Ανακοίνωση Αναδημοσίευση

Αυτό το άρθρο αναδημοσιεύεται στις 18 Αυγούστου, το 2014, επειδή δύο από τα 16 σύνολα δεδομένων από TCGA (The Cancer Genome Atlas) που περιλαμβάνονται σε αυτή τη μελέτη, δηλαδή καρκίνος του τραχήλου (μορατόριουμ – 27 Σεπτεμβρίου του 2014) και πόρου αδενοκαρκίνωμα του παγκρέατος (μορατόριουμ – 30 Ιουλ 2015), χρησιμοποιήθηκαν σε αντίθεση με τις κατευθυντήριες γραμμές Δημοσίευση στο https://cancergenome.nih.gov/publications /publicationguidelines

οι συγγραφείς και η TCGA συμφώνησαν ότι η αναδημοσίευση του άρθρου με αυτά τα σύνολα δεδομένων αφαιρούνται θα επιλύσετε το πρόβλημα, και το προσωπικό Ακαδημαϊκό Editor και PLoS έχουν πεισθεί ότι τα αποτελέσματα και τα συμπεράσματα του άρθρου σταθεί χωρίς αυτά τα δύο σύνολα δεδομένων. Αναδημοσιεύουμε το άρθρο να αναφέρει τα αποτελέσματα που λαμβάνονται από τις 14 επιτρέπονται σύνολα δεδομένων

Η σύνοψη των αποτελεσμάτων αφηρημένα ήταν προηγουμένως:.

Πραγματοποιήσαμε ανάλυση GISTIC2 των TCGA σύνολα δεδομένων που εκτείνονται σε 16 καρκίνος υποτύπων και εντόπισε 486 γονίδια που ενισχύθηκαν σε δύο ή περισσότερα σύνολα δεδομένων. Ο κατάλογος περιορίστηκε σε 75 σχετίζονται με τον καρκίνο γονίδια με τους πιθανούς «druggable» ιδιότητες. Η πλειοψηφία των γονιδίων ήταν εντοπισμένες στο 14 αμπλικόνια εξαπλωθεί σε όλη την γονιδίωμα. Για τον εντοπισμό πιθανών γονιδίων οδηγός του καρκίνου, αναλύσαμε τα δεδομένα αριθμό αντιγράφων του γονιδίου και την έκφραση του mRNA από μεμονωμένα δείγματα ασθενών και εντόπισε 42 υποτιθέμενο γονίδια του οδηγού του καρκίνου που συνδέεται με ποικίλες ογκογόνων διαδικασιών

Η σύνοψη των αποτελεσμάτων αφηρημένα είναι τώρα.:

Πραγματοποιήσαμε ανάλυση GISTIC2 των TCGA σύνολα δεδομένων που εκτείνονται σε 14 υποτύπων καρκίνου και εντοπίστηκαν 461 γονίδια που ενισχύθηκαν σε δύο ή περισσότερα σύνολα δεδομένων. Ο κατάλογος περιορίστηκε σε 73 σχετίζονται με τον καρκίνο γονίδια με τους πιθανούς «druggable» ιδιότητες. Η πλειοψηφία των γονιδίων ήταν εντοπισμένες στο 13 αμπλικόνια εξαπλωθεί σε όλη την γονιδίωμα. Για τον εντοπισμό πιθανών γονιδίων οδηγός του καρκίνου, αναλύσαμε τα δεδομένα αριθμό αντιγράφων του γονιδίου και την έκφραση του mRNA από μεμονωμένα δείγματα ασθενών και εντόπισε 40 υποτιθέμενο γονίδια του οδηγού του καρκίνου που συνδέεται με ποικίλες ογκογόνων διαδικασιών.

Αναφορά

1. Chen Υ, McGee J, ο Τσεν Χ, Doman TN, Gong Χ, et al. (2014) Προσδιορισμός των Druggable Γονίδια Driver Καρκίνου ενισχυμένα σε όλη TCGA σύνολα δεδομένων. PLoS ONE 9 (5): doi e98293: 10.1371 /journal.pone.0098293.

Δείτε το άρθρο

PubMed /NCBI

Google Scholar

Η

Η

Παράθεση: Το

PLoS ONE

Προσωπικό ( 2014) Διόρθωση: Αναγνώριση Druggable γονίδια Driver Καρκίνου ενισχυμένα σε όλη TCGA σύνολα δεδομένων. PLoS ONE 9 (9): e107646. doi: 10.1371 /journal.pone.0107646

Δημοσιεύθηκε: δεύτερης Σεπτεμβρίου 2014

Copyright: © 2014 Η PLoS ONE προσωπικού. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται.