Αφηρημένο

Αυτή η μελέτη διεξήχθη για να εκτιμηθεί η προγνωστική σημασία της γονιδιωματικής ανωμαλιών σε χρωμόσωμα 4ιζ σε ασθενείς με NSCLC. Έχουμε εντοπίσει προηγουμένως αριθμού αντιγράφων αλλαγές στο 4q12-q32 να σχετίζονται σημαντικά με την πρώιμη αιματογενή διάδοση μη μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα (NSCLC), και τώρα στοχεύουν να περιορίσουν τα εν δυνάμει θερμά σημεία εντός αυτού 107 Mb εκτείνονται περιοχή. Χρησιμοποιώντας οκτώ δείκτες μικροδορυφόρων στη θέση 4q12-35, αλληλομόρφων ανισορροπία (AI) αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν σε μια προκαταρκτική μελέτη κοόρτης (

n =

86). Θέσεις δεικτών κλινικοπαθολογοανατομικών και προγνωστικές ενώσεις AI αναλύσεις περαιτέρω επικυρωθεί σε μια μεγαλύτερη ομάδα μελέτης με τη χρήση φθορισμού

in situ

υβριδισμού (FISH) σε 209 ασθενείς με NSCLC. Απώλειες στις θέσεις 4q21.23 και 4q22.1 έχουν αποδειχθεί ότι σχετίζονται με προηγμένη κλινικοπαθολογοανατομικές χαρακτηριστικά, καθώς και με κοντή νόσο δωρεάν (DFS) και τη συνολική επιβίωση (OS) (DFS:

P =

0.019? OS:

P =

0,002). αναλύσεις πολυμεταβλητή προσδιόρισε τις απώλειες 4q21.23-22.1 να αποτελεί ανεξάρτητο προγνωστικό δείκτη τόσο για DFS και OS σε NSCLC (HR 1,64 με 2,20, όλα τα

P & lt?

0,04), και ιδιαίτερα σε καρκίνο εκ πλακωδών κυττάρων του πνεύμονα (

P & lt?

0.05). Μια μελέτη έκθεση περίπτωση ενός ασθενούς με καρκίνο του πνεύμονα αποκάλυψε περαιτέρω απώλεια 4q21.23 σε διαδίδονται καρκινικά κύτταρα (DTC). Ούτε κέρδη στις τελευταίες θέσεις, ούτε γονιδιωματική εκτροπές στο 4q12, 4q31.2 και 4q35.1, έδειξε μια προγνωστική σημασία. Συμπερασματικά, τα δεδομένα μας δείχνουν ότι η απώλεια σε 4q21.23-22.1 σε NSCLC είναι προγνωστικής σημασίας σε ασθενείς με NSCLC και ως εκ τούτου, περιλαμβάνει πιθανών νέων ογκοκατασταλτικών γονιδίων με κλινική σημασία

Παράθεση:. Ουζούνογλου FG, Dethlefsen Ε, Hanssen Α, Wrage M, L Deutsch, Harms-Effenberger K, et al. (2014) Απώλεια 4q21.23-22.1 Είναι ένας προγνωστικός δείκτης για την ελεύθερη νόσου και τη συνολική επιβίωση σε μη μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα. PLoS ONE 9 (12): e113315. doi: 10.1371 /journal.pone.0113315

Επιμέλεια: Sai Yendamuri, Roswell Park Cancer Institute, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 24 Μαρτίου 2014? Αποδεκτές: 26 Οκτ 2014? Δημοσιεύθηκε: 11η Δεκεμβρίου 2014

Copyright: © 2014 Ουζούνογλου et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Δεδομένα Διαθεσιμότητα:. Η συγγραφείς επιβεβαιώνουν ότι όλα τα δεδομένα που διέπουν τα ευρήματα είναι πλήρως διαθέσιμα χωρίς περιορισμούς. Όλα τα σχετικά δεδομένα είναι εντός του Υποστηρίζοντας αρχεία πληροφοριών του χαρτιού και

Χρηματοδότηση:. Η εργασία αυτή υποστηρίχθηκε από το Hamburger Krebsgesellschaft e.V., Αμβούργο, Γερμανία. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Genomic αστάθεια είναι ένα από τα βασικά χαρακτηριστικά του καρκίνου [1]. Πολυάριθμες μελέτες σε γενωμική αστάθεια σε μη μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα (NSCLC) ανέδειξαν συγκεκριμένα μοτίβα διαγραφή και για τις δύο μεταστατικών και πρωτογενείς όγκους [2] – [4]. Αντιγραφή αριθμού εκτροπών σε NSCLC μπορεί να βρεθεί σε πολλαπλές περιοχές, μερικοί είναι ειδικό για την ιστολογική υπότυπο, και μερικά εξαρτάται από την σοβαρότητα της ιστοπαθολογικών μεταβολών (π.χ. το στάδιο του όγκου ή τη διαβάθμιση) [5] – [11] Επιπλέον, η εμφάνιση του αντιγράφου αριθμός αλλαγών, έχει αποδειχθεί ότι είναι ένα πρώιμο γεγονός στην παθογένεση του καρκίνου του πνεύμονα. Αυτό μπορεί να βρεθεί σε συνδυασμό με ένα διαδοχικό μοτίβο της απώλειας της ετεροζυγωτίας (ΑΕ), η οποία αρχίζει με την απώλεια αλληλική στο χρωμόσωμα 8p, ακολουθούμενη από 3ρ και 9p διαγραφές [7], [12], [13].

Έχουμε προηγουμένως δείξει ότι η πρώιμη αιματογενή διάδοση των καρκινικών κυττάρων οδηγείται από ένα συγκεκριμένο μοτίβο γονιδιωματικών μεταβολών. Εκτός από αυτό το πρότυπο, μία μεγάλη διαγραφή του χρωμοσώματος 4q12-q32 (& gt? 107 ΜΒΡ) υποδεικνύει μια ισχυρή συσχέτιση με την παρουσία του διαδίδονται καρκινικών κυττάρων (DTC) στο μυελό των οστών, καθώς και εγκεφαλικές μεταστάσεις των ασθενών με καρκίνο του πνεύμονα [14] . Ωστόσο, η προγνωστική σημασία αυτής της περιοχής δεν έχει ακόμη ερευνηθεί. Ο σκοπός αυτής της μελέτης ήταν να περιορίσετε τις σχετικές περιοχές hotspot και να διερευνήσει προγνωστική επιπτώσεις τους στον NSCLC. Επιπλέον, επιδιώξαμε να αναλύσει αν η απώλεια αυτή θα μπορούσε επίσης να ανιχνευθεί σε κωδικούς DTC του ασθενούς NSCLC.

