Αφηρημένο

Ιστορικό

οισοφάγου καρκίνος ήταν η πέμπτη πιο συχνά διαγιγνώσκεται καρκίνος και η τέταρτη κύρια αιτία του καρκίνου που σχετίζονται με το θάνατο στην Κίνα το 2009. οισοφαγικό καρκίνωμα πλακωδών κυττάρων (ESCC) αντιπροσωπεύει περισσότερο από το 90 τοις εκατό του οισοφάγου καρκίνων. Γενετικοί παράγοντες πιθανώς να διαδραματίσουν σημαντικό ρόλο στην καρκινογένεση ESCC

Μέθοδοι

Θα διεξαχθεί μια μελέτη ασθενών-μαρτύρων νοσοκομείο βάση για την αξιολόγηση λειτουργικών

hTERT

rs2736098 G & gt?. Α και

TERT-CLPTM1L

rs401681 C & gt? πολυμορφισμών Τ μοναδικού νουκλεοτιδίου (SNPs), σχετικά με τον κίνδυνο ESCC. Εξακοσίων είκοσι εννέα ESCC περιπτώσεις και 686 έλεγχοι προσλήφθηκαν. γονότυπους τους προσδιορίστηκαν χρησιμοποιώντας την αντίδραση ανίχνευσης απολίνωση (LDR) μέθοδο.

Αποτελέσματα

Όταν το

τ-CLPTM1L

rs401681 CC ομοζυγώτες γονότυπο χρησιμοποιήθηκε ως ομάδα αναφοράς, η CT γονότυπο συσχετίστηκε με σημαντικά μειωμένο κίνδυνο ESCC (προσαρμογή OR = 0.74, 95% CI = 0,58 – 0,94,

σ

= 0,012)? οι παραλλαγές CT /ΤΤ συσχετίστηκαν με 26% μειωμένο κίνδυνο ESCC (προσαρμογή OR = 0.74, 95% CI = 0,59 – 0,93,

P

= 0,009). Το σημαντικά μειωμένο κίνδυνο ESCC που σχετίζονται με το

τ-CLPTM1L

rs401681 C & gt? Τ πολυμορφισμού συσχετίστηκε με το αντρικό φύλο, ηλικία (& lt? 63 χρόνια στη μελέτη μας) και η κατανάλωση αλκοόλ. Καμία συσχέτιση μεταξύ του

hTERT

rs2736098 G & gt?. Παρατηρήθηκε πολυμορφισμός και τον κίνδυνο ESCC

Συμπέρασμα

τ-CLPTM1L

rs401681 CT και CT /TT γονότυπους συσχετίστηκαν με μειωμένο κίνδυνο ESCC, ιδιαίτερα μεταξύ των ανδρών, οι νέοι ασθενείς και εκείνοι φέρεται να είναι πότες. Ωστόσο, τα αποτελέσματά μας είναι προκαταρκτικά συμπεράσματα. Οι μεγαλύτερες μελέτες με μεγαλύτερη αυστηρότητα σχέδια μελέτης που απαιτείται για να επιβεβαιωθούν τα ευρήματα αυτά

Παράθεση:. Yin J, Wang L, Zheng L, Wang Χ, Shi Υ, Shao A, et al. (2014)

τ-CLPTM1L

Rs401681 C & gt? Τ πολυμορφισμού συσχετίστηκε με μειωμένο κίνδυνο καρκίνου του οισοφάγου σε ένα κινεζικό πληθυσμό. PLoS ONE 9 (7): e100667. doi: 10.1371 /journal.pone.0100667

Επιμέλεια: Sai Yendamuri, Roswell Park Cancer Institute, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 31 του Ιούλη, 2013? Αποδεκτές: 29 Μάη 2014? Δημοσιεύθηκε: 9 του Ιουλίου 2014

Copyright: © 2014 Yin et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτή η μελέτη υποστηρίχθηκε εν μέρει από το Εθνικό Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας (81101889, 81000028), στην επαρχία Jiangsu Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών (BK2010333, BK2011481), Ίδρυμα Κοινωνικής Ανάπτυξης του Zhenjiang (SH2010017), Changzhou Νέα Ταλέντα και Επιστήμης-Τεχνολογίας του Ιδρύματος του Γραφείου Υγείας (QN201102 ), και το «333» Πρόγραμμα ελιτίστικη Εκπαίδευση Jiangsu (BRA2013135). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

οισοφάγου καρκίνος ήταν η πέμπτη πιο συχνά διαγιγνώσκεται καρκίνος και η τέταρτη κύρια αιτία θανάτου από καρκίνο σχετίζονται στην Κίνα το 2009 [1]. Οισοφάγου καρκίνος είναι πολύ επιθετική και σχετίζεται με κακή πρόγνωση [2]. Οισοφαγικό καρκίνωμα πλακωδών κυττάρων (ESCC) αντιπροσωπεύει περισσότερο από το 90 τοις εκατό των καρκίνων του οισοφάγου [3]. Το κάπνισμα και η υπερβολική κατανάλωση αλκοόλ είναι σημαντικοί παράγοντες περιβαλλοντικού κινδύνου για ESCC [4]. Ωστόσο, μόνο ένα υποσύνολο των ατόμων που εκτίθενται σε αυτούς τους παράγοντες κινδύνου για το περιβάλλον αναπτύσσεται ESCC, γεγονός που υποδηλώνει ότι οι γενετικοί παράγοντες, όπως οι πολυμορφισμοί ενός νουκλεοτιδίου (SNPs), μπορεί επίσης να συμβάλει στην ESCC καρκινογένεση.

Πρόσφατα, αρκετές ένωση γονιδίωμα-ευρεία μελέτες (GWAS) ανέφεραν ότι η κοινή πολυμορφισμοί της τελομεράσης ανάστροφης μεταγραφάσης-χειλεογναθουπερωιοσχιστία διαμεμβρανική 1 όπως, CLPTM1L (

τ-CLPTM1L

), η οποία βρίσκεται σε θέση 5p15.33, συσχετίστηκαν με τον κίνδυνο πολλών τύπων καρκίνου [5], [6]. Η 5p15.33 θέση, η οποία συνδέεται με τη λειτουργία της τελομεράσης, περιέχει δύο γονίδια-κλειδιά: το

TERT

γονίδιο και το

CLPTM1L

γονίδιο. Η

τ-CLPTM1L

SNP, rs401681 (C & gt? T, που βρίσκεται στο ιντρόνιο 13 του

CLPTM1L

, 27 kb από το

TERT

γονίδιο), είναι ένα από τα πιο εκτενώς SNPs. Οι δύο παραλλαγές στο 5p15 (rs401681 και rs2736098) σχετίζονται σημαντικά με τον καρκίνο της ουροδόχου κύστης σε άτομα της ευρωπαϊκής καταγωγής. Οι παραλλαγές αυτές είναι σε ανισορροπία σύνδεσης (LD) με

CLPTM1L

και

TERT

, και οι δύο παραλλαγές συνδέονται επίσης με βασικοκυτταρικό καρκίνωμα [6], τον καρκίνο του πνεύμονα [7], γλοίωμα [8] και άλλους όγκους [6]. Η

τ-CLPTM1L

rs401681 C αλληλόμορφο σχετίζεται επίσης με μικρότερο μέσο μήκος των τελομερών στα λεμφοκύτταρα [9]. Η τελομεράση εκφράζεται σε κυτταρικές σειρές βλαστικών και είναι αδρανές σε σωματικά κύτταρα [10]. TERT είναι η αντίστροφη μεταγραφάση καταλυτική υπομονάδα τελομεράσης, του οποίου η επαγωγή, μαζί με την ενεργοποίηση της τελομεράσης, είναι κρίσιμα βήματα κατά την κυτταρική αθανατοποίηση και τον μετασχηματισμό [11]. Τα τελομερή μπορεί να γίνει δυσλειτουργική για λόγους ποικιλίας, όπως σταδιακή βράχυνση που προκλήθηκε από ατελή αναδιπλασιασμό των χρωμοσωμάτων, οξειδωτική βλάβη του DNA ή μεταλλάξεις σε δομικές πρωτεΐνες, όπως τριτ [12]. Μεταλλάξεις στις περιοχές κωδικοποίησης του TERT μπορεί να επηρεάσει τελομεράσης δραστηριότητα και το μήκος των τελομερών, με αποτέλεσμα τη σοβαρή κλινικών φαινοτύπων, συμπεριλαμβανομένων συνδρόμων ανεπάρκειας του μυελού των οστών και μια σημαντική αύξηση στη συχνότητα του καρκίνου [13].

