Αφηρημένο

Ιστορικό

Περισσότερα από τα δύο τρίτα των γυναικών που υποβάλλονται σε χειρουργική επέμβαση για ύποπτο νεόπλασμα των ωοθηκών δεν έχουν καρκίνο. προηγούμενα αποτελέσματα μας δείχνουν φωσφολιπίδια ως πιθανοί βιοδείκτες του καρκίνου των ωοθηκών. Σε αυτή τη μελέτη, μετρήσαμε τα επίπεδα των πολλαπλών φωσφολιπιδίων μεταξύ των γυναικών που υποβάλλονται σε χειρουργική επέμβαση για ύποπτο καρκίνο των ωοθηκών στον ορό για τον προσδιορισμό βιοδεικτών που προβλέπουν καλύτερα αν μια ωοθηκική μάζα είναι κακοήθεις.

Μεθοδολογία /Κύρια Ευρήματα

λαμβάνονται δείγματα ορού προεγχειρητικά από τις γυναίκες με υποψία καρκίνου των ωοθηκών είναι εγγεγραμμένοι στο πλαίσιο μιας μελλοντικής, βασισμένη στον πληθυσμό σύστημα ταχείας διαπίστωση. Τα δείγματα αναλύθηκαν από όλες τις γυναίκες στις οποίες επιβεβαιώθηκε η διάγνωση του επιθηλιακού καρκίνου των ωοθηκών (EOC) και από καλοήθεις περιπτώσεις νόσου τυχαία επιλεγμένες από τις υπόλοιπες (μη-EOC) δείγματα. Μετρήσαμε βιολογικώς σχετικών φωσφολιπιδίων χρησιμοποιώντας χρωματογραφία /φασματομετρία μάζας ηλεκτροψεκασμού ιονισμού υγρού. Εφαρμόσαμε μια ισχυρή προσέγγιση των στατιστικών και μηχανική μάθηση, Hybrid huberized φορέας υποστήριξης της μηχανής (HH-SVM) να δώσει προτεραιότητα φωσφολιπίδια για να εισάγετε τα μοντέλα βιοδεικτών, και χρησιμοποιείται διασταυρωμένης επικύρωσης για την απόκτηση συντηρητικές εκτιμήσεις των ποσοστών σφάλματος ταξινόμησης.

Αποτελέσματα

Το μοντέλο HH-SVM χρησιμοποιώντας τις μετρήσεις των ειδικών συνδυασμών των φωσφολιπιδίων συμπληρώνει μέτρηση κλινικών CA125 και βελτιώνει διαγνωστική ακρίβεια. Συγκεκριμένα, η μέτρηση των φωσφολιπιδίων βελτιωμένη ευαισθησία (προσδιορισμός των περιπτώσεων με προεγχειρητικά επίπεδα CA125 κάτω από 35) μεταξύ των δύο τύπων των περιπτώσεων στις οποίες απόδοση CA125 είναι ιστορικά φτωχή – περιπτώσεις πρώιμο στάδιο και των βλεννωδών ιστολογία. Μέτρηση των φωσφολιπιδίων βελτίωσε την ταυτοποίηση των περιπτώσεων πρώιμο στάδιο από 65% (με βάση CA125) έως 82%, και βλεννώδες περιπτώσεις από 44% έως 88%.

Συμπεράσματα /σημαντικότητα

επίπεδα ειδικής φωσφολιπίδια του ορού διαφέρουν μεταξύ των γυναικών με καρκίνο των ωοθηκών και εκείνων με καλοήθεις συνθήκες. Αν επικυρωθεί από ανεξάρτητες μελέτες στο μέλλον, αυτοί οι βιοδείκτες μπορεί να χρησιμεύσει ως συμπλήρωμα κατά τη στιγμή της κλινικής παρουσίασης, να γίνει διάκριση μεταξύ των γυναικών με καρκίνο των ωοθηκών και τα άτομα με καλοήθεις καταστάσεις με κοινά συμπτώματα και χαρακτηριστικά

Παράθεση:. Shan L, Chen YA, Davis L, Han G, Zhu W, Molina μ.Χ., et al. (2012) Μέτρηση της φωσφολιπίδια μπορεί να βελτιώσει την διαγνωστική ακρίβεια σε καρκίνο των ωοθηκών. PLoS ONE 7 (10): e46846. doi: 10.1371 /journal.pone.0046846

Επιμέλεια: Αντώνης WI. Lo, το Κινεζικό Πανεπιστήμιο του Χονγκ Κονγκ, Χονγκ Κονγκ

Ελήφθη: 26 Οκτώβρη 2011? Αποδεκτές: 10 Σεπ 2012? Δημοσιεύθηκε: 17 Οκτώβρη 2012

Copyright: © Shan et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτή η μελέτη χρηματοδοτήθηκε από την αμερικανική Εταιρεία Καρκίνου (CRTG-00-196), το Εθνικό Ίδρυμα Καρκίνου (R01-CA106414), Υπουργείο άμυνας DAMD17-98-1-8659 και το Ίδρυμα Celma Mastry καρκίνου των ωοθηκών. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:. Οι συγγραφείς έχουν διαβάσει την πολιτική του περιοδικού και έχουν τα ακόλουθα συγκρούσεις: 1) Συγγραφείς και ιδρυμάτων που συνδέονται κατέχουν διπλώματα ευρεσιτεχνίας για τα φωσφολιπίδια αναλύθηκαν για αυτή τη δημοσίευση και 2) ένα ή περισσότερους συγγραφείς που απασχολούνται από μια εμπορική εταιρεία. Τα ακόλουθα διπλώματα ευρεσιτεχνίας έχουν κατατεθεί ως αποτέλεσμα της έρευνας που διεξάγεται: Μέθοδος για τον καρκίνο του Ανίχνευσης Χρησιμοποιώντας το ΙΡΑ ως δείκτης, Serial # 61 /189.495, αρχείου Ημερομηνία 20/08/08. Licensed 01/09? Μέθοδος για τον καρκίνο του Ανίχνευσης Χρησιμοποιώντας πλασμαλογόνα ως δείκτες, Serial # 61 /199.565, αρχείου Ημερομηνία 18/11/08. Licensed 01/09? Μέθοδος για την ανίχνευση ή την παρακολούθηση του καρκίνου Χρησιμοποιώντας LPC ως δείκτης (LPC 14:00), PCT /US2008 /012483, αρχείου Ημερομηνία 11/05/08. Licensed 01/09? Λυσοφωσφατιδυλοχολίνη ως βιοδεικτών του καρκίνου των ωοθηκών, # US6248553 Patent Β1, Ημερομηνία κατάθεσης 05.13.05. Κατά τη στιγμή αυτή η έρευνα έγινε και το χειρόγραφο γράφτηκε δύο συν-συγγραφείς, Lain Shan και Lorelei Davis, είχαν προσληφθεί από μια εμπορική εταιρεία με το όνομα του Frantz βιοδείκτες, LLC. Frantz βιοδείκτες, LLC δεν είναι πλέον λειτουργικό εμπορική εταιρεία. Αυτό δεν αλλάζει την τήρηση των συγγραφέων σε όλες τις PLoS ONE πολιτικές για την ανταλλαγή δεδομένων και υλικών.

Εισαγωγή

στοιχεία δείχνουν ότι μεταξύ των γυναικών με πρόσφατα διαγνωσμένο καρκίνο των ωοθηκών, εκείνοι των οποίων η αρχική χειρουργική επέμβαση εκτελείται από ένα γυναικολογικό ογκολόγο έχουν χαμηλότερη νοσηρότητα και τη θνησιμότητα και αυξημένη συνολική επιβίωση [1], [2]. Ωστόσο, μέχρι σήμερα στις ΗΠΑ, η αρχική χειρουργική επέμβαση για ύποπτο καρκίνο των ωοθηκών συχνά εκτελείται χωρίς την παραπομπή σε τέτοιου είδους ειδικούς [1]. Αυτό οφείλεται εν μέρει επειδή δεν υπάρχει ακριβής τρόπος να γνωρίζουμε εκ των προτέρων αν μια χειρουργική πυελική μάζα υποψία ότι είναι ο καρκίνος των ωοθηκών είναι, στην πραγματικότητα, ο καρκίνος. Ως αποτέλεσμα, περισσότερο από τα δύο τρίτα των γυναικών που υποβάλλονται σε χειρουργική επέμβαση για ύποπτο νεόπλασμα των ωοθηκών δεν έχουν καρκίνο [3] – [5]. Καθώς εκτιμάται ότι το 5-10% των γυναικών στις ΗΠΑ θα υποβληθεί σε χειρουργική επέμβαση για ύποπτο νεόπλασμα των ωοθηκών κατά τη διάρκεια της ζωής τους, αυτό είναι ένα ζήτημα με σημαντικές επιπτώσεις για τη δημόσια υγεία [6].

Αυτή τη στιγμή είναι δύσκολο να κατάλληλα γυναίκες διαλογής με πυελική μάζα να γυναικολογικών ογκολόγους βασίζεται σε υψηλό δείκτη υποψίας για τον καρκίνο των ωοθηκών, δεδομένου ότι υπάρχουν περιορισμένα εργαλεία για να γίνει μια τέτοια εκτίμηση. Ένα νέο τεστ αίματος, OVA1, έλαβε πρόσφατα έγκριση από τον FDA ως συμπλήρωμα στις προεγχειρητικές αξιολόγηση των μαζών εξαρτηματικές [7]. Το μόνο καλά επικυρωμένη βιοδείκτη καρκίνου των ωοθηκών σε κλινική χρήση, ΟΑ125 ορό, είναι αυξημένη σε μόνο το μισό περίπου του καρκίνου των ωοθηκών πρώιμο επιθηλιακά στάδιο (EOC) και δεν είναι αυξημένη σε περίπου 20% του συνόλου στάδιο EOC, καθιστά ανεπαρκώς ευαίσθητη [8] [9] .Το πιο συχνά αναφερόμενη τιμή αναφοράς CA125 που χαρακτηρίζει μια κλινικά θετική δοκιμή διαλογής είναι 35 μονάδες /ml, ενώ CA125 είναι επίσης αυξημένα σε πολλές καλοήθεις γυναικολογικών παθήσεων, συμπεριλαμβανομένων πολλών καταστάσεων που σχετίζονται με την πυελική μάζες. Μία από τις πρώτες μελέτες διαλογής συνδυάζοντας CA125 και υπέρηχος έδειξε ότι η χρήση CA125 στον ορό ως η πρώτη δοκιμή γραμμή και υπερηχογράφημα πυέλου ως δευτερεύουσα δοκιμή έχει υψηλή ειδικότητα (99,9%) και θετική προγνωστική αξία (26,8%) για την ανίχνευση του καρκίνου των ωοθηκών [10 ]. Σε μια αναδρομική ανάλυση των γυναικών υψηλού κινδύνου, η χρήση επαναλαμβανόμενων μετρήσεων των τιμών CA125 ενσωματώνονται στο διαμήκη στατιστικά μοντέλα παρουσίασαν βελτιωμένη ευαισθησία από 70% έως 86%, διατηρώντας παράλληλα ειδικότητα στο 98% [11]. Μια πρόσφατη μεγάλη προοπτική μελέτη (UK Collaborative Δίκη των ωοθηκών Screening [UKCTOC]), την αξιολόγηση διαλογής πολυτροπικότητας (ετήσιος έλεγχος ΟΑ125 ερμηνεύεται χρησιμοποιώντας έναν αλγόριθμο για τον κίνδυνο του καρκίνου των ωοθηκών σε συνδυασμό με διακολπικό υπερηχογράφημα ως δεύτερη δοκιμή γραμμή) Υπαινίσσεται ότι η πολυτροπικότητα έχει σημαντικά υψηλότερη ειδικότητα (99,8%) από ό, τι με τη χρήση υπερήχων μόνη (98,2%) για την ανίχνευση πρωτογενών καρκίνων των ωοθηκών και των σαλπίγγων, αν και δεν βρέθηκε στατιστικώς σημαντική διαφορά στην ευαισθησία [12]. Στον προστάτη, του πνεύμονα, του παχέος εντέρου και των ωοθηκών δίκη προσυμπτωματικό έλεγχο του καρκίνου, μια τυχαιοποιημένη μελέτη, τα αποτελέσματα μέσα από τέσσερις γύρους του προσυμπτωματικού ελέγχου του καρκίνου των ωοθηκών έδειξε ότι οι περισσότερες από τις περιπτώσεις οθόνης ανιχνεύθηκε ήταν προχωρημένου σταδίου [13], η οποία υποστηρίζει την ανάγκη για πρόσθετες μεθόδους και στρατηγικές για την επίτευξη έγκαιρης ανίχνευσης. Έτσι, ένα εργαλείο ή βιολογικός δείκτης που επιτρέπει την ακριβή κατάταξη των ασθενών σε ομάδες υψηλού και χαμηλού κινδύνου για ωοθηκών κακοήθεια θα βελτιώσει την ικανότητα κατάλληλα διαλογή ασθενών με γυναικολογικό ογκολόγους. Επιπλέον, σε μεμονωμένες περιπτώσεις πυελική μάζα, όπου η κλινική υποψία κακοήθειας δεν είναι υψηλό, είναι πιθανό ότι η αξιολόγηση των βιοδεικτών μπορεί να διευκολύνει άγρυπνο αναμονής και να οδηγήσει σε λιγότερες ή /και λιγότερο επείγουσες χειρουργικές επεμβάσεις.