Για το σκοπό αυτό, πραγματοποιήσαμε την πρώτη ανισορροπία αλληλομόρφων (AI /ΑΕ) αναλύει σε μια προκαταρκτική ομάδα μελέτης (

n =

86). Για περαιτέρω επαλήθευση, μια φθορισμού

in situ

υβριδισμός (FISH) ανάλυση των 209 ασθενών με NSCLC εκτελέστηκε. Μια απώλεια μέσα σε λιγότερο από 4 MB-που εκτείνονται σε περιοχή στο 4q21.23-4q22.1 ταυτοποιήθηκε ως ένα σημαντικό αρνητικό προγνωστικό δείκτη για την ελεύθερη νόσου, καθώς και τη συνολική επιβίωση σε NSCLC. Επιπλέον, πραγματοποιήσαμε διαδοχικές ανοσοφθορισμού (IF) και FISH αναλύσεις για την ΚΒΔΕ ενός ενιαίου NSCLC ασθενή, που δείχνει μια απώλεια της 4q21.23 στον πρωτογενή όγκο. Η ίδια η απώλεια θα μπορούσε επίσης να ανιχνευθεί στην κωδικοί DTC.

Υλικά και Μέθοδοι

Δείγματα

Αυτή η μελέτη εγκρίθηκε από την επιτροπή δεοντολογίας του θαλάμου των γιατρών, Αμβούργο, Γερμανία . Γραπτή συγκατάθεση λήφθηκε από όλους τους ασθενείς. Όλα κλινική έρευνα έχει διεξαχθεί σύμφωνα με τις αρχές που διατυπώνονται στη Διακήρυξη του Ελσίνκι. Όλα τα δείγματα όγκων ελήφθησαν κατά τη διάρκεια χειρουργικής εκτομές στο Πανεπιστημιακό Ιατρικό Κέντρο Hamburg-Eppendorf ή συνδέεται χειρουργικά τμήματα. Κλινικοπαθολογοανατομικές δεδομένα προήλθαν από μια προοπτική βάση δεδομένων και τα δεδομένα παρακολούθησης ελήφθησαν από συνεντεύξεις με το γενικό γιατρό ή τον ασθενή στο τμήμα εξωτερικών ασθενών.

Για το αλληλομόρφων ανισορροπία (AI) αναλύει σε 4Q, 86 χειρουργικά αντιμετωπίζεται ασθενείς με πρωτοπαθή NSCLC με τις διαθέσιμες συμφωνημένα καρκινώματος και υγιή γονιδιακού DNA αξιολογήθηκαν για την ένταξη. Η μέση ηλικία του ομάδα μελέτης ήταν 65,9 χρόνια, με κυρίαρχο αρσενικό ποσοστό (65,1% έναντι 34,9%). Όσον αφορά τους τύπους των κυττάρων του καρκίνου του πνεύμονα, 37 ασθενείς (43,0%) είχε ένα καρκίνωμα πλακωδών κυττάρων (δρΟΟ) και 49 (57,0%) ενός αδενοκαρκινώματος (AC). Ο μέσος χρόνος παρακολούθησης ήταν 21,4 μήνες (2-60). Περισσότερες λεπτομέρειες δίνονται στον Πίνακα S1.

Για τον αριθμό αντιγράφων του DNA εκτροπές (FISH) σε 4Q, μια μικροσυστοιχία ιστού (TMA), που αποτελείται από 209 ασθενείς αξιολογήθηκαν πρωτοπαθή καρκίνο του πνεύμονα, χρησιμοποιήθηκε, με μέση ηλικία 62,3 χρόνου κατά το χρόνο της χειρουργικής επέμβασης. κατανομές των δύο φύλων ήταν συγκρίσιμη με την ομάδα μελέτης AI, με παρόμοια υπεροχή των αρρένων ασθενών (68,4%). Η ομάδα μελέτης FISH περικλείονται 88 (42,1%) ασθενείς με SqCCs, 78 (37,1%) με ACS, 34 (16,3%) με καρκίνωμα μεγάλου κυττάρου του πνεύμονα, και εννέα ασθενείς (4,5%) με καρκίνο του πνεύμονα νευροενδοκρινική. Το διάμεσο χρόνο παρακολούθησης ήταν 24,7 μήνες (2,5 έως 60). Περισσότερες λεπτομέρειες δίνονται στον Πίνακα S1.

Όλοι οι ασθενείς αναταξινομήθηκαν σύμφωνα με την έβδομη έκδοση της ταξινόμησης ΤΝΜ των κακοήθων όγκων [15]. Όσον αφορά τη χορήγηση της επικουρικής θεραπείας, τα ακόλουθα συγκεκριμένα κριτήρια εφαρμόστηκαν από το 2004: ≥ ασθενείς σταδίου ΙΙ λάβει επικουρική χημειοθεραπεία με σισπλατίνη και Vinorelbin. Σταδιακή ασθενείς Ib αξιολογήθηκαν για επικουρική θεραπεία εάν ο όγκος ήταν & gt? 4 cm ή σε ασθενείς με εισβολή σε φλέβα (V +) ή εισβολή εντός του λεμφικού αγγείου (L +). Επικουρική χημειοθεραπεία που ακολουθείται από την ακτινοβολία (50-60 Gy) συζητήθηκε για ≥ Stage III. Τα χαρακτηριστικά των ασθενών και για τις δύο ομάδες μελέτης φαίνονται στον Πίνακα S1.

DNA απομόνωση

Το γονιδιακό DNA της ταιριάζει καρκινώματος (νωπά-κατεψυγμένα) και παθολογικά-επαληθεύεται μη κακοήθη ιστό πνεύμονα ή λευκοκύτταρα περιφερικού αίματος, που ελήφθησαν πριν από τη χειρουργική επέμβαση εκχυλίστηκε και καθαρίστηκε σύμφωνα με το πρωτόκολλο του κατασκευαστή χρησιμοποιώντας το κιτ ιστού QIAamp (Qiagen, Hilden, Γερμανία) ή InnuPREP DNA Microkit (AnalytikJena, Jena, Germany). Εάν είναι απαραίτητο, οδηγίες μικροανατομή διεξήχθη, για να ληφθεί ένα περιεχόμενο κυττάρου όγκου τουλάχιστον 70%. συγκέντρωση του DNA προσδιορίστηκε με NanoDrop ND-1000 φασματοφωτόμετρο (Wilmington, DE) και τα δείγματα αραιώθηκαν σε 10 ng /μl και αποθηκεύεται στους -20 ° C μέχρι τη χρήση.