Ο ρόλος των CLPTM1L περιγράφηκε αρχικώς σε καρκινικά κύτταρα ωοθηκών, όπου η υπερέκφραση του γονιδίου που επάγεται απόπτωση σε σισπλατίνη-ευαίσθητα κύτταρα [14]. CLPTM1L εμπλέκεται επίσης στην μιτοχονδριακή απόπτωση σε φυσιολογικά κύτταρα, και αναφέρθηκε ότι υπερεκφράζεται στον καρκίνο του πνεύμονα κύτταρα [15]. Η

CLPTM1L

γονίδιο μπορεί να παίζει ένα ρόλο στην αποπτωτική απόκριση. Η υπερέκφραση του

CLPTM1L

mRNA έχει παρατηρηθεί σε πολλούς τύπους καρκίνου, συμπεριλαμβανομένων των μη-μελάνωμα καρκίνος του δέρματος [13]. Αν και η λειτουργία του

CLPTM1L

γονίδιο είναι σε μεγάλο βαθμό άγνωστη, μελέτες έχουν δείξει ότι μπορεί να διεγείρει απόπτωση. Για παράδειγμα, CLPTM1L, ως μία προβλεπόμενη διαμεμβρανική πρωτεΐνη, υπερεκφράζεται σε σισπλατίνη ανθεκτικές κυτταρικές γραμμές καρκίνου των ωοθηκών, και μπορεί να εμπλέκεται στην αποπτωτική απόκριση των κυττάρων στη σισπλατίνη που προκαλείται από γενοτοξικό στρες.

Οι CLPTM1L

παραλλαγές πιθανολογηθεί ότι αυξάνουν τη μεταβολική ενεργοποίηση των αντιδραστικών μεταβολιτών ή /και το σχηματισμό και την επιμονή του προσαγωγών DNA [6]. Jiang et al. διαπίστωσε ότι

τ-CLPTM1L

rs401681 ήταν μια γενετική παραλλαγή που σχετίζεται με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα [16].

Η βιολογική και παθολογική σημασία της hTERT και τ-CLPTM1L υποδηλώνει ότι η λειτουργική γενετικές παραλλαγές σε η

hTERT

και

τ-CLPTM1L

γονίδια μπορεί να συμβάλει στην ανάπτυξη της ESCC. Έτσι, ο στόχος της παρούσας έρευνας ήταν να αξιολογήσει τη σχέση μεταξύ

hTERT

rs2736098 G & gt? Α και

τ-CLPTM1L

rs401681 C & gt? Πολυμορφισμούς Τ και ευαισθησία ESCC σε ένα νοσοκομείο που βασίζεται ασθενών-μαρτύρων μελέτη. Εκτελέσαμε γονοτυπική ανάλυση των

hTERT

rs2736098 G & gt? Και

TERT CLPTM1L-

rs401681 C & gt Α?. Τ SNPs σε 629 περιπτώσεις ESCC και 686 ελέγχους σε ένα κινεζικό πληθυσμό

Ασθενείς και Μέθοδοι

Ηθικά έγκριση του πρωτοκόλλου της μελέτης

Αυτή η μελέτη ασθενών-μαρτύρων νοσοκομείο με βάση εγκρίθηκε από το Διοικητικό συμβούλιο αναθεώρηση του Πανεπιστημίου Jiangsu (Zhenjiang, Κίνα). Έχουμε συμμορφωθεί με την Παγκόσμια Διακήρυξη Ιατρικού Συλλόγου του Ελσίνκι σχετικά με την ηθική συμπεριφορά της έρευνας στον άνθρωπο ή /και τα ζώα [17]. Όλα τα θέματα που προβλέπονται γραπτή συγκατάθεση πρέπει να περιλαμβάνονται στη μελέτη.

Τα άτομα της μελέτης

629 ασθενείς με καρκίνο του οισοφάγου είχαν διαδοχικά προσληφθεί από το Νοσοκομείο Ενταγμένο Λαϊκό Πανεπιστήμιο Jiangsu και Affiliated Νοσοκομείο του Πανεπιστημίου Jiangsu ( Zhenjiang, Κίνα) μεταξύ Οκτωβρίου 2008 και Δεκεμβρίου 2010. Όλες οι περιπτώσεις καρκίνου του οισοφάγου διαγνώστηκαν ως ESCC από παθολογικές μέσα. Τα κριτήρια αποκλεισμού ήταν οι ασθενείς που είχαν προηγουμένως: τον καρκίνο? οποιαδήποτε μετάσταση του καρκίνου? ακτινοθεραπεία ή χημειοθεραπεία. Τα 686 έλεγχοι ήταν ασθενείς χωρίς καρκίνο συχνότητας ταιριάζουν με τις περιπτώσεις όσον αφορά την ηλικία (± 5 έτη) και το φύλο προσλαμβάνονται από τα δύο νοσοκομεία που αναφέρονται παραπάνω κατά την ίδια χρονική περίοδο. Οι περισσότεροι από τους ελέγχους που έγιναν δεκτοί στα νοσοκομεία για τη θεραπεία του τραύματος.

