχείων που προβλέπονται στο σύνολο δεδομένων. Σημαντικούς παράγοντες για την μονοπαραγοντική ανάλυση συνήφθησαν πολυμεταβλητή ανάλυση Cox. Η συνολική επιβίωση αναλύθηκε και σε σύγκριση με τη μέθοδο Kaplan-Meier. Οι διαφορές στην επιβίωση δοκιμάστηκαν για στατιστική σημαντικότητα με το τεστ log-rank. Οι τιμές Ρ μικρότερες από 0,05 θεωρήθηκαν να υποδεικνύει στατιστική σημαντικότητα. Δίπλευρη τιμές Ρ υπολογίστηκαν για σύνολα δεδομένων εκπαίδευσης, ενώ μονόπλευρο τιμές Ρ υπολογίστηκαν για σύνολα δεδομένων δοκιμών. Όλες οι στατιστικές αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση JMP 7.1.

Αποτελέσματα

Χαρακτηρισμός των φλεγμονωδών γονιδιακής έκφρασης σε σχετιζόμενο με τον όγκο ενδοθήλιο

Για να εξεταστεί ο ρόλος του ΤΝΡ-α διαμεσολαβούμενη φλεγμονή στρωματικά στην ανάπτυξη του όγκου, χρησιμοποιήσαμε ένα συνγονιδιακό μοντέλο όγκου μελανώματος ποντικού Β16-Ρ1 εγκατεστημένοι σε άγριου τύπου (WT) ποντίκια και ποντίκια με ανοσολογική δυσλειτουργία, ως αποτέλεσμα της βλαστικής σειράς διαγραφών και των δύο TNF-α υποδοχέων (TNFR 1, 2 – /- , που αναφέρεται εδώ ως νοκ-άουτ [KO]). Η διακοπή του στρωματικών ΤΝΡ-α σηματοδότησης σημαντικά εξασθενημένη την ανάπτυξη των όγκων σε ποντικούς ΚΟ σε σύγκριση με εκείνη σε ποντικούς WT (σχετικός όγκος (V /V

0) [μέση τιμή ± SEM]? ΚΟ: 9.0 ± 0.9? WT: 21 ± 2,5? ρ = 0,0033? Εικ. 1Α), υποστηρίζοντας έτσι ένα ρόλο για στρωματικά σηματοδότηση TNF-α στην ανάπτυξη του όγκου. Σε συνεργασία με τα στοιχεία αυτά, βρήκαμε μια αυξημένη έκφραση του προ-φλεγμονωδών ένζυμο, COX2, στα καρκινικά αγγεία διηθούν του WT ποντικούς σε σύγκριση με ποντικούς ΚΟ, όπως μετρήθηκε από το ποσοστό των COX2-θετικά κύτταρα του αγγειακού ενδοθηλίου (WT: 65 ± 4,9%? KO: 9,3 ± 5,1%? p = 0,0014? Εικόνα 1Β και Γ).. Σε ένα πείραμα επαναληπτικές καθαρίσαμε ενδοθηλιακών κυττάρων από εκτομή WT και ΚΟ όγκους ίσου όγκου και εκτελείται γονίδιο προφίλ έκφρασης του απομονωμένου σχετιζόμενου με τον όγκο ενδοθηλιακά κύτταρα (ΤΑΕΟ’ς). Εντοπίσαμε διαφορική έκφραση των 993 σύνολα ανιχνευτής που αντιστοιχεί σε 808 γονίδια. WT ΤΑΕΟ’ς παρουσίασαν αυξημένη έκφραση του 686 σύνολα ανιχνευτή και μειωμένη έκφραση του 307 ανιχνευτή θέτει σε σχέση με KO ΤΑΕΟ’ς (Πίνακας S3). Αυτά τα γονίδια κωδικοποιούν ένζυμα (104), μετεγγραφικών ρυθμιστών (66), κινάσες (35), οι μεταφορείς (20), και χημειοκίνες /κυτοκίνες (7). Αξιοποιήσαμε Ingenuity Διαδρομή Ανάλυση (IPA) για την ταξινόμηση των διαφορικά εκφρασμένων γονιδίων και προσδιορίζονται «Φλεγμονώδης Απόκριση» ως το πιο σημαντικά εμπλουτισμένη σύνολο λειτουργιών υπερεκφράζεται σε WT ΤΑΕΟ’ς. Όπως μετράται από το ακριβές τεστ του Fisher, η συχνότητα των γονιδίων που εμπλέκονται στις λειτουργίες φλεγμονώδη απόκριση ήταν ιδιαίτερα σημαντική με p-τιμές που κυμαίνονται από 2,4 × 10

