Αφηρημένο

TMPRSS2

/

ERG

αναδιάταξη,

PTEN

γονίδιο διαγραφή, και του υποδοχέα ανδρογόνων (

AR

) γονίδιο ενίσχυση έχουν παρατηρηθεί σε διάφορα στάδια του ανθρώπινου καρκίνου του προστάτη. Υποθέσαμε ότι η χρήση αυτών των δεικτών ως ένα συνδυασμένο πάνελ θα επιτρέψει την καλύτερη διαφοροποίηση μεταξύ χαμηλού κινδύνου και του καρκίνου του προστάτη υψηλού κινδύνου. Αναλύσαμε 110 δείγματα πρωτογενούς καρκίνου του προστάτη, 70 μεταστατικού δείγματα όγκων από 11 ασθενείς, και 27 ιστοί ξενομοσχεύματος που προέρχονται από 22 ασθενείς με προχωρημένο καρκίνο του προστάτη χρησιμοποιώντας φθορισμό in situ υβριδισμού (FISH) ανάλυση με ανιχνευτές που στοχεύουν το

TMPRSS2

/

ERG

,

PTEN

, και

AR

γονιδιακούς τόπους. Ετερογένεια των εκτροπών ανιχνεύονται αξιολογήθηκε. Γενετικά μοτίβα που επίσης συσχετίζεται με τα επίπεδα μεταγραφής. Μεταξύ των δειγμάτων με πλήρη δεδομένα, ο πίνακας FISH τρεις σήμανσης ανιχνεύονται χρωμοσωμικές ανωμαλίες σε 53% των πρωτοπαθών καρκίνων του προστάτη και 87% των μεταστατικών (Met) ή ευνουχισμό ανθεκτικά (CRPC) όγκους. Ο αριθμός των δεικτών με μη φυσιολογικό αποτέλεσμα FISH είχε μια διαφορετική κατανομή μεταξύ των δύο ομάδων (

P

& lt? 0.001). Στο επίπεδο του ασθενούς, Met /CRPC όγκοι είναι 4,5 φορές περισσότερες πιθανότητες να παρουσιάζουν ανωμαλίες από ασθενείς με πρωτοπαθή καρκίνο (

P

& lt? 0,05). Ετερογένεια μεταξύ όγκων Met /CRPC είναι ως επί το πλείστον μεταξύ των ασθενών. ετερογένεια μεταξύ των ασθενών οφείλεται κυρίως στη διαφορά μεταξύ του πρωτογενούς όγκου προστάτη και μεταστάσεων, ενώ πολλαπλές μεταστατικές θέσεις δείχνουν συνεπής ανωμαλίες. μεταβλητότητα ενδο-όγκου είναι πιο σημαντικό με την AR

αριθμού αντιγράφων σε πρωτογενείς όγκους.

AR αριθμό αντιγράφων

συσχετίζονται καλά με την

έκφραση AR

mRNA (rho = 0.52,

P

& lt? 0.001). Ειδικά μεταξύ των

TMPRSS2: ERG

CRPC όγκους σύντηξης-θετικό,

AR

mRNA και

ERG

επίπεδα mRNA συσχετίζονται ισχυρώς (rho = 0.64,

P

& lt? 0.001). Συνολικά, η ομάδα FISH τρεις-δείκτη μπορεί να αποτελέσει ένα χρήσιμο εργαλείο για τη διαστρωμάτωση του κινδύνου των ασθενών με καρκίνο του προστάτη

Παράθεση:. Qu Χ, Randhawa G, Friedman C, Kurland BF, Glaskova L, Coleman I, et al. (2013) Ένα πάνελ FISH Τρία-Marker Ανιχνεύει Περισσότερα γενετικών ανωμαλιών του

AR

,

PTEN

και

TMPRSS2 /ERG

σε Ευνουχισμός ανθεκτικά ή μεταστατικό προστάτη από ό, τι στην Πρωτοβάθμια όγκων του προστάτη. PLoS ONE 8 (9): e74671. doi: 10.1371 /journal.pone.0074671

Συντάκτης: Dean G. Τανγκ, το Πανεπιστήμιο του Τέξας ΜΌ Anderson Κέντρο Καρκίνου, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 3 Μάη του 2013? Αποδεκτές: 4 Αύγ, 2013? Δημοσιεύθηκε: 30 Σεπτεμβρίου 2013

Copyright: © 2013 Qu et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτή η μελέτη υποστηρίχθηκε από PNW SPORE Ρ50 CA097186, P50CA138293, P01CA085859, PC093372 και PC093509 απονέμεται από το Εθνικό Ινστιτούτο Καρκίνου. Η γενιά ξενομόσχευμα και τη συλλογή κλινικό δείγμα υποστηρίχθηκε από τον Richard Ίδρυμα Μ Lucas. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Η ανακάλυψη της υποτροπιάζουσας

αναδιατάξεις ETS

γονιδίου σε καρκίνους του προστάτη έχει οδηγήσει σε μελέτες που αξιολογούν το λειτουργικό ρόλο του

ETS

γονιδίων στην παθογένεση αυτής της νόσου και ως διαγνωστικοί και προγνωστικοί βιοδείκτες. Ο πιο κοινός τύπος του

ETS

αναδιάταξη, η σύντηξη των ανδρογόνων ρυθμιζόμενων

TMPRSS2

με την ογκογόνο

ERG

ανιχνεύεται στο ήμισυ περίπου των όγκων του προστάτη, αλλά κανένα από καλοήθη αδένων [1]. Ωστόσο, μελέτες που αξιολογούν την προγνωστική σημασία του

TMPRSS2

:

ERG

σύντηξης έχουν αποδώσει ασυνεπή αποτελέσματα [2] – [5]. Πρόσθετες γενετικοί παράγοντες είναι πιθανό να εργάζονται σε συνεννόηση με την σύντηξη κατά τη διάρκεια της εξέλιξης του καρκίνου. Πρόσφατες μελέτες έχουν δείξει ότι οι γενετικές ανωμαλίες δεν είναι κοινά μόνο στον καρκίνο του προστάτη, αλλά επίσης να αλληλεπιδρούν μεταξύ τους μέσω σχετικών μηχανισμών, συμβάλλοντας έτσι στην εξέλιξη σε επιθετικές ασθένειες.

TMPRSS2

ρυθμίζεται από ανδρογόνα, και ο υποδοχέας ανδρογόνων (AR) είναι συχνά ενισχύεται σε ασθενείς που έλαβαν θεραπεία με θεραπεία στέρησης ανδρογόνων [6], [7].

ΡΤΕΝ

διαγραφή, ένα άλλο κοινό εκτροπή σε καρκίνο του προστάτη, συσχετίστηκε με την έκφραση των κατάντη π-Akt και συνδέονται με ειδική θνησιμότητα λόγω καρκίνου [8], [9].

ETS

γονίδιο αναδιατάξεις έδειξαν να συνεργαστούν με

PTEN

διαγραφή και τις επιπτώσεις του καρκίνου του προστάτη πρόγνωση [10], [11]. Παρεμβολής μεταξύ ΡΙ3Κ και AR μονοπάτια σηματοδότησης πρόσφατα προταθεί ως μηχανισμός για την ανάπτυξη του καρκίνου ανθεκτικού ευνουχισμού προστάτη (CRPC) [12], [13].

PTEN

διαγραφή φάνηκε να καταστέλλει την έκφραση του γονιδίου των ανδρογόνων-απόκρισης διαμορφώνοντας

AR

δραστικότητα του παράγοντα μεταγραφής. Επίσης,

PTEN

και

AR

έκφρασης έχει αποδειχθεί ότι σχετίζεται αντίστροφα με καρκίνο του προστάτη [14].

Ένα κρίσιμο κλινικό ερώτημα αφορά τον προσδιορισμό χαρακτηριστικών των νεοδιαγνωσθέντων καρκίνων του προστάτη που θα διακρίνει επιθετική από νωχελικός συμπεριφορά. Η μοριακή ετερογένεια των καρκίνων του προστάτη υποδηλώνει ότι η ατομική βιοδείκτες μπορεί να μην είναι επαρκής, και ότι οι πολλαπλές γενετικοί δείκτες μπορεί καλύτερα συνδέσει με την έκβαση. Στην παρούσα μελέτη, χρησιμοποιήσαμε ένα φθορισμού τρεις σήμανσης in situ υβριδισμού (FISH) πάνελ για την ανίχνευση

TMPRSS2

ή /και

ERG

ανακατατάξεις,

AR

γονίδιο ενίσχυσης, και

PTEN

διαγραφή τόσο στην πρωτοβάθμια όσο και CRPC δείγματα καρκίνου του προστάτη και σύγκριση του επιπολασμού, σύμπτωση, και την αλληλεπίδραση αυτών των τριών δεικτών. Με την αναφορά των στοιχείων έκφρασης του mRNA που παράγεται από ταιριάζουν δείγματα όγκων από τον ίδιο ασθενή, αποδείξαμε επίσης πώς ευρήματα FISH συσχετίζεται με τις αλλαγές στη γονιδιακή έκφραση. Εντός και μεταξύ των ασθενών ετερογένεια των όγκων αναλύθηκε επίσης.

Υλικά και Μέθοδοι

Δείγμα Απόκτηση

Ηθική δήλωση.

Η μελέτη εγκρίθηκε από το Institutional Review Boards (IRB) της Έρευνας Καρκίνου Fred Hutchinson Center και το Πανεπιστήμιο της Washington Medical Center. IRB παραιτήθηκε από την ανάγκη για γραπτή συγκατάθεση για τη μελέτη αυτή, διότι χρησιμοποιήθηκαν μόνο απο-προσδιορίζονται τα υλικά, τα οποία προέρχονταν από την τράπεζα ιστών του Πανεπιστημίου της Ουάσιγκτον Ουρολογίας.

Τα δείγματα ασθενών.

αποχαρακτηριστούν αρχειοθετούνται χωρίς θεραπεία δείγματα πρωτογενούς καρκίνου του προστάτη (n = 110) ελήφθησαν από το Πανεπιστήμιο της Ουάσιγκτον (UW) και Virginia Mason Νοσοκομείο στο Σιάτλ. Συνολικά 83 πρωτοπαθείς όγκους που δημιουργούνται να αναλυθούν τα δεδομένα για τουλάχιστον ένα δείκτη FISH στον πίνακα, συμπεριλαμβανομένων 69 ασθενών με

TMPRSS2

/

ERG

δεδομένων FISH, 65 ασθενείς με

AR

δεδομένα FISH και 42 ασθενείς με

PTEN

δεδομένων FISH. Μεταστατικός δείγματα όγκου (n = 70) συλλέχθηκαν σε UW από αυτοψίες που εκτελούνται μέσα σε 2 έως 4 ωρών από το θάνατο του 11 CRPC ασθενείς κάτω της ταχείας αυτοψίας πρόγραμμα [15]. Οι όγκοι ελήφθησαν από διάφορες θέσεις οργάνων, καταψύχθηκαν αμέσως και αποθηκεύτηκαν στους -80 ° C. Όλοι οι ιστοί κόπηκαν για την H & amp? Χρώση Ε και, για την εξακρίβωση της ιστολογίας, επανεξετάζονται από έναν παθολόγο. FISH ανάλυση επικεντρώθηκε σε περιοχές καρκίνο. Ένα σύνολο 67 όγκων απέδωσε αναλυθούν τα δεδομένα για τουλάχιστον ένα δείκτη FISH στον πίνακα, συμπεριλαμβανομένων των 56 όγκων από 10 ασθενείς με

TMPRSS2

/

ERG

δεδομένων FISH, 65 όγκους από 11 ασθενείς με

AR

δεδομένων FISH, και 62 όγκων από 11 ασθενείς με

PTEN

δεδομένων FISH.

Ο καρκίνος του προστάτη ξενομοσχεύματα.

Ο καρκίνος του προστάτη ξενομοσχεύματα (γραμμές LuCaP) ήταν απομονώθηκε αρχικά από διάφορα όργανα των προηγμένων ασθενών [16]. αναλύσεις FISH ήταν επιτυχής σε 27 γραμμές LuCaP, που αντιπροσωπεύουν 22 ασθενείς, μία εκ των οποίων ήταν επίσης μεταξύ των μεταστατικών ασθενείς που περιγράφηκαν παραπάνω. Αυτές περιλάμβαναν 27 όγκους από 22 ασθενείς με

TMPRSS2

/

ERG

δεδομένων FISH, 26 όγκους από 21 ασθενείς με

AR

δεδομένων FISH, και 25 όγκων από 21 ασθενείς με

PTEN

δεδομένων FISH. Μαζί, συνδυάζοντας μεταστατικών όγκων των ασθενών και ξενομοσχεύματα που προέρχονται από ασθενείς με καρκίνο του προστάτη σε προχωρημένο στάδιο, η παρούσα μελέτη αξιολόγησε συνολικά 94 όγκων από 32 ασθενείς.

φθορισμού in situ υβριδοποίησης (FISH)

TMPRSS2

/

ERG

αναδιάταξη αξιολογήθηκε χρησιμοποιώντας νέα δοκιμασία FISH 4-χρώμα μας όπως περιγράφεται χωριστά [17]. «

TMPRSS2: ERG

» αναφέρεται στην παρουσία της σύντηξης των δύο γονιδίων. «

TMPRSS2

/

ERG

αναδιάταξη» αναφέρεται σε διάφορους υποτύπους της αναδιάταξης του ενός ή και των δύο γονιδίων, όπως ορίζεται στην ενότητα Αποτελέσματα. ανάλυση FISH του

ενίσχυση AR

γονίδιο εκτελέστηκε χρησιμοποιώντας το SpectrumOrange AR (Xq12) ανιχνευτή σε συνδυασμό με την SpectrumGreen επισημασμένου ChrX κεντρομεριδίου (Xp11.1-q11.1) CEP X ανιχνευτή ως έλεγχο (Abbott Molecular, IL) .

PTEN

γονίδιο διαγραφή εξετάστηκε χρησιμοποιώντας το

PTEN

/CEP10 dual-χρώμα σετ FISH Probe (Abbott Molecular, IL), συμπεριλαμβανομένου του SpectrumOrange επισημαίνονται PTEN (10q23) καθετήρα και η SpectrumGreen επισημαίνονται Chr10 κεντρομερίδιο (10p11.1-10q11.1) CEP 10 καθετήρα.

για κάθε δείγμα, μια σειρά από 25 έως 50 ανέπαφο και μη επικαλυπτόμενες ενδιάμεσης πυρήνες μετρήθηκαν με το χέρι χρησιμοποιώντας ένα φακό βύθισης 100 × λάδι σε ένα Zeiss Ζ1 μικροσκόπιο (Carl Zeiss Canada Ltd, Καναδάς).

AR

κέρδος και

ΡΤΕΝ

διαγραφή αξιολογήθηκαν μετρώντας τον αριθμό των σημάτων γονιδίου και το αντίστοιχο σήμα κεντρομερές ανά πυρήνα.

AR

κέρδος ορίστηκε ως ο μέσος όρος αριθμού αντιγράφων του

AR

ανά πυρήνες ίση ή μεγαλύτερη του 2. True

AR

γονιδιακή ενίσχυση ορίστηκε ως η αναλογία του συνολικού αριθμού του

AR

σήματα διαιρείται με τον συνολικό αριθμό των κεντρομερίδιο χρωμόσωμα Χ ίση ή μεγαλύτερη από 2. Τα δείγματα με

ΡΤΕΝ

ετερόζυγο διαγραφή είχε αναλογία του συνολικού αριθμού των

ΡΤΕΝ

σήματα διαιρείται με το συνολικό αριθμό των σημάτων CEP10 ίση ή μικρότερη από 0,75. Μια αναλογία

PTEN

/CEP10 ίσο ή κάτω από 0,2 θεωρείται ομόζυγο

PTEN

διαγραφή. Για τις αναλύσεις σε επίπεδο ασθενών των CRPC ασθενείς με πολλαπλούς όγκους, η έκφραση από ένα δεδομένο δείκτη θεωρήθηκε ανώμαλη εάν η εκτροπή παρατηρήθηκε σε τουλάχιστον μία όγκου.

Έκφραση Array

Agilent 44 K όλη την ανθρώπινη γονιδίωμα ολιγονουκλεοτίδιο έκφραση μικροσυστοιχίες (Agilent Technologies, Inc., Santa Clara, CA) χρησιμοποιήθηκαν για να προφίλ ξενομοσχεύματα καρκίνου του προστάτη και του ανθρώπινου ευνουχισμού ανθεκτικά μεταστάσεις μαλακών ιστών του προστάτη. Προσφάτως κατεψυγμένα ξενομοσχεύματα υποβλήθηκαν σε επεξεργασία για την εξαγωγή συνολικού RNA το οποίο ενισχύθηκε ένα γύρο? δείγματα ασθενών ήταν λέιζερ-σύλληψη μικροτομή και ενισχύθηκαν δύο γύρους όπως περιγράφηκε προηγουμένως [18]. επισήμανση Probe και υβριδοποίηση εκτελέσθηκε ακολουθώντας την Agilent προτεινόμενες πρωτόκολλα και φθορίζουσες εικόνες συστοιχία συλλέχθηκαν χρησιμοποιώντας την Agilent DNA G2565BA μικροσυστοιχία σαρωτή. Agilent λογισμικού Χαρακτηριστικό εκχύλισης χρησιμοποιήθηκε στο δίκτυο, εκχύλισμα, και την ομαλοποίηση των δεδομένων. αναλογίες έκφρασης ήταν log

2 κλίμακα και η μέση επικεντρωμένη σε όλη κάθε γονίδιο.

Στατιστική Ανάλυση

Για να συμπληρώσει τις συγκρίσεις των αρχειοθετημένα πρωτοπαθούς όγκου με μια ξεχωριστή ομάδα ασθενών με μεταστατική νόσο, εμείς εξετάζονται μέσα-ασθενή ετερογένεια των

AR

και

PTEN

για ασθενείς με μεταστατική νόσο, υποθέτοντας ότι οι όγκοι του προστάτη μπορεί να διαφέρουν από ταυτόχρονη μεταστατικές βλάβες. Γραμμική μικτά μοντέλα με τυχαίες επιδράσεις των ασθενών είχαν τοποθετηθεί σε όγκους μη-προστάτη, και ένα διάστημα εμπιστοσύνης 95% που υπολογίζεται για το [19] προβλέψεις έχουν ένα συγκεκριμένο θέμα, με μέση τιμή έκφρασης. Αν όγκου του προστάτη κατάστασης αριθμός αντιγράφων ενός ατόμου έπεσε έξω από το διάστημα εμπιστοσύνης, θα πρέπει να ερμηνευθεί ως απόδειξη των πιθανών διαφορών μεταξύ του καθεστώτος του αριθμού αντιγράφων των πρωτογενών και μεταστατικών βλαβών. Μια γραμμική μικτά αποτελέσματα μοντέλου και η% ICC9 SAS macro χρησιμοποιήθηκε για τον υπολογισμό εντός των τάξεων συντελεστές συσχέτισης και τα διαστήματα εμπιστοσύνης τους [20]. Λογιστική παλινδρόμηση και γενικευμένη εκτίμηση εξισώσεις (GEE) χρησιμοποιήθηκαν για σύγκριση ποσοστών ανωμαλία για πρωτογενή και μεταστατικό δείγματα, ελέγχοντας για πηγή ιστού (ταχεία αυτοψία vs ξενομόσχευμα) και εντός ασθενούς συσχετισμού για ανάλυση καρκινικών επιπέδου. Ετερογένεια εντός του όγκου διακύμανσης για διαφορετικές περιοχές του όγκου επίσης διερευνηθεί με τη χρήση γραμμικών μεικτών μοντέλων. Πρόσθετες στατιστική συμπερασματολογία περιλαμβάνονται Spearman συντελεστές συσχέτισης, και το τεστ Wilcoxon Rank Sum να συγκρίνουν τις διανομές του αριθμού των δεικτών με ανώμαλη έκφραση.

