Αφηρημένο

Ιστορικό

ισπανόφωνους είναι γνωστό ότι είναι μια εξαιρετικά ποικιλόμορφη και γενετικά αναμεμειγμένη εθνοτική ομάδα. Η έλλειψη των μεθοδολογιών για τον έλεγχο για την εθνικότητα και το άγνωστο πρόσμιξη σε σύνθετα πληθυσμούς μελέτη των Ισπανόφωνων έχει αφήσει ένα κενό στην κατανόηση ορισμένων θεμάτων του καρκίνου διαφορά. ποσοστά επίπτωσης από το στόμα και του φάρυγγα καρκίνο (OPC) στο Πουέρτο Ρίκο είναι από τα υψηλότερα στο δυτικό ημισφαίριο. Πραγματοποιήσαμε μια επιδημιολογική μελέτη για να εξετάσει τον κίνδυνο και τους προστατευτικούς παράγοντες, εκτός από πιθανές συνιστώσες γενετική προδιάθεση για καρκίνο του στόματος και τα προκαρκινικά στάδια στο Πουέρτο Ρίκο.

Μεθοδολογία /Κύρια Ευρήματα

Έχουμε προσληφθεί 310 Πουέρτο Ρίκο κατοίκους που είχαν διαγνωστεί με είτε ένα περιστατικό στοματικό καρκίνωμα πλακωδών κυττάρων, του στόματος προκαρκινικά στάδια, ή καλοήθη στοματική κατάσταση. Οι συμμετέχοντες συμπλήρωσαν μια συνέντευξη πρόσωπο με πρόσωπο και συνέβαλε στοματική κύτταρα για την εξαγωγή του DNA. σύνολα αστάρι ΑΒΙ Biosystem Taqman ™ χρησιμοποιήθηκαν για προσδιορισμό του γονότυπου 12 Προγόνων ενημερωτικό δείκτες (AIMS). εκτιμήσεις προγονική ομάδα παρήχθησαν χρησιμοποιώντας το μέγιστο Λογισμικό εκτίμησης της πιθανότητας (LEADMIX), και επιπλέον ανάλυση σε κύριες συνιστώσες διεξήχθη για την ανίχνευση υποδομές πληθυσμού. Χρησιμοποιήσαμε άνευ όρων υποχώρηση υλικοτεχνικής να εκτιμήσει τη συμβολή του καταγωγή με τον κίνδυνο να διαγνωστούν είτε με τον καρκίνο του στόματος ή τα προκαρκινικά στάδια, ενώ τον έλεγχο για άλλους πιθανούς συγχυτικούς παράγοντες. Οι εκτιμήσεις μέγιστης πιθανότητας έδειξε ότι οι συμμετέχοντες στη μελέτη είχαν μέση συνεισφορά καταγωγή ομάδα 69,9% Ευρώπης, το 24,5% της Αφρικής, και 5,7% ανιχνεύσιμη Native American. Οι χώρες της Αφρικής και αυτόχθονες της Αμερικής εκτιμήσεις ομάδας ήταν σημαντικά υψηλότερο από ό, τι αναμενόταν. Ούτε αυτο-προσδιορίζονται εθνικότητα, ούτε η καταγωγή δείκτες έδειξαν κάποια σημαντική συσχέτιση με τον καρκίνο του στόματος κινδύνου /προκαρκινικά στάδια στη μελέτη μας.