-11 έως 7,4 × 10

-3. ανάλυση ΙΡΑ έδειξαν σημαντική σύνδεση αυτού του γονιδίου που είναι γνωστό για ΤΝΡ-α που συνδέονται με φλεγμονώδη μονοπάτια που προκαλούνται από ΝΡ-κΒ και ιντερφερόνες (p = 10

-38? Σχ. 1D). Αυτά τα ευρήματα έδειξαν ότι σηματοδότηση στρωματικά ΤΝΡ-α συμβάλλει στην επιτάχυνση της ανάπτυξης του όγκου και φλεγμονώδεις γονιδιακή έκφραση σε σχετιζόμενο με τον όγκο ενδοθήλιο

(Α) Β16-Ρ1 ανάπτυξης όγκου μελανώματος ήταν σημαντικά κατέστειλε σε TNFR 1, 2 -. /- ποντικούς (ΚΟ) με διασπάστηκαν στρωματικά σηματοδότηση TNF-α σε σύγκριση με εκείνη σε ποντικούς άγριου τύπου (WT). Ο όγκος του όγκου μετρήθηκε σε σχέση με την Ημέρα 0 όγκος, η οποία ήταν ίση σε ποντικούς WT και ΚΟ (ρ = 0,19? t-test 2-tailed Student). Ημέρα 7, ρ = 0,002. Τα δεδομένα είναι μέσες ± SEM. (Β) Tumor σχετιζόμενη ενδοθηλιακά κύτταρα (ΤΑΕΟ’ς) σε ποντικούς ΚΟ μείωσαν σημαντικά την έκφραση του προ-φλεγμονωδών ένζυμο COX2. Αντιπροσωπευτικές εικόνες της ανοσοϊστοχημείας για COX2 πραγματοποιούνται σε όγκους Β16-Ρ1 (Ημέρα 7) και (C) ποσοτικός προσδιορισμός των COX2-θετικά ΤΑΕΟ’ς. μπαρ κλίμακα, 20 μm. Τα δεδομένα είναι μέσες ± SEM. Ρ = 0.0014 (2-tailed t-test του Student). (D) WT ΤΑΕΟ’ς υπερεκφράζουν ένα ιδιαίτερα σημαντικό δίκτυο γονίδιο «φλεγμονώδη αντίδραση» (p = 10

-38? Ακριβής δοκιμασία του Fisher). Συμπαγείς γραμμές αντιπροσωπεύουν άμεσες σχέσεις, ενώ διακεκομμένες γραμμές αντιπροσωπεύουν έμμεσες σχέσεις. Κόκκινο χρώμα δείχνει υπερέκφραση σε WT ΤΑΕΟ’ς. (Ε) διέγερση των ανθρώπινων ενδοθηλιακών κυττάρων ομφάλιας φλέβας (HUVECs) με ένα συνδυασμό των προ-φλεγμονωδών κυτοκινών TNF-α, ΙΡΝβ και ΙΡΝγ επήγαγε την έκφραση και των δύο πειραματικά προέρχονται ενδοθηλιακών φλεγμονωδών γονιδίων (μαύρες ράβδοι), καθώς και γνωστές δεικτών της ενδοθηλιακής φλεγμονής (λευκές ράβδοι). Ολικό RNA αναλύθηκε με ποσοτική RT-PCR. Τα δεδομένα είναι μέσες πολλαπλή μεταβολή ± SEM σε σχέση με μάρτυρα HUVECs. Ρ & lt? 0,01 απέναντι γονίδια (2-tailed t-test του Student). (F) Ρυθμισμένα μέσα καλλιέργειας από τα επεξεργασμένα HUVECs επιτάχυνε την ανάπτυξη των ανθρώπινων όγκων του παχέος εντέρου ξενομοσχεύτηκε σε αθυμικούς ποντικούς. Προ-επεξεργασία υποδεικνύει προηγούμενη επώαση των καρκινικών κυττάρων με ρυθμισμένα μέσα καλλιέργειας από διεγερμένα HUVEC, ενώ ελέγχου υποδεικνύει επώαση με ρυθμισμένα μέσα από ψευδο-αγωγή HUVECs. Ο όγκος του όγκου μετρήθηκε σε σχέση με την Ημέρα 0 όγκος (8 ημέρες μετά την ένεση). Τα δεδομένα είναι μέσες ± SEM. Ημέρα 18, ρ = 0.0009 (t-test 2-tailed Student).