Κάθε θέμα προσωπικά αμφισβητήθηκε από εκπαιδευμένους ερευνητές χρησιμοποιώντας ένα προ-δοκιμαστεί ερωτηματολόγιο για να λάβουν πληροφορίες σχετικά με τα δημογραφικά δεδομένα (π.χ., ηλικία, φύλο) και τις σχετικές παράγοντες κινδύνου (συμπεριλαμβανομένων κάπνισμα και η κατανάλωση αλκοόλ). Μετά τη συνέντευξη, 2-mL δείγματα φλεβικού αίματος συλλέχθηκαν από κάθε υποκείμενο. Τα άτομα που κάπνιζαν ένα τσιγάρο την ημέρα για & gt? 1 χρόνια ορίστηκαν ως «καπνιστές». Θέματα που κατανάλωναν ≥3 αλκοολούχα ποτά την εβδομάδα για & gt? 6 μήνες θεωρήθηκαν ως «πότες αλκοόλ»

Απομόνωση του DNA και του γονότυπου με την αντίδραση ανίχνευσης σύνδεση και σε απευθείας σύνδεση πρόβλεψη λειτουργία SNP

αίματος. συλλέχθηκαν δείγματα από ασθενείς που χρησιμοποιούν Vacutainers και μεταφέρθηκαν σε σωλήνες με επένδυση από αιθυλενοδιάμινο τετρα-οξεικό οξύ (EDTA). Γονιδιωματικό DNA απομονώθηκε από το ολικό αίμα με την QIAamp Blood DNA Mini Kit (Qiagen, Βερολίνο, Γερμανία) [18]. Τα δείγματα γονότυπος χρησιμοποιώντας την μέθοδο αντίδρασης ανίχνευσης απολίνωση (LDR) με την τεχνική υποστήριξη της Σαγκάης Biowing Εφαρμοσμένη Βιοτεχνολογία Εταιρείας όπως περιγράφηκε προηγουμένως [19]. SNPs γονότυπος χρησιμοποιώντας τη δοκιμασία LDR αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης (PCR) από την ΑΒΙ 9600 σύστημα (Applied Biosystems, USA). Οι αλληλουχίες DNA στόχου ενισχύθηκαν με themultiplex μέθοδο PCR. Η κοινή ανιχνευτής σημάνθηκε στο 3 ‘άκρο με 6-καρβοξυ-φλουορεσκεΐνη και φωσφορυλιωμένο στο 5’ άκρο. παράμετροι LDR ήταν ως εξής: 94 ° C για 2 λεπτά, 20 κύκλοι των 94 ° C για 30 s και 60 ° C για 3 λεπτά. Μετά την αντίδραση LDR, αναμίξαμε προϊόν LDR-αντίδρασης 1 μL με 1 μL ROX και ρυθμιστικού διαλύματος φόρτωσης 1 μL. Μετά από αυτό, το μίγμα μετουσιώθηκε στους 95 ° C για 3 λεπτά και ψύχεται σε παγωμένο νερό αμέσως. Τα φθορίζοντα προϊόντα LDR διαφοροποιήθηκαν από την ΑΒΙ sequencer 377 (Applied Biosystems, USA). Για τον έλεγχο της ποιότητας, επαναλαμβανόμενες αναλύσεις έγιναν για 160 (12,17%) επιλέγονται τυχαία δείγματα με υψηλή ποιότητα του DNA

Εμείς που χρησιμοποιούνται σε απευθείας σύνδεση εργαλείο πρόβλεψης:. https://www.regulomedb.org/and http: //snpinfo .niehs.nih.gov /snpinfo /snpfunc.htm να προβλέψει

hTERT

rs2736098 G & gt? Α και

τ-CLPTM1L

rs401681 C & gt?. λειτουργία των Τ SNPs

Στατιστικές αναλύσεις

οι διαφορές στις κατανομές των δημογραφικών χαρακτηριστικών, επιλεγμένες μεταβλητές, και γονότυπους του

hTERT

rs2736098 G & gt? Α και

τ-CLPTM1L

rs401681 C & gt? T παραλλαγές μεταξύ των περιπτώσεων και οι έλεγχοι αξιολογήθηκαν με τη χρήση του

χ

2 τεστ. Οι συσχετίσεις μεταξύ των

hTERT

rs2736098 G & gt? Α και

τ-CLPTM1L

rs401681 C & gt? T γονότυπους και τον κίνδυνο της ESCC εκτιμήθηκε υπολογίζοντας τις εξόχως απόκεντρες περιοχές και 95% ΚΠ τους με τη χρήση λογιστικής παλινδρόμησης αναλύσεις για το αργό ΕΑΠ και να προσαρμόζονται ΕΑΠ κατά τη ρύθμιση για την ηλικία, το φύλο, το κάπνισμα και την κατάσταση του πόσιμου. Η ισορροπία Hardy-Weinberg (HWE) ελέγχθηκε με καλοσύνη-of-fit

χ

2 τεστ για να συγκρίνουν τις παρατηρούμενες συχνότητες γονοτύπου με τις αναμενόμενες αυτές μεταξύ των ατόμων της ομάδας ελέγχου. Όλες οι στατιστικές αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με τη SAS 9.1.3 (SAS Institute, Cary, NC, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής).

Αποτελέσματα

χαρακτηριστικά του πληθυσμού της μελέτης

Χαρακτηριστικά των περιπτώσεων και των ελέγχων περιλαμβάνονται στη μελέτη συνοψίζονται στον πίνακα 1. Οι περιπτώσεις και οι έλεγχοι φάνηκε να συνδυαστούν κατάλληλα για την ηλικία και το φύλο, όπως προτείνεται από το

χ

2 δοκιμές (

P

= 0,541 και

P

= 0,185, αντίστοιχα). Όπως φαίνεται στον Πίνακα 1, ανιχνεύθηκε σημαντική διαφορά σχετικά με το καθεστώς του καπνίσματος μεταξύ των περιπτώσεων και των ελέγχων (

P

& lt? 0.001), και πίνοντας ποσοστό ήταν υψηλότερο σε ασθενείς ESCC από ό, τι στην ομάδα ελέγχου (

P

& lt? 0.001). Ο πρωταρχικός πληροφορίες για δύο γονότυπος SNPs ήταν στον Πίνακα S1. Για το

hTERT

rs2736098 G & gt? Α, η γονοτυπική ήταν επιτυχής σε 600 (95,39%) περιπτώσεις ESCC και 651 (94,90%) ελέγχους σε όλα τα 1315 δείγματα, και για το

τ-CLPTM1L

rs401681 C & gt? T, η γονοτυπική ήταν επιτυχής σε 604 (96.03%) περιπτώσεις ESCC και 664 (96,78%) των ελέγχων. Τα ποσοστά αντιστοιχίας των επαναλαμβανόμενων αναλύσεων ήταν 100%. Μικρά συχνότητα αλληλόμορφο (MAF) σε ελέγχους μας ήταν παρόμοια με MAF για τους Κινέζους στη βάση δεδομένων για όλους τους δύο SNPs (Πίνακας S1). Οι παρατηρούμενες συχνότητες γονοτύπου για αυτές τις δύο πολυμορφισμούς στους ελέγχους ήταν όλοι σε HWE (Πίνακας S1).

Η

Σύλλογοι μεταξύ δύο πολυμορφισμών και κίνδυνο ESCC

Οι κατανομές γονότυπου

hTERT

rs2736098 G & gt? Α και

τ-CLPTM1L

rs401681 C & gt? T στις περιπτώσεις και τους ελέγχους που παρουσιάζονται στον πίνακα 2. στην ενιαία θέση αναλύσεις, οι συχνότητες γονοτύπου του

τ-CLPTM1L

rs401681 C & gt? T ήταν 47.68% (CC), 41,72% (CT) και 10,60% (ΤΤ) στους ασθενείς υπόθεση και 40,06% (CC), 47,74% (CT) και 12,20% (ΤΤ) στο τα θέματα ελέγχου, και η διαφορά ήταν στατιστικά σημαντική (

P

= 0.024). Όταν το

τ-CLPTM1L

αλληλόμορφο rs401681 C χρησιμοποιήθηκε ως ομάδα αναφοράς, το Τ αλληλόμορφο συσχετίστηκε με σημαντικά μειωμένο κίνδυνο για ESCC (Τ

vs

C: προσαρμογή OR = 0,81, 95 % CI = 0,69 – 0,96,

P

= 0,014). Όταν το

τ-CLPTM1L

rs401681 CC ομοζυγώτες γονότυπο χρησιμοποιήθηκε ως ομάδα αναφοράς, το CT γονότυπος συσχετίστηκε με σημαντικά μειωμένο κίνδυνο για ESCC (CT

vs

CC: προσαρμογή OR = 0,74, 95% CI = 0,58 – 0,94,

P

= 0,012). Όταν το

τ-CLPTM1L

rs401681 CC ομοζυγώτες γονότυπο χρησιμοποιήθηκε ως ομάδα αναφοράς, ο γονότυπος ΤΤ δεν σχετίστηκε με τον κίνδυνο για ESCC (ΤΤ

vs

CC: προσαρμογή OR = 0.75, 95 % CI = 0,51 – 1,09,

P

= 0.126). Στο κυρίαρχο μοντέλο, οι

τ-CLPTM1L

rs401681 CT παραλλαγές /ΤΤ συσχετίστηκαν με 26% μειωμένο κίνδυνο ESCC, σε σύγκριση με το

