PLoS One: p21 rs3176352 G & gt? C και p73 rs1801173 C & gt? T πολυμορφισμοί συνδέονται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του οισοφάγου σε κινεζική Πληθυσμός


Αφηρημένο

Στόχος

οισοφάγου καρκίνος ήταν η πέμπτη πιο συχνά διαγιγνώσκεται καρκίνος και η τέταρτη κύρια αιτία του καρκίνου που σχετίζονται με το θάνατο στην Κίνα το 2009. Οι γενετικοί παράγοντες μπορεί να παίζουν σημαντικό ρόλο στην οισοφάγου καρκίνωμα πλακωδών κυττάρων (ESCC) καρκινογένεση.

Σχέδια και Μέθοδοι

Για να αξιολογηθεί η επίδραση

p21

,

p53

,

TP53BP1

και

p73

πολυμορφισμούς μονών νουκλεοτιδίων (SNPs), σχετικά με τον κίνδυνο ESCC, πραγματοποιήσαμε μια μελέτη ασθενών-μαρτύρων του νοσοκομείου. Ένα σύνολο 629 ​​περιπτώσεων ESCC και 686 έλεγχοι προσλήφθηκαν. γονότυπους τους προσδιορίστηκαν χρησιμοποιώντας αντίδραση ανίχνευσης απολίνωση (LDR) μέθοδο.

Αποτελέσματα

Όταν το

p21

rs3176352 GG ομοζυγώτες γονότυπο χρησιμοποιήθηκε ως ομάδα αναφοράς, η CC γονότυπο ήταν σχετίζεται με σημαντικά αυξημένο κίνδυνο ESCC. Όταν το

p73

rs1801173 CC ομοζυγώτες γονότυπο χρησιμοποιήθηκε ως ομάδα αναφοράς, το CT γονότυπος σχετίζεται με σημαντικά αυξημένο κίνδυνο ESCC. Μετά τη διόρθωση Bonferroni, για

p21

rs3176352 G & gt? C, το

σ

σωστή ήταν ακόμη σημαντικές. Για τους άλλους έξι SNPs, σε όλα τα μοντέλα σύγκριση, δεν παρατηρήθηκε συσχέτιση μεταξύ των πολυμορφισμών και τον κίνδυνο ESCC

Συμπεράσματα

p21

rs3176352 G & gt?. C και

p73

rs1801173 C & gt? T SNPs σχετίζονται με αυξημένο κίνδυνο ESCC. Για να επιβεβαιώσετε τα τρέχοντα ευρήματα, τα πρόσθετα, μεγαλύτερες μελέτες και ιστο-ειδική βιολογική χαρακτηρισμό απαιτείται

Παράθεση:. Zheng L, Tang W, Shi Υ, Τσεν S, Wang Χ, Wang L, et al. (2014)

p21

rs3176352 G & gt? C και

p73

rs1801173 C & gt? T πολυμορφισμοί συνδέονται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του οισοφάγου σε ένα κινεζικό πληθυσμό. PLoS ONE 9 (5): e96958. doi: 10.1371 /journal.pone.0096958

Επιμέλεια: Ralf Krahe, Πανεπιστήμιο του Τέξας MD Anderson Cancer Center, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 13, Ιανουαρίου του 2014? Αποδεκτές: 12, Απριλίου 2014? Δημοσιεύθηκε: May 12, 2014

