Αφηρημένο

Ιστορικό

Για να διευκρινιστούν οι γενετικές μεταλλάξεις που σχετίζονται με ενδοπορικού θηλώδη βλεννώδη νεοπλάσματα (IPMN) και IPMN που σχετίζονται με όγκους του παγκρέατος, που διεξάγεται σχετίζονται με τον καρκίνο γονίδιο αναλύσεων, χρησιμοποιώντας αγνά παγκρεατικό χυμό και εκτομή του παγκρέατος ιστούς.

Μέθοδοι

καθαρό παγκρέατος χυμός συλλέχθηκε από 152 ασθενείς [εννέα με ένα φυσιολογικό πάγκρεας, 22 με χρόνια παγκρεατίτιδα (CP), 39 με παγκρεατικού πόρου αδενοκαρκίνωμα (PDAC), και 82 με IPMN], και εκτομή ιστών από το πάγκρεας συλλέχθηκαν από 48 ασθενείς (έξι IPMNs και 42 PDACs ). Το εκχυλισμένο DNA ενισχύθηκε με αλυσιδωτή αντίδραση πολυπλεκτικό πολυμεράσης (PCR) με στόχο 46 γονίδια σχετίζονται με τον καρκίνο που περιέχει 739 μεταλλακτική hotspots. Οι μεταλλάξεις αναλύθηκαν χρησιμοποιώντας ένα sequencer DNA ημιαγωγών που βασίζονται.

Αποτελέσματα

Μεταξύ των 46 γονίδια που σχετίζονται με τον καρκίνο,

KRAS

και

Gnas

μεταλλάξεις ήταν πιο συχνά ανιχνεύεται σε δύο περιπτώσεις PDAC και IPMN. Σε καθαρή παγκρεατικό χυμό,

Gnas

μεταλλάξεις εντοπίστηκαν στο 7,7% των περιπτώσεων PDAC και 41,5% των περιπτώσεων IPMN (

σ

& lt? 0.001 έναντι άλλων). Όλα PDAC περιπτώσεις με

Gnas

μεταλλάξεις (n = 3), συνοδεύτηκαν από IPMN. Η πολυπαραγοντική ανάλυση έδειξε ότι

Gnas

μεταλλάξεις σε περιπτώσεις IPMN συνδέθηκαν με διατατική κύριο παγκρεατικό πόρο (ΔΠΠ,

σ

= 0,016), ενώ δεν παρατηρήθηκαν στατιστικά ανεξάρτητες συσχετίσεις με τις κλινικές μεταβλητές για

KRAS

μεταλλάξεις. Στα εκτομή του παγκρέατος ιστούς,

Gnas

μεταλλάξεις εντοπίστηκαν στο 50% των περιπτώσεων PDAC ταυτόχρονα με IPMN, το 33,3% των PDAC περιπτώσεις που προέρχονται από IPMN, και 66,7% των περιπτώσεων IPMN, ενώ δεν

Gnas

μεταλλάξεις εντοπίστηκαν σε περιπτώσεις PDAC χωρίς IPMN.

Συμπεράσματα

Το

Gnas

μετάλλαξη συγκεκριμένα βρέθηκαν σε περιπτώσεις με IPMN και είχε σκεφτεί ότι κάποιοι PDACs θα μπορούσε να είναι επηρεάζεται από την ταυτόχρονη, αλλά ξεχωριστά, βρίσκεται IPMN στο παθογόνο μηχανισμό τους. Επιπλέον, η

Gnas

μετάλλαξη σχετίζεται σημαντικά με MPD διάταση σε περιπτώσεις IPMN, γεγονός που υποδηλώνει το ρόλο της στην υπερέκκριση βλέννας

Παράθεση:. Takano S, M Fukasawa, Maekawa S, M Kadokura, Miura Μ , Shindo H, et al. (2014) Βαθιά αλληλουχίας των σχετιζόμενων με τον καρκίνο γονίδια αποκάλυψε

Gnas

Μεταλλάξεις να σχετίζεται με εντός του πόρου θηλώδες βλεννώδες νεοπλάσματα και τις κυριότερες παγκρεατικού πόρου Διαστολή του. PLoS ONE 9 (6): e98718. doi: 10.1371 /journal.pone.0098718

Επιμέλεια: Jörg Δ Hoheisel, Deutsches Krebsforschungszentrum, Γερμανία

Ελήφθη: 31 του Ιανουαρίου, 2014? Αποδεκτές: 2 Μαΐου του 2014? Δημοσιεύθηκε: 4 Ιουνίου 2014

Copyright: © 2014 Takano et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτό το έργο υποστηρίχθηκε από επιχορηγήσεις από το Υπουργείο Παιδείας, Πολιτισμού, Αθλητισμού, Επιστημών και Τεχνολογίας της Ιαπωνίας (25860527, https://www.jsps.go.jp/j-grantsinaid/) και από επιχορηγήσεις από το Ίδρυμα για την Πρόοδο της Επιστήμης Διεθνές (https://www.fais.or.jp/grant/fy25/01_file/2013_01members.pdf). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

εισαγωγή

εντός του πόρου θηλώδες νεόπλασμα βλεννώδες (IPMN) είναι ένα παγκρεατικό όγκο εξωκρινείς χαρακτηρίζεται από κυστική διάταση των κύριων ή /και του παγκρέατος υποκατάστημα αγωγούς? αυτές οι αγωγοί επενδεδυμένα με ένα παράγουν βλεννίνη άτυπα επιθήλιο που συχνά πολλαπλασιάζεται σε ένα θηλοειδή μόδα [1] – [3]. IPMN συνδέεται με ένα φάσμα ασθενειών που κυμαίνονται από αδένωμα σε διηθητικό πορογενές παγκρεατικό αδενοκαρκίνωμα (PDAC). PDAC μπορεί να προέρχεται από IPMN ή μπορεί να αναπτυχθεί ταυτόχρονα σε άλλες περιοχές μιας παγκρέατος στην οποία έχει αναπτυχθεί IPMN. Οι δύο IPMN σχετίζονται μορφές PDAC θεωρούνται ως διαφορετικές οντότητες ασθένεια λόγω των διαφορετικών proximities τους στην IPMN στο πάγκρεας. Ωστόσο, η πρόγνωση αυτών των IPMN σχετίζονται μορφές PDAC είναι συχνά καλύτερη από εκείνη των απλών PDAC εάν πρώιμη διάγνωση γίνεται [4], [5]. Σε αντίθεση, τα γενετικά χαρακτηριστικά των δύο αυτών IPMN που σχετίζονται με τις μορφές των PDAC και οι λόγοι για διαφορετικές προβλέψεις τους δεν είναι πλήρως κατανοητοί.

