Αφηρημένο

Ιστορικό

Η ταυτοποίηση των γονιδίων ευαισθησίας για συγκεκριμένους τύπους καρκίνου μπορεί να παρέχει τις απαραίτητες πληροφορίες για την πλήρη χαρακτηρισμό των συνδρόμων καρκίνου. Οκτώ πολυμορφισμούς μονών νουκλεοτιδίων (SNPs), rs465498, rs17728461, rs4488809, rs753955, rs13361707, rs9841504, rs2274223, και rs13042395, αναφέρθηκαν από μελέτες συσχέτισης γονιδιώματος μεγάλη (GWASs) να συνδέεται στενά με την ευαισθησία του καρκίνου του πνεύμονα (LC), γαστρικό καρκίνο (GC) ή καρκίνο του οισοφάγου (ΕΚ) του πληθυσμού Han από τη βόρεια ή νότια Κίνα. Ωστόσο, Κινέζοι Χαν ανθρώπους από διαφορετικές γεωγραφικές περιοχές μπορεί να έχουν διαφορετικό γενετικό υπόβαθρο. Η μελέτη αυτή έχει ως στόχο να αξιολογήσει τις γενετικές συσχετίσεις των οκτώ SNPs που αναφέρθηκαν παραπάνω με τρεις καρκίνους του κινδύνου σε έναν πληθυσμό Han από τα βορειοδυτικά της Κίνας.

Μέθοδοι

Ένα σύνολο 186 καρκίνου χωρίς ελέγχους και 436 περιπτώσεις με μη-μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα (NSCLC) (159 περιπτώσεις), μη καρδιακή GC (167 περιπτώσεις) ή ΕΚ (110 περιπτώσεις) συμμετείχαν σε αυτή τη μελέτη. Chi-square test και polytomous αναλύσεις λογιστικής παλινδρόμησης χρησιμοποιήθηκαν για να εκτιμηθεί η σχέση μεταξύ οκτώ SNPs σχετίζονται με τον καρκίνο και τρεις καρκίνους σε έναν πληθυσμό Κινέζων Χαν από την βορειοδυτική Κίνα. Τα υλικοτεχνική αποτελέσματα παλινδρόμησης προσαρμόστηκαν για συγχυτικούς παράγοντες και False Discovery Rate μέθοδο Benjamini και Hochberg (FDR) χρησιμοποιήθηκε για να ρυθμίσετε τις πολλαπλές δοκιμές υπόθεση. Σύλλογος αναλύσεις από το κάπνισμα ή την κατάσταση του πόσιμου οινοπνεύματος αναλύθηκαν από crossover αναλύσεις.

Αποτελέσματα

Ένα από τα οκτώ SNPs, rs17728461 συνδέθηκε με την ευαισθησία NSCLC (σε ένα ετερόζυγο μοντέλο, OR = 0,44, 95% CI = 0,27 – 0,72,

σ

= 0.001). Δύο SNPs, rs753955 και rs13042395, συσχετίστηκαν με τον κίνδυνο της μη καρδιακή GC σε διαφορετικά γενετικά μοντέλα (

σ

& lt? 0,05). Δεν SNPs συνδέθηκαν με ΕΚ. αναλύει τα crossover έδειξε ότι η rs13042395 CT γονότυπο, σε συνδυασμό με το κάπνισμα τσιγάρων ή η κατανάλωση αλκοόλ, θα μπορούσε να αυξήσει περαιτέρω τον κίνδυνο για μη καρδιακή GC (

σ

& lt? 0,05).

Συμπεράσματα

Αυτά τα αποτελέσματα έδειξαν ότι rs17728461 μπορεί να σχετίζεται ειδικώς με τον κίνδυνο NSCLC. rs753955 και rs13042395 ήταν ειδικά συνδέονται με ευαισθησία σε μη καρδιακή GC στην Ningxia Κινέζων Χαν. Ευαισθησία που σχετίζεται με πολυμορφισμούς στα βορειοδυτικά Κινέζων Χαν δεν ήταν πολύ σύμφωνες με αυτές στα βόρεια Κινέζων Χαν ή νότια κινεζική Χαν. εξακολουθεί να απαιτείται η επικύρωση αυτών των ευρημάτων με μια λειτουργική αξιολόγηση και μεγαλύτερο πληθυσμό

