Αφηρημένο

Ιστορικό

ομάδα Pigmentosum ξηροδερμίας συμπλήρωσης C γονίδιο (XPC) είναι ένα βασικό μέλος του νουκλεοτιδίου επισκευή εκτομής Pathway και παίζει σημαντικό ρόλο στο σύστημα των ανθρωπίνων επιδιόρθωση του DNA. Έχει αναφερθεί ότι οι διάφοροι κοινοί πολυμορφισμοί του XPC συνδέονται με ευαισθησία σε καρκίνο του πνεύμονα. Ωστόσο, το συμπέρασμα είναι ακόμα ασαφείς.

Μέθοδος

Αυτή η μετα-ανάλυση πραγματοποιήθηκε για να προσδιοριστεί η σχέση μεταξύ των πολυμορφισμών XPC (Lys939Gln, Ala499Val, και PAT) και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου του πνεύμονα. Δημοσιεύθηκε λογοτεχνίες εντοπίστηκαν από την αναζήτηση σε απευθείας σύνδεση βάσεις δεδομένων και καταλόγους αναφοράς των σχετικών μελετών. αναλογίες πιθανοτήτων (OR) και 95% διαστήματα εμπιστοσύνης (ΠΙ) υπολογίστηκαν για την εκτίμηση της αντοχής σύνδεσης. προκατάληψη δημοσίευση ανιχνεύτηκαν με τη δοκιμή Egger και Begg του.

Αποτέλεσμα

Μετά από αυστηρή διαλογή, εντοπίσαμε 14 επιλέξιμες μελέτες σε αυτό το μετα-ανάλυση, συμπεριλαμβανομένων των 5647 περιπτώσεων καρκίνου του πνεύμονα και 6908 ελέγχους. Με τη συγκέντρωση όλων των επιλέξιμων μελέτες, διαπιστώσαμε ότι η ομοζυγώτες Gln939Gln γονότυπος σχετίζεται με σημαντικά αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα στις ασιατικές πληθυσμού (GlnGln vs LysLys, OR = 1.229, 95% CI: 1,000 – 1,510? GlnGln vs LysLys /LysGln, Ή = 1.257, 95% CI: 1,038 – 1,522). Όσο για τον πολυμορφισμό PAT, σε Καυκάσιο πληθυσμό, βρήκαμε φορείς της – /- γονότυπος συσχετίστηκαν σημαντικά μειωμένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα στο μοντέλο σύγκριση ομοζυγώτες (- /- + /+, OR = 0,735, 95% CI vs: 0.567- 0,952)

Συμπέρασμα

σε αυτό το μετα-ανάλυση διαπιστώσαμε ότι Gln939Gln γονότυπος σχετίζεται με σημαντικά αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σε ασιατικό πληθυσμό.? ο PAT – /- γονότυπος μείωσε σημαντικά την ευαισθησία σε καρκίνο του πνεύμονα σε Καυκάσιο πληθυσμό? ενώ ο πολυμορφισμός XPC Ala499Val δεν σχετίστηκε με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα

Παράθεση:. Jin Β, Dong Υ, Ζανγκ Χ, Wang Η, Han Β (2014) Σύνδεσμος XPC πολυμορφισμών και τον Καρκίνο του Πνεύμονα κινδύνου: Μια Μετα- Ανάλυση. PLoS ONE 9 (4): e93937. doi: 10.1371 /journal.pone.0093937

Επιμέλεια: Graham R. Wallace, Πανεπιστήμιο του Birmingham, Ηνωμένο Βασίλειο

Ελήφθη: 14 Νοέμβρη 2013? Αποδεκτές: 10 Μαρτίου 2014? Δημοσιεύθηκε: 15, Απριλίου του 2014

Copyright: © 2014 Jin et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτή η μελέτη χρηματοδοτήθηκε από τα βασικά έργα του τμήματος φαρμακολογίας της Σαγκάης Επιστήμης και Τεχνολογίας της Επιτροπής (11.411.951.200). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

