έχουν

Αφηρημένο

Πολλά αντίγραφο περιοχές αριθμό-μεταβληθεί (προσαρμογείς CNA) έχουν εντοπιστεί στο γονιδίωμα του καρκίνου του τραχήλου της μήτρας, κυρίως, επιμηκύνσεις των 3q και 5p. Ωστόσο, η συμβολή του αριθμού αντιγράφων αλλοιώσεις του τραχήλου της μήτρας καρκινογένεση είναι άλυτο, διότι γονιδιώματος σε επίπεδο υπάρχει μια έλλειψη συσχέτισης μεταξύ του αριθμού αντιγράφων αλλαγές και γονιδιακής έκφρασης. Σε αυτή τη μελέτη, ερευνήσαμε εάν προσαρμογείς CNA στις κυτταρικές σειρές Calo, CaSki, HeLa, και SiHa συσχετίστηκαν με αλλαγές στη γονιδιακή έκφραση. Κατά μέσο όρο, 19,2% των γονιδιωμάτων κυτταρική γραμμή είχε CNAs. Ωστόσο, μόνο το 2,4% αποτελείται ελάχιστη επαναλαμβανόμενες περιοχές (MRRs) κοινό σε όλες τις κυτταρικές σειρές. Λαμβάνοντας υπόψη ότι η 3q είχε περιορισμένη κοινή κέρδη (13%), 5p ήταν εντελώς διπλές περιοδικώς. Γονιδίωμα-ευρύ, μόνο το 15,6% των γονιδίων που βρίσκονται στην έκφραση μεταλλαγμένου γονιδίου προσαρμογείς CNA? Αντίθετα, το ποσοστό σε MRRs ήταν μέχρι 3 φορές αυτό. Χρ 5p επιβεβαιώθηκε εξ ολοκλήρου ενισχύθηκε από ψάρια? Ωστόσο, κατ ‘ανώτατο όριο 33,5% των διερευνηθούν γονίδια σε 5p είχαν απελευθερωθεί. Στο 3ο τρίμηνο, το ποσοστό αυτό ήταν 13,4%. Ακόμη και σε 3q26, η οποία είχε 5 MRRs και 38,7% κατ ‘επανάληψη έχει αποκτηθεί SNPs, το ποσοστό ήταν μόλις 15,1%. Είναι ενδιαφέρον, έως και 19% της απελευθερωμένης γονιδίων στα 5p και 73% στο 3q26 ρυθμίστηκαν προς τα κάτω, γεγονός που υποδηλώνει επιπλέον παράγοντες που εμπλέκονται στη γονιδιακή καταστολή. Οι απορυθμισμένη γονίδια στο 3ο τρίμηνο και 5p συνέβη σε συστάδες, γεγονός που υποδηλώνει τοπικών παραγόντων της χρωματίνης μπορεί επίσης να επηρεάσει τη γονιδιακή έκφραση. Σε περιοχές ενισχύθηκαν ασυνεχώς, μειωτικά γονίδια αυξήθηκε σταθερά καθώς ο αριθμός των ενισχυμένων SNPs αυξήθηκε (ρ & lt? 0,01, συσχέτιση Spearman του). Ως εκ τούτου, η μερική γονιδιακή ενίσχυση μπορεί να λειτουργούν σε φίμωση γονιδιακής έκφρασης. Πρόσθετες γονίδια στο 1ο τρίμηνο, 3ο τρίμηνο και 5p θα μπορούσαν να εμπλέκονται στην καρκινογένεση του τραχήλου της μήτρας, ειδικά σε απόπτωση. Αυτές περιλαμβάνουν

PARP1

στο 1ο τρίμηνο,

TNFSF10

και

ECT2

στο 3ο τρίμηνο του

και CLPTM1L

,

AHRR

,

PDCD6

, και

DAP

σε 5p. Συνολικά, η έκφραση του γονιδίου και αριθμό αντιγράφων προφίλ αποκαλύπτουν εκτός από το γονίδιο δόση παράγοντες, όπως επιγενετικές ή χρωματίνης τομείς, μπορεί να επηρεάσει την έκφραση γονιδίων εντός του εξ ολοκλήρου ενισχύονται τμήματα του γονιδιώματος

Παράθεση:. Vazquez-Mena O, Medina-Martinez I , Juárez-Torres Ε, Barron V, Espinosa Α, Villegas-Sepulveda Ν, et al. (2012) ενισχυμένα γονίδια μπορεί να υπερεκφράζεται, Αμετάβλητο, ή προς τα κάτω σε τραχήλου της μήτρας Γραμμές Cancer Cell. PLoS ONE 7 (3): e32667. doi: 10.1371 /journal.pone.0032667

Επιμέλεια: Alessandro Μαρτσέλο, Διεθνές Κέντρο Γενετικής Μηχανικής και Βιοτεχνολογίας, Ιταλία

Ελήφθη: 5 Σεπτεμβρίου 2011? Αποδεκτές: 30 του Γενάρη 2012? Δημοσιεύθηκε: 7, Μαρτίου 2012