τ-CLPTM1L

rs401681 CC γονότυπο (προσαρμογή OR = 0.74, 95% CI = 0,59 – 0,93,

P

= 0,009). Στο υπολειπόμενου το μοντέλο, όταν η

τ-CLPTM1L

rs401681 CC /CT γονοτύπων χρησιμοποιήθηκαν ως ομάδα αναφοράς, η ομοζυγώτες με γονότυπο ΤΤ που δεν συνδέονται με τον κίνδυνο για ESCC (προσαρμογή OR = 0,87, 95% CI = 0,61 – 1,24,

P

= 0,447) (Πίνακας 2)

Η

hTERT

rs2736098 G & gt? α. δεν έδειξε σημαντική διαφορά στις κατανομές γονότυπου μεταξύ περιπτώσεις και τους ελέγχους (

P

= 0,727). αναλύσεις λογιστικής παλινδρόμησης έδειξε ότι η

hTERT

rs2736098 G & gt?. Ένα πολυμορφισμός δεν συσχετίστηκε με τον κίνδυνο ESCC (Πίνακας 2)

Η χρήση ισχύος και Μέγεθος δείγματος Υπολογισμός (PS, έκδοση 3.0, 2009 , https://biostat.mc.vanderbilt.edu/twiki/bin/view/Main/PowerSampleSize) και λαμβάνοντας υπόψη

τ-CLPTM1L

rs401681 C & gt? T μεταλλαγμένα αλληλόμορφα στην ομάδα ελέγχου, ΕΑΠ, δείγματα ESCC και δείγματα ελέγχου, η δύναμη της ανάλυσής μας (α = 0.05) ήταν 0.708 σε 604 περιπτώσεις ESCC και 664 ελέγχους, με OR 0,74

Διαστρωμάτωση αναλύσεις σχετικά με την τ-CLPTM1L rs401681 C & gt?. πολυμορφισμούς Τ και τον κίνδυνο της ESCC

για να αξιολογηθούν τα αποτελέσματα των

τ-CLPTM1L

rs401681 C & gt? T γονότυπους για ESCC κινδύνου σύμφωνα με διαφορετική ηλικία, το φύλο, το κάπνισμα και την κατάσταση της κατανάλωσης αλκοόλ? πραγματοποιήσαμε τις αναλύσεις διαστρωμάτωση (Πίνακας 3). Ένα σημαντικά μειωμένο κίνδυνο ESCC που συνδέονται με το

τ-CLPTM1L

rs401681 C & gt? Τ πολυμορφισμού ήταν εμφανής στους άνδρες ασθενείς (CT

vs

CC:

P

= 0,0003? CT /TT

vs

CC:

P

= 0.0002), νεότερους ασθενείς (& lt? 63 χρόνια στη μελέτη μας) (CT /ΤΤ

vs

CC:

P

= 0.049) και σε ασθενείς που βρίσκονταν σε κατάσταση πόσιμο (CT

vs

CC:

P

= 0,012? CT /ΤΤ

vs

CC:

P

= 0,016) (Πίνακας 3).

η

Συζήτηση

Σε αυτή τη μελέτη ασθενών-μαρτύρων νοσοκομείο με βάση, διερευνήθηκε η συσχέτιση του

hTERT

rs2736098 G & gt? Α και

τ-CLPTM1L

rs401681 C & gt? T SNPs με τον κίνδυνο ESCC σε ένα κινεζικό πληθυσμό. Πολυπαραγοντική λογιστική ανάλυση αποκάλυψε ότι το

τ-CLPTM1L

rs401681 CT και γονότυπους CT /ΤΤ σχετίζεται με μειωμένο κίνδυνο ESCC, ενώ καμία σημαντική συσχέτιση μεταξύ του

hTERT

rs2736098 G & gt? Πολυμορφισμό και το παρατηρήθηκε κίνδυνο ESCC. Ένα σημαντικά μειωμένο κίνδυνο του ESCC που συνδέονται με το

τ-CLPTM1L

rs401681 C & gt?. Τ πολυμορφισμού, ιδιαίτερα μεταξύ των ανδρών, οι νέοι ασθενείς και εκείνοι φέρεται να είναι πότες

Η λειτουργία της CLPTM1L και το ρόλο της στην ογκογένεση είναι σε μεγάλο βαθμό άγνωστη. Ωστόσο, μια πρόσφατη μελέτη ανέφερε ότι CLPTM1L ήταν συνήθως υπερεκφράζεται αντι-αποπτωτικό παράγοντα στον καρκίνο του πνεύμονα [15]. Αυτό πρότεινε μια ανασταλτική ρόλο στην γονοτοξικό στρες που προκαλείται απόπτωση, και προσδιορίζονται CLPTM1L ως σημαντικός παράγοντας που επηρεάζει την επιβίωση του DNA κατεστραμμένα καρκινικά κύτταρα και, ενδεχομένως, την ευαισθησία του καρκίνου του πνεύμονα [20].