Τα αλληλόμορφα ανάλυση ανισορροπίας

Based σε προηγούμενη μελέτη μας, τέσσερις περιοχές hotspot εκπροσωπούνται σε θέσεις 4q12, 4q21.23, 4q31.2 και 4q35.1 επιλέχθηκαν για περαιτέρω ανάλυση [14]. Για κάθε περιφέρεια, δύο δείκτες χρησιμοποιήθηκαν για να εκτιμηθεί η συχνότητα και η κλινική σημασία της γρίπης των πτηνών (βλέπε Πίνακα S2, για τις λεπτομέρειες όλων των μικροδορυφόρων δείκτες). Επίθεση εκκινητές σημάνθηκαν με μια φθορίζουσα χρωστική (6-ΡΑΜ) για την επακόλουθη τριχοειδή ηλεκτροφόρηση. PCRs διεξήχθησαν σε 10 μΐ μίγματος αντίδρασης που αποτελείται από 10 ng εκμαγείου DNA, 2,5 mM τριφωσφορικού δεοξυριβονουκλεοτιδίου μίγμα (Invitrogen, Darmstadt, Γερμανία), 2,5 pmol με νόημα και αντινόημα εναρκτήρα (MWG, Ebersberg, Γερμανία), 0.25 U AmpliTaq Gold πολυμεράσης ( Applied Biosystems) και 5 μΐ ύδατος άνευ νουκλεάσης. Οι συνθήκες PCR αποτελούνταν από επαναλαμβανόμενους κύκλους στους 95 ° C, 60 ° C-62 ° C και 72 ° C για 30 s. Για τον προσδιορισμό AI, τριχοειδή ηλεκτροφόρηση με ΑΒΙ Prism 3130 Genetic Analyzer (Applied Biosystems, Freiburg, Γερμανία), χρησιμοποιώντας ένα μίγμα 40 ml φορμαμιδίου (Hi-Di), 0,2 μl Genescan-500-ROX πρότυπο καθώς και 0,1 μΙ PCR προϊόντος και μετουσίωση στους 94 ° C για 2 λεπτά και διεξήχθη εκτιμήθηκε το μήκος των θραυσμάτων αλληλόμορφου και την ένταση φθορισμού. Τα αλληλόμορφα ορίστηκαν ως οι δύο ψηλότερες κορυφές εντός του αναμενόμενου εύρους μεγέθους και αναλογία ≥1.5 μεταξύ των υψών των κορυφών του όγκου και φυσιολογικό αλληλόμορφα βαθμολογήθηκαν ως AI. Για τη συνολική διασφάλιση της ποιότητας, το 10% των χρησιμοποιημένων δειγμάτων χρησιμοποιήθηκαν τυχαία για επαναλαμβανόμενες αναλύσεις. Η συμφωνία της κατάστασης αλληλομόρφων ήταν & gt?. 99%

φθορισμού

in situ

υβριδισμός (FISH) ανάλυση

Ανάλυση αντιγραφής του DNA απώλεια αριθμό των δύο περιοχών hot-spot με βάση το AI αναλύσεις αξιολογήθηκε σε ένα μεγαλύτερο πληθυσμό της μελέτης με φθορισμό

in situ

υβριδισμός (FISH). Τρεις διαφορετικοί ανιχνευτές BAC στόχο την περιφερειών 2 (RP11-570L13: 4q21.23 και RP11-1053C2: 4q22.1) και 3 (RP11-634D8: 4q31.2) υβριδίστηκαν σε TMA. Οι χρησιμοποιούνται ανιχνευτές BAC ελήφθησαν από την Πηγή BioScience LifeSciences (Nottingham, UK). Ένα μg κάθε ανιχνευτή BAC σημάνθηκε με τυχαία πριμοδότηση (BioPrime Labeling System, Invitrogen) με σημασμένο με φθορισμό dUTPs (RP11-570L13 και RP11-634D8: Φάσμα Πορτοκαλί, RP11-1053C2: Φάσμα Πράσινη? Enzo Επιστήμες της Ζωής, Abbott). Ως σημείο αναφοράς, ένας ανιχνευτής κεντρομεριδίου (CEP 10, SpectrumAqua) χρησιμοποιήθηκε (Enzo Life Sciences, Abbott). Προκειμένου να ελεγχθεί η εξειδίκευση και η ποιότητα των φθορισμό σημασμένο με ανιχνευτές BAC, το ψάρι δοκιμάστηκε για πρώτη φορά σε μετάφαση spreads χρωμόσωμα. Στη συνέχεια, τα πρωτόκολλα για τα παραφίνης πλάκες που καθορίζονται για κάθε ανιχνευτή BAC ξεχωριστά. Πρώτον, τα πλακίδια επωάστηκαν στους 60 ° C για μία ώρα πριν από την αποπαραφινοποιήθηκαν σε ξυλόλιο και ενυδατώθηκαν σε μια σειρά αιθανόλης. Η στερέωση επιτυγχάνεται τοποθετώντας τα πλακίδια σε διάλυμα 2% φορμαλδεΰδης και μεθανόλης στους -20 ° C, που ακολουθείται από ξέπλυμα τους σε φωσφορικό ρυθμιστικό αλατούχο διάλυμα (1χ PBS) και προ-κατεργασία τους με ένα διάλυμα προ-επεξεργασίας (Invitrogen) στους 90 ° C για 10 λεπτά. Μετά PBS πλύση, τα πλακίδια υποβλήθηκαν σε επεξεργασία με ένα προθερμασμένο ένζυμο αντιδραστήριο (Invitrogen) στους 37 ° C για 10 λεπτά. Και πάλι, πλύθηκαν σε PBS και στη συνέχεια αφυδατώνονται σε μια σειρά αιθανόλης. Τέλος, τα πλακίδια μετουσιώθηκαν στους 85 ° C για 5 λεπτά, προτού επωάστηκαν με τα μείγματα υβριδισμού διερευνητή στους 37 ° C όλη τη νύκτα. πλύση μετα-υβριδισμού πραγματοποιήθηκε στη συνέχεια σε 2 χ SSC, 0,3% ΝΡ-40 ρυθμιστικό σε 70 ° C και θερμοκρασία δωματίου, που ακολουθείται από μια δεύτερη ενυδάτωση σε μια σειρά αιθανόλης. διάλυμα DAPI εφαρμόστηκε για την ανίχνευση του μορφολογικά ανέπαφο μη επικαλυπτόμενα κύτταρα όγκου. Κατά μέσο όρο, φθορίζοντα σήματα από 32 κύτταρα του όγκου για κάθε ανιχνευτή μετρήθηκαν (εύρος 11-57). Προκειμένου να αξιολογηθεί το πειραματικό σφάλμα, καθώς και για να καθοριστούν οι αποκοπές του λόγου σήματος-προς-κεντρομεριδίου, μετρήθηκαν τα σήματα υβριδοποίησης των 10 φυσιολογικά δείγματα ελέγχου (επίσης βρίσκεται στην ΤΜΑ). Αντίστοιχα, ο λόγος & gt? 1.5 ορίστηκε ως ένα κύτταρο που φέρει ένα DNA-κέρδος, ενώ ένα ποσοστό & lt? 0,75 ορίστηκε ως απώλεια