ο καρκίνος του πνεύμονα είναι η κύρια αιτία θανάτου από καρκίνο σχετίζονται με όλο τον κόσμο. Το 2008, 1.610.000 νέες περιπτώσεις καρκίνου του πνεύμονα διαγνώστηκε, αντιπροσωπεύοντας το 12,7% όλων των νέων περιπτώσεων κακοήθων όγκων [1]. Παρά το γεγονός ότι το κάπνισμα έχει αποδειχθεί ως κυρίαρχο παράγοντα κινδύνου του καρκίνου του πνεύμονα, μόνο ένα μικρό ποσοστό των καπνιστών ανέπτυξε καρκίνο του πνεύμονα κατά τη διάρκεια της ζωής τους [2]. Η ευαισθησία του κάθε ατόμου στον καρκίνο του πνεύμονα μπορεί να εξηγηθεί εν μέρει από τη γενετική ποικιλομορφία [3] και τις πιθανές αλληλεπιδράσεις γονιδίων-περιβάλλοντος [4].

Ένα παράγοντες κινδύνου πολλά, όπως το κάπνισμα, η υπεριώδης και ιονίζουσα ακτινοβολία, μπορεί να προκαλέσει ο σχηματισμός ογκώδη προϊόντα προσθήκης, διασταυρούμενες συνδέσεις, και σπασίματα στα σκέλη του DNA [2]. Αυτές οι βλάβες του DNA επισκευαστεί από τέσσερα μεγάλα μονοπάτια επιδιόρθωσης του DNA, δηλαδή νουκλεοτίδιο επιδιόρθωση εκτομής (NER), επιδιόρθωση βάσης εκτομή (ΚΑΚ), διπλό επισκευή διάλειμμα σκέλος (DSBR) και αναντιστοιχία επισκευή (MMR) οδών [5]. Περισσότεροι από εκατό που κωδικοποιούν πρωτεΐνη γονιδίων που εμπλέκονται σε οδούς ανθρώπινο σύστημα επιδιόρθωσης DNA έχουν ταυτοποιηθεί και οι μελέτες έδειξαν ότι οι πολυμορφισμοί ενός νουκλεοτιδίου σε γονίδια που σχετίζονται με την επισκευή πολλαπλά DNA συνδέονται ικανότητα επιδιόρθωσης του DNA [6], [7]. Το κάπνισμα τσιγάρων προκάλεσε βλάβη του DNA επιδιορθώνεται κυρίως από την οδό NER [8]. Πολλές μελέτες έχουν δείξει ότι οι διάφοροι πολυμορφισμοί του γονιδίου ομάδα Pigmentosum ξηροδερμίας συμπλήρωσης C (XPC), ένα ένζυμο κλειδί στην οδό της NER, που σχετίζονται με μειωμένη ικανότητα επιδιόρθωσης του DNA και την επιδεκτικότητα σε καρκίνο του πνεύμονα [1], [9] – [12 ]. Αν και έχουν περισσότερες από εκατό SNPs στις περιοχές κωδικοποίησης του XPC έχουν αναφερθεί, δύο κοινές SNPs ήταν πιο ερευνήθηκαν: ο Lys939Gln (rs2228001) πολυμορφισμός στο πεδίο αλληλεπιδρά με TFIIH, και ο Ala499Val (rs2228000) πολυμορφισμός στο πεδίο αλληλεπιδρά με RAD23B. Επιπλέον, η XPC εσονικές πολυ-κατά την εισαγωγή /διαγραφή πολυμορφισμός (PAT) συσχετίστηκε επίσης με τον κίνδυνο καρκίνου των πνευμόνων στους Καυκάσιους [13]. Ωστόσο, η σχέση μεταξύ πολυμορφισμών XPC (Lys939Gln, Ala499Val, και PAT) και τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα ήταν ακόμη ασαφή και τις προηγούμενες μετα-αναλύσεις δεν διαλευκανθεί πλήρως αυτό το θέμα [11], [12]. Έτσι, πραγματοποιήθηκε αυτή η ενημερωμένη έκδοση μετα-ανάλυση για να παρέχει πιο ακριβή εκτίμηση της σχέσης μεταξύ πολυμορφισμών XPC και την ευαισθησία στον καρκίνο του πνεύμονα.

Μέθοδοι

Λογοτεχνία Ψάχνοντας

Αυτή η μετα- ανάλυση έγινε και αναφέρονται σύμφωνα με την κατευθυντήρια γραμμή PRISMA (Checklist S1). Μια βιβλιογραφική έρευνα διεξήχθη με τη χρήση PubMed, EMBASE και Υποδομών China National Γνώσης (CNKI) της βάσης δεδομένων μέχρι το Νοέμβριο του 2013. Δεν υπήρχαν περιορισμοί προέλευσης ή γλώσσες. Ψάχνοντας τους όρους που περιλαμβάνονται συνδυασμοί των ιατρικών διακρίσεων και λέξεις κλειδιά «Pigmentosum ξηροδερμίας, Συμπλήρωση Ομάδα C» ή «XPC», «πολυμορφισμοί, μόνο νουκλεοτίδιο» ή «SNP», και «νεόπλασμα, του πνεύμονα» ή «ο καρκίνος του πνεύμονα». Εξετάστηκαν επίσης άλλες εναλλακτικές ορθογραφίες και συντμήσεις. Οι κατάλογοι αναφοράς του προηγούμενου μετα-αναλύσεις το χέρι εξετάστηκαν για τον εντοπισμό πρόσθετων σχετικών μελετών

ένταξης και αποκλεισμού Κριτήρια

Οι μελέτες επιλέχθηκαν σύμφωνα με τα ακόλουθα κριτήρια ένταξης:. (1) πλήρες κείμενο δημοσιεύεται άρθρα? (2) επιδημιολογικές μελέτες σύνδεσης με ένα νοσοκομείο βάση ή με βάση τον πληθυσμό σχεδιασμού? (3) ερευνά τη σχέση μεταξύ πολυμορφισμών XPC (Lys939Gln, Ala499Val, και PAT) και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου του πνεύμονα? (4) την παροχή συχνοτήτων λεπτομέρεια γονότυπο για τον υπολογισμό των συγκεντρωμένων αναλογία πιθανοτήτων. Τα κριτήρια αποκλεισμού ήταν τα εξής: (1) τις μελέτες χωρίς συχνότητες λεπτομέρεια γονότυπο, τα οποία ήταν σε θέση να υπολογίσει λόγος πιθανοτήτων? (2), εάν υπήρχαν πολλαπλές αναφορές της ίδιας μελέτης, μόνο το ένα με περισσότερους συμμετέχοντες ή το πιο πρόσφατο είχε συμπεριληφθεί και οι άλλοι αποκλείστηκαν. Τίτλοι και περιλήψεις από την αναζήτηση αποτελέσματα ελέγχθηκαν και πλήρεις εργασίες κειμένου περαιτέρω αξιολόγηση για την επιβεβαίωση επιλεξιμότητας. Δύο κριτές (Bo Jin και Yu Dong) επιλέγονται ανεξάρτητα επιλέξιμες μελέτες. Διαφωνίας μεταξύ των δύο κριτές, ενώ διακανονίστηκε συζητώντας με το τρίτο κριτής (Baohui Han).

Data Extraction

Τα ακόλουθα δεδομένα συλλέχθηκαν από δύο κριτές (Bo Jin και Yu Dong) χρησιμοποιώντας ανεξάρτητα ένα προσχεδιασμένες μορφή: όνομα του πρώτου συγγραφέα, ο χρόνος έκδοσης, χώρα όπου διεξήχθη η μελέτη, οι μέθοδοι προσδιορισμού του γονότυπου, την εθνικότητα, την πηγή του ελέγχου, τον αριθμό των περιπτώσεων και των ελέγχων, η συχνότητα του γονότυπου στις περιπτώσεις και τους ελέγχους. Μελέτες με ένα μέγεθος δείγματος πάνω από 500 συμμετέχοντες ορίστηκαν ως «μεγάλο»? αλλιώς «μικρό». Διαφορετικές καταβάσεις εθνικότητα είχαν χαρακτηριστεί ως Ασίας και του Καυκάσου. Επιλέξιμες μελέτες ορίστηκαν ως νοσοκομείο με βάση (ΗΒ) και με βάση την κοινότητα (PB) ανάλογα με την πηγή του ελέγχου.