Το

CLPTM1L

γονίδιο ρυθμίζεται αυξητικά σε σισπλατίνη ανθεκτικές κυτταρικές γραμμές, και συνδέεται με σισπλατίνη απόπτωση? Επιπλέον, η υπερέκφραση του

CLPTM1L

mRNA έχει παρατηρηθεί σε πολλούς καρκίνους [6], [14], [21], [22]. Οι παραλλαγές σε αυτό το τόπο υπέθεσε να ρυθμίζουν το μήκος των τελομερών και να συνδέεται με πολλαπλές κακοήθειες, συμπεριλαμβανομένων των καρκίνων του πνεύμονα, του προστάτη, της ουροδόχου κύστης, του τραχήλου της μήτρας και του παγκρέατος. Rs401681 βρίσκεται στο ιντρόνιο 13 της

CLPTM1L

στο 5p15.33, και είναι ένα από τα πιο μελετημένα SNPs. Αν και λίγα είναι γνωστά για την λειτουργία αυτού του SNP, η ανάλυση βιοπληροφορικής μας έδειξε ότι ενδέχεται να επηρεάσει ρύθμιση μεταγραφής και περαιτέρω επηρεάζει την έκφραση του γονιδίου. Για να δείξει ότι αυτές οι αλλαγές μπορούν να συμβάλουν πράγματι ιδιότητες του καρκίνου, οι ίη vitro μελέτες επικύρωσης με κυτταρικές σειρές ειδικά ίη vitro της ESCC που φιλοξενούν αυτές τις γενετικές αλλοιώσεις warrented. Όπως καλλιέργειες κυττάρων, παροδικές επιμολύνσεις, δοκιμασία λουσιφεράσης, δοκιμασίες μετατόπισης ηλεκτροφορητικής κινητικότητας, ανάλυση κηλίδος Western, PCR αντίστροφης μεταγραφάσης, αναλύσεις χρωματίνης ανοσοκατακρήμνιση και ποσοτική Real-Time PCR.

Αρκετές μελέτες που εξετάζουν τη σχέση μεταξύ του

CLPTM1L

rs401681 πολυμορφισμού και του καρκίνου έχουν δημοσιευθεί, με αντιφατικά αποτελέσματα [6], [15], [19], [23], [24], [25]. Μια μελέτη ένωση που περιλάμβανε 2.396 περιπτώσεις καρκίνου του πνεύμονα και 3.001 έλεγχοι έδειξαν ότι το

CLPTM1L

Τ αλληλόμορφου συσχετίστηκε με σημαντικά μειωμένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα [15]. Nan και οι συνεργάτες παρατήρησαν μια υποδηλώνουν θετική σχέση μεταξύ του αλληλόμορφου rs401681 C και βραχύτερο σχετικό μήκος των τελομερών [7]. Rafnar et al. πρότεινε ότι το αλληλόμορφο rs401681 C ενδέχεται να σχετίζεται με την επιτάχυνση της σταδιακής βράχυνση των τελομερών με την ηλικία [6]. Οι πιθανές σχέσεις μεταξύ μικρότερη τελομερή και μειωμένο κίνδυνο μελανώματος έχουν αναφερθεί. Αυτό θα μπορούσε να αποδοθεί στη μικρότερη αντιγραφική διάρκεια ζωής των μελανοκυττάρων που παρέχεται από ένα βραχύτερο μήκος των τελομερών, το οποίο παρέχει μια πιο αυστηρή εμπόδιο για απεριόριστο κυτταρική διαίρεση. Μειωμένο κίνδυνο μελανώματος θα μπορούσε επίσης να συνδέεται με τη μείωση του μεγέθους σπίλων και μετρήστε σε άτομα με μικρότερη τελομερή. Rs401681 συνδέεται επίσης με τον κίνδυνο καρκίνου του παγκρέατος, όπως φαίνεται από την παρουσία του χρωμοσώματος άκρα λείπει τελομερείς επαναλαμβανόμενες αλληλουχίες σε αυτόν τον καρκίνο [26]. Jiang et al. διαπίστωσε ότι

τ-CLPTM1L

rs401681 Τ αλληλόμορφου συσχετίστηκε με μειωμένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα [16]. Και σε ESCC ομάδα, η τάση του

τ-CLPTM1L

αλληλόμορφο rs401681 T είναι προστατευτική, αλλά δεν φτάνουν σημαντική (OR = 0,935, 95% CI = 0,800 – 1,093 σε προσθετικό μοντέλο) [16], αναφέροντας απαραίτητα για αντιγραφές σε άλλες cohors.