Έχουμε ήδη αναλυθεί κυκλοφορούν φωσφολιπίδια, συμπεριλαμβανομένων λυσοφωσφατιδικού οξύ (LPA), λυσοφωσφατιδυλοχολίνη (LPC) και συναφών ειδών, για τη δυνατότητά τους να διακρίνουν μεταξύ των γυναικών με EOC και υγιείς μάρτυρες, με ελπιδοφόρα αποτελέσματα [14]. Σε άλλες πρόσφατες εργασίες, εντοπίσαμε πλασμαλογόνα ως μια άλλη ομάδα των κυκλοφορούντων ουσιών με δυναμικό ως βιοδείκτες του καρκίνου των ωοθηκών [15]. Στην παρούσα μελέτη, επιδιώξαμε να επεκταθεί σε προηγούμενη εργασία μας προς επικύρωση αυτών των πολλά υποσχόμενων βιοδεικτών για την κλινική εφαρμογή στη διάγνωση του καρκίνου των ωοθηκών. Μετρήσαμε τα επίπεδα στον ορό των πολλαπλών ειδών των λιπιδίων, περιλαμβανομένων συγκεκριμένα είδη του LPA, LPC και plasmenylphosphoethanolamine (ΡΡΕ) προκειμένου να αξιολογηθεί η απόδοσή τους σε διακρίσεις μεταξύ EOC και καλοήθους νόσου σε σύγκριση με, ή σε συνδυασμό με, την κλινική μέτρηση της CA125 σε προεγχειρητική δείγματα λαμβάνονται μελλοντικά από τις γυναίκες που παρουσιάζουν με υποψία καρκίνου των ωοθηκών

Ορισμένες από τις γενικές υπολογιστικές προκλήσεις για τις μελέτες βιοδεικτών περιλαμβάνουν τα ακόλουθα:. εντοπισμό ισχυρές στατιστικές μεθόδους, επιλέγοντας την έξυπνη δείκτες από ένα (μεγάλο) πίνακα των πιθανών υποψηφίων, την αξιολόγηση της κοινής επιδράσεις των πολλαπλών δεικτών, και αποφεύγοντας μοντέλο υπερπροσαρμογής λόγω της πολυπλοκότητας της μη γραμμικής υπολογιστικών μοντέλων. φορέας υποστήριξης του μηχανήματος (SVM) έχει αποδειχθεί ότι έχουν ανώτερη απόδοση σε σχέση με την ακρίβεια ταξινόμησης και έχει αναγνωριστεί ως μία από τις πιο ισχυρές μεθόδους στατιστικής και μηχανικής μάθησης για την ανάλυση μεγάλων διαστάσεων δεδομένων, όπως αυτή που προέρχεται από την έκφραση των γονιδίων και μελέτες βιοδεικτών [16], [17]. Στη μελέτη μας, έχουμε απασχολούνται SVM. Να δοθεί προτεραιότητα τους δείκτες που εισέρχονται στο μοντέλο, που χρησιμοποιήθηκε για πρώτη φορά Hybrid huberized Support Vector Machines (HH-SVM), η οποία επιλέγει αυτόματα τις μεταβλητές και να εκτιμήσει τη σημασία τους με αποδοτικό υπολογιστικό κόστος [18]. Για να αποφύγετε το μοντέλο υπερπροσαρμογής, χρησιμοποιούμε μια κοινή τεχνική αναδειγματοληψία, πέντε φορές διασταυρωμένης επικύρωσης, να αποκτήσει πιο αντικειμενικά ποσοστά σφάλματος [19]. Εν συντομία, έχουμε τοποθετηθεί πρώτα το μοντέλο χρησιμοποιώντας 4/5 των δεδομένων κατά τη δοκιμή τα αποτελέσματα για το υπόλοιπο 1/5 των στοιχείων, και αυτό το στάδιο επαναλήφθηκε 5 φορές έτσι ώστε κάθε 1/5 των δεδομένων ελέγχθηκε μία φορά κατά τη διάρκεια της μοντέλο ανάπτυξη. Έχουμε αναπτύξει δύο τύπους μοντέλων σε αυτή τη μελέτη, τα μοντέλα ενός σταδίου και μοντέλα δύο σταδίων. Να αναπτύξουν μοντέλα ένα βήμα μας, CA125 είχε συμπεριληφθεί μαζί με τις άλλες μετρούμενες βιοδεικτών ως συνεχείς μεταβλητές χωρίς προκαθορισμένο σημείο αποκοπής. Για την ανάπτυξη των μοντέλων δύο-βήμα, χρησιμοποιήσαμε για πρώτη φορά την συχνά αναφερόμενη κλινική τιμή αναφοράς του 35 μονάδες /ml για CA125 που χαρακτηρίζει ένα θετικό τεστ προσυμπτωματικού ελέγχου και, στη συνέχεια, χρησιμοποιείται ο αλγόριθμος μας για τις άλλες μετρούμενες βιοδεικτών για να διερωτηθεί κατά πόσον ένα πρόσθετο τεστ προστίθεται στο Αυτή η τιμή αναφοράς του CA125 θα μπορούσε να βελτιώσει τη διαγνωστική ακρίβεια για την ταξινόμηση, μεταξύ των γυναικών με κλινική παρουσίαση των υπόπτων καρκίνου των ωοθηκών, μεταξύ «περιπτώσεις» (δείγματα από τις γυναίκες, στους οποίους η χειρουργική επέμβαση επιβεβαίωσε EOC) και «benigns» (δείγματα από τις γυναίκες, στους οποίους η χειρουργική επέμβαση επιβεβαιωθεί κανένα καρκίνος ωοθηκών). Περισσότερες λεπτομέρειες για το μοντέλο ανάπτυξης που παρέχονται στο στατιστικό τμήμα.

