Οι

Αφηρημένο

δείκτες μικροδορυφόρων που χρησιμοποιείται για την απώλεια-του-ετεροζυγωτίας, αλληλομόρφων ανισορροπία και κλωνικότητας αναλύσεις σε καρκίνους. Συνήθως, το DNA του όγκου σε σύγκριση με αντίστοιχο φυσιολογικό DNA. Ωστόσο, η κανονική DNA δεν είναι πάντα διαθέσιμη και μπορεί να εμφανίσει παρεκκλίνουσα αναλογίες αλληλόμορφο λόγω αριθμού αντιγράφων παραλλαγές στο γονιδίωμα. Επιπλέον, αιχμές τραύλισμα μπορεί να περιπλέξει την ανάλυση. Για να χρησιμοποιήσετε μικροδορυφορικών δεικτών για τη διάγνωση του υποτροπιάζοντος καρκίνου της ουροδόχου κύστης, στοχεύσαμε να επιλέξετε δεικτών χωρίς αιχμές τραύλισμα και μία σταθερή αναλογία μεταξύ αλληλομόρφων, αποφεύγοντας έτσι την ανάγκη για ένα δείγμα DNA ελέγχου. Ερευνήσαμε 49 δείκτες μικροδορυφορικού με τρι- και τετρανουκλεοτιδικές επαναλήψεις σε περιοχές που συνήθως χάνεται στον καρκίνο της ουροδόχου κύστης. Με βάση την ανάλυση των 50 ΟΝΑ αίματος επιλέχθηκαν οι 12 καλύτερες επιδόσεις δείκτες, με λίγες αιχμές τραύλισμα και μια σταθερή αναλογία μεταξύ των κορυφών ύψη. Ανά δείκτη άνω και κάτω κόψει τιμές για αναλογίες αλληλόμορφο προσδιορίστηκαν. LOH των δεικτών παρατηρήθηκε σε 59/104 DNAs όγκου. Στη συνέχεια προσδιορίζεται η ευαισθησία του πίνακα δείκτη για ανίχνευση του υποτροπιάζοντος καρκίνου της ουροδόχου κύστης με προσδιορισμό 102 δειγμάτων ούρων από αυτούς τους ασθενείς. Ευαισθησία ήταν 63% όταν οι ασθενείς κατανεμήθηκαν για ΑΕ σε πρωτοπαθείς όγκους τους. Έχουμε αποδείξει ότι η εκ των προτέρων επιλογή των μικροδορυφορικών δεικτών εξαλείφει την ανάγκη για ένα αντίστοιχο δείγμα αίματος. Για τη διάγνωση του καρκίνου της ουροδόχου κύστης υποτροπών στα ούρα αυτό μειώνει σημαντικά το κόστος. Επιπλέον, η προσέγγιση αυτή διευκολύνει την αναδρομική ανάλυση των αρχειακών δείγματα όγκων για αλληλομόρφων ανισορροπία

Παράθεση:. Van Tilborg Α.Ε.Ε., Kompier LC, Lurkin Ι, Poort R, El Bouazzaoui S, van der Keur K, et al. (2012) Η επιλογή των μικροδορυφορικών δεικτών για καρκίνο της ουροδόχου κύστης Η διάγνωση χωρίς την ανάγκη για αντίστοιχες αίματος. PLoS ONE 7 (8): e43345. doi: 10.1371 /journal.pone.0043345

Επιμέλεια: Masaru Katoh, Εθνικό Κέντρο Καρκίνου, Ιαπωνία

Ελήφθη: 2 Απριλίου του 2012? Αποδεκτές: 19 Ιούλ του 2012? Δημοσιεύθηκε: 22 Αυγούστου 2012