Συμπεράσματα /Σημασία

Η εφαρμογή του καταγωγή ενημερωτικό δεικτών (στόχοι), που έχει σχεδιαστεί ειδικά για ισπανόφωνοι, προτείνει καμία κρυφή πληθυσμού υποδομή είναι παρόν βασίζεται σε δειγματοληψία μας και παρέχει μια βιώσιμη προσέγγιση για την αξιολόγηση και τον έλεγχο της καταγωγής σε μελλοντικές μελέτες στις οποίες συμμετείχαν ισπανόφωνοι πληθυσμοί

Παράθεση:. Erdei Ε, Sheng η Maestas Ε, Mackey Α, Λευκό KA, Li L, et al. (2011) Αυτο-Αναφέρθηκαν Εθνότητα και γενετική καταγωγή σε σχέση με τον καρκίνο του στόματος και προ-καρκίνου στο Πουέρτο Ρίκο. PLoS ONE 6 (8): e23950. doi: 10.1371 /journal.pone.0023950

Επιμέλεια: Zheng Su, Genentech Inc., Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 30ης Απριλίου 2011? Αποδεκτές: 28 Ιουλίου 2011? Δημοσιεύθηκε: 29 Αυγ 2011

Copyright: © 2011 Erdei et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτό το έργο χρηματοδοτήθηκε από το Εθνικό Ινστιτούτο Υγείας επιχορήγησης 5U54DE014257. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Σύμφωνα με το 2000 δεδομένα Ηνωμένης απογραφής, το 80,5 τοις εκατό των Πορτορικανοί θεωρούσαν τους εαυτούς τους White, και 19,5 τοις εκατό ανέφερε ως μη-Λευκό? 8,0 τοις εκατό ισχυρίστηκε αφρικανικής καταγωγής (πιθανότατα από Δυτικής Αφρικής προγονική ομάδες, συμπεριλαμβανομένων των IBO και Γιορούμπα άτομα), και μόνο το 0,4 τοις εκατό των ερωτηθέντων Απογραφή θεωρούσαν τους εαυτούς τους απογόνους των Πουέρτο Ρίκο Tainos [1]. Οι Tainos ήταν μια αμερικανική φυλή ιθαγενών μέλη της οποίας κατοικείται το νησί πριν από την έναρξη της ιστορικής Ισπανικός επιρροή [2] – [3].

Είναι τεκμηριωμένο ότι καθ ‘όλη την εποχή της ισπανικής αυτοκρατορίας, Πορτορικανοί ζούσαν κάτω μια διαχωρισμένη κοινωνική δομή που ήταν ένα κατασκεύασμα της περιορισμένης ανάμιξη των τριών κύριων προγονική ομάδες του πληθυσμού [2] – [3]. Η ύπαρξη αυτών των κοινωνικών δομών εξετάστηκε πρόσφατα από τη σύγχρονη γονιδιωματικής τεχνολογίας για την ανίχνευση μεταξύ υγιών Πορτορικανοί [4].

ποσοστά επίπτωσης από το στόμα και του φάρυγγα καρκίνο (OPC) στο Πουέρτο Ρίκο είναι από τα υψηλότερα στο δυτικό ημισφαίριο [ ,,,0],5] – [9]. Περαιτέρω, οι διαφορές εθνο-περιφερειακή έχουν αναφερθεί στο οποίο OPC επίπτωσης και θνησιμότητας είναι πολύ υψηλότερα μεταξύ των ισπανόφωνων άνδρες που ζουν στην πολιτεία της Νέας Υόρκης από ό, τι μεταξύ των ΗΠΑ Ισπανικός άνδρες στο σύνολό τους [10]. Μια πιθανή σχέση μεταξύ των προγόνων τους γενετικούς παράγοντες και τα επιδημιολογικά στοιχεία σχετικά με τον κίνδυνο OPC μεταξύ των Ισπανών δεν έχει διερευνηθεί στο παρελθόν.