Η

αξιολογείται άμεσα έκφραση ενδοθηλιακής γονιδίου σε απόκριση προς προ-φλεγμονώδη σήματα με διέγερση καλλιεργημένα ανθρώπινα ενδοθηλιακά κύτταρα ομφάλιας φλέβας (HUVECs) με ένας συνδυασμός του TNF-α και οι ιντερφερόνες (IFN) β και γ. Όπως προσδιορίζεται με ποσοτική RT-PCR, η έκφραση του

VCAM1

(μόριο προσκόλλησης αγγειακού κυττάρου 1),

ICAM1

(ενδο-κυτταρικό μόριο προσκόλλησης 1), και

sele

( Ε-σελεκτίνη), που είναι δείκτες του ενεργοποιημένου ενδοθηλίου [4], επάχθηκαν 1.8- έως 2.6-φορές, αντίστοιχα (Εικ. 1 Ε). Σε συνεννόηση με τα αποτελέσματα αυτά, τα γονίδια δείκτη φλεγμονής υπερεκφράζεται σε WT ΤΑΕΟ’ς, συμπεριλαμβανομένων των

STAT1

(μετατροπέας σήματος και ενεργοποιητής της μεταγραφής 1),

ΤΑΡ1

(μεταφορέα, ΑΤΡ-δεσμευτική κασέτα, μείζον σύμπλεγμα ιστοσυμβατότητας 1),

IRF7

(ρυθμιστικό παράγοντα ιντερφερόνης 7),

IFI44

(ιντερφερόνη-που προκαλείται από πρωτεΐνη 44), και

CXCL10

(χημειοκινών, CXC μοτίβο, συνδέτη 10), υπερεκφράστηκαν 1.9- σε 17,4 φορές μετά την κατεργασία (Σχ. 1Ε). Ελέγξαμε περαιτέρω την υπόθεση ότι ενεργοποιημένα ενδοθηλιακά κύτταρα αυξάνουν την ανάπτυξη των ανθρώπινων όγκων με επώαση καλλιεργημένων κυττάρων όγκου με ρυθμισμένα μέσα καλλιέργειας είτε από TNF-α /IFN-αγωγή ή μάρτυρα HUVECs. Προσαρμοσμένα μέσα από TNF-α /IFN-αγωγή HUVECs αύξησε σημαντικά την αύξηση ξενομοσχευμάτων ανθρώπινου όγκου κόλου σε αθυμικούς ποντικούς 2.3-φορές σε σύγκριση σε συσκευασμένα μέσων από μάρτυρα HUVECs (p = 0,0009? Εικ. 1F). Σε ανθρώπινους όγκους του μαστού, παρατηρήσαμε μια παρόμοια 3.0-πλάσια αύξηση της ανάπτυξης του όγκου (ρ = 0.02) (τα δεδομένα δεν παρουσιάζονται). Αυτά τα ευρήματα έδειξαν ότι η έκφραση ενδοθηλιακής γονιδίου σε απόκριση προς προ-φλεγμονώδη σήματα σχετίζεται με ενισχυμένη ανάπτυξη ανθρώπινου όγκου.

Η έκφραση του όγκου των ενδοθηλιακών προερχόμενων φλεγμονωδών γονιδίων σε ανθρώπινες ασθένειες που σχετίζονται με χρόνια φλεγμονή

