Αφηρημένο

Ιστορικό

ΑΚΤ1 (v-ΑΚΤ ποντικού thymoma ιικό ομόλογο ογκογονίδιο 1) κινάση είναι ένα από τα πιο συχνά ενεργοποιείται πολλαπλασιάστηκαν και την επιβίωση μονοπάτι του καρκίνου. Πρόσφατα έχει δειχθεί ότι E17K μετάλλαξη στο πεδίο πλεκστρίνης ομολογία (PH) του ΑΚΤ1 πρωτεΐνης οδηγεί σε καρκίνο ενισχύοντας τη φωσφορυλίωση και μεμβράνη εντοπισμό της πρωτεΐνης. Το μεταλλαγμένο έδειξε αντοχή σε ΑΚΤ1 /2 αναστολέα VIII μορίου φαρμάκου. Στην παρούσα μελέτη δείξαμε τις λεπτομερείς δομικές και μοριακές συνέπειες που συνδέονται με τη ρύθμιση δραστηριότητα της μεταλλαγμένης πρωτεΐνης.

Μέθοδοι

Η βαθμολογία σύνδεσης παρουσίασαν σημαντική απώλεια της συγγένειας αλληλεπίδραση με ΑΚΤ1 /αναστολέα 2 VIII μορίου φαρμάκου. Περαιτέρω, οι μελέτες προσομοίωσης μοριακής δυναμικής παρουσίασε στοιχεία ταχείας διαμορφωτικών drift παρατηρείται σε μεταλλαγμένα δομή.

Αποτελέσματα

Δεν υπήρχε απώλεια σταθερότητας στην μετάλλαξη σε σύγκριση με φυσική δομή και το μεγάλο κατιόν-π αλληλεπιδράσεις επίσης φαίνεται να διατηρούνται. Επιπλέον, τα ενεργά κατάλοιπα που εμπλέκονται στον εντοπισμό μεμβράνης της πρωτεΐνης εμφάνισαν σημαντική αύξηση στο σχηματισμό NHbonds σε μεταλλαγμένα. Η αύξηση στο σχηματισμό NHbond σε ενεργά κατάλοιπα αντιπροσωπεύει το 4-πλάσια αύξηση στο δυναμικό εντοπισμό μεμβράνης της πρωτεΐνης.

Συμπέρασμα

Το συνολικό αποτέλεσμα δείχνει ότι, καίτοι η μετάλλαξη δεν προκάλεσε καμία σταθερότητα απώλεια στη δομή, οι συνδεδεμένες παθολογικές συνέπειες θα μπορούσε να έχει συμβεί λόγω των ραγδαίων διαμορφωτική παρασύρει παρατηρείται στον τομέα μεταλλαγμένο ΑΚΤ1 PH.

Γενικά Σημασία

Η μεθοδολογία που εφαρμόζεται και τα αποτελέσματα που λαμβάνονται σε αυτό το έργο θα διευκολύνουν τον προσδιορισμό του πυρήνα μοριακών μηχανισμών του καρκίνου που σχετίζονται με μεταλλάξεις και στο σχεδιασμό πιθανών αναστολέων τους για τα ναρκωτικά

Παράθεση:. Kumar Α, Purohit Ε (2013) Cancer Associated E17K μετάλλαξη προκαλεί ταχεία Διαμορφωτική Drift στο ΑΚΤ1 πλεκστρίνης ομολογίας (PH ) τομέα. PLoS ONE 8 (5): e64364. doi: 10.1371 /journal.pone.0064364

Επιμέλεια: Reiner Albert Veitia, Institut Jacques Monod, Γαλλία

Ελήφθη: 30 του Γενάρη 2013? Αποδεκτές: 12 του Απριλίου του 2013? Δημοσιεύθηκε: 31 Μαΐου του 2013

Copyright: © 2013 Kumar, Purohit. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτοί οι συγγραφείς δεν έχουν καμία υποστήριξη ή χρηματοδότηση για να αναφέρετε

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

ΑΚΤ1 (v-ΑΚΤ ποντικού thymoma ιικό ομόλογο ογκογονίδιο 1) κινάση είναι ένα μέλος της ίσως το πιο συχνά ενεργοποιούνται πολλαπλασιασμό και την επιβίωση της πορείας του καρκίνου [1] – [6]. Τα μέλη της οικογένειας γονιδίων ΑΚΤ συνδέεται με τον καρκίνο στον άνθρωπο? ιδιαίτερα σημαντικό είναι η γενετική ενίσχυση της ΑΚΤ2. Σημείο μετάλλαξη στο ΑΚΤ1 έχει ανιχνευθεί σε σύνδρομο Proteus [2], του ενδομητρίου καρκινώματα [4], [7] και της λευχαιμίας [5], [8] – [9], ενίσχυση γονιδίου σε ένα μόνο γαστρικό καρκίνωμα έξω από μια οθόνη πάνω από 225 διαφορετικές ανθρώπινες κακοήθειες [10], και 1 γλοιοσαρκώματος από 103 κακοήθων νευρογλοιακών καρκίνων [11]. Σε μια άλλη μελέτη βρέθηκε ότι η δραστηριότητα ΑΚΤ1 κινάσης συχνά αυξημένα σε διάφορες υψηλής ποιότητας, καρκίνων προχωρημένου σταδίου [12] αν και οι ακριβείς μηχανισμοί αυτών των παρατηρήσεων είναι ακόμα ασαφής. Η ενεργοποίηση του ΑΚΤ1 οδηγείται από εντοπισμό μεμβράνη, η οποία είναι με τη σειρά της κινείται από την δέσμευση του ομολογίας πλεκστρίνης (ΡΗ) τομέα για να φωσφατιδυλινοσιτόλη-3,4,5-τριςφωσφορικής (PtdIns (3,4,5) P3) ή phosphatidylinositol- 3,4-διφωσφορική (PtdIns (3,4) P2), ακολουθούμενη από φωσφορυλίωση του ρυθμιστικού αμινοξέα σερίνη 473 (Ser 473) και θρεονίνη 308 (Thr 308) [3], [13]. Η παθολογική σύνδεση των ΑΚΤ με τη μεμβράνη του πλάσματος είναι ένα κοινό νήμα που συνδέει ΑΚΤ στον καρκίνο [1] – [7], [14] – [15]. Το ογκογόνο συμπεριφορά της πρωτεΐνης Gag-ΑΚΤ σύντηξης από το ρετροϊό ΑΚΤ8 λευχαιμίας ποντικών (ν-ΑΚΤ ποντικού θυμώματος ιικό ομόλογο ογκογονίδιο 8) απαιτεί μια μεμβράνη-σήμα στόχευσης-την μυριστοϋλίωση πρώτη συμπερασματική απόδειξη ότι παθολογική εντοπισμός μεμβράνη της δραστικότητας κινάσης ΑΚΤ1 μπορούσε να μετασχηματισμό σε ποντικούς [16]. Επιπλέον, η σημασία της ΑΚΤ στον ανθρώπινο καρκίνο είναι σε μεγάλο βαθμό συνάγεται από συχνά εμφανιζόμενες μεταλλάξεις στα ένζυμα που ρυθμίζει την δραστηριότητα αυτών των δευτερολέπτων φωσφολιπιδίων αγγελιοφόρου (PtdIns (3,4,5) P3, PtdIns (3,4) P2), και τελικά προκαλεί η ενεργοποίηση του ΑΚΤ μέσω μεμβράνης πρόσληψης [1], [3], [17], [18]. δείγματα όγκων, από τους ασθενείς με καρκίνο του μαστού, καρκίνο του παχέος εντέρου και περιπτώσεις λευχαιμίας έχει δειχθεί ότι φιλοξενούν συχνά ενεργοποίηση σωματικές μεταλλάξεις σε ΑΚΤ1 [1], [5]. Επιπλέον, η απώλεια που συνδέεται αλληλεπιδρούν μέλη όπως η δραστικότητα των λιπιδίων φωσφατάσης φωσφατάσης και tensin ομόλογο (ΡΤΕΝ) έχει αναφερθεί σε γλοιοβλάστωμα, του προστάτη και του ενδομητρίου μέσω σωματικών μεταλλάξεων [11], ή στον καρκίνο του μαστού με τη βοήθεια των επιγενετικών σίγηση [12], η οποία αντιπροσωπεύει μια εναλλακτική έμμεσο μηχανισμό για την ενεργοποίηση ΑΚΤ. Ως εκ τούτου, ΑΚΤ1 φαίνεται να έχει έναν κρίσιμο αλλά παθητικό ρόλο στην ογκογένεση και ενεργεί ως μια έμμεση ενδιάμεσος μεταξύ μεταλλαγμένες ανάντη ρυθμιστικές πρωτεΐνες και κατάντη μορίων σηματοδότησης.