Στατιστική Ανάλυση

Η δύναμη σύνδεσης μεταξύ πολυμορφισμών XPC (Lys939Gln, Ala499Val, και PAT) και τους κινδύνους του καρκίνου μετρήθηκε με αναλογία πιθανοτήτων (OR) με διαστήματα εμπιστοσύνης 95% (95% CI). Οι εκτιμήσεις των συγκεντρωμένων ΕΑΠ επιτεύχθηκαν με τον υπολογισμό του σταθμισμένου μέσου όρου του ή από κάθε μελέτη. Ένα 95% CI χρησιμοποιήθηκε για τη δοκιμή στατιστικής σημαντικότητας και 95% CI χωρίς 1 για Ή δείχνει μια σημαντική αυξηθεί ή να μειωθεί κίνδυνο καρκίνου. Αποδόσεις αναλογίες 5 μοντέλα σύγκρισης υπολογίστηκαν: ομοζυγώτες (AA εναντίον αα), ετεροζυγώτες (Αα εναντίον αα), κυρίαρχη (αααα εναντίον αα), υπολειπόμενο (ΑΑ έναντι αααα), και αλληλόμορφο (Α έναντι α) σύγκρισης μοντέλα (α, παραλλαγή αλληλόμορφου? ​​α, άγρια ​​αλληλόμορφο? η XPC 939Gln, 499Val, και PAT – αλληλόμορφα υποτεθεί ως παραλλαγή αλληλόμορφα). υποομάδα αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν σύμφωνα με (i) την πηγή του ελέγχου, (ii) εθνότητες, και (iii) το μέγεθος του δείγματος, για να εξετάσει την επίδραση αυτών των παραγόντων σχετικά με τη σύνδεση. Για να δοκιμαστεί η ευρωστία του συνεταιρίζεσθαι και χαρακτηρίζουν τις πιθανές πηγές στατιστικής ετερογένειας, ανάλυση ευαισθησίας πραγματοποιήθηκαν αποκλείοντας μελέτες ένα-ένα και αναλύοντας την ομοιογένεια και την επίδραση του μεγέθους για το σύνολο των μελετών υπόλοιπα.

Chi-square Based δοκιμή Q χρησιμοποιήθηκε για να ελεγχθεί η στατιστική ετερογένεια μεταξύ των μελετών, και η ετερογένεια θεωρήθηκε σημαντική όταν ρ & lt? 0.10 [14]. Το μοντέλο σταθερών επιδράσεων (με βάση τη μέθοδο Mantel-Haenszel) και το μοντέλο τυχαίων δράσεων (με βάση τη μέθοδο Dersimonian-Laird) χρησιμοποιήθηκαν για να συγκεντρώσουν τα στοιχεία από διάφορες μελέτες. Το μοντέλο σταθερών επιδράσεων χρησιμοποιήθηκε όταν δεν υπήρχε σημαντική ετερογένεια? Αλλιώς, εφαρμόστηκε το μοντέλο τυχαίων δράσεων [15]. προκατάληψη δημοσίευση αξιολογήθηκε χρησιμοποιώντας δοκιμασία Begg και δοκιμή Egger του [16]. HWE (Hardy-Weinberg ισορροπία) ελέγχθηκε με Χ

2 δοκιμασία Pearson ‘s (P & lt? 0.05 μέσα παρέκκλινε από HWE). Όλες οι αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση Stata έκδοση 11.0 (StataCorp, College Station, TX).

Αποτελέσματα

Με την αναζήτηση σε απευθείας σύνδεση βάσεις δεδομένων και αναφορές και συναφή χαρτιά, 219 αρχεία ανακτήθηκαν. Μετά την αρχική διαλογή των τίτλων και των περιλήψεων, 14 άρθρα πλήρους κειμένου εντοπίστηκαν [1], [9], [10], [13], [17] – [26], ένας [26] του οποίου είχε αποκλειστεί για το λόγω των αναφορών διπλούν από μία μελέτη (Σχήμα 1). Στη μελέτη που αναφέρθηκε από τον Chang JS [10], δύο ξεχωριστές πληθυσμός είχε συμπεριληφθεί και τα δεδομένα αντιπροσωπεύουν ανεξάρτητα? Έτσι, κάθε πληθυσμός αντιμετωπίστηκε ως μια ανεξάρτητη μελέτη. Επομένως, ένα σύνολο 14 επιλέξιμων μελέτες συμπεριλήφθηκαν και αναλύθηκαν σε αυτό το μετα-ανάλυση [1], [9], [10], [13], [17] – [25], συμπεριλαμβανομένων 5647 περιπτώσεων καρκίνου του πνεύμονα και 6.908 ελέγχους.