Παράθεση:. Dong Υ, Chen J, Chen Ζ, Tian C, Lu Η, Ruan J, et al. (2015) Αξιολόγηση της σύνδεσης των Οκτώ πολυμορφισμών με Καρκίνο Ευαισθησία σε Κινέζους Χαν πληθυσμού. PLoS ONE 10 (7): e0132797. doi: 10.1371 /journal.pone.0132797

Συντάκτης: Scott M. Langevin, Πανεπιστήμιο του Cincinnati College of Medicine, Ηνωμένες Πολιτείες |

Ελήφθη: 18 Φλεβάρη του 2015? Αποδεκτές: 18 Ιουνίου 2015? Δημοσιεύθηκε: 15 Ιουλίου 2015

Copyright: © 2015 Dong et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Δεδομένα Διαθεσιμότητα: Όλα τα σχετικά δεδομένα είναι εντός του χαρτιού

Χρηματοδότηση: το έργο χρηματοδοτήθηκε από το Εθνικό Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας (αριθμοί επιχορήγηση 81460434, 81160249, 81260339, 81301886 και 81160252 για να WJY, JC, και HSL? http:. //www.nsfc.gov.cn/), το Ίδρυμα Επιστημών Ningxia Φυσικό (αριθμός επιχορήγηση NZ13057 να WJY). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Ο καρκίνος είναι πλέον κατανοητό να έχουν τόσο ένα γενετικό και ένα περιβαλλοντικό συστατικό. Μελέτες των κληρονομικών συνδρόμων καρκίνου και στοχευμένες και αναλύσεις μετάλλαξης γονιδίωμα-ευρεία έχουν παράσχει επαρκή αποδεικτικά στοιχεία για τη συμμετοχή των γενετικών αλλοιώσεων στην καρκινογένεση [1]. Κατανόηση γενετικοί παράγοντες σε σχέση με τον καρκίνο είναι σημαντική, γιατί τον προσδιορισμό αυτών των παραγόντων μπορεί να είναι χρήσιμη για την πρόβλεψη του κινδύνου και για την ανάπτυξη των παραγόντων χημειο-προληπτικών και άλλων προληπτικών μέτρων [2].

Μέχρι τώρα, γονιδιώματος σε επίπεδο μελετών συσχετισμού (GWASs), μια ισχυρή μέθοδος για τη διερεύνηση των γενετικών καθοριστικών παραγόντων πολύπλοκες ασθένειες, έχουν εντοπίσει επιτυχώς εκατοντάδες SNPs που σχετίζονται με τον κίνδυνο καρκίνου του [3], συμπεριλαμβανομένου του καρκίνου του πνεύμονα (LC), γαστρικό καρκίνο (GC), και καρκίνο του οισοφάγου (ΕΚ ). Η GWAS από τον Hu

et al

ανέφερε ότι τέσσερα SNPs, rs465498 σε 5p15.33, rs17728461 στο 22q12, rs4488809 στο 3q28, και rs753955 στο 13q12, συσχετίστηκαν με τον κίνδυνο LC στην Κινέζων Χαν [4]. Δύο νέα SNPs, rs13361707 σε 5q13.1 και rs9841504 στο 3q13.31, που προσδιορίζονται από Shi

et al

, συσχετίστηκαν σε σημαντικό βαθμό με τον κίνδυνο της GC [5]. Δύο SNPs, rs2274223 στο 10q23 και rs13042395 σε 20p13, συσχετίστηκαν με τον κίνδυνο της ΕΚ σε ένα μεγάλο αριθμό των Κινέζων Χαν [6]. Ωστόσο, οι πληθυσμοί των Χαν που συμμετείχαν σε αυτές τις τρεις GWASs επιλέχθηκαν κυρίως από τη βόρεια Κίνα (Πεκίνο) ή νότια Κίνα (Nanjing πόλη της επαρχίας Jiangsu). Κινέζοι Χαν άνθρωποι από διαφορετικά μέρη μπορεί να έχουν διαφορετικό γενετικό υπόβαθρο που οφείλεται σε πολύπλοκες προέλευσή τους και τη μακρά ιστορία της αλληλεπίδρασης με πολλά γύρω από εθνοτικές [7] ομάδων. Ως εκ τούτου, οι άνθρωποι Χαν από την αυτόνομη περιοχή Ningxia Hui, η οποία βρίσκεται στη βορειοδυτική Κίνα, μπορεί να έχει ένα διαφορετικό γενετικό υπόβαθρο από εκείνες στη βόρεια ή νότια Κίνα. Για να διερευνήσουν περαιτέρω τις ενώσεις και τις ιδιαιτερότητες των οκτώ SNPs (rs465498, rs17728461, rs4488809, rs753955, rs13361707, rs9841504, rs2274223, και rs13042395) που αναφέρθηκαν παραπάνω με την ευαισθησία των τριών μορφών καρκίνου στον πληθυσμό Κινέζων Χαν στην περιοχή Ningxia της βορειοδυτικής Κίνας, μια μελέτη ασθενών-μαρτύρων νοσοκομείο με βάση εκτελέστηκε.

δείγματα και τις μεθόδους

πληθυσμός μελέτης και της συλλογής δεδομένων

Όλα τα δείγματα ήταν από τους κατοίκους Ningxia Han οποίων η προγονική μητρική διαβίωσης θέσεις ήταν Ningxia Hui Αυτόνομη Περιφέρεια και τουλάχιστον τρεις γενιές της οικογένειάς τους ήταν άνθρωποι Χαν. Οι ασθενείς με πρωτοπαθή μη μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα (NSCLC), μη καρδιακή GC ή ΕΚ προσλήφθηκαν μεταξύ 2009 και 2012 στο Γενικό Νοσοκομείο της Ningxia Ιατρικό Πανεπιστήμιο (Ningxia περιοχή, Κίνα). Όλοι οι εγγεγραμμένοι ασθενείς με καρκίνο είχαν διαγνωστεί με παθολογικά μέσα και διαγνώσεις τους ήταν ιστολογικά επιβεβαιωμένη. Επιπλέον, οι ασθενείς με χρόνιες παθήσεις, καταστάσεις που εμπλέκονται ζωτικά όργανα, ή σοβαρή ενδοκρινολογικές, μεταβολικές, ή θρεπτική ασθενειών εξαιρέθηκαν από αυτή τη μελέτη. Οι ασθενείς αποκλείστηκαν επίσης αν είχαν λάβει καμία μετάγγιση αίματος κατά τη διάρκεια των τελευταίων 6 μηνών, ανοσοκατασταλτική θεραπεία, χημειοθεραπεία ή ακτινοθεραπεία.

Υγιεινή, άσχετα άτομα ήταν τυχαία προσληφθεί ως υποκείμενα ελέγχου από το κέντρο check-up της υγείας κατά την Γενικό Νοσοκομείο κατά την ίδια περίοδο. Το κριτήριο ένταξης για τους μάρτυρες ήταν η απουσία της ιστορίας του καρκίνου. Κανένα από αυτά τα υγιή άτομα είχαν ιστορικό επαφής με ισχυρή καρκινογόνο, όπως ο αμίαντος, τριοξείδιο του αρσενικού, το βενζόλιο και ούτω καθεξής.

Κάθε θέμα προσωπικά αμφισβητήθηκε από εκπαιδευμένους ερευνητές χρησιμοποιώντας ένα προ-δοκιμαστεί ερωτηματολόγιο για να λάβουν πληροφορίες σχετικά με τη δημογραφική δεδομένων, συμπεριλαμβανομένης της ηλικίας κατά τη διάγνωση, το φύλο, την εθνικότητα, το οικογενειακό ιστορικό καρκίνου, κατοικημένη περιοχή, το επάγγελμα, που ζουν και τις διατροφικές συνήθειες (

e

.

g

., το κάπνισμα και η κατανάλωση αλκοόλ) . Τα άτομα που κάπνιζαν ένα τσιγάρο ανά ημέρα για περισσότερο από 1 χρόνο ταξινομήθηκαν ως καπνιστές και εκείνοι που είχαν τρεις ή περισσότερες φορές αλκοολούχα ποτά την εβδομάδα για περισσότερο από 6 μήνες ορίστηκαν ως πότες οινοπνεύματος. Μετά τη συνέντευξη, 2-ml δείγματα φλεβικού αίματος συλλέχθηκαν από κάθε συμμετέχοντα για την παρασκευή DNA και προσδιορισμού του γονότυπου. Τέλος, 440 περιπτώσεις (συμπεριλαμβανομένων 162 ασθενών με NSCLC, 168 ασθενείς GC μη-καρδιακή και 110 ασθενείς ΕΚ) και 186 του καρκίνου χωρίς ελέγχους συμπεριλήφθηκαν στην παρούσα μελέτη.

Αυτή η μελέτη ασθενών-μαρτύρων νοσοκομείο με βάση εγκρίθηκε από την Επιτροπή Δεοντολογίας Ιατρική Επανεξέταση της Ningxia Ιατρικό Πανεπιστήμιο (Ningxia περιοχή, Κίνα). Υπεγράφη ενημερωμένη συγκατάθεση λήφθηκε από κάθε συμμετέχοντα.