Υλικά και Μέθοδοι

Θέματα

Το πρωτόκολλο της μελέτης εξετάστηκε και εγκρίθηκε από το Διοικητικό Συμβούλιο Institutional Review στο Πανεπιστήμιο της Νότιας Φλόριντα και όλους τους συμμετέχοντες παρείχαν ενυπόγραφη ενημερωμένη συγκατάθεση. Θέματα στην παρούσα μελέτη εντάχθηκαν μέσω ενός εν εξελίξει υποψήφιους με βάση τον πληθυσμό της έρευνας του καρκίνου των ωοθηκών στην Τάμπα της Φλόριντα μητροπολιτική περιοχή (με πληθυσμό περίπου 2 εκατομμύρια). Μέσω του συστήματος ταχείας διαπίστωση της μελέτης, συνολικά 1.057 γυναίκες με υποψία καρκίνου των ωοθηκών είχαν εγγραφεί προεγχειρητικά μεταξύ του Ιανουαρίου 2005 και του Μαρτίου του 2009, αντιπροσωπεύοντας περίπου το 75% του συνόλου των επιλέξιμων περιπτώσεις στην οριοθετημένη γεωγραφική περιοχή. Οι γυναίκες με προηγούμενη ετερόπλευρη ή αμφοτερόπλευρη ωοθηκεκτομή ήταν μη επιλέξιμες, όπως και οι γυναίκες με προηγούμενο ιστορικό καρκίνου (εκτός από τον καρκίνο του δέρματος μη-μελάνωμα). Όλοι οι ασθενείς υποβλήθηκαν σε προεγχειρητική ραδιολογική απεικόνιση, είτε με υπερηχογράφημα πυέλου, CT, και /ή MRI. Μόνο οι ασθενείς που υποβλήθηκαν σε χειρουργική επέμβαση με βάση την κλινική υποψία καρκίνου των ωοθηκών ήταν επιλέξιμες και αν ένας ασθενής διαγνώστηκε με EOC, χειρουργική σταδιοποίηση τεκμηριώθηκε (συμπεριλαμβανομένων 233 στο οποίο ΕΓΚ επιβεβαιώθηκε – ορίζεται ως πρωτογενή ωοθηκική, πρωτοβάθμια σάλπιγγα ή πρωτοπαθή καρκίνο του περιτοναίου). Τα καλοήθη δείγματα επιλέχθηκαν τυχαία από τα υπόλοιπα (μη-EOC) δείγματα? καλοήθεις παθολογίες περιλαμβάνουν ενδομητρίωση, κύστη ωοθηκών, και των ωοθηκών ίνωμα. Προεγχειρητική ΟΑ125 ορό κλινικές μετρήσεις ελήφθησαν από τα ιατρικά αρχεία. Παθολογία κεντρικά επανεξετάζεται από ειδικό παθολόγο καρκίνου των ωοθηκών (S.N). Όλες οι ιστολογικές εκτιμήσεις πραγματοποιήθηκαν τυφλωμένοι στις εργαστηριακές τιμές των δοκιμασιών βιοδεικτών και όλες οι εργαστηριακές δοκιμές έγινε τυφλώθηκε σε ιστολογική αποτέλεσμα (καλοήθης έναντι EOC). Δείγματα από μερικά από τα θέματα σε αυτή τη μελέτη ήταν ανεξάρτητα γονότυπος σε μια μελέτη σύνδεσης γονιδίωμα-ευρεία ώστε να εντοπίζουν την ευαισθησία τόπους που σχετίζονται με τον κίνδυνο καρκίνου των ωοθηκών [20] ή /και ελέγχονται για μεταλλάξεις σε γνωστά γονίδια των ωοθηκών ευαισθησία του καρκίνου [21].

τα δείγματα ορού

τα δείγματα αίματος για μετρήσεις βιοδείκτη μελέτη ελήφθησαν από την ρουτίνα φλεβοκέντησης πριν από τη χειρουργική επέμβαση. Τα δείγματα αφέθηκαν να πήξουν και διατηρείται σε θερμοκρασία δωματίου κατά τη μεταφορά. Τα δείγματα φυγοκεντρήθηκαν και ο ορός δειγματίζεται σε κρυοσωλήνες, κατεψυγμένα στους -80 ° C εντός τεσσάρων ωρών από τη συλλογή του δείγματος και διατηρείται στην κατάψυξη μέχρι την εργαστηριακή ανάλυση.

Εκχύλιση λιπιδίων

Τα λιπίδια εκχυλίστηκαν χρησιμοποιώντας τροποποιημένη Bligh -Dyer μέθοδο [22], η οποία ακολουθεί τη διαδικασία που περιγράφεται παρακάτω: παρασκευάστηκε μίγμα που αποτελείται από 1000 pmol DHPE (1,2-Diheptadecanoyl-

sn

-γλυκερο-3-Φωσφοαιθανολαμίνη), 200 pmol [

13C

16] 16:00 LPA (βαρύ ισότοπο του άνθρακα-13 με την ένδειξη 1-παλμιτοϋλ-2-υδροξυ-sn-γλυκερόλη-3-φωσφατιδικό οξύ), και [

13C

3] 14:00 LPC (βαρύ ισότοπο του άνθρακα-13 με την ένδειξη 1-μυριστοϋλ-2-υδροξυ-sn-γλυκερόλη-3-φωσφοχολίνη (Ν, Ν, Ν

13C-τριμεθυλ)), που προστέθηκε σε 200 μΐ ορού ασθενούς, τα οποία συλλέγονται ως περιγράφεται παραπάνω. Αυτά τα προστιθέμενα λιπίδια χρησίμευσαν ως εσωτερικά πρότυπα για την ποσοτικοποίηση του LPA, ΡΡΕ, και LPC, αντίστοιχα. Το μίγμα στροβιλίστηκε και 2 ml 2:01 (v:v) προστέθηκε μεθανόλη-χλωροφόρμιο. Το νέο μίγμα στροβιλίστηκε εκ νέου και διατηρήθηκε σε θερμοκρασία δωματίου για 10 λεπτά. και στη συνέχεια υποβλήθηκε σε φυγοκέντρηση σε 3000 g στους 10 ° C για 10 λεπτά. Μετά από φυγοκέντρηση, δύο στρώματα θα μπορούσε να δει σε αυτό το μίγμα. Το κορυφαίο στρώμα είναι ένα μίγμα από νερό, μεθανόλη, και χλωροφόρμιο ενώ το κάτω στρώμα είναι ένα πρωτεϊνούχο σφαιρίδιο. Το άνω υγρό στρώμα μεταφέρθηκε σε έναν άλλο σωλήνα και ξηραίνεται υπό άζωτο. Το ξηρό σφαιρίδιο επανασυστάθηκε σε 200 μΐ 0.1 Μ οξικό αμμώνιο διαλύεται σε μεθανόλη και μεταφέρθηκε σε μια ένεση εισαχθεί μέσα σε ένα φιαλίδιο ένεσης.

χρωματογραφία και φασματομετρία μάζας

Υγρή χρωματογραφία ηλεκτροψεκασμού διαδοχικής φασματομετρίας μάζας (LC /ESI /MS /MS) των αναλύσεων LPA, ΡΡΕ, και LPC διεξήχθησαν χρησιμοποιώντας ένα φασματόμετρο μάζας Quattro Micro (Waters, Milford, ΜΑ, USA) εφοδιασμένο με ιονισμό ηλεκτροψεκασμού (ESI) ανιχνευτή και διασυνδεδεμένο με ένα HPLC Shimadzu SCL-10AVP σύστημα (Shimadzu, Tokyo, Japan).