PDAC προκύπτει ως αποτέλεσμα της συσσώρευσης των γενετικών και επιγενετικών μεταλλάξεις που προσδίδουν μια επιλεκτική πλεονέκτημα για τα καρκινικά κύτταρα [6], [7]. Μεταλλάξεις στο

KRAS

,

CDKN2A

,

TP53

, και

Smad4

έχουν συχνά αναφερθεί σε περιπτώσεις PDAC χρησιμοποιώντας συμβατικές μεθόδους, όπως η άμεση αλληλούχιση [ ,,,0],8]. Πρόσφατα, η ανάλυση ολόκληρου exome χρησιμοποιώντας αλληλούχιση επόμενης γενιάς αποκάλυψε επίσης μεταβολές υψηλής συχνότητας σε αυτά τα λίγα γονίδια [6], [7], [9].

Σε αντίθεση, σωματικές ογκογονικές μεταλλάξεις στο νουκλεοτίδιο γουανίνης δεσμευτική πρωτεΐνη, άλφα διέγερσης (

Gnas

) που κωδικοποιεί την πρωτεΐνη G, έχουν πρόσφατα εντοπιστεί σε 41-66% των περιπτώσεων IPMN [10] – [12].

Gnas

μεταλλάξεις έχουν επίσης εντοπιστεί σε αρκετές όγκων του ενδοκρινικού συστήματος [13], ορισμένα αδενώματα της υπόφυσης [14], και το σύνδρομο McCune-Albright [15]. Αυτές οι μεταλλάξεις προκύπτουν από πολύ νωρίς στη φυσική ανάπτυξη των IPMN [10] και είναι εξαιρετικά ειδικό για IPMN [11], [12], [16]. Με εξαίρεση ένα μικρό ποσοστό των παγκρεατικών ενδο-επιθηλιακών νεοπλασιών (PanINs),

Gnas

μεταλλάξεις σπάνια έχουν ανιχνευθεί σε περισσότερες περιπτώσεις από PDAC ή άλλων κυστική νεοπλάσματα [11], [12], [16]. Ωστόσο, είναι άγνωστο το πώς η κλινική παρουσίαση της IPMN μπορεί να επηρεαστεί από

Gnas

μετάλλαξη. Επιπλέον, είναι επίσης άγνωστο αν οι IPMN σχετίζονται PDACs συνδέονται με

Gnas

μεταλλάξεις

Η ανίχνευση αυτών των μεταλλάξεων σε παγκρεατικό χυμό [17] – [21]. Ή σε δείγματα που λαμβάνονται με την ενδοσκοπική υπερηχογράφημα αναρρόφηση με λεπτή βελόνα (EUS-FNA) [22] βοηθά στη διάγνωση της πρώιμο στάδιο της νόσου. Ωστόσο, μόνο λίγα κοινά μεταλλαγμένα γονίδια μπορούν να αναλυθούν σε μικρά δείγματα λόγω των περιορισμών στη συμβατική τεχνολογία αλληλούχισης. Για να αντιμετωπιστούν αυτά τα όρια, ο προσδιορισμός αλληλουχίας επόμενης γενιάς ημιαγωγών που βασίζονται έχει πρόσφατα αναπτυχθεί και επέτρεψε την ταχεία, βαθιά, και οικονομικά αποδοτική αλληλουχίας ενός ευρέος φάσματος DNA από τις μικρές κλινικά δείγματα που λαμβάνονται [23].

η μελέτη αυτή, αλληλουχίας ημιαγωγών που βασίζονται χρησιμοποιήθηκε για τη διεξαγωγή ανάλυσης γονιδιακής μετάλλαξης σχετίζονται με τον καρκίνο του παγκρέατος για νεοπλάσματα χρησιμοποιώντας μικρά δείγματα ιστού. Χρησιμοποιώντας αγνά παγκρεατικό χυμό, διερευνήσαμε την μεταλλακτική προφίλ των παγκρεατικών νεοπλασμάτων και τη σύνδεση αυτού του προφίλ με τις κλινικές μεταβλητές. Επιπλέον, χρησιμοποιώντας εκτομή ιστών, συγκρίναμε τις διαφορές στην μεταλλακτική χαρακτηριστικών των δύο τύπων PDACs που σχετίζονταν με IPMN (PDAC προέρχεται από IPMN και PDAC ταυτόχρονη με IPMN).

Υλικά και Μέθοδοι

ασθενείς και δείγματα

Τα καθαρά παγκρέατος χυμοί και συναφείς κλινικές πληροφορίες λήφθηκαν από 152 περιπτώσεις [CP (χρόνια παγκρεατίτιδα), n = 22? PDAC, n = 39? IPMN, η = 82? φυσιολογικό πάγκρεας, n = 9] που υποβλήθηκαν σε θεραπεία στο Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο Yamanashi από 2000 το 2012 (μεταφορά Πίνακας 1). Ενδελεχή παγκρέατος εξετάσεις πραγματοποιήθηκαν σε όλες τις περιπτώσεις. Ενδοσκοπική nasopancreatic αποστράγγισης (ENPD) πραγματοποιήθηκε κατά τη διάρκεια της ενδοσκοπικής ανάδρομης χολαγγειοπαγκρεατογραφία (ERCP) για την απόκτηση του παγκρεατικού υγρού για κυτταρολογική εξέταση. Ελήφθη το καθαρό παγκρεατικό χυμό και αποθηκεύεται αμέσως σε -80 ° μέχρι τη χρήση. Σε περιπτώσεις με χολική νόσο και ένα κανονικό πάγκρεας, ο ENPD διεξήχθη για να αποφευχθεί η μετα-ERCP παγκρεατίτιδα, και τα συλλεγέντα παγκρεατικά υγρά ταξινομήθηκαν ως κανονικά παγκρεατικά περιπτώσεις στην ανάλυση. Οι διαχωρισμένοι ιστοί ελήφθησαν στο ίδιο νοσοκομείο από 2006 να 2012 από περιπτώσεις με IPMN (n = 6) και PDAC (n = 42), όπως φαίνεται στον Πίνακα 2. Από τα δείγματα ιστών PDAC, 21 είχαν macrodissected κατεψυγμένα δείγματα και 21 μικροτομή (FFPE) δείγματα παραφίνη-ενσωματωμένες φορμόλη-σταθερό, ενώ έξι από τα δείγματα IPMN ήταν κατεψυγμένα δείγματα. Η διάγνωση και η ταξινόμηση των IPMN βασίστηκαν στα διεθνή συναίνεση κατευθυντήριες γραμμές για τη διαχείριση των IPMN και βλεννώδες κυστική νεοπλάσματα του παγκρέατος, που ιδρύθηκαν το 2006 [1]. Η μελέτη αυτή εγκρίθηκε από την Επιτροπή Δεοντολογίας του Ανθρώπου αναθεώρηση του Πανεπιστημιακού Νοσοκομείου Yamanashi. Γραπτή συγκατάθεση λήφθηκε από όλους τους ασθενείς.