επιλογή SNP και του γονότυπου

Λογοτεχνία για GWASs δημοσιευόταν μέχρι το Δεκέμβριο 2012 αναθεωρήθηκε, και των υποψήφιων SNPs που είχαν προηγουμένως αναφερθεί να σχετίζεται με LC (rs465498, επιλέχθηκαν rs753955, rs17728461, και rs4488809), GC (rs13361707 και rs9841504) και ΕΚ (rs2274223 και rs13042395) για την έρευνα. Γενωμικό DNA εκχυλίστηκε από τα περιφερειακά λευκοκύτταρα αίματος των συμμετεχόντων χρησιμοποιώντας ένα QIAamp DNA Mini Kit (Qiagen, Hilden, Germany) ακολουθώντας τις οδηγίες του κατασκευαστή και αποθηκεύονται στους -20 ° C μέχρι τη χρήση.

Το έργο γονοτυποποίηση SNP ήταν εκτελείται από μια βελτιωμένη μέθοδο αντίδραση ανίχνευσης πολυπλεξίας λιγάσης (iMLDR, Genesky Bio-Tech Cod., Ltd, Shanghai, Κίνα) όπως περιγράφηκε προηγουμένως [8]. Οι εκκινητές για την αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης (PCR) και οι ανιχνευτές για την LDR εισήχθησαν στον Πίνακα τέθηκαν 1. Δύο αρνητικά δείγματα αναφοράς: ένα με διπλά αποσταγμένο νερό ως μήτρα και το άλλο με δείγμα DNA χωρίς εκκινητές, διατηρώντας όλες τις άλλες συνθήκες τις ίδιο σε ένα πιάτο. Διπλότυπα δοκιμασίες σχεδιάστηκαν και τα αποτελέσματα ήταν συνεπή. Τα ποσοστά κλήσης στο γονοτυπική όλων αυτών των οκτώ SNPs ήταν πάνω από 99% (Πίνακας 2). Τρεις NSCLC περιπτώσεις και μία περιπτώσεις GC μη καρδιακή αποκλείστηκαν λόγω της χαμηλής ποιότητας του γονότυπου. rs9841504 και rs2274223 επιλέχθηκαν επίσης και ο γονότυπος τόσο από τη μέθοδο iMLDR και άμεση μέθοδος προσδιορισμού αλληλουχίας για την αξιολόγηση του συσχετισμού του γονότυπου. Τα ποσοστά αντιστοιχίας στην γονοτυπική των δύο SNPs ήταν 100%. Τέλος, 436 περιπτώσεις (159 ασθενείς με NSCLC, 167 ασθενείς μη καρδιακή GC, και 110 ασθενείς ΕΚ) και 186 του καρκίνου χωρίς ελέγχους συμπεριλήφθηκαν στην παρούσα μελέτη.

Η

Η στατιστική ανάλυση

Μια δοκιμασία chi-τετράγωνο χρησιμοποιήθηκε για να αξιολογήσει τις διαφορές στις κατανομές των δημογραφικών χαρακτηριστικών, επιλεγμένες μεταβλητές και γονοτύπων μεταξύ των περιπτώσεων και ελέγχων. Συνεχείς μεταβλητές αναλύθηκαν χρησιμοποιώντας το

t

test του Student. συχνότητες γονότυπο στα θέματα ελέγχου για κάθε SNP ελέγχθηκαν για αναχώρηση από Hardy-Weinberg ισορροπία (HWE) χρησιμοποιώντας την καλοσύνη-of-fit

χ

2

δοκιμή. Polytomous αναλύσεις λογιστικής παλινδρόμησης χρησιμοποιήθηκαν για να υπολογιστούν οι προσαρμοσμένοι λόγοι πιθανοτήτων (OR) και τα διαστήματα εμπιστοσύνης 95% (ΚΠ) για τη σύνδεση μεταξύ των γενετικών παραλλαγών και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου, όπως αξιολογείται με διαφορετικό γενετικό μοντέλα (πρόσθετο, ετερόζυγο, ομόζυγο και κυρίαρχο και υπολειπόμενο) προσαρμοσμένο για την ηλικία, το φύλο, το οικογενειακό ιστορικό καρκίνου, το κάπνισμα και το καθεστώς κατανάλωση αλκοόλ. False Discovery Rate μέθοδο Benjamini και Hochberg (FDR) χρησιμοποιήθηκε για να ρυθμίσετε τις πολλαπλές δοκιμές υπόθεση. Crossover αναλύσεις χρησιμοποιήθηκαν για τη διεξαγωγή ένωση αναλύσεις μεταξύ rs13042394 και μη καρδιακή GC από το κάπνισμα ή την κατάσταση κατανάλωσης αλκοόλ. Όλες οι στατιστικές αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση του Microsoft Excel 2007, SPSS 17.0 στατιστικό πακέτο (SPSS, Chicago, IL) και το πρόγραμμα plink-1,07-dos. Το πρότυπο α = 0,05.