Endothelial φλεγμονή εμπλέκεται στην παθογένεση πολλών ανθρώπινων ασθενειών [16] – [18]. Για να καθοριστεί εάν πειραματικώς λαμβανόμενο φλεγμονωδών γονιδίων ήταν σχετικές με ανθρώπινες ασθένειες, μετρήσαμε την έκφραση των 554 διακριτών ανθρωπίνων ορθόλογα των γονιδίων ενδοθήλιο προερχόμενο όγκου σε σύνολα δεδομένων των ανθρώπινων ασθενειών που συνδέονται με τη χρόνια φλεγμονή. Αυτά τα γονίδια σημαντικά διακεκριμένος παθολογικών δειγμάτων ιστού από κίρρωση (153 γονίδια), η φλεγμονώδης νόσος του εντέρου (140 γονίδια), και ρευματοειδή αρθρίτιδα (106 γονίδια) από κανονικά συγκριτικά του ιστού (Σχήμα 2Α-C?. Πίνακας S4). Ειδικότερα, οι ευαισθησίες και εξειδικεύσεις για τις εν λόγω σειρές γονιδίων κυμαίνονταν από 88-100% και 90-100%, αντίστοιχα (Πίνακας S5). Ένα υποσύνολο σαράντα εννέα-γονίδιο αμοιβαίως δυσρυθμισμένη στα σύνολα δεδομένων δοκιμαστεί και συγκλίνουσες στην έκφραση με το πειραματικό μοντέλο (Σχ. 2D). Όπως αναμενόταν, αυτά τα γονίδια ήταν σημαντικά εμπλουτισμένη με οδών που εμπλέκονται στην «Φλεγμονώδης Απόκριση» (τιμή-ρ: 1,4 × 10

-12 με 1,7 × 10

-2) που περιλαμβάνει την παρουσίαση αντιγόνου, σηματοδότηση ιντερφερόνη, TNFR 1 και 2 σηματοδότηση, και NF-κΒ σηματοδότηση (Σχ. 2Ε). Αυτά τα αποτελέσματα κατέδειξαν ότι ένα φλεγμονώδες προφίλ γονιδιακής έκφρασης υπερεκφράζεται σε WT ΤΑΕΟ’ς εκφράζεται διαφορικά σε πολλά ανθρώπινα φλεγμονωδών νόσων.

εκφραστική ομαδοποίηση των ανθρωπίνων ορθόλογα του όγκου γονιδίων προέρχεται από το ενδοθήλιο σε δείγματα ιστών ασθενών του (Α) κίρρωση ( 153 γονίδια), (Β) ασθένεια φλεγμονώδους εντέρου (IBD) (140 γονίδια), και (C) η ρευματοειδής αρθρίτιδα (RA) (106 γονίδια) σε σύγκριση με κανονικά συγκριτικά του ιστού. Εντός του διαγράμματος διασποράς, κάθε στήλη αντιπροσωπεύει ένα δείγμα ασθενούς και κάθε σειρά αντιπροσωπεύει μια διαφορικά εκφραζόμενο γονίδιο. Τα άρρωστα δείγματα συμβολίζεται με μαύρο καταπακτές. Έκφραση απεικονίζεται ως μέση κανονικοποιημένη, log2-μετασχηματισμένα αξίες. (D) Σαράντα εννέα γονίδια αμοιβαία απορυθμίζεται στα σύνολα δεδομένων δοκιμαστεί και συμφωνούν στην έκφραση με το πειραματικό μοντέλο. (Ε) ανάλυση Διαδρομή του συνόλου 49-γονιδίου επιδεικνύοντας σημαντική υπερ-εκπροσώπηση των πολλών μονοπατιών που σχετίζονται με φλεγμονή. Ρ-τιμές υπολογίστηκαν χρησιμοποιώντας το ακριβές τεστ του Fisher. Κόκκινη γραμμή δείχνει p = 0.05.

Η

Ανάπτυξη ενός προγνωστικού μοριακού ταξινομητή

επόμενο Υποθέσαμε ότι τα ενδοθηλιακά προερχόμενο φλεγμονώδη έκφραση γονιδίου είναι προβλεπτική της έκβασης του όγκου σε ασθενείς με καρκίνο. Χρησιμοποιήσαμε Cox αναλογικό παλινδρόμηση κίνδυνος σε όλη τη σειρά σαράντα εννέα-γονίδιο για τον εντοπισμό έξι γονίδια που σχετίζονται με μειωμένη συνολική επιβίωση σε καθένα από τα τέσσερα σύνολα δεδομένων κατάρτισης που αντιπροσωπεύουν τον καρκίνο του πνεύμονα (n = 257), ο καρκίνος του μαστού (n = 197), ο καρκίνος του παχέος εντέρου (n = 154), και γλοίωμα (n = 77). Έχουμε ορίσει αυτό το έξι-γονιδίου οριστεί ως η υπογραφή που σχετίζονται με φλεγμονή ενδοθηλιακά προερχόμενη Gene (IREG), το οποίο περιλαμβάνει τα γονίδια