* οι δύο πληθυσμοί στη μελέτη Chang JS είχαν αντιμετωπίζονται ως 2 ξεχωριστές μελέτες

Η

Ο πολυμορφισμός Lys939Gln ερευνήθηκε σε 10 μελέτες [1] -. [3], [10], [12], [21], [23], [24] και οι περισσότεροι από αυτούς εκτελέστηκαν σε Καυκάσιο πληθυσμό. Ο πολυμορφισμός Ala499Val αναφέρθηκε στο 5 [9], [12], [20], [21], [24] μελετών και 4 από αυτά διεξήχθησαν σε ασιατικό πληθυσμό. Και 5 μελέτες [3], [12], [15], [16], [25] διερεύνησε τη σχέση μεταξύ PAT πολυμορφισμό και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου του πνεύμονα. Από τις 14 επιλέξιμες μελέτες, 6 μελέτες ήταν το νοσοκομείο με βάση και 7 μελέτες χρησιμοποιείται η μέθοδος PCR-RFLP. Εκτός από τον πολυμορφισμό Lys939Gln αναφέρθηκε από Shen Μ [21], όλα τα δεδομένα κατανομής γονότυπου των πολυμορφισμών XPC ήταν σύμφωνα με HWE. Τα αρχικά χαρακτηριστικά των επιλέξιμων μελέτες φαίνεται στον πίνακα 1.

Η

XPC Lys939Gln Πολυμορφισμός

4030 περιπτώσεις καρκίνου του πνεύμονα και 5336 οι έλεγχοι ήταν διαθέσιμα για την ανάλυση των XPC Lys939Gln πολυμορφισμό και το μετα αποτελέσματα της ανάλυσης ήταν έδειξε στον πίνακα 2. Κατά τη συνολική ανάλυση, δεν υπάρχει σημαντική συσχέτιση του πολυμορφισμού XPC Lys939Gln με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα παρατηρήθηκε σε κανένα από τα 5 μοντέλα σύγκρισης. ανάλυση υπο-ομάδα έδειξε ότι πηγή των ελέγχων και το μέγεθος του δείγματος δεν μετέβαλε τη σύνδεση. Ωστόσο, στην ανάλυση της υποομάδας σύμφωνα με την εθνικότητα, βρήκαμε ότι η ομοζυγώτες Gln939Gln γονότυπος σχετίζεται με σημαντικά αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα στις ασιατικές πληθυσμού (GlnGln vs LysLys, OR = 1.229, 95% CI: 1,000 – 1,510? GlnGln vs LysLys /LysGln, OR = 1.257, 95% CI: 1,038 – 1,522? Σχήμα 2), ενώ δεν διαπιστώθηκε καμία συσχέτιση μεταξύ Καυκάσιο πληθυσμό. αποτελέσματα μετα-ανάλυση για Lys939Gln πολυμορφισμού φαίνονται στον πίνακα 2. Δεν υπάρχουν ενδείξεις για μεροληψία δημοσίευσης ανιχνεύτηκε από δοκιμασία Begg του (P = 0,283, σχήμα S1) και τη δοκιμή Egger του (P = 0,186).

Η

XPC Ala499Val πολυμορφισμός

2605 ασθενείς και 3329 μάρτυρες συνέβαλαν στην ανάλυση της XPC Ala499Val πολυμορφισμού. Με τη συγκέντρωση όλων των επιλέξιμων μελέτες, δεν βρήκαμε καμία σημαντική συσχέτιση μεταξύ XPC Ala499Val πολυμορφισμό και την ευαισθησία στον καρκίνο του πνεύμονα (AlaVal /ValVal, OR = 1.054, 95% CI: 0,950 – 1,170? Σχήμα 3). Περαιτέρω στρωματοποιημένη ανάλυση πραγματοποιήθηκαν για τις πηγές του ελέγχου, την εθνικότητα και το μέγεθος του δείγματος, και κανένας από αυτούς τους συγχυτικούς παράγοντες επηρέασαν τα συγκεντρωτικά αποτελέσματα. αποτελέσματα μετα-ανάλυση για Ala499Val πολυμορφισμού φαίνονται στον Πίνακα δοκιμή 3.Begg του (P = 0,462, σχήμα S2) και τη δοκιμή Egger του (P = 0,762) πρότεινε καμία ένδειξη για μεροληψία δημοσίευσης.