P

-τιμές ήταν δύο όψεων? στατιστικές αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση του λογισμικού SAS /STAT, έκδοση 9.3 (SAS Institute, Inc., Cary, NC).

Αποτελέσματα

Η επικράτηση των γενετικών ανωμαλιών Εντοπίστηκε από την ομάδα FISH Τρία-δείκτη σε εντοπισμένες Πρωτοβάθμιας και Μεταστατικό ή Ευνουχισμός Resistant (Met /CRPC) ασθενείς

Ο πίνακας FISH τρεις-δείκτη (Σχήμα 1) που χρησιμοποιείται στη μελέτη μας ανιχνευθεί συχνές γενετικές ανωμαλίες στον καρκίνο του προστάτη, και αυτά ήταν σημαντικά πιο συχνή στο Met /CRPC όγκους σε σχέση με το μη επεξεργασμένο πρωτογενείς όγκους (Σχήμα 2Α).

(Α) Απεικόνιση της τεχνικής FISH 4-χρώμα για την ανίχνευση των αναδιατάξεων του

TMPRSS2

και /ή

ERG

. ανιχνευτές FISH στοχεύουν 5 ‘-

TMPRSS2

(κόκκινο, καθετήρας Ι), 3′ –

TMPRSS2

(πράσινο, ανιχνευτής ΙΙ), 5 ‘-

ERG

(χρυσό, καθετήρα ΙΙΙ), και 3 ‘-

ERG

(μπλε, καθετήρα IV) ταυτόχρονα, την ανίχνευση διαφόρων μοντέλων σήματος, συμπεριλαμβανομένων των κανονικών (i), ενιαίο σύντηξης (ii), dual /συγκρότημα σύντηξης (iii), εναλλακτική αναδιάταξη χωρίς σύντηξης (iv), και αύξηση αριθμού αντιγράφων (CNI) χωρίς αναδιατάξεις. Συλλαμβάνονται εικόνες FISH (i) και (ii) εμφανίζονται στον αριστερό πίνακα του 1Γ? εικόνες του (iii) – (ν) δείχνονται κάτω από την αντίστοιχη εικόνα. (Β) ανιχνευτές FISH χρησιμοποιείται για την ανίχνευση

ενίσχυση AR

γονιδίων και

PTEN

γονίδιο διαγραφή

AR

ενίσχυση γονιδίου αναλύθηκε με τη χρήση ανιχνευτών που στοχεύουν

AR

(πορτοκαλί ) και το κεντρομερίδιο χρωμοσώματος Χ (πράσινο, CEPX).

PTEN

γονίδιο διαγραφή ανιχνεύθηκε με τη χρήση ανιχνευτών που στοχεύουν

PTEN

(πορτοκαλί) και το χρωμόσωμα 10 κεντρομερίδιο (πράσινο, CEP10). (C) Εκπρόσωπος ενδιάμεσης εικόνες FISH. Επάνω αριστερά, κανονική

TMPRSS2

και

ERG

μοτίβο σήμα επιδεικνύοντας δύο από τους τέσσερις ανιχνευτές ανά πυρήνα? Κάτω αριστερά,

TMPRSS2

:

ERG

σύντηξης εμφανίζεται ως αντιπαράθεση κόκκινο και μπλε σήματα ταυτόχρονα με λείπουν ή διαχωρισμό των διάμεσης πράσινο και χρυσό σήματα? Top μέση, κανονική

AR

μοτίβο σήμα επιδεικνύοντας ένα πορτοκαλί

AR

και ένα πράσινο σήμα Χ ανά πυρήνα? Κάτω στη μέση,

ενίσχυση AR

γονίδιο που παρουσιάζουν περισσότερο από το διπλάσιο του αριθμού των

AR

σήματα από τα σήματα CEPX? Πάνω δεξιά, η κανονική

PTEN

μοτίβο σήματος αποδεικνύει 2 πορτοκαλί

PTEN

και 2 πράσινα σήματα CEP10 ανά πυρήνα? Κάτω δεξιά,

PTEN

διαγραφή δείχνει καμία ή 1 αντίγραφο του

PTEN

σήματα ανά πυρήνα.

Η

Ένας ασθενής με πολλαπλούς όγκους, θεωρήθηκε ανώμαλη από ένα συγκεκριμένο δείκτη, αν η εκτροπή παρατηρήθηκε σε τουλάχιστον μία όγκου. διαγράμματα (Α) πίτα αποδεικνύουν το ποσοστό των ατόμων χωρίς (λευκό), ένα (ανοιχτό γκρι), δύο (σκούρο γκρι) και τρεις (μαύρο) ανωμαλίες ανιχνεύονται από τον πίνακα μεταξύ του πρωτοπαθή καρκίνο του προστάτη (n = 34) και η μεταστατικό καρκίνο ή ευνουχισμός ανθεκτικός προστάτη (Met /CRPC) ομάδα (n = 30), αντίστοιχα. Μεταξύ των πρωτογενών ασθενείς, ένας αστερίσκος χρησιμοποιείται για να τονίσει μέτρια αύξηση AR (κατά μέσο όρο

AR

ανά πυρήνα & gt? = 1.5 αλλά & lt? 2). (BD) Επικράτηση της κάθε υποτύπου των ανωμαλιών που ανιχνεύεται από επιμέρους δείκτη FISH μεταξύ των πρωταρχικών ασθενείς (ένας όγκος ανά ασθενή, n = 34), Met /CRPC όγκους (n = 81), και Met /CRPC ασθενών /ξενομοσχεύματα (η = 30 ), αντίστοιχα.