Copyright: © 2014 Zheng et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτή η μελέτη υποστηρίχθηκε εν μέρει από το Εθνικό Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας (81370001, 81371927, 81101889, 81000028), στην επαρχία Jiangsu Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών (BK2010333, BK2011481), Ίδρυμα Κοινωνικής Ανάπτυξης του Zhenjiang (SH2010017) και Changzhou Νέα Ταλέντα και Επιστήμης-Τεχνολογίας του Ιδρύματος της Γραφείο υγείας (QN201102) και το Νοσοκομείο Συνδεδεμένες Λαϊκής ταμείο Πανεπιστημίου Jiangsu (Y200913). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Καθώς η τέταρτη κύρια αιτία των θανάτων από καρκίνο και το πέμπτο πιο κοινή διάγνωση του καρκίνου στην Κίνα το 2009 [1], το ποσοστό του 5-ετή επιβίωση του καρκίνου του οισοφάγου είναι πολύ κακή και λογαριασμούς μόνο 12,3% σε 23 Ευρωπαϊκές χώρες [2]. Περισσότερο από το 90% του οισοφάγου καρκίνων είναι καρκίνωμα του οισοφάγου από πλακώδες επιθήλιο (ESCC). Εκτός από περιβαλλοντικούς παράγοντες κινδύνου, όπως το κάπνισμα και η υπερβολική κατανάλωση αλκοόλ, πολυμορφισμοί ενός νουκλεοτιδίου (SNPs), όπως γενετικοί παράγοντες μπορεί να παίζουν σημαντικό ρόλο στην καρκινογένεση ESCC [3].

ογκοκατασταλτικά πρωτεΐνη ρ53 συχνά μεταλλάσσεται σε διάφορους τύπους των καρκίνων και εμπλέκεται στον κυτταρικό πολλαπλασιασμό και την εξέλιξη του όγκου [4]. Η

p53

γονίδιο βρίσκεται στο χρωμόσωμα 17ρ13.1. Μια καλά μελετημένη

p53

πολυμορφισμού, Arg72Pro (rs1042522 C /G? R /P) έχει αναφερθεί ότι έχει λειτουργική σημασία [5], [6]. Σε σύγκριση με Arg πρωτεΐνη άγριου τύπου, η Pro παραλλαγή αλληλόμορφου κωδικοποιημένη πρωτεΐνη είναι πιο αποτελεσματική στην επαγωγή DNA έκφραση πυρηνικών γονιδίων επισκευής [7]. Πολυμορφισμός

p53

rs1042522 G & gt? C έχει συσχετιστεί με κίνδυνο πολλά είδη καρκίνων [8]

P21 (WAF1 /Cip1 /CDKN1A), ένας μη ειδικός αναστολέας CDK και ένα κλειδί. μεσολαβητής της G0-G1 διακοπή του κυτταρικού κύκλου, ρυθμίζεται προς τα πάνω από την άγριου τύπου ρ53. λειτουργίες p21 κατά τη διάρκεια της επισκευής των γονιδίων και την αγγειογένεση [9]. Κυττάρων διακοπή κύκλου στο σημείο περιορισμού φάση G1-S προκαλείται μέσω p21 πάνω ρύθμιση που επάγεται από ρ53, και το σχετικό G1 κυκλίνες-cdk2 σύμπλοκα αναστολής [10]. Σε ρ53-ελλειπή κύτταρα, ρ21 αλληλεπιδρά με πυρηνικό αντιγόνο πολλαπλασιαζόμενων κυττάρων (PCNA) και προκαλεί τόσο G1 και G2 διακοπή του κυτταρικού κύκλου [11]. Με την αναστολή της αντιγραφής του DNA PCNA-εξαρτώμενη, έκφραση ρ21 μπορεί να καταστείλει την ανάπτυξη του όγκου και την επισκευή αναντιστοιχία in vitro [12].

p21

κωδικοποιεί μια πρωτεΐνη 21-kDa, βρίσκεται στο χρωμόσωμα 6p21.2 και αποτελείται από τρία εξώνια και δύο ενδόνια [13].

πρωτεΐνης όγκου 53 πρωτεΐνη δέσμευσης 1 (TP53BP1) αλληλεπιδρά ειδικά με

p53

και συμμετέχει τόσο στην επιδιόρθωση του DNA και τον έλεγχο του κυτταρικού κύκλου. Συνεργαζόμενη με αισθητήρες ζημιές και μετατροπείς σήματος, TP53BP1 βοηθά μεσολαβήσει το σημείο ελέγχου βλάβης του DNA [14].

P73

μετοχές δομικές και λειτουργικές ομοιότητες με

p53

.

p73

βρίσκεται σε 1p36.33, χαρτογράφηση σε μια περιοχή που συχνά διαγράφονται σε καρκίνους [15]. ρ73 ενεργοποιεί μεταγραφή του ρ21-ρ53 και αποκρίνονται γονίδια, τα οποία συμμετέχουν στον έλεγχο του κυτταρικού κύκλου, την επιδιόρθωση του DNA, την απόπτωση και αναστέλλει την ανάπτυξη των κυττάρων σε ένα ρ53-τον ίδιο τρόπο με την επαγωγή απόπτωσης ή G1 διακοπή του κυτταρικού κύκλου [16], [17]. Αυτό υποδηλώνει ότι ρ73 έχει λειτουργίες ογκο-κατασταλτικά. Σε αντίθετη περίπτωση, η

p73

γονίδιο έχει μερικές σημαντικές διαφορές από την p53. Σε αντίθεση με p53-ανεπαρκή ποντίκια, εκείνοι που στερούνται

ρ73

δεν δείχνουν αυξημένη ευαισθησία σε αυθόρμητη ογκογένεση [18].

γενετικές παραλλαγές στα γονίδια ρ53 οδού, όπως

ρ21

,

p53

,

TP53BP1

και

p73

, μπορεί να συμβάλει στην ανάπτυξη της ESCC. Σε μια μελέτη ασθενών-μαρτύρων νοσοκομείο με βάση, εκτελέσαμε γονοτυπική ανάλυση των οκτώ λειτουργικά

p21

,

p53

,

TP53BP1

και

p73

SNPs σε 629 περιπτώσεις ESCC και 686 ελέγχους σε ένα κινεζικό πληθυσμό.

Υλικά και Μέθοδοι

Ηθικά έγκριση του πρωτοκόλλου της μελέτης

Τα δεδομένα έχει κατατεθεί σε υποστηρικτικά αρχεία πληροφοριών. Όσον αφορά την ηθική συμπεριφορά της έρευνας στον άνθρωπο ή /και τα ζώα, θα συμμορφωθεί με τη Διακήρυξη της Παγκόσμιας Ιατρικής Ένωσης του Ελσίνκι. Το Διοικητικό Συμβούλιο αναθεώρηση του Πανεπιστημίου Jiangsu (Zhenjiang, Κίνα) ενέκρινε την εν λόγω μελέτη ασθενών-μαρτύρων νοσοκομείο. Γραπτή συγκατάθεση δόθηκε από όλους τους συμμετέχοντες στη μελέτη.

Οι ασθενείς και οι έλεγχοι

Μεταξύ Οκτωβρίου 2008 και Δεκεμβρίου του 2010, από το Νοσοκομείο Ενταγμένο Λαϊκό Πανεπιστήμιο Jiangsu και Affiliated Νοσοκομείο του Πανεπιστημίου Jiangsu (Zhenjiang , Κίνα), 629 ασθενείς με καρκίνο του οισοφάγου προσλήφθηκαν διαδοχικά. Από παθολογική μέσα, όλες οι περιπτώσεις καρκίνου του οισοφάγου διαγνώστηκαν ως ESCC. Τα κριτήρια αποκλεισμού ήταν: ασθενείς οι οποίοι είχαν προηγουμένως καρκίνο? κάθε μεταστάσεις καρκίνου και ραδιοθεραπεία ή χημειοθεραπεία. 686 ασθενείς χωρίς καρκίνο αντιστοιχήθηκαν με τις περιπτώσεις όσον αφορά την ηλικία (± 5 έτη) και το φύλο, ως μάρτυρες. Οι έλεγχοι είχαν προσληφθεί από τις προαναφερθείσες δύο νοσοκομεία κατά την ίδια χρονική περίοδο. Οι περισσότεροι από τους μάρτυρες που υποβάλλονται σε θεραπεία για τραύματα (συμπεριλαμβανομένων 612 ασθενείς με τραύμα, 45 ασθενείς μολυσματική ασθένεια και 29 ασθενείς υπέρταση).