Διαδοχική χρώση ανοσοφθορισμού και FISH ανάλυση

Για το. απομόνωση του DTC, μονοπύρηνα κύτταρα από αναρροφήματα μυελού των οστών των ασθενών με NSCLC απομονώθηκαν με φυγοκέντρηση βαθμίδωσης FICOLL. Τα κύτταρα στη συνέχεια φυγοκεντρήθηκαν CYTO-πάνω σε γυάλινες πλάκες. Για την ανίχνευση του DTC, μια χρώση ανοσοκυτταροχημεία εκτελέστηκε σύμφωνα με την μέθοδο ΑΡΑΑΡ (αλκαλική φωσφατάση αντι αλκαλική φωσφατάση), χρησιμοποιώντας ένα αντίσωμα έναντι κυτοκερατίνες (A45-B /Β3, Micromet, Martinsried, Γερμανία) [16]. Ένα, το μονοκλωνικό αντίσωμα ισότυπο ποντικού (MOPC 21, IgG1? Sigma- Aldrich) χρησίμευσε ως αρνητικός έλεγχος. DTC θετικούς ασθενείς χρησιμοποιήθηκαν για την ανάλυση της απώλειας 4q22.1 με ανάλυση FISH. FISH έγινε σε καρκινικά κύτταρα που ανιχνεύθηκαν προηγουμένως από ΕΑΝ χρώση με Cy3 σημασμένο αντι-κυτοκερατίνης αντισώματος (Α45-Cy3? Micromet). Για τη στερέωση των κυττάρων, χρησιμοποιήθηκε διάλυμα Β (Micromet). Μετά από ένα στάδιο πλύσης PBS, μη ειδική θέσεις σύνδεσης αποκλείστηκαν με 10% ΑΒ ορού (Biotest AG, Dreieich, Γερμανία). Μια άλλη πλύση PBS ακολουθήθηκε από 45 min αγωγή με αντίσωμα Α54-Cy3 (1:300). Τα κύτταρα και πάλι πλένονται και DAPI (CellSearch) εφαρμόστηκε για την πυρηνική χρώση. Οι κωδικοί DTC είχαν επισημανθεί σε έναν αυτοματοποιημένο τρόπο (Ariol σάρωσης, Leica Biosystems, Nussloch, Γερμανία) και εντοπίζεται με την Αγγλία Finder για την εκ νέου ταυτοποίηση. Για διαδοχικές ανάλυση FISH, τα κύτταρα πλύθηκαν με PBS και επωάστηκαν για 7 λεπτά σε ένα προθερμασμένο πρωτεϊνάση Κ (0,1 μg /ml) διάλυμα (20 mM Tris-HCl ρΗ 7,5, 0,2% ad CaCl2xH2O 50 ml απεσταγμένο νερό.). Στη συνέχεια, τα κύτταρα αφυδατώνονται σε μια σειρά αιθανόλης και μετουσιωμένη για 5 λεπτά στους 75 ° C (70% φορμαμίδιο, 0.6 χ SSC, ρΗ 7,4). Τα κύτταρα και πάλι τα αφυδατωμένα και μίγματα υβριδισμού ανιχνευτή μετουσιώθηκαν για 5 λεπτά στους 75 ° C. Ο υβριδισμός διεξήχθη όλη τη νύχτα στους 37 ° C. πλύση μετα-υβριδισμού έγινε σε 50% φορμαμίδη /2Χ SSC, σε 2Χ SSC και σε 0,1 χ SSC στους 45 ° C. Μετά την εφαρμογή DAPI, οι κωδικοί DTC μεταφέρθηκαν και μετρήθηκαν σήματα φθορισμού των κεντρομερίδιο 3 και RP11-1053C2 ανιχνευτές. Μια αναλογία & lt? 0,75 ορίστηκε ως απώλεια

Στατιστική ανάλυση

Για τη στατιστική ανάλυση, SPSS 21.0 για MAC (SPSS Inc., Chicago, IL) χρησιμοποιήθηκε

.. Συσχέτιση μεταξύ του αριθμού AI /αντιγραφή αλλαγές και κλινικοπαθολογοανατομικές παράμετροι αξιολογήθηκαν από την chi-square test. Η συνολική επιβίωση (OS) υπολογίστηκε ως το χρονικό διάστημα από την ημερομηνία της επέμβασης είτε την ημερομηνία του θανάτου ή από την τελευταία παρακολούθηση, όποιο από τα δύο συμβεί πρώτο εντός 60 μηνών. Η ασθένεια ελεύθερη επιβίωση (DFS) ορίστηκε ως το χρονικό διάστημα από την ημερομηνία της χειρουργικής επέμβασης για την ημερομηνία της υποτροπής ή θανάτου όγκων που σχετίζονται με, όποιο από τα δύο συμβεί πρώτο εντός 60 μηνών. Ασθενείς ζωντανοί χωρίς υποτροπή κατά την τελευταία ημερομηνία παρακολούθηση ή μετά από 60 μήνες ήταν λογοκρισία. Ενδονοσοκομειακή θνησιμότητα (εντός 60 ημερών) οδήγησε στον αποκλεισμό από την ανάλυση επιβίωσης. Επιβίωση αναλύθηκε χρησιμοποιώντας τη δοκιμασία log-rank και απεικονίζονται με τη χρήση της μεθόδου Kaplan-Meier. Εάν δεν ορίζεται διαφορετικά, τα αποτελέσματα παρουσιάζονται ως διάμεση επιβίωση σε μήνες με διάστημα εμπιστοσύνης 95% (95% CI). Για μια πολυπαραγοντική ανάλυση, cox μοντέλο κινδύνου παλινδρόμησης χρησιμοποιήθηκε για να εκτιμηθεί η προγνωστική αξία της ΓΠ /αντιγραφή αριθμό αλλαγών. Τα αποτελέσματα παρουσιάζονται ως αναλογία κινδύνου (HR) και 95% CI. Σημαντικές δηλώσεις αναφέρονται σε P-τιμές των δίπλευρη δοκιμές & lt?. 0.05