TMPRSS2

/

Οι ERG

ανωμαλίες κατηγοριοποιούνται ως ενιαίο σύντηξης (γαλάζιο), dual /συγκρότημα σύντηξης (σκούρο μπλε), εναλλακτικά αναδιατάξεις (πράσινο), και αντιγράψτε αύξηση αριθμού (CNI) της φυσιολογικό αλληλόμορφα γονίδιο (κίτρινο).

AR

FISH ανιχνεύθηκε μέτρια

AR

κέρδος (γαλάζιο), κέρδος Χ (σκούρο μπλε) και

AR

γονίδιο ενίσχυσης (πράσινο).

PTEN

ανωμαλίες FISH περιλαμβάνει ετερόζυγο (γαλάζιο) και ομόζυγη (πράσινο)

PTEN

διαγραφές. (Ε) Η συνύπαρξη των ανωμαλιών στις τρεις δείκτες εμφανίζονται ως 3D σφαίρα οικόπεδα για την πρωτογενή ομάδα του καρκίνου (αριστερά) και τον /CRPC ομάδα Met (δεξιά).

TMPRSS2

/

ERG

,

PTEN

, και

Τα AR

αποτελέσματα παρουσιάζονται στο Χ, Υ, και Ζ, αντίστοιχα. Η τιμή που παρέχονται σε κάθε κυμαίνεται άξονα από 0 έως 1. «0» υποδηλώνει την κανονική για ένα δεδομένο δείκτη. Για

TMPRSS2

/

ERG

, «0.5» υποδεικνύει ανακατατάξεις, συμπεριλαμβανομένης της σύντηξης και εναλλακτικών ανακατατάξεις? «1» σημαίνει CNI των κανονικών αλληλίων χωρίς καμία αναδιάταξη. Για

PTEN

FISH, τόσο ομόζυγα και ετερόζυγα διαγραφές παρουσιάζονται ως «1». Για

AR

FISH, «1» δεικνύει

AR

αντιγράψετε κέρδος αριθμό (& gt? = 2.0). Οι ασθενείς με τον ίδιο συνδυασμό ανωμαλιών συγκεντρωμένοι σε μια σφαίρα, ο όγκος του οποίου είναι ανάλογη με το ποσοστό των ασθενών στην αντίστοιχη κοόρτη. Μόνο οι ασθενείς με διαθέσιμα δεδομένα από τις τρεις δείκτες που περιλαμβάνονται. Η πράσινη σφαίρα στον πρωτογενή οικόπεδο ασθενή υποδηλώνει μέτριο

AR

κέρδος (& gt? 1.5 αλλά & lt? 2,0).

Η

Από τους 34 πρωτογενείς όγκους στο οποίο θα μπορούσαν να αξιολογηθούν όλες οι 3 δείκτες , 16 (47%) δεν εμφάνισαν ανωμαλίες που περιλαμβάνουν

AR

,

PTEN

ή

TMPRSS2 /ERG

? 11 (32%) ήταν ανώμαλη από ένα μόνο δείκτη. όγκοι έξι ασθενείς (18%) ανιχνεύθηκαν ανώμαλη από δύο δείκτες, μεταξύ των οποίων 3 με

TMPRSS2

:

ERG

σύντηξης και ομόζυγη

PTEN

διαγραφή, 2 με

TMPRSS2

:

ERG

σύντηξης και ετερόζυγο

PTEN

διαγραφή, και 1 με μη-σύντηξης εναλλακτική αναδιάταξη μαζί με ετερόζυγη

PTEN

διαγραφή. Κανένας από τους ασθενείς ήταν ανώμαλη και από τους τρεις δείκτες, επειδή δεν υπήρχε ανιχνεύσιμη

AR

ανωμαλία, όταν η τιμή αποκοπής για

AR

αύξηση ορίστηκε να & gt? = 2.0

AR

ανά πυρήνα, μια αυθαίρετα καθορίζεται αυστηρά αποκοπής. Δύο ασθενείς θα πρέπει να ταξινομούνται ως ήπια

AR

κέρδος αν χρησιμοποιείτε

AR

αριθμού αντιγράφων ανά πυρήνες

& gt?

= 1.5 ως τιμή αποκοπής, που ιδρύθηκε ως μέση τιμή + 3SD με βάση αποτελέσματα απαρίθμηση σε κανονικό προστάτη επιθηλιακά κύτταρα από 18 διαφορετικά δείγματα.

από τους ασθενείς /ξενομοσχευμάτων με FISH αποτελέσματα από τους τρεις δείκτες, 4 (13%) δεν είχαν μη φυσιολογικές τιμές δείκτη το 30 Met /CRPC. Πέντε (17%) εμφανίζονται ως μη φυσιολογική από ένα μόνο δείκτη? 13 (43%) ανιχνεύθηκαν ως μη φυσιολογική από δύο δείκτες, συμπεριλαμβανομένων των 8 (27%) εμφανίζονται ως μη φυσιολογική από

TMPRSS2

/

ERG

και

AR

FISH και 5 ( 17%) από το

TMPRSS2

/

ERG

και

PTEN

. Οκτώ ασθενείς (27%) ήταν ανώμαλη από όλες τις τρεις δοκιμασίες.

περαιτέρω αξιολογήθηκε υποτύπους των γενετικών ανωμαλιών που ανιχνεύεται από κάθε δείκτη στο Met /CRPC κοόρτη (Σχήμα 2 Β-D). Αναδιατάξεις

TMPRSS2

και /ή

ERG

ανιχνεύθηκαν σε 14 ασθενείς (47%), συμπεριλαμβανομένων των 5 (17%) με το τυπικό και μόνο

TMPRSS2

:

ERG

σύντηξης, 5 (17%), με διπλή ή σύνθετη

TMPRSS2

:

ERG

σύντηξης, και 4 (13%) με εναλλακτικές αναδιατάξεις χωρίς σύντηξης. Αντιγραφή αύξηση αριθμού (CNI) του χρωμοσώματος 21 παρατηρήθηκε σε 10 ασθενείς (33%) με τη χρήση των

TMPRSS2

/

ERG

ανιχνευτές FISH.