Αποτελέσματα

Δημογραφικά στοιχεία των συμμετεχόντων

Τα δημογραφικά στοιχεία όπως η ηλικία, το φύλο και το οικογενειακό ιστορικό καρκίνου, το κάπνισμα, το αλκοόλ και το ποτό για όλα τα θέματα που προσλαμβάνονται σε αυτή τη μελέτη συνοψίζονται στον πίνακα 3. Υπήρχαν σημαντικές διαφορές μεταξύ των NSCLC, μη καρδιακή GC ή ομάδα ΕΚ και της ομάδας ελέγχου σε ηλικία (

σ

& lt? 0,05). Στατιστική διαφορά βρέθηκε στο φύλο μεταξύ της ομάδας NSCLC (άνδρες αντιπροσωπεύουν το 64,2%) και την ομάδα ελέγχου (άνδρες αντιπροσωπεύουν το 60,8%). Ωστόσο, τα ποσοστά των αρσενικών σε μη καρδιακή GC (72,5%) και ΕΚ (74,5%) ήταν υψηλότερη από ότι στην ομάδα ελέγχου (60,8%). Η διαφορά μεταξύ NSCLC και της ομάδας ελέγχου στην κατανάλωση αλκοόλ δεν ήταν σημαντική, αλλά πιο NSCLC ασθενών ήταν καπνιστές τσιγάρων (

σ

= 0,027). Στατιστικά σημαντικές διαφορές βρέθηκαν μεταξύ των μη-καρδιακή GC ή ΕΚ και το κάπνισμα, κατανάλωση αλκοόλ ή οικογενειακό ιστορικό καρκίνου (

σ

& lt? 0,05).

Η

Τα αποτελέσματα της εφοδιαστικής αναλύσεις παλινδρόμησης στον πίνακα 4 έδειξαν ότι η συσχέτιση μεταξύ NSCLC και της έκθεσης του καπνίσματος ήταν σημαντική (OR = 1,65, 95% CI = 1,06 – 2,57,

σ

= 0,027). Παρόμοια αποτελέσματα βρέθηκαν μεταξύ των μη-καρδιακή GC ή ΕΚ και την έκθεση του καπνίσματος (OR = 2,91, 95% CI = 1,88 – 4,51,

σ

& lt? 0.001, και OR = 2.72, 95% CI = 167- 4.42,

σ

& lt? 0.001, αντίστοιχα) ή αλκοόλ πόσιμο έκθεσης (OR = 3,22, 95% CI = 1,92 – 5,39,

σ

& lt? 0.001, και OR = 3,11, 95% CI = 1,76 – 5,48,

σ

& lt? 0.001, αντίστοιχα)

η

Γενετική διανομή των SNPs σε μια μελέτη ασθενών-μαρτύρων

Βασικές πληροφορίες του. επιλέγεται SNPs δείχθηκε στον πίνακα 2. Όλα τα SNPs είχαν κατανομές εντός των παραμέτρων του HWE για τον πληθυσμό ελέγχου. Οι συχνότητες γονοτύπου των οκτώ SNPs στις περιπτώσεις και έλεγχοι παρουσιάζονται στον Πίνακα 5.

Η

Σύνδεσης μεταξύ SNPs και καρκίνους

Polytomous αναλύσεις λογιστικής παλινδρόμησης χρησιμοποιήθηκαν για να εκτιμηθεί η συσχέτιση μεταξύ SNPs και τον κίνδυνο του καρκίνου με τη χρήση διαφορετικών γενετικών μοντέλων. Τα αποτελέσματα παρατίθενται στους Πίνακες 6 και 7, καθώς και όλα τα αποτελέσματα προσαρμόστηκαν ανάλογα με την ηλικία, το φύλο, το οικογενειακό ιστορικό καρκίνου, το κάπνισμα και η κατανάλωση αλκοόλ.