Αποτελέσματα

Μικροδορυφορικοί ανάλυση

Η ομάδα μελέτης που χρησιμοποιείται για την ανάλυση μικροδορυφορικού αποτελείται από ένα σύνολο 86-συμφωνημένα καρκίνωμα και δείγματα φυσιολογικού ιστού των ασθενών με καρκίνο του πνεύμονα που υποβλήθηκε σε χειρουργική επέμβαση. Μια ανάλυση μικροδορυφορικών πραγματοποιήθηκε σε ένα σύνολο τεσσάρων περιοχών επί του χρωμοσώματος 4Q, χρησιμοποιώντας δύο πολυμορφικούς δείκτες για κάθε περιοχή. Η αλληλόμορφη δείκτες κοντά στο άλλο αποκάλυψε πολύ παρόμοιες συχνότητες διαγραφή οδηγούν σε οριστική απώλεια των συχνοτήτων ετεροζυγωτίας του 18,6% (

n =

16) στην περιοχή 1? 23,3% (

n =

20) στην περιοχή 2? 25,6% (

n =

22) στην περιοχή 3 και το 34,9% (

n =

30) στην περιοχή 4. Το ποσοστό των μη ενημερωτικών περιπτώσεις κυμαίνονταν από 16,3% έως 36,0%, ανάλογα στο δείκτη. Με τη χρήση δύο δείκτες για την ανίχνευση AI σε κάθε περιφέρεια, οι μη-πληροφοριακές περιπτώσεις θα μπορούσε να μειωθεί σε κυμαίνεται από 2,3% έως 15,1%. Περιοχές 1 και 3 είχαν συγκλίνοντα αποτελέσματα (κανονική /ζημία), ενώ η περιοχή 2 περιείχε τρία disconcordant αποτελέσματα και περιοχή 4 περιείχε ένα από το καθένα. Όλα disconcordant αποτελέσματα επαναλήφθηκαν και τα αποτελέσματα παρέμειναν όμοια, υποδηλώνοντας μια πιθανή σημείο διακοπής μεταξύ των δεικτών. Συνολικά, το 45,3% (

n =

39) αποκάλυψε τουλάχιστον μία απώλεια αλληλομόρφων εντός των αναλυθεί περιοχές. Μέσα σε αυτούς τους ασθενείς, 17,9% (

n =

7) αποκάλυψε μια απώλεια σε όλες τις περιοχές. Τα λεπτομερή αριθμητικά αποτελέσματα δίνονται στον πίνακα 1 και S1 σχήμα, πληροφορίες υποστήριξης.

Η

AI στο χρωμόσωμα 4ιζ και κλινικοπαθολογοανατομικές χαρακτηριστικά

Δεν υπήρχε ένδειξη μιας σημαντικής στατιστική συσχέτιση μεταξύ AI με κλινικοπαθολογοανατομικές χαρακτηριστικά σε τέσσερις περιοχές που ερευνήθηκαν. Ωστόσο, 83,3% (

n =

15) των ασθενών με ΑΙ σε περιοχή 2 αναπτύξει μια υποτροπή σε αντίθεση με 16,7% (

n =

3) χωρίς AI (Ρ = 0,073).

AI στο χρωμόσωμα 4ιζ ως προγνωστικός δείκτης για την επιβίωση

σε αναλύσεις μονοπαραγοντική επιβίωσης, μια τάση μικρότερη διάμεση ασθένεια δωρεάν (DFS) και τη συνολική επιβίωση (OS) σε ασθενείς με AI στην περιοχή 1 και 2 ήταν εμφανής (μέση διαφορά επιβίωσης από 11,9 μήνες σε 14 μήνες? οι λεπτομέρειες παρουσιάζονται στο S3 πίνακα). Ωστόσο, οι διαφορές δεν ήταν στατιστικά σημαντική (P & gt? 0,05). Δεδομένου ότι η ομάδα μελέτης για την επιβίωση αναλύσεις περιορίστηκε σε 68-77 περιπτώσεις, συμπεριλαμβανομένων των ασθενών IV στάδιο UICC καθώς επίσης ασθενείς με θετικά περιθώρια εκτομή, συγχητικές επιδράσεις στην ανάλυση επιβίωσης πρέπει να αναμένεται. Αυτό ήταν εμφανές για την περιοχή 2. Ως εκ τούτου, μετά από στρωματοποίηση κατά ηλικία, το φύλο, το στάδιο του όγκου, και τις παραμέτρους των περιθωρίων εκτομής, η παρουσία της γρίπης των πτηνών στην περιοχή 2 έχει αποδειχθεί ότι είναι ένας ανεξάρτητος προγνωστικός δείκτης για την DFS (HR 3.82,

P =

0.044). Μια παρόμοια μη σημαντική τάση παρατηρήθηκε επίσης για το OS (HR 3.56,

P =

0,072). Ένα στάδιο του όγκου UICC ≥ III ήταν η ισχυρότερη και μόνο πρόσθετο αρνητικό προγνωστικό δείκτη για DFS και OS, με HR 4,22 (

P =

0,007) και HR 2,87 (P = 0.047), αντίστοιχα (S4 Πίνακας).

FISH αριθμό αντιγράφων ανάλυση

με βάση τα δηλωθέντα allelotyping αποτελέσματα, επιδιώξαμε να ελέγξει αυτά τα αποτελέσματα σε ένα μεγαλύτερο πληθυσμό της μελέτης με ανάλυση FISH. Δύο διαφορετικοί ανιχνευτές BAC, ένα υβριδισμό με την περιοχή 2 και μία υβριδισμό με την περιοχή 3 ιδρύθηκαν (S5 Πίνακας).

Για την περιοχή 4q21.23 ανιχνεύεται από RP11-570L13, μια απώλεια DNA παρατηρήθηκε στο 24,9% (

n =

52) και ένα κέρδος DNA σε 4,3% (

n =

9) από τα δείγματα που αναλύθηκαν. Μια απώλεια ανιχνεύεται στη θέση αυτή αποκάλυψε μια σημαντική ιστολογικό τύπο εξαρτώμενη συσχέτιση, με 38,0% (

n =

30) απώλεια δρΟΟ σε αντίθεση με 22,7% (

n =

15,

P =

0.049) σε AC. Η ανάλυση με RP11-1053C2 ανιχνευτή αποκάλυψε απώλεια 30,6% και αύξηση στο 7,2% (

n =

15), και πάλι αποκαλύπτοντας μια σημαντικά πιο συχνή ρυθμός απώλειας δρΟΟ (44,6%,

n =

33) σε σύγκριση με AC (23,3%,

n =

17,

P =

0.022).

Χρησιμοποιώντας RP11-634D8 καθετήρα (περιοχή 3), το ποσοστό των επιτυχημένη ανάλυση ήταν 71,6% (

n =

204). Μια απώλεια αριθμό αντιγράφων του DNA ανιχνεύθηκε σε 36,8% (

n =

77) και μια αύξηση στο 7,7% (

n =

16) των αναλυθούν δείγματα.