IFI44

,

ΤΑΡ1

,

SPP1

(εκκρίνεται φωσφοπρωτεΐνη 1? επίσης γνωστή ως οστεοποντίνη),

ANXA3

(αννεξίνη Α3),

RGS2

(ρυθμιστής του G πρωτεΐνη σηματοδότησης 2), και

ΡϋΚ1

(πυροσταφυλικής αφυδρογονάσης κινάσης, ισοένζυμο 1). Κατασκευάσαμε ένα έξι-γονίδιο IREG βαθμολογία που σε συνδυασμό γονιδιακής έκφρασης με τον κίνδυνο θανάτου στα σύνολα δεδομένων εκπαίδευσης (Εικ. S1). ασθενείς IREG + ορίστηκαν ως εκείνες που έχουν μια έξι-γονίδιο βαθμολογία μεγαλύτερη ή ίση με την ομάδα διάμεσο σκορ. Σε ανεξάρτητη ομάδες ασθενών, εξετάσαμε την ικανότητα του έξι-γονίδιο σκορ για την ταξινόμηση των ασθενών σε προγνωστικές ομάδες με βάση την έκφραση του γονιδίου. Kaplan-Meier ανάλυση επιβίωσης συγκρίνοντας ομάδες ασθενών έδειξαν μια σημαντικά μειωμένη συνολική επιβίωση για τους ασθενείς IREG + σε ανεξάρτητες ομάδες του καρκίνου του μαστού (η = 98? P = 0,0008), ο καρκίνος του παχέος εντέρου (n = 78? P = 0,0013), γλοίωμα (n = 50 ? p = 0,017), και ο καρκίνος του πνεύμονα (n = 184?. p = 0,026) (Σχήμα 3Α-D). Αυτή η συσχέτιση μεταξύ της κατάστασης IREG και επιβίωσης επιβεβαιώθηκε από μονοπαραγοντική Cox ανάλογη ανάλυση κινδύνου της συνολικής επιβίωσης. ασθενείς IREG + είχαν αυξημένο κίνδυνο θανάτου από 2,72 φορές σε καρκίνο του παχέος εντέρου (p = 0,0027), 3.21-φορές σε καρκίνο του μαστού (p = 0,0015), 1.66-φορές σε καρκίνο του πνεύμονα (ρ = 0.052), και 2,12 φορές σε γλοιώματος (p = 0,034) (Πίνακας 1). Αξίζει να σημειωθεί ότι, σε όλους τους τύπους καρκίνου του IREG + κατάσταση συσχετίστηκε σημαντικά με μεγαλύτερες πρωτογενείς όγκους του υψηλότερου βαθμού ιστολογική (Πίνακας 2). Επιπλέον, σε κάθε σύνολο δεδομένων όγκου δοκιμάζονται, βρήκαμε μια σημαντική θετική συσχέτιση μεταξύ

VCAM1

γονιδιακής έκφρασης και βαθμολογία IREG (Σχ. 3Ε-Η). Αυτά τα ευρήματα έδειξαν ότι συλλογικά η υπογραφή IREG είναι προβλεπτική της συνολικής επιβίωσης σε πολλαπλούς ανθρώπινους καρκίνους. Επιπλέον,

VCAM1

, δείκτης της κυτοκίνης-ενεργοποιημένο ενδοθήλιο, είναι συν-εκφράζεται με την υπογραφή IREG.

έκφραση IREG σχετίζεται με κακή πρόγνωση σε (Α) του καρκίνου του μαστού (η = 98 ), (Β) καρκίνου του παχέος εντέρου (n = 78), (Γ) γλοίωμα (n = 50), και (Δ) του καρκίνου του πνεύμονα (n = 184). Οι καμπύλες επιβίωσης Kaplan-Meier για τις ομάδες ασθενών που προσδιορίζονται με βάση τη βαθμολογία IREG. P-τιμές δείχνουν σημαντικές διαφορές στη συνολική επιβίωση, όπως μετράται με τις δοκιμές log-rank. Κόκκινο = IREG +, μπλε = IREG-. (Ε-Η) Έκφραση του έξι-γονίδιο όρος IREG συσχετίστηκε θετικά με την έκφραση του γονιδίου VCAM1 σε κάθε τύπο όγκου. Παρουσιάζεται είναι ο συντελεστής συσχέτισης Pearson.

Η

Η ανάλυση

Η πολυπαραγοντική με το πρότυπο κλινικές και παθολογικές προγνωστικούς παράγοντες

Σε πολυπαραγοντικές αναλύσεις με τη χρήση συμπαράγοντες που διατίθενται για κάθε σύνολο δεδομένων, IREG + κατάσταση παρέμεινε μια σημαντική συμμεταβλητή στον καρκίνο του μαστού, καρκίνο του πνεύμονα, του παχέος εντέρου και του καρκίνου σε σχέση με πρότυπες κλινικές και παθολογικές παράγοντες που σχετίζονται με κακή πρόγνωση (πίνακες S6, S7, S8, και S9). Σε αυτές τις μορφές καρκίνου, δεν υπήρξαν σημαντικές πολυπαραγοντική αλληλεπιδράσεις μεταξύ IREG + καθεστώς και τους άλλους συμπαράγοντες. Αυτά τα αποτελέσματα έδειξαν ότι η προγνωστική επίδραση της βαθμολογίας IREG δεν εξηρτάτο από συγκεκριμένες τιμές των αντίστοιχων συμπαράγοντες. Στην περίπτωση του καρκίνου του μαστού με κακή πρόγνωση (ηλικίας & lt? 40 ή όγκος μεγέθους ≥T2), επεκτείναμε αυτήν την ανάλυση με περαιτέρω διαστρωμάτωση των ασθενών με χρήση της βαθμολογίας IREG (Σχ S2.). Διαπιστώσαμε ότι για κάθε αντίστοιχη παράγοντας που σχετίζεται με κακή πρόγνωση, οι ασθενείς IREG + είχε 2.4- έως 2,8 φορές σημαντικά αυξημένα κίνδυνο θανάτου σε σύγκριση με IREG- ασθενείς. Μια παρόμοια ανάλυση των ασθενών με καρκίνο του πνεύμονα με κακή πρόγνωση (ηλικίας ≥65 ή συμμετοχή λεμφαδένων) έδειξαν μια σημαντική 1,4 έως 2,0 φορές μεγαλύτερο κίνδυνο θανάτου σε IREG + ασθενείς (Εικ. S3). Για τους ασθενείς με καρκίνο σταδίου 3 ή 4 του παχέος εντέρου, ασθενείς IREG + είχαν 1,9 φορές αυξημένο κίνδυνο θανάτου σε σύγκριση με IREG- ασθενείς (Εικ. S4). Τέλος, για ασθενείς γλοίωμα διατρέχουν υψηλότερο κίνδυνο (ηλικία & lt? 55), οι ασθενείς IREG + είχαν σημαντικά αυξημένο κίνδυνο θανάτου από 2,4 φορές, αντίστοιχα (Σχ S5, Πίνακας S10.). Σε συνδυασμό με τα προηγούμενα δεδομένα, τα αποτελέσματα αυτά επιβεβαίωσαν ότι IREG + καθεστώς ενισχύει την ταυτοποίηση των ασθενών με καρκίνο διατρέχουν μεγαλύτερο κίνδυνο για θάνατο.

Συζήτηση

Τα ευρήματα αυτά υποδηλώνουν ότι η ενδοθηλιακή φλεγμονή είναι ένας διαμεσολαβητής της αύξησης του όγκου και την εξέλιξη. Σε υποστήριξη αυτής της υπόθεσης, έχουμε αποδείξει ότι η αναστάτωση της σηματοδότησης στρωματικών ΤΝΡ-α καταστέλλει φλεγμονώδη έκφραση γονιδίων σε σχετιζόμενο με τον όγκο ενδοθηλιακά κύτταρα και παρεμποδίζει σημαντικά την ανάπτυξη του όγκου. Δείχνουμε επίσης ότι ρυθμισμένα μέσα καλλιέργειας από ανθρώπινα ενδοθηλιακά κύτταρα που ενεργοποιούνται από προφλεγμονώδεις κυτοκίνες επιταχύνει την ανάπτυξη των ανθρώπινων όγκων σε ποντικούς με ανοσοανεπάρκεια. Τέλος, έχουμε εξάγει μια μοριακή υπογραφή αντανακλαστικό του ενδοθηλίου των όγκων φλεγμονώδη έκφραση των γονιδίων που είναι ιδιαίτερα έξυπνη κακής κλινικής έκβασης σε τέσσερις τύπους καρκίνου στον άνθρωπο. Συμφωνούν με τα πειραματικά μας μοντέλο, οι ασθενείς με όγκους που εκφράζουν αυτά τα γονίδια φλεγμονής είχαν σημαντικά μεγαλύτερες πρωτογενείς όγκους της τριτοβάθμιας ιστολογική ποιότητας.

έχουν Μοριακής υπογραφές ανακαλύψει μέσω προφίλ γονιδιακής έκφρασης έχει αποδειχθεί για να προσθέσετε προγνωστική αξία σε κλινικά και παθολογικά ευρήματα σε αρκετούς ανθρώπινους καρκίνους. Ο εντοπισμός προγνωστικές μεταβλητές που συνεργάζονται με γνωστούς παράγοντες μπορούν να βελτιώσουν την αναγνώριση των ασθενών που διατρέχουν υψηλότερο κίνδυνο υποτροπής και θανάτου. Πρόσφατα, αρκετές μελέτες έχουν προσδιορίσει υπογραφές στρωματικά ξενιστή, είτε σε καθαρισμένη στρωματικά κύτταρα ή από δείγματα ολικού όγκου, όπως σημαντική προγνωστικοί παράγοντες σε πολλαπλούς τύπους καρκίνου στον άνθρωπο, συμπεριλαμβανομένου του καρκίνου του μαστού, καρκίνο του πνεύμονα, γαστρικό καρκίνο, καρκίνο του προστάτη, και λεμφωμάτων [19] – [26]. Finak et al [19] χρησιμοποιείται σύλληψη λέιζερ μικροδιατομής (LCM) των πρωτογενών όγκων του μαστού για την κατασκευή ενός στρώματος που προέρχεται προγνωστικό υπογραφή που προέβλεψε κακή έκβαση σε ολόκληρο σύνολα δεδομένων έκφρασης που προέρχονται από όγκους. Οι συγγραφείς διαπίστωσαν ότι η κακή έκβαση ήταν στενά συνδεδεμένη με την έκφραση πολλών γονιδίων ενδοθηλιακής προέλευσης και ότι τα δείγματα των ασθενών εντός της κακής ομάδας αποτέλεσμα είχαν σημαντικά μεγαλύτερη ενδοθηλιακά περιεχόμενο από εκείνα που στην καλή ομάδα έκβαση. Επιπλέον, Lenz et al [25] προφίλ γονιδιακής έκφρασης σε δείγματα βιοψίας από ασθενείς με διάχυτη από μεγάλα Β-κύτταρα λέμφωμα και προσδιόρισε μια άκρως προγνωστική υπογραφή στρωματικών σε ασθενείς με δυσμενή έκβαση που ήταν σε μεγάλο βαθμό αποτελείται από γνωστά ενδοθηλιακά δείκτες. Όπως επίσης, Saadi κ.ά. [21] έδειξε ότι η εξέλιξη από προ-κακοήθη νόσο να οισοφαγικού αδενοκαρκινώματος συνδέθηκε με μια αξιοσημείωτη έκφραση φλεγμονωδών μεσολαβητών σε κύτταρα LCM στρωματικά παραβιαστεί, εν μέρει, από τα ενδοθηλιακά κύτταρα. Αυτές οι μελέτες τονίζουν το ρόλο των μη κακοήθη όγκο-διηθητικά κύτταρα στρώματος στην πρόγνωση των ανθρώπινων καρκίνων. Από την άποψη αυτή, οι περισσότερες βιοψίες όγκων περιέχουν ένα σημαντικό κλάσμα του στρωματικά κύτταρα (έως 50% [10]). Ως εκ τούτου, οι υπογραφές που προέρχονται από δείγματα ολικού όγκου αντανακλούν και τις δύο μορφές έκφρασης του όγκου και του στρώματος. Παρ ‘όλα αυτά, λίγες μελέτες μέχρι σήμερα έχουν εντοπιστεί προγνωστική μοριακό υπογραφές σχετικές με πολλαπλούς ανθρώπινους καρκίνους, και καμία από τις οποίες προήλθαν από σχετιζόμενο με τον όγκο ενδοθηλιακά κύτταρα.