Για LPA και ΡΡΕ ποσοτικοποίηση, τα λιπίδια διαχωρίστηκαν με Luna 5μ C18 (2) στήλη (50 χ 2,0 mm, 5 μm μέγεθος σωματιδίου, Phenomenex, Torrance, CA, USA). 1 mM οξικό αμμώνιο υδατικό διάλυμα χρησιμοποιήθηκε ως κινητή φάση Α, ενώ 1 mM οξικό αμμώνιο σε μεθανόλη χρησιμοποιήθηκε σαν κινητή φάση Β Ο συνολικός χρόνος διεξαγωγής ήταν 15 λεπτά και ο ρυθμός ροής ήταν 200 μl /min. Η βαθμίδα που χρησιμοποιήθηκε ήταν ως ακολούθως: η στήλη πρώτα εξισορροπείται με 20% Β (80% Α), ακολουθούμενη από μία γραμμική μεταβολή από 20% Β (80% Α) έως 100% Β (0% Α) στην πρώτη 3 λεπτά . Η βαθμίδα διατηρήθηκε σε 100% Β (0% Α) με τον ακόλουθο 8 λεπτά. Στα υπόλοιπα 4 λεπτά, η βαθμίδα άλλαξε πίσω σε 70% Β (30% Α) για την εκ νέου εξισορρόπηση της στήλης. Για να μειωθεί η μόλυνση του φασματόμετρο μάζας, οι εκλούτες μεταξύ 0-2,5 λεπτά και 13-15 λεπτά κατευθύνθηκαν σε απόβλητα. 20 μΐ δείγματος ενέθηκαν σε ένα βρόγχο ένεσης 50 μΐ. Φασματομετρίας μάζας αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν σε απευθείας σύνδεση χρησιμοποιώντας ηλεκτροψεκασμού παράλληλα ιονισμού φασματομετρία μάζας με την αρνητική λειτουργία πολλαπλών παρακολούθηση αντίδρασης (MRM). Οι παράμετροι MS είναι: τριχοειδή τάσης, 3,0 KV? Τάση κώνου, 50 V? θερμοκρασία πηγής, 100 ° C? θερμοκρασία αποδιαλύτωσης, 350 ° C? ποσοστό του φυσικού αερίου αποδιαλύτωσης, 500 L /hr ροής? ποσοστό του φυσικού αερίου κώνου, 50 L /hr ροής? μάζα ανάλυση των δύο μητρικών και κόρη ιόντα, 15.0? πολλαπλασιαστή, 650.

Για LPC ποσοτικοποίηση, τα λιπίδια διαχωρίστηκαν με Hypersil στήλη HTS GOLD DASH (20 × 2,1 χιλιοστά, 5 μm μέγεθος σωματιδίου, Thermo Electron, Waltham, ΜΑ). 0,3% μυρμηκικό οξύ σε νερό χρησιμοποιήθηκε ως κινητή φάση Α ενώ 0,3% μυρμηκικό οξύ σε μεθανόλη χρησιμοποιήθηκε σαν κινητή φάση Β Ο συνολικός χρόνος διεξαγωγής ήταν 14 λεπτά και ο ρυθμός ροής ήταν 200 μl /min. Η βαθμίδα που χρησιμοποιήθηκε ήταν ως ακολούθως: η στήλη πρώτα εξισορροπείται με 20% Β (80% Α), ακολουθούμενη από μία γραμμική μεταβολή από 20% Β (80% Α) έως 100% Β (0% Α) στην πρώτη 3 λεπτά . Η βαθμίδα διατηρήθηκε σε 100% Β (0% Α) με τον ακόλουθο 7 λεπτά. Στα υπόλοιπα 4 λεπτά, η βαθμίδα άλλαξε πίσω σε 20% Β (80% Α) για την εκ νέου εξισορρόπηση της στήλης. Για να μειωθεί η μόλυνση του φασματόμετρο μάζας, οι εκλούτες μεταξύ 0-2,5 λεπτά και 11-14 λεπτά κατευθύνθηκαν σε απόβλητα. 40 μΐ δείγματος ενέθηκαν σε ένα βρόγχο έγχυσης 20 μΐ. Μάζας φασματομετρικές αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν σε απευθείας σύνδεση με ηλεκτροψεκασμού ιονισμού διαδοχική φασματομετρία μάζας με το θετικό τρόπο έλεγχος πολλαπλής αντίδρασης (MRM). Οι παράμετροι MS είναι: τριχοειδή τάσης, 4,0 KV? Τάση κώνου, 40 V? θερμοκρασία πηγής, 100 ° C? θερμοκρασία αποδιαλύτωσης, 350 ° C? ποσοστό του φυσικού αερίου αποδιαλύτωσης, 500 L /hr ροής? ποσοστό του φυσικού αερίου κώνου, 50 L /hr ροής? μάζα ανάλυση των δύο μητρικών και κόρη ιόντα, 15.0? πολλαπλασιαστή, 650.

Μέτρα Εργαστήριο Ποιοτικού Ελέγχου

Επειδή επιπτώσεις της παρτίδας είναι ένα σημαντικό ζήτημα, στο πλαίσιο των προσπαθειών ανακάλυψη βιοδεικτών, έχουμε απασχολούνται αρκετές στρατηγικές για να παρακολουθεί και να λογοδοτεί για αυτήν την ανησυχία, συμπεριλαμβανομένων των εσωτερικών προτύπων, ποιότητας δείγματα ελέγχου και βαθμονόμησης. Τα εσωτερικά πρότυπα που περιγράφονται παραπάνω (στην ενότητα «Lipid Extraction»). ελέγχου (QC) δείγματα Ποιότητα αποτελούνταν από πολλαπλά ταυτόσημα 300 μι κλάσματα από συγκεντρωμένο ανθρώπινο ορό. Ένα QC δείγμα τρέχει πριν από κάθε 10 κλινικά δείγματα. Βαθμονομητές αποτελείτο από διάφορες συγκεντρώσεις του καθαρού πρότυπα λιπιδίων εμβολιάζεται σε 4% αλβουμίνη ανθρώπινου ορού εντός ρυθμιστικού DPBS. Εννέα διαφορετικές συγκεντρώσεις βαθμονομητές έγιναν από το μητρικό διάλυμα και να τρέξει πριν από κάθε 100 δείγματα.

Δεδομένα προ-επεξεργασίας και Κανονικοποίηση

Τα δεδομένα που λαμβάνονται από τις στρατηγικές ελέγχου τριών ποιότητα που περιγράφεται παραπάνω χρησιμοποιήθηκαν για να διεύθυνση run-to-τρέχει παραλλαγή και να παρέχει μια βάση για τη μετατροπή της χρωματογραφίας περιοχής κορυφής με απόλυτη συγκέντρωση για κάθε αναλυτή. Ελήφθησαν οι περιοχές κάτω από τις κορυφές χρωματογραφία 8 ΜΑΠ, 6 οι LPA, 5 LPCs και τα αντίστοιχα εσωτερικά πρότυπα τους (με την ένδειξη από τα βαρέα ισότοπα). Οι περιοχές κάτω από τις κορυφές των εσωτερικών προτύπων χρησιμοποιήθηκαν για να εκτιμηθεί η αναλογία κορυφής μεταξύ του αναλυτή και των εσωτερικών προτύπων. Η συμπεριφορά του κάθε αναλύτη σε κορυφή παραγωγή σε σύγκριση με το αντίστοιχο εσωτερικό πρότυπο ήταν παρόμοιο, με την εξαίρεση της SPC και ΡΑΡ-C16? Αυτές οι αναλυτών εξαιρέθηκαν από τις αναλύσεις. Έτσι, συνολικά 17 λιπίδια και CA125 συμπεριλήφθηκαν στις αναλύσεις.

