Αφηρημένο

Ασυμφωνία επισκευής ανεπάρκεια του παχέος εντέρου (CRC) οθόνη εκτεταμένη αστάθεια στις αλληλουχίες μικροδορυφορικού DNA (MSI). Αν και MSI έχει αναφερθεί ότι εμφανίζεται συνήθως κατά κωδικοποίησης επαναλήψεις, οδηγώντας σε αλλοιώσεις στη λειτουργία ενός αριθμού γονιδίων που κωδικοποιούν σχετίζονται με τον καρκίνο πρωτεΐνες, τίποτα δεν είναι γνωστό σχετικά με την πιθανολογούμενη επίδραση αυτής της διαδικασίας για μη-κωδικοποίησης microRNAs. Σε miRbase V15, εντοπίσαμε πολύ λίγα ανθρώπινα γονίδια microRNA με μονο- ή δι-νουκλεοτίδιο επαναλήψεις (

n

= 27). Μια ανάλυση μεταλλάξεων αυτών των αλληλουχιών σε μια μεγάλη σειρά κυτταρικών γραμμών MSI CRC και πρωτογενείς όγκους υπογραμμίζεται αστάθεια σε 15 από τα 24 γονίδια που μελετήθηκαν microRNA επιτυχώς σε μεταβλητές συχνότητες που κυμαίνονται από 2,5% έως 100%. Μετά από μια μέγιστη πιθανότητα στατιστική μέθοδο, τα γονίδια microRNA χωρίστηκαν σε δύο ομάδες που διέφεραν σημαντικά στις συχνότητες μετάλλαξης τους και την τάση τους να αντιπροσωπεύουν μεταλλάξεις που μπορεί ή δεν μπορεί να είναι υπό επιλεκτικές πιέσεις κατά τη διάρκεια MSI ογκική πρόοδο. Η πρώτη ομάδα περιελάμβανε 21 γονίδια που εμφανίζονται καθόλου ή λίγες μεταλλάξεις στο CRC. Η δεύτερη ομάδα περιείχε τρία γονίδια, δηλαδή,

HSA-mir-1273c

,

HSA-mir-1303

και

HSA-mir-567

, με συχνές (≥80 %) και μερικές φορές δι-αλληλόμορφες μεταλλάξεις σε όγκους MSI. Για το μόνο που εκφράζεται σε παχέος ιστούς,

HSA-mir-1303

, καμία άμεση σχέση βρέθηκε μεταξύ της παρουσίας ή όχι μονο- ή δι-αλληλικές μεταβολές και τα επίπεδα έκφρασης ώριμου miR σε κυτταρικές σειρές MSI , όπως προσδιορίζεται με αλληλούχιση και ποσοτική PCR αντίστοιχα. Συνολικά, τα αποτελέσματα μας παρέχουν αποδείξεις ότι επαναλήψεων DNA που περιέχεται στα ανθρώπινα γονίδια miRNA είναι σχετικά σπάνιες και διατηρούνται από μεταλλάξεις λόγω της MSI στο MMR ανεπάρκεια καρκινικά κύτταρα. Λειτουργικές μελέτες απαιτούνται τώρα για να συμπεράνει αν μεταλλαχθεί miRNAs, και ειδικά το miR-1303, θα μπορούσε να έχει ένα ρόλο στην MSI ογκογένεση

Παράθεση:. El-Murr Ν, Abidi Ζ, Wanherdrick Κ, Svrcek Μ, Gaub MP , Fléjou JF, et al. (2012)

Mirna

γονίδια συνιστούν νέα Στόχοι για αστάθεια μικροδορυφόρου στον Καρκίνο του παχέος εντέρου. PLoS ONE 7 (2): e31862. doi: 10.1371 /journal.pone.0031862

Επιμέλεια: Hoguen Kim, Yonsei University College of Medicine, Δημοκρατίας της Κορέας

Ελήφθη: 18, Νοέμ 2011? Αποδεκτές: 13 Γενάρη του 2012? Δημοσιεύθηκε: 14 Φεβρουαρίου 2012