AR

κέρδος σε μία ή περισσότερες αλλοιώσεις παρατηρήθηκε σε 18 ασθενείς (60%), συμπεριλαμβανομένων 6 (20%) που προέκυψε από κέρδος του X-χρωμόσωμα και 12 (40%) με την αληθινή

AR

ενίσχυση του γονιδίου (

AR

/Χ & gt? = 2). Η διαγραφή του

ΡΤΕΝ

ανιχνεύθηκε σε 15 ασθενείς (50%), συμπεριλαμβανομένων των 5 με ομόζυγη διαγραφή.

Μια δοκιμή αθροίσματος κατάταξης Wilcoxon πρότεινε ότι η Met /CRPC κοόρτης (n = 30) είχαν γενικά περισσότερες αλλοιώσεις ανιχνεύονται από ψάρια από την ομάδα των πρωτογενών καρκίνων (Ν = 34) (W = 1287,

P

& lt? 0.001).

AR

κέρδος, συμπεριλαμβανομένων μέτρια αύξηση (W = 1334,

P

& lt? 0.001), και ο συνδυασμός του

TMPRSS2 /ERG

και

PTEN

μεταβολές (W = 1181,

P

= 0.005) ήταν επίσης σημαντικά πιο συχνή στους /CRPC όγκους Met.

η έρευνα των επιμέρους δεικτών αποτυπώνεται μοναδικά τάσεις των αλλαγών κάθε γενετική ανωμαλία κατά τη διάρκεια της εξέλιξη του καρκίνου του προστάτη. Περίπου το 80% του Met /CRPC δείγματα ταυτοποιήθηκαν με

TMPRSS2

/

ERG

FISH ως ανώμαλη, σε σύγκριση με 48% στην πρωτοβάθμια δείγματα, και η διαφορά ήταν στατιστικά σημαντική (Πίνακας 1? Σχήμα 2Β ) (

P

= 0,03). Αυτή η διαφορά φαίνεται να οφείλεται στην εκτροπή CNI και όχι το

TMPRSS2: ERG

ίδια σύντηξη? το ποσοστό των ασθενών με σύντηξη ή εναλλακτικά αναδιάταξη παραμένει παρόμοια, αλλά το ποσοστό των ασθενών με διπλή σύντηξη, σε αντίθεση με ενιαία σύντηξης είναι σαφώς μεγαλύτερη στην /CRPC κατηγορία Met από ό, τι στον πρωτογενή ομάδα όγκου (Σχήμα 2Β). Εξέτασης των επιμέρους όγκων (προσαρμογή για μέσα-πρόσωπο καθεστώς συσχέτισης και ξενομόσχευμα), οι πιθανότητες ενός Met /CRPC όγκου εμφανίζουν μια ανωμαλία ήταν 4,5 φορές μεγαλύτερη από ό, τι αποδόσεις για πρωτοπαθή όγκο (

P

= 0,05). Ενώ σχεδόν όλοι οι ασθενείς με πρωτοπαθή καρκίνο έδειξε φυσιολογική

AR

κατάσταση, πάνω από το 70% των ασθενών CRPC Met /κατέδειξε διάφορους βαθμούς

AR

αριθμού αντιγράφων γονιδίου κέρδος (Πίνακας 1? Σχήμα 2C). ΡΤΕΝ FISH έδειξαν αυξημένη ετερόζυγο

ΡΤΕΝ

διαγραφή και ομόζυγο

ΡΤΕΝ

διαγραφή στο Met /CRPC σύγκριση με την πρωτογενή τους ασθενείς (Πίνακας 1? Εικόνα 2D) (

P = 0,07

κατά τη επίπεδο όγκου,

P = 0,003

στο επίπεδο του ασθενούς). Αξίζει να σημειωθεί ότι, για τις αξιολογήσεις σε επίπεδο ασθενών, υπήρχε μια ιεραρχία, έτσι ώστε αν ένα τραύμα ήταν ετερόζυγο και η άλλη ομόζυγη, το επίπεδο ασθενής θεωρήθηκε ομόζυγη.

Η

Τα δεδομένα του συνόλου του πίνακα σε διαφορετικά άτομα έδειξε ότι ασθενείς με καρκίνο του προστάτη με

PTEN

διαγραφή έτειναν επίσης να εμφανίζουν μη φυσιολογικά αποτελέσματα στο

TMPRSS2

/

ERG

FISH (Σχήμα 2Ε). Μεταξύ των 34 ασθενών με πρωτοπαθή καρκίνο με τα διαθέσιμα στοιχεία από τις τρεις δείκτες, 6 από τα 8 άτομα με

PTEN

διαγραφή (75%) παρουσίασαν επίσης μια ανώμαλη

TMPRSS2

/

ERG

αποτέλεσμα FISH (Σχήμα 2Ε). Μεταξύ των 30 Met CRPC ασθενείς /με τα δεδομένα που διατίθενται από είτε με δύο ή τρεις δείκτες, 13 από τα 14 άτομα με

PTEN

διαγραφή (93%) έδειξε επίσης ανωμαλίες στο

TMPRSS2

/

ERG

ανάλυση FISH. Στο Met CRPC ασθενείς /, ανώμαλη

TMPRSS2 /ERG

Αποτελέσματα FISH ήταν επίσης πιο διαδεδομένη μεταξύ των ασθενών που αποδεικνύουν αύξηση του

AR

, και αντίστροφα (Σχήμα 2Ε). Δεκαέξι από τους 17 ασθενείς (94%) με

AR

κέρδος έδειξε

TMPRSS2

/

ERG

ανωμαλίες. Δεκαέξι από τους 24 ασθενείς (67%) με

TMPRSS2

/

ERG

ανωμαλίες έδειξαν επίσης

AR

κέρδος. Τα λεπτομερή αποτελέσματα FISH σε όλα τα μεταστατικό δείγματα από κάθε CRPC ασθενή συνοψίζονται στον Πίνακα 2. Τα αποτελέσματα των δειγμάτων ξένου μοσχεύματος παρατίθενται στον Πίνακα 3.

Η

ενδο- και Σύγκριση των Γονιδιωματική Παρεκκλίσεις Inter-ασθενούς και ετερογένεια στην ευνουχισμός Ανθεκτικό Καρκίνος του προστάτη

Η FISH 3-δείκτη αναλύσεις απέδωσε δύο παρατηρήσεις από ασθενείς με μεταστατικό καρκίνο του προστάτη: (1) εντός του ίδιου του ασθενούς, εκτροπές σε μεταστατικούς όγκους ήταν γενικά σταθερή σε όλες όγκους? (2) αρκετές πρωτοπαθείς όγκους του προστάτη της CRPC ασθενείς παρουσίασαν ένα προφίλ διαφορετικό από μακρινές μεταστατικές θέσεις. FISH αναλύσεις για

AR

αριθμό αντιγράφων (Εικόνα 3Α) και

αναλογία ΡΤΕΝ

/CEP10 (Εικόνα 3Β) έδειξαν αντικρουόμενα αποτελέσματα μεταξύ των πρωτοπαθών όγκων και των μεταστατικών βλαβών. Πιο συγκεκριμένα, για τον ασθενή # 9, ο όγκος του προστάτη έδειξε

AR

αντιγράψετε αύξηση αριθμού, ενώ οι μεταστατικές βλάβες όλοι είχαν κατά μέσο όρο

AR

& lt? 2. Για τον ασθενή # 11, οι πρωτογενείς όγκοι του προστάτη έδειξε φυσιολογική

AR

αποτελέσματα, ενώ μεταστατικές αλλοιώσεις έδειξε

AR

κέρδος. Ομοίως, η βλάβη του προστάτη σε ασθενείς # 3 αποδεικνύεται ετερόζυγο

PTEN

διαγραφή, όταν όλες οι μεταστατικές βλάβες είχαν φυσιολογική

PTEN

. Αντίθετα, για τον ασθενή # 11, οι μεταστατικές αλλοιώσεις έδειξε ομόζυγο

ΡΤΕΝ

διαγραφή ενώ η αλλοίωση του προστάτη δεν το έκανε. Σε άλλες περιπτώσεις (# 8 και # 10), οι όγκοι του προστάτη δεν διέφερε από μεταστατικές βλάβες σε ανώμαλη

vs

φυσιολογικά σήματα σήμανσης, αλλά ήταν έξω από το διάστημα εμπιστοσύνης 95% για τη μέση ένα συγκεκριμένο θέμα βασίζεται σε γραμμική μικτά μοντέλα ταιριάζει σε μεταστατικές αλλοιώσεις.

αποτέλεσμα FISH κάθε όγκο που αντιπροσωπεύεται από έναν χαρακτήρα αποτύπωση (γκρι για μεταστατικών βλαβών, κόκκινο για προστάτη) με πολλαπλές βλάβες στον ίδιο ασθενή στην ίδια συντεταγμένη Χ. Τα διαστήματα εμπιστοσύνης για τις τιμές αριθμητικό μέσο αντιγράφων ένα συγκεκριμένο θέμα παρουσιάζεται σε μαύρο χρώμα. Τα κατώτατα όρια για ανώμαλα σήματα που επισημαίνονται ως οριζόντιες διακεκομμένες γραμμές σε κάθε οικόπεδο. (Α) Μέσος αριθμός

AR

ανά πυρήνα. (Β) Μέσος όρος

PTEN

/

CEP10

αναλογία.

Η

Σε γενικές γραμμές, περισσότερο από το 75% της διακύμανσης ήταν μεταξύ των ασθενών, με σχετικά μικρή ενδο- παραλλαγή του ασθενούς: η εσωτερικός συντελεστής συσχέτισης ήταν 0.76 (95% CI 0,54 – 0,90) για το μέσο όρο

AR

και 0,82 (95% CI 0,62 – 0,92) για

PTEN

/CEP10. Ωστόσο, όταν ολόκληρος ο πίνακας αξιολογήθηκε για κάθε άτομο, 4 (# 3, # 5, # 9 και # 11) από τους 8 ασθενείς (50%) με διαθέσιμη από όλες τις τρεις δείκτες στις τοπικές όγκους του προστάτη δεδομένα έδειξαν διαφορετικά προφίλ μεταξύ οι πρωτογενείς και μεταστατικούς όγκους. Περαιτέρω σύγκριση χρησιμοποιώντας δεδομένα των επιμέρους δείκτες έδειξαν διαφορετικά επίπεδα απόκλισης του πρωτεύοντος από μεταστατικούς όγκους. Από τους 8 ασθενείς με διαθέσιμη

TMPRSS2

/

ERG

Αποτελέσματα FISH σε όγκους ιστοσελίδα του προστάτη, 3 (37,5%) είχε ως αποτέλεσμα προστάτη διαφορετικές από εκείνες σε άλλες μεταστατικές θέσεις (Πίνακας 2). Είναι ενδιαφέρον, ασθενή # 5 κατέδειξε διπλής σύντηξης διαγραφή μεταξύ μεταστατικές θέσεις, ενώ μόνο και μόνο διαγραφή σύντηξης ανιχνεύθηκε σε έναν όγκο από τον προστάτη του ίδιου ασθενούς. Στις αναλύσεις των

AR

, 3 (# 3, # 9, και # 11) από τους 10 ασθενείς (30%) έδειξαν αποτελέσματα στον προστάτη που απέκλινε από εξω-προστατικών όγκων. Η αξιολόγηση των

PTEN

διαγραφή έδειξε ότι 2 (# 3 και # 11) από 9 ασθενείς (22,2%) παρουσίασαν διαφορετικές

PTEN

Αποτελέσματα FISH μεταξύ ιστοσελίδα του προστάτη και μεταστατικούς όγκους. Στον ασθενή # 11, όλα τα έξτρα-προστατική μετάσταση έδειξε ομόζυγη

PTEN

διαγραφή, ενώ οι όγκοι του προστάτη έδειξε φυσιολογική

PTEN

αποτελέσματα. Ομοίως, τα δεδομένα του πίνακα για ξενομοσχεύματα έδειξαν επίσης ότι οι γραμμές ξενομοσχεύματος που προέρχονται από τον ίδιο ασθενή τείνουν να παρουσιάζουν την ίδια γονιδιωματική ανωμαλία (Πίνακας 3).