Ας

R

χαρακτηρίζει την αναλογία κορυφής μεταξύ της περιοχής κάτω από την χρωματογραφική κορυφή για αναλύτη πάνω από τα εσωτερικά πρότυπα, και

C

δηλώσει τη συγκέντρωση. Με δεδομένη την παρατηρηθείσα γραμμική σχέση μεταξύ της ποσοτικοποιημένη αναλογία κορυφής και γνωστή συγκέντρωση σε κάθε σύνολο δεδομένων βαθμονομητή, ένα απλή γραμμική παλινδρόμηση διεξήχθη για να εκτιμηθεί η κλίση παλινδρόμησης για κάθε παρτίδα, η οποία στη συνέχεια χρησιμοποιήθηκε για τη μετατροπή συγκέντρωση για τα κλινικά δείγματα από την αναλογία κορυφής όπως. Χρησιμοποιήσαμε το δείγμα τρέχει QC μεταξύ κάθε 10 κλινικά δείγματα για να εξετάζει την τροποποίηση οποιασδήποτε πιθανής επίδρασης της παρτίδας. Η εκτιμώμενη συγκέντρωση QC χρησιμοποιήθηκε επίσης για τον υπολογισμό των συγκεντρώσεων παρτίδα προσαρμοσμένο για κάθε αναλύτη έτσι ώστε οι συγκεντρώσεις ήταν συγκρίσιμες μεταξύ των παρτίδων για κάθε μία από τις οι LPA και ΜΑΠ. Εάν η προσαρμοσμένη συγκέντρωση ήταν χαμηλότερη από το μηδέν, τότε μηδέν χρησιμοποιήθηκε για την εκτίμηση της συγκέντρωσης. Για LPCs, δεν υπήρχε παρατηρήσιμη ένδειξη των επιδράσεων παρτίδας. Ως εκ τούτου, δεν απαιτείται προσαρμογή της παρτίδας πραγματοποιήθηκε.

Ανάπτυξη στατιστικών μοντέλων

Εμείς απασχολούνται μια ισχυρή προσέγγιση των στατιστικών και μηχανική μάθηση, SVM [16], [17], στην κατάταξη των 211 δειγμάτων του ασθενών που έχουν διαγνωστεί με EOC (περιπτώσεις) και τα 212 καλοήθη δείγματα (benigns) περιλαμβάνονται στην ανάλυση. Αν και SVM δείχνει μια ανώτερη απόδοση ταξινόμησης με πολλές άλλες μεθόδους στατιστικής και μηχανικής μάθησης, συμμερίζεται επίσης ορισμένες κοινές προκλήσεις με άλλες μεθόδους, δηλαδή, μεταβλητή επιλογής (επιλογή βιοδείκτη) και τον κίνδυνο δημιουργίας υπερβολικά αισιόδοξες ποσοστά σφάλματος λόγω μοντέλο υπερπροσαρμογής. Χρησιμοποιήσαμε HH-SVM [18] Η πρώτη να δοθεί προτεραιότητα δείκτες για να εισάγετε το μοντέλο για την κατάταξη μεταξύ benigns και περιπτώσεις. HH-SVM συνδυάζει την huberized συνάρτηση απώλειας άρθρωση και την ελαστική-net ποινή να εκτελέσει την ταξινόμηση και την μεταβλητή επιλογής. Χρησιμοποιήσαμε το παρελθόν που δημοσιεύθηκε

R

κώδικα [18] για τη δημιουργία οικοπέδων βάρος να δοθεί προτεραιότητα τους δείκτες με βάση τη σημασία τους στην κατάταξη. Επειδή CA125 στον ορό είναι ένας κοινός βιολογικός δείκτης που χρησιμοποιείται στην κλινική πρακτική, χτίσαμε τα μοντέλα περιλαμβάνοντας CA125 και την προσθήκη των λιπιδίων δείκτη υποψήφιο ένα-ένα, με βάση τα βάρη εκτιμάται από HH-SVM. Κάθε ένα από τα SVMs ήταν εφοδιασμένο με χρήση Matlab λειτουργία

svmclassify

και οι παράμετροι εκτιμήθηκαν. Χρησιμοποιήσαμε

K

φορές σε χιαστί επικύρωση (CV) για να αποφευχθεί το μοντέλο overfitting [19], όπου

K

= 5 στη μελέτη μας. Οι γενικευμένες λάθη υπολογίζεται με τη χρήση 5-φορές διασταυρωμένης επικύρωσης είναι πιο αντικειμενική [19] από τα ποσοστά σφάλματος υπολογίζεται χωρίς διασταυρούμενη επικύρωση. Τα δεδομένα χωρίστηκαν σε

K

(= 5) περίπου μέρη ίσα-μεγέθους. Για το

k

ου (δηλαδή, το 5

ου) μέρος, υπάρχει περίπου ένα ίσο μέρος της υπόθεσης ΕΓΚ και καλοήθη δείγματα (μισό και μισό) και το μοντέλο είχε τοποθετηθεί στην άλλη

K

-1 (= 4) τμήματα των δεδομένων. Το σφάλμα πρόβλεψης του μοντέλου υπολογίστηκε στη συνέχεια για την

k

th μέρος. Η διαδικασία διεξήχθη για

k

= 1, 2, …, 5, και στη συνέχεια η εκτίμηση σταυρό επικύρωση του σφάλματος πρόβλεψης (σφάλματα CV) υπολογίστηκε aswhere είναι το μέρος που περιέχει παρατήρηση

i

, και είναι η εντοιχισμένη αξία για την παρατήρηση

i

, υπολογίζεται με το

ου μέρος των δεδομένων αφαιρεθεί.

Έχουμε αναπτύξει δύο τύπους μοντέλων, ένα βήμα μοντέλα και δικύκλων βήμα μοντέλα. Για τους ένα βήμα μοντέλα, εμείς δεν χρησιμοποιούν ένα συγκεκριμένο σημείο αποκοπής για τις τιμές CA125 παρόλο που οι τιμές CA125 συμπεριλήφθηκαν στα μοντέλα SVM. Για τα δύο στάδια μοντέλα, έχουμε αναπτύξει αλγορίθμους μας για τις υψηλές και χαμηλές ομάδες υψηλού κινδύνου από την πρώτη χρήση του CA125 σημείο αποκοπής των 35 μονάδων /ml, δεδομένου ότι αυτή είναι η πιο συχνά αναφερόμενη τιμή αναφοράς που χρησιμοποιούνται κλινικά για να ορίσουν ένα θετικό τεστ, και έχει επίσης έχουν χρησιμοποιηθεί σε δοκιμές διαλογής για να καθορίσουν την μη φυσιολογικό αποτέλεσμα της δοκιμής, συμπεριλαμβανομένου του προστάτη, του πνεύμονα, του παχέος εντέρου, των ωοθηκών Δίκη προσυμπτωματικό έλεγχο του καρκίνου [13] .Ως εκ τούτου, χρησιμοποιήσαμε το απλό σημείο αποκοπής των 35 μονάδων /ml ως το πρώτο βήμα για την οικοδόμηση του δύο βήμα μοντέλα. Σημειώστε ότι όλοι οι ασθενείς στη μελέτη μας υποβλήθηκαν σε διαγνωστική απεικόνιση ραδιολογική, δεν διαλογής, και οι πληροφορίες απεικόνισης δεν έχει ενσωματωθεί στο μοντέλο ανάπτυξης.

Για τους ένα βήμα μοντέλα, για ένα δεδομένο σύνολο των δεικτών, το μοντέλο έχει αναπτυχθεί με τον ίδιο τρόπο για όλα τα δείγματα, ανεξάρτητα από το προεγχειρητικό επίπεδο CA125. Ξεκινήσαμε το μοντέλο ανάπτυξης με CA125 μόνο του. Υποψήφια φωσφολιπίδια ανάλογα με τα βάρη παράγονται χρησιμοποιώντας HH-SVM όπως περιγράφηκε παραπάνω, και στη συνέχεια προστέθηκε στα μοντέλα ένα προς ένα κατά τη διάρκεια της ανάπτυξης του μοντέλου. Χρησιμοποιώντας cross-επικύρωσης είναι πιο συντηρητική σε σύγκριση με τα μοντέλα που αναπτύχθηκαν χωρίς διασταυρούμενη επικύρωση. Για την απόδειξη της αρχής, έχουμε αναπτύξει δύο μοντέλα με και χωρίς διασταυρωμένης επικύρωσης, δείχνουν ότι τα μοντέλα με απόδοση διασταυρωμένης επικύρωσης πιο αντικειμενικά ποσοστά σφάλματος.

Για τα δύο στάδια μοντέλα, τα δείγματα πρώτη κατατάσσονται σε υψηλή -CA125 (CA125≥35 μονάδες /ml) και χαμηλής-CA125 (ΟΑ125 & lt? 35 μονάδες /ml) ομάδες. Στο δεύτερο βήμα, έχουμε αναπτύξει ξεχωριστά μοντέλα για κάθε μία από τις δύο ομάδες, τα υψηλής και χαμηλής CA125 ομάδες, αντίστοιχα. Συγκεκριμένα, έχουμε αναπτύξει τα μοντέλα δύο βημάτων με βάση την κοινώς αναφερόμενη σημείο αποκοπής του CA125 σε 35 μονάδες /ml ως το πρώτο βήμα? Στη συνέχεια ρώτησε αν μια δεύτερη δοκιμή προστεθεί σε αυτήν την τιμή αναφοράς του CA125 μπορεί να βελτιώσει τη διαγνωστική ακρίβεια για την ταξινόμηση «περιπτώσεις» (δείγματα από γυναίκες με EOC) και «benigns» (δείγματα από τις γυναίκες χωρίς καρκίνο).

Αποτελέσματα

Η τρέχουσα μελέτη περιελάμβανε δείγματα από όλους τους συμμετέχοντες στους οποίους η διάγνωση της EOC επιβεβαιώθηκε (Ν = 233), καθώς και ισάριθμοι τυχαία επιλεγμένα δείγματα από τις γυναίκες από την ίδια ομάδα διαγνωστεί με καλοήθη νόσο. Δύο περιπτώσεις αποκλείστηκαν λόγω έλλειψης στοιχείων για την προεγχειρητική επίπεδο CA125. Προκαταρκτική ανάλυση (χρησιμοποιώντας Boxplots και ιστογράμματα? Δεδομένα δεν δείχνονται) υποδηλώνουν ότι τα επίπεδα των μετρούμενων βιοδεικτών μπορεί δυνητικά να διαφέρουν μεταξύ διαφορετικών φυλετικών ομάδων, και μόνο ένα μικρό μέρος των δειγμάτων είναι από μη-Καυκάσιους. Ως εκ τούτου, περιόρισε την ανάλυση με τα Καυκάσια άτομα. Αυτό οδήγησε σε ένα σύνολο 211 δειγμάτων ΕΓΚ και 212 καλοήθεις δειγμάτων που περιλαμβάνονται στις αναλύσεις. Μεταξύ των 211 περιπτώσεις ΕΓΚ, η μέση ηλικία (± τυπική απόκλιση) ήταν 62 (± 12) ετών, με 31 προεμμηνοπαυσιακές και μετεμμηνοπαυσιακές 180. Μεταξύ των 212 benigns, η μέση ηλικία (± σταθερή απόκλιση) ήταν 57 (± 14), μεταξύ των οποίων 65 ήσαν προεμμηνοπαυσιακές και 147 μετεμμηνοπαυσιακές. Περαιτέρω λεπτομέρειες σχετικά με τα χαρακτηριστικά των ΕΓΚ περιπτώσεις που προβλέπονται στον πίνακα 1.

Η

Αποτελέσματα CA125

Ένα σύνολο από 211 περιπτώσεις και 212 benigns συμπεριλήφθηκε στην ανάλυση. Χρησιμοποιώντας μόνο τη συγκέντρωση CA125 με σημείο αποκοπής των 35 μονάδων /ml για την ταξινόμηση των δειγμάτων σε περιπτώσεις (CA125≥35 μονάδες /ml) και benigns (CA125 & lt? 35 μονάδες /ml), το ποσοστό σφάλματος είναι 29.79% (126/423). Η ευαισθησία είναι 84,36% (178/211) και η ειδικότητα είναι 56.13% (119/212). Το ποσοστό ψευδώς θετικών (καλοήθη δείγματα ταξινομούνται ως περιπτώσεις) είναι αρκετά υψηλή, όπως είναι τυπικό στην κλινική πράξη.

Ένα βήμα Μοντέλο Αποτελέσματα

Ξεκινήσαμε το μοντέλο ανάπτυξης μόνο με CA125, ο μοναδικός που χρησιμοποιούνται συνήθως κλινικά βιοδείκτης για τον καρκίνο των ωοθηκών. Πρόσθετες δείκτες προστέθηκαν στα μοντέλα ένα-ένα με βάση τα βάρη εκτιμήθηκαν με τη χρήση HH-SVM (Πίνακας 2).