Η

DNA εξόρυξη

DNA από τα εκτομή ιστών εξήχθη χρησιμοποιώντας το QIAamp DNA Mini Kit (Qiagen, Valencia, CA, USA ) για τα κατεψυγμένα δείγματα και QIAamp DNA FFPE Kit (Qiagen) για τα δείγματα FFPE. DNA από το καθαρό παγκρεατικό υγρό εκχυλίζεται χρησιμοποιώντας το DNeasy Blood Mini Kit (Qiagen) σύμφωνα με τις οδηγίες του κατασκευαστή. Κατά μέσο όρο, 1,4 μg και 0,3 μg του DNA εκχυλίζονται από τα κατεψυγμένα δείγματα και δείγματα FFPE, αντίστοιχα, και περίπου 3-4 μα DNA εκχυλίζονται από 400 μL καθαρού παγκρεατικού χυμού.

Παρασκευή βιβλιοθηκών αμπλικονίου

Ο Ion AmpliSeq Panel Cancer (Life Technologies, Carlsbad, CA, USA) χρησιμοποιήθηκε για να δημιουργήσει βιβλιοθήκες αμπλικόνιο στόχου, όπως περιγράφηκε προηγουμένως [23]. Εν συντομία, 10 ng του DNA ενισχύθηκε με PCR χρησιμοποιώντας προ-αναμεμιγμένο Πισίνες Ion AmpliSeq Cancer Primer περιέχει 190 ζεύγη εκκινητών και ο AmpliSeq HiFi Master Mix (Ίων AmpliSeq Βιβλιοθήκη Kit, Life Technologies). Τα 190 πολυπλεγμένο αμπλικόνια υποβλήθηκαν σε επεξεργασία με Αντιδραστήριο Fupa (Life Technologies) για μερική πέψη των αλληλουχιών εκκινητή και φωσφορυλίωση. Τα αμπλικόνια στη συνέχεια συνδέθηκε σε προσαρμογείς από το ιόν Xpress Barcode Προσαρμογείς 1-16 Kit (Life Technologies) σύμφωνα με τις οδηγίες του κατασκευαστή. Μετά την πρόσδεση, τα αμπλικόνια υποβλήθηκαν nick-μετάφρασης και επιπλέον ενίσχυση της βιβλιοθήκης με PCR για να ολοκληρωθεί η σύνδεση μεταξύ των προσαρμογέων και αμπλικόνια. Η ευαισθησία του DNA BioAnalyser υψηλής Kit (Agilent, Santa Clara, CA, USA) χρησιμοποιήθηκε για να απεικονίσει το μέγεθος και το εύρος και για τον προσδιορισμό των συγκεντρώσεων της βιβλιοθήκης.

Γαλάκτωμα PCR και αλληλούχιση

Πολυπλεκτικά γραμμικό κώδικα βιβλιοθήκες ενισχύθηκαν με PCR γαλάκτωμα σε σωματίδια ιόντων Sphere (ISP) με τη χρήση του Ion One Touch 200 v2 Kit Template (Life Technologies) σύμφωνα με τις οδηγίες του κατασκευαστή. Αφού οι ISPs πρότυπο ανακτήθηκαν από το γαλάκτωμα, οι θετικές ISPs πρότυπο βιοτινυλιώθηκαν κατά τη διάρκεια της διαδικασίας γαλακτώματος και εμπλουτισμένο με Dynabeads MyOne Στρεπταβιδίνη C1 σφαιρίδια (Life Technologies). Διεξήχθη αλληλούχιση σε προσωπικό Genome Machine Sequencer (ϋίβ Technologies) χρησιμοποιώντας το Ion PGM 200 κιτ αλληλούχισης (Life Technologies) σύμφωνα με τις οδηγίες του κατασκευαστή. Δεδομένου ότι τα καρκινικά κύτταρα με DNA μεταλλαγμένου μπορεί να υπάρχουν ως ελάσσονα πληθυσμοί στα δείγματα λόγω των μικρών διαστάσεων μεταξύ των ολόκληρο καρκινικούς ιστούς και /ή τη μόλυνση με μη νεοπλασματικά κύτταρα, η ανάλυση βαθιά αλληλούχισης διεξήχθη σε αυτή τη μελέτη για την ανίχνευση μεταλλάξεων σε ένα ρυθμό τόσο χαμηλά όσο 1%. Torrent Software Suite v2.2 (Life Technologies) χρησιμοποιήθηκε για να αναλύσει το γραμμωτό κωδικό διαβάζει, να ευθυγραμμίσει διαβάζει στο γονιδίωμα αναφοράς, και να τρέξει μετρήσεις, συμπεριλαμβανομένης της απόδοσης τσιπ-φόρτωση και συνολικές μετρήσεις ανάγνωσης και την ποιότητα. Παραλλαγές προσδιορίστηκαν με το λογισμικό v2.0 Variant καλούντος (Life Technologies). Η αξία της ποιότητας του στοχευόμενου βάσης ορίστηκε σε 21, η οποία είναι ίση με 0,79% της πιθανότητας για σφάλμα στην ανίχνευση μετάλλαξης. Το όριο του λόγου ανίχνευσης μετάλλαξης ορίστηκε σε ≥1%. Ο Ion AmpliSeq Panel Καρκίνο (Life Technologies), το οποίο χρησιμοποιήθηκε στην ενίσχυση της βιβλιοθήκης, στοχεύει 739 θέσεις μετάλλαξης των 46 γονιδίων που σχετίζονται με τον καρκίνο που αναφέρθηκαν στον Κατάλογο Σωματικών Μεταλλάξεων Καρκίνου (COSMIC? Μεταλλάξεις hotspot) [24]? Αυτές οι μεταλλάξεις ανιχνεύονται hotspot αναλύθηκαν σε συνδυασμό με τις κλινικές μεταβλητές. Τα 46 γονίδια σχετίζονται με τον καρκίνο που απαριθμούνται στον οριζόντιο άξονα της γραφικής παράστασης στο Σχήμα 1 και Σχήμα 2.