ενδονεοπλαστική Αξιολογήσεις της Genomic Ετερογένεια σε Μεταστατικό Ασθενείς

Εμείς δίπλα προσπάθησε να αξιολογήσει διακύμανση γονιδιωματική αλλοιώσεις που ανιχνεύεται από τον πίνακα FISH σε μεμονωμένα κύτταρα που περιλαμβάνουν μια πρωτοταγή ή μεταστατικού όγκου. Βρήκαμε σημαντική διακύμανση εντός του όγκου σε ποσοστό

AR

αριθμό αντιγράφων για όγκους ιστοσελίδα του προστάτη. Γραμμική μικτά μοντέλα προβλέψει

AR

αριθμού αντιγράφων σε κυτταρικό επίπεδο με τον τύπο του όγκου, με τυχαία αποτελέσματα ασθενή. Ο πίνακας 4 δείχνει τις εκτιμήσεις για τον αριθμό των

AR

ανά κύτταρο, και για τις εκτιμήσεις των παραμέτρων συνδιακύμανση που δείχνουν πώς εντός του όγκου διακύμανσης και το σφάλμα της μέτρησης διαφέρουν μεταξύ των διαφόρων τύπων όγκων. όγκοι ιστοσελίδα του προστάτη είχαν το υψηλότερο κατ ‘εκτίμηση στο πρόσωπο

AR

τυπική απόκλιση (1,43

AR

ανά κύτταρο). Αρκετοί όγκοι του προστάτη και μετάσταση στους λεμφαδένες είχαν κάποια ασυνήθιστα υψηλές μετρήσεις που μπορεί να έχουν συμβάλει στην εκτίμηση. Για το

PTEN /CEP10

αναλογία, οι εκτιμήσεις συνδιακύμανσης βρέθηκαν επίσης να είναι ετερογενής με τον τύπο του όγκου (χ

2

6 = 20, p = 0,003), αλλά μέσα-ασθενή προστάτη

ΡΤΕΝ /

CEP10 ενδοογκική ετερογένεια δεν ήταν διαφορετική από εκείνη της μετάστασης (χ

2

1 = 0,7, ρ = 0,40). Πίνακας 4 δείχνει ότι οι διαφορές ετερογένεια ιστού που βασίζεται ήταν λόγω των χαμηλών ενδοατομική μεταβλητότητα στην περιτοναϊκή και των επινεφριδίων αλλοιώσεις. Αυτά τα αποτελέσματα μπορούν να συγχέονται με εφέ ασθενή, δεδομένου ότι λίγοι ασθενείς είχαν επινεφριδίων ή περιτοναϊκή βλάβες. Με ένα τεστ λόγου πιθανοφανειών, στατιστικά μοντέλα με ξεχωριστό συμμεταβλητή εκτιμήσεις για κάθε τύπο όγκου χωρέσει τα δεδομένα καλύτερα από ένα μοντέλο που δεν έκανε διάκριση μεταξύ των όγκων (χ

2

6 = 412,

P

& lt ? 0.001), και ένα μοντέλο που διακρίνεται μεταξύ του ιστού του προστάτη και άλλες βλάβες (χ

2

5 = 332,

P

& lt?. 0.001)

η

Συσχέτιση της Γονιδιωματική Τροποποιήσεις και Gene Expression στο Ευνουχισμός Ανθεκτικό Καρκίνος του προστάτη

για να διερευνηθεί η λειτουργική σχέση των γενετικών ανωμαλιών που ανιχνεύεται από πάνελ μας, συσχετίζονται ευρήματα FISH μας με τα δεδομένα γονιδιακής έκφρασης από 91 ταιριάζουν Met /CRPC δείγματα, συμπεριλαμβανομένων 65 όγκους των ασθενών και 26 ξενομοσχεύματα (Πίνακας S1).

Πρέπει πρώτα σε σύγκριση

AR

αντιγράψετε τον αριθμό, που καθορίζεται από FISH, με το

AR

μεταγραφή αφθονία, καθορίζεται από cDNA μικροσυστοιχιών , από το ίδιο δείγμα όγκου. Παρατηρήσαμε ένα ευρύ φάσμα των

AR

έκφραση σε Met /CRPC όγκοι (Σχήμα 4Α). Ο μέσος αριθμός των

AR

ανά πυρήνα και το επίπεδο της σχετικής

AR

mRNA σχετίστηκαν θετικά με rho = 0.52 (

P

& lt? 0.001) (Εικόνα 4Α). Όταν έγινε κανονικοποίηση ως προς το διάμεσο

AR

επίπεδο έκφρασης του mRNA όλων των όγκων τόσο με

AR

δεδομένων FISH και mRNA έκφραση (n = 88), τα δείγματα με

AR

κέρδος (n = 48), συμπεριλαμβανομένων της αύξησης του Χ (n = 17) και

AR

ενίσχυσης (n = 31) που εκφράζονται

AR

mRNA σε 2.5 ± 0.3 φορές (Μέσος όρος ± SE) υψηλότερο από ό, τι η μέση, ενώ οι όγκοι χωρίς να

AR

κέρδος (n = 40) είχαν

AR

επίπεδο mRNA ως 0,7 ± 0,2 φορές σε σύγκριση με το μέσο (W = 1106,

P

& lt? 0.001). Όταν οι όγκοι με

AR

κέρδος περαιτέρω διαιρέθηκαν σε ομάδες των απολαβής του X (n = 17) έναντι

AR

γονίδιο ενίσχυσης (n = 31), τα δεδομένα μας έδειξαν ότι

AR

mRNA εκφράστηκε σε παρόμοιο επίπεδο μεταξύ των δύο (W = 361,

P =

0,24).

(Α) διάγραμμα διασποράς καταδεικνύει τη συσχέτιση μεταξύ των δεδομένων FISH και έκφραση

AR

(n = 88). Ο άξονας Χ δείχνει το μέσο αριθμό των

AR

σήματα ανά πυρήνα. Ο άξονας Υ δηλώνει το

AR

επίπεδο mRNA ανιχνεύεται στη συστοιχία έκφρασης σε σχέση με το διάμεσο. Μαύρο ανοιχτοί κύκλοι σημαίνουν τα δείγματα με μέσο όρο λιγότερο από 2

AR

ανά πυρήνες. Μπλε τετράγωνα δηλώνουν δείγματα με αριθμό αντιγράφων κέρδος

AR

οφείλεται στην αύξηση της X. μαύρα τρίγωνα υποδηλώνουν δείγματα με

AR

γονίδιο ενίσχυσης. (Β) οικόπεδο διασποράς καταδεικνύει την επίδραση του

TMRPSS2

:

ERG

σύντηξης και

AR

έκφρασης για την αφθονία των

ERG

μεταγραφή (n = 80 ). Ο Χ και Υ-άξονας δείχνει τη σχετική αφθονία του mRNA της

AR

και

ERG

σε σύγκριση με το μέσο, ​​αντίστοιχα. Ανοικτή κύκλους και μαύρα τετράγωνα αντιπροσωπεύουν τους όγκους χωρίς και με το

TMPRSS2

:.

ERG

σύντηξης, αντίστοιχα

Η

Στη συνέχεια, αξιολόγησε την επίδραση του

TMPRSS2