Αντιγραφή απώλεια αριθμό στο χρωμόσωμα 4ιζ και κλινικοπαθολογοανατομικές χαρακτηριστικά

Αντιγραφή απώλεια αριθμό στη θέση 4q21.23 (RP11-570L13) έδειξε μια σημαντική συσχέτιση με την προηγμένη μέγεθος του όγκου (

P =

0,005), αλλά με καμία άλλες παθολογικές χαρακτηριστικά. Αντιγραφή απώλεια αριθμό σε 4q22.1 θέση (RP11-1053C2) αποκάλυψε μια σημαντική συσχέτιση με την παρουσία μεταστάσεων λεμφαδένων (απώλεια PN0: 25,2%,

n =

26 έναντι ζημιών ≥pN1: 44,0%,

n =

37?

P =

0,005), καθώς και προχωρημένο στάδιο UICC (απώλεια UICC I: 25,3%,

n =

23 έναντι ζημιών UICC ≥II: 41,4%,

n =

41?

P =

0,032). Αντιγραφή απώλεια αριθμό στη θέση 4q31.2 (RP11-634D8) έδειξε μια σημαντική συσχέτιση με την προηγμένη μέγεθος του όγκου (

P =

0.019). Ωστόσο, δεν υπάρχουν περαιτέρω συσχετισμοί με κλινικοπαθολογοανατομικές χαρακτηριστικά ήταν εμφανής (S5 Πίνακας).

Αντιγραφή απώλεια αριθμό στο χρωμόσωμα 4ιζ ως προγνωστικός δείκτης για την επιβίωση

Στο πλαίσιο μιας μονοπαραγοντική ανάλυση, αντίγραφο απώλεια αριθμό στη θέση 4q21.23 (RP11-570L13) αποκάλυψε μια μη σημαντική τάση προς μικρότερη διάμεση DFS (12,5 μήνες έναντι 28,0 μηνών,

P =

0,056). Υποομάδα αναλύσεις, ωστόσο, έδειξε μια ισχυρή συσχέτιση με DFS σε δρΟΟ υποομάδα (11,2 μήνες έναντι 39,1 μηνών, p = 0,031? Σχ. 1, S6 Πίνακα). Μια παρόμοια επίδραση στο OS αναφέρθηκε για όλη την ομάδα μελέτης (23,9 μήνες έναντι 42,6 μηνών,

P =

0.033) και δρΟΟ υποομάδα (12,5 μήνες έναντι 41 μηνών,

P = 0,031

, εικ . 2, S6 πίνακας)

Α:. Αντιγραφή απώλεια αριθμό στη θέση 4q21.23 (RP11-570L13) αποκάλυψε μια τάση μικρότερη διάμεση επιβίωση χωρίς νόσο (DFS) σε μονοπαραγοντική ανάλυση (12,5 μήνες έναντι 28,0 μηνών,

P =

0,056). Β: Αντιγραφή απώλεια αριθμό στη θέση 4q21.23 (RP11-570L13) στο ακανθοκυτταρικό καρκίνωμα (δρΟΟ) υποομάδας έδειξε ισχυρή συσχετίσεις με μικρότερη DFS (11,2 μήνες έναντι 39,1 μηνών)

P = 0,031

. C: Αντιγραφή απώλεια αριθμό σε 4q22.1 θέση (RP11-1053C2) έδειξε σημαντικές συσχετίσεις με μικρότερη DFS (12,5 μήνες έναντι 32,7 μηνών),

P = 0,010

. D: Αντιγραφή απώλεια αριθμό σε 4q22.1 θέση (RP11-1053C2) έδειξε σημαντικές συσχετίσεις με μικρότερη DFS σε δρΟΟ υποομάδα (11,7 μήνες έναντι 35,5 μηνών),

P = 0,027

. οικόπεδα επιβίωσης για εκτροπές κέρδος είχαν ξεθωριάσει για λόγους σαφήνειας

Η

Α:. Αντιγραφή απώλεια αριθμό στη θέση 4q21.23 (RP11-570L13) αποκάλυψε ισχυρή συσχετίσεις με μικρότερη διάμεση συνολική επιβίωση (OS) στο μονοπαραγοντική ανάλυση (23,9 μήνες έναντι 42,6 μηνών),

P =

0.033. Β: Αντιγραφή απώλεια αριθμό στη θέση 4q21.23 (RP11-570L13) στο ακανθοκυτταρικό καρκίνωμα (δρΟΟ) υποομάδας έδειξε ισχυρή συσχετίσεις με μικρότερη OS (12,5 μήνες έναντι 41 μηνών),

P = 0,031

C: Αντιγραφή απώλεια αριθμό σε 4q22.1 θέση (RP11-1053C2) έδειξε σημαντικές συσχετίσεις με μικρότερη DFS (25,8 μήνες έναντι 40,3 μηνών),

P = 0,012

. D: Αντιγραφή απώλεια αριθμό σε 4q22.1 θέση (RP11-1053C2) έδειξε σημαντικές συσχετίσεις με μικρότερη DFS σε αδενοκαρκίνωμα υποομάδα (10,0 μήνες έναντι 43,1 μηνών),

P =

0.035. οικόπεδα επιβίωσης για εκτροπές κέρδος είχαν ξεθωριάσει για λόγους σαφήνειας.

Η

Αντιγραφή απώλεια αριθμό σε 4q22.1 θέση (RP11-1053C2) έδειξε σημαντικές συσχετίσεις με μικρότερη διάμεση DFS στο σύνολο της κοόρτης της μελέτης, καθώς και όπως στο πλαίσιο της υποομάδας δρΟΟ (12,5 μήνες έναντι 32,7 μηνών,

P =

0,010 και 11,7 μήνες έναντι 35,5 μηνών,

P = 0,027

? εικ. 1, S6 πίνακα). Επιπλέον, η απώλεια της 4q22.1 σχετίστηκε με μικρότερο λειτουργικό σύστημα στο σύνολο της κοόρτης της μελέτης και την υποομάδα AC, ενώ δεν παρατηρήθηκε συσχέτιση εντός της υποομάδας δρΟΟ (ολόκληρη ομάδα μελέτης: 25,8 μήνες έναντι 40,3 μηνών,

P =

0.012? AC υποομάδα: 10,0 μήνες έναντι 43,1 μηνών,

P =

0.035, εικ 2, S6 πίνακας)

σε αντίθεση, ο αριθμός αντιγράφων κέρδη δεν αποκάλυψε συσχέτιση με την επιβίωση σε.. οποιαδήποτε από τις αναλύθηκαν θέσεις. Σύμφωνα με τα αποτελέσματα της μελέτης κοόρτης AI, αντιγράψτε απώλεια αριθμό στην περιοχή 3 (RP11-634D8, θέση 4q31.2) δεν είχε καμία επίδραση στην επιβίωση (S6 Πίνακας).