Χρησιμοποιώντας ένα προ-δοκιμαστεί ερωτηματολόγιο, εκπαιδευμένοι ερευνητές αμφισβήτησαν κάθε θέμα προσωπικά και λαμβάνονται δημογραφικές πληροφορίες δεδομένων ( π.χ., ηλικία, φύλο) και οι συναφείς παράγοντες κινδύνου (όπως το κάπνισμα και η κατανάλωση αλκοόλ). Δείγματα φλεβικού αίματος (2-mL) συλλέχθηκαν μετά από τη συνέντευξη από κάθε υποκείμενο. Ο ορισμός της «καπνιστές» κάπνιζε το ένα τσιγάρο την ημέρα για & gt? 1 έτος. Ο ορισμός της «πότες αλκοόλ» ήταν η κατανάλωση ≥3 αλκοολούχα ποτά την εβδομάδα για & gt? 6 μήνες

Απομόνωση του DNA, την επιλογή SNPs και του γονότυπου με την αντίδραση ανίχνευσης απολίνωση (LDR)

Από σύνολο. αίμα, γονιδιωματικό DNA απομονώθηκε [19]. Η επιλογή 8 SNPs βασίστηκε σε προηγούμενα δημοσιευμένα άρθρα με λειτουργική εξέταση [20], [21], [22], [23]. Με την τεχνική υποστήριξη της Σαγκάης Biowing Εφαρμοσμένη Βιοτεχνολογία Εταιρείας, τα δείγματα γονότυπος χρησιμοποιώντας τη μέθοδο LDR [24]. Σε 160 (12,17%) επιλέγονται τυχαία δείγματα με υψηλή ποιότητα του DNA, επαναλαμβανόμενες αναλύσεις έγιναν για τον έλεγχο της ποιότητας.

Στατιστικές αναλύσεις

Χρησιμοποιώντας το

χ

2 τεστ , μεταξύ των περιπτώσεων και των ελέγχων, τις κατανομές των δημογραφικών χαρακτηριστικών, επιλεγμένες μεταβλητές, και γονότυπους του

p21

,

p53

,

TP53BP1

και

p73

αξιολογήθηκαν παραλλαγές διαφορές. Χρησιμοποιώντας λογιστική παλινδρόμηση αναλύσεις, οι συσχετίσεις μεταξύ των οκτώ SNPs και τον κίνδυνο ESCC εκτιμήθηκαν για το αργό ΕΑΠ και να προσαρμόζονται ΕΑΠ κατά τη ρύθμιση για την ηλικία, το φύλο, το κάπνισμα και την κατάσταση του πόσιμου. Λόγω του αριθμού των συγκρίσεων, εφαρμόσθηκε η διαδικασία διόρθωση Bonferroni. Με καλοσύνη-of-fit

χ

2 δοκιμή, η ισορροπία Hardy-Weinberg (HWE) ελέγχθηκε για να συγκρίνουν τις παρατηρούμενες συχνότητες γονοτύπου με τις αναμενόμενες αυτές μεταξύ των ατόμων της ομάδας ελέγχου. Με SAS 9.1.3 (SAS Institute, Cary, NC, USA), έγιναν όλες οι στατιστικές αναλύσεις.