Ο γ-άξονας του σχήματος αντιπροσωπεύει το ποσοστό των περιπτώσεων με μεταλλάξεις σε κάθε γονίδιο. A. Όχι μετάλλαξη ανιχνεύθηκε σε καθαρή παγκρεατικό χυμό από περιπτώσεις με φυσιολογικό πάγκρεας ιστό. Β

Gnas

μετάλλαξη ανιχνεύτηκε σε μία περίπτωση (4,5%) με CP (χρόνια παγκρεατίτιδα) και ένα μικρό κυστική βλάβη. Γ

Gnas

και

KRAS

μεταλλάξεις ανιχνεύθηκαν σε 7,7% (τρία από 39 περιπτώσεις) και 20,5% (οκτώ από τις 39 περιπτώσεις), αντίστοιχα, που είχαν αδενοκαρκίνωμα παγκρεατικού πόρου (PDAC). Η

Gnas

μετάλλαξη ανιχνεύτηκε σε όλες τις περιπτώσεις με ενδοπορικού θηλώδες νεόπλασμα βλεννώδες (IPMN, n = 3). Δ

Gnas

και

KRAS

μεταλλάξεις εντοπίστηκαν στο 41,5% (34 από 82 περιπτώσεις) και 39,0% (32 από 82 περιπτώσεις), αντίστοιχα, με IPMN.

Η

Ο γ-άξονας του σχήματος αντιπροσωπεύει το ποσοστό των περιπτώσεων με μεταλλάξεις σε κάθε γονίδιο. A. Στο εκτομή ιστού, η

KRAS

μετάλλαξη ανιχνεύτηκε σε 84,6% (22 από 26 περιπτώσεις) από τις περιπτώσεις παγκρεατικού πόρου αδενοκαρκίνωμα (PDAC) που δεν έχουν ενδοπορικού θηλώδες νεόπλασμα βλεννώδες (IPMN). Β

KRAS

και

Gnas

μεταλλάξεις εντοπίστηκαν σε 80% (οκτώ από τις 10 περιπτώσεις) και 50% (πέντε από 10 περιπτώσεις), αντίστοιχα, των περιπτώσεων PDAC ταυτόχρονα με IPMN. Γ

KRAS

και

Gnas

μεταλλάξεις εντοπίστηκαν στο 66,7% (τέσσερις από 6 περιπτώσεις) και 33,3% (δύο εκ των 6 περιπτώσεις), αντίστοιχα, των περιπτώσεων PDAC προέρχονται από IPMN. Δ

KRAS

και

Gnas

μεταλλάξεις ανιχνεύθηκαν σε 100% (n = 6) και 66,7% (τέσσερις από 6 περιπτώσεις), αντίστοιχα, του μη επεμβατική περιπτώσεις IPMN.

η στατιστική ανάλυση

Οι συσχετίσεις μεταξύ των μεταλλάξεων του γονιδίου και κλινικές μεταβλητές αξιολογήθηκαν χρησιμοποιώντας το ακριβές τεστ του Fisher ή το χ

2 δοκιμών και μεταβλητές με ένα

σ

αξία & lt? 0.2 ήταν περιλαμβάνονται στην πολυπαραγοντική ανάλυση. Συνεχής δεδομένα όπως το μέγεθος κύστη και την παρουσία του τοιχογραφία οζιδίων κατηγοριοποιήθηκαν σύμφωνα με λειτουργικού χαρακτηριστικού δέκτη ανάλυση (ROC) (τα δεδομένα δεν παρουσιάζονται). Για την πολυπαραγοντική ανάλυση, χρησιμοποιήθηκε ένα μοντέλο λογιστικής πολλαπλής παλινδρόμησης, και

σ

-τιμή & lt?. 0.05 θεωρήθηκε ως σημαντική

Αποτελέσματα

Βαθιά ανάλυση της αλληλουχίας των 46 σχετίζονται με τον καρκίνο γονίδια σε καθαρή παγκρεατικό χυμό

Οι σχετίζονται με τον καρκίνο μεταλλάξεις στα γονίδια 46 αναλύθηκαν στην καθαρή παγκρεατικό υγρό των 152 περιπτώσεις, με μέσο όρο 2,114 διαβάζει ανά αμπλικόνιο. Τα εξάγεται παραλλαγές με τον κατάλογο των τροποποιημένα γονίδια, η συχνότητα παραλλαγή, διαβάστε το βάθος, και τα αντίστοιχα COSMIC αναγνωριστικά από τα δεδομένα βαθιά αλληλουχίας της κάθε υπόθεσης επισυνάπτεται ως υποστηρικτικές πληροφορίες σε αυτό το έγγραφο όπως το Microsoft Excel-σχηματοποιημένα αρχεία (File S1-S4) . Δεν μετάλλαξη ανιχνεύθηκε στο παγκρεατικό υγρό από τις εννέα περιπτώσεις με φυσιολογικό παγκρεατικό ιστό (Εικ. 1Α). Ένα

Gnas

μετάλλαξη ανιχνεύτηκε σε μία περίπτωση με εγκεφαλική παράλυση που συνοδεύτηκε από μια μικρή κύστη (5 mm)? αυτό μπορεί να ήταν αντιπροσωπευτικό ενός πρώιμου βλάβης IPMN (Εικ. 1 Β και Εικ. 3Α).

KRAS

,

Gnas

, και

TP53

μεταλλάξεις εντοπίστηκαν στις δύο περιπτώσεις PDAC και IPMN (Εικ. 1).

KRAS

μεταλλάξεις εντοπίστηκαν στο 20,5% των περιπτώσεων PDAC (

σ

= 0,0074 έναντι φυσιολογικό και CP) και 39,0% των περιπτώσεων IPMN (

σ

& lt? 0.001 vs . φυσιολογικό και CP).

Gnas

μεταλλάξεις εντοπίστηκαν στο 7,7% του PDAC περιπτώσεις και 41,5% των περιπτώσεων IPMN (

σ

& lt? 0.001 έναντι άλλων). IPMN ήταν παρούσα σε όλες τις PDAC περιπτώσεις που περιείχε το

Gnas

μετάλλαξη (n = 3).

Α. Μια περίπτωση του CP με μια μικρή κύστη (μπλε βέλος) που είχε το

Gnas

μετάλλαξη (Εικ. 1Β) σε καθαρό παγκρεατικό χυμό σε Μαγνητική Χολαγγειογραφία απεικόνισης (MRCP). B-D. PDAC με

Gnas

μεταλλάξεις διαφορετική από την ταυτόχρονη IPMN. Σε περιπτώσεις 30 (Β) και 31 (C), MRCP απεικόνιση αποκάλυψε στένωση στο MPD στον παγκρεατικό κεφάλι κοντά στο PDAC (κίτρινο βέλος). Το IPMN βρισκόταν στον παγκρεατικό σώμα (μπλε βέλος). Υπολογιστική τομογραφική απεικόνιση στην περίπτωση 28 (D) αποκάλυψε ότι η PDAC βρισκόταν στο παγκρέατος σώμα (κίτρινο βέλος), ενώ η IPMN βρισκόταν στην κεφαλή του παγκρέατος (μπλε βέλος). Ο κατάλογος των περιπτώσεων Β-D φαίνεται στον Πίνακα 4.

Η

Από την ανάλυσή μας έδειξε ότι το

Gnas

μετάλλαξη ήταν ειδικά για IPMN, οι συσχετίσεις μεταξύ των επιλεγμένων κλινικών μεταβλητών και

Gnas

κατάσταση στις 82 IPMN περιπτώσεις αναλύθηκαν στατιστικά για να διευκρινιστεί η κλινική σημασία και τη σπουδαιότητα του

Gnas

μετάλλαξη στο παγκρεατικό υγρό. Η μονοπαραγοντική ανάλυση αποκάλυψε μια σχέση μεταξύ του

Gnas

μετάλλαξη και τον τύπο IPMN (κύριο είδος αγωγού) και το ποσό της διαστολής (≥6 mm) στο MPD (Πίνακας 3). Στην πολυπαραγοντική ανάλυση, μόνο ΔΠΠ διάταση συσχετίστηκε ανεξάρτητα με το

Gnas

μετάλλαξη (Πίνακας 3). Από την άλλη πλευρά, η

KRAS

μετάλλαξη που σχετίζεται με την τοποθεσία (σώμα του παγκρέατος και της ουράς,

σ

= 0,044) και την ποσότητα του διάταση (≥6 mm) στο MPD (

σ

= 0,01) από την μονοπαραγοντική ανάλυση? Ωστόσο, δεν υπήρξε καμία ανεξάρτητη κλινική συσχέτιση με αυτή τη μετάλλαξη μετά την πολυμεταβλητή ανάλυση (τα δεδομένα δεν παρουσιάζονται).

Η

Βαθιά ανάλυση αλληλουχίας του 46 γονιδίων που σχετίζονται με τον καρκίνο σε εκτομή ιστούς παγκρεατικού όγκου

Μετά βρήκαμε το

Gnas

μετάλλαξη σε περιπτώσεις που είχαν PDAC ταυτόχρονα με IPMN, καθώς και σε περιπτώσεις που είχε μόνο IPMN από την ανάλυση του παγκρεατικού υγρού, έχουμε την επόμενη αλληλουχία δείγματα ιστού για τον προσδιορισμό των πιθανών τύπων μεταλλάξεων στο IPMN , PDAC προέρχεται από IPMN, PDAC που ήταν με ταυτόχρονη IPMN και PDAC μόνο. Ο προσδιορισμός της αλληλουχίας πραγματοποιήθηκε σε 48 εκτομή του παγκρέατος (PDAC χωρίς IPMN, n = 26? PDAC ταυτόχρονη με IPMN, η = 10? PDAC προέρχεται από IPMN, η = 6? Μη επεμβατική IPMN, η = 6? Εικ. 2). Ο μέσος αριθμός των διαβάζει ανά amplicon ήταν 2.582. Τα εξάγεται παραλλαγές με τον κατάλογο των τροποποιημένα γονίδια, η συχνότητα παραλλαγή, διαβάστε το βάθος, και τα αντίστοιχα COSMIC ID από τα δεδομένα βαθιά αλληλουχίας κάθε περίπτωση έχουν συνδεθεί με αυτό το χαρτί, όπως υποστηρίζουν πληροφορίες στο Microsoft Excel-σχηματοποιημένα αρχεία (File S5-S8) .

KRAS

μεταλλάξεις εντοπίστηκαν στο 84,6% των PDAC περιπτώσεις χωρίς IPMN, το 80% των PDAC περιπτώσεις που ήταν ταυτόχρονη με IPMN, 66,7% των PDAC περιπτώσεις που προήλθαν από IPMN, και 100% των περιπτώσεων IPMN.

Gnas

μεταλλάξεις εντοπίστηκαν στο 50% των περιπτώσεων PDAC που ήταν ταυτόχρονη με IPMN (

σ

= 0.0007 έναντι PDAC χωρίς IPMN), το 33,3% των PDAC περιπτώσεις που προήλθαν από IPMN (

σ

= 0.03 vs. PDAC χωρίς IPMN), και 66,7% των περιπτώσεων IPMN (

σ

= 0,0004 έναντι PDAC χωρίς IPMN), ενώ δεν

εντοπίστηκαν Gnas

μεταλλάξεις σε περιπτώσεις PDAC χωρίς IPMN.

Gnas

μεταλλάξεις έτσι ανιχνεύονται μόνο σε IPMN και IPMN που σχετίζονται με PDAC (PDAC ταυτόχρονα με IPMN και PDAC προέρχονται από IPMN). Μια λεπτομερής κατάλογος των μεταλλάξεων του γονιδίου παρέχεται στον Πίνακα 4. Έτσι, παρόμοια χαρακτηριστικά σε γονιδιακές μεταλλάξεις παρατηρήθηκαν για τις τρεις αυτές κατηγορίες νόσου (Πίνακας 4).