Η

Αφού ρυθμιστεί από Benjamini και Hochberg False Discovery Rate μέθοδο (FDR), μόνο ένα από τα οκτώ SNPs, rs17728461 στο

HORMAD2

–

LIF

γονίδιο που σχετίζεται με NSCLC κίνδυνο. Η ετεροζυγώτες CG της rs17728461, σε σύγκριση με την CC ομοζυγώτες, συσχετίστηκε με μειωμένο κίνδυνο NSCLC (προσαρμογή OR = 0.44, 95% CI = 0,27 – 0,72,

σ

= 0,0010).

Δύο από τα οκτώ SNPs, rs753955 στο

MIPEP TNFRSF19-

γονιδίων και rs13042395 στο

C20orf54

γονιδίου, συνδέθηκαν με την ευαισθησία των μη-καρδιακή GC. rs753955 G-αλληλόμορφο συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο μη καρδιακή GC (προσθετικό μοντέλο: OR = 1.86, 95% CI = 1,34 – 2,58,

σ

= 0,0002). Στο μοντέλο ομοζυγώτες, ο κίνδυνος GC μη καρδιακή φορέων γονότυπο GG rs753955 ήταν 4,69 φορές από ό, τι εκείνοι που φέρουν rs753955 γονότυπο ΑΑ (OR = 4,69, 95% CI = 02.18 – 10.08,

σ

= 0,0001) Ίδιο αποτέλεσμα βρέθηκε στο υπολειπόμενο μοντέλο (OR = 4,04, 95% CI = 1,99 – 8,23,

σ

= 0,0001). Ομοίως, rs13042395 CT γονότυπο ή CT + ΤΤ γονότυπο σχετίζονταν με αυξημένο κίνδυνο μη καρδιακή GC, σε σύγκριση με το CC γονότυπο (μοντέλο ετεροζυγώτες, OR = 2.54, 95% CI = 1,57 – 4,10,

p =

0,0001? κυρίαρχο μοντέλο:. OR = 2.25, 95% CI = 1,43 – 3,53,

σ

= 0,0004)

Ωστόσο, δεν υπάρχει σύνδεση μεταξύ των οκτώ SNPs και τον κίνδυνο ΕΚ παρατηρήθηκε σε αυτή τη μελέτη .

ανάλυση crossover από το κάπνισμα ή το αλκοόλ κατάσταση πόσιμο

Τα αποτελέσματα των crossover αναλύσεων από το κάπνισμα τσιγάρων ή η κατανάλωση αλκοόλ ήταν απεικονίζονται στον πίνακα 8. ανάλυση crossover έδειξε ότι υπάρχουν σημαντικά αυξημένο κίνδυνο μη καρδιακό GC μεταξύ των συμμετεχόντων με rs13042395 CT + ΤΤ γονότυπο ο οποίος ήταν επίσης καπνιστές ή πότες αλκοόλ σε σύγκριση με εκείνα των καπνιστών χωρίς τσιγάρο ή πότες μη-αλκοόλη που έφερε το γονότυπο rs13042395 CC (προσαρμογή OR = 6.03, 95% CI = 2,63 -13.86,

σ

& lt? 0,0001, και προσαρμογή OR = 4,62, 95% CI = 1,87 – 11,39,

σ

= 0,0009, αντίστοιχα). Όταν αυτές εστιάζονται σε rs13042395 CT φορείς οι οποίοι ήταν επίσης καπνιστές ή πότες το αλκοόλ, ο κίνδυνος της μη καρδιακή GC αυξήθηκε περαιτέρω (προσαρμογή OR = 6.75, 95% CI = 2,78 – 16,36,

σ

& lt? 0,0001, και προσαρμογή OR = 7.47, 95% CI = 2,50 – 22,32,

σ

= 0,0003, ξεχωριστά).

η

Συζήτηση

ο καρκίνος είναι η δεύτερη κύρια αιτία θανάτου και αναπηρίας στον κόσμο, πίσω μόνο από καρδιακή νόσο [9]. Σύμφωνα με τη νέα έκδοση του Διεθνούς Οργανισμού Ερευνών για τον Καρκίνο (IARC) ‘s σε απευθείας σύνδεση GLOBOCAN βάση δεδομένων του 2012, μεταξύ των πάνω από δύο δωδεκάδες διακριτές καρκίνους που έχουν εξεταστεί, LC, μη καρδιακή GC, και ΕΚ κατάταξη στην πρώτη δεκάδα στη συχνότητα εμφάνισης και τα ποσοστά θνησιμότητας [10]. Περίπου το 40% των νέων κρουσμάτων και των θανάτων από αυτές τις τρεις καρκίνους στον κόσμο έχουν συμβεί στην Κίνα, η οποία καθιστά LC, μη καρδιακή GC και ΕΚ μια μεγάλη απειλή για την ανθρώπινη υγεία στην Κίνα [10].