Η χρήση της προγονικής ενημερωτικών δεικτών επιτρέπει την ταυτοποίηση των γενετικά μοτίβα που σχετίζονται με υποδομές του πληθυσμού και μπορεί να χρησιμοποιηθεί για να διερευνήσει κατά πόσον τα εν λόγω δείκτες που σχετίζονται με τον κίνδυνο στοματικό καρκίνωμα πλακωδών κυττάρων ή συνδεδεμένων προκαρκινικές αλλοιώσεις του. Για να εξετάσει τον κίνδυνο και τους προστατευτικούς παράγοντες, μεταξύ του υψηλού πληθυσμού συχνότητα του Πουέρτο Ρίκο θα διεξαχθεί η μελέτη μας υποστηρίζεται από τις Ηνωμένες Πολιτείες Εθνικό Ινστιτούτο Υγείας. Ένας από τους κύριους στόχους του ερευνητικού έργου ήταν να εντοπιστούν οι παράγοντες γενετικής προδιάθεσης επηρεάζεται από εθνογραφική διαφορές στο Πουέρτο Ρίκο πληθυσμού.

Ο στόχος αυτής της ανάλυσης ήταν να συνοψίσει τις ενώσεις μεταξύ εθνότητας και τον κίνδυνο των δύο στοματικές αλλοιώσεις προκαρκινικές και πλακώδες καρκίνωμα μεταξύ των συμμετεχόντων στην επιδημιολογική μελέτη μας στο Πουέρτο Ρίκο.

Η

Υλικά και Μέθοδοι

Ηθική δήλωση

το ερευνητικό έργο εγκρίθηκε από τις Institutional Review Boards στο Πανεπιστήμιο του Πουέρτο Ρίκο, Ιατρικών Επιστημών Πανεπιστημιούπολη? Πανεπιστήμιο της Νέας Υόρκης, και το πανεπιστήμιο του New Mexico.

Οι συμμετέχοντες στη μελέτη

Τριακόσια δέκα συμμετέχοντες διαγνώστηκαν με είτε μια καλοήθης κατάσταση του στόματος, του στόματος υπερκεράτωση ή επιθηλιακή υπερπλασία (HK /EH), από του στόματος επιθηλιακή δυσπλασία (Αγγλικό Λεξικό της Οξφόρδης), ή καρκίνωμα του στόματος πλακωδών κυττάρων [μέση ηλικία: 59.13 (SD ± 12,75) έτη] εντάχθηκαν από 6 εργαστήρια παθολογίας στο Πουέρτο Ρίκο (βλέπε πίνακα 1). Οι συμμετέχοντες παρέχεται γραπτή συγκατάθεση για να είναι μέρος του ερευνητικού έργου και δώρισε βιολογικών δειγμάτων για την εκχύλιση του DNA. Έδωσαν επίσης την άδεια να επανεξετάσει το στόμα βιοψία ιστού των υλικών τους και την αντίστοιχη H & amp? Ε βάφονται διαφάνειες. Με βάση την τελευταία, έμπειρο, πίνακας-επικυρωμένο από του στόματος παθολόγους επανεξετασθούν και να επικυρωθούν κάθε διάγνωση.

Η

Οι συμμετέχοντες συμπλήρωσαν ένα λεπτομερές ερωτηματολόγιο επιδημιολογικές που αξιολογούνται αυτο-προσδιορίζονται φυλή /εθνικότητα (Λευκό, Μαύρο, mestiza και άλλα) , τον τρόπο ζωής, διατροφικούς παράγοντες (π.χ. κατανάλωση φρούτων και λαχανικών) πρακτικές, γνωστοί παράγοντες κινδύνου (συμπεριλαμβανομένης της κατανάλωσης αλκοόλ, η χρήση καπνού), και τη στοματική υγιεινή.