Η

XPC PAT πολυμορφισμός

Ο πολυμορφισμός PAT διερευνήθηκε σε 5 μελέτες, συμπεριλαμβανομένων 2014 ασθενών με καρκίνο του πνεύμονα και 1958 ελέγχους. Μόνο τα μοντέλα σύγκριση ομοζυγώτες και ετεροζυγώτες σύγκριση διεξήχθησαν για PAT πολυμορφισμό. Η συνολική ανάλυση έδειξε ότι ο πολυμορφισμός PAT δεν συσχετίστηκε σημαντικά με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου του πνεύμονα. ανάλυση υποομάδας σύμφωνα με πηγές των ελέγχων διαπιστώθηκε καμία σημαντική συσχέτιση ούτε. Ενώ σε Καυκάσιο πληθυσμό, βρήκαμε φορείς της – /- γονότυπος συσχετίστηκαν σημαντικά μειωμένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα στο μοντέλο σύγκριση ομοζυγώτες (- /- + /+, OR = 0,735, 95% CI vs: 0,567 – 0,952? Σχήμα 4) , και το – /+ γονότυπος επίσης οριακά σχετίζεται με μειωμένο κίνδυνο (- /+ vs ++, ή = 0,786, 95% CI: 0,615 – 1,004). Καμία σχέση δεν παρατηρήθηκε στον ασιατικό πληθυσμό. Στην ανάλυση της υποομάδας των «μεγάλων» μελέτες, τα αποτελέσματα έδειξαν ότι η – /+ γονότυπος μειωμένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα (- /+ vs ++, OR = 0,812, 95% CI: 0,671 – 0,983). αποτελέσματα μετα-ανάλυση για το PAT πολυμορφισμού φαίνονται στον πίνακα 4.No ενδείξεις για μεροληψία δημοσίευσης βρέθηκε (Σχήμα S3).

Η

Συζήτηση

XPC είναι ένα από τα 8 βασικά γονίδια στο μονοπάτι NER και εμπλέκεται στην αναγνώριση ζημίας, ο σχηματισμός συμπλόκου ανοιχτό και επανόρθωση [27]. Η οδός NER είναι κυρίως υπεύθυνη για την εξάλειψη μιας ευρείας ποικιλίας των βλαβών του DNA, και ως εκ τούτου είναι ένας σημαντικός μηχανισμός άμυνας ενάντια άσχετα δομικά βλάβες του DNA [17]. Προηγούμενες μελέτες έχουν δείξει ότι τα επίπεδα προϊόντος προσθήκης DNA μπορεί να προβλέψει την ανάπτυξη του καρκίνου του πνεύμονα [28]. Λειτουργική SNPs σε περιοχές κωδικοποίησης πρωτεΐνης μπορεί να μεταβάλλει αμινοξέα αλληλουχία και ακόμη και τη λειτουργία της πρωτεΐνης. Οι πολυμορφισμοί XPC Lys939Gln και Ala499Val συμβαίνουν στις περιοχές κωδικοποίησης της πρωτεΐνης και να προκαλέσει αμινοξέα υποκατάστασης λειτουργικό τομέα, έτσι είναι λογικό ότι οι λειτουργικές πολυμορφισμοί του XPC (Lys939Gln, Ala499Val και PAT) θα αλλάξει την ικανότητα επιδιόρθωσης του DNA και την ευαισθησία στον καρκίνο του πνεύμονα.