Αποτελέσματα

χαρακτηριστικά του πληθυσμού της μελέτης

Θήκες και των ελέγχων » τα χαρακτηριστικά συνοψίζονται στον πίνακα 1. με το

χ

2 δοκιμές, οι περιπτώσεις και οι έλεγχοι ταιριάζουν επαρκώς με την ηλικία και το φύλο. Μεταξύ των υποθέσεων και των ελέγχων, σημαντική διαφορά ανιχνεύθηκε για το κάπνισμα και το ποτό κατάσταση, η οποία παρουσιάζεται στον Πίνακα 1. Η κύρια πληροφορίες για οκτώ γονότυπος SNPs ήταν στον Πίνακα 2. Τα ποσοστά αντιστοιχίας των επαναλαμβανόμενων αναλύσεων ήταν 100% εκτός από

p21

rs3176352 G & gt? C (158/160, 98,75%). Για όλα τα SNPs, συχνότητα έλασσον αλληλόμορφο (MAF) σε ελέγχους μας ήταν παρόμοια με MAF για τους Κινέζους στη βάση δεδομένων. Στους ελέγχους, για τις οκτώ αυτές πολυμορφισμών, οι παρατηρούμενες συχνότητες γονοτύπου ήταν όλα σε HWE (Πίνακας 2).

Η

Σύλλογοι μεταξύ p21, p53, TP53BP1 και p73 πολυμορφισμών και κίνδυνο ESCC και γονότυπου συνδυασμός ανάλυση

Όταν το

p21

rs3176352 GG ομοζυγώτες γονότυπο χρησιμοποιήθηκε ως ομάδα αναφοράς, ο γονότυπος GC δεν σχετίστηκε με τον κίνδυνο για ESCC? το CC γονότυπος σχετίζεται με σημαντικά αυξημένο κίνδυνο για ESCC (CC εναντίον ΦΕΚ: προσαρμογή OR = 1,61, 95% CI = 01.18 έως 02.20,

σ

= 0,0030). Στο κυρίαρχο μοντέλο, το

p21

rs3176352 παραλλαγές GC /CC ήταν που δεν συνδέονται με τον κίνδυνο ESCC, σε σύγκριση με το

p21

rs3176352 GG γονότυπο. Στο υπολειπόμενο μοντέλο, όταν οι

p21

rs3176352 γονότυπους GG /GC χρησιμοποιήθηκαν ως ομάδα αναφοράς, ο γονότυπος CC ομοζυγώτες συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο 63% των ESCC (CC εναντίον ΦΕΚ /GC: προσαρμογή OR = 1.63, 95% CI = 01.23 έως 02.15,

σ

= 0,0006) (Πίνακας 3).

η

Όταν το

χρησιμοποιήθηκε p73

rs1801173 CC ομοζυγώτες με γονότυπο ως ομάδα αναφοράς, το CT γονότυπος σχετίζεται με σημαντικά αυξημένο κίνδυνο για ESCC (CT εναντίον CC: προσαρμογή OR = 1.39, 95% CI = 1,10 – 1,76,

σ

= 0.006)? το γονότυπο ΤΤ δεν σχετίστηκε με τον κίνδυνο ESCC. Στο κυρίαρχο μοντέλο, οι

p73

rs1801173 CT /ΤΤ παραλλαγές που σχετίζονται με σημαντικά αυξημένο κίνδυνο για ESCC (CT /ΤΤ έναντι CC: προσαρμογή OR = 1.37, 95% CI = 1,10 – 1,72,

σ

= 0,006), σε σύγκριση με το

p73

rs1801173 CC γονότυπο. Στο υπολειπόμενο μοντέλο, όταν η

p73

rs1801173 CC /CT γονοτύπων χρησιμοποιήθηκαν ως ομάδα αναφοράς, η ομοζυγώτες με γονότυπο ΤΤ που δεν συνδέονται με τον κίνδυνο ESCC (Πίνακας 3).