Οι συχνότητες των γενετικών πολυμορφισμών συχνά διαφέρουν μεταξύ των εθνοτικών ομάδων. Στην παρούσα κινεζική μελέτη, η συχνότητα αλληλόμορφου του

τ-CLPTM1L

rs401681 Τ ήταν 0.361 σε 686 άτομα ελέγχου, η οποία είναι σύμφωνη με τις τιμές που αναφέρονται στη βάση δεδομένων SNP για την κινεζική Han (0.305) και Ιαπωνικά πληθυσμών ( 0,343)? Ωστόσο, η συχνότητα ήταν χαμηλότερη από εκείνη της υποσαχάριας Αφρικής (0.642) του πληθυσμού (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP).

Αυτή η μελέτη ασθενών-μαρτύρων είχε αρκετούς περιορισμούς . Πρώτον, οι ασθενείς και οι έλεγχοι είχαν εγγραφεί από τα νοσοκομεία και ως εκ τούτου δεν μπορεί να είναι αντιπροσωπευτικό του γενικού πληθυσμού? οι πληροφορίες οικογενειακό ιστορικό καρκίνου των περιπτώσεων και οι έλεγχοι δεν ελήφθη, αυτό εγγενή προκατάληψη μπορεί να έχει ως αποτέλεσμα ψευδή ευρήματα. Δεύτερον, οι πολυμορφισμοί διερευνήθηκαν στη μελέτη μας βασίστηκαν σε λειτουργικές εκτιμήσεις και δεν μπορεί να παρέχει μια ολοκληρωμένη εικόνα της γενετικής ποικιλότητας των

τ-CLPTM1L

, όπως rs402710 και rs2736100 et al. Απαιτούνται περαιτέρω μελέτες για να διευκρινιστεί το γενετικό μηχανισμό του οισοφάγου καρκινογένεσης με πρόστιμο-χαρτογράφηση της περιοχής ευαισθησία των παραλλαγών. Τρίτον, η στατιστική ισχύ της μελέτης μας ήταν περιορισμένη λόγω του μέτριου μεγέθους του δείγματος και η απουσία μιας κοόρτης επικύρωσης. Μεγαλύτερο, είναι καλά σχεδιασμένες μελέτες δικαιολογείται να επιβεβαιώσετε τις συσχετίσεις που παρατηρήθηκαν στην παρούσα μελέτη. Τέλος, δεν είχαμε λάβει λεπτομερείς πληροφορίες σχετικά με τη μετάσταση του καρκίνου και την επιβίωση, η οποία περιορίζεται περαιτέρω την ανάλυση των ρόλων του

hTERT

rs2736098 G & gt? Α και

τ-CLPTM1L

rs401681 C & gt? Πολυμορφισμών Τ . σε ESCC εξέλιξη και την πρόγνωση

Εν κατακλείδι, η μελέτη μας παρέχει ισχυρά αποδεικτικά στοιχεία ότι η λειτουργική

τ-CLPTM1L

rs401681 C & gt? T πολυμορφισμός μπορεί να συμβάλλουν στον κίνδυνο της ESCC. Ωστόσο, η ακριβής λειτουργική σημασία της

CLPTM1L

rs401681 SNP παραμένει ασαφής. Μπορεί να είναι σε ισχυρή LD με άλλα πιθανά λειτουργικά ή συνάφεια SNPs, συμβάλλοντας με τον κίνδυνο ESCC. Πρόσθετες, μεγαλύτερες μελέτες και in vitro ή ιστο-ειδικό βιολογικό χαρακτηρισμό που απαιτούνται για να επιβεβαιώσετε την τρέχουσα προκαταρκτικά συμπεράσματα.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Πίνακα S1.

Δημοτικό πληροφορίες για

hTERT

rs2736098 G & gt? Α και

τ-CLPTM1L

rs401681 C & gt? T πολυμορφισμοί

doi:. 10.1371 /journal.pone.0100667.s001

(DOCX)

δεδομένων S1.

δεδομένων του

hTERT

rs2736098 G & gt? Α και

τ-CLPTM1L

rs401681 C & gt? T πολυμορφισμοί

doi:. 10.1371 /journal.pone.0100667.s002

( SAV)

Ευχαριστίες

Σας ευχαριστούμε όλους τους ασθενείς που συμμετείχαν σε αυτή τη μελέτη. Θα θέλαμε να ευχαριστήσουμε τον Δρ Yiqun Chen (Biowing Εφαρμοσμένη Βιοτεχνολογία Εταιρείας, Σαγκάη, Κίνα) για τεχνική υποστήριξη.