Τα ενδοθηλιακά κύτταρα παίζουν ενεργό ρόλο σε έναν αριθμό φλεγμονωδών λειτουργιών που οδηγούν σε αυξημένη ροή αίματος, αγγειακή διαρροή των πρωτεϊνών του πλάσματος, και την πρόσληψη λευκοκυττάρων. Πολλές επιτυχημένες θεραπείες που στοχεύουν χρόνιας φλεγμονής αλλάξει άμεσα η έκφραση του γονιδίου ενδοθηλιακής [4]. Ειδικά παραδείγματα περιλαμβάνουν ΤΝΡ-α αναστολείς στη ρευματοειδή αρθρίτιδα και φλεγμονώδη νόσο του εντέρου και στατίνες σε καρδιαγγειακή νόσο [4]. Υπάρχει ένας αυξανόμενος όγκος αποδείξεων ότι πολλές κακοήθειες συνδέονται με ασθένειες χρόνιας φλεγμονής. Ένας μηχανισμός με τον οποίο συμβαίνει αυτό είναι μέσω της επαγωγής και συσσώρευση της βλάβης του DNA σε πολλαπλασιαζόμενα κύτταρα με ενδοδιηθητικά φλεγμονώδη κύτταρα σε θέσεις επίμονη φλεγμονή. Αυτές οι αλλαγές οδηγούν σε μόνιμη γονιδιωματικής αλλαγές που προωθούν, τελικά, κακοήθη μετασχηματισμό [2]. Η ισχυρότερη σύνδεση μεταξύ χρόνιας φλεγμονής και κακοήθη ασθένεια είναι στην καρκινογένεση του παχέος εντέρου που προκύπτουν σε άτομα με φλεγμονώδεις νόσους του εντέρου. Ενώ είναι γνωστό ότι φλεγμονώδη μονοπάτια σε άλλα στρωματικά κύτταρα συμβάλλουν επίσης στην ανάπτυξη του όγκου [2], τα αποτελέσματά μας δείχνουν ότι σχετίζονται με όγκους ενδοθηλιακού φλεγμονή είναι ένας σημαντικός καθοριστικός παράγοντας στην πρόοδο του όγκου. Προς στήριξη των ευρημάτων μας, οι αναδυόμενες στοιχεία δείχνουν ότι τα ενδοθηλιακά σημάτων κυττάρων που προέρχονται, συμπεριλαμβανομένων των φλεγμονωδών μεσολαβητών, ρυθμίζουν άμεσα την εξέλιξη του όγκου μέσω μηχανισμών «angiocrine» ανεξάρτητα από την αγγειογένεση [27]. Παρ ‘όλα αυτά, απαιτούνται περαιτέρω μελέτες για να χαρακτηρίσει τους μηχανισμούς με τους οποίους φλεγμονή του όγκου των ενδοθηλιακών κυττάρων την προώθηση της ανάπτυξης του όγκου.

Τα ευρήματά μας διαφέρουν από πολλές εμπειρικά προέρχεται υπογραφές γονιδίου σε ότι εντοπίσαμε ένα μοριακό προγνωστικός δείκτης επιβίωσης σε ασθενείς με διαφορετικές ανθρώπινων καρκίνων βασίζονται σε ένα πειραματικό μοντέλο της ενδοθηλιακής όγκου φλεγμονή, η οποία μπορεί να αποδειχθεί χρήσιμη βιολογικώς και κλινικά. Περαιτέρω προοπτική αξιολόγησης της υπογραφής έξι-γονίδιο χρησιμοποιώντας RT-PCR μπορεί να οδηγήσει σε μια ακριβή και επαναλήψιμα εργαλείο πρόβλεψης που μπορεί να βοηθήσει στη λήψη κλινικών αποφάσεων σε πολυάριθμους καρκίνους του ανθρώπου. Από θεραπευτική άποψη, η επιλεκτική αναστολή της ενδοθηλιακής προέλευσης φλεγμονώδεις παράγοντες, χωρίς να διαταραχθεί η ακεραιότητα των αιμοφόρων αγγείων, μπορεί να εξακολουθεί να εμποδίσει την ανάπτυξη του όγκου και ως εκ τούτου να αποφευχθούν πιθανές τοξικές παρενέργειες στον κανονικό αγγειακό σύστημα [6], [7]. Ακόμη περισσότερο, είναι γνωστό ότι η αγγειογενετική δραστηριότητα δεν σχετίζεται υποχρεωτικά με την πρόγνωση όγκων [7].