Αφηρημένο

λογοτεχνίας που βασίζεται σε ανακάλυψη εστίαση Swanson για Αναβιώνοντας προηγουμένως δημοσιευθεί, αλλά παραμελημένη γνώσης. Σε αυτή τη μελέτη, προτείνουμε ένα μοντέλο δύο σταδίων της διαδικασίας ανακάλυψης και δημιουργούν μια υπόθεση μεταξύ ανανδαμιδίου και γαστρικού καρκίνου. Περαιτέρω, η πιθανή σχέση επιβεβαιώθηκε με παρακολούθηση πειραματισμό. Η θεραπεία ανανδαμιδίου οδήγησε σε ανακατανομή του κυτταρικού κύκλου των γαστρικών καρκινικών κυττάρων. Το πιο σημαντικό, η διακύμανση του κυτταρικού κύκλου που προκαλείται από μερικά γονίδια από τα Β-πλευράς της κλειστής ανακάλυψη, υποδεικνύοντας τον πιθανό ρόλο της Β-πλευράς. βιβλιογραφία που βασίζεται σε ανακάλυψη Swanson που συγκεντρώνει όχι μόνο τα δεδομένα για τις πιθανές αλληλεπιδράσεις, αλλά παρέχει επίσης τη δυνατότητα να παρατηρήσουμε το μεγαλύτερο παρασκήνιο πίσω από αυτές τις άμεσες συνδέσεις και είναι ένα ανεκτίμητο εργαλείο για την ανακάλυψη οι ερευνητές

Παράθεση:. Dong W, Liu Υ, Zhu W, Mou Q, Γουάνγκ J, Προσομοίωση Λογοτεχνία-Based Discovery Swanson Χου Υ (2014): Η ανανδαμίδη Θεραπεία αναστέλλει την ανάπτυξη των κυττάρων του καρκίνου του γαστρικού

In Vitro

και

in silico

. PLoS ONE 9 (6): e100436. doi: 10.1371 /journal.pone.0100436

Επιμέλεια: Valli De Re, Centro di Riferimento Oncologico, IRCCS Εθνικό Ινστιτούτο Καρκίνου, Ιταλία

Ελήφθη: 12 Ιαν 2014? Αποδεκτές: 25 Μαΐου 2014? Δημοσιεύθηκε: 20 Ιουνίου 2014

Copyright: © 2014 Dong et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτή η μελέτη χρηματοδοτήθηκε από την κινεζική Γηριατρικής Ογκολογίας (πρόγραμμα ογκολογίας, χορηγεί CGOS-03-2013-1-1-00600). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Η ταχεία ανάπτυξη της επιστήμης έχει οδηγήσει σε μια εκθετική αύξηση της βάσης των γνώσεων μας. Κατά συνέπεια, είναι πολύ δύσκολο για ιατρικούς ερευνητές για να ανακτήσετε και να ενσωματώσει τις πιο σχετικές, ενημερωμένες πληροφορίες από την καθημερινή κατακλυσμό της δημοσιευμένης βιβλιογραφίας. Για παράδειγμα, ο συνολικός αριθμός των δημοσιεύσεων αναπροσαρμόζονται από τον όρο αναζήτησης «γαστρικό καρκίνο» αυξήθηκε περισσότερο από 4 φορές το 2012 σε σύγκριση με το 1980. Συχνά, η πιο σχετική πληροφόρηση τείνει να παραβλέπονται ή να αγνοούνται σε τρέχουσες μελέτες [1]. Επιπλέον, με την αύξηση της εξειδίκευσης στους τομείς της επιστήμης και της τεχνολογίας, υπάρχουν μεγαλύτερες προκλήσεις στην ανταλλαγή πληροφοριών cross-λειτουργικά, ως επιστημονική κατανόηση γίνεται όλο και πιο εστιασμένη και λιγότερο διαφοροποιημένη. Ωστόσο, μια ουσιαστική σχέση πρέπει να υπάρχει μεταξύ των διαφόρων τομέων της έρευνας. Ως εκ τούτου, είναι πιο σημαντικό να καθοριστεί το αγνόησε τη γνώση από την ίδια την ανάπτυξη της πληροφορίας [2].