Το ογκογόνο ενεργοποίηση του ΑΚΤ1 μπορεί να προκληθεί από διάφορα μέσα, πιο συχνά εμφανιζόμενων είτε λόγω του συμβιβασμού στη μεμβράνη της στόχευσης κατά τομέα ΡΗ, είτε λόγω των παθολογικών διαμορφωτικές αλλαγές που συμβαίνουν στο μεταλλαγμένο δομή. Οι γενετικές μεταλλάξεις στον τομέα ΡΗ έχει αναφερθεί προηγουμένως να διαταράξουν την συμπεριφορά εντοπισμού και σε απώλεια της ευαισθησίας έναντι των PtdIns και έχει οδηγήσει σε σοβαρές συνέπειες για λειτουργική συμπεριφορά της [1]. Ενώ εξέταση των αιτίων πίσω από τέτοια παρατήρηση, η υπολογιστική προσέγγιση αποτελεί ένα σημαντικό σπονδυλική στήλη και χρησιμεύει στη διεξαγωγή έντονο πειραματικές παρατηρήσεις στην είσοδο χαμηλό κόστος. Μια σημειακή μετάλλαξη στο νουκλεοτίδιο 49 που καταλήγει σε μια υποκατάσταση της λυσίνης για γλουταμικό οξύ στο αμινοξύ 17 (ΑΚΤ (E17K)) έχει ενοχοποιηθεί σε περιπτώσεων καρκίνου [1], [3], [19] – [21]. Η μοριακή αιτία πίσω από την συνδεδεμένων ογκολογική έκβαση δεν έχει ακόμη μελετηθεί σε πολλές λεπτομέρειες. Είναι γνωστό ότι η πρόσδεση του φωσφοϊνοσιτιδίων στην περιοχή ΡΗ ενεργοποιεί ΑΚΤ1. Στην διαμόρφωση apo, Glu 17 καταλαμβάνει το θύλακα φωσφοϊνοσιτιδίου δέσμευσης και σχηματίζει ένα δίκτυο δεσμών υδρογόνου. Στο έργο του Carpten et al. (2007), δείχθηκε ότι τα Lys 17 υποκατάσταση οδηγεί σε μετατόπιση της επιφανειακό φορτίο γύρω από το θύλακα από αρνητική με Glu 17 για την αποτελεσματική ουδέτερο στο μεταλλαγμένο [1]. Αυτή η μετάλλαξη έχει ως αποτέλεσμα ένα αυξημένο επίπεδο φωσφορυλίωσης ΑΚΤ για Thr και Ser 308 473 σε σύγκριση με τον άγριο τύπο. ΑΚΤ1 (E17K) δραστικότητα κινάσης δείχθηκε να είναι περίπου τέσσερις φορές μεγαλύτερη από εκείνη του ΑΚΤ1 (WT), υποδηλώνοντας ότι η μετάλλαξη έχει αλλάξει την ρύθμιση ΑΚΤ1 και ως εκ τούτου αυξάνει την κυτταρική δραστηριότητα [1]. Περαιτέρω, έχει επίσης προταθεί ότι η μετάλλαξη προκαλεί μεγάλη αύξηση συγγένεια για ΡΙ (4,5) Ρ2 η οποία είναι απαραίτητη για την συστατική μεμβράνη πλάσματος στόχευση της περιοχής μεταλλαγμένου ΡΗ και έτσι στην ογκογόνο χαρακτήρα της πλήρους μήκους πρωτεΐνης E17K ΑΚΤ1 [3]. Επιπλέον, προτάθηκε επίσης ότι η μετάλλαξη τομέα E17K ΡΗ προκάλεσε διαρθρωτικές αλλαγές στον τομέα PH, η οποία εμπόδισε την περαιτέρω αλληλεπίδραση του με ΑΚΤ1 /2 αναστολέα VIII [1]. Όλες αυτές οι παρατηρήσεις υποδεικνύουν έντονα ότι οι επιζήμιες διαμορφωτικές αλλαγές στην μετάλλαξη χώρου ΡΗ μπορεί να προκάλεσαν τέτοια παθολογική εκβάσεις.