δείγματα στοματικά κυττάρων

Βιολογικά συλλογή δείγματος και του γονότυπου

συλλέχθηκαν κατά την περίοδο Νοέμβριος 2003 έως τον Μάιο του 2008, από τους συμμετέχοντες, χρησιμοποιώντας έξι κυτταρολογική βούρτσες μέσα στο στόμα σε επιλεγμένα σημεία και με την επακόλουθη στοματικό διάλυμα πλύσεις για τη συλλογή πρόσθετων στοματική κυττάρων. Οι συμμετέχοντες διαχωρίστηκε με 10 ml Πεδίο στοματικό διάλυμα και στη συνέχεια με 8 ml αποσταγμένου νερού στην οποία αμέσως προστίθενται 2 ml 70% αιθανόλης για την πρόληψη ανάπτυξης βακτηρίων και μυκήτων κατά τη μεταφορά. Όλα τα βιολογικά δείγματα ταχυδρομηθεί στο Πανεπιστήμιο του Νέου Μεξικού, όπου γονιδιακό DNA εκχυλίζεται με τη χρήση του Puregene DNA στοματικά Kit κυττάρων (Gentra Systems, Minneapolis, MN). Όλα τα δείγματα υποβλήθηκαν σε επεξεργασία σύμφωνα με τις οδηγίες του κατασκευαστή. Ελήφθη ένα μέσο όρο 70-80 μα πρωταρχική πηγή γονιδιωματικού DNA και ποσοτικά με τη χρήση NanoDrop φασματοφωτόμετρο (Thermo Fisher Scientific Inc, Rockford, IL). Η οπτική πυκνότητα μετρήθηκε στα 260 και 280 νανόμετρα για την αξιολόγηση της απόδοσης και της ποιότητας του DNA. Τα δείγματα αποθηκεύονται σε καταψύκτες -80 ° C πριν από την γονοτυπική.

Αποτελέσματα γονότυπου για 12 Προγόνων ενημερωτικό δείκτες παράχθηκαν χρησιμοποιώντας PCR System TaqMan7900 Real-Time (Applied Biosystems Inc., Carlsbad, CA) και εξασφάλιση ποιότητας αστάρι σύνολα TaqMan SNP Γονοτυπικές Αναλύσεις

Προγόνων ενημερωτικό δείκτες (AIMS)

επιλεγεί Προγόνων ενημερωτικό δείκτες (AIMS) βασίστηκαν σε προηγούμενα δημοσιευμένες πληροφορίες για ισπανόφωνους [11] – [13].. Προγόνων ενημερωτικό δείκτες είναι πολυμορφισμούς μονών νουκλεοτιδίων τυχαία κατανεμημένα σε όλη του ανθρώπινου γονιδιώματος και είναι χρήσιμο σε διακρίσεις τις γενετικές συνεισφορές των κύριων γονική εθνοτικές ομάδες. Τα επιλεγμένα στόχοι ήταν σχετικοί με Πουέρτο Ρίκο γονική πληθυσμούς: Αφρικανοί, Ευρωπαίοι και οι αυτόχθονες Αμερικανοί (Πίνακας 2). Αντιπροσωπεύουν αυτόχθονες της Αμερικής -Ευρωπαϊκή καταγωγή, Ευρωπαϊκή-αφρικανικής καταγωγής, και Native American -αφρικανική διαφορές καταγωγή. Η διαφορά συχνότητας αλληλόμορφου, που ονομάζεται τιμές μεταξύ δύο ομάδων γονική δέλτα (δ), βασίζεται σε συχνότητες του ομόζυγου άγριων αλληλόμορφο σε μία γονική πληθυσμού σε σύγκριση με την αντίστοιχη συχνότητα αλληλόμορφου του άλλου προγονική πληθυσμού [13]. Εκτός από τα βιβλιογραφικά δεδομένα, η παρουσία και οι συχνότητες του ομόζυγο άγρια ​​αλληλόμορφο για όλες τις δώδεκα δείκτες επικυρώθηκαν με χρήση NCBI δεδομένων ιστοσελίδα HapMap για να εξασφαλίζεται η ακριβής και ενημερωμένη επιλογή των δεικτών. Ο πίνακας 2 δείχνει αναλυτικά τα καταγωγή ενημερωτικό δείκτες που χρησιμοποιούνται σε αυτή τη μελέτη.