Όταν η

p21

rs1801270 CC ομοζυγώτες γονότυπο χρησιμοποιήθηκε ως ομάδα αναφοράς, ο γονότυπος ΑΑ συσχετίστηκε με σημαντικά μειωμένο κίνδυνο για ESCC. Όταν το

TP53BP1

rs560191 ΦΕΚ /γονότυπους GC χρησιμοποιήθηκαν ως ομάδα αναφοράς, η CC γονότυπο συσχετίστηκε με σημαντικά μειωμένο κίνδυνο για ESCC (Πίνακας 3). αναλύσεις λογιστικής παλινδρόμησης έδειξε ότι τα

p21

rs2395655 G & gt? Α,

p21

rs1059234 C & gt? Τ,

p21

rs762623 C & gt? Α και

p53

rs1042522 G & gt? C πολυμορφισμοί δεν συσχετίστηκαν με τον κίνδυνο ESCC (Πίνακας 2). Μετά τη διόρθωση Bonferroni (αριθμός πολλαπλές δοκιμής = 32), για

p21

rs3176352 G & gt? C, η προσαρμοσμένη

σ

= 0,096 για CC εναντίον GG, ρυθμίζεται

p

= 0,0192 για CC εναντίον ΦΕΚ /GC. Για

p73

rs1801173 C & gt?. Τ, η

σ

σωστές = 0,202 για CT εναντίον CC μετά από προσαρμογή για την ηλικία et al,

σ

σωστές = 0,195 για CT /ΤΤ έναντι CC. Για τα υπόλοιπα 6 SNPs, σε όλα τα μοντέλα σύγκρισης,

σ

& gt?. 0.05

Όταν οι

p21

rs3176352 CC γονότυπο και

p73

rs1801173 CT /γονότυπους ΤΤ θεωρήθηκαν ως παραλλαγή του κινδύνου γονότυπους. Όταν η ομάδα φορέας γονότυπος δεν παραλλαγή του κινδύνου χρησιμοποιήθηκε ως ομάδα αναφοράς, η κάθε ομάδα φορέα παραλλαγή γονότυπου ενός κινδύνου (προσαρμογή OR = 1.42, 95% CI = 1,12 – 1,80,

σ

= 0,0035) και οι δύο τον κίνδυνο ομάδα παραλλαγή γονότυπους φορέα (προσαρμογή OR = 2.47, 95% CI = 1,60 – 3,82,

σ

& lt? 0.0001) συσχετίστηκαν με σημαντικά αυξημένο κίνδυνο για ESCC

αναλύει Διαστρωμάτωση στο p21. rs3176352 G & gt? C και p73 rs1801173 C & gt? T πολυμορφισμό και ο κίνδυνος ESCC

για να αξιολογηθούν τα αποτελέσματα των

p21

rs3176352 G & gt? C γονότυπους για ESCC κινδύνου σύμφωνα με διαφορετική ηλικία, το φύλο, το κάπνισμα και το καθεστώς κατανάλωση αλκοόλ? πραγματοποιήσαμε αναλύσεις διαστρωμάτωσης. Ένα σημαντικά αυξημένο κίνδυνο ESCC που συνδέονται με το

p21

rs3176352 G & gt? C πολυμορφισμού ήταν εμφανής μεταξύ όλων των υποομάδων εκτός από γυναίκες ασθενείς μετά από στρωματοποίηση (Πίνακας S1). Ένα σημαντικά μειωμένο κίνδυνο του ESCC που συνδέονται με το

p73

rs1801173 C & gt?. Τ πολυμορφισμού ήταν εμφανής μεταξύ των ηλικιωμένων ασθενών, οι γυναίκες ασθενείς και ασθενείς που ποτέ δεν πίνει ή το κάπνισμα (Πίνακας S2)

Συζήτηση

Σε αυτή τη μελέτη ασθενών-μαρτύρων νοσοκομείο με βάση της ESCC, βρήκαμε ότι το

p21

rs3176352 CC και

p73

rs1801173 CT /γονότυπους ΤΤ συσχετίστηκαν με αυξημένο κίνδυνο ESCC? θετικά αποτελέσματα παρατηρήθηκαν επίσης σε ανάλυση συνδυασμό γονότυπο. Για το καλύτερο της γνώσης μας, αυτή είναι η πρώτη θετική συσχέτιση του

p21

rs3176352 G /C και

T πολυμορφισμών με ESCC κίνδυνο p73

rs1801173 C /.