Η

Όπως περιγράφεται στις μεθόδους, ένα σύνολο μοντέλων προσαρμόστηκαν με CV, και η άλλη χωρίς βιογραφικό σημείωμα. Τα εκτιμώμενα ποσοστά σφάλματος για μοντέλα με 1 έως 5 περιλαμβάνονται δείκτες συνοψίζονται στον Πίνακα 3. Όπως ήταν αναμενόμενο, τα μοντέλα χωρίς βιογραφικό έχουν πιο αισιόδοξες εκτιμήσεις των ποσοστών σφάλματος. Καθώς ο αριθμός των μεταβλητών αυξάνεται, τα ποσοστά σφάλματος γίνει μικρότερο. Σε αντίθεση, το σφάλμα βιογραφικό σημείωμα των μοντέλα με δύο δείκτες, CA125 και 16:00, 18:01 ΜΑΠ, είναι η ελάχιστη μεταξύ των 5 μοντέλα είναι εξοπλισμένα με το βιογραφικό (Πίνακας 3). Καθώς ο αριθμός των δεικτών αυξάνεται από 2 έως 5, τα σφάλματα CV γίνονται μεγαλύτερες (αντί για μικρότερο). Τα σφάλματα CV αυξάνουν καθώς ο αριθμός των δεικτών αυξάνεται και να αναφέρει την υπερπροσαρμογής όπως αναμένεται. Τα μοντέλα με υψηλότερους αριθμούς των δεικτών δεν αναφέρονται εδώ. Το μοντέλο με το ελάχιστο σφάλμα CV περιέχει δύο δείκτες, CA125 και 16:00, 18:01 ΜΑΠ. βελτίωση της ταξινόμησης πάνω από το μοντέλο με μόνο CA125 οφείλεται στη βελτίωση της εξειδίκευσης. Η ιδιαιτερότητα είναι 85,38% και η ευαισθησία είναι 70,62%. Για τη σύγκριση της απόδοσης του μοντέλου με εκείνη του σημείο αποκοπής 35 μονάδες /ml για CA125, τη ρύθμιση του ειδικότητα σε 56,13%, η ευαισθησία βελτιώνεται από 84,36% έως 88,15%. Κατά παρόμοιο τρόπο, με τη χρήση αυτού του μοντέλου, υπάρχει συγκρίσιμη διαγνωστική ειδικότητα του 58,49% (σε σύγκριση με 56,13%) σε αυτό το σύνολο των δειγμάτων, ενώ διατηρείται η ευαισθησία στο 84,36%.

Η

Δύο βήμα Model αποτελέσματα

στα ένα βήμα μοντέλα παραπάνω, έχουμε δείξει ότι το μοντέλο ανάπτυξης που χρησιμοποιούν διασταυρωμένης επικύρωσης είναι πιο συντηρητικές. Έτσι, για τα δύο στάδια μοντέλα, χρησιμοποιήσαμε μόνο την συντηρητική προσέγγιση για την ανάπτυξη μοντέλων προκειμένου να αποφευχθεί υπερπροσαρμογής. Όπως περιγράφεται στα Υλικά και Μέθοδοι τμήμα, τα δείγματα πρώτα ταξινομήθηκαν σε υψηλής CA125 (CA125≥35) ή χαμηλής CA125 (ΟΑ125 & lt? 35) ομάδες. Για το δεύτερο βήμα, έχουμε αναπτύξει ξεχωριστά μοντέλα SVM για τις ομάδες υψηλής και χαμηλής CA125-CA125. Η HH-SVM, όπως περιγράφεται στο τμήμα Υλικά και Μέθοδοι χρησιμοποιήθηκε για να δώσει προτεραιότητα βιοδείκτες για τα υψηλής και χαμηλής CA125 ομάδες, αντίστοιχα.

Με βάση την κατάταξη των δεικτών σε κάθε υψηλής και χαμηλής -CA125 ομάδες (Πίνακας 4), τα σφάλματα διασταυρούμενης επικύρωσης για SVMs με 1 έως 7 δείκτες εκτιμήθηκαν, αντίστοιχα. Για την ομάδα χαμηλού CA125, το πρώτο μοντέλο SVM περιέχει την κορυφαία δείκτη, 16:00, 18:01 ΜΑΠ. Το μοντέλο αρχικά τοποθετηθεί και το λάθος βιογραφικό εκτιμήθηκε. Το δεύτερο μοντέλο SVM περιέχει ένα επιπλέον δείκτη στο μοντέλο, 15:00 LPC, εκτός από την αρχική (την υψηλότερη κατάταξη) δείκτη, 16:00, 18:01 ΜΑΠ. Αυτή η διαδικασία της προσθήκης δεικτών ένα-ένα μέσα μοντέλα με βάση τα βάρη εκτιμάται από HH-SVM επαναλαμβάνεται για τα μοντέλα με 3 δείκτες, 4 μαρκαδόρους, και έως 7 δείκτες. Καθώς ο αριθμός των δεικτών στα υποδείγματα αυξάνεται, οι αυξημένες σφάλματα CV δείχνουν την υπερπροσαρμογής των μοντέλων, όπως αναμενόταν, έτσι σταματήσαμε την προσθήκη δείκτες. Για την ομάδα χαμηλής CA125, το μοντέλο με το μικρότερο ποσοστό σφάλματος CV είναι το μοντέλο με 4 δείκτες: 16:00, 18:01 PPE, 15:00 LPC, 18:02 LPA, και 18:00, 22:06 PPE (ως μέρος του συνόλου των 3 μοντέλα στον πίνακα 5), που αναφέρεται ως «σετ 4 δείκτης» στον πίνακα 5. για την ομάδα υψηλής CA125, τα μοντέλα προσαρμόστηκαν με τον ίδιο τρόπο. Το πρώτο SVM περιέχει τα κορυφαία δείκτη, 16:00, 18:01 PPE, και επιπλέον μοντέλα με περισσότερους δείκτες χτίστηκαν με την προσθήκη τους ένα-ένα. Το μοντέλο αρχικά τοποθετηθεί και το λάθος βιογραφικό εκτιμήθηκε. Το μικρότερο ποσοστό σφάλματος CV είναι ότι το μοντέλο με 2 δείκτες: 16:00, 18:01 ΜΑΠ και 14:00 LPC, (ως μέρος του μοντέλου

M3

στον Πίνακα 5). Αυτές οι 2 δείκτες που αναφέρονται ως «σύνολο 2 δείκτη» στον Πίνακα 5.

Η

Το σφάλμα ταξινόμησης τιμές, τις ιδιαιτερότητες και τις ευαισθησίες των τριών μοντέλων δύο σταδίων με συνδυασμούς είτε το 2 τα σύνολα δείκτη ή /και τα σετ 4 σημειωτή συνοψίζονται στον πίνακα 3. το πρώτο στάδιο της μοντελοποίησης για όλα τα τρία μοντέλα είναι ταυτόσημη, δηλαδή, χρησιμοποιώντας συγκέντρωση CA125 35 μονάδες /ml ως το σημείο αποκοπής για την ταξινόμηση των δειγμάτων σε υψηλής και χαμηλής ομάδες CA125. Διαφορετικά μοντέλα για τις υψηλής και χαμηλής CA125 ομάδες προσαρμόστηκαν χωριστά (Πίνακας 5). Το πρώτο μοντέλο,

M1

, έχει ξεχωριστά μοντέλα SVM για τις ομάδες υψηλής και χαμηλής CA125. Οι δείκτες για κάθε SVM είναι οι 4 δείκτες που αναφέρονται παραπάνω (16:00, 18:01 PPE, 15:00 LPC, 18:02 LPA, και 18:00, 22:06 PPE), αλλά τα μοντέλα είναι εξοπλισμένα χωριστά για κάθε