Η Μοριακή δυναμική προσομοίωση (MDS) υπήρξε μια υποσχόμενη προσέγγιση για τη διερεύνηση των διαμορφωτικές μεταβολές στο μεταλλαγμένο δομή πρωτεΐνης με αναφορικά με την φυσική διαμόρφωση του [22] – [29]. Γνωρίζουμε ότι η αλλαγή στη διαμορφωτική προσανατολισμό ενός μορίου πρωτεΐνης επηρεάζει την αλληλεπίδρασή του με συνδέτη, καθώς και τη βιολογική τους εταίρους της. Στην εργασία αυτή επικεντρώθηκε μελέτη μας για τη διερεύνηση των αλλαγών στη δυναμική συμπεριφορά του τομέα ΑΚΤ1 PH που προκαλείται από τον καρκίνο προκαλώντας μετάλλαξη E17K. Προηγούμενες έρευνες έχουν δείξει ότι E17K μετάλλαξη έχει ένα δυνητικό ρόλο στην επαγωγή σημαντική μεταβολή σε ΑΚΤ1-PH διαμόρφωση τομέα καθώς και στην επαγωγή αντίστασης έναντι ΑΚΤ1 /2 αναστολέα VIII [1]. Διενεργήσαμε MDS στην ιδέα να συναγάγει τις διαμορφωτικές αλλαγές που συμβαίνουν στο μεταλλαγμένο δομή, η οποία μπορεί να ευθύνεται για τις παρατηρούμενες μοριακών αλλαγών και των συνδεδεμένων παθολογικών αποτελεσμάτων. Επιπλέον, οι μελέτες σύνδεσης βοήθησε επίσης στον προσδιορισμό των αλλαγών στην συγγένεια αλληλεπίδραση συνδέτη πρωτεΐνης. Συνολικά, τα αποτελέσματα μας παρείχε μια ισχυρή ένδειξη των μεγάλων που συμβαίνει διαμορφωτική μετατόπιση στην μεταλλαγμένη πρωτεΐνη σε σύγκριση με την μητρική.

Υλικά και Μέθοδοι

Σύνολα

Έχουμε επιλέξει κρυσταλλικές δομές των ιθαγενών PH (ΠΠ ID: 1UNP), τη δομή E17K (ΠΠ ID: 2UZS) και τη δομή της ΑΚΤ1 /2 αναστολέα VIII (ΠΠ ID: 3O96) από Brookhaven Protein Data Bank [30] για την έρευνά μας. Τα λαμβανόμενα δομές ήταν ενέργεια ελαχιστοποιείται χρησιμοποιώντας GROMOS96 43a1 forcefield μέσω gromacs 4.5.4.package [31].

κατιόντων-π αλληλεπιδράσεις

κατιόντων-π αλληλεπιδράσεις υπολογίστηκαν με τη χρήση του προγράμματος Capture [32]. αλληλεπιδράσεις κατιόντος-π σε πρωτεϊνικές δομές εντοπίστηκαν και αξιολογήθηκαν με τη χρήση ενός κριτηρίου ενέργειας που βασίζονται για την επιλογή σημαντικών ζεύγη πλευρικών αλυσίδων. Η ποσοστιαία σύνθεση ενός συγκεκριμένου υπολείμματος αμινοξέος που συμβάλλουν στην κατιόντων π αλληλεπιδράσεις λαμβάνεται από την εξίσωση: όπου «i» αντιπροσωπεύει τις πέντε κατάλοιπα (Lys, Arg, Phe, Trp, και Tyr),

n

cat-π είναι ο αριθμός των καταλοίπων που εμπλέκονται στην κατιόν-π αλληλεπιδράσεις, και

n

(i) είναι ο αριθμός των καταλοίπων του τύπου «i» στους θεωρούνται πρωτεϊνικές δομές.

Furthere ο αλληλεπίδραση κατιόντος-π αναγνωρίζεται όλο και περισσότερο ως ένα σημαντικό μη ομοιοπολική σύνδεση αλληλεπίδραση σχετική με δομικής βιολογίας. Χρησιμοποιεί μια παραλλαγή των βελτιστοποιημένες δυνατότητες για το πεδίο υγρό προσομοιώσεις (OPLS) δύναμη για να παρέχει μια ενεργητική αξιολόγηση όλων των πιθανών κατιόντος-π αλληλεπιδράσεις σε μια πρωτεΐνη. Η ηλεκτροστατική ενέργεια () υπολογίζεται χρησιμοποιώντας την εξίσωση: όπου και είναι οι χρεώσεις για τα άτομα

i

και

ι

, αντίστοιχα, και είναι η απόσταση μεταξύ τους. Ο van der Waals ενέργειας δίνεται από:

Πού και? και είναι ο van der Waals ακτίνα και το βάθος καλά, αντίστοιχα.

Αν ≤-2,0 kcal /mol, το ζεύγος υπολογίζεται ως αλληλεπίδραση κατιόντος-π. Αν & gt? -1,0 Kcal /mol, η δομή απορρίπτεται. Αν -2.0 & lt? ≤-1,0 kcal /mol, η δομή διατηρείται μόνο αν ≤-1,0 kcal /mol

Ligand Binding κοιλότητα Ανάλυση

ρίζας δεσμευτική κοιλότητα της δομής τομέα ΑΚΤ1 ΡΗ. εξετάζονται από το εργαλείο CASTp [33]. CASTp υλοποιεί στοιχειώδη τακτική triangulations, που συνήθως αναφέρονται ως σταθμισμένος τριγωνοποίησης Delaunay και το συγκρότημα άλφα για να μετρηθεί το σχήμα συμπληρωματικότητας της δοθεί μακρομόριο. Μετρά επίσης τις προσβάσιμες τσέπες επιφάνεια και τις εσωτερικές κοιλότητες που είναι απρόσιτες. Μέτρα ακολουθήστε τις αναλυτικούς υπολογισμούς εντοπισμό περιοχή και τον όγκο του κάθε τσέπη και κοιλότητα [33].