Swanson (1990) ανέπτυξε και εφάρμοσε ένα νέο εργαλείο για να εξορύξουν την υπάρχουσα βάση γνώσεων για λαθραία ή υποαναφορά σχέσεις, και να αναστήσει προηγουμένως δημοσιευθεί αλλά παραμελημένη υποθέσεις, μια διαδικασία γνωστή ως βιβλιογραφία που βασίζεται σε ανακάλυψη [3]. Αυτή η διαδικασία λειτουργεί ως τρόπος σύνδεσης 2 φαινομενικά άσχετες συμπεράσματα, εάν αναφέρεται σε αυτή τη μορφή: αν το «Α σχετίζεται με Β» και «Β σχετίζεται με C», τότε η υπόθεση ότι «Α προκαλεί C» Συνιστάται έντονα [4 ]. Αν και αυτή η προσέγγιση δεν παρέχει μια οριστική απόδειξη, η ανακάλυψη είναι, από μόνη της, πολύ χρήσιμη για την αποκάλυψη προηγουμένως άγνωστη σχέσεις [5]. Περαιτέρω, μπορεί να βοηθήσει τους ερευνητές πρόσβαση σε πλαίσιο και η δική μου γνώση που δεν μπορεί να αποκαλυφθεί χρησιμοποιώντας ένα παραδοσιακό αναζήτηση.

Στην παρούσα μελέτη, πραγματοποιήσαμε μια προσέγγιση 2-βήμα για την προσομοίωση της βιβλιογραφίας που βασίζεται σε μεθοδολογία ανακάλυψης Swanson σε 2 στους τομείς της βιολογικής έρευνας λογοτεχνίας που κανονικά δεν βιβλιογραφικά σύνδεση: καρκίνο του στομάχου και την ψυχολογία. Γαστρικό καρκίνος είναι μία από τις πιο συχνά διαγιγνώσκονται καρκίνοι, η δεύτερη κύρια αιτία θανάτου από καρκίνο που σχετίζονται με όλο τον κόσμο, και ένα σοβαρό πρόβλημα για τη δημόσια υγεία [6]. Προηγούμενη έρευνα έχει επίσης αποδειχθεί ότι μια ποικιλία των ψυχολογικών παραγόντων που μπορεί να έχουν σημαντική επίδραση στις σωματικές ασθένειες. Ωστόσο, η σχέση μεταξύ καρκίνου του στομάχου και της ψυχολογίας έχει προηγουμένως παραμεληθεί. Ως εκ τούτου, επιλέχθηκαν αυτά τα 2 πεδία της έρευνας με στόχο την εξεύρεση μιας παραμεληθεί κοινή σύνδεση.

Η διαδικασία ανακάλυψης 2-βήμα δημιουργείται μια υπόθεση σχετικά με τη συσχέτιση μεταξύ του ανανδαμιδίου και καρκίνου του στομάχου και εφόσον μια πιθανή κοινή μοριακό δίκτυο που μπορεί να διαμεσολαβεί τις επιδράσεις. Η υπόθεση εξετάστηκε στη συνέχεια πειραματικά. Η ανανδαμίδη βρέθηκε να αναστέλλει την ανάπτυξη σε 4 κυτταρικές γραμμές γαστρικού καρκίνου, συμπεριλαμβανομένων BGC823, SGC7901, AGS, και Ν87. Η κυτταρομετρία ροής δεδομένα κατέδειξαν ότι η παρουσία επάγεται ανανδαμιδίου G2 /M διακοπή του κυτταρικού κύκλου σε κύτταρα AGS και Ν87. Επιπλέον, επιβεβαίωσε ότι ανανδαμιδίου μπορεί να ενεργήσει για τη ρύθμιση που σχετίζονται γονιδίων του κυτταρικού κύκλου, συμπεριλαμβανομένων CHEK1, CDKN1A, CDKN2A, που λαμβάνεται από την κλειστή διαδικασία ανακάλυψης. Συλλογικά, αυτά τα δεδομένα υποδεικνύουν ότι το ανανδαμίδιο επηρεάζει την κατανομή του κυτταρικού κύκλου των γαστρικών καρκινικών κυττάρων με τη ρύθμιση των ρυθμιστών του κύκλου Β-πλευράς κύτταρο, μια υπόθεση που ελέγχθηκε πειραματικά σε αυτή τη μελέτη, παρέχοντας έτσι ερευνητές με μία εναλλακτική άποψη σχετικά με το ρόλο του ανανδαμιδίου. Χρησιμοποιώντας αυτή την προσέγγιση, ήμασταν σε θέση να κομμάτι με επιτυχία μαζί ένα προηγουμένως κρυφό σχέση μεταξύ 2 διαφορετικών πεδίων και προσθέτουν στη συνολική βάση γνώσεων.

Μέθοδοι και Υλικά