Για να εκτιμηθεί η συσχετίσεις μεταξύ των SNPs και καρκίνους, ένας μεγάλος αριθμός μελετών έχουν διεξαχθεί κατά την τελευταία δεκαετία σε διάφορες πληθυσμιακές ομάδες, συμπεριλαμβανομένων των Κινέζων Χαν. Ο πληθυσμός Κινέζων Χαν είναι η μεγαλύτερη εθνοτική ομάδα στην Κίνα, συνθέτοντας το 98% του συνόλου του πληθυσμού της Κίνας [7]. Μερικές μελέτες έχουν αναφέρει ότι το γενετικό υπόβαθρο του πληθυσμού Χαν στη βόρεια Κίνα είναι διαφορετική από ότι στη νότια Κίνα [11-14]. Ως εκ τούτου, ο πληθυσμός Κινέζων Χαν, ένας φαινομενικά ομοιογενή πληθυσμό, στην πραγματικότητα έχει μια περίπλοκη υποδομή. Σε αυτή τη μελέτη, αναλύσαμε τις συσχετίσεις μεταξύ των οκτώ SNPs που είχαν προηγουμένως αναφερθεί σε GWASs από δύο πληθυσμούς Han σε διαφορετικά γεωγραφικά σημεία και NSCLC, μη καρδιακή GC και ΕΚ σε έναν πληθυσμό Κινέζων Χαν από την βορειοδυτική Κίνα.

μεταξύ των οκτώ SNPs, μόνο rs17728461 ήταν ειδικά σχετίζεται με NSCLC στη μελέτη μας. rs17728461 βρίσκεται στο 22q12.2, περίπου 38 kb κατάντη του

LIF

γονίδιο που κωδικοποιεί ανασταλτικό παράγοντα λευχαιμίας (LIF). LIF διαδραματίζει σημαντικό ρόλο στη διαδικασία της LC από το μορφοτροπέα σήματος και ενεργοποιητής της μεταγραφής 3 (STAT3) οδού [15, 16]. Hu

et al

‘s GWAS εντοπίστηκε για πρώτη φορά rs17728461 G-αλληλόμορφο ως παράγοντας κινδύνου της LC σε πληθυσμούς Χαν από τη βόρεια και τη νότια Κίνα. Σε αντίθεση, όμως, το έργο μας διαπίστωσε ότι rs17728461 G-αλληλόμορφο συσχετίστηκε με μειωμένο κίνδυνο NSCLC σε έναν πληθυσμό Χαν από την βορειοδυτική Κίνα. Οι πληροφορίες αλληλόμορφο δείχνει ότι η συχνότητα έλασσον αλληλόμορφο (MAF) της rs17728461 στον πληθυσμό από την βορειοδυτική Κίνα και οι πληθυσμοί από τη βόρεια και τη νότια Κίνα ποικίλουν ευρέως (0,26

vs

. 0,17).

Δύο άλλες SNPs, rs753955 και rs13042395 παρατηρήθηκαν να είναι ειδικά και ξεχωριστά που συνδέεται με τον κίνδυνο GC μη καρδιακή σε αυτή τη μελέτη. rs753955 βρίσκεται στο

MIPEP

γονιδίου σε 13q12.12, το οποίο κωδικοποιεί το μιτοχονδριακό ενδιάμεσο πεπτιδάσης (MIPEP). MIPEP μπορεί να συμβάλλει στην ανεπάρκεια φραταξίνη και χρησιμοποίηση του σιδήρου και τον ακριβή μηχανισμό της MIPEP στην καρκινογένεση πρέπει ακόμη να αντιμετωπιστούν στο μέλλον [17]. Hu