Συμπληρωματικότητα Ανάλυση

Χρησιμοποιήσαμε το PatchDock web server [34] για τον υπολογισμό της συμπληρωματικότητας του αναστολέα ΑΚΤ1 /2 VIII και ΑΚΤ1 χώρου ΡΗ. Η βασική αρχή αυτού του Server γίνεται με βάση την εκπροσώπηση μοριακό σχήμα, επιφάνεια επίθεμα που ταιριάζουν συν φιλτραρίσματος και βαθμολόγησης. Έχει ως στόχο την εξεύρεση μετασχηματισμούς σύνδεσης που δίνουν καλή κατάσταση συμπληρωματικότητα μοριακή. Τέτοιες μετατροπές, όταν εφαρμόζονται, να προκαλέσει και τις δύο ευρείες περιοχές διασύνδεσης και μικρές ποσότητες στερεοχημικές συγκρούσεις. αλγόριθμο τμηματοποίησης είναι υλοποιήθηκαν για την ανίχνευση των γεωμετρικών μπαλώματα. Τα επιθέματα φιλτράρονται, έτσι ώστε μπαλώματα μόνο με τα υπολείμματα «hot spot» διατηρούνται. Περαιτέρω, οι τεχνικές υβριδικό της Γεωμετρικής Κατακερματισμός και Pose-Clustering ταιριάζουν implimented να ταιριάζει με τα μπαλώματα. Όλα τα σύμπλοκα με απαράδεκτες διεισδύσεις των ατόμων του υποδοχέα στα άτομα του συνδέτη απορρίπτεται. Τέλος, οι υπόλοιποι υποψήφιοι κατατάσσονται σύμφωνα με ένα γεωμετρικό βαθμολογία συμπληρωματικότητα σχήμα. 3D συντεταγμένες των ιθαγενών και των μεταλλαγμένων δομών υποβλήθηκαν σε docking με ΑΚΤ1 /2 αναστολέας VIII.

Docking Ανάλυση

μελέτες μοριακής σύνδεσης διεξήχθησαν για να διερευνηθεί ο ρόλος της μετάλλαξης σε επηρεάζουν τον αναστολέα ΑΚΤ1 /2 VIII δραστικότητα δέσμευσης του τομέα κινεσίνης χρησιμοποιώντας ΑυΤΌϋΟΟΚ 4.0 [35]. AutoDockTools 1.4.6 χρησιμοποιήθηκε για καθορισμό των σημείων Autogrid καθώς και οπτικοποίηση των αγκυροβολημένο δομές συνδέτη-αμινοξύ [35]. Πλέγμα χάρτης με επίκεντρο τους συνδέτες θέσεις της αυτοφυούς και μεταλλαγμένου δομές δέσμευσης κατασκευάστηκαν για να καλύψουν τις τσέπες δεσμευτικός ΑΚΤ1 /2 αναστολέα VIII. Λαμαρκιανή γενετικό αλγόριθμο χρησιμοποιήθηκε για τη διενέργεια προσομοιώσεων μοριακής σύνδεσης. Προσομοιώσεις πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση έως και 2,5 εκατομμύρια ενέργεια αξιολογήσεων με μέγιστο αριθμό 27 000 γενεών. Τα χαμηλότερα ενέργειας διαμορφώσεων θεωρήθηκαν ως οι δεσμευτικές διαμορφώσεις μεταξύ ΑΚΤ1 /2 αναστολέα VIII και PH τομέα.

Μοριακής Δυναμικής Προσομοίωσης

Μοριακής Δυναμικής Προσομοίωσης διεξήχθη με τη χρήση gromacs 4.5.4 πακέτο [31] . Δομές της φυσικής και της μεταλλαγμένης ΡΗ χρησιμοποιήθηκαν ως σημείο εκκίνησης για προσομοιώσεις MD. Συστήματα διαλυμένες σε ένα ορθογώνιο κουτί με τα μόρια του νερού TIP3P σε 10 οριακή ακτίνα. Σε φυσιολογικό ρΗ βρέθηκαν να είναι αρνητικά φορτισμένα, έτσι ώστε να καταστεί το σύστημα προσομοίωσης ηλεκτρικά ουδέτερα οι δομές, προσθέσαμε 2 ιόντα χλωρίου (CL

-) στο πλαίσιο προσομοίωσης με τη χρήση του «Genion» εργαλείο που συνοδεύει με το πακέτο gromacs . Αρχικά τα μόρια διαλύτη χαλαρή ενώ όλα τα άτομα είχαν διαλυμένης ουσίας αρμονικά συγκρατημένη στις αρχικές τους θέσεις με μια σταθερή δύναμη 100 kcal /mol για 5000 βήματα. Emtol κριτήριο σύγκλισης του 1000 kcal /mol και fourierspacing 0,12 nm χρησιμοποιήθηκε. Μετά από αυτό, ολόκληρα μοριακό σύστημα υποβλήθηκε σε ελαχιστοποίηση ενέργειας με τη χρήση της μεθόδου συζευγμένο κλίση. Berendsen μέθοδος σύζευξης θερμοκρασία [36] χρησιμοποιήθηκε για τη ρύθμιση της θερμοκρασίας στο εσωτερικό του κουτιού. σύζευξη Ισότροπο πίεση διεξήχθη χρησιμοποιώντας μέθοδο Parrinello-Rahman. Ηλεκτροστατικές αλληλεπιδράσεις υπολογίζονται βάσει της μεθόδου Particle Mesh Ewald [37]. Οι ιονισμός καταστάσεις των υπολειμμάτων τέθηκαν κατάλληλα σε ρΗ 7 με όλες τις ιστιδίνες υποτίθεται ουδέτερο. Η πίεση διατηρήθηκε σε 1 atm με τον επιτρεπόμενο εύρος συμπίεσης της 4.5e

-5 atm. SHAKE αλγόριθμος χρησιμοποιήθηκε για να περιορίσουν τα μήκη δεσμού που περιλαμβάνει υδρογόνο, επιτρέποντας ένα βήμα χρόνο 2 fs. Van der Waals και αλληλεπιδράσεις Coulomb περικοπεί σε 1.0 nm. Το μη συνδεδεμένο λίστα ζεύγος ενημερώθηκε κάθε 10 βήματα και διαμορφώσεων φυλάχτηκαν κάθε 0,5 ps. προσομοίωσης συγκράτησης θέση για το 2000 ps εφαρμόστηκε για να επιτρέψει μόρια διαλύτη για να εισέλθουν στην περιοχή κοιλότητα της δομής. Τέλος, τα συστήματα υποβλήθηκαν σε MD προσομοίωσης για 50 ns. Υπολογίσαμε την συγκριτική ανάλυση των διαρθρωτικών αποκλίσεων στη μητρική και μεταλλαγμένα δομή PH. RMSD, RMSF, η SAS και η ανάλυση Rg πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση g_rms, g_rmsf, ​​g_sas και g_gyrate εργαλείο αντίστοιχα. Αριθμός διακριτών δεσμών υδρογόνου που σχηματίζονται από συγκεκριμένα υπολείμματα σε άλλα αμινοξέα μέσα στην πρωτεΐνη κατά τη διάρκεια της προσομοίωσης (NHbond) υπολογίστηκε χρησιμοποιώντας g_hbond. NHbond καθορίζεται με βάση την απόσταση δότη-δέκτη μικρότερη από 0,35 nm και του δότη-υδρογόνου-αποδέκτη. Γραφήματα χαράχθηκαν χρησιμοποιώντας Γκρέις GUI toolkit 5.1.22 έκδοση.