Η πολυπαραγοντική ανάλυση εντοπίστηκαν απώλεια αριθμό αντιγράφων σε θέση 4q21.23 (RP11-570L13) ως αρνητικό προγνωστικό δείκτη για DFS και OS για όλη την ομάδα μελέτης (COX αναλογικό μοντέλο κινδύνου, στρωματοποιημένη ανά ηλικία, το φύλο, η κάθαρση περιθώριο, ταξινόμησης και το στάδιο UICC? DFS: HR 1,77 (1.10- 2,84 95% CI),

P =

0.019? OS: HR 2,20 (1,33 – 3,64 95% CI),

P = 0,002

, πίνακας 2), καθώς και για την υποομάδα δρΟΟ ( DFS: HR 2,85 (1,35 – 6,04 95% CI),

P =

0.006? OS: HR 2.77 (1.26 – 6.13 95% CI),

P = 0,012

, S7 πίνακα). Παρόμοια αποτελέσματα παρατηρήθηκαν για την απώλεια αντίγραφο αριθμό στη θέση 4q22.1 που αφορούν το σύνολο της ομάδας μελέτης (RP11-1053C2? DFS: HR 1,64 (1,03 – 2,61 95% CI),

P = 0,038

? OS: 1.84 ( 01.12 έως 03.01 95% CI),

P =

0,015, πίνακας 3), ενώ υποομάδα ανάλυση δεν έφτασε στατιστική σημασία (S8 Πίνακας). Ένα δεύτερο μοντέλο της πολυπαραγοντικές αναλύσεις, συμπεριλαμβανομένης της διαχείρισης των επικουρική χημειοθεραπεία έγινε (πληροφορίες που διατίθενται σε 116 ασθενείς). Τα αποτελέσματα έμεινε σημαντική όταν συμπεριλήφθηκε η χορήγηση συμπληρωματικής χημειοθεραπείας (τα δεδομένα δεν παρουσιάζονται).

Η

Εν ολίγοις, οι δύο θέσεις στην περιοχή 2, δηλαδή 4q21.23 (RP11-570L13) και 4q22 0.1 (RP11-1053C2), προσδιορίστηκαν ως αρνητικός προγνωστικός δείκτης για την DFS, καθώς και OS στο σύνολο της κοόρτης της μελέτης. Ωστόσο, μόνο η απώλεια σε θέση 4q21.23 έφτασε σημασία επίσης στην υποομάδα δρΟΟ. Ένα διάγραμμα ροής που συνοψίζει την επιβίωση αναλύσεις της κλάσης μελέτης, η πρόοδος της μελέτης και τα αποτελέσματα δίνονται στο S2 και S3 Σχήματα.

Αναφορά περίπτωσης της 4q21.23 απώλεια κωδικοί DTC

Με βάση μας νωρίτερα διαπιστώνοντας ότι 4q12-32 απώλεια συσχετίζεται με θετική κατάσταση DTC, θελήσαμε να διερευνήσουμε κατά πόσο η απώλεια αυτής της περιοχής είναι επίσης παρούσα σε κωδικούς DTC από έναν ασθενή με απώλεια 4ιζ στον πρωτογενή όγκο [14]. Μια απώλεια 4q22.1 ανιχνεύθηκε στο 77% (17/22) των ασθενών κωδικούς DTC. Το φάσμα των ανιχνευτή RP11-1053C2 και κεντρομεριδίου 3 σήματα ήταν ετερογενή, κυμαίνεται από 1 έως 5 σήματα (μέση 1,7 και 2,7 αντίστοιχα). ανάλυση FISH Πραγματοποιήθηκε επίσης επί εγκλεισμένα σε παραφίνη υλικό πρωτογενούς όγκου και του πνεύμονα υποτροπή από τον ίδιο ασθενή (εικ. 3). Αυτά τα αποτελέσματα αποκάλυψαν πάλι μια απώλεια 4q22.1 και υψηλού βαθμού ετερογένειας στα επιμέρους κύτταρα που κυμαίνονται από 0-4 σήματα σε πρωτογενή όγκο και 0-5 στο υλικό υποτροπή του όγκου.

κύτταρα μυελού των οστών του ασθενούς είχαν ανοσοκυτταροχημικώς χρωματίστηκαν κατά κυτοκερατίνης χρησιμοποιώντας την μέθοδο ΑΡΑΑΡ. Μια θετική DTC (κόκκινο) και ένα αρνητικό λευκοκυττάρων (καφέ) δείχνονται. Β: μυελού των οστών τα κύτταρα του ασθενούς βάφτηκαν με φθορισμό κατά κυτοκερατίνης (κόκκινο σήμα) που ακολουθείται από ανάλυση FISH σε C) με ανιχνευτή RP11-1053C2 και CEN3 ανιχνευτή (RP11-1053C2 ανιχνευτή: 1 πράσινο σήμα? Καθετήρας CEN3: 3 φάσμα πορτοκαλί σήματα ? πυρηνική χρώση σε DAPI). Cen7 καθετήρα (Cen7 καθετήρα: aqua φάσμα εμφανίζεται στο ψευδο-χρώμα ματζέντα) ήταν εκτός χρησιμοποιούνται για την ανάλυση FISH στο D) πρωτοπαθούς όγκου (2-5 πορτοκαλί σήματα /κυττάρων, 2-4 σήματα ματζέντα /κυττάρων και 0-2 πράσινα σήματα /κύτταρο) και Ε) υλικό όγκου υποτροπής FFPE (3-6 πορτοκαλί, 4-5 ματζέντα και 1-3 πράσινα σήματα /κύτταρο).