Η

Η στατιστική ανάλυση

Κατ ‘αρχάς, θα καθορίζεται συχνότητες s

ξωτικό που αναφέρθηκαν από την εθνικότητα

μεταξύ μελέτης συμμετεχόντων. Στη συνέχεια, δημιουργείται

εκτιμήσεις γενετική πρόσμιξη

να δημιουργήσει αξίες πρόσμιξη χρησιμοποιώντας LEADMIX 1.0. Μετά την εκτίμηση του γονότυπου και αλληλόμορφο συχνότητα, LEADMIX 1.0 (Πιθανότητα Εκτίμηση του πρόσμιξη) λογισμικό χρησιμοποιήθηκε για τον υπολογισμό της συνεισφοράς των τριών κύριων πατρογονικές ομάδων που εκπροσωπούνται στο δείγμα της μελέτης μας. LEADMIX είναι ένα Fortran πρόγραμμα υπολογιστή εκτίμηση μέγιστης πιθανοφάνειας για πρόσμιξη αναλογίες και γενετικής παρέκκλισης χρησιμοποιώντας δεδομένα του πληθυσμού που συλλέγονται σε αντιπροσωπευτικά γενετικούς δείκτες. Το λογισμικό αυτό δημιουργήθηκε από τον Wang του Πανεπιστημίου της Οξφόρδης, Ινστιτούτο Ζωολογίας, Λονδίνο, Ηνωμένο Βασίλειο [14]. Μετά την εγγραφή, το λογισμικό έγινε λήψη, και δημιουργήθηκε περιέχουν αναμένεται το αρχείο εισόδου και ανιχνεύονται οι συχνότητες αλληλομόρφων των εφαρμοζόμενων 12 προγονική δείκτες. εκτιμήσεις καταγωγή ομάδα ειδικών δημιουργήθηκαν στο Πανεπιστήμιο του Νέου Μεξικού Κέντρο πυρήνα εγκατάσταση Advanced Computing με τη χρήση «ειδικά σχεδιασμένο» πόρων υπερυπολογιστή διαθέσιμα για αυτό το έργο (id2010008).

Στη συνέχεια, συγκρίναμε τη νόσο και την ομάδα διάγνωση συγκεκριμένων συχνότητες του κάθε προγονική γενετικού δείκτη στις αναμενόμενες συχνότητες αλληλόμορφο της AIMS δημοσιεύονται στη βιβλιογραφία. Η σύγκριση έγινε με βάση τις αναμενόμενες τιμές συχνότητα του αλληλομόρφου άγριου τύπου σε κάθε γονική πληθυσμού [13]. Χρησιμοποιήσαμε Hardy-Weinberg ισορροπία δοκιμές για την εκτίμηση απόκλισης από τις αναμενόμενες κατανομές συχνότητας. Χρησιμοποιήθηκαν δύο όψεων ρ-τιμές. Άνευ όρων λογιστικής παλινδρόμησης χρησιμοποιήθηκε για να εξετάσει κατά πόσον ο γονότυπος κάθε SNP ήταν προγνωστική της κατάστασης της νόσου. Τέλος, ανάλυση κύριων συνιστωσών (PCA) χρησιμοποιήθηκε για να επιβεβαιωθεί ότι όλα τα 12 δείκτες συνέβαλαν ομοιόμορφα με τη γενετική δομή του πληθυσμού μας.

Αποτελέσματα

Με βάση τις απαντήσεις στο ερωτηματολόγιο, αυτο-προσδιορίζονται εθνικότητα δεν ήταν διαφορετική μεταξύ των ανθρώπων στις διάφορες διαγνωστικές κατηγορίες. Ο Πίνακας 1 παρουσιάζει τις τέσσερις βασικές κατηγορίες ασθενειών και τον αριθμό των συμμετεχόντων σε κάθε κατηγορία. Μόνο ένα άτομο εντοπίστηκε στην ομάδα Αγγλικό Λεξικό της Οξφόρδης ο οποίος ήταν αυτο-προσδιορίζονται Μαύρο? άλλες διαγνώσεις της νόσου δεν έδειξε αξιοσημείωτη συνάθροιση ή σημαντική απόκλιση από την εθνότητα.