Αποτελέσματα και Συζήτηση

Carpten et al. (2007) πρότεινε ότι η μετάλλαξη E17K είχε προκαλέσει σημαντική αύξηση στη δραστηριότητα ΑΚΤ1 [1]. Σύμφωνα με τα συμπεράσματα που παρουσιάζονται στην εργασία τους, η μετάλλαξη προκαλεί σημαντική αλλαγή στην διαμόρφωση του χώρου ΡΗ ΑΚΤ1 η οποία τελικά οδηγεί σε πάνω από φωσφορυλίωση, 4.5 φορές αύξηση στον εντοπισμό μεμβράνης τάση και αύξηση της δράσης της κινάσης της, η οποία μπορεί να οδηγήσει σε καρκίνο [1] – [6]. Επιπλέον, η μετάλλαξη προκαλεί την απώλεια σε δέσμευση με ΑΚΤ1 /2 αναστολέα VIII. Αν και τα πειραματικά αποτελέσματα έχουν παρουσιάσει την οριακή επισκόπηση του μοριακού μηχανισμού που σχετίζεται με μετάλλαξη E17K, θα εξακολουθούν να στερούνται την λεπτομερή εξήγηση της παρατηρούμενης φαινότυπο σε μοριακό και ατομικό επίπεδο. Για να κατανοήσουμε τις σχετικές διαρθρωτικές και μοριακές αλλαγές, πραγματοποιήσαμε μοριακής σύνδεσης και προσομοίωσης μοριακής δυναμικής. Τα αποτελέσματα που λαμβάνονται στη μελέτη μας παρέχονται ενδιαφέρον συμπεράσματα, να δείχνει προς την ταχεία διαμορφωτική μετατόπιση στον τομέα E17K PH. Πρώτα εξετάσαμε την πιο προσιτή κοιλότητα του τομέα ΑΚΤ1 ΡΗ χρησιμοποιώντας το εργαλείο CASTp σύνδεσης συνδετήρα. Από τα αποτελέσματα CASTp, ήταν σαφές ότι τα κατάλοιπα 38 σε 52 και 77 87 θέσεις αμινοξέων σχηματίζει το πιο προσιτό περιοχές κοιλότητα για αλληλεπίδραση συνδετήρα. Για να εξεταστεί η μεταβολή στη συγγένεια σύνδεσης στη μητρική και μεταλλαγμένη πρωτεΐνη, μπορούμε περαιτέρω διεξήχθη ανάλυση συμπληρωματικότητας χρησιμοποιώντας το εργαλείο patchdock. Στα αποτελέσματα patchdock η συνολική βαθμολογία σύνδεσης των μεταλλαγμένων με συνδέτη βρέθηκαν να είναι χαμηλότερη σε σύγκριση με τη φυσική δομή (Πίνακας 1).

Η

Ανάλυση Μοριακής σύνδεσης διεξήχθη χρησιμοποιώντας ΑυΤΌϋΟΟΚ 4.0 πακέτο για να ξετυλίξουν τις αλλαγές στο ΑΚΤ1 /2 αναστολέα VIII συγγένεια στην μετάλλαξη δομή σύνδεσης σε σύγκριση με εγγενή. Ένα αξιοσημείωτο απώλεια συγγένειας αλληλεπίδρασης παρατηρήθηκε στο μεταλλαγμένο δομή σε σύγκριση με εγγενή. Στη μητρική η ενέργεια βέλτιστη δέσμευση ήταν -12.32 kcal /mol, ενώ στην μετάλλαξη βρέθηκε να είναι -3.87 kcal /mol (Πίνακας 1). Μια καλύτερη κατανόηση της αλλαγής στην μοριακή αλληλεπίδραση μπορεί να φανεί στο Σχ. 1. Ένα σύνολο 6 αμινο αλληλεπιδράσεων υπόλειμμα οξέος με ΑΚΤ1 /2 αναστολέα VIII παρατηρήθηκαν στην φυσική δομή, ενώ στην μετάλλαξη υπήρχε μόνο ένας βρέθηκε αλληλεπίδραση. Επιπλέον, τα πρότυπα της φυσικής αλληλεπιδράσεων δεν επελέγησαν για τον μεταλλαγμένο δομή. Τα υπολείμματα Met 1, Ser 2, Asp 3, Gln 59, Gln 79 και Arg 86, οι οποίες συμμετέχουν ενεργά στο αλληλεπίδραση αναστολέα στη μητρική, δεν έδειξε κανένα ρόλο στη μεταλλαγμένη δομή (Εικ. 1). Αυτές οι μοριακές αλληλεπιδράσεις αποκάλυψε τις καταστροφικές συνέπειες της μετάλλαξης σε ΑΚΤ1 /2 αναστολέας VIII συγγένειας αλληλεπίδραση χώρου ΡΗ.

