Αφηρημένο

καρκίνος του CRC είναι μία από τις πλέον θανατηφόρες ασθένειες στις δυτικές χώρες. Προκειμένου να αναπτυχθούν προγνωστικούς βιοδείκτες για CRC (καρκίνο του παχέος εντέρου) επιθετικότητα, αναλύσαμε αναδρομικά 267 ασθενείς CRC μέσω ενός νέου, πολυδιάστατη πλατφόρμα βιοδείκτη. Χρησιμοποιώντας nanofluidic τεχνολογία για την ανάλυση qPCR και ποσοτική φθορισμού ανοσοϊστοχημεία για την ανάλυση πρωτεϊνών, αξιολογήσαμε 33 microRNAs, 124 mRNAs και 9 αντιγόνα πρωτεϊνών. Η ανάλυση πραγματοποιήθηκε σε κάθε ενιαία διάσταση (microRNA, το γονίδιο ή πρωτεΐνη), χρησιμοποιώντας τόσο το μοντέλο Cox πολυπαραγοντική και τη μέθοδο Kaplan-Meier. Στη συνέχεια, θα απλοποιηθούν οι λογοκρίνονται δεδομένων επιβίωσης σε δεδομένα δυαδικής απόκρισης (επιθετικοί εναντίον μη επιθετικό καρκίνο). Στη συνέχεια, θα ενσωματωθούν τα δεδομένα σε ένα διαγνωστικό βαθμολογία χρησιμοποιώντας φέτες αντίστροφη παλινδρόμησης για επαρκή μείωση της διάσταση. Ακρίβεια εκτιμήθηκε χρησιμοποιώντας περιοχή κάτωθεν της καμπύλης (AUC). ανάλυση Single διάσταση οδήγησε στην ανακάλυψη των επιμέρους παραγόντων που ήταν σημαντικοί παράγοντες πρόβλεψης της έκβασης. Αυτά περιλαμβάνονται επτά συγκεκριμένες microRNAs, τέσσερα γονίδια, και μία πρωτεΐνη. Όταν αυτοί οι παράγοντες προσδιορίστηκαν ποσοτικά μεμονωμένα ως παράγοντες πρόβλεψης της επιθετικής νόσου, το υψηλότερο αποδείξιμη περιοχή κάτω από την καμπύλη (AUC) ήταν 0,68. Αντίθετα, όταν όλα τα αποτελέσματα από την ενιαία διαστάσεις συνδυάστηκαν σε ολοκληρωμένες βιοδείκτες, AUCs είχαν αυξηθεί δραματικά με τις αξίες προσεγγίζουν ακόμη και άνω των 0,9. ανάλυση ενιαία διάσταση δημιουργεί στατιστικά σημαντικοί προγνωστικοί, αλλά προγνωστική δυνάμεις τους είναι αναντίστοιχο για την κλινική χρησιμότητα. Μια νέα, πολυδιάστατη ολοκληρωμένη προσέγγιση υπερνικά αυτές τις ελλείψεις. Πρόσφατα προέρχεται ολοκληρωμένη βιοδείκτες έχουν τη δυνατότητα να κατευθύνει ουσιαστικά την επιλογή των θεραπευτικών στρατηγικών για μεμονωμένους ασθενείς, ενώ διαλεύκανση μοριακών μηχανισμών που οδηγούν την εξέλιξη της νόσου

Παράθεση:. Mariani Μ, Ο S, McHugh Μ, Andreoli Μ, Pandya D, Sieber S, et al. (2014) Ολοκληρωμένη Ανάλυση Πολυδιάστατη απαιτούνται για ακριβή Πρόγνωσης βιοδείκτες στον καρκίνο του παχέος εντέρου. PLoS ONE 9 (7): e101065. doi: 10.1371 /journal.pone.0101065

Επιμέλεια: Γιάννης Souglakos, Πανεπιστημιακό Γενικό Νοσοκομείο Ηρακλείου και Εργαστήριο όγκων Κυτταρικής Βιολογίας, Τμήμα Ιατρικής, Πανεπιστήμιο Κρήτης, Ελλάδα