Οι εκτιμήσεις μέγιστης πιθανότητας υπολογίζεται από το λογισμικό LEADMIX έδειξαν ότι οι συμμετέχοντες στη μελέτη μας είχε μια μέση ομάδα 69.89% Ευρώπης, 24.45% Αφρικανικός, και 5,66% ανιχνεύσιμη Native American συμβολή καταγωγή.

Όταν εξετάζεται ξεχωριστά τις γονικές συχνότητες αλληλομόρφων των στόχων μεταξύ των συμμετεχόντων στη μελέτη μας, οι συχνότητες αλληλόμορφο ήταν σημαντικά διαφορετική σε Πουέρτο Ρίκο συμμετέχοντες της μελέτης μας σε σύγκριση με τις γονικές ομάδες των Ευρωπαίων, Αφρικανών και αυτόχθονες Αμερικανούς ? Ωστόσο, δεν εντοπίζονται τυχόν καταγωγή δείκτες που θα μπορούσε να εξηγήσει ένα σημαντικό μέρος οποιασδήποτε από τις διαγνώσεις της νόσου (Πίνακας 3).

Η

Χρησιμοποιώντας ανάλυση κύριων συνιστωσών (PCA) για την ανίχνευση των εθνοτικών υπο-ομάδες μέσα μας του πληθυσμού του δείγματος, δεν εντόπισε οποιαδήποτε καταγωγή δείκτη που έδειξαν στατιστικά σημαντική συνεισφορά σε μια υποκείμενη υποδομή του πληθυσμού.

Άνευ όρων πολλαπλής λογιστικής μοντελοποίηση χρησιμοποιήθηκε για την αξιολόγηση της συμβολής των δεικτών 12 καταγωγή και κάθε μία από τις κύριες ομάδες γονέων (White ευρωπαϊκού, μαύρο, και Ιθαγενών Αμερικανών) στον κίνδυνο να διαγνωστεί είτε με τον καρκίνο του στόματος ή προκαρκινικά στάδια (σε σχέση με εκείνη ενός καλοήθους στοματική κατάσταση), ενώ τον έλεγχο για άλλους πιθανούς συγχυτικούς παράγοντες, όπως η ηλικία, το φύλο, την εκπαίδευση, το κάπνισμα, και κατανάλωση αλκοόλ. Σε κάθε περίπτωση, τα εκτιμώμενα ποσοστά πιθανοτήτων ήταν σχετικά αδύναμο και κανένα επιτευχθεί στατιστική σημαντικότητα (Πίνακας 4).

Η

Συζήτηση

Ο πληθυσμός στο Πουέρτο Ρίκο είναι ιστορικά και ανθρωπολογικά αναμιγνύονται και διαχωρίζονται σε την ίδια στιγμή, παρέχοντας έτσι την ευκαιρία να ερευνήσει κατά πόσον ένα υποκείμενο, απαρατήρητα υποδομή του πληθυσμού θα μπορούσαν να επηρεάσουν τον κίνδυνο καρκίνο του στόματος ή προ-καρκίνου στο νησί. Η ανάλυση αυτή χρησιμεύει ως βάση για περαιτέρω έρευνα γενετικής ευαισθησίας μας, συμπεριλαμβανομένων των παραλλαγών στα γονίδια του ανοσοποιητικού συστήματος και σημαντικές υποψήφια γονίδια που συνδέονται με μεταστατικό δυναμικό στον καρκίνο του στόματος