Δομή στα αριστερά δείχνει μητρική Ph- ΑΚΤ1 /2 αναστολέα VIII πολύπλοκη και τη δομή στα δεξιά δείχνει μεταλλαγμένο PH ( E17K) -. ΑΚΤ1 /2 αναστολέας VIII συγκρότημα

η

η πρωτεΐνη-συνδέτη αλληλεπιδράσεις που συχνά συνοδεύονται από σημαντικές αλλαγές στη διαμόρφωσή τους. Έτσι, για να ερευνήσει την αιτία της ΑΚΤ1 /2 αναστολέας VIII δεσμευτική απώλεια συνάφειας στην μεταλλαγμένη δομή και να κατανοήσουν τις διαρθρωτικές συνέπειες της μετάλλαξης E17K, πραγματοποιήσαμε δυναμική προσομοίωση του φυσικού μοριακών και το μεταλλαγμένο τομέα ΑΚΤ1 PH. Ερευνήσαμε RMSD, RMSF, Rg, SASA και παραλλαγή NHbond, και οι διακυμάνσεις απόσταση μεταξύ των σημαντικών αλληλεπιδρούν υπολείμματα στο φυσικό και μεταλλαγμένο δομή. RMSD για όλα τα Ca άτομα από την αρχική δομή υπολογίσθηκαν που θεωρήθηκαν ως η κεντρική προέλευση για να μετρηθεί το σύστημα πρωτεΐνης. Εδώ η RMSD μετρά μέση απόσταση μεταξύ των ατόμων των πρωτεϊνών στα δύο διαδοχικές καταστάσεις. Στο Σχ. 2 και το Σχ. 3, η μητρική και η μεταλλαγμένη πρωτεΐνη PH έδειξε διακριτή μόδας της απόκλισης μέχρι 13 ns από την αρχική δομή τους, με αποτέλεσμα την ραχοκοκαλιά RMSD ~ 0,3 στη μητρική και -0.4 στα μεταλλαγμένα. Μετά από 13 ns, μεταλλαγμένη πρωτεΐνη PH έδειξε ακραία μορφή απόκλιση μέχρι το τέλος της προσομοίωσης, σε σύγκριση με το φυσικό. Στο 13137 ps η μεταλλαγμένη δομή έδειξε μια απότομη αύξηση στην τιμή RMSD φθάνοντας έως και 3,36 nm και περαιτέρω επέστρεψε στο 0,44 nm σε 16.078 ps (Εικ. 2, Σχ. 3). Αυτή η τάση της διακύμανσης συνεχίστηκε το μεταλλαγμένο δομή μέχρι το τέλος και έδειξε ακραίες αποκλίσεις σε σύγκριση με μητρική. Επιπλέον, η μετάλλαξη έφτασε μέχρι υψηλότερο επίπεδο RMSD της σε 35.931 ps, φθάνοντας έως και 4,9 nm. Όλα αυτά είναι δεδομένα πρότειναν ότι η μεταλλαγμένη δομή είχε υποβληθεί σε διακριτές διαμορφωτική μετατόπιση καθ ‘όλη τη προσομοίωση, ενώ τέτοιες εκτροπές δεν παρατηρήθηκαν στην φυσική δομή. Τα παραπάνω παρατηρούνται διαμορφωτική παρασύρει ήταν ακόμη σε συμφωνία με τα αποτελέσματα που προέκυψαν από την ανάλυση του χρόνου που εξαρτώνται από τις διακυμάνσεις δευτερεύουσα δομή μέσω της ανάλυσης dSsp. Τα μεταλλαγμένα κατάλοιπα τερματική δομή έδειξε διαμορφωτική παρασυρόμενα από άλφα-έλικα για να κάμψει μορφή, ενώ τέτοια παρασύρεται δεν παρατηρήθηκε σε φυσική δομή (Εικ. 2). Επιπλέον, ακραία διαμορφωτική παρασύρει παρατηρήθηκαν στο μεταλλαγμένο μεταξύ 25 ns-35 ns. Το ποσό των κάμψεων αυξήθηκε σημαντικά μετά από 34 ns timestep σε μεταλλαγμένη δομή (Εικ. 2). Ιδιαίτερα στην περιοχή υπόλειμμα 80 έως 105, η οποία διακρίνεται μόδα διαμορφωτικών παρασυρόμενα από άλφα έλικα να λυγίσει και μορφή σπείρας παρατηρήθηκαν στο μεταλλαγμένο δομή (Εικ. 2), και φαίνεται στο Σχ. 4. Όλα τα αποτελέσματα ήταν στενά αντιστοιχία με τις αποκλίσεις RMSD (Εικ. Εικ. 2, 3, Σχ. 4). Έχουμε επίσης έδειξαν τα επάλληλα δομές για φυσική και μεταλλαγμένη στην αρχή της προσομοίωσης και για συγκεκριμένα βήματα χρόνου, όπου ο διαμορφωτικός παρασύρει εμφανίστηκε σε υψηλότερη κλίμακα (Εικ. 2). Φάνηκε σαν η ταχεία παρασύρεται είχε επίσης προκαλέσει ορισμένες μεταβάσεις τομέα και διαμορφωτικές αλλαγές στο μεταλλαγμένο δομή, ειδικά στην τερματική περιοχή C της περιοχής ΡΗ, σε σύγκριση με μητρική.

Εικόνα εμφανίζεται στο πάνω μέρος αντιπροσωπεύει μητρική και μεταλλαγμένα οικόπεδο dSsp. Στη μέση, οι επάλληλων φυσικού και μεταλλαγμένου δομές που παρουσιάζονται. Εδώ η φυσική εμφανίζεται με πράσινο χρώμα και μεταλλαγμένα με κόκκινο χρώμα. Στο κάτω μέρος, η πλοκή RMSD εμφανίζεται. Native εμφανίζεται σε μαύρο και μεταλλαγμένα με κόκκινο χρώμα.

Η

Native εμφανίζεται σε μαύρο και μεταλλαγμένα με κόκκινο χρώμα.

Η

Εδώ η μητρική εμφανίζεται με πράσινο χρώμα και μεταλλαγμένα με κόκκινο χρώμα.

