Αφηρημένο

Το θαλάσσιο μύκητα

Microascus brevicaulis

στέλεχος LF580 είναι ένα μη-μοντέλο δευτεροβάθμια παραγωγός μεταβολίτη με υψηλές αποδόσεις των δύο δευτερογενών μεταβολιτών scopularides Α και Β, τα οποία εμφανίζουν διακριτές δραστηριότητες έναντι κυτταρικών γραμμών όγκου. Ένα μεταλλαγμένο στέλεχος ελήφθη με τη χρήση UV μεταλλαξιογονία, δείχνοντας ταχύτερη ανάπτυξη και τις διαφορές στο σχηματισμό ιζήματος εκτός υψηλότερα επίπεδα παραγωγής. Εδώ, δείχνουμε την πρώτη μελέτη proteome ενός θαλάσσιου μύκητα. Συγκριτικό πρωτεομική εφαρμόστηκαν για να αποκτήσουν βαθύτερη κατανόηση της ρύθμισης της παραγωγής και της φυσιολογίας του στελέχους άγριου τύπου και μεταλλαγμένων της. Για το σκοπό αυτό, καθορίστηκε ένα βελτιστοποιημένο πρωτόκολλο εκχύλισης πρωτεΐνης. Συνολικά, ταυτοποιήθηκαν 4759 πρωτεΐνες. Το κεντρικό μεταβολικό μονοπάτι του στελέχους LF580 χαρτογραφήθηκε χρησιμοποιώντας την ανάλυση οδό KEGG και GO σχολιασμό. Χρησιμοποιεί επισήμανση iTRAQ, 318 πρωτεΐνες φαίνεται ότι ρυθμίζεται σημαντικά στο μεταλλαγμένο στέλεχος: 189 ήταν καθοδική και 129 αυξητικά. Πρωτεομική είναι ένα ισχυρό εργαλείο για την κατανόηση των ρυθμιστικών πτυχών: Οι διαφορές στο επίπεδο proteome θα μπορούσε να αποδοθεί στην περιορισμένη θρεπτικών διαθεσιμότητα στο στέλεχος άγριου τύπου οφείλεται σε μια ισχυρή σχηματισμό ιζήματος. Η πληροφορία αυτή μπορεί να εφαρμοστεί για τη βελτιστοποίηση στο στέλεχος και το επίπεδο της διαδικασίας. Η σύνδεση μεταξύ των θρεπτικών συστατικών περιορισμό και τον σχηματισμό ιζήματος στο μη-μοντέλο μύκητα

Μ

.

brevicaulis

είναι σε συναίνεση με τη γνώση σχετικά με το μοντέλο οργανισμούς όπως

Aspergillus niger

και

Penicillium chrysogenum

Η

Παράθεση:. Kramer Α, Beck HC, Kumar Α, Kristensen LP, Imhoff JF, Labes Α (