et al

‘s GWAS αναφέρθηκε για πρώτη φορά ότι rs753955 G-αλληλόμορφο συσχετίστηκε με την ευαισθησία των LC σε πληθυσμούς τόσο από τη βόρεια Κίνα και η νότια Κίνα. Στη μελέτη μας, ωστόσο, rs753955 G-αλληλόμορφο βρέθηκε να σχετίζεται με τον κίνδυνο GC μη καρδιακή αντί των κινδύνων LC στον πληθυσμό των Χαν από την βορειοδυτική Κίνα. Επιπλέον, έχουμε παρατηρήσει επίσης ότι rs13042395 T-αλληλόμορφο σχετίζεται με τον αυξημένο κίνδυνο μη καρδιακή GC. Τα αποτελέσματα της ανάλυσης crossover από το κάπνισμα ή την κατάσταση της κατανάλωσης αλκοόλ ανέφερε ακόμη ότι rs13042395 CT φορείς παρουσίασαν σημαντικά αυξημένο κίνδυνο μη καρδιακή GC όταν ήταν επίσης καπνιστές ή πότες αλκοόλ. rs13042395, που βρίσκεται στο

C20orf54

γονιδίου σε 20p13, αναφέρθηκε για πρώτη φορά ως παράγοντας κινδύνου για οισοφαγικό καρκίνωμα πλακωδών κυττάρων (ESCC) σε Wang

et al

‘s GWAS της βόρειας πληθυσμού Χαν. Ωστόσο, πέντε μελέτες από διάφορες ομάδες, μεταξύ των οποίων η δική μας, απέτυχε να βρει οποιαδήποτε συσχέτιση με την ΕΚ [18-21]. Επιπλέον, σε μια μεταγενέστερη μελέτη, ο Wang

et al

ανέφεραν μια διόρθωση ότι το δημοσιευθεί ένωση για rs13042395 T-αλληλόμορφο δεν θα μπορούσε να επαναληφθεί και σε πρόσθετες αναλύσεις των δεδομένων από την ίδια περιοχή? το αρχικό εύρημα θα μπορούσε να είναι το αποτέλεσμα μιας ανεπαρκούς ελέγχου για τη διαστρωμάτωση του πληθυσμού, χρησιμοποιώντας γενετικά απαράμιλλη θέματα ή, λιγότερο πιθανό, θα μπορούσε να οφείλεται στην τύχη και μόνο [6].

Σε γενικές γραμμές, αναλύσαμε τις συσχετίσεις μεταξύ της αναφερόμενης οκτώ SNPs και ο κίνδυνος των τριών καρκίνων (NSCLC, μη καρδιακή GC και ΕΚ) σε έναν πληθυσμό Χαν από την βορειοδυτική Κίνα. στατιστικά στοιχεία μας έδειξαν ότι rs17728461 ήταν ειδικά σχετίζεται με τον κίνδυνο NSCLC, rs753955 και rs13042395 αφορούσαν ειδικά με ευαισθησία σε μη καρδιακή GC. Οι πολυμορφισμοί ευαισθησία στις βορειοδυτικές Κινέζων Χαν δεν ήταν πολύ συνεπής με εκείνα των βόρειο ή νότιο Κινέζων Χαν.

Συμπεράσματα

Εν κατακλείδι, το έργο μας και των άλλων έχουν δείξει ότι πολυμορφισμοί ευαισθησία προσδιορίζονται σε GWASs μπορεί να ποικίλει σε διαφορετικές εθνοτικές πληθυσμών, ακόμη και σε πολύ στενή πληθυσμούς Χαν που ζουν σε διαφορετικές γεωγραφικές περιοχές. Ωστόσο, πρέπει να αναφερθεί αρκετοί περιορισμοί της δουλειάς μας. Πρώτον, δεδομένου ότι όλοι οι συμμετέχοντες είχαν εγγραφεί από το νοσοκομείο και ο μέσος όρος ηλικίας των ελέγχων ήταν επίσης νεότερος από ό, τι εκείνες των περιπτώσεων, ως εκ τούτου, μεροληψία της επιλογής δεν μπορεί να αποκλειστεί. Δεύτερον, τα αποτελέσματά μας ελήφθησαν με περιορισμένο μέγεθος του δείγματος, που μας επιτρέπει να σχεδιάσετε μόνο προκαταρκτικά συμπεράσματα. Τέλος, οι λειτουργικές δοκιμασίες που απαιτούνται για περαιτέρω μελέτες. Ως εκ τούτου, απαιτείται η επικύρωση αυτών των ευρημάτων από την λειτουργική αξιολόγηση και με μεγαλύτερο πληθυσμό.

Ευχαριστίες

Σας ευχαριστούμε Wiley για τη γλωσσική βοήθεια κατά την προετοιμασία αυτού του χειρογράφου. Ευχαριστούμε όλους τους συμμετέχοντες της μελέτης αυτής.