η

με στόχο να διαπιστωθεί κατά πόσον η μετάλλαξη επηρεάσει τη δυναμική συμπεριφορά των υπολειμμάτων και να εξετάσει την αιτία της εν λόγω διαμορφωτική παρασύρει παρατηρείται σε RMSD και dSsp αποτελέσματα, υπολογίστηκαν οι τιμές RMSF των ιθαγενών και των μεταλλαγμένων υπολειμμάτων ραχοκοκαλιά ( Σχ. 5). τιμές RMSF των μεταλλαγμένων υπολειμμάτων βρέθηκαν να είναι σημαντικά υψηλότερα σε μεταλλαγμένη δομή σε σύγκριση με τη φυσική (Εικ. 5). Αυτό έδειξε ότι η παρατηρούμενη παρασύρεται συνοδεύτηκε από αύξηση της ατομικής διακυμάνσεις στο μεταλλαγμένο δομή. Η ακτίνα περιστροφής (Rg) ορίζεται ως η ρίζα μάζα-βάρος μέση τετραγωνική απόσταση συλλογή ατόμων από το κοινό κέντρο μάζας. Ως εκ τούτου, δίνει μια εικόνα για τη συνολική διάσταση της πρωτεΐνης και έχει βοηθήσει στην εξέταση της έννοιας της ταχείας διαμορφωτική παρασύρει παρατηρείται στο μεταλλαγμένο δομή. Ακτίνα οικόπεδο περιστροφής για Ca άτομα πρωτεΐνης έναντι χρόνου στο 300 Κ φαίνεται στο Σχ. 6. Οι διακυμάνσεις Rg στο μεταλλαγμένο δομή ήταν πολύ παρόμοια με τα παραπάνω παρατηρούμενες αλλαγές RMSD. Μετά 13137 ps παρατηρήθηκαν μια απότομη αύξηση στις τιμές Rg στο μεταλλαγμένο δομή, φθάνοντας μέχρι το υψηλότερο επίπεδο των 4,1 nm, ενώ η αξία Rg της φυσικής δομής παρέμεινε στο 1,5 nm. Επιπλέον, σε 35 931 ps έφτασε μέχρι τη μέγιστη τιμή των 5,62 στο μεταλλαγμένο. Στο τέλος της προσομοίωσης, η μεταλλαγμένη δομή έδειξε Rg αξία των 4,16, ενώ στη μητρική βρέθηκε να είναι 1.42.

Native εμφανίζεται σε μαύρο και μεταλλαγμένα με κόκκινο χρώμα.

Η

( α) Πλήρης διακυμάνσεις Rg. (Β) περιορίζεται στο μέγιστο ανώτατο όριο Rg των 6 nm. Native εμφανίζεται σε μαύρο και μεταλλαγμένα με κόκκινο χρώμα.

Η

Διαλύτης προσβασιμότητα των λογαριασμών επιφάνεια για την περιοχή bimolecular επιφάνειας εκτιμητέο σε μόρια διαλύτη. Άνοδος στην τιμή SASA στο μεταλλαγμένο δομή δηλώνει ότι είναι συγγενής επέκταση σε σύγκριση με μητρική. Η αλλαγή του SASA της φυσικής και της μεταλλαγμένης πρωτεΐνης με το χρόνο φαίνεται στο Σχ. 7. Mutant πρωτεΐνη έδειξαν μεγαλύτερη αξία SASA με το χρόνο, ενώ η μητρική παρουσίασαν χαμηλότερη τιμή SASA. Μεγαλύτερη διακύμανση σε οικόπεδο Rg έδειξαν ότι η μεταλλαγμένη πρωτεΐνη, καθώς και η περιοχή πρόσδεσης ΑΤΡ θα μπορούσαν να υποστούν σημαντικές δομικές μετάβασης. Αυτό υποστηρίζεται περαιτέρω από SASA αποτέλεσμα όπου η μεταλλαγμένη βρέθηκε να παρουσιάζουν μεγάλες SASA σε σύγκριση με εγγενή. Όλα αυτά παρατήρηση συλλογικά πρότεινε ότι η μετάλλαξη μπορεί να έχουν υποστεί παρασύρεται η οποία τελικά οδήγησε στην μετάβασή της σε μια ανοικτή διαμόρφωση και θα μπορούσε να συμβεί λόγω των ζημιών σταθερότητα στη δομή της πρωτεΐνης. Έτσι, για να διευκρινίσει αν η μετάλλαξη είχε προκαλέσει οποιαδήποτε ζημιά στη δομική σταθερότητα της πρωτεΐνης κατά τη διάρκεια της διαδικασίας παρασύρεται, ερευνήσαμε την συνολική ενεργειακή διακύμανση σε όλη την προσομοίωση. Τα αποτελέσματα έδειξαν πολύ μικρή αύξηση στην συνολική ενεργειακή αξία στο μεταλλαγμένο δομή, η οποία απέκλεισε την έννοια των ζημιών σταθερότητα που προκαλείται από μετάλλαξη (Εικ. 8).

Native εμφανίζεται σε μαύρο και μεταλλαγμένα με κόκκινο χρώμα.

Native παρουσιάζεται σε μαύρο και μεταλλαγμένο με κόκκινο χρώμα.

η

δεσμού υδρογόνου είναι ο κύριος παράγοντας για τη διατήρηση της φυσικής διαμόρφωσης της πρωτεΐνης και της ευελιξίας πρωτεΐνη είναι ευθέως ανάλογη προς ενδομοριακή NHbonds μεταξύ των υπολειμμάτων αμινοξέων [38] – [40]. Η ενδομοριακή ανάλυση NHbond της φυσικής και μεταλλαγμένες πρωτεΐνες έγιναν σε σχέση με το χρόνο, προκειμένου να κατανοηθεί η σχέση μεταξύ της ευελιξίας και σχηματισμό δεσμού υδρογόνου. Μεταλλαγμένα δομή έδειξαν σημαντικά μικρότερο αριθμό σχηματισμού NHbond κατά τη διάρκεια της προσομοίωσης, σε σύγκριση με την φυσική δομή (Εικ. 9). Αυτή η παρατήρηση ήταν αντιστοιχία προς την αύξηση του Rg και SASA τιμές στο μεταλλαγμένο και υποδηλώνουν έντονα ότι οι παρατηρούμενες διαμορφωτική παρασύρει και αύξηση της ατομικής διακυμάνσεις μπορεί να έχουν προκαλέσει, λόγω της απώλειας του σχηματισμού NHbond σε πρωτεΐνη. Επιπλέον, τα υπολείμματα αμινοξέων Κ30, Κ32, W36, R38, R40, Q53, R56, K57 και V58 είχε δειχθεί ότι είναι δραστικά συστατικά σε εντοπισμό τους να μεμβράνης [41]. Έτσι υπολογίζεται ο αριθμός των NHbond σχηματισμού από αυτά τα κατάλοιπα να μελετηθεί η επίδραση της μετάλλαξης επί εντοπισμού μεμβράνης. Αν και ο συνολικός αριθμός των NHbonds σχηματίζεται στην μεταλλαγμένη δομή ήταν σημαντικά χαμηλότερη σε σύγκριση με τη φυσική, ο συνολικός αριθμός των NHbonds σχηματίζονται σε αυτά τα υπολείμματα δεν πάσχουν από οποιεσδήποτε σημαντικές απώλειες που επιβάλλονται από μετάλλαξη. Απώλεια στην σχηματισμός NHbond παρατηρήθηκε σε κατάλοιπα Κ30 και Q53, ενώ άλλα υπολείμματα έχει είτε έδειξε μεγαλύτερο αριθμό NHbonds ή διατηρείται η φυσική καταμέτρηση των NHbonds όλη την προσομοίωση στο μεταλλαγμένο δομή (Εικ. 10). Αυτά τα αποτελέσματα ήταν επίσης σε ισχυρό συμφωνία με την παρατήρηση αναφέρεται από Carpten et al., (2007) [1], όπου φάνηκε ότι η μετάλλαξη είχε προκαλέσει σημαντική αύξηση του δυναμικού της μεμβράνης εντοπισμός της πρωτεΐνης. Η αύξηση στο σχηματισμό NHbond σε αυτά τα υπολείμματα θα μπορούσαν να είναι ένας ισχυρός παράγοντας στην εξήγηση της αύξησης του δυναμικού εντοπισμό μεμβράνης της μεταλλαγμένης πρωτεΐνης.