σε αυτό το μετα-ανάλυση, εντοπίσαμε 14 επιλέξιμες μελέτες, συμπεριλαμβανομένων των 5647 περιπτώσεων καρκίνου του πνεύμονα και 6908 ελέγχους, και ανέλυσε τη σχέση μεταξύ XPC Lys939Gln, Ala499Val, και πολυμορφισμούς PAT και ευαισθησία σε καρκίνο του πνεύμονα. Βρήκαμε ότι οι πολυμορφισμοί XPC Lys939Gln, Ala499Val και PAT δεν συσχετίστηκαν με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σε συνολικό πληθυσμό. Ενώ ο γονότυπος XPC Gln939Gln συσχετίστηκε με σημαντικά αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα στις ασιατικές πληθυσμού και σε Καυκάσιο πληθυσμό, το PAT – /- γονότυπος μείωσε σημαντικά τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου του πνεύμονα

Ο πολυμορφισμός XPC Lys939Gln βρίσκεται στην περιοχή αλληλεπίδρασης. με ΤΡΙΙΒ. Με τη συγκέντρωση των 9 επιλέξιμες μελέτες, βρήκαμε ο πολυμορφισμός Lys939Gln συσχετίστηκε μόνο με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου των πνευμόνων στους Ασιάτες. Όσο για τον πολυμορφισμό PAT, η σημαντικά μειωμένη ευαισθησία παρατηρήθηκε μόνο σε Καυκάσιους. Αυτά τα αποτελέσματα υποδηλώνουν την ύπαρξη εθνικών διαφορών, η οποία μπορεί να προκαλείται από διαφορετικό γενετικό υπόβαθρο, η έκθεση του περιβάλλοντος, το στυλ ζωής και άλλους παράγοντες. Για την επίτευξη των πιο ακριβής αντιστοιχία, μελλοντικές μελέτες θα πρέπει να λαμβάνουν εθνοτική διαφορά στο αντιπαροχή. Σε αυτή την μετα-ανάλυση, δεν ανιχνεύθηκε εμφανής προκατάληψη δημοσίευση. Επιπλέον, δεν υπάρχει σημαντική ετερογένεια ήταν παρούσα στις περισσότερες συγκρίσεις, εκτός για αρκετές υποομάδες.

πολυμορφισμούς XPC και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου έχει διερευνηθεί από πολλές μετα-αναλύσεις [11], [12]. Πρόσφατα, J και οι συνεργάτες του [11] πραγματοποιείται μια ολοκληρωμένη μετα-ανάλυση για το XPC Lys939Gln και Ala499Val πολυμορφισμών και την ευαισθησία του καρκίνου. Σε σύγκριση με την εργασία Εκείνος του J, εστιάσαμε μόνο για τη σύνδεση των πολυμορφισμών XPC με καρκίνο του πνεύμονα, ενώ Εκείνος J και συνεργάτες [11] ανέλυσε μια ποικιλία καρκίνων, συμπεριλαμβανομένου του καρκίνου του πνεύμονα, ο καρκίνος του μαστού, ο καρκίνος της ουροδόχου κύστης, καρκίνο του παχέος εντέρου, κλπ [11] . Από την άλλη πλευρά, αναλύσαμε επίσης τον πολυμορφισμό PAT. Επιπλέον, έχουμε εντοπίσει περισσότερες μελέτες είναι επιλέξιμες και εκτελούνται λεπτομερών αναλύσεων υποομάδα. Σε σύγκριση με μια άλλη πρόσφατη μετα-ανάλυση για πολυμορφισμών XPC και τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα που αναφέρθηκαν από Liu C et al [12], αποκλείσαμε το αντίγραφο της μελέτης που αναφέρθηκαν από τον Hu Z et al [26], ενώ ο Liu και οι συνεργάτες του δεν αποκλείεται αυτή τη μελέτη. Για PAT πολυμορφισμός, Liu διαπίστωσε ότι σε σύγκριση με το – /- γονότυπος, το PAT – /+ γονότυπος ήταν σημαντικά σχετίζεται με μειωμένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα στις ασιατικές πληθυσμού [12]. Ωστόσο, βρήκαμε σε Καυκάσιος πληθυσμός που τους μεταφορείς των PAT – /- γονότυπος είχε μειώσει σημαντικά την ευαισθησία σε καρκίνο του πνεύμονα σε σύγκριση με τους μεταφορείς των + /+ γονότυπο, και καμία σημαντική συσχέτιση παρατηρήθηκε στις ασιατικές πληθυσμό. Ενώ η παρούσα μετα-ανάλυση είναι υπό εξέταση, Zhu ML [29] ανέφεραν μια άλλη μετα-ανάλυση για το XPC πολυμορφισμού και τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα. Zhu ML και οι συνεργάτες του αξιολόγησαν τις πολυμορφισμών Lys939Gln και Ala499Val, ενώ δεν ανέλυσε τη σχέση μεταξύ PAT πολυμορφισμού και του καρκίνου του πνεύμονα.