Κανένα από τα 12 γονότυπου δείκτες καταγωγή έδειξε υποδομή του πληθυσμού μεταξύ των συμμετεχόντων.? Ωστόσο, οι συχνότητες ήταν ενδεικτική μιας αναμεμειγμένη κατάσταση του πληθυσμού, τη διαπίστωση επιβεβαιώνεται περαιτέρω από ομάδα ειδικών εκτιμήσεις μέγιστης πιθανότητας μας. Η μελέτη μας συμμετείχαν περιπτώσεις (δηλαδή, άτομα που έχουν διαγνωστεί με από του στόματος προκαρκινικά στάδια ή καρκίνο) και τους ελέγχους (άτομα διαγνωστεί με μια καλοήθης πάθηση του στόματος), μέσω συμμετέχοντα εργαστήρια παθολογίας στο νησί του Πουέρτο Ρίκο. Παρά το γεγονός ότι δεν είχαμε εφαρμόσει τη διαδικασία προσλήψεων με βάση τον πληθυσμό, ανιχνεύθηκε μέγιστη εκτιμήσεις πιθανότητας μας ήταν ακόμα πολύ κοντά στην γνωστή ευρωπαϊκή συμβολή στον πληθυσμό (80,5% το έτος 2000. Απογραφή έναντι 69,9%) και σε συνάρτηση με το γεγονός ότι οι άνθρωποι από η Ιβηρική Χερσόνησος άρχισε να συμπληρώσετε Πουέρτο Ρίκο αρχή στις αρχές της [2] του 1500. Νέα 2010 πληροφορίες Απογραφής των ΗΠΑ δείχνει ακόμα πιο κοντά εκτιμήσεις ως μειώθηκε το ποσοστό των Πορτορικανοί ισχυρίστηκε ότι ήταν λευκοί (75,8%) και αύξησε το ποσοστό αυτο-αναφερόμενη ως Μαύρος ή Αφρικανικός-αμερικανική (12,4% το 2010, από 8% το 2000) [ ,,,0],. 15]

Η ομάδα-ειδική συχνότητα της Αφρικής δεικτών ήταν σημαντικά υψηλότερη με βάση τη μέγιστη πιθανοφάνειας μας από ό, τι αναμενόταν με βάση δημοσιευμένα το 2000 στοιχεία της Απογραφής των ΗΠΑ (24,5% έναντι 8%? p & lt? 0,0001). Είναι ενδιαφέρον, το Native American συμβολή καταγωγή ήταν πολύ μεγαλύτερη σε πληθυσμό της μελέτης μας από ό, τι οποιαδήποτε συγκρίσιμη πληθυσμού δημογραφικά στοιχεία θα δείχνουν (5,7% έναντι 0,4%? P & lt? 0,0001). Αυτά τα αποτελέσματα δείχνουν προς νέους χώρους στη μελέτη της χρόνιας ανάπτυξης νόσου μεταξύ Πορτορικανοί να συμπεριλάβει ανθρωπολογικές και κοινωνικούς καθοριστικούς παράγοντες.

Περιορισμοί της

μελέτης

Η έρευνα υλοποιήθηκε εν μέσω της αλλαγής της υγειονομικής περίθαλψης κανονισμούς στις Ηνωμένες Πολιτείες και Πουέρτο Ρίκο (δηλαδή, εισαγωγή του HIPAA). αλλαγών πολιτικής και των συναφών αβεβαιότητες μεταξύ των επαγγελματιών του τομέα της υγείας, εργαστήρια παθολογίας, και το ευρύ κοινό που θέτουν προκλήσεις για την υλοποίηση της συλλογής δεδομένων και προσωπικές συνεντεύξεις με τους συμμετέχοντες, και οδήγησε σε ένα μικρότερο από το αναμενόμενο μέγεθος του δείγματος. Επιπλέον, κατά την υλοποίηση της μελέτης, ταυτοποιήσαμε ένα έλλειμμα στην ανίχνευση του στόματος προκακοήθων αλλοιώσεων στο νησί [16] – [17], η οποία οδήγησε σε χαμηλότερη από την αναμενόμενη εγγραφή του αριθμού των ατόμων με διάγνωση του στόματος προκαρκινικές αλλοιώσεις (HK /EH και Αγγλικό Λεξικό της Οξφόρδης).