Native εμφανίζεται σε μαύρο και μεταλλαγμένα με κόκκινο χρώμα.

Η

(α) Κ30 (β) K32 (γ) W36 (δ) R38 (ε) R40 (στ) Q53 (ζ) R56 (h) K57 (i) V58. Native παρουσιάζεται σε μαύρο και μεταλλαγμένο με κόκκινο χρώμα.

Η

Η σημασία της αλληλεπίδρασης κατιόντος π είχαν εξετασθεί σε αρκετές έρευνες για αντίστοιχες ρόλο τους στη διατήρηση της σταθερότητας των πρωτεϊνών. Ερευνήσαμε συνολικά 3 ενεργειακά σημαντικών κατιόντων π αλληλεπιδράσεις περιλαμβανομένων Arg86-Phe55 (Εικ. 11a), Lys8-Trp99 (Σχ. 11β) και Arg69-Trp22 στον τομέα ΑΚΤ1 ΡΗ (Σχ. 11γ). Να εξετάσει αν οι κατιόντων-π αλληλεπιδράσεις διατηρείται στο μεταλλαγμένο δομή, ερευνήσαμε περαιτέρω τις διακυμάνσεις μήκος ομολόγων για αυτές τις μακρινές αλληλεπίδραση κατιόντος-π. Ήταν αξιοσημείωτη παρατήρηση ότι διατηρήθηκαν τα κατιόντα π αλληλεπιδράσεις στη μητρική όσο και μεταλλάκτη. Επιπλέον, η αλληλεπίδραση Arg69-Trp22 έδειξε σαφές σχέδιο διακύμανσης και μπορεί να παίζει σημαντικό ρόλο στην πρόκληση διαμορφωτική drift (Σχ. 11γ). Με συλλογικά μελετήσει όλες τις δομικές και μοριακές αλλαγές στον τομέα PH ΑΚΤ1 θα μπορούσαμε να πούμε ότι η παρατηρούμενη διαμορφωτική παρασύρεται, αυξάνεται σε ατομικό διακυμάνσεις και την απώλεια του συνόλου NHbonds στο μεταλλαγμένο δομή συνέβαλε σημαντικά στην πρόκληση που παρατηρήθηκαν παθολογικές συνέπειες που επιβάλλονται από μετάλλαξη E17K. Επιπλέον, η άνοδος 4 φορές σε δυναμικό εντοπισμό της μεμβράνης θα μπορούσε να προκληθεί από την αύξηση στα NHbonds σε ενεργά κατάλοιπα εντοπισμός του χώρου ΡΗ. Αυτές οι παρατηρήσεις μας οδήγησαν στο συμπέρασμα ότι ο καρκίνος σχετίζεται φαινότυπος που παρατηρείται στην περίπτωση ΑΚΤ1 PH μετάλλαξης E17K τομέα προκαλείται από τις αναφερθείσες μοριακές και διαμορφωτικές αλλαγές οι οποίες προκαλούν επίσης αντίσταση στην ΑΚΤ1 /2 αναστολέα VIII με επαγωγή σχήμα παρασύρεται σε αντίστοιχες θύλακα σύνδεσης του .

(α) Arg86-Phe55 (β) Lys8-Trp99 (γ) Arg69-Trp22. Native εμφανίζεται σε μαύρο και μεταλλαγμένα με κόκκινο χρώμα.

Η

Συμπέρασμα

αμινοξέων παραλλαγές συνήθως προκαλεί παθολογικές εκβάσεις καταστρέφοντας τη φυσική διαμόρφωση της πρωτεΐνης. Η μετάλλαξη E17K στον τομέα PH ΑΚΤ1 είχε αναφερθεί ότι προκαλούν καρκίνο και αντοχή σε ΑΚΤ1 /2 αναστολέα VIII. Να εξετάσει το λεπτομερές μοριακό μηχανισμό πίσω από αυτό το αποτέλεσμα, πραγματοποιήσαμε σύνδεσης και μοριακής δυναμικής προσομοίωσης μοριακής των ιθαγενών και των μεταλλαγμένων δομή. Οι αλληλεπιδράσεις της σταθερότητας και σημαντικό αμινοξύ διατηρήθηκαν στο μεταλλαγμένο δομή, η οποία απέκλεισε την πιθανότητα βλαπτική επίδραση της μετάλλαξης. Επιπλέον, μια απότομη αύξηση στις τιμές RMSD και διαμορφωτική παρασύρει παρατηρήθηκαν σε μεταλλαγμένα sructure. Επιπλέον, η αντίσταση σε ΑΚΤ1 δύναμη /2 αναστολέα VIII είχε προκληθεί από τις αλλαγές στη διαμορφωτική δομή του θύλακα σύνδεσης. Εν κατακλείδι, το συνολικό αποτέλεσμα exaplained ότι η μοριακή αιτία της 4 φορές αύξηση στην μεταλλαγμένη εντοπισμό πρωτεΐνης και ενεργότητας της κινάσης, η οποία έχει προκαλέσει τελικά καρκίνο που σχετίζεται φαινοτύπους.

Ευχαριστίες

Με ιδιαίτερη χαρά ανακοινώνουμε τη διαχείριση της Vellore Institute του Πανεπιστημίου Τεχνολογίας και καθηγητής Riccardo Zecchina από HuGeF-Τορίνο για την παροχή των εγκαταστάσεων για να πραγματοποιήσει αυτό το έργο.