P21 είναι ένας αναστολέας κινάσης που εξαρτάται από κυκλίνη. Έχει παρατηρηθεί ότι σε μια ευρεία ποικιλία καρκίνων, η έκφραση ρ21 μεταβάλλεται. Στο G1 φάση, η πρωτεΐνη ρ21 διαταράσσει τον κυτταρικό κύκλο εξέλιξης [25], [26]. Η πρόσδεση της πρωτεΐνης ρ53 καταστολέα όγκου με τον υποκινητή ρ21 επάγει έκφραση p21 [27]

P21

rs3176352 G /C (IVS2 + 16 G & gt? C). Βρίσκεται στο ιντρόνιο 2

ρ21

, 16 bp προς τα κάτω από τη θέση ματίσματος. Αυτή η μετάβαση C-προς-G προβλέπεται να επηρεάσει την

p21

αγγελιαφόρο RNA splicing [28]. Choi

et al.

Έδειξε ότι

p21

rs3176352 G /C πολυμορφισμός φαίνεται να είναι σε ανισορροπία σύνδεσης με Ser31Arg σε μια κορεατική πληθυσμό. Η ανάλυση αυτού του απλότυπου για επιδεκτικότητα καρκίνου του πνεύμονα έδειξε ένα προστατευτικό αποτέλεσμα που εξαρτιόταν από τον αριθμό των παραλλαγή αλληλίων. Σε προηγούμενη μελέτη στην οποία συμμετείχαν 80 ασθενείς με καρκίνο του οισοφάγου και 200 ​​του καρκίνου χωρίς ελέγχους από Ningxia Περιφέρεια της Κίνας, η

p21

rs3176352 G /C πολυμορφισμός δεν συσχετίστηκε με οισοφάγου κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου [29]. Μια μελέτη ασθενών-μαρτύρων από το βορειοανατολικό Ιράν, με 126 περιπτώσεις και 100 έλεγχοι, εκτελέστηκε για την ανίχνευση ενώσεων

p21

πολυμορφισμούς (rs1801270 και rs1059234) με ESCC κίνδυνο [30]. Τα δεδομένα υποδηλώνουν ότι αυτά τα δύο

p21

πολυμορφισμούς, αμφότερα μεμονωμένα και σε συνδυασμό, δεν ESCC βιοδείκτες γενετική ευαισθησία, η οποία συμφωνεί με τα αποτελέσματά μας.

P73, ένα ομόλογο ρ53, έχει κάποια ρ53- σαν δραστηριότητες και παίζει σημαντικό ρόλο στη ρύθμιση του κυτταρικού κύκλου, απόπτωση και επιδιόρθωση του DNA. Σε μια υψηλή συχνότητα εμφάνισης περιοχή της Κίνας,

ρ73

πολυμορφισμοί δεν συνδέθηκαν με ESCC επιδεκτικότητα [31]. Ωστόσο, τα αποτελέσματά μας είναι πιο αξιόπιστα λόγω του υψηλότερου αριθμού των υποθέσεων και των ελέγχων.

p73

rs1801173 C /T πολυμορφισμού χρήζει περαιτέρω λειτουργική μελέτη για τη διαλεύκανση της αιτιολογίας αυτού του SNP και ESCC.