Η

Συζήτηση

σε μια προηγούμενη μελέτη , ήμασταν σε θέση να εντοπίσει πέντε χρωμοσωμικές περιοχές διαφοροποίηση ασθενείς με ή χωρίς πρώιμη διάδοση του όγκου. Απώλεια 4q12-q32 έδειξε την ισχυρότερη συσχέτιση με τη θετική κατάσταση του κωδικού DTC. Εβδομήντα τρία γονίδια εντός αυτής της περιοχής βρέθηκαν κάτω ρυθμιζόμενη μεταξύ των NSCLC ασθενείς μυελό των οστών θετικά, υποδεικνύοντας μία πιθανή παρουσία των ογκοκατασταλτικών γονιδίων εντός αυτής της περιοχής [14]. Σε αυτή τη μελέτη, ήμασταν σε θέση να περιορίσετε την περιοχή-στόχο και να προσδιορίσει τις απώλειες αριθμό αντιγράφων μέσα σε λιγότερο από 4 MB-που εκτείνονται σε περιοχή στο χρωμόσωμα 4q21.23-22.1 ως ανεξάρτητοι προγνωστικοί δείκτες για την DFS, καθώς και OS σε NSCLC. Η παρουσία των απωλειών αριθμού αντιγράφων εντός αυτής της περιοχής συνδέθηκε με τουλάχιστον 18-μηνών μικρότερη μέση επιβίωση, σε σύγκριση με ασθενείς με φυσιολογική αριθμούς αντιγράφων. Περαιτέρω, η παρουσία των απωλειών αριθμού αντιγράφων προκάλεσε αυξημένο κίνδυνο υποτροπής της νόσου και το θάνατο που κυμαίνονται από 1,6 έως 2,9 εντός 60 μηνών παρακολούθησης, ανεξάρτητα των καθιερωμένων δεικτών πρόγνωσης για NSCLC (εξαρτάται από την ιστολογική υποτύπου και η θέση της απώλειας αριθμού αντιγράφων) . Επιπλέον, στη μελέτη έκθεση περίπτωσή μας, ήμασταν σε θέση να αποδείξει ότι η απώλεια της χρωμοσωμικής περιοχής 4q21.23 είναι παρούσα όχι μόνο τόσο στην πρωτογενή όγκο του πνεύμονα και του όγκου υποτροπή του ιστού, αλλά και σε ένα μεγάλο μέρος της πολύ ετερογενείς και άλλοι κωδικοί DTC. Αυτό υπογραμμίζει τη σημασία αυτής της χρωμοσωμικής περιοχής για τη διάδοση του όγκου. Μονογονικής δισωμίας είναι ένας μηχανισμός για το πώς μια απώλεια της ετεροζυγωτίας σε κύτταρα θα μπορούσε να προέρχεται [17]. Στο NSCLC δεν έχουμε επίγνωση των μελετών δείχνουν μονογονεϊκή δισωμία στο 4Q. Δυστυχώς δεν διεξάγει ειδική έρευνα για το αν η AI σε δείγματα μας οφειλόταν σε μονογονεϊκή δισωμία, καθώς τα δείγματα για αναλύσεις AI και FISH δεν ήταν αλληλοεπικάλυψη. Εμείς δεν ήταν σε θέση να κάνει οποιαδήποτε δήλωση για το αν μια απώλεια 4ιζ εμφανίζεται πιο συχνά σε polysomic περίπτωση του χρωμοσώματος 4 όπως συνηθίζαμε κεντρομερίδιο 10 ως αναφορά. Στην αρχική μας έγγραφο που περιγράφει τη σχέση μεταξύ της απώλειας των 4Q και την κατάσταση θετικά DTC μελετήσαμε 30 ασθενείς με NSCLC από array CGH. Σε αυτό το μάλλον μικρό αριθμό περιπτώσεων, δεν μπορέσαμε να βρούμε οποιαδήποτε συσχέτιση μεταξύ της απώλειας της 4Q και το συνολικό αριθμό των χρωμοσωμικών ανωμαλιών [14], υποδεικνύοντας ότι η απώλεια της 4Q είναι ειδικά σχετίζεται με μεταστατικό συμπεριφορά, ανεξάρτητα από το επίπεδο της χρωμοσωμικής αστάθειας στον όγκο .

Απώλεια διαφόρων μεγέθους περιοχές στο χρωμόσωμα 4ιζ έχει συσχετισθεί με χαμηλότερα ποσοστά επιβίωσης σε πολλούς τύπους καρκίνου επιθηλιακών συμπεριλαμβανομένου ορθοκολικού καρκίνου, του πόρου του παγκρέατος αδενοκαρκίνωμα, ηπατοβλάστωμα και στοματικό καρκίνωμα πλακωδών κυττάρων [3], [18] – [22]. Επιπλέον, σε NSCLC, απώλειες 4Q έχουν συσχετιστεί με μεταστατικό αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα. Ωστόσο, το μέγεθος και τη θέση των διαγραφών 4Q ποικίλλει μεταξύ των διαφόρων μελετών [3], [18] – [22]

Εκτός από την αναγνώριση της περιοχής στόχου 4ιζ στον NSCLC και πιθανή κλινική σημασία της, μας. δεδομένα δείχνουν ιστολογικών υποτύπων συγκεκριμένες αποκλίσεις όσον αφορά τις συχνότητες αλληλομόρφων απώλειας και προγνωστική σημασία. Η ανάλυση των υποομάδων αποκάλυψε σημαντικά υψηλότερο ποσοστό των αλληλομόρφων απώλεια δρΟΟ ανιχνευτές σε αντίθεση με AC ανιχνευτές. Σύμφωνα με αυτές τις διαφορές, την απώλεια σε 4q21.23 (με RP11-570L13 δείκτης) μέσα σε περιοχή 2 ταυτοποιήθηκε ως αρνητικός προγνωστικός δείκτης για την DFS και OS στο σύνολο της κοόρτης της μελέτης NSCLC και ιδιαίτερα της υποομάδας δρΟΟ. Αυτή η περιοχή δεν βρέθηκε να αποτελεί ανεξάρτητο προγνωστικό δείκτη στην υποομάδα AC. Οι παρατηρούμενες ιστολογικών υποτύπων συγκεκριμένες συχνότητες αλληλομόρφων απώλεια με μεταβλητή επίδραση στην επιβίωση είναι σύμφωνες με προηγούμενες μελέτες αναφέρουν πολλές χρωμοσωμικές περιοχές διαφοροποιώντας δρΟΟ από την AC, συμπεριλαμβανομένης της πιο κοινή απώλεια της 4Q σε δρΟΟ [5], [8] – [10], [23], [24]. Επιπλέον, πολυάριθμες μελέτες έχουν δείξει ότι αυτές οι διαφορετικές γονιδιωματικές μεταβολές των AC και δρΟΟ θα μπορούσε να παράσχει ευοίωνο ευκαιρίες για τους υποψήφιους στοχευμένες θεραπείες των ασθενών με καρκίνο του πνεύμονα [11]. Καθώς οι LCLC και νευροενδοκρινείς πνεύμονα υποομάδες καρκίνου ήταν πολύ μικρό για αναλύσεις υποομάδων, απαιτούνται περαιτέρω μελέτες προκειμένου να αξιολογηθεί η ενδεχομένως αποκλίνει αντίκτυπο των αλληλομόρφων των ανισορροπιών στις 4ιζ στις ακόλουθες ιστολογικών υποτύπων.

κοόρτης μελέτη μας δεν περιλαμβάνουν προκαρκινικά αλλοιώσεις. Κατά συνέπεια, εξακολουθεί να είναι ασαφές όταν συμβαίνουν αυτά τα κρίσιμα αλληλομόρφων ανισορροπίες εντός της προθεσμίας των παθογένεση του καρκίνου του πνεύμονα.