προκατάληψη Συμμετοχή σε μικρά δείγματα της μελέτης είναι ένα σημαντικό μέλημα στη μοριακή επιδημιολογία. Για την αντιμετώπιση αυτού του ζητήματος, έχουμε καταβάλει κάθε δυνατή προσπάθεια για να ελεγχθεί απαρατήρητα, δυναμικό υπο-ομάδες που θα θέτει προβλήματα όταν αναλύθηκαν διαγνωστικές ομάδες. Βρήκαμε ότι το δείγμα της μελέτης αντιπροσώπευαν το συνολικό πληθυσμό αναμεμιγμένο καλά. Παρ ‘όλα αυτά, χρειάζεται περισσότερη έρευνα, κατά προτίμηση με τη δημιουργία ενός μεγαλύτερου, συγκεντρωτική μελέτη Ισπανόφωνος ομάδα που θα σχεδιαστεί ειδικά για την αντιμετώπιση, λεπτομερώς, οι προγονικές εισφορές σε γενετική προδιάθεση για καρκίνο του στόματος, προ-καρκίνου και άλλων χρόνιων παθήσεων.

Εν ολίγοις, βρήκαμε ότι ούτε αυτο-προσδιορίζονται εθνικότητα, ούτε η καταγωγή δείκτες έδειξαν κάποια σημαντική συσχέτιση με τον καρκίνο του στόματος /κινδύνου προκαρκινικά στάδια στη μελέτη μας.

Επιπλέον, η εφαρμογή του καταγωγή πληροφοριακοί δείκτες (AIMS), ειδικά σχεδιασμένο για ισπανόφωνους, παρέχει μια βιώσιμη προσέγγιση για την αξιολόγηση και τον έλεγχο της καταγωγής σε μελλοντικές μελέτες στις οποίες συμμετείχαν Ισπανικός πληθυσμούς.

Ευχαριστίες

Είμαστε πολύ ευγνώμονες για συμμετέχοντες στη μελέτη μας, ειδικά για εκείνους που έχασαν τη μάχη τους ενάντια καρκίνο του στόματος, αλλά ήταν πρόθυμος να παράσχει γενετικό υλικό αφιερωμένο στην προφορική έρευνα για τον καρκίνο

Είμαστε ευγνώμονες στους συναδέλφους μας στο NYU-UPR RAAHP Κέντρο καρκίνο του στόματος στην Οδοντιατρική Σχολή, Σαν Χουάν, Πουέρτο Ρίκο.? ειδικά για Carmen J. Buxo, MPH, DrPH, Lumarie Cuadrado, Β.Α., Φ.Μ. και η Jennifer Guadalupe Berrios, BS για την πρόσληψη των συμμετεχόντων στην μελέτη μας. Ευχαριστούμε όλους τους συμμετέχοντες προσωπικό Εργαστήριο Παθολογίας γύρω από το Πουέρτο Ρίκο για διαγνωστικές πληροφορίες, και Δρ. Ellen Eisenberg και Stanley Kerpel που εξέτασε όλες τις μικροσκοπικές διαφάνειες που συλλέγονται κατά τη διάρκεια της μελέτης.

Το έργο αυτό δεν θα ήταν δυνατή χωρίς την ευγενική και εξειδικευμένη υποστήριξη από το Πανεπιστήμιο του Νέου Μεξικού Κέντρου Προχωρημένων Ερευνών Computing, και το Πανεπιστήμιο της νέο Μεξικό Κέντρο Καρκίνου κοινό αγαθό για την Βιοπληροφορική και Υπολογιστική Βιολογία. Ένα ιδιαίτερο ευχαριστώ πηγαίνει στον Daniel Felker, BS για την αφοσίωση και την εμπειρία του που προβλέπονται αναλύσεις υπερυπολογιστών μας.