Οι συχνότητες των γενετικών πολυμορφισμών συχνά διαφέρουν μεταξύ των εθνοτικών ομάδων. Στην παρούσα κινεζική μελέτη, η συχνότητα αλληλόμορφου του

p21

rs3176352 C ήταν 0.410 σε 686 άτομα ελέγχου, η οποία είναι σύμφωνη με τις τιμές που αναφέρονται στη βάση δεδομένων SNP για την κινεζική Han (0,422) και την ιαπωνική πληθυσμού (0.455) , υψηλότερη από εκείνη της Αφρικής (0.233) του πληθυσμού της Υποσαχάριας και αφροαμερικάνων πληθυσμού (0.250), και αλλά χαμηλότερη από εκείνη του ευρωπαϊκού πληθυσμού (0.758). Η συχνότητα αλληλόμορφου του

p73

rs1801173 Τ ήταν 0.230 σε 686 άτομα ελέγχου, η οποία είναι σύμφωνη με τις τιμές που αναφέρονται στη βάση δεδομένων SNP για την CHB + JPT (Κινέζοι Χαν + Ιάπωνες) πληθυσμούς (0.267), υψηλότερο από εκείνο της Υποσαχάριας Αφρικής (0.102) του πληθυσμού και του ευρωπαϊκού πληθυσμού (0.150).

Αυτή η μελέτη ασθενών-μαρτύρων είχε αρκετούς περιορισμούς. Πρώτον, γιατί οι ασθενείς και οι έλεγχοι εντάχθηκαν από τα νοσοκομεία, εγγενή προκατάληψη μπορεί να έχουν ως αποτέλεσμα την ψευδή ευρήματα. Δεύτερον, οι πολυμορφισμοί μελετήσαμε μπορεί να μην παρέχουν την ολοκληρωμένη εικόνα της

p21

,

p53

,

TP53BP1

και

p73

γενετική ποικιλότητα. Οι μελέτες Πρόστιμο-χαρτογράφηση που απαιτείται. Τρίτον, λόγω του μετρίου μεγέθους του δείγματος και η απουσία μιας κοόρτης επικύρωσης, η στατιστική ισχύς ήταν περιορισμένη. Τέλος, η ιογενείς λοιμώξεις και το ανοσοποιητικό παραμέτρους πληροφορίες δεν ήταν διαθέσιμες, έτσι η δύναμη της αναλύσεις μας ήταν περιορισμένη.

Εν κατακλείδι, η μελέτη μας παρέχει ισχυρά αποδεικτικά στοιχεία ότι

p21

rs3176352 G /C και

p73

rs1801173 C /T πολυμορφισμοί μπορεί να συμβάλει στην ESCC κίνδυνο. Οι ιστο-ειδική βιολογικές μελέτες χαρακτηρισμού και αντιγραφή με μεγαλύτερους πληθυσμούς που απαιτούνται για την επιβεβαίωση των ευρημάτων μας.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Πίνακα S1.

Στρωματοποιημένη ανάλυση μεταξύ

p21

rs3176352 G & gt? C πολυμορφισμός και τον κίνδυνο ESCC από το φύλο, την ηλικία, το κάπνισμα και η κατανάλωση αλκοόλ

doi:. 10.1371 /journal.pone.0096958.s001

( DOCX)

Πίνακας S2.

Στρωματοποιημένη ανάλυση μεταξύ

p73

rs1801173 C & gt? Τ πολυμορφισμού και ESCC κινδύνου με βάση το φύλο, την ηλικία, το κάπνισμα και η κατανάλωση αλκοόλ

doi:. 10.1371 /journal.pone.0096958.s002

( DOC)

δεδομένων S1.

δεδομένων του p21, p53, TP53BP1 και p73 πολυμορφισμοί

doi:. 10.1371 /journal.pone.0096958.s003

(SAV)

Ευχαριστίες

Σας ευχαριστούμε για όλα ασθενείς που συμμετείχαν σε αυτή τη μελέτη. Θα θέλαμε να ευχαριστήσουμε τον Δρ Yiqun Chen (Biowing Εφαρμοσμένη Βιοτεχνολογία Εταιρείας, Σαγκάη, Κίνα) για τεχνική υποστήριξη.

You must be logged into post a comment.