Η

Ακτινολογικής εικόνες PDAC ταυτόχρονα με IPMN

Οι ακτινολογικές εικόνες για τις περιπτώσεις 28, 30, και 31 στον πίνακα 4 φαίνεται στο Σχήμα 3 ως εκπρόσωπος εικόνες που αποδεικνύεται PDAC ταυτόχρονα με IPMN. Σε αυτές τις περιπτώσεις, το

Gnas

μεταλλάξεις εντοπίστηκαν σε PDAC και η συνακόλουθη IPMN βρισκόταν σε μια ξεχωριστή περιοχή του παγκρέατος. Για παράδειγμα, παγκρεατικό στενώσεις αγωγός, ως αποτέλεσμα της PDAC ήταν εμφανής στην κεφαλή του παγκρέατος σε περίπτωση 30 (Σχ. 3Β) και θήκη 31 (Σχ. 3C), ενώ η IPMN ήταν ορατή στον παγκρεατικό σώμα. Στην περίπτωση 28 (Σχ. 3D), ένα χαμηλής πυκνότητας μάζας βλάβη PDAC και τις πολλαπλές κυστικές αλλοιώσεις του IPMN προφανώς διαχωρίστηκαν στο πάγκρεας.

Σύλλογος τύπων μεταλλάξεων μεταξύ παγκρεατικό χυμό και εκτομή του παγκρέατος ιστούς όγκου

Μερικά γονίδια όπως

ATM

,

BRAF

,

IDH1

, και

RB1 ​​

ανιχνεύθηκαν μόνο στον παγκρεατικό υγρό (Εικ . 1), αλλά όχι στα εκτομή ιστούς (Σχ. 2). Αντίθετα, το ποσοστό των περιπτώσεων με μεταλλάξεις του

KRAS

ή

Gnas

ήταν υψηλότερη στις εκτομή ιστούς σε σχέση με το παγκρεατικό υγρό (Εικ. 1, 2). Για να διερευνηθεί αν τα προφίλ μεταλλάξεων του παγκρεατικού χυμού αντιπροσωπεύεται σωστά εκείνες των παγκρεατικών όγκων, οι προφίλ μεταλλάξεων μεταξύ του παγκρεατικού υγρού και εκτομή ιστών παγκρεατικού όγκου συγκρίθηκαν σε 21 περιπτώσεις για τις οποίες τα δύο δείγματα ήταν διαθέσιμα. Μεταξύ των

KRAS

(n = 17) και

Gnas

(n = 7) μεταλλάξεις που βρέθηκαν στις 21 εκτομή ιστών του παγκρέατος όγκου, η

KRAS

και

Gnas

μεταλλάξεις ανιχνεύθηκαν στο παγκρεατικό υγρό σε 41,2% (7/17) και 71,4% (5/7) των περιπτώσεων, αντίστοιχα (Πίνακας 5), υποδεικνύοντας ότι η ευαισθησία του παγκρεατικού υγρού για την ανίχνευση μεταλλάξεων του παγκρεατικών όγκων μπορεί να φθάσει το 50% περίπου. Αν κοιτάξουμε τις λεπτομέρειες μεταξύ των

KRAS

(n = 11) και

Gnas

(n = 4) μεταλλάξεις που βρέθηκαν στα εκτομή του παγκρέατος ιστούς των περιπτώσεων PDAC the15,

KRAS

και

Gnas

μεταλλάξεις ανιχνεύθηκαν στο παγκρεατικό υγρό από 27,3% (3/11) και 50% (2/4) των περιπτώσεων, αντίστοιχα. Μεταξύ των

KRAS

(n = 6) και

Gnas

(n = 3) μεταλλάξεις που βρέθηκαν στα εκτομή του παγκρέατος ιστών από τις έξι περιπτώσεις IPMN,

KRAS

και

Gnas

μεταλλάξεις ανιχνεύθηκαν στο παγκρεατικό υγρό σε 66,7% (4/6) και 100% (3/3) των περιπτώσεων, αντιστοίχως. Το ποσοστό των περιπτώσεων με μεταλλάξεις ήταν υψηλότερα σε σχέση με το IPMN PDAC? Ως εκ τούτου, πιστεύαμε ότι οι μεταλλάξεις ανιχνεύονται στο παγκρεατικό υγρό θα μπορούσε να είναι εναλλακτικός τρόπος για να μετρήσει τις μεταλλάξεις σε αυτά από ιστούς τουλάχιστον στις περιπτώσεις με IPMN, σύμφωνα με αυτή την ανάλυση. Ως αποτέλεσμα, αναλύσαμε τη συσχέτιση μεταξύ των κλινικών μεταβλητών και

Gnas

κατάσταση με τον παγκρεατικό χυμό σε περιπτώσεις με IPMN.

Η

Συζήτηση

Σε αυτή τη μελέτη , της αλληλουχίας του DNA ημιαγωγών που βασίζονται πραγματοποιήθηκε σε κλινικά δείγματα που λαμβάνονται από καθαρό χυμό του παγκρέατος και εκτομή παγκρεατικού ιστού, με έμφαση στην IPMN και IPMN που σχετίζονται με όγκους. Η ανάλυση του παγκρεατικού υγρού αποκάλυψε ότι η

Gnas

μετάλλαξη ήταν ειδικά για IPMN και ότι το

Gnas

μετάλλαξη συγκεκριμένα σχετίζεται με IPMN με MPD διάταση. Η ανάλυση των εκτομή ιστών σε σχέση με το

Gnas

κατάστασης μεταλλάξεων έδειξαν ότι IPMN που σχετίζονται με PDAC (τόσο PDAC ταυτόχρονα με IPMN και PDAC προέρχεται από IPMN) μοιράζονται παρόμοια μετάλλαξης χαρακτηριστικά και ότι αυτά τα χαρακτηριστικά διέφεραν από αυτά των απλών PDAC.

Μεταξύ των 46 γονίδια που σχετίζονται με τον καρκίνο αλληλουχία στη μελέτη μας,

KRAS

και

Gnas

μεταλλάξεις ανιχνεύθηκαν με υψηλή συχνότητα, ενώ άλλοι συμπεριλαμβανομένων των

TP53

,

Smad4

, και

CDKN2A

μεταλλάξεις εντοπίστηκαν μόνο σε λίγες περιπτώσεις, όπως προαναφέρθηκε. Επειδή υπήρξαν πολλές προηγούμενες εκθέσεις που έχουν αναλυθεί

KRAS

μεταλλάξεις σε PDAC ή IPMN, επικεντρώσαμε την ανάλυσή μας για το

Gnas

μετάλλαξη. Οι πρόσφατες εξελίξεις στην αλληλούχιση επόμενης γενιάς έχουν αποκαλύψει λεπτομερής γενετικές αλλοιώσεις σε περιπτώσεις με PDAC [6], [7], [9] και IPMN [12], [16]. Jones et al [7], Biankin et al [9], και Wang et al [6] διεξάγεται ανάλυση της αλληλουχίας σε ολόκληρο exome του παγκρέατος PDAC και αποκάλυψε ότι

KRAS

,

TP53

,

Smad4,

και

CDKN2A

ήταν οι πιο συχνά μεταβάλλονται τα γονίδια, όπως αναφέρθηκε προηγουμένως [8]. Από αυτά τα τέσσερα γονίδια, οι μεταλλάξεις για το

TP53

,

Smad4

, και

CDKN2A

γονίδια εντοπίστηκαν σε λίγες μόνο περιπτώσεις με PDAC στη μελέτη μας. Αν και ομόζυγη διαγραφή έχει αναφερθεί στο

Smad4

και

CDKN2A

γονίδια σε προηγούμενες μελέτες [8], ακριβής προσδιορισμός του ομόζυγη διαγραφή σε κλινικά δείγματα ήταν δύσκολη λόγω της μόλυνσης του DNA από τα φυσιολογικά κύτταρα . Ωστόσο, η επιτυχής ανίχνευση ομόζυγη εξάλειψη του DNA ήταν δυνατό για αυτά τα γονίδια στην ανάλυση της καθαρής παγκρεατικού καρκίνου κυτταρικές γραμμές (δεν παρουσιάζονται τα δεδομένα). Επειδή μόνο το 73

TP53

hot spot μεταλλάξεις ανάμεσα από περισσότερες από 1000 θέσεις μετάλλαξης που αναφέρονται στην κοσμική βάση δεδομένων έγιναν στόχος από τις πισίνες Ion AmpliSeq Καρκίνος Primer και, επιπλέον, χρησιμοποιήθηκαν [24] δείγματα χαμηλού όγκου-κυτταροβρίθεια, η

TP53

αλλαγές μπορεί να έχουν υποτιμηθεί στη μελέτη μας. Αυτά τα γονίδιο μεταβολές θα μπορούσαν να έχουν ανιχνευθεί με άλλες μεθόδους, όπως ανοσοϊστοχημεία ή ανάλυση διακύμανσης αριθμού αντιγράφων. Φαινόταν περίεργο ότι ορισμένες μεταλλάξεις όπως

ATM, BRAF, IDH1

, και

RB1 ​​

ανιχνεύθηκαν μόνο στον παγκρεατικό χυμό και όχι σε εκτομή δείγματα. Ωστόσο, δεδομένου ότι κάθε ιστός που χρησιμοποιείται για την ανάλυση ήταν μόνο ένα μέρος του όλου όγκου, ήταν πιθανό ότι η παγκρεατικό υγρό θα μπορούσε να είναι πιο αντιπροσωπευτικά των μεταλλάξεων από ολόκληρο όγκου σε ορισμένες συνθήκες.

Wu et al [16 ] και Furukawa et al [12] πραγματοποιήθηκε αλληλούχιση ολόκληρου exome των IPMN από εκτομή ιστών και διαπίστωσε ότι

KRAS

,

Gnas

, και

RNF43

ήταν συχνά μεταλλαγμένα γονίδια. Σε αυτή τη μελέτη, η

KRAS

και

Gnas

μεταλλάξεις ανιχνεύθηκαν επίσης στον παγκρεατικό χυμό και εκτομή ιστών από τις περιπτώσεις που με IPMN.

Gnas

μεταλλάξεις έχουν αναφερθεί σε αρκετές νεοπλάσματα στο ενδοκρινικό σύστημα [13], [24], ορισμένα αδενώματα της υπόφυσης [14], και το σύνδρομο McCune-Albright [15].

Gnas

μεταλλάξεις έχουν επίσης αναφερθεί στο παρελθόν σε IPMN [11], [12] υποθέσεις που είχε παγκρέατος κύστεις [10], [12], [16] με ένα ποσοστό ανίχνευσης του 41-66% από εκτομή ιστών , παγκρεατικό υγρά κύστη, ή σεκρετίνη-διεγερμένα παγκρεατικό υγρό συλλέγεται από το δωδεκαδάκτυλο. Πιο πρόσφατα, έχει αναφερθεί ότι ενδοπορικού θηλώδη νεοπλάσματα του χοληδόχου πόρου [25], [26], πυλωρού αδένωμα αδένας του στομάχου και του δωδεκαδακτύλου [27], και χαμηλής ποιότητας appendiceal βλεννώδες νεοπλάσματα [28] έμοιαζε IPMN ιστολογικά και ότι αυτές νεοπλάσματα είχε μια υψηλή συχνότητα

Gnas

μεταλλάξεις.

Gnas

κωδικοποιεί την α-υπομονάδα μιας διεγερτικής Ο-πρωτεΐνης (Οαδ) και μιας μετάλλαξης στο

Gnas

προκαλεί την συστατική ενεργοποίηση της αδενυλύλ κυκλάσης και ένα ανυψωμένο επίπεδο cAMP [29], [30 ]. Αν και οι ρόλοι /λειτουργίες του

Gnas

μεταλλάξεις σε IPMN ή PDAC δεν έχουν διευκρινιστεί, αυτές οι μεταλλάξεις μπορεί να σχετίζεται περισσότερο με την έναρξη του όγκου από ό, τι με την εξέλιξη του όγκου, επειδή η μετάλλαξη έχει επίσης παρατηρηθεί σε όγκους χαμηλής ποιότητας [ ,,,0],10], [12]. Στη μελέτη μας,

Gnas

μεταλλάξεις εντοπίστηκαν στο 41,5% της καθαρής παγκρεατικού υγρού και 66,7% των εκτομή δείγματα ιστών από τις περιπτώσεις με IPMN? τα ποσοστά αυτά μετάλλαξη ήταν σχεδόν ίσα με αυτά σε προηγούμενες εκθέσεις. Σε αντίθεση,

KRAS

μεταλλάξεις έχουν αναφερθεί σε εκτομή ιστούς τόσο από IPMN και PDAC, με τις αντίστοιχες σειρές ποσοστό ανίχνευσης 48-81% [12], [16] και 78-100% [7], [ ,,,0],9], [12], υποδεικνύοντας ότι

KRAS

μεταλλάξεις μπορούν να συνδέονται και με τα δύο ασθένειες? Ωστόσο, ο ρυθμός μετάλλαξης ήταν κάπως υψηλότερο σε PDAC. Η

KRAS

ποσοστά ανίχνευσης μετάλλαξης στη μελέτη μας ήταν ισοδύναμες με τις μελέτες των εκτομή ιστών τόσο στο IPMN και PDAC περιπτώσεις.

Gnas

μεταλλάξεις που σχετίζονται με MPD διάταση σε IPMN περιπτώσεις μέσα από την πολυπαραγοντική ανάλυση. Kanda et al ανέφεραν μια ανεξάρτητη ένωση

Gnas

μεταλλάξεις με την ανάπτυξη πολλαπλών κύστεων σε περιπτώσεις με παγκρέατος κύστεις και Marco et al ανέφεραν ότι IPMN με ένα εντερικό φαινότυπο έχει συνδεθεί πάντα με το

Gnas

μεταλλάξεις [10], [31]. Τα δεδομένα μας επιβεβαίωσε την ειδικότητα του

Gnas

μεταλλάξεις σε IPMN και πρότεινε ένα λειτουργικό ρόλο του

Gnas

μεταλλάξεις στο σχηματισμό IPMN. Ειδικότερα, δεδομένου ότι MPD διαστολή χωρίς απόφραξη IPMN έχει γενικά θεωρείται ότι είναι το αποτέλεσμα της υπερέκκρισης βλέννας,

Gnas

μεταλλάξεις μπορεί να έχει ένα ρόλο στην ρύθμιση προς τα άνω του υπερέκκριση βλέννας. Στην πραγματικότητα, έχει αναφερθεί πρόσφατα ότι η εισαγωγή του

Gnas

μετάλλαξη σε καλλιεργημένα κύτταρα οδηγεί στην προς τα πάνω ρύθμιση του βλεννίνης γονιδίων, υποστηρίζοντας την υπόθεση μας [32]. Μια πρόσφατη μελέτη που αναφέρουν την υψηλή συχνότητα του

Gnas

μετάλλαξη, ιδιαίτερα στο εντερικό τύπο IPMN που έχει εμφανή παραγωγή βλέννας, υποστήριξε τα αποτελέσματά μας, καθώς και [31]. Περαιτέρω μελέτες για μια πιθανή αιτιακή σχέση μεταξύ

Οι Gnas

μεταλλάξεις και MPD διάταση δικαιολογημένη.

παρατηρήθηκαν παρόμοιες μορφές μετάλλαξης των γονιδίων του καρκίνου που σχετίζονται μεταξύ του PDAC που ήταν ταυτόχρονη με IPMN και η PDAC προέρχεται από IPMN σε αυτή τη μελέτη. Σε προηγούμενες μελέτες,

Gnas

μεταλλάξεις δεν έχουν ανιχνευθεί σε απλούς PDAC με μερικές εξαιρέσεις [12], [33]. Συμβατικά, αυτοί οι όγκοι έχουν ταξινομηθεί σε τρεις ομάδες: συνήθεις PDAC, PDAC ταυτόχρονα με IPMN και PDAC προέρχονται από IPMN [4], [5]. Μία σχηματική κατάταξη των PDAC από την άποψη της σχέσης με IPMN παρέχεται στην εικόνα 4. Στην συνήθη PDAC, δεν IPMN προσδιορίζεται στο πάγκρεας (Σχ. 4Α). PDAC προέρχεται από IPMN είναι μια επεμβατική καρκίνου κατά την οποία μπορεί να παρατηρηθεί μια ιστολογική μετάβαση από IPMN να PDAC (Εικ. 4C) [4]. Από την άλλη πλευρά, η ταυτόχρονη PDAC με IPMN είναι ένα αδενοκαρκίνωμα του πόρου που θεωρείται ότι είναι μια διαφορετική οντότητα ασθένεια από την PDAC προέρχεται από IPMN (Σχήμα 4D).? οι βλάβες PDAC είναι ξεχωριστή και διακριτή από τις συνακόλουθες βλάβες IPMN στο πάγκρεας σε ακτινολογική απεικόνιση και ιστολογική εξέταση. Μια ετήσια συχνότητα εμφάνισης ενός ανεξάρτητου PDAC ανάπτυξη 0,8 έως 4,1% έχει αναφερθεί σε περιπτώσεις με IPMN τη διάρκεια της παρακολούθησης [5], [34] – [36]. Παρά το γεγονός ότι PDAC ταυτόχρονα με IPMN μπορεί να αναπτυχθεί ανεξάρτητα από IPMN, βιολογική συμπεριφορά του μοιάζει με εκείνη του PDAC προέρχονται από IPMN διότι το αποτέλεσμά του είναι πιο ευνοϊκή σε σύγκριση με τα αποτελέσματα των απλών PDAC. Παρά το γεγονός ότι μια άλλη έκθεση που σπουδάζουν

Gnas

κατάσταση στην PDAC ταυτόχρονα με IPMN δεν έδειξε μετάλλαξη σε έξι PDAC ταυτόχρονα με τις περιπτώσεις IPMN, ευαισθησία ανίχνευσης τους μπορεί να ήταν χαμηλότερο από το αναμενόμενο, επειδή ανιχνεύθηκε μόνο

Gnas

μεταλλάξεις στο 1 από 6 IPMN περιπτώσεων [37]. Από την μεταλλάξεων μοτίβο

Gnas

παρατηρήθηκε σε αυτή τη μελέτη, έχουμε σκεφτεί ότι PDAC ταυτόχρονα με IPMN και PDAC προέρχεται από IPMN μπορούν να μοιράζονται κάποια παρόμοια μοριακών μηχανισμών με την παθογένεια της PDAC.

Α. Η

KRAS

μετάλλαξη ανιχνεύτηκε σε τακτική PDAC χωρίς IPMN. Β

KRAS

και

Gnas

μεταλλάξεις εντοπίστηκαν σε IPMN. Γ

KRAS

και

Gnas

μεταλλάξεις εντοπίστηκαν σε PDAC προέρχονται από πρωτογενή IPMN. Δ

KRAS

και

Gnas

μεταλλάξεις εντοπίστηκαν όχι μόνο στην IPMN αλλά και σε PDAC που αναπτύχθηκε ξεχωριστά από IPMN.

Η

Η έρευνά μας απέδειξε ότι ο καρκίνος-σχετικών γονίδιο προφίλ με αλληλούχιση ημιαγωγών που βασίζονται είναι δυνατή με τη χρήση μικρών κλινικά δείγματα. Από την άλλη πλευρά, η ευαισθησία ανίχνευσης ήταν κάπως χαμηλότερη στην ανάλυσή μας, εν μέρει λόγω της ανεπαρκούς βάθους αλληλούχισης για κάθε γονίδιο για ένα μεγάλο αριθμό γονιδίων στοχευμένες σε μία μόνο ανάλυση.