Θα πρέπει επίσης να επισημανθεί Περιορισμοί αυτής της μετα-ανάλυσης. Το κάπνισμα είναι ο κυριότερος παράγοντας κινδύνου για καρκίνο του πνεύμονα και μια κοινή αιτία της βλάβης του DNA. Από μετα-ανάλυση είναι μια μέθοδος που βασίζεται σε δημοσιευμένες μελέτες, και τη συλλογή στοιχείων από δημοσιευμένες μελέτες θα χάσετε πολλά επιμέρους στοιχεία. Χωρίς αρκετά ατομικά στοιχεία, δεν θα μπορούσαμε να καθορίσει την αλληλεπίδραση μεταξύ πολυμορφισμών XPC και το κάπνισμα. Από την άλλη πλευρά, τα κριτήρια επιλογής των υποκειμένων σε κάθε επιλέξιμη μελέτες ήταν επίσης αρκετά ετερογενή. Για παράδειγμα, στη μελέτη των Sakoda LC [9], επελέγησαν δύο περιπτώσεις καρκίνου του πνεύμονα και των ελέγχων από το β-καροτένιο και ρετινόλη Δοκιμή Αποτελεσματικότητας, και ήταν όλοι σε υψηλό κίνδυνο καρδιαγγειακού κινδύνου. Lee GY (24) και οι συνεργάτες επιλέγονται υγιείς εθελοντές ως έλεγχος, ενώ οι έλεγχοι στη μελέτη αναφέρθηκε από López-Cima MF (18) ήσαν ασθενών που εισάγονται σε ορισμένα νοσοκομεία με διάφορους διαγνώσεις. Τα ετερογενή κριτήρια θα μπορούσε επίσης να οδηγήσει σε πιθανή προκατάληψη. Ο καρκίνος είναι μια σύνθετη διαδικασία που εμπλέκονται τόσο γενετικοί όσο και περιβαλλοντικοί παράγοντες, και η έκθεση σε περιβαλλοντικούς παράγοντες δεν αναλύθηκε σε αυτό το μετα-ανάλυση λόγω περιορισμένων ατομικών στοιχείων. Επιπλέον, ο αριθμός των μελετών για την ανάλυση των XPC Ala499Val και πολυμορφισμοί PAT ήταν σχετικά μικρή.

Για να Συνοπτικά, σε αυτή την μετα-ανάλυση διαπιστώσαμε ότι Gln939Gln γονότυπος σχετίζεται με σημαντικά αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα στις ασιατικές πληθυσμού αλλά όχι σε Καυκάσιους? ο PAT – /- γονότυπος μείωσε σημαντικά την ευαισθησία σε καρκίνο του πνεύμονα σε Καυκάσιος πληθυσμός αλλά όχι σε Ασιάτες? ο πολυμορφισμός XPC Ala499Val δεν σχετίστηκε με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου του πνεύμονα. Περαιτέρω μελέτες δικαιολογείται να επικυρωθούν τα ευρήματα αυτά.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Εικόνα S1.

Χωνί οικόπεδο XPC Lys939Gln πολυμορφισμού. Κύκλοι αντιπροσωπεύουν το βάρος της κάθε μελέτης

doi:. 10.1371 /journal.pone.0093937.s001

(ΔΕΘ)

Εικόνα S2.

Χωνί οικόπεδο XPC Ala499Val πολυμορφισμού. Κύκλοι αντιπροσωπεύουν το βάρος της κάθε μελέτης

doi:. 10.1371 /journal.pone.0093937.s002

(ΔΕΘ)

Εικόνα S3.

Χωνί οικόπεδο XPC PAT πολυμορφισμού. Κύκλοι αντιπροσωπεύουν το βάρος της κάθε μελέτης

doi:. 10.1371 /journal.pone.0093937.s003

(ΔΕΘ)

Λίστα ελέγχου S1.

PRISMA Λίστα ελέγχου

doi:. 10.1371 /journal.